Ultrasone DNA-fragmentatie voor next-generation sequencing
Next-generation sequencing (NGS) vereist betrouwbare afschuiving en fragmentatie van genomisch DNA om genomische DNA-strengen te sequencen en genoombibliotheken te maken. De gecontroleerde fragmentatie van DNA tot DNA-fragmenten is een essentiële stap in de monstervoorbereiding die nodig is voordat het DNA wordt gesequencet. Ultrasone behandeling is een bewezen efficiënte en betrouwbare techniek voor het fragmenteren van DNA tot fragmenten van een bepaalde lengte. Protocollen voor ultrasone DNA-fragmentatie leveren reproduceerbare fragmentatieresultaten op. Ultrasone sonicatoren van Hielscher kunnen een breed scala aan grootteverdelingen van genomische DNA-fragmenten produceren, die via de bedrijfsparameters nauwkeurig kunnen worden geregeld. Omdat de ultrasone systemen van Hielscher voor DNA-afschuiving beschikbaar zijn voor afzonderlijke en meerdere monsterbuisjes en voor microplaten, wordt de monstervoorbereiding zeer efficiënt.
De UIP400MTP Plate Sonicator voor monstervoorbereiding met een hoge verwerkingscapaciteit soniceert monsters gelijkmatig in multiwellplaten, microtiterplaten en platen met 96 wells
- herhaalbare / reproduceerbare resultaten
- nauwkeurig instelbaar om een bepaalde fragmentlengte te verkrijgen
- snelle verwerking
- consistente resultaten van DNA-fragmentatie
- apparaten voor alle monstervolumes (bijv. meerdere monsterbuisjes of microplaten)
- hoge verwerkingscapaciteit
- nauwkeurige temperatuurregeling
- eenvoudige, gebruiksvriendelijke bediening
Next-generation sequencing: ultrasone DNA-fragmentatie voor bibliotheekvoorbereiding
Om next-generation sequencing uit te voeren, moeten de drie basisstappen (1) bibliotheekvoorbereiding, (2) sequencing en (3) data-analyse worden uitgevoerd. Tijdens de bibliotheekvoorbereiding wordt DNA gefragmenteerd, waarna de fragmentuiteinden worden gerepareerd (gepolijst) door één adeninebase toe te voegen en de doelfragmenten worden omgezet in dubbelstrengs DNA. Ten slotte worden zogeheten adapters aangehecht door ligatie, PCR of tagmentatie, zodat het uiteindelijke DNA-product van de bibliotheek kan worden gekwantificeerd voor sequencing.
DNA-fragmentatie met sonicatie: Vooral bij het gebruik van sequencingtechnologieën voor korte reads, zoals Illumina, die langere DNA-fragmenten niet gemakkelijk kunnen uitlezen, moeten de DNA-strengen tot fragmenten van een bepaalde grootte worden gefragmenteerd. Dit kan betrouwbaar worden bereikt met ultrasone behandeling.
Ultrasone behandeling kan betrouwbaar worden gebruikt voor de fragmentatie van DNA, RNA en chromatine.
Next-generation sequencing – bibliotheekvoorbereiding
Ultrasone DNA-fragmentatie wordt vaak toegepast bij het voorbereiden van DNA-sequencingbibliotheken voor platforms voor next-generation sequencing (NGS). Deze techniek wordt gebruikt om DNA-moleculen op te breken in kleinere fragmenten binnen een gewenst groottebereik, wat de daaropvolgende stappen in de bibliotheekvoorbereiding vergemakkelijkt. Ultrasone DNA-fragmentatie is doorgaans nodig tijdens de bibliotheekvoorbereiding in NGS-workflows om genomisch DNA te fragmenteren tot kleinere stukken die geschikt zijn voor verdere verwerking en sequencing. De techniek speelt een cruciale rol bij het waarborgen van het succes van het sequencingexperiment door DNA-fragmenten te genereren binnen het passende groottebereik voor het specifieke sequencingplatform dat wordt gebruikt.
Elektroforetische analyses van genomisch DNA van E. coli EDL933 dat gedurende 0 – 15 min aan ultrasone behandeling is blootgesteld. L geeft de DNA-ladder aan. (Basselet et al. 2008)
Next-generation sequencing – processtappen:
- Ultrasone DNA-fragmentatie: Voordat de bibliotheek wordt opgebouwd, wordt het genomische DNA gefragmenteerd tot kleinere, beter hanteerbare stukken. Bij ultrasone fragmentatie worden hoogfrequente geluidsgolven gebruikt om de DNA-moleculen door afschuiving op te delen in fragmenten binnen het gewenste groottebereik. Deze stap is cruciaal omdat hij helpt waarborgen dat de later gegenereerde sequencingreads een geschikte lengte hebben voor het gebruikte sequencingplatform. Het groottebereik van de fragmenten kan worden aangepast aan de specifieke vereisten van het sequencingexperiment.
