Sonicatie voor assays – De Assay-at-Once sonicator UIP400MTP
Sonicatie is een essentiële techniek in laboratoriumprotocollen, vooral voor toepassingen zoals assays voor chromatine-immunoprecipitatie (ChIP). Door ultrasone energie te gebruiken om cellen open te breken, DNA door afschuiving te fragmenteren en chromatine te solubiliseren, stelt sonicatie onderzoekers in staat monsters efficiënter en reproduceerbaarder voor te bereiden. De sonicators voor multiwellplaten van Hielscher behoren tot de meest geavanceerde en effectieve hulpmiddelen die hiervoor beschikbaar zijn. Ze stroomlijnen workflows met een hoge verwerkingscapaciteit doordat ze geschikt zijn voor platen met maximaal 96 wells.
Belangrijkste voordelen van sonicators voor multiwellplaten voor assays
De contactloze sonicators voor 96-wellsplaten van Hielscher, zoals de UIP400MTP, bieden een zeer betrouwbare en gecontroleerde aanpak voor cellysis en fragmentatie van chromatine door afschuiving. Dit contactloze ontwerp zorgt ervoor dat elke well gelijkmatig wordt behandeld, wat consistente resultaten oplevert bij grote aantallen monsters. Met deze sonicator kunnen onderzoekers meerdere processen uitvoeren, waaronder:
- Cellysis: Effectieve sonicatie breekt celmembranen open, waardoor de celinhoud vrijkomt.
- Fragmentatie van DNA en RNA door afschuiving: Ultrasone golven met hoge intensiteit fragmenteren DNA en RNA tot de gewenste grootte, wat essentieel is voor daaropvolgende assays.
- Chromatinefragmentatie: Fragmentatie van chromatine door afschuiving tot kleinere stukken voor daaropvolgende analyses, zoals chromatine-immunoprecipitatie (ChIP), DNA-sequencing of andere epigenetische onderzoeken. Lees meer over chromatinefragmentatie met de UIP400MTP!
- Solubilisatie: Verbetert de oplosbaarheid van monsterbestanddelen en helpt zo bij het voorbereiden van uniforme, reproduceerbare monsters voor assays.
Deze functies zijn essentieel voor monstervoorbereiding met een hoge verwerkingscapaciteit en miniaturisatie van monsters, omdat ze onderzoekers in staat stellen meerdere monsters te verwerken met een minimaal risico op kruisbesmetting.
Het belang van sonicatie bij ChIP-assays
Assays voor chromatine-immunoprecipitatie (ChIP) zijn afhankelijk van nauwkeurige fragmentatie van chromatine door afschuiving om DNA-fragmenten van een optimale grootte te verkrijgen, doorgaans tussen 200–600 basenparen (bp). Deze fragmenten zijn noodzakelijk voor effectieve immunoprecipitatie, nauwkeurige piekresolutie en betrouwbare resultaten bij ChIP-Seq-assays. De Hielscher UIP400MTP Assay-At-Once sonicator is bijzonder geschikt voor ChIP-protocollen en zorgt voor uniforme chromatinefragmentatie in meerdere wells. De voordelen van deze precisie in ChIP-workflows zijn onder meer:
- Hoge chromatineopbrengst: Efficiënte sonicatie maakt uit elk monster een grotere hoeveelheid chromatine vrij.
- Consistentie tussen monsters: De sonicator voor multiwellplaten zorgt voor consistente fragmentgroottes in alle wells en vermindert zo de variabiliteit bij ChIP-assays.
- Verbeterde gevoeligheid en resolutie bij ChIP-Seq: Correct gefragmenteerd DNA zorgt voor een duidelijkere piekresolutie, een cruciale factor bij het detecteren van nauwkeurige interacties tussen eiwitten en DNA.
De rol van betrouwbare sonicatie bij succesvolle assays
Voor assays met grote aantallen monsters, zoals bij klinische diagnostiek of geneesmiddelenonderzoek, zijn reproduceerbaarheid en verwerkingscapaciteit essentieel. De sonicators voor multiwellplaten van Hielscher bieden een oplossing door uniforme monstervoorbereiding in een groot aantal wells mogelijk te maken. Deze consistentie verbetert niet alleen de robuustheid van assays, maar verhoogt ook de algehele efficiëntie van de workflow, waardoor tijd en middelen in het laboratorium worden bespaard.
De sonicators voor multiwellplaten van Hielscher zijn van onschatbare waarde in assayprotocollen, vooral wanneer verwerking met een hoge capaciteit vereist is. Door betrouwbare cellysis, fragmentatie van DNA door afschuiving en solubilisatie te garanderen, optimaliseren deze sonicators de monstervoorbereiding voor nauwkeurige en reproduceerbare resultaten. Voor onderzoekers die met ChIP-assays werken, biedt de sonicator UIP400MTP een robuust hulpmiddel dat de chromatineopbrengst, de consistentie van fragmenten en de gevoeligheid van assays verbetert – wat uiteindelijk leidt tot succesvollere experimenten en duidelijkere inzichten.
