Protocol voor bepaling van de minimale remmende concentratie (MIC)
De Biofilm-gebaseerde Minimum Inhibitory Concentration (MIC)-test is een essentiële methode voor het evalueren van de effectiviteit van antimicrobiële stoffen tegen biofilm-geassocieerde micro-organismen, die een verhoogde weerstand vertonen vanwege hun beschermende extracellulaire matrix. Een cruciale stap in deze test is de verstoring van biofilmstructuren om ingesloten cellen vrij te maken voor een nauwkeurige beoordeling van de levensvatbaarheid. De UIP400MTP sonicator voor meerdere wells vergemakkelijkt dit proces door gebruik te maken van gefocust ultrasoon geluid om gecontroleerde cavitatie te genereren, waardoor biofilmcellen efficiënt worden losgemaakt en in een uniforme suspensie worden gedispergeerd. Deze nauwkeurige en reproduceerbare verstoring van de biofilm verbetert de betrouwbaarheid en verwerkingscapaciteit van MIC-tests, waardoor de UIP400MTP een essentieel hulpmiddel is voor de vooruitgang van biofilmonderzoek.
Sonificatie voor biofilmonthechting
De Biofilm-gebaseerde MIC-test meet gewoonlijk de levensvatbaarheid of groeiremming van bacteriën met behulp van methoden zoals uitplaten, kolonietelling of optische dichtheidsmetingen. Sonificatie is een cruciale stap in MIC-tests op basis van biofilm bij het bepalen van de antimicrobiële gevoeligheid van micro-organismen die met biofilm geassocieerd zijn. De belangrijkste functie is het losmaken en dispergeren van cellen in de biofilmmatrix tot een uniforme suspensie voor nauwkeurige analyse.
Biofilms zijn aanzienlijk resistenter tegen antimicrobiële middelen in vergelijking met planktoncellen, waardoor een goede onthechting essentieel is voor een nauwkeurige analyse. Tijdens dit proces genereren ultrasone golven gecontroleerde cavitatie, waardoor de biofilmmatrix uiteenvalt en de ingebedde cellen vrijkomen in een uniforme suspensie in het herstelmedium. Deze stap maakt een nauwkeurige beoordeling van de levensvatbaarheid van de biofilmcellen mogelijk door methoden zoals uitplaten, verdunnen en kolonietelling. Een juiste verstoring van de biofilm door sonicatie voorkomt dat achtergebleven matrixcomponenten de cellen afschermen, wat anders zou kunnen leiden tot een onderschatting van de antimicrobiële activiteit. De multi-well plaat sonicator UIP400MTP is bijzonder geschikt voor dit doel en biedt nauwkeurige en reproduceerbare sonicatiecondities voor een betrouwbare en high-throughput bereiding van testplaten.
UIP400MTP microtiterplaat sonicator voor nauwkeurig controleerbare biofilmonthechting in MIC en MBEC testen.
Waarom Sonicatie nodig is in Biofilm-gebaseerde Minimum Inhibitrory Concentration Assays
Voor levensvatbaarheidsmetingen en celtellingen is een volledige en betrouwbare losmaking en dispersie van afzonderlijke cellen vereist. De UIP400MTP zorgt voor een uniforme, niet-schadelijke biofilmdetachering en celdispersie voor robuuste testresultaten.
- Complexiteit van de biofilm: Biofilms zijn gestructureerde microbiële gemeenschappen ingekapseld in een extracellulaire polymere substantie (EPS) matrix, die de micro-organismen beschermt en ze resistenter maakt tegen antimicrobiële middelen.
- Uniforme verspreiding: Om de levensvatbaarheid van in een biofilm ingebedde cellen of hun gevoeligheid voor antimicrobiële stoffen nauwkeurig te meten, moet de biofilm eerst losgemaakt worden en uiteenvallen in een homogene suspensie.
Biofilm-gebaseerd Minimum Inhibitory Concentration Assay Protocol
De MIC-test (Minimum Inhibitory Concentration) bepaalt de laagste concentratie van een antimicrobiële stof die nodig is om de zichtbare groei van micro-organismen te remmen. Dit protocol is ontworpen voor biofilm-geassocieerde micro-organismen, waarbij gebruik wordt gemaakt van de UIP400MTP multi-well plaat sonicator voor biofilmverstoring.
Stap 1: Bereiding van bacterieel inoculum
- Bereid de bacteriesuspensie:
Laat bacteriën in geschikte media groeien tot de mid-logaritmische fase.
Verdun de kweek om een gestandaardiseerde celdichtheid te bereiken (bijvoorbeeld 0,5 McFarland-standaard of OD600 ~0,1). - Bereid antimicrobiële oplossingen:
Verdun het antimicrobiële middel in een geschikt medium om een reeks concentraties te maken (bijvoorbeeld tweevoudige seriële verdunningen). - Doseer in de 96well-plaat:
Voeg de antimicrobiële oplossingen toe aan de wells van een standaard 96-wells plaat, met een uiteindelijk wellvolume van ~150-200 µL.
Neem groeicontroles (geen antimicrobiële) en steriliteitscontroles (geen bacterieel inoculum) op.
Stap 2: Biofilmvorming op het knijperdeksel
- Bevestig het deksel van de knijper:
Plaats het deksel van de speciale pin op de geënte wells en zorg ervoor dat de pinnen volledig ondergedompeld zijn in de bacteriesuspensie. - Incubeer de plaat:
Incubeer bij de juiste temperatuur (bijv. 37°C) gedurende een bepaalde tijd (bijv. 24 uur) onder statische omstandigheden om biofilmvorming op de pinnen mogelijk te maken. - Spoel de wasknijpers af:
Verwijder het knijperdeksel van de bacteriesuspensie en spoel voorzichtig in steriele zoutoplossing of PBS om loszittende planktoncellen te verwijderen. - Blootstelling aan antimicrobiële stoffen:
Breng de pindeksel over in een nieuwe 96well-plaat die de eerder bereide antimicrobiële verdunningen bevat.
Incubeer gedurende een bepaalde periode (bijv. 24 uur) onder statische omstandigheden zodat het antimicrobiële middel op de biofilms kan inwerken.
Stap 3: Blootstelling aan antimicrobiële stoffen
Multi-well platen sonicator UIP400MTP voor high-throughput monstervoorbereiding
Stap 4: Sonificeren met de microplaat Sonicator UIP400MTP
De sonicatiestap is cruciaal om biofilms los te maken van de deksels van de haringen om de levensvatbaarheid te beoordelen. Volg deze stappen voor de UIP400MTP sonicator:
- Bereid de opstelling voor:
Vul een nieuwe 96-well plaat met medium voor herstel (bijvoorbeeld neutralisatiebouillon of steriel groeimedium) in elke well. - Breng de knijperdeksel over:
Verwijder het deksel van de antimicrobiële behandelingsplaat.
Spoel het deksel van de pin in steriele zoutoplossing of PBS om achtergebleven antimicrobiële middelen te verwijderen. - Plaats de plaat in de sonicator:
Bevestig het deksel van de pin op de plaat met medium voor herstel.
Plaats de plaat met medium voor herstel in de UIP400MTP sonicator en zorg ervoor dat de plaat gecentreerd en stabiel staat zoals beschreven in de handleiding. - Pas de sonicatieparameters aan:
Stel de sonicatieparameters in op de UIP400MTP (instellingen kunnen worden aangepast aan de biofilm):
Amplitude: 70-100%.
Sonificatietijd: 1-3 minuten (aanpassen op basis van de structuur van de biofilm) in cyclusmodus. - Sonicate:
Start het sonicatieproces. De ultrasone golven zullen de biofilmmatrix verstoren en de cellen in het herstelmedium losmaken. - Bewaak het proces:
Gebruik de insteekbare temperatuursensor om de monstertemperatuur in de wells te controleren. De UIP400MTP kan aangesloten worden op een koelmachine voor koeling. - Post-sonatiebehandeling:
Breng het medium met losgemaakte biofilms onmiddellijk over in een nieuwe steriele plaat voor verdere analyse.
(A) Plaat met TSB met 2% glucose gebruikt voor biofilmvorming, celherstel en bepaling van MIC en MBEC; (B) Deksel met pinnen voor de vorming van stafylokokkenbiofilms.
De biofilmcellen die zich op de pinnen vormden, werden door middel van sonicatie (Hielscher Ultrasound Technology) gedurende 5 minuten losgemaakt in 96-wellsplaten met vers kweekmedium voor herstel van de cellen.
(Afbeelding en studie: ©de Oliveira et al., 2016)
Stap 4: Levensvatbaarheidsbeoordeling
Plaat en kweek losgemaakte biofilms:
- Voer seriële verdunningen van het recovery medium uit en plaats deze op agar om kolonievormende eenheden (CFU) te tellen.
- MIC evalueren:
Bepaal de MIC als de laagste antimicrobiële concentratie die de zichtbare microbiële groei in het herstelmedium volledig remt.
Ontwerp, productie en advies – Kwaliteit Made in Germany
Hielscher ultrasone machines staan bekend om hun hoge kwaliteit en ontwerpnormen. Robuustheid en eenvoudige bediening zorgen voor een soepele integratie van onze ultrasone machines in industriële faciliteiten. Ruwe omstandigheden en veeleisende omgevingen worden gemakkelijk door Hielscher ultrasone machines aangepakt.
Hielscher Ultrasonics is een ISO-gecertificeerd bedrijf en legt speciale nadruk op hoogwaardige ultrasone apparaten met state-of-the-art technologie en gebruiksvriendelijkheid. Uiteraard zijn de Hielscher ultrasoonapparaten CE-conform en voldoen ze aan de eisen van UL, CSA en RoHs.
Stroomlijn monstervoorbereiding in 96-well platen en assayplaten met behulp van de multi-wells sonicator UIP400MTP
Literatuur / Referenties
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
veelgestelde vragen
Wat is de MIC Assay?
De minimale remmende concentratie (MIC-test) is een gestandaardiseerde test die wordt gebruikt om de laagste concentratie van een antimicrobiële stof te bepalen die nodig is om de zichtbare groei van een micro-organisme te remmen. De test wordt gewoonlijk uitgevoerd met behulp van broth microdilutie of agar verdunningsmethoden, waarbij micro-organismen worden blootgesteld aan seriële verdunningen van het antimicrobiële middel. MIC-tests zijn essentieel voor het evalueren van de antimicrobiële werkzaamheid, het sturen van klinische behandelingen en het beoordelen van resistentieniveaus bij zowel planktonische als biofilm-geassocieerde micro-organismen.
Wat is het verschil tussen de Biofilm-gebaseerde Minimum Inhibitory Concentration Assay en de MBIC-assay?
De op biofilm gebaseerde Minimum Inhibitory Concentration (MIC)-test en de Minimum Biofilm Inhibitory Concentration (MBIC)-test zijn verwant, maar verschillend in hun doel en methodologie.
De MIC-test op basis van biofilm evalueert de laagste concentratie van een antimicrobiële stof die nodig is om zichtbare biofilmgroei of levensvatbaarheid te remmen, waarbij de nadruk ligt op biofilm-geassocieerde cellen in plaats van planktonische bacteriën. De MBIC-test meet daarentegen specifiek het vermogen van een antimicrobiële stof om biofilmvorming te voorkomen, in plaats van reeds gevormde biofilms te behandelen. Hoewel beide tests te maken hebben met biofilm-geassocieerde bacteriën, richt de op biofilm gebaseerde MIC-test zich op behandeling en legt de MBIC-test de nadruk op preventie, waardoor ze complementaire instrumenten zijn voor het bestuderen van de antimicrobiële werkzaamheid tegen biofilms.
Welke biofilms worden gebruikt in MIC-tests?
Microbiële biofilms en planktoncellen worden beide gebruikt in minimale remmende concentraties (MIC) om de antimicrobiële werkzaamheid onder verschillende omstandigheden te bestuderen.
- Planktonische cellen:
Planktonische cellen zijn vrij zwevende, afzonderlijke microbiële cellen die dienen als standaardmodel voor traditionele MIC-tests. Veel voorkomende micro-organismen zijn Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus en Candida albicans. Deze testen bepalen de MIC die nodig is om de groei van vrij levende cellen te remmen en zijn essentieel voor initiële antimicrobiële screening. - Biofilm-geassocieerde cellen:
Biofilmcellen zijn micro-organismen die ingebed zijn in een extracellulaire matrix, waardoor hun resistentie tegen antimicrobiële stoffen aanzienlijk toeneemt. Biofilm MIC-tests omvatten vaak:- Gramnegatieve bacteriën: Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa en Klebsiella pneumoniae, die bekend staan om hun biofilmvorming in infecties en industriële omgevingen.
- Gram-positieve bacteriën: Staphylococcus aureus (inclusief MRSA), Staphylococcus epidermidis en Enterococcus faecalis, die vaak betrokken zijn bij apparaatgerelateerde infecties.
- Schimmels: Candida albicans en verwante soorten, belangrijk in biofilm-gerelateerde schimmelinfecties.
- Gemengde soorten biofilms: Deze worden soms gebruikt om natuurlijke polymicrobiële biofilms na te bootsen, zoals die gevonden worden in chronische wonden of industriële biofouling.
Door de MIC-waarden voor planktoncellen en biofilm-geassocieerde cellen te vergelijken, kunnen onderzoekers de verhoogde resistentie van biofilms beoordelen en agentia identificeren die effectief zijn tegen deze meer veerkrachtige microbiële gemeenschappen.
Wat is het verschil tussen MIC en MBEC?
De minimale remmende concentratie (MIC) is de laagste concentratie van een antimicrobiële stof die nodig is om biofilmvorming te voorkomen, terwijl de minimale biofilmuitroeiingsconcentratie (MBEC) de laagste concentratie is die nodig is om een gevestigde biofilm uit te roeien. MIC richt zich op biofilmpreventie, terwijl MBEC de doeltreffendheid van de behandeling tegen volwassen biofilms beoordeelt.
Welke platen worden gewoonlijk gebruikt voor MBEC-assays?
Microtiterplaten die gewoonlijk gebruikt worden voor MBEC-tests zijn meestal 96-wells platen gemaakt van polystyreen of polypropyleen. Deze materialen bieden een geschikt oppervlak voor biofilmvorming en zijn chemisch resistent tegen de antimicrobiële stoffen die tijdens de test worden getest. Polystyreenplaten genieten de voorkeur vanwege hun optische helderheid, wat voordelig is voor downstreamanalyses zoals spectrofotometrische of op fluorescentie gebaseerde metingen. Het ontwerp van deze platen omvat afneembare knijperdeksels, die essentieel zijn voor de assay aangezien biofilms zich vormen op de knijpers die in de wells met groeimedia zijn ondergedompeld. Gestandaardiseerde platen, zoals die welke voldoen aan het MBEC-assayprotocol, zijn speciaal ontworpen om reproduceerbaarheid en compatibiliteit met de UIP400MTP sonicator of andere verwerkingsapparatuur te garanderen.
Wat zijn PEG-Lid Plates?
PEG-dekselplaten zijn gespecialiseerde multi-well plaatsystemen waarbij het deksel is voorzien van kleine polyethyleenglycol (PEG) pinnen die in elke well uitsteken. Deze pinnen bieden een oppervlak voor microbiële biofilmvorming onder gecontroleerde omstandigheden, waardoor echte biofilmgroei wordt nagebootst. Door het ontwerp kunnen biofilms zich op de pinnen ontwikkelen terwijl de wells groeimedia of antimicrobiële stoffen bevatten, waardoor het mogelijk wordt om met hoge snelheid de gevoeligheid van biofilms voor behandelingen te testen, zoals in MBEC-, MBIC- en MIC-tests.
Wat is het voordeel van ultrasone biofilmverwijdering ten opzichte van celschrapen?
Ultrasone biofilmverwijdering biedt een aanzienlijk voordeel ten opzichte van het schrapen van cellen door een niet-invasieve, uniforme en zeer efficiënte methode te bieden om biofilms van oppervlakken te verwijderen. In tegenstelling tot schrapen, dat inconsistent kan zijn en het onderliggende oppervlak of de cellen kan beschadigen, dringen ultrasone golven door in de biofilmmatrix en breken deze uiteen zonder de integriteit van aangrenzende structuren aan te tasten. Deze methode garandeert reproduceerbaarheid, minimaliseert het risico op besmetting en is bijzonder effectief voor toepassingen die een nauwkeurige verwijdering van de biofilm vereisen, zoals microbiologische studies of het testen van medische apparatuur. Lees meer over hoe de UIP400MTP Sonicator uitblinkt in het schrapen van cellen!
Hielscher Ultrasonics produceert hoogwaardige ultrasone homogenisatoren van lab naar industrieel formaat.