- Klonale amplificatie door PCR: Na ultrasone fragmentatie ondergaan de DNA-fragmenten reparatie van de uiteinden, adapterligatie en PCR-amplificatie om de uiteindelijke DNA-sequencingbibliotheken te genereren. Deze stappen bereiden de gefragmenteerde DNA-moleculen voor op het sequencingproces door adaptersequenties toe te voegen die nodig zijn voor binding aan het sequencingplatform en die aanhechtingsplaatsen voor primers voor PCR-amplificatie bieden.
- DNA-sequencing door synthese: Zodra de sequencingbibliotheken zijn voorbereid, begint het proces van DNA-sequencing door synthese (SBS). Tijdens SBS wordt de DNA-sequentie bepaald door nucleotiden achtereenvolgens aan de complementaire streng toe te voegen. Deze stap omvat cyclische reacties van nucleotide-inbouw, beeldvorming en afsplitsing, waardoor de DNA-sequentie kan worden bepaald op basis van de fluorescentiesignalen die de ingebouwde nucleotiden uitzenden.
- Massaal parallelle sequencing: In de laatste stap worden de ruimtelijk gescheiden, geamplificeerde DNA-templates gelijktijdig op massaal parallelle wijze gesequencet. Deze sequencingbenadering met een hoge verwerkingscapaciteit maakt het mogelijk om miljoenen tot miljarden sequencingreads in één sequencingrun te genereren, waardoor DNA-sequenties efficiënt en snel kunnen worden bepaald.
Hoe werkt ultrasone DNA-fragmentatie?
Sonicatie, ook bekend als akoestische monsterverwerking, is een veelgebruikte methode om DNA te fragmenteren. Voor ultrasone DNA-afschuiving worden de monsters onder gecontroleerde omstandigheden blootgesteld aan ultrasone golven. Het werkingsprincipe van ultrasone DNA-fragmentatie is gebaseerd op de trillingen en cavitatie die door de ultrasone golven worden opgewekt. De afschuifkrachten die ontstaan door ultrasone (akoestische) cavitatie breken DNA-moleculen met een hoog molecuulgewicht. Sonicatie-instellingen zoals intensiteit (amplitude, duur), pulsatiemodus en temperatuur maken nauwkeurige DNA-fragmentatie tot DNA-fragmenten van een bepaalde gewenste lengte mogelijk. Hoewel DNA met ultrasone behandeling vaak wordt verkleind tot 100 tot 600 bp, kunnen langere DNA-fragmenten van maximaal 1300 bp worden verkregen wanneer mildere ultrasone omstandigheden worden toegepast.
Ultrasone DNA-afschuiving tijdens ChIP – chromatine-immunoprecipitatie
Bewerkt naar Jkwchui onder CC-BY-SA.03
Temperatuurregeling om DNA-afbraak te voorkomen
De dubbelstrengige moleculaire structuur van DNA is zeer gevoelig voor verhoogde temperaturen, waardoor nauwkeurige temperatuurregeling tijdens de stappen van de monstervoorbereiding een cruciale factor is voor betrouwbare analyseresultaten.
Of u nu de ultrasone sonicatoren met een sonde van Hielscher, de VialTweeter of de UIP400MTP gebruikt – continue temperatuurbewaking en -regeling worden gewaarborgd door een aansluitbare temperatuursensor en de slimme apparaatsoftware. Om de temperatuur binnen een bepaald bereik te houden, kunt u een boven- en ondergrens voor de temperatuur instellen. De ultrasone sonicator pauzeert daarom zodra deze temperatuurgrens wordt overschreden en hervat de sonicatie automatisch wanneer de temperatuur met een ingestelde ∆T is gedaald.
De geavanceerde software van de ultrasone sonicatoren van Hielscher waarborgt dat de ideale omstandigheden voor monsterbehandeling betrouwbaar worden gehandhaafd.
