Лизис клеток BL21 с помощью обработки ультразвуком
Клетки BL21 представляют собой штамм E. coli, широко используемый в исследовательских лабораториях, биотехнологии и промышленном производстве благодаря способности высокоэффективно экспрессировать белки. Ультразвуковое разрушение клеток, лизис и экстракция белков – распространённый метод выделения и сбора целевых белков из внутреннего содержимого клеток BL21. Обработка ультразвуком полностью разрушает клетку и высвобождает все заключённые в ней белки, делая доступными 100% белка.
Клетки BL21 для экспрессии белков
BL21 – химически компетентный бактериальный штамм E. coli, подходящий для трансформации и экспрессии белков на высоком уровне с использованием системы индукции T7 РНК-полимераза–IPTG. Клетки BL21 обеспечивают высокоэффективную экспрессию белка любого гена, находящегося под контролем промотора T7. Штамм E. coli BL21(DE3) представляет собой штамм для производства белков на основе РНК-полимеразы T7, используемый в сочетании с экспрессионными векторами на основе промотора T7, и широко применяется в лабораториях и промышленности для производства рекомбинантных белков. В BL21(DE3) экспрессия гена, кодирующего рекомбинантный белок, транскрибируется РНК-полимеразой T7 (T7 RNAP), кодируемой в хромосоме, которая осуществляет транскрипцию в восемь раз быстрее обычной РНК-полимеразы E. coli. Это делает штамм BL21(DE3) высокоэффективным и превращает его в одну из наиболее предпочтительных клеточных систем экспрессии белков.
Протокол ультразвукового лизиса и экстракции белков из клеток BL21
Лизис клеток BL21 чаще всего проводят с помощью обработки ультразвуком в сочетании с лауроилсаркозинатом натрия (также известным как саркозил) в качестве лизирующего буфера. Преимущества ультразвукового разрушения клеток и экстракции белков заключаются в надёжности, воспроизводимости, а также в простоте, безопасности и быстроте работы ультразвуковых устройств. Приведённый ниже протокол содержит пошаговые указания по ультразвуковому лизису клеток BL21:
- Для удаления белков-шаперонов бактериальные осадки BL21 ресуспендировали в 50 ml охлаждённого на льду буфера Sodium Tris-EDTA (STE) (состоящего из 10 mM Tris-HCL, pH 8,0, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl с добавлением 100 mM PMSF).
- Затем добавляют 500 ul лизоцима (10 mg/ ml) и инкубируют клетки на льду в течение 15 min.
- После этого добавляют 500 ul DTT и 7 ml саркозила (10% (w/v), приготовленного в буфере STE).
- Необходимо поддерживать все буферы для очистки охлаждёнными на льду и постоянно держать образцы на льду. По возможности все этапы очистки следует проводить в холодной комнате.
- Для ультразвукового лизиса и экстракции белков образцы подвергают обработке ультразвуком с помощью многопробного ультразвукового устройства VialTweeter в течение 4 x 30 sec при амплитуде 100% с интервалом 2 min между обработками ультразвуком. В качестве альтернативы можно использовать ультразвуковой гомогенизатор зондового типа с микронаконечником, например UP200Ht с S26d2 (3 x 30 sec, пауза 2 min. между ультразвуковыми циклами, амплитуда 80%).
- Для последующих этапов очистки образцы необходимо держать на льду или, в качестве альтернативы, хранить при -80°C до дальнейшей обработки.
Ультразвуковой разрушитель клеток UP200St с микронаконечником S26d2 для лизиса и экстракции белков
Ультразвуковой лизис при точном контроле температуры
Точный и надёжный контроль температуры имеет решающее значение при работе с биологическими образцами. Высокие температуры вызывают термическую деградацию белков в образцах.
Как и все механические методы пробоподготовки, обработка ультразвуком выделяет тепло. Однако при использовании VialTweeter температуру образцов можно хорошо контролировать. Мы предлагаем различные способы мониторинга и регулирования температуры образцов при их подготовке к анализу с помощью VialTweeter и VialPress.
- Мониторинг температуры образца: ультразвуковой процессор UP200St, приводящий в действие VialTweeter, оснащён интеллектуальным программным обеспечением и подключаемым датчиком температуры. Подключите датчик температуры к UP200St и поместите наконечник датчика температуры в одну из пробирок с образцами. С помощью цифрового цветного сенсорного дисплея в меню UP200St можно задать определённый диапазон температур для обработки образца ультразвуком. Ультразвуковое устройство автоматически остановится при достижении максимальной температуры и приостановит работу, пока температура образца не снизится до нижнего значения заданной температуры ∆. Затем обработка ультразвуком автоматически возобновится. Эта интеллектуальная функция предотвращает деградацию, вызванную нагревом.
- Блок VialTweeter можно предварительно охладить. Поместите блок VialTweeter (только сонотрод без преобразователя!) в холодильник или морозильную камеру: предварительное охлаждение титанового блока помогает отсрочить повышение температуры образца. По возможности сам образец также можно предварительно охладить.
- Используйте сухой лёд для охлаждения во время обработки ультразвуком. Заполните неглубокий поддон сухим льдом и поместите VialTweeter на лёд, чтобы тепло могло быстро рассеиваться.
Клиенты по всему миру используют VialTweeter и VialPress для ежедневной пробоподготовки в биологических, биохимических, медицинских и клинических лабораториях. Интеллектуальное программное обеспечение и система контроля температуры процессора UP200St обеспечивают надёжный контроль температуры и предотвращают деградацию образцов, вызванную нагревом. Ультразвуковая пробоподготовка с помощью VialTweeter и VialPress обеспечивает высоконадёжные и воспроизводимые результаты!
Найдите оптимальный ультразвуковой разрушитель клеток для вашей задачи лизиса
Hielscher Ultrasonics – производитель с многолетним опытом выпуска высокопроизводительных ультразвуковых разрушителей клеток и гомогенизаторов для лабораторий, настольных систем и систем промышленного масштаба. Объём вашей культуры бактериальных клеток, цель исследования или производства и объём клеток, подлежащих обработке за час или день, – важнейшие факторы при выборе подходящего ультразвукового разрушителя клеток для вашей задачи.
Hielscher Ultrasonics предлагает различные решения для одновременной обработки ультразвуком нескольких образцов (до 10 пробирок с помощью VialTweeter) и массовой обработки образцов (например, микротитрационных планшетов / планшетов ELISA с помощью UIP400MTP), а также оборудование от классических лабораторных ультразвуковых устройств зондового типа с различными уровнями мощности от 50 до 400 ватт до полностью промышленных ультразвуковых процессоров мощностью до 16 000 ватт на устройство для коммерческого разрушения клеток и экстракции белков на крупных производствах. Все ультразвуковые устройства Hielscher рассчитаны на работу в режиме 24/7/365 при полной нагрузке. Прочность и надёжность – основные характеристики наших ультразвуковых устройств.
Все цифровые ультразвуковые гомогенизаторы оснащены интеллектуальным программным обеспечением, цветным сенсорным дисплеем и автоматическим протоколированием данных, что делает ультразвуковое устройство удобным рабочим инструментом в лабораториях и на производстве.
Сообщите нам, какие клетки, в каком объёме, с какой частотой и с какой целью вам необходимо обрабатывать в ваших биологических образцах. Мы порекомендуем вам наиболее подходящий ультразвуковой разрушитель клеток с учётом требований вашего процесса.
Приведённая ниже таблица даёт представление о приблизительной производительности обработки наших ультразвуковых систем: от компактных ручных гомогенизаторов и многопробных ультразвуковых устройств до промышленных ультразвуковых процессоров для коммерческого применения:
| Объём партии | Расход | Рекомендуемые устройства |
|---|---|---|
| 96-луночные / микротитрационные планшеты | не применимо | UIP400MTP |
| 10 пробирок по 0,5–1,5mL | не применимо | VialTweeter с UP200St |
| 0,01–250mL | 5–100mL/min | UP50H |
| 0,01–500mL | 10–200mL/min | UP100H |
| 10–2000mL | 20–400mL/min | UP200Ht, UP400St |
| 0,1–20L | 0,2–4L/min | UIP2000hdT |
| 10–100L | 2–10L/min | UIP4000hdT |
| не применимо | 10–100L/min | UIP16000 |
| не применимо | больше | кластер устройств UIP16000 |
Свяжитесь с нами! / Задайте нам вопрос!
Ультразвуковое устройство UIP400MTP для планшетов для высокопроизводительного разрушения клеток в 96-луночных планшетах
Ультразвуковое устройство UP200Ht с микронаконечником S26d2 размером 2mm для обработки ультразвуком небольших образцов
Узнайте больше о том, как использовать ультразвуковой гомогенизатор тканей для эффективного и надёжного приготовления буферных растворов!
Полезные сведения
Бактерии Escherichia coli
Escherichia coli – тип неспорообразующих грамотрицательных бактерий, характеризующихся формой прямой палочки. Бактерии E.coli присутствуют в окружающей среде, пищевых продуктах и кишечнике людей и животных. E. coli обычно подвижны благодаря перитрихиальным жгутикам, но существуют и неподвижные типы. E.coli – так называемые факультативно-анаэробные хемоорганотрофные организмы, то есть они способны как к дыхательному, так и к бродильному метаболизму. Большинство типов E.coli безвредны и выполняют полезные функции в организме, например подавляют рост вредных видов бактерий, синтезируют витамины и т. д.
Бактериальные клетки Escherichia coli так называемого типа B представляют собой особую категорию штаммов E.coli, широко используемых в исследованиях таких механизмов, как чувствительность к бактериофагам или системы рестрикции–модификации. Кроме того, бактерии E.coli ценятся как надёжный рабочий инструмент для экспрессии белков в биотехнологических лабораториях и лабораториях наук о жизни. Например, E.coli используют для синтеза таких соединений, как белки и олигосахариды, в промышленном масштабе. Благодаря специфическим особенностям, таким как недостаток протеаз, низкое образование ацетата при высоком уровне глюкозы и повышенная проницаемость, клетки E. coli B являются наиболее часто используемыми клетками-хозяевами для производства белков методами генной инженерии.
Рекомбинантный белок
Рекомбинантные белки (rProt) приобретают значительную важность во многих отраслях, включая химическое производство, фармацевтику, косметическую промышленность, медицину и ветеринарию, сельское хозяйство, пищевую промышленность, а также переработку отходов.
Для производства рекомбинантного белка требуется система экспрессии. В качестве экспрессирующих клеточных систем для производства рекомбинантной ДНК можно использовать как прокариотические, так и эукариотические клетки. Хотя бактериальные клетки наиболее широко используются для экспрессии белков благодаря таким факторам, как низкая стоимость, простота масштабирования и несложные требования к питательной среде, системы на основе клеток млекопитающих, дрожжей, водорослей, насекомых и бесклеточные системы являются признанными альтернативами. Тип белка, его функциональная активность, а также требуемый выход экспрессируемого белка влияют на выбор клеточной системы для экспрессии белков.
Для экспрессии рекомбинантного белка определённую клетку необходимо трансфицировать ДНК-вектором, содержащим матрицу рекомбинантной ДНК. Затем клетки, трансфицированные этой матрицей, культивируют. В результате действия клеточного механизма клетки транскрибируют и транслируют интересующий белок, тем самым производя целевой белок.
Поскольку экспрессируемые белки заключены в клеточном матриксе, клетку необходимо лизировать (разрушить и разорвать), чтобы высвободить белки. На последующем этапе очистки белок отделяют и очищают.
Первым рекомбинантным белком, использованным для лечения, стал рекомбинантный человеческий инсулин в 1982 году. Сегодня во всём мире для медицинского лечения производят более 170 типов рекомбинантных белков. К часто используемым в медицине рекомбинантным белкам относятся, например, рекомбинантные гормоны, интерфероны, интерлейкины, факторы роста, факторы некроза опухоли, факторы свёртывания крови, тромболитические препараты и ферменты для лечения таких серьёзных заболеваний, как диабет, карликовость, инфаркт миокарда, застойная сердечная недостаточность, церебральная апоплексия, рассеянный склероз, нейтропения, тромбоцитопения, анемия, гепатит, ревматоидный артрит, астма, болезнь Крона, а также для терапии онкологических заболеваний. (См. Phuc V. Pham, в Omics Technologies and Bio-Engineering, 2018)
Литература / Источники
- Cheraghi S.; Akbarzade A.; Farhangi A.; Chiani M.; Saffari Z.; Ghassemi S.; Rastegari H.; Mehrabi M.R. (2010): Improved Production of L-lysine by Over-expression of Meso-diaminopimelate Decarboxylase Enzyme of Corynebacterium glutamicum in Escherichia coli. Pak J Biol Sci. 2010 May 15; 13(10), 2010. 504-508.
- LeThanh, H.; Neubauer, P.; Hoffmann, F. (2005): The small heat-shock proteins IbpA and IbpB reduce the stress load of recombinant Escherichia coli and delay degradation of inclusion bodies. Microb Cell Fact 4, 6; 2005.
- Martínez-Gómez A.I.; Martínez-Rodríguez S.; Clemente-Jiménez J.M.; Pozo-Dengra J.; Rodríguez-Vico F.; Las Heras-Vázquez F.J. (2007): Recombinant polycistronic structure of hydantoinase process genes in Escherichia coli for the production of optically pure D-amino acids. Appl Environ Microbiol. 73(5); 2007. 1525-1531.
- Kotowska M.; Pawlik K.; Smulczyk-Krawczyszyn A.; Bartosz-Bechowski H.; Kuczek K. (2009): Type II Thioesterase ScoT, Associated with Streptomyces coelicolor A3(2) Modular Polyketide Synthase Cpk, Hydrolyzes Acyl Residues and Has a Preference for Propionate. Appl Environ Microbiol. 75(4); 2009. 887-896.
Ультразвуковое устройство VialTweeter для одновременной обработки ультразвуком 10 образцов, например для разрушения клеток BL21