Belangrijkste kenmerken van de sonicator voor multiwellplaten UIP400MTP
| Sonicatie met een hoge verwerkingscapaciteit | De UIP400MTP is perfect geschikt voor 96-wellsplaten en andere multiwellplaten en maakt gelijktijdige, identieke sonicatie van meerdere monsters mogelijk. Dit verkort de duur van de monstervoorbereiding aanzienlijk en verhoogt de verwerkingscapaciteit bij het testen van grote aantallen monsters. |
| Gebruik de multiwellplaat van uw keuze | De UIP400MTP is ontworpen voor sonicatie van alle standaard multiwellplaten, PCR-platen of microtiterplaten. U kiest de plaat die het meest geschikt is voor uw experimenten. Omdat de UIP400MTP geen merkspecifieke verbruiksartikelen vereist, bespaart u hiermee veel geld! |
| Contactloze ultrasone behandeling | De sonicator voor multiwellplaten UIP400MTP past intensief ultrageluid toe zonder iets in het monster te steken. U kunt verzegelde multiwellplaten, gesloten vaten en flesjes sonificeren. Hielscher levert op maat gemaakte monsterhouders voor alle niet-standaard flesjes of vaten. |
| Precisie en controle | Met nauwkeurige regeling en slimme software kunt u de ultrasone parameters optimaal afstemmen op uw specifieke verwerkingsbehoeften. U krijgt bij elk experiment maximale efficiëntie en effectiviteit van de sonicatie. |
| Temperatuurregeling | Stel een specifieke temperatuur in voor uw sonicatie. De sonicator voor platen UIP400MTP kan de monstertemperatuur bewaken en de sonicatie daarop aanpassen. Een recirculerende koelvloeistof koelt elke well in de plaat voor een nauwkeurige temperatuurregeling. |
| Procesregistratie en bediening op afstand | Elke sonicatiecyclus kan vanaf een computer worden aangestuurd. Er is geen software-installatie nodig. U kunt uw standaardbrowser (bijv. Chrome, Firefox, Edge of Safari) op elk besturingssysteem (bijv. MacOS, Windows, Android, iOS of Linux) gebruiken om de UIP400MTP op afstand te bedienen en te bewaken. Elke sonicatiecyclus levert een gedetailleerd sonicatieverslag op voor evaluatie en documentatie. Het verslagbestand heeft een niet-merkgebonden CSV-formaat dat u kunt openen met het programma van uw voorkeur, bijv. Microsoft Excel, Apple Numbers of OpenOffice Calc. |
| Robuust en betrouwbaar | De UIP400MTP is in Duitsland ontworpen en gebouwd volgens de hoogste kwaliteitsnormen en is niet alleen krachtig, maar ook opmerkelijk duurzaam. Het ontwerp voldoet aan industriële normen en is moeiteloos bestand tegen de zware belasting van dagelijks gebruik in een veeleisende laboratoriumomgeving. U kunt de UIP400MTP bij toepassingen met een hoge verwerkingscapaciteit continu gebruiken, 24 uur per dag, 7 dagen per week. |
Hoe de UIP400MTP miniaturisatie van assays mogelijk maakt
De sonicator voor multiwellplaten UIP400MTP van Hielscher speelt een cruciale rol bij de miniaturisatie van assays en stelt wetenschappers en clinici in staat assayvolumes te verkleinen zonder in te boeten aan nauwkeurigheid of precisie. Deze mogelijkheid is van onschatbare waarde in vakgebieden zoals microbiologie, geneesmiddelenonderzoek, diagnostiek, gepersonaliseerde geneeskunde en klinische diagnostiek, waar geminiaturiseerde assays efficiënter, kosteneffectiever en sneller testen mogelijk maken.