DNA-fragmentatie van grote aantallen monsters met de ultrasone sonicator UIP400MTP voor multiwellplaten
Het aantal monsters in de levenswetenschappen is in het afgelopen decennium aanzienlijk toegenomen. Dit betekent dat zeer grote aantallen monsters (bijv. 384, 1536 of 3456 wells per microplaat) tijdens de monstervoorbereiding en analyse onder consequent gelijke omstandigheden moeten worden verwerkt om vergelijkbare en geldige resultaten te verkrijgen. Met de UIP400MTP volgt Hielscher Ultrasonics de trend van verwerking van grote aantallen monsters. De UIP400MTP is een ultrasone sonicator voor monstervoorbereiding met microplaten. De UIP400MTP kan platen met 6, 12, 24, 48, 96, 384, 1536 of 3456 wells verwerken. Afhankelijk van het type microplaat kan elke well doorgaans monstervolumes van tientallen nanoliters tot meerdere milliliters bevatten. De UIP400MTP wordt veel gebruikt in onderzoek binnen de levenswetenschappen en wordt zeer vaak ingezet voor monstervoorbereiding voorafgaand aan assays zoals ELISA (enzymgekoppelde immunosorbentassay) of PCR, voorafgaand aan eiwitanalyses, evenals voor chromatinevoorbereiding voorafgaand aan CHiP en CHiP-seq, identificatie van histonmodificaties en andere analytische behandelingen (bijv. gelelektroforese, massaspectrometrie).
Lees meer over de verwerking van PCR-platen met een hoge verwerkingscapaciteit!
De VialTweeter voor monstervoorbereiding van maximaal 10 monsterbuisjes
De VialTweeter is een veelgebruikte ultrasone laboratoriumsonicator VialTweeter die effectieve en comfortabele gelijktijdige sonicatie van maximaal 10 monsterbuisjes mogelijk maakt. Omdat de monsterbuisjes en reageerbuizen (bijv. Eppendorf-buisjes, cryobuisjes, centrifugebuizen) indirect worden gesoniceerd, wordt elke kruisbesmetting voorkomen. Omdat elk monster dezelfde ultrasone intensiteit ontvangt, zijn alle sonicatieresultaten homogeen en reproduceerbaar. De VialTweeter biedt alle slimme functies van onze andere digitale apparaten (bijv. een slim menu, programmeerbare instellingen, temperatuurregeling, bediening op afstand enz.), waardoor het hoogste gebruikerscomfort wordt gewaarborgd.
Sondes met meerdere vingers voor microwellplaten
Sondes met meerdere vingers, beschikbaar voor de ultrasone homogenisatoren met een sonde UP200Ht en UP200St, hebben 4 of 8 vingers en vormen een comfortabele optie om meerdere monsters tegelijkertijd onder dezelfde omstandigheden te soniceren. De sonotrode MTP-24-8-96 is bijvoorbeeld een sonde met acht vingers die ideaal is voor integratie in geautomatiseerde systemen of voor efficiënte handmatige monstervoorbereiding in de wells van multiwellplaten. De sonotrode met meerdere vingers is ideaal voor automatisering in laboratoria waar voornamelijk bekerglazen en reageerbuizen met een standaard ultrasone sonotrode worden verwerkt. De sondes met meerdere vingers en de standaardsondes kunnen binnen enkele minuten snel worden verwisseld, waardoor de ultrasone sonicator met één sonde wordt omgevormd tot een ultrasoon apparaat voor celontsluiting met meerdere sondes.
Ultrasone sonicatoren van Hielscher voor DNA-fragmentatie
Hielscher Ultrasonics biedt verschillende platforms op basis van ultrageluid voor de fragmentatie van DNA, RNA en chromatine. Deze verschillende platforms omvatten ultrasone sondes (sonotroden), oplossingen voor indirecte sonicatie voor de gelijktijdige monstervoorbereiding van meerdere buizen of multiwellplaten (bijv. platen met 96 wells, microtiterplaten), sonoreactoren en ultrasone cuphorns. Alle platforms voor DNA-afschuiving worden aangedreven door op frequentie afgestemde ultrasone processoren met hoge prestaties die nauwkeurig regelbaar zijn en reproduceerbare resultaten leveren.
Ultrasone processoren voor elk aantal monsters en elke monstergrootte
Met de ultrasone sonicatoren van Hielscher voor meerdere monsters, VialTweeter (voor maximaal 10 reageerbuizen) en UIP400MTP (voor microplaten/ multiwellplaten), kan de monsterverwerkingstijd worden verkort dankzij intense en nauwkeurig regelbare ultrasone behandeling, terwijl de gewenste grootteverdeling en opbrengst van DNA-fragmenten worden verkregen. Ultrasone DNA-fragmentatie maakt de monstervoorbereiding efficiënt, betrouwbaar en schaalbaar. Protocollen kunnen lineair worden opgeschaald van één naar talrijke monsters door voortdurend gecontroleerd ultrageluid toe te passen.
Ultrasone sonicatoren met sondes met één tot vijf vingers zijn ideaal voor de voorbereiding van kleinere aantallen monsters. De ultrasone laboratoriumsonicatoren van Hielscher zijn verkrijgbaar in verschillende formaten, zodat wij u het ideale apparaat voor uw toepassing en vereisten kunnen aanbevelen.
Nauwkeurige procesregeling
Nauwkeurig regelbare sonicatie-instellingen zijn cruciaal, omdat overmatige sonicatie DNA, RNA en chromatine kan vernietigen, terwijl onvoldoende ultrasone afschuiving leidt tot te lange DNA- en chromatinefragmenten. De digitale ultrasone sonicatoren van Hielscher kunnen eenvoudig op nauwkeurige sonicatieparameters worden ingesteld. Specifieke sonicatie-instellingen kunnen ook als geprogrammeerde instelling worden opgeslagen om dezelfde procedure snel te herhalen.
Alle sonicaties worden automatisch vastgelegd en als CSV-bestand opgeslagen op een ingebouwde SD-kaart. Dit maakt nauwkeurige documentatie van uitgevoerde proeven mogelijk en maakt het eenvoudig om sonicatieruns te beoordelen.
Via bediening op afstand in de browser kunnen alle digitale ultrasone sonicatoren met elke standaardbrowser worden bediend en bewaakt. Er hoeft geen aanvullende software te worden geïnstalleerd, omdat een LAN-verbinding een zeer eenvoudige plug-and-play-installatie mogelijk maakt.
De hoogste gebruiksvriendelijkheid bij ultrasone monstervoorbereiding
Alle ultrasone sonicatoren van Hielscher zijn ontworpen om ultrageluid met hoge prestaties te leveren en tegelijkertijd altijd zeer gebruiksvriendelijk en eenvoudig te bedienen te zijn. Alle instellingen zijn goed gestructureerd in een overzichtelijk menu, dat eenvoudig toegankelijk is via een kleurenaanraakscherm of bediening op afstand in de browser. De slimme software met programmeerbare instellingen en automatische gegevensregistratie zorgt voor optimale sonicatie-instellingen voor betrouwbare en reproduceerbare resultaten. De overzichtelijke en eenvoudig te gebruiken menu-interface maakt de ultrasone sonicatoren van Hielscher tot gebruiksvriendelijke en efficiënte apparaten.
De onderstaande tabel geeft u een indicatie van de geschatte verwerkingscapaciteit van onze ultrasone laboratoriumsonicatoren, die ideaal zijn voor monstervoorbereidingstaken zoals DNA- en RNA-fragmentatie, cellysis en eiwitextractie:
| Apparaat | Vermogen [W] | Type | Volume [mL] |
|---|---|---|---|
| UIP400MTP | 400 | voor microplaten | 6 – 3456 wells | VialTweeter | 200 | voor maximaal 10 monsterbuisjes plus mogelijkheid tot aanklemmen | 0,5 – 1,5 |
| UP50H | 50 | met sonde | 0,01 – 250 |
| UP100H | 100 | met sonde | 0,01 – 500 |
| UP200Ht | 200 | met sonde | 0,1 – 1000 |
| UP200St | 200 | met sonde | 0,1 – 1000 |
| UP400St | 400 | met sonde | 5,0 – 2000 |
| CupHorn | 200 | CupHorn, sonoreactor | 10 – 200 |
| GDmini2 | 200 | contaminatievrije doorstroomcel |
Neem contact met ons op! / Stel ons uw vragen!
Het ultrasone apparaat voor de voorbereiding van meerdere monsters VialTweeter maakt gelijktijdige sonicatie van maximaal 10 monsterbuisjes mogelijk. Met het aanklemapparaat VialPress kunnen maximaal 4 extra buizen tegen de voorzijde worden gedrukt voor intense sonicatie.
De sonotrode MTP-24-8-96 heeft acht ultrasone sondes voor de sonicatie van de wells van microtiterplaten.
Literatuur / Referenties
- Qiyun Liang, Christoph Ratzke (2025): Lysing diverse bacteria with the Hielscher UIP400MTP for DNA sequencing. Protocol Uni Tübingen 2025.
- Poptsova, M., Il’icheva, I., Nechipurenko, D. et al. (2014): Non-random DNA fragmentation in next-generation sequencing. Scientific Reports 4, 4532; 2014.
- Basselet P., Wegrzyn G., Enfors S.-O., Gabig-Ciminska M. (2008): Sample processing for DNA chip array-based analysis of enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC). Microbial Cell Factories 7:29. 2008.
- Wang Y., Joshu C.E., Curtis S.D., Douville C., Burk V.A., Ru M., Popoli M., Ptak J., Dobbyn L., Silliman N., Coresh J., Boerwinkle E., Prizment A., Bettegowda C., Kinzler K.W., Papadopoulos N., Platz E.A., Vogelstein B. (2025): Detection of cancers three years prior to diagnosis using plasma cell-free DNA. Cancer Discovery 2025 May.
- Doublier S., Riganti Ch., Voena C., Costamagna C., Aldieri E., Pescarmona G., Ghigo D., Bosia A. (008): RhoA Silencing Reverts the Resistance to Doxorubicin in Human Colon Cancer Cells. Molecular Cancer Research 6(10), 2008.
- Fredlund E., Gidlund A., Olsen M., Börjesson T., Spliid N.H.H., Simonsson M. (2008): Method evaluation of Fusarium DNA extraction from mycelia and wheat for down-stream real-time PCR quantification and correlation to mycotoxin levels. Journal of Microbiological Methods 2008.
- Fritsche C., Sitz M., Weiland N., Breitling R., Pohl H.-D. (2007): Characterization of the growth behavior of Leishmania tarentolae – a new expression system for recombinant proteins. Journal of Basic Microbiology 47, 2007. 384–393.
- Ristola M., Arpiainen S., Saleem M. A., Mathieson P. W., Welsh G. I., Lehtonen S., Holthöfer H. (2009): Regulation of Neph3 gene in podocytes – key roles of transcription factors NF-κB and Sp1. BMC Molecular Biology 10:83, 2009.
- Rodriguez J., Vives L., Jorda M., Morales C., Munoz M., Vendrell E., Peinado M. A. (2008): Genome-wide tracking of unmethylated DNA Alu repeats in normal and cancer cells. Nucleic Acids Research Vol. 36, No. 3, 2008. 770-784.
- Weiske J. Huber O. (2006): The Histidine Triad Protein Hint1 Triggers Apoptosis Independent of Its Enzymatic Activity. The Journal of Biological chemistry. Vol. 281, No. 37, 2006. 27356–27366.
Wetenswaardigheden
Wat is next-generation sequencing?
Next-generation sequencing, ook wel Next Gen Sequencing (NGS), sequencing met een hoge verwerkingscapaciteit of sequencing van de tweede generatie genoemd, verwijst naar de benadering van massaal parallelle sequencing, waarbij per run zeer grote (massale) hoeveelheden DNA van miljoenen fragmenten gelijktijdig parallel worden gesequencet.
Om next-generation sequencing uit te voeren, zijn de drie basisstappen
- bibliotheekvoorbereiding,
- sequencing en
- data-analyse
vereist.
Tijdens de bibliotheekvoorbereiding moeten DNA-strengen worden gefragmenteerd tot DNA-fragmenten van een bepaalde lengte. Sonicatie is een van de voorkeursmethoden om DNA te fragmenteren.
Tijdens het DNA-sequencingproces wordt de volgorde van nucleotiden in DNA – bekend als de nucleïnezuursequentie – bepaald. De nucleïnezuursequentie bestaat uit vier nucleotidebasen – adenine, cytosine, guanine, thymine – die informatie coderen.
Next-generation sequencing stimuleert onderzoek in de levenswetenschappen en de gepersonaliseerde geneeskunde, omdat DNA- en RNA-sequencing intensief worden gebruikt in genoomonderzoek, kankeronderzoek, onderzoek naar zeldzame en complexe ziekten, microbieel onderzoek, agrigenomica en vele andere onderzoeksgebieden.
Next-generation sequencing versus Sanger-sequencing
Terwijl met next-generation sequencing (NGS) enorme aantallen genomische monsters kunnen worden gesequencet, kan Sanger-sequencing (ook bekend als de ketenterminatiemethode of sequencing van de eerste generatie) slechts kleine aantallen monsters sequencen. Sanger-sequencing sequencet slechts één DNA-fragment tegelijk en kan binnen één dag worden uitgevoerd. Vanwege de nauwkeurigheid wordt Sanger-sequencing ook beschouwd als de technologie die de gouden standaard vormt en wordt gebruikt om resultaten van next-generation sequencing te verifiëren.
Sanger-sequencing bereikt leeslengten van ongeveer 800bp (doorgaans 500–600bp met niet-verrijkt DNA). De langere leeslengten van Sanger-sequencing bieden aanzienlijke voordelen ten opzichte van andere sequencingmethoden, vooral bij het sequencen van repetitieve regio’s van het genoom. De beperkingen van sequentiegegevens met korte reads vormen vooral een probleem bij het sequencen van nieuwe genomen (de novo) en bij het sequencen van sterk herschikte genoomsegmenten, zoals die doorgaans voorkomen in kankergenomen of in chromosoomregio’s die structurele variatie vertonen. [vgl. Morozova and Marra, 2008]
DNA – desoxyribonucleïnezuur – vormen en functies
Elke vorm van DNA heeft unieke kenmerken en toepassingen en draagt bij aan een breed spectrum aan onderzoeksgebieden, waaronder oncologie, genetica, forensische wetenschap en evolutiebiologie. Sonicatoren van Hielscher vormen een zeer efficiënte en betrouwbare oplossing om DNA en RNA te isoleren en te fragmenteren voor uw analysedoeleinden. In de onderstaande lijst lichten wij de specifieke vormen van DNA toe en categoriseren wij ze op basis van hun biologische context en functies:
- Genomisch DNA (gDNA)
Genomisch DNA (gDNA): De volledige verzameling DNA in een organisme, inclusief zowel coderende (genen) als niet-coderende regio’s. - Extracellulair DNA
Circulerend tumor-DNA (ctDNA): DNA-fragmenten die door tumorcellen in de bloedbaan worden afgegeven.
Celvrij DNA (cfDNA): DNA-fragmenten die vrij in de bloedbaan circuleren en afkomstig zijn uit verschillende weefsels. - Extrachromosomaal circulair DNA (eccDNA): Circulaire DNA-moleculen die zich buiten de chromosomen in eukaryote cellen bevinden.
Viraal DNA: DNA dat afkomstig is van virussen, hetzij geïntegreerd in het gastheergenoom, hetzij als episomaal DNA. - Mitochondriaal DNA
Mitochondriaal DNA (mtDNA): DNA dat zich in de mitochondriën bevindt, via de moeder wordt overgeërfd en betrokken is bij de energieproductie. - Plasmide-DNA
Plasmide-DNA: Kleine, circulaire DNA-moleculen die zich onafhankelijk van het chromosomale DNA repliceren, vaak in bacteriën voorkomen en worden gebruikt bij genetische manipulatie. - Kern-DNA
Kern-DNA (nDNA): DNA dat zich in de kern van eukaryote cellen bevindt en het grootste deel van het genetische materiaal in een organisme vormt. - DNA uit één cel
DNA uit één cel (scDNA): DNA dat uit één cel wordt geëxtraheerd en wordt gebruikt voor gedetailleerde genoomanalyse op het niveau van de individuele cel. - Recombinant DNA
Recombinant DNA (rDNA): DNA-moleculen die met laboratoriummethoden voor genetische recombinatie worden gevormd om genetisch materiaal uit meerdere bronnen samen te brengen. - Gespecialiseerde vormen
Omgevings-DNA (eDNA): DNA dat wordt verzameld uit omgevingsmonsters (bodem, water) zonder de bronorganismen te isoleren
Oud DNA (aDNA): DNA dat uit oude specimens wordt geëxtraheerd en inzicht biedt in de evolutiebiologie en oude populaties. - Chromosomaal DNA
Chromosomaal DNA: DNA dat de chromosomen in de celkern vormt en zowel coderende als niet-coderende regio’s omvat. - Virale en synthetische vormen
Viraal DNA: DNA dat afkomstig is van virussen en dat geïntegreerd kan zijn in gastheergenomen of als zelfstandige entiteiten kan bestaan.
Synthetisch DNA: Kunstmatig gesynthetiseerde DNA-sequenties die via chemische processen worden gemaakt en vaak worden gebruikt in onderzoek en biotechnologie.
Hielscher Ultrasonics produceert ultrasone homogenisatoren met hoge prestaties in formaten van laboratoriumformaat tot industrieel formaat.