Hielscher Ultrasonics
Meil on hea meel teie protsessi arutada.
Helistage meile: +49 3328 437-420
Saatke meile kiri: info@hielscher.com

E. coli ultraheli lüüs

  • E. coli bakterid on mikrobioloogias ja biotehnoloogias kõige sagedamini kasutatavad bakterid.
  • Ultraheli rakkude katkestajad annavad usaldusväärseid ja reprodutseeritavaid tulemusi E. coli lüüsi jaoks.
  • Intensiivsed, kuid täpselt kontrollitavad kavitatsiooni- ja nihkejõud põhjustavad täielikke häireid ja suuri ekstraheerimissaaseid (nt valgud, DNA).

Miks on E. coli ultraheli rakkude häirimine eelistatud meetod?

Ultraheli homogenisaatorid või sondi tüüpi ultrasonikaatorid pakuvad E. coli lüüsi jaoks mitmeid eeliseid, kuna intensiivne ultraheli häirib tõhusalt rakuseinu ja membraane. Sondi tüüpi ultrasonikaatoreid kasutatakse laialdaselt E. coli lüüsi jaoks järgmistel põhjustel:

  • Rakuseinte tõhus katkestamine: E. colil on peptidoglükaanist koosnev pooljäik rakusein, mida võib traditsiooniliste lüüsimeetoditega olla raske murda. Sondi tüüpi ultrasonikaator tekitab intensiivseid ultraheli laineid, mis tekitavad rakke ümbritsevas vedelikus kavitatsioonimulle. Kui need mullid kokku varisevad, tekitavad nad kiireid vedelikujoad ja lööklaineid, mille tulemuseks on rakuseinte mehaanilised häired, vabastades tõhusalt raku sisu, näiteks biomolekule.
  • Suurem levik: Sondi / sonotrode tekitatud ultraheli lained võivad tungida sügavale proovi, jõudes suurema arvu E. coli rakkudeni ja töödeldes neid ühtlaselt. See aitab tagada, et lüüs on kogu proovis ühtlasem, mille tulemuseks on suurem rakkude katkestamise efektiivsus.
  • Vähendatud töötlemisaeg: Sondi tüüpi ultrasonikaatori poolt tarnitud energia on väga kontsentreeritud ja lokaliseeritud, mis viib kiire ja tõhusa rakulüüsini. Võrreldes teiste meetoditega, nagu helmeste peksmine või ensümaatiline lüüs, võib ultrahelitöötlus saavutada E. coli lüüsi mõne minuti või isegi sekundi jooksul. Kuigi paljud alternatiivsed tehnikad, nagu külmsulatamine, nõuavad mitut raviringi, avab ultraheli lüüs rakud ühes protsessietapis.
  • Temperatuuri reguleerimine: Tipptasemel ultrasonikaatorid on varustatud temperatuuriandurite ja nutika tarkvaraga, mis võimaldab seada maksimaalse protsessi temperatuuri. Ultrasonikaator peatub automaatselt, kui temperatuuri piir on saavutatud ja käivitab ultrahelitöötlusprotsessi, kui saavutatakse seatud temperatuuripunkt. Proovide jahutamine jäävannis on lihtne meetod proovi temperatuuri madalal hoidmiseks ja kuumusest tingitud proovi lagunemise vältimiseks.
  • Mastaapsus: Sondi tüüpi ultrasonikaatorid on saadaval erinevates suurustes, alates pihuseadmetest kuni suuremahuliste tööstusmudeliteni. See muudab need sobivaks väikeste koguste töötlemiseks laboris või suuremate biotöötlusrakenduste jaoks, nt vaktsiinide tootmiseks või molekulide biosünteesiks.
  • Mitmekülgsus: Ultrasonikaatoreid saab kasutada mitmesugustes rakendustes peale rakulüüsi, nagu DNA lõikamine, valgu ekstraheerimine, koe homogeniseerimine, nanoosakeste dispersioon ja emulgeerimine. Seetõttu tagab sondi tüüpi ultrasonikaatorisse investeerimine mitmekülgsuse uurimis- või tööstuskeskkonnas.
  • Sondi tüüpi ultrasonikaatorid nagu UP200St on usaldusväärsed koe homogenisaatorid ja rakupurustid, seetõttu kasutatakse neid laialdaselt proovide ettevalmistamiseks geneetikas, nt E.coli lüüsi jaoks

    Valgu ekstraheerimine E.coli rakkudest toimub tõhusalt ultraheli sond UP200St

    Sondi tüüpi ultrasonikaator pakub E. coli lüüsile palju eeliseid. Usaldusväärne ja täpne kontroll ultraheli protsessi parameetrite üle võimaldab soovitud tulemuste saavutamiseks optimeerida tööparameetreid, nagu võimsus, kestus ja proovide käitlemine.
     

    Teabe nõudmine




    Pange tähele meie Privaatsuspoliitika.




     

    See õpetus selgitab, millist tüüpi sonikaator sobib kõige paremini teie proovide ettevalmistamise ülesannete jaoks, nagu lüüs, rakkude katkestamine, valkude eraldamine, DNA ja RNA killustumine laborites, analüüs ja uuringud. Valige oma rakenduse, proovi mahu, proovi numbri ja läbilaskevõime jaoks ideaalne sonikaatori tüüp. Hielscher Ultrasonicsil on teile ideaalne ultraheli homogenisaator!

    Kuidas leida täiuslik sonikaator rakkude katkestamiseks ja valkude ekstraheerimiseks teaduses ja analüüsis

    Video pisipilt

    Ultraheli DNA killustumist kasutatakse sageli proovi ettevalmistamise etapina järgmise põlvkonna sekveneerimisel (NGS)

    E. coli EDL933 genoomse DNA elektroforeetilised analüüsid, mis viidi läbi 0 – 15 min ultraheliga. L tähistab DNA redelit.
    (uuring ja pilt: ©Basselet et al. 2008)

    Rakkude katkestamine ultraheli kavitatsiooni abil

    Ultraheli sondi tüüpi homogenisaatorid töötavad umbes 20 000 tsükliga sekundis (20 kHz juures) ja põhjustavad kavitatsiooni vedelikes või suspensioonides. Akustiline kavitatsioon mikroskoopilised vaakumilaadsete rõhkude ja kõrgete temperatuuride piirkonnad, mis rebivad rakud laiali. Kuigi temperatuur võib ulatuda mitme tuhande kraadini, on kavitatsioonimahud nii väikesed, et need ei soojenda protsessi oluliselt. Ultraheli genereeris akustilise kavitatsiooni ja nihkejõud perforeerivad või purustavad bakterirakkude, näiteks E.coli rakumembraani. Hielscheri ultrasonikaatorid võimaldavad täpset kontrolli protsessi parameetrite üle, nagu ultraheli intensiivsus, amplituud, energiasisend ja temperatuur. Seega saab ultraheli lüüsiprotsessi optimaalselt kohandada vastavalt rakutüübile, rakukultuurile ja protsessi eesmärgile.
     

    Ultraheli lüüsi eelised

    • lüüsi täpne kontroll (intensiivsus, amplituud, temperatuur)
    • usaldusväärsed, reprodutseeritavad tulemused
    • optimaalne kohandamine konkreetsete proovidega
    • temperatuuri reguleerimine
    • väga väikeste kuni väga suurte proovide puhul (μL-liitrini)
    • Puhtmehaaniline töötlemine
    • kasutajasõbralik ja ohutu kasutamine
    • lineaarne skaala laborist tootmiseni
    Ultraheli seade VialTweeter võimaldab samaaegset proovi ettevalmistamist kuni 10 viaali samadel protsessitingimustel. (Suurendamiseks klõpsake!)

    VialTweeter ultraheli lüüsi jaoks

    Teabe nõudmine




    Pange tähele meie Privaatsuspoliitika.




    Ultraheli homogenisaator vs muud lüüsimeetodid

    Kuigi keemiline ja ensümaatiline lüüs võib olla problemaatiline – kuna keemiline lüüs võib muuta valgustruktuure ja tekitada puhastusprobleeme ning ensümaatiline lüüs nõuab pikka inkubatsiooniaega ega ole reprodutseeritav – Ultraheli häired on keerukas, kiire rakkude katkestamise meetod.
    Ultraheli lüüs põhineb ainult mehaanilistel jõududel. Kemikaale ei lisata, ultrahelitöötlus purustab rakuseina nihkejõududega. Keemiline lüüs võib muuta valgu struktuuri ja tekitada puhastusprobleeme. Ensümaatiline katkestus nõuab pikka inkubatsiooniaega ja ei ole reprodutseeritav. E.coli bakterirakkude ultraheli rakkude katkestamine on kiire, lihtne, usaldusväärne ja reprodutseeritav. Sellepärast kasutatakse Hielscheri ultrasonikaatoreid bioloogilistes ja biokeemilistes laborites üle maailma proovide ettevalmistamiseks, eel-ananlüütikumideks, in vitro diagonstikaks ja mitmekülgseteks analüüsideks.

    Ultraheli lüüsi üldised soovitused

    Sonikatsioon on kõige populaarsem meetod väga väikeste, keskmiste ja suurte koguste rakususpensioonide lüüsimiseks – pico-liitrist kuni 100L / h (kasutades ultraheli voolurakku). Rakke lüüsitakse vedeliku nihke ja kavitatsiooniga. DNA nihkub ka ultrahelitöötluse ajal, mistõttu ei ole vaja rakususpensioonile lisada DNaasi.
     

    Temperatuuri reguleerimine ultraheli E.coli lüüsi ajal
    Ultraheli rakkude katkestaja UP100H (100W) rakkude katkestamiseks ja taimeühendite ekstraheerimiseks.Proovi eeljahutamisega ja proovi hoidmisega ultrahelitöötluse ajal jääl saab proovi termilist lagunemist kergesti vältida.
    Ideaaljuhul tuleks proove lüüsi ajal hoida jääkülmana, kuid enamiku proovide puhul piisab, kui temperatuur ei tõuse üle kultuuri või koeallika temperatuuri. Seetõttu on soovitatav hoida suspensiooni jääl ja sonikeerida mitme lühikese ultraheli impulsiga 5-10 sek ja pausidega 10-30 sek. Pauside ajal võib soojus hajuda, et taastada madal temperatuur. Suuremate rakuproovide jaoks on saadaval erinevad jahutussärkidega voolurakureaktorid.
    Loe siit üksikasjalikke näpunäiteid ja soovitusi edukaks ultraheli lüüsiks!

    E. coli lüsaatide ultraheli valmistamise protokollid

    Teadlased kasutavad Hielscheri ultraheli homogenisaatoreid E.coli rakkude katkestamiseks. Allpool leiate erinevaid testitud ja tõestatud protokolle E.coli lüüsi jaoks, kasutades Hielscheri ultraheli homogenisaatoreid erinevate E. coli seotud rakenduste jaoks.
     

    See videoklipp näitab Hielscheri ultraheli homogenisaatorit UP100H, ultrasonikaatorit, mida kasutatakse laialdaselt proovide ettevalmistamiseks laborites.

    Ultraheli homogenisaator UP100H

    Video pisipilt

    Rakkude kasv, ristsidumine ja E. coli rakuekstraktide valmistamine ultraheli abil

    SeqA ja RNA polümeraasi puhul kasvatati ChIP-Chip E. coli MG1655 või MG1655 ΔseqA 37 °C juures OD-ks600 umbes 0,15 50 ml LB-s (+ 0,2% glükoosi), enne kui lisati 27 μl formaldehüüdi (37%) ml söötme kohta (lõplik kontsentratsioon 1%). Ristlinkimine viidi läbi aeglasel loksutamisel (100 pööret minutis) toatemperatuuril 20 minutit, millele järgnes kustutamine 10 ml 2,5 M glütsiiniga (lõppkontsentratsioon 0,5 M). Kuumašoki katsete jaoks kasvatati E. coli MG1655 65 ml LB söötmes 30 °C juures OD-ni600 umbes 0,3. Seejärel viidi 30 ml kultuuri eelsoojendatud kolbi temperatuuril 43 °C ja ülejäänut hoiti temperatuuril 30 °C. Ristsidumine ja kustutamine toimus nii, nagu eespool kirjeldatud, välja arvatud see, et rakke hoiti 5 minutit temperatuuril 30 või 43 °C, enne kui neid toatemperatuuril aeglaselt loksutati. Rakud koguti tsentrifuugimise teel ja pesti kaks korda külma TBS-iga (pH 7,5). Pärast resuspensiooni 1 ml lüüsipuhvris (10 mM Tris (pH 8,0), 20% sahharoosi, 50 mM NaCl, 10 mM EDTA, 10 mg/ml lüsosüümi) ja inkubeerimist 37 °C juures 30 minutit, millele järgnes 4 ml IP puhvri lisamine, töödeldi rakke jääl 12 korda 30 sekundi ja 30 sekundi vaheaegadega, kasutades Hielscheri ultraheli protsessorit UP400St 100% võimsuse seadistusega. Pärast 10minutilist tsentrifuugimist 9000 g juures hoiti -20 °C juures 800 μl supernatandi alikvoote. (Waldminghaus 2010)
     

    Ensüümide ületootmine ja puhastamine ultraheli sondiga

    Ultrasonicator UP100H on laboratoorne homogenisaator, mida sageli kasutatakse rakukultuuriplaatide proovide ettevalmistamiseks.Dekahistidiini (His10)-märgistatud valkude ületootmiseks muundati E. coli BL21(DE3) pET19b konstruktsioonidega. Üleöö eelkultuur koguti tsentrifuugimise teel ja 1% kasutati ekspressioonikultuuri inokuleerimiseks. PET19mgtB-d kandvaid rakke kasvatati 22 °C juures, kuni optiline tihedus 600 nm juures (OD600) oli 0,7. Kultuur viidi üle temperatuurini 17 °C ja indutseeriti 100 μM IPTG-ga. 16 tunni pärast koguti kultuur tsentrifuugimise teel 7 500 × g juures 4 °C juures. Rakud resuspendeeriti 50 mM fosfaatpuhvri lisandiga soolalahuses (PBS) 0,3 M NaCl-ga pH 7,4 juures ja katkestati ultraheliga S2 mikro-otsa sonotrode juures Hielscheri ultrasonikaatoris UP200St tsüklis 0,5 ja amplituudiga 75%.
    Dekahistidiiniga märgistatud GtfC ületootmine indutseeriti 37 °C juures OD juures600 0,6 koos 100 μM IPTG-ga. Seejärel inkubeeriti rakke 4 tundi, koguti ja lüüsiti, nagu eespool MgtB puhul märgitud.
    Toorrakuekstraktid tsentrifuugiti 15 000 × g ja 4 °C juures, et settida rakujäätmeid. Selitatud ekstraktid laaditi 1-ml HisTrap FF Crude kolonnidesse, kasutades ÄKTAprime Plus süsteemi. Ensüümid puhastati vastavalt tootja protokollile Tema märgistatud valkude gradiendi elueerimiseks. Elueeritud valgulahuseid dialüüsiti kaks korda 1,000 mahuosa 50 mM fosfaatpuhvri lisandiga keedusoolalahusega, pH 7,4, 0,3 M NaCl-ga 4 °C juures. Puhastamist analüüsis 12% SDS-PAGE. Valgu kontsentratsioon määrati Bradfordi meetodil, kasutades Roti-Quanti. (Rabausch et al. 2013)
     

    E. coli bakterite valgu ultraheli ekstraheerimine
    Huvipakkuv söödavalk (antud juhul Arabidopsis thaliana MTV1) sulatatakse GST sildile ja väljendatakse BL21 Escherichia coli (E. coli) rakkudes.

    1. Võetakse üks GST-MTV1 ja GST pellet (mis vastab 50 ml bakterikultuurile) ja suspendeeritakse uuesti 2,5 ml jääkülma ekstraheerimise puhvris.
    2. Kasutage ultrasonikaatorit UP100H (varustatud MS3 mikrotip-sonotrode'iga väikeste koguste jaoks umbes 2-5 ml), et häirida bakterirakke, kuni need on lüüsitud, mida näitab vähenenud läbipaistmatus ja suurenenud viskoossus. See tuleb läbi viia jääl ja soovitatav on sonikeerida intervallidega (nt 10 sek ultraheliga töötlemine, millele järgneb 10-sekundiline paus jääl ja nii edasi). Tuleb olla ettevaatlik, et mitte liiga kõrge intensiivsusega ultraheliga sonikeerida. Kui tuvastatakse vahutamine või valge sademe moodustumine, tuleb intensiivsust vähendada.
    3. Lüüsitud bakterite lahus viiakse 1,5 ml mikrotsentrifuugiküvettidesse ja tsentrifuugitakse 4 °C juures, 16 000 x g 20 minutit.

     

    Ultraheli sondid kasutavad akustilise kavitatsiooni jõude raku häirimiseks ning molekulide ja DNA eraldamiseks E.coli-st.

    Sondi tüüpi ultrasonikaatorid nagu UP400St E.coli tõhusaks lüüsimiseks kasutatakse akustilise kavitatsiooni tööpõhimõtet.

    Rekombinantse valgu ekspressioonianalüüs ja puhastamine ultrahelitöötluse abil

    E. coli pellet töödeldi ultraheliga Hielscheri ultrasonikaatoriga UP100H. Selleks resuspendeeriti rakupellet jahutatud lüüsipuhvris (50 mM Tris-HCl pH = 7,5, 100 mM NaCl, 5 mM DTT, 1 mM PMSF) ja jahutati jääl 10 minutit. Seejärel töödeldi rakususpensiooni ultraheliga 10 lühikese 10-sekundilise purunemisega, millele järgnes jahutamiseks intervall 30 s. Lõpuks eemaldati rakujäätmed ultratsentrifuugimisega 4 ° C juures 15 minutit kiirusel 14000 pööret minutis. rPR-ekspressiooni kinnitamiseks manustati supernatanti 12% polüakrüülamiidgeeliga ning analüüsiti SDS-PAGE ja Western blot-meetodil. rPR-i puhastamine toimus Ni2+-NTA vaigu (Invitrogen, USA) abil vastavalt tootja juhendile. Selles etapis kasutati natiivset puhastusmeetodit. Puhastatud valgu puhtust hinnati elektroforeesi abil 12% polüakrüülamiidgeelil ja sellele järgnenud Coomassie sinisel värvimisel. Puhastatud valgu kontsentratsiooni mõõdeti Micro BCA valguanalüüsi komplektiga (PIERCE, USA). (Azarnezhad et al. 2016)
     

    See video näitab 200-vatist ultraheli kuppara laboriproovide hajutamiseks, homogeniseerimiseks, ekstraheerimiseks või degaseerimiseks.

    Ultraheli Cuphorn (200 vatti)

    Video pisipilt

    Ultraheli homogenisaatorid E. coli lüüsi jaoks

    Hielscher Ultrasonics projekteerib, toodab ja tarnib suure jõudlusega ultraheli homogenisaatoreid E. coli bakterite ja teiste rakutüüpide, kudede ja rakukultuuride usaldusväärseks ja tõhusaks lüüsiks.
    Ultraheli sondide lai portfell ja kaudsed ultrahelitöötlussüsteemid võimaldavad meil pakkuda teile ideaalset ultraheli koe homogenisaatorit teie rakkude katkestamise ja ekstraheerimise rakenduse jaoks.

    Disain, tootmine ja nõustamine – Kvaliteet Valmistatud Saksamaal

    Hielscheri ultrasonikaatoreid saab kaugjuhtida brauseri juhtimise kaudu. Sonikatsiooni parameetreid saab jälgida ja kohandada täpselt protsessi nõuetega.Hielscheri ultrasonikaatorid on tuntud oma kõrgeimate kvaliteedi- ja disainistandardite poolest. Nutikas tarkvara, intuitiivne menüü, programmeeritavad seaded ja automaatne andmete protokollimine on vaid mõned Hielscheri ultrasonikaatorite omadused. Vastupidavus ja lihtne kasutamine võimaldavad meie ultrasonikaatorite sujuvat integreerimist uurimis- ja biotehnoloogiarajatistesse. Isegi karmid tingimused ja nõudlikud keskkonnad on Hielscheri ultrasonikaatorite poolt kergesti käsitsetavad.

    Hielscher Ultrasonics on ISO sertifitseeritud ettevõte ja paneb erilist rõhku suure jõudlusega ultrasonikaatoritele, millel on tipptasemel tehnoloogia ja kasutajasõbralikkus. Loomulikult on Hielscheri ultrasonikaatorid CE-nõuetele vastavad ja vastavad UL, CSA ja RoHs nõuetele.

    Allolev tabel annab teile ülevaate meie ultrasonikaatorite ligikaudsest töötlemisvõimsusest:

    Partii maht Voolukiirus Soovitatavad seadmed
    mitme kaevu / mikrotiitri plaadid mujal liigitamata UIP400MTP
    CupHorn viaalide või keeduklaasi jaoks mujal liigitamata Ultraheli CupHorn
    Ultraheli mikrovoolu reaktor mujal liigitamata GDmini2
    kuni 10 viaali 0,5 kuni 1,5 ml lahusega mujal liigitamata VialTweeter
    0.5 kuni 1,5 ml mujal liigitamata VialTweeter
    1 kuni 500 ml 10 kuni 200 ml / min UP100H
    10 kuni 2000 ml 20 kuni 400 ml / min UP200Ht, UP400St
    0.1 kuni 20L 0.2 kuni 4L / min UIP2000hdT
    10 kuni 100L 2 kuni 10L/min UIP4000
    mujal liigitamata 10 kuni 100 L / min UIP16000
    mujal liigitamata Suurem klaster UIP16000

    Võta meiega ühendust! / Küsi meilt!

    Küsi lisainfot

    Palun kasutage allolevat vormi, et taotleda lisateavet ultraheli koe homogenisaatorite ja rakupurustite, lüüsirakenduste ja hindade kohta. Meil on hea meel arutada teie protsessi teiega ja pakkuda teile ultraheli homogenisaatorit, mis vastab teie nõuetele!









    Pange tähele, et meie Privaatsuspoliitika.




    Video näitab ultraheli proovide ettevalmistamise süsteemi UIP400MTP, mis võimaldab usaldusväärset proovi ettevalmistamist mis tahes standardsetest mitme süvendiga plaatidest, kasutades suure intensiivsusega ultraheli. UIP400MTP tüüpiliste rakenduste hulka kuuluvad rakkude lüüs, DNA, RNA ja kromatiini lõikamine ning valgu ekstraheerimine.

    Ultrasonikaatori UIP400MTP mitme kaevuga plaadi ultrahelitöötluseks

    Video pisipilt

    Ultraheli E. coli lüüsi lisaprotokollid

    Allitsiiniga modifitseeritud valgud E. colis, kasutades ultraheli VialTweeterit

    VialTweeter ultraheli protsessori UP200STSulfhüdrüülisisalduse määramine 5,5′-ditiobis(2-nitrobensoehappe) analüüsiga
    Mopsi minimaalse söötme (1:100) inokuleerimiseks kasutati E. coli MG1655 öökultuuri. Kultuuri kasvatati aeroobselt, kuni saavutati A600 0, 4. Kultuur jagati stressiraviks kolmeks 15 ml kultuuriks. Töötlemata kultuur toimis negatiivse kontrollina. Ühele ülejäänud kahest kultuurist lisati 0,79 mM allitsiini (128 μg ml-1) või 1 mM diamiidi. Kultuure inkubeeriti 15 minutit, 5 ml igast kultuurist koguti tsentrifuugimise teel (8,525 × g, 4 °C, 10 minutit). Rakke pesti kaks korda 1 ml fosfaatpuhvri lisandiga keedusoolalahusega (137 mM NaCl, 2,7 mM KCl, 10 mM Na2HPO4, 2 mM KH2PO4, pH 7,4, säilitati enne kasutamist anaeroobselt) ja tsentrifuugiti (13 000 × g, 4 °C, 10 min). Rakud resuspendeeriti lüüsipuhvris (fosfaatpuhvri lisandiga keedusoolalahus 6 mM guanidiiniumHCl-ga, pH 7,4) enne 4 ° C juures ultraheliga katkestamist (VialTweeter ultrasonikaator, Hielscher GmbH, Saksamaa) (3 × 1 min). Rakujäätmed granuleeriti tsentrifuugimise teel (13 000 × g, 4 °C, 15 min). Supernatant kanti magnetsegamisvardaga 3,5 ml QS-makroküvetile (10 mm) ja segati 1 ml lüüsipuhvriga. Proovide ekstinktsiooni jälgiti 412 nm juures Jasco V-650 spektrofotomeetriga, mis oli varustatud PSC-718 reguleeritava temperatuuriga kambrihoidjaga toatemperatuuril. Lisati 100 μl 3 mM ditiobis(2-nitrobensoehape) lahust. Väljasuremist jälgiti, kuni see saavutas küllastumise. Tiooli kontsentratsiooni arvutamiseks kasutati ekstinktsioonitegurit ε412 = 13 700 meetrit-1 Cm-1 tio-2-nitrobensoehappe (TNB) puhul. Rakutiooli kontsentratsioonid arvutati E. coli rakkude mahu põhjal 6,7 × 10-15 liiter ja raku tihedus A600 = 0, 5 (vastab 1 × 10-le8 rakud ml-1 kultuuri). (Müller jt 2016)
     

    In vivo glutatiooni määramine ultraheli rakupurusti abil

    E.coli MG1655 kasvatati MOPS-i minimaalses söötmes kogumahus 200ml, kuni saavutati A600 0,5. Kultuur jagati stressiraviks 50 ml kultuurideks. Pärast 15-minutilist inkubeerimist 0,79 mM allitsiini, 1 mM diamiidi või dimetüülsulfoksiidiga (kontroll) koguti rakud 4,000 g juures 4 °C juures 10 minutit. Rakke pesti kaks korda KPE puhvriga enne graanulite resuspensiooni 700 μl KPE puhvris. Deproteiinimiseks lisati 300 l 10% (w / v) sulfosalitsüülhapet enne rakkude katkestamist ultraheliga (3 x 1 min; VialTweeter ultrasonikaator). Supernatandid koguti pärast tsentrifuugimist (30 min, 13 000g, 4 °C). Sulfosalitsüülhappe kontsentratsiooni vähendati 1% -ni, lisades 3 mahuosa KPE puhvrit. Glutatiooni ja GSSG üldsisalduse mõõtmised viidi läbi eespool kirjeldatud viisil. Rakulise glutatiooni kontsentratsioonid arvutati E. coli rakkude mahu põhjal 6,7×10-15 liiter ja raku tihedus A600 0,5 (vastab 1-le×108 rakud ml-1 kultuuri). GSH kontsentratsioonid arvutati, lahutades 2[GSSG] kogu glutatioonist. (Müller jt 2016)

    Inimese mAspAT-i ekspressioon E. coli's, kasutades ultraheli homogenisaatorit

    Ultraheli rakkude katkestaja UP400St (400W) rakusisese aine (nt valgud, organellid, DNA, RNA jne) ekstraheerimiseksE. coli BL21 (DE3) üksikkoloonia, mis sisaldab ekspressioonivektorit 30 ml Luria-Bertani (LB) söötmes, mis sisaldab 100 μg/ml ampitsilliini, ja seejärel kasvatatakse seda 37 °C juures kuni optilise tiheduseni (OD600) jõudis 0,6-ni. Rakud koguti tsentrifuugimise teel 4 000 × g juures 10 minutit ja resuspendeeriti 3L värskes LB söötmes, mis sisaldas 100 μg/ml ampitsilliini.
    Seejärel indutseeriti valgu ekspressioon 1 mM isopropüül-β-ᴅ-1-tiogalaktopüranosiidiga (IPTG) 20 tundi 16 ° C juures. Rakud koguti tsentrifuugimise teel 8 000 × g juures 15 minutit ja pesti puhvriga A (20 mM NaH2PO4, 0,5 M NaCl, pH 7,4). 3 L kultuurist saadi ligikaudu 45 g (märgkaaluga) rakke. Pärast tsentrifuugimist resuspendeeriti rakugraanulid 40 ml (1 L kultuuri jaoks) jääkülma ekstraheerimise puhvris A ja lüüsiti ultraheliga jääkülmal temperatuuril, kasutades Hielscheri ultraheli rakupurustit UP400St. Rakkude lüüsi tsentrifuugiti kiirusel 12 000 pööret minutis 15 minutit, et eraldada lahustuvad (supernatant) ja sadestunud (pelleti) fraktsioonid. (Jiang et al. 2015)
     



    Faktid, mida tasub teada

    E.coli

    Escherichia coli (E. coli) on gramnegatiivne, fakultatiivselt anaeroobne, vardakujuline koliformne bakter perekonnast Escherichia, mida tavaliselt leidub soojavereliste organismide (endotermide) alumises sooles. On suur hulk E. coli tüvesid (või alatüüpe), millel on erinevad omadused. Enamik E. coli tüvesid on inimestele ohutud, nt B- ja K-12-tüved, mida kasutatakse tavaliselt laborites teadusuuringutes. Kuid mõned tüved on kahjulikud ja võivad põhjustada tõsiseid haigusi.
    E. coli mängib kaasaegses biotehnikas ja tööstuslikus mikrobioloogias olulist rolli, kuna baktereid on lihtne manipuleerida. Tavalised laborirakendused, mis hõlmavad sageli E. coli kasutamist, nt rekombinantse desoksüribonukleiinhappe (DNA) loomiseks või mudelorganismina toimimiseks.
    E. coli on väga mitmekülgne peremeesorganism heteroloogsete valkude tootmiseks ja E. coli rekombinantsete valkude tootmiseks on saadaval mitmesuguseid valgu ekspressioonisüsteeme. Kasutades plasmiide, mis võimaldavad valgu kõrgetasemelist ekspressiooni, saab bakteritesse viia geene, mis võimaldab toota selliseid valke suurtes kogustes tööstuslikes käärimisprotsessides.
    E.coli kasutatakse insuliini tootmiseks rakutehastena. Edasised rakendused hõlmavad modifitseeritud E. coli rakkude kasutamist vaktsiinide ja immobiliseeritud ensüümide väljatöötamiseks ja tootmiseks, biokütuste tootmiseks ning bioremediatsiooniks.
    Tüvi K-12 on E. coli mutantne vorm, mis ekspresseerib üle ensüümi Leeliseline fosfataas (ALP). See mutatsioon tekib ensüümi pidevalt kodeeriva geeni defekti tõttu. Kui geen toodab toodet ilma inhibeerimiseta, nimetatakse seda konstitutiivseks aktiivsuseks. Seda spetsiifilist mutantset vormi kasutatakse ALP ensüümi eraldamiseks ja puhastamiseks.
    E. coli baktereid kasutatakse laialdaselt ka rakutehastena. Tehismikroobe (nt baktereid) ja taimerakke saab kasutada nn rakutehastena. Need geneetiliselt muundatud rakud toodavad molekule, kemikaale, polümeere, valke ja muid aineid, mida kasutatakse näiteks farmaatsia-, toidu- ja keemiatööstuses. Selliste biotehnoloogiliste rakkude sisemuses toodetud molekulide vabastamiseks on ultraheli lüüs tavaline meetod rakuseinte katkestamiseks ja sihtainete ülekandmiseks ümbritsevasse vedelikku. Loe lähemalt biotehnoloogiliste rakkude lüüsist!

    Ultraheli DNA lõikamine

    Ultraheli nihkejõud on tavaliselt kasutatav meetod molekulide, organellide ja valkude vabastamiseks raku sisemusest ning DNA ahelate purustamiseks tükkideks. Akustiline kavitatsioon purustab rakuseinad ja membraanid, et eraldada rakkudest DNA ja tekitada umbes 600-kohaseid fragmente – 800 bp pikk, mis sobib ideaalselt analüüsiks.
    Klõpsake siin, et saada lisateavet DNA killustumise ultraheli homogenisaatorite kohta!

    Kirjandus / Viited


    Suure jõudlusega ultraheli! Hielscheri tootevalik hõlmab kogu spektrit kompaktsest labori ultrasonikaatorist üle pink-top ühikute kuni täistööstuslike ultraheli süsteemideni.

    Hielscher Ultrasonics toodab suure jõudlusega ultraheli homogenisaatoreid alates Lab kuni tööstuslik suurus.

    Meil on hea meel teie protsessi arutada.

    Let's get in contact.