- Contactloze sonicatie in 96-wellsplaten
De contactloze sonicatietechnologie van de UIP400MTP is bij uitstek geschikt voor geminiaturiseerde assayformaten. Doordat deze sonicator geschikt is voor 96-wellsplaten, kan hij zeer kleine monstervolumes gelijktijdig in meerdere wells verwerken. Traditionele sonicatiemethoden hebben bij kleinere volumes vaak moeite om consistentie te bereiken door een ongelijkmatige energieverdeling, maar de UIP400MTP levert uniforme ultrasone golven in alle wells, waardoor de resultaten ook bij geminiaturiseerde formaten betrouwbaar blijven. - Precisie en uniformiteit tussen monsters
Miniaturisatie vereist nauwkeurige controle over de monstervoorbereiding, omdat kleinere volumes gevoeliger kunnen zijn voor variaties. De gerichte sonicatie van de UIP400MTP zorgt ervoor dat elke well een identiek sonicatieniveau ontvangt, wat essentieel is om de nauwkeurigheid en reproduceerbaarheid voor alle monsters te behouden. Deze consistentie is cruciaal in vakgebieden zoals geneesmiddelenonderzoek en klinische diagnostiek, waar zelfs kleine variaties de resultaten kunnen beïnvloeden. Lees meer over gerichte sonicatie! - Efficiënte cellysis en fragmentatie van DNA door afschuiving bij kleinere volumes
Bij kleinere volumes worden efficiënte cellysis en fragmentatie van DNA door afschuiving lastiger, terwijl ze cruciaal zijn voor hoogwaardige assayresultaten. De ultrasone golven met hoge intensiteit van de UIP400MTP zijn krachtig genoeg om zelfs bij kleinere volumes effectieve celontsluiting en fragmentatie van DNA door afschuiving te bereiken. Dankzij deze mogelijkheid kunnen onderzoekers lysaten en DNA-fragmenten van de benodigde kwaliteit verkrijgen zonder de volumes te hoeven vergroten, waardoor het een ideaal hulpmiddel is voor geminiaturiseerde workflows. - Kostenbesparing en efficiënt gebruik van middelen
Geminiaturiseerde assays verbruiken minder reagentia en verminderen de verspilling van monstermateriaal, wat vooral gunstig is bij het werken met zeldzame of dure monsters. De UIP400MTP ondersteunt dit door monstervoorbereiding met een hoge verwerkingscapaciteit bij kleine volumes mogelijk te maken, zodat wetenschappers hun middelen maximaal kunnen benutten. In vakgebieden zoals gepersonaliseerde geneeskunde, waar van patiënten afkomstig monstermateriaal beperkt beschikbaar kan zijn, is deze efficiëntie bijzonder voordelig. - Hogere verwerkingscapaciteit en snelheid
Door assayvolumes te verkleinen, helpt de UIP400MTP laboratoria meer monsters in kortere tijd te verwerken, waardoor de verwerkingscapaciteit aanzienlijk toeneemt. Deze snelle verwerking is cruciaal in vakgebieden met een grote vraag, zoals diagnostiek en geneesmiddelenonderzoek, waar tijdkritische resultaten rechtstreeks van invloed kunnen zijn op de patiëntenzorg of onderzoeksresultaten. Geminiaturiseerde assays in combinatie met de hoge verwerkingscapaciteit van de UIP400MTP maken sneller testen en analyseren op grote schaal mogelijk. - Ondersteunt automatisering en screening met een hoge verwerkingscapaciteit
De compatibiliteit van de UIP400MTP met alle standaardformaten van multiwellplaten maakt naadloze integratie mogelijk met geautomatiseerde systemen die worden gebruikt voor screening met een hoge verwerkingscapaciteit. Deze integratie is een groot voordeel in vakgebieden zoals microbiologie en geneesmiddelenonderzoek, waar snelle, geautomatiseerde verwerking essentieel is voor het screenen van grote bibliotheken van verbindingen of het analyseren van talrijke microbiële stammen.
De UIP400MTP maakt miniaturisatie van assays mogelijk door betrouwbare sonicatie voor kleine volumes te leveren en zo precisie en consistentie tussen monsters te garanderen. Doordat het apparaat geminiaturiseerde assays met een hoge nauwkeurigheid, reproduceerbaarheid en efficiëntie kan verwerken, kunnen wetenschappers en clinici volumes verkleinen en tegelijkertijd snellere, kosteneffectieve en hoogwaardige resultaten bereiken in diverse onderzoeks- en klinische vakgebieden. Lees meer!
Assays die mogelijk worden gemaakt door de sonicator voor multiwellplaten UIP400MTP
De sonicator voor multiwellplaten UIP400MTP wordt gebruikt voor assays waarbij celontsluiting nodig is om eiwitten en biomoleculen vrij te maken, voor biofilmonderzoek en voor antimicrobiële tests, zoals:
- ELISA: Sonicatie wordt gebruikt wanneer bij de monstervoorbereiding cellen moeten worden opengebroken om eiwitextracten te verkrijgen.
- MBEC-assays (minimale biofilm-eradicatieconcentratie): Voor het bepalen van de concentratie antimicrobiële middelen die nodig is om gevestigde biofilms te elimineren. Lees meer over het gebruik van de UIP400MTP voor MBEC-assays, inclusief protocol.
- MBIC-assays (minimale biofilmremmende concentratie): Voor het beoordelen van het vermogen van antimicrobiële middelen om biofilmvorming te voorkomen.
- Assays voor biofilmkwantificatie: Voor het opbreken van biofilms om biomassa of celviabiliteit te meten met methoden zoals CFU-tellingen of spectrofotometrie.
- Geneesmiddelenscreening met een hoge verwerkingscapaciteit: Voor het beoordelen van de werkzaamheid van antimicrobiële verbindingen tegen biofilmvormende bacteriën in multiwellformaten.
- Extractie van extracellulaire matrix: ECM-extractie is een essentiële stap in de monstervoorbereiding voorafgaand aan talrijke assays. Vind hier het protocol voor extractie van extracellulaire matrix met een hoge verwerkingscapaciteit met de UIP400MTP!
- PMCA: Cyclische amplificatie van verkeerd gevouwen eiwitten is een onmisbare stap voor betrouwbare priondetectie. Ontdek hoe de UIP400MTP PMCA met een hoge verwerkingscapaciteit mogelijk maakt voor robuuste resultaten!
Literatuur / Referenties
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- UIP400MTP-Multi-well-Plate-Sonicator-Infographic
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Veelgestelde vragen
Wat is sonicatie voor assays?
Sonicatie voor assays is een techniek die ultrasone golven gebruikt om cellen te ontsluiten, DNA door afschuiving te fragmenteren en eiwitten of chromatine te solubiliseren, waardoor efficiënte monstervoorbereiding voor biochemische assays mogelijk wordt.
Wat is een assay?
Een assay is een laboratoriumprocedure om de aanwezigheid, hoeveelheid of activiteit van een specifieke stof of analyt in een monster te meten, vaak om biologische, chemische of biochemische eigenschappen te beoordelen. Assays zijn een veelgebruikte procedure in klinische laboratoria, de levenswetenschappen, moleculaire biologie, farmacologie, milieubiologie en mijnbouw.
Wat is het verschil tussen een assay en een test?
De termen “assay” en “test” worden vaak door elkaar gebruikt, maar hebben in wetenschappelijke contexten verschillende betekenissen:
- Assay: Een assay is een nauwkeurige, kwantitatieve of semikwantitatieve analytische procedure die is ontworpen om de aanwezigheid, hoeveelheid of functionele activiteit van een specifieke stof (analyt) in een monster te meten. Assays zijn doorgaans goed gedefinieerde, reproduceerbare protocollen die worden gebruikt om zuiverheid, concentratie of biologische activiteit te beoordelen. Ze worden vaak gebruikt bij biochemische, farmacologische of chemische analyses.
- Test: Een test is een bredere term die verwijst naar elke methode of elk proces waarmee de eigenschappen of functionaliteit van een monster of systeem worden beoordeeld. Tests kunnen kwalitatief of kwantitatief zijn en variëren van eenvoudige beoordelingen (bijv. een pH-test) tot complexere evaluaties. In tegenstelling tot assays vereisen tests mogelijk een minder hoge mate van specificiteit of kwantitatieve meting.
Samenvattend zijn alle assays tests, maar zijn niet alle tests assays. Assays zijn doorgaans specifieker en kwantitatiever, terwijl tests een breed scala aan procedures kunnen omvatten met uiteenlopende specificiteit en mate van detail.
Wat zijn de drie typen assays?
De drie belangrijkste typen assays zijn:
- Biochemische assays: Deze assays meten de activiteit of concentratie van specifieke moleculen (zoals enzymen, substraten of metabolieten) in biochemische reacties. Ze worden veel gebruikt om enzymkinetiek, bindingsaffiniteiten en metabole routes te analyseren.
- Celgebaseerde assays: Celgebaseerde assays beoordelen de effecten van verbindingen, eiwitten of andere stoffen op levende cellen. Ze meten parameters zoals celviabiliteit, proliferatie, cytotoxiciteit, signaalroutes en genexpressie en bieden daarmee inzicht in cellulaire reacties en de effecten van geneesmiddelen.
- Immunoassays: Immunoassays gebruiken antilichamen om specifieke antigenen of analyten in een monster te detecteren en te kwantificeren. Veelvoorkomende typen zijn ELISA (enzymgekoppelde immunosorbentassay), westernblotting en immunofluorescentie. Deze assays worden veel gebruikt in diagnostiek en onderzoek om eiwitten, hormonen en ziekteverwekkers te detecteren.
Elk van deze assays is essentieel in onderzoek, diagnostiek en geneesmiddelenontwikkeling, omdat ze kwantitatieve of kwalitatieve gegevens over verschillende biologische of chemische eigenschappen opleveren.
Wat zijn de belangrijkste assays in de levenswetenschappen en microbiologie?
- Enzymgekoppelde immunosorbentassay (ELISA): ELISA is een veelgebruikte immunoassay om specifieke eiwitten, antilichamen of antigenen in biologische monsters te detecteren en te kwantificeren. Deze assay is van onschatbare waarde voor het diagnosticeren van ziekten, het volgen van immuunreacties en het detecteren van biomarkers. Bij het analyseren van intracellulaire componenten wordt sonicatie gebruikt om cