Yeni Nesil Dizileme için Ultrasonik DNA Parçalama
Yeni Nesil Dizileme (NGS), genomik DNA ipliklerini dizilemek ve genom kütüphaneleri oluşturmak için genomik DNA’nın güvenilir biçimde kesilmesini ve parçalanmasını gerektirir. DNA’nın kontrollü biçimde DNA parçalarına ayrılması, DNA dizilenmeden önce gerçekleştirilmesi gereken temel bir numune hazırlama adımıdır. Ultrasonikasyonun, DNA’yı belirli uzunlukta parçalara ayırmak için verimli ve güvenilir bir teknik olduğu kanıtlanmıştır. Ultrasonik DNA parçalama protokolleri, yeniden üretilebilir parçalama sonuçları elde eder. Hielscher sonikatörleri, çalışma parametreleri aracılığıyla hassas biçimde kontrol edilebilen çok çeşitli genomik DNA parça boyutu dağılımları üretebilir. Hielscher ultrasonik DNA kesme sistemleri tekli ve çoklu viyallerin yanı sıra mikroplakalar için de sunulduğundan, numune hazırlama son derece verimli hâle gelir.
UIP400MTP plaka sonikatörü yüksek numune işleme kapasitesine sahip numune hazırlama için çok kuyucuklu plakalardaki, mikrotitrasyon plakalarındaki ve 96 kuyucuklu plakalardaki numunelere eşit biçimde sonikasyon uygular
- tekrarlanabilir / yeniden üretilebilir sonuçlar
- belirli bir parça uzunluğu elde etmek için hassas biçimde ayarlanabilirlik
- hızlı işleme
- tutarlı DNA parçalama sonuçları
- her türlü numune hacmi için cihazlar (ör. çoklu viyaller veya mikroplakalar)
- yüksek numune işleme kapasitesi
- hassas sıcaklık kontrolü
- basit, kullanıcı dostu kullanım
Yeni Nesil Dizileme: Kütüphane Hazırlama için Ultrasonik DNA Parçalama
Yeni nesil dizileme gerçekleştirmek için (1) kütüphane hazırlama, (2) dizileme ve (3) veri analizi olmak üzere üç temel adım uygulanmalıdır. Kütüphane hazırlama sırasında DNA parçalanır, ardından tek bir adenin bazı eklenerek parça uçları onarılır (düzeltilir) ve hedef parçalar çift iplikli DNA’ya dönüştürülür. Son olarak, nihai kütüphane DNA ürününün dizileme için miktarının belirlenebilmesi amacıyla adaptör adı verilen yapılar ligasyon, PCR veya tagmentasyon yoluyla bağlanır.
Sonikasyon ile DNA Parçalama: Özellikle daha uzun DNA parçalarını kolayca okuyamayan Illumina gibi kısa okuma dizileme teknolojileri kullanıldığında, DNA iplikleri belirli bir boyuta kadar parçalanmalıdır; bu, ultrasonikasyon ile güvenilir biçimde gerçekleştirilebilir.
Ultrasonikasyon, DNA, RNA ve kromatin parçalama için güvenilir biçimde kullanılabilir.
Yeni Nesil Dizileme – Kütüphane Hazırlama
Ultrasonik DNA parçalama, yeni nesil dizileme (NGS) platformları için DNA dizileme kütüphanelerinin hazırlanmasında yaygın olarak uygulanır. Bu teknik, DNA moleküllerini istenen boyut aralığında daha küçük parçalara ayırmak için kullanılır ve böylece kütüphane hazırlamanın sonraki adımlarını kolaylaştırır. Ultrasonik DNA parçalama, genomik DNA’yı sonraki işleme ve dizileme adımlarına uygun daha küçük parçalara ayırmak için genellikle NGS iş akışlarının kütüphane hazırlama adımında gereklidir. Kullanılan belirli dizileme platformuna uygun boyut aralığında DNA parçaları üreterek dizileme deneyinin başarısının sağlanmasında kritik bir rol oynar.
0 – 15 min ultrasonikasyona maruz bırakılan E. coli EDL933 genomik DNA’sının elektroforetik analizleri. L, DNA merdivenini gösterir. (Basselet et al. 2008)
Yeni Nesil Dizileme – İşlem Adımları:
- Ultrasonik DNA Parçalama: Kütüphane oluşturulmadan önce genomik DNA, daha küçük ve daha kolay işlenebilir parçalara ayrılır. Ultrasonik parçalama, DNA moleküllerini istenen boyut aralığındaki parçalara ayırmak için yüksek frekanslı ses dalgalarıyla kesme işlemini içerir. Bu adım kritiktir, çünkü daha sonra üretilen dizileme okumalarının kullanılan dizileme platformu için uygun uzunlukta olmasını sağlamaya yardımcı olur. Parçaların boyut aralığı, dizileme deneyinin özel gereksinimlerine göre ayarlanabilir.
- PCR ile Klonal Çoğaltma: Ultrasonik parçalamadan sonra DNA parçaları, nihai DNA dizileme kütüphanelerini oluşturmak için uç onarımı, adaptör ligasyonu ve PCR amplifikasyonundan geçirilir. Bu adımlar, dizileme platformuna bağlanmak için gerekli adaptör dizilerini ekleyerek ve PCR amplifikasyonu için primer bağlanma bölgeleri sağlayarak parçalanmış DNA moleküllerini dizileme işlemine hazırlar.
- Sentez Yoluyla DNA Dizileme: Dizileme kütüphaneleri hazırlandıktan sonra sentez yoluyla DNA dizileme (SBS) işlemi başlar. SBS sırasında DNA dizisi, tamamlayıcı ipliğe nükleotitlerin sıralı olarak eklenmesiyle belirlenir. Bu adım, nükleotitlerin yapıya katılması, görüntüleme ve kesimden oluşan döngüsel reaksiyonları içerir ve yapıya katılan nükleotitlerin yaydığı floresan sinyallere dayanarak DNA dizisinin belirlenmesini mümkün kılar.
- Kitlesel Paralel Dizileme: Son adımda, mekânsal olarak birbirinden ayrılmış ve çoğaltılmış DNA kalıpları, kitlesel paralel biçimde eş zamanlı olarak dizilenir. Bu yüksek işleme kapasitesine sahip dizileme yaklaşımı, tek bir dizileme çalışmasında milyonlarca ila milyarlarca dizileme okumasının üretilmesini mümkün kılarak DNA dizilerinin verimli ve hızlı biçimde belirlenmesini sağlar.
Ultrasonik DNA Parçalama Nasıl Çalışır?
Akustik numune işleme olarak da bilinen sonikasyon, DNA’yı parçalamak için yaygın olarak kullanılan bir yöntemdir. Ultrasonik DNA kesme için numuneler, kontrollü koşullar altında ultrasonik dalgalara maruz bırakılır. Ultrasonik DNA parçalamanın çalışma prensibi, ultrason dalgalarının oluşturduğu titreşimlere ve kavitasyona dayanır. Ultrasonik (akustik) kavitasyondan kaynaklanan kesme kuvvetleri, yüksek molekül ağırlıklı DNA moleküllerini parçalar. Şiddet (genlik, süre), darbe modu ve sıcaklık gibi sonikasyon ayarları, DNA’nın istenen belirli uzunlukta DNA parçalarına hassas biçimde ayrılmasını mümkün kılar. Ultrasonikasyon kullanılarak DNA sıklıkla 100 ila 600 bp uzunluğa indirilirken, daha hafif ultrasonik koşullar uygulandığında 1300 bp’ye kadar daha uzun DNA parçaları elde edilebilir.
ChIP – kromatin immünopresipitasyonu sırasında ultrasonik DNA kesme
CC-BY-SA.03 kapsamında Jkwchui’den uyarlanmıştır
DNA Bozunmasını Önlemek için Sıcaklık Kontrolü
DNA’nın çift iplikli moleküler yapısı, yüksek sıcaklıklara karşı son derece hassastır; bu nedenle numune hazırlama adımları sırasında sıcaklığın hassas biçimde kontrol edilmesi, güvenilir analiz sonuçları için kritik bir faktördür.
İster Hielscher prob sonikatörlerini ister VialTweeter veya UIP400MTP sonikatörünü kullanın, takılabilir bir sıcaklık sensörü ve akıllı cihaz yazılımı sayesinde sürekli sıcaklık izleme ve kontrolü sağlanır. Sıcaklığı belirli bir aralıkta tutmak için üst ve alt sıcaklık sınırı ayarlayabilirsiniz. Böylece sonikatör, bu sıcaklık sınırı aşıldığında hemen duraklar ve sıcaklık ayarlanan ∆T kadar düştüğünde sonikasyona otomatik olarak devam eder.
Hielscher sonikatörlerinin gelişmiş yazılımı, ideal numune işleme koşullarının güvenilir biçimde korunmasını sağlar.
UIP400MTP Çok Kuyucuklu Plaka Sonikatörü ile Kitlesel Numune DNA Parçalama
Yaşam bilimlerinde numune sayıları son on yılda önemli ölçüde artmıştır. Bu, karşılaştırılabilir ve geçerli sonuçlar elde etmek için çok yüksek sayıda numunenin (ör. mikroplaka başına 384, 1536 veya 3456 kuyucuk) numune hazırlama ve analiz sırasında sürekli olarak aynı koşullarda işlenmesi gerektiği anlamına gelir. Hielscher Ultrasonics, UIP400MTP ile kitlesel numune işleme eğilimini takip etmektedir. UIP400MTP, mikroplakalar kullanılarak numune hazırlamaya yönelik bir sonikatördür. UIP400MTP, 6, 12, 24, 48, 96, 384, 1536 veya 3456 kuyucuklu plakaları işleyebilir. Mikroplaka türüne bağlı olarak her kuyucuk, tipik olarak onlarca nanolitreden birkaç mililitreye kadar numune hacmi alabilir. Yaşam bilimleri araştırmalarında yaygın olarak kullanılan UIP400MTP, ELISA (enzime bağlı immünosorbent testi) veya PCR gibi testlerden ve protein analizlerinden önce numune hazırlamanın yanı sıra CHiP ve CHiP-seq öncesinde kromatin hazırlama, histon modifikasyonlarının belirlenmesi ve diğer analitik işlemler (ör. jel elektroforezi, kütle spektrometrisi) için çok yaygın olarak kullanılır.
PCR plakalarının yüksek işleme kapasitesiyle işlenmesi hakkında daha fazla bilgi edinin!
10 Viyale Kadar Numune Hazırlama için VialTweeter
VialTweeter, aynı anda 10 viyale kadar etkili ve rahat sonikasyona olanak tanıyan, yaygın olarak kullanılan bir VialTweeter laboratuvar sonikatörüdür. Viyallere ve deney tüplerine (ör. Eppendorf viyalleri, kriyo viyalleri, santrifüj tüpleri) dolaylı olarak sonikasyon uygulandığından, her türlü çapraz kontaminasyon önlenir. Her numuneye aynı ultrason şiddeti aktarıldığı için tüm sonikasyon sonuçları homojen ve yeniden üretilebilirdir. VialTweeter, diğer dijital cihazlarımız gibi tüm akıllı özellikleri (ör. akıllı menü, programlanabilir ayarlar, sıcaklık kontrolü, uzaktan kontrol vb.) sunarak en yüksek kullanıcı konforunu sağlar.
