Sonicação com sonda para a preparação de amostras: um guia completo
A sonicação com sonda é uma ferramenta potente para romper células, fragmentar ADN por cisalhamento e dispersar partículas em amostras líquidas. Tal como todas as técnicas nas ciências da vida, na microbiologia e na análise clínica, a sonicação exige uma otimização cuidadosa para evitar danos nas amostras, sobretudo ao trabalhar com materiais sensíveis ao calor. Seguindo recomendações – como manter as amostras em gelo, controlar a amplitude da sonicação, utilizar o modo pulsado e otimizar a profundidade de imersão do sonotrodo – pode obter resultados eficazes e reprodutíveis. Em última análise, um protocolo de sonicação bem otimizado assegura o sucesso das aplicações subsequentes e preserva a integridade das suas preciosas amostras.
Sonicação – uma etapa indispensável na preparação de amostras
A sonicação com sonda é uma técnica amplamente utilizada na preparação de amostras em investigação biológica, química e de materiais. O processo envolve a utilização de energia ultrassónica para romper células, fragmentar ADN por cisalhamento, dispersar nanopartículas ou emulsionar soluções. Ao transmitir ondas ultrassónicas de elevada energia através de uma amostra líquida por meio de uma sonda (sonotrodo, corneta ultrassónica, sonda ultrassónica), a sonicação com sonda cria regiões localizadas de elevada pressão, turbulência e cavitação, que rompem mecanicamente as estruturas celulares ou dispersam homogeneamente as partículas. No entanto, a técnica exige uma otimização cuidadosa para evitar danificar a amostra, em particular materiais biológicos sensíveis, como proteínas e ácidos nucleicos. Este guia sobre sonicação com sonda apresenta recomendações práticas para uma preparação eficaz de amostras.
O homogeneizador ultrassónico de laboratório UP200Ht é popular nos laboratórios de investigação para a preparação de amostras, lise, extração, fragmentação de ADN e dissolução.
- Ajuste as definições de amplitude
A amplitude da sonicação refere-se à magnitude das vibrações produzidas pela sonda. Amplitudes mais elevadas fornecem energia ultrassónica mais intensa, mas geram mais calor, aumentando o risco de degradação da amostra. Em contrapartida, amplitudes mais baixas proporcionam uma sonicação mais suave, reduzindo a acumulação de calor e mantendo a integridade da amostra.
Dependendo da sua aplicação específica, utilizar uma amplitude mais baixa durante um período mais longo poderá proporcionar melhores resultados do que aplicar uma amplitude muito elevada em impulsos curtos. Esta abordagem reduz a probabilidade de degradação térmica, assegurando simultaneamente uma rutura ou mistura adequada da amostra. - Utilize o registo automático de dados
O menu inteligente de todos os sonicadores digitais Hielscher inclui o registo automático de dados. Assim que liga o seu sonicador, todos os dados importantes, como a energia fornecida (total e líquida), a amplitude, a potência e o tempo, são monitorizados – incluindo a temperatura e a pressão, se tiver ligado os sensores de temperatura e pressão. Todos os dados são gravados com a indicação da data e da hora num ficheiro CSV num cartão SD integrado. - Otimização da energia fornecida: obtenha a quantidade certa de potência ultrassónica
Otimizar o processamento ultrassónico com base na energia específica fornecida (Ws/mL) oferece uma abordagem mais reprodutível e quantificável do que os protocolos baseados no tempo. Embora a duração da sonicação continue a ser um fator, é a energia total fornecida por unidade de volume que, em última análise, determina o grau de rutura da amostra. Uma energia fornecida insuficiente pode resultar numa lise ou dispersão incompleta, enquanto um fornecimento excessivo pode causar degradação molecular, desnaturação de proteínas ou sobreaquecimento – sobretudo em sistemas biológicos ou poliméricos sensíveis.
A nossa recomendação: Comece com valores baixos de energia específica fornecida – normalmente no intervalo de 10–50 Ws/mL, dependendo do tipo de amostra – e aumente-os gradualmente conforme necessário. Monitorize o processo avaliando alterações físicas (por exemplo, turbidez, viscosidade, dispersão de partículas) e esteja atento a indicadores de sonicação excessiva, como formação excessiva de espuma, aumento da temperatura ou alteração da cor da amostra. Ajuste a amplitude, o ciclo de impulsos e a duração em conformidade para atingir a dose de energia pretendida, minimizando simultaneamente o esforço térmico ou mecânico. - Utilize o modo pulsado para minimizar a acumulação de calor
Os sonicadores Hielscher podem funcionar em modo pulsado, o que é particularmente útil para amostras sensíveis à temperatura. O modo pulsado alterna entre fases de sonicação e de repouso, permitindo que a amostra arrefeça entre impulsos. Isto evita picos rápidos de temperatura, minimizando o risco de degradação induzida pelo calor. - A importância do controlo da temperatura: mantenha as suas amostras frias
A sonicação transfere energia ultrassónica para o líquido, gerando calor devido à turbulência e ao atrito. Se não for controlado, este fenómeno pode levar a temperaturas elevadas, que podem degradar amostras biológicas sensíveis, como proteínas, enzimas e ácidos nucleicos. Para mitigar este efeito, o controlo da temperatura é fundamental durante a sonicação.
Uma das formas mais simples e eficazes de evitar o sobreaquecimento é manter as suas amostras em gelo durante todo o processo de sonicação. Isto ajuda a manter uma temperatura baixa e estável e protege a sua amostra da degradação térmica.
Todos os sonicadores digitais Hielscher dispõem de monitorização da temperatura. Um sensor de temperatura conectável mede continuamente a temperatura da amostra. De acordo com o limite de temperatura definido no programa, o sonicador faz uma pausa automaticamente quando o limite superior de temperatura é atingido e retoma a sonicação assim que é atingido o limite inferior da diferença de temperatura definida.
Além disso, pode:- Colocar o tubo da amostra em gelo antes de iniciar o processo de sonicação.
- Interromper periodicamente a sonicação para permitir o arrefecimento, se forem necessárias sessões prolongadas.
- Manter a amostra em gelo após a sonicação para a estabilizar ainda mais.
Isto é particularmente importante para amostras de proteínas, uma vez que as proteínas podem desnaturar rapidamente a temperaturas elevadas. Ao manter as suas amostras frias, preserva a sua integridade funcional para aplicações subsequentes, como Western blotting, ensaios enzimáticos ou espectrometria de massa.
- O tamanho certo do sonotrodo para a sua amostra
Escolher o tamanho certo do sonotrodo para a sonicação de amostras nas ciências da vida e na microbiologia é crucial para assegurar uma transferência de energia ótima e uma rutura eficaz de células ou biomoléculas. Um sonotrodo de tamanho adequado permite uma cavitação eficiente, essencial para romper paredes celulares, lisar células e homogeneizar amostras. Se o sonotrodo for demasiado grande ou demasiado pequeno para o volume ou tipo de amostra, pode causar uma sonicação não uniforme, aquecimento excessivo ou rutura celular insuficiente, comprometendo potencialmente os resultados experimentais. Por isso, selecionar o tamanho adequado do sonotrodo ajuda a manter a integridade da amostra e assegura a reprodutibilidade das experiências. - Profundidade correta da sonda: evite a formação de espuma e a exposição uniforme
O posicionamento da sonda é um fator fundamental na sonicação, embora seja frequentemente descurado. Uma profundidade adequada da sonda assegura uma transferência eficiente de energia e a mistura da amostra. Se a sonda estiver demasiado próxima da superfície, poderá ocorrer formação excessiva de espuma, que pode aprisionar bolhas de ar e reduzir a eficácia da sonicação. Se a sonda estiver demasiado profunda, poderá não conseguir uma circulação adequada, levando a uma sonicação não uniforme da amostra.
A profundidade ideal da sonda situa-se normalmente entre 1/4 e 1/3 da altura do líquido no tubo ou recipiente. Experimente diferentes profundidades para encontrar a posição ótima que maximize a transferência de energia sem causar formação de espuma.
No caso de recipientes grandes para amostras, poderá ser benéfico mover lentamente o sonotrodo através da amostra para assegurar uma sonicação uniforme de toda a amostra.
Se utilizar os modelos de sonicadores para múltiplas amostras CupHorn ou UIP400MTP, encha o cuphorn conforme descrito no manual. - Otimize o processo de sonicação: adapte-o à sua amostra
A chave para uma sonicação com sonda bem-sucedida é a otimização. Uma vez que diferentes amostras, incluindo células, tecidos e substâncias químicas, respondem de forma diferente à energia ultrassónica, é importante adaptar o processo às suas necessidades específicas. Os fatores a considerar durante a otimização incluem:
Volume da amostra: Volumes maiores podem exigir tempos de sonicação mais longos ou amplitudes mais elevadas.
Viscosidade da amostra: Amostras viscosas podem necessitar de uma sonicação mais intensa para conseguir uma rutura suficiente.
Resultado pretendido: Se estiver a lisar tecidos resistentes, poderá ser necessário um regime de sonicação mais intenso, enquanto uma sonicação mais curta poderá ser suficiente para o cisalhamento do ADN.
Ao testar e aperfeiçoar sistematicamente os parâmetros – como a amplitude, a duração e a profundidade da sonda – pode otimizar o processo de sonicação para as características específicas da sua amostra.
Encontre o sonicador certo para a sua tarefa de preparação de amostras
A Hielscher Ultrasonics oferece uma gama completa de sonicadores para a sua tarefa de preparação de amostras. Indique-nos fatores importantes, como o tipo de amostra, o volume e a aplicação específica em que está a trabalhar. A nossa equipa de especialistas terá todo o gosto em aconselhá-lo, propondo o homogeneizador ultrassónico mais adequado às suas experiências de investigação.
A tabela abaixo dá-lhe uma indicação da capacidade aproximada de processamento dos nossos equipamentos ultrassónicos de dimensão laboratorial:
| Equipamentos recomendados | Volume por lote | Caudal |
|---|---|---|
| Sonicador para placas de 96 poços UIP400MTP | placas multipoços / de microtitulação | n.a. |
| CupHorn ultrassónico | CupHorn para frascos ou copo de precipitação | n.a. |
| GDmini2 | microrreator ultrassónico de fluxo | n.a. |
| VialTweeter | 0,5 a 1,5mL | n.a. |
| UP100H | 1 a 500mL | 10 a 200mL/min |
| UP200Ht, UP200St | 10 a 1000mL | 20 a 200mL/min |
| UP400St | 10 a 2000mL | 20 a 400mL/min |
| Agitador de peneiros ultrassónico | n.a. | n.a. |
A Hielscher Ultrasonics é uma empresa com certificação ISO e dá especial ênfase a equipamentos ultrassónicos de elevado desempenho com tecnologia de ponta e facilidade de utilização. Naturalmente, os equipamentos ultrassónicos Hielscher estão em conformidade com os requisitos CE e cumprem os requisitos UL, CSA e RoHs.
A Hielscher Ultrasonics fornece sonicadores potentes sem contacto para a preparação de amostras e a análise clínica. O sonicador para placas multipoços UIP400MTP, o VialTweeter, o CupHorn e o sonicador de fluxo GDmini2 processam as amostras sem lhes tocar.
- elevada eficiência
- tecnologia de ponta
- fiabilidade e robustez
- controlo preciso e ajustável do processo
- por lotes e em linha
- para qualquer volume
- software inteligente
- funcionalidades inteligentes (por exemplo, programação, registo de dados, controlo remoto)
- operação fácil e segura
- manutenção reduzida
- CIP (limpeza no local)
Sonicador VialTweeter para a sonicação simultânea de 10 amostras, por exemplo, para romper células, extrair proteínas e fragmentar ADN por cisalhamento
Bibliografia / Referências
- Claudia Lindemann, Nataliya Lupilova, Alexandra Müller, Bettina Warscheid, Helmut E. Meyer, Katja Kuhlmann, Martin Eisenacher, Lars I. Leichert (2013): Redox Proteomics Uncovers Peroxynitrite-Sensitive Proteins that Help Escherichia coli to Overcome Nitrosative Stress. J Biol Chem. 2013 Jul 5; 288(27): 19698–19714.
- Turrini, Federica; Donno, Dario; Beccaro, Gabriele; Zunin, Paola; Pittaluga, Anna; Boggia, Raffaella (2019): Pulsed Ultrasound-Assisted Extraction as an Alternative Method to Conventional Maceration for the Extraction of the Polyphenolic Fraction of Ribes nigrum Buds: A New Category of Food Supplements Proposed by The FINNOVER Project. Foods. 8. 466; 2019
- Giricz Z., Varga Z.V., Koncsos G., Nagy C.T., Görbe A., Mentzer R.M. Jr, Gottlieb R.A., Ferdinandy P. (2017): Autophagosome formation is required for cardioprotection by chloramphenicol. Life Science Oct 2017. 11-16.
- Hemida, Yasmine (2016): Effect of Rapamycin as an Inhibitor of the mTOR Cell Cycle Entry Complex on the Selective Lysis of Human Leukemia Cells Lines in Vitro Using 20 kHz Pulsed Low-Frequency Ultrasound. Honors Capstone Projects – All. 942, 2016.
- Fernandes, Luz; Santos, Hugo; Nunes-Miranda, J.; Lodeiro, Carlos; Capelo, Jose (2011): Ultrasonic Enhanced Applications in Proteomics Workflows: single probe versus multiprobe. Journal of Integrated OMICS 1, 2011.
- Priego-Capote, Feliciano; Castro, María (2004): Analytical uses of ultrasound – I. Sample preparation. TrAC Trends in Analytical Chemistry 23, 2004. 644-653.
- Welna, Maja; Szymczycha-Madeja, Anna; Pohl, Pawel (2011): Quality of the Trace Element Analysis: Sample Preparation Steps. In: Wide Spectra of Quality Control; InTechOpen 2011.
Perguntas frequentes
Qual é o objetivo da sonicação?
O objetivo da sonicação é utilizar ondas sonoras, normalmente na gama ultrassónica, para agitar partículas numa amostra, facilitando processos como a rutura celular, a homogeneização e a decomposição de estruturas moleculares. É habitualmente utilizada em aplicações de biologia, química e ciência dos materiais para melhorar a mistura, promover reações ou libertar conteúdos celulares.
Em que consiste a técnica de sonicação?
A técnica de sonicação envolve a utilização de ondas ultrassónicas intensas (normalmente a frequências entre 20–30 kHz) para gerar vibrações rápidas num meio líquido. Estas vibrações provocam a formação e o colapso de bolhas microscópicas, um processo conhecido como cavitação acústica. Esta cavitação cria pressão e temperatura elevadas localizadas, que podem romper células, dispersar partículas ou facilitar reações químicas. A técnica de sonicação é amplamente utilizada em laboratórios para aplicações como lise celular, extração, cisalhamento do ADN, homogeneização e síntese de nanopartículas.
Como se prepara uma amostra para sonicação?
Para preparar uma amostra para sonicação, o material da amostra (normalmente líquido ou sólidos em suspensão) é colocado num recipiente adequado, frequentemente um balão de vidro, um tubo de plástico ou uma placa multipoços, com volume suficiente para acomodar as vibrações ultrassónicas e evitar derrames. Se necessário, a amostra é diluída com uma solução tampão ou um solvente para manter a concentração pretendida e evitar o sobreaquecimento durante a sonicação. Para amostras sensíveis ao calor, o recipiente é depois parcialmente submerso num banho de gelo ou numa camisa de arrefecimento para dissipar o calor gerado pelas ondas ultrassónicas. A sonda do sonicador é posicionada corretamente para assegurar uma transferência eficiente de energia. Os parâmetros, como a amplitude, o tempo e o modo pulsado, são definidos com base nos requisitos específicos da experiência.
A sonicação rompe o ADN?
Sim, a sonicação pode romper o ADN. As ondas ultrassónicas de elevada energia geradas durante a sonicação podem fragmentar moléculas de ADN por cisalhamento ao criar regiões localizadas de elevada pressão e calor, levando a esforços mecânicos nas cadeias de ADN. Isto resulta na fragmentação do ADN em segmentos mais pequenos. O grau de rutura do ADN depende da duração e da intensidade da sonicação. Em algumas experiências, como na imunoprecipitação da cromatina (ChIP) ou na preparação de bibliotecas para sequenciação de nova geração (NGS), a sonicação é utilizada como uma técnica fiável para o cisalhamento controlado do ADN.
A Hielscher Ultrasonics fabrica homogeneizadores ultrassónicos de elevado desempenho com dimensões desde as de laboratório até às de escala industrial.