Mikrokuyucuklu Plakalar için Çok Parmaklı Problar
UP200Ht ve UP200St ultrasonik prob homojenizatörleri için sunulan 4 veya 8 parmaklı çok parmaklı problar, birden fazla numuneye aynı anda aynı koşullarda sonikasyon uygulamak için rahat bir seçenektir. Örneğin MTP-24-8-96 sonotrodu, otomatik sistemlere entegrasyon veya çok kuyucuklu plakaların kuyucuklarında verimli manuel numune hazırlama için ideal olan sekiz parmaklı bir probdur. Çok parmaklı sonotrot, çoğunlukla beherlerin ve deney tüplerinin standart bir ultrasonik sonotrot kullanılarak işlendiği laboratuvarlarda otomasyon için idealdir. Çok parmaklı problar ile standart problar birkaç dakika içinde hızla birbirleriyle değiştirilebilir ve böylece tek problu sonikatör, çok problu ultrasonik parçalayıcıya dönüştürülür.
DNA Parçalama için Hielscher Sonikatörleri
Hielscher Ultrasonics, DNA, RNA ve kromatin parçalama için ultrason tabanlı çeşitli platformlar sunar. Bu farklı platformlar; ultrasonik probları (sonotrotları), birden fazla tüpte veya çok kuyucuklu plakalarda (ör. 96 kuyucuklu plakalar, mikrotitrasyon plakaları) eş zamanlı numune hazırlama için dolaylı sonikasyon çözümlerini, sonoreaktörleri ve ultrasonik cuphornları içerir. DNA kesme için kullanılan tüm platformlar, hassas biçimde kontrol edilebilen ve yeniden üretilebilir sonuçlar sağlayan, frekansı ayarlanmış yüksek performanslı ultrasonik işlemcilerle çalışır.
Her Numune Sayısı ve Boyutu için Ultrasonik İşlemciler
Hielscher çoklu numune sonikatörleri VialTweeter (10 deney tüpüne kadar) ve UIP400MTP (mikroplakalar / çok kuyucuklu plakalar için) ile yoğun ve hassas biçimde kontrol edilebilen ultrasonikasyon sayesinde, istenen DNA parça boyutu dağılımı ve verimi elde edilirken numune işleme süresini azaltmak mümkün olur. Ultrasonik DNA parçalama, numune hazırlamayı verimli, güvenilir ve ölçeklenebilir hâle getirir. Sürekli kontrol edilen ultrason uygulanarak protokoller tek bir numuneden çok sayıda numuneye doğrusal olarak ölçeklenebilir.
Bir ila beş parmaklı prob sonikatörleri, daha az sayıda numunenin hazırlanması için idealdir. Hielscher laboratuvar sonikatörleri çeşitli boyutlarda sunulduğundan, uygulamanız ve gereksinimleriniz için ideal cihazı önerebiliriz.
Hassas İşlem Kontrolü
Hassas biçimde kontrol edilebilen sonikasyon ayarları kritik öneme sahiptir; çünkü aşırı sonikasyon DNA, RNA ve kromatini yok edebilirken, yetersiz ultrasonik kesme çok uzun DNA ve kromatin parçalarıyla sonuçlanır. Hielscher dijital sonikatörleri, hassas sonikasyon parametrelerine kolayca ayarlanabilir. Aynı prosedürün hızlı biçimde tekrarlanması için belirli sonikasyon ayarları, programlanmış ayarlar olarak da kaydedilebilir.
Tüm sonikasyon işlemleri otomatik olarak kayıt altına alınır ve dahili bir SD kartta CSV dosyası olarak saklanır. Bu, gerçekleştirilen denemelerin doğru biçimde belgelenmesini sağlar ve sonikasyon çalışmalarının kolayca gözden geçirilmesini mümkün kılar.
Tarayıcı üzerinden uzaktan kontrol ile tüm dijital sonikatörler, herhangi bir standart tarayıcı aracılığıyla çalıştırılabilir ve izlenebilir. LAN bağlantısı çok basit bir tak ve çalıştır kurulumu sağladığından, ek yazılım yüklenmesi gerekmez.
Ultrasonik Numune Hazırlamada En Yüksek Kullanım Kolaylığı
Tüm Hielscher sonikatörleri, yüksek performanslı ultrason sağlarken aynı zamanda her zaman son derece kullanıcı dostu ve kolay kullanılabilir olacak şekilde tasarlanmıştır. Tüm ayarlar, renkli dokunmatik ekran veya tarayıcı üzerinden uzaktan kontrol aracılığıyla kolayca erişilebilen açık bir menüde düzenli biçimde yapılandırılmıştır. Programlanabilir ayarlara ve otomatik veri kaydına sahip akıllı yazılım, güvenilir ve yeniden üretilebilir sonuçlar için optimum sonikasyon ayarlarını sağlar. Sade ve kullanımı kolay menü arayüzü, Hielscher sonikatörlerini kullanıcı dostu ve verimli cihazlar hâline getirir.
Aşağıdaki tablo, DNA ve RNA parçalama, hücre lizisi ve protein ekstraksiyonu gibi numune hazırlama görevleri için ideal olan laboratuvar sonikatörlerimizin yaklaşık işleme kapasitesi hakkında fikir verir:
| Cihaz | Güç [W] | Tip | Hacim [mL] |
|---|---|---|---|
| UIP400MTP | 400 | mikroplakalar için | 6 – 3456 kuyucuk | VialTweeter | 200 | 10 viyale kadar, ayrıca kelepçeyle bağlama olanağı | 0,5 – 1,5 |
| UP50H | 50 | prob tipi | 0,01 – 250 |
| UP100H | 100 | prob tipi | 0,01 – 500 |
| UP200Ht | 200 | prob tipi | 0,1 – 1000 |
| UP200St | 200 | prob tipi | 0,1 – 1000 |
| UP400St | 400 | prob tipi | 5,0 – 2000 |
| CupHorn | 200 | CupHorn, sonoreaktör | 10 – 200 |
| GDmini2 | 200 | kontaminasyonsuz akış hücresi |
Bizimle İletişime Geçin! / Bize Sorun!
Ultrasonik çoklu numune hazırlama ünitesi VialTweeter aynı anda 10 viyale kadar sonikasyona olanak tanır. Kelepçeyle bağlanan VialPress cihazıyla, yoğun sonikasyon için 4 adede kadar ek tüp ön yüzeye bastırılabilir.
MTP-24-8-96 sonotrodu, mikrotitrasyon plakalarının kuyucuklarına sonikasyon uygulamak için sekiz ultrasonik proba sahiptir.
Literatür / Kaynaklar
- Qiyun Liang, Christoph Ratzke (2025): Lysing diverse bacteria with the Hielscher UIP400MTP for DNA sequencing. Protocol Uni Tübingen 2025.
- Poptsova, M., Il’icheva, I., Nechipurenko, D. et al. (2014): Non-random DNA fragmentation in next-generation sequencing. Scientific Reports 4, 4532; 2014.
- Basselet P., Wegrzyn G., Enfors S.-O., Gabig-Ciminska M. (2008): Sample processing for DNA chip array-based analysis of enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC). Microbial Cell Factories 7:29. 2008.
- Wang Y., Joshu C.E., Curtis S.D., Douville C., Burk V.A., Ru M., Popoli M., Ptak J., Dobbyn L., Silliman N., Coresh J., Boerwinkle E., Prizment A., Bettegowda C., Kinzler K.W., Papadopoulos N., Platz E.A., Vogelstein B. (2025): Detection of cancers three years prior to diagnosis using plasma cell-free DNA. Cancer Discovery 2025 May.
- Doublier S., Riganti Ch., Voena C., Costamagna C., Aldieri E., Pescarmona G., Ghigo D., Bosia A. (008): RhoA Silencing Reverts the Resistance to Doxorubicin in Human Colon Cancer Cells. Molecular Cancer Research 6(10), 2008.
- Fredlund E., Gidlund A., Olsen M., Börjesson T., Spliid N.H.H., Simonsson M. (2008): Method evaluation of Fusarium DNA extraction from mycelia and wheat for down-stream real-time PCR quantification and correlation to mycotoxin levels. Journal of Microbiological Methods 2008.
- Fritsche C., Sitz M., Weiland N., Breitling R., Pohl H.-D. (2007): Characterization of the growth behavior of Leishmania tarentolae – a new expression system for recombinant proteins. Journal of Basic Microbiology 47, 2007. 384–393.
- Ristola M., Arpiainen S., Saleem M. A., Mathieson P. W., Welsh G. I., Lehtonen S., Holthöfer H. (2009): Regulation of Neph3 gene in podocytes – key roles of transcription factors NF-κB and Sp1. BMC Molecular Biology 10:83, 2009.
- Rodriguez J., Vives L., Jorda M., Morales C., Munoz M., Vendrell E., Peinado M. A. (2008): Genome-wide tracking of unmethylated DNA Alu repeats in normal and cancer cells. Nucleic Acids Research Vol. 36, No. 3, 2008. 770-784.
- Weiske J. Huber O. (2006): The Histidine Triad Protein Hint1 Triggers Apoptosis Independent of Its Enzymatic Activity. The Journal of Biological chemistry. Vol. 281, No. 37, 2006. 27356–27366.
Bilinmesi Gerekenler
Yeni Nesil Dizileme Nedir?
Yeni Nesil Dizileme (NGS), yüksek işleme kapasitesine sahip dizileme veya ikinci nesil dizileme olarak da adlandırılan yeni nesil dizileme, her çalışmada milyonlarca parçadan oluşan çok büyük (kitlesel) miktarlardaki DNA’nın eş zamanlı olarak paralel biçimde dizilendiği kitlesel paralel dizileme yaklaşımını ifade eder.
Yeni nesil dizileme gerçekleştirmek için şu üç temel adım
- kütüphane hazırlama,
- dizileme ve
- veri analizi
gereklidir.
Kütüphane hazırlama sırasında DNA iplikleri, belirli uzunlukta DNA parçalarına ayrılmalıdır. Sonikasyon, DNA’yı parçalamak için tercih edilen tekniklerden biridir.
DNA dizileme işlemi sırasında DNA’daki nükleotitlerin sırası – nükleik asit dizisi olarak bilinir – belirlenir. Nükleik asit dizisi, bilgiyi kodlayan dört nükleotit bazından – adenin, sitozin, guanin, timin – oluşur.
DNA ve RNA dizileme, genomik araştırmalarda, kanser araştırmalarında, nadir ve karmaşık hastalıkların araştırılmasında, mikrobiyal araştırmalarda, tarımsal genomikte ve diğer birçok araştırma alanında yoğun biçimde kullanıldığından, yeni nesil dizileme yaşam bilimleri ve kişiselleştirilmiş tıp araştırmalarını ileri taşımaktadır.
Yeni Nesil Dizileme ile Sanger Dizilemesinin Karşılaştırılması
Yeni Nesil Dizileme (NGS) ile çok büyük sayıda genomik numuneyi dizilemek mümkünken, Sanger Dizilemesi (zincir sonlandırma yöntemi veya Birinci Nesil Dizileme olarak da bilinir) yalnızca az sayıda numuneyi dizileme kapasitesine sahiptir. Sanger dizilemesi, bir seferde yalnızca tek bir DNA parçasını diziler ve tek bir günde tamamlanabilir. Doğruluğu nedeniyle Sanger dizilemesi, yeni nesil dizileme ile elde edilen sonuçları doğrulamak için kullanılan altın standart teknoloji olarak da kabul edilir.
Sanger dizilemesi, yaklaşık 800bp okuma uzunluklarına ulaşır (zenginleştirilmemiş DNA ile tipik olarak 500–600bp). Sanger dizilemesindeki daha uzun okuma uzunlukları, özellikle genomun tekrarlayan bölgelerinin dizilenmesi açısından diğer dizileme yöntemlerine göre önemli avantajlar sunar. Kısa okuma dizisi verilerinin getirdiği güçlük, özellikle yeni genomların (de novo) dizilenmesinde ve tipik olarak kanser genomlarında veya kromozomların yapısal varyasyon gösteren bölgelerinde görülen, yüksek düzeyde yeniden düzenlenmiş genom segmentlerinin dizilenmesinde sorun oluşturur. [krş. Morozova and Marra, 2008]
DNA – Deoksiribonükleik Asit – Biçimleri ve İşlevleri
Her DNA biçimi, onkoloji, genetik, adli bilimler ve evrimsel biyoloji dâhil olmak üzere geniş bir araştırma alanı yelpazesine katkıda bulunan kendine özgü özelliklere ve uygulamalara sahiptir. Hielscher sonikatörleri, analiz amaçlarınız için DNA ve RNA’yı izole etmek ve parçalamak üzere son derece verimli ve güvenilir bir çözümdür. Aşağıdaki listede belirli DNA biçimlerini açıklıyor ve bunları biyolojik bağlamlarına ve işlevlerine göre sınıflandırıyoruz:
- Genomik DNA (gDNA)
Genomik DNA (gDNA): Hem kodlayan (genler) hem de kodlamayan bölgeler dâhil olmak üzere bir organizmadaki DNA’nın tamamı. - Hücre Dışı DNA
Dolaşımdaki Tümör DNA’sı (ctDNA): Tümör hücreleri tarafından kan dolaşımına salınan DNA parçaları.
Hücresiz DNA (cfDNA): Çeşitli dokulardan kaynaklanan ve kan dolaşımında serbestçe dolaşan DNA parçaları. - Kromozom Dışı Halkasal DNA (eccDNA): Ökaryotik hücrelerde kromozomların dışında bulunan halkasal DNA molekülleri.
Viral DNA: Konak genomuna entegre olmuş veya epizomal DNA biçiminde bulunan, virüslerden kaynaklanan DNA. - Mitokondriyal DNA
Mitokondriyal DNA (mtDNA): Mitokondrilerde bulunan, anneden kalıtılan ve enerji üretiminde rol oynayan DNA. - Plazmit DNA’sı
Plazmit DNA’sı: Kromozomal DNA’dan bağımsız olarak çoğalan, bakterilerde yaygın olarak bulunan ve genetik mühendisliğinde kullanılan küçük, halkasal DNA molekülleri. - Çekirdek DNA’sı
Çekirdek DNA’sı (nDNA): Ökaryotik hücrelerin çekirdeğinde bulunan ve bir organizmadaki genetik materyalin çoğunluğunu oluşturan DNA. - Tek Hücre DNA’sı
Tek Hücre DNA’sı (scDNA): Tek bir hücreden elde edilen ve tek tek hücreler düzeyinde ayrıntılı genomik analiz için kullanılan DNA. - Rekombinant DNA
Rekombinant DNA (rDNA): Birden fazla kaynaktan gelen genetik materyali bir araya getirmek için laboratuvarda genetik rekombinasyon yöntemleriyle oluşturulan DNA molekülleri. - Özelleşmiş Biçimler
Çevresel DNA (eDNA): Kaynak organizmalar izole edilmeden çevresel numunelerden (toprak, su) toplanan DNA
Antik DNA (aDNA): Eski örneklerden elde edilen ve evrimsel biyoloji ile eski popülasyonlar hakkında bilgi sağlayan DNA. - Kromozomal DNA
Kromozomal DNA: Hücre çekirdeğindeki kromozomları oluşturan ve hem kodlayan hem de kodlamayan bölgeleri kapsayan DNA. - Viral ve Sentetik Biçimler
Viral DNA: Konak genomlarına entegre olmuş veya bağımsız yapılar olarak bulunabilen, virüslerden elde edilen DNA.
Sentetik DNA: Kimyasal işlemlerle oluşturulan, genellikle araştırmalarda ve biyoteknolojide kullanılan, yapay olarak sentezlenmiş DNA dizileri.
Hielscher Ultrasonics, laboratuvar ölçeğinden endüstriyel ölçeğe kadar yüksek performanslı ultrasonik homojenizatörler üretir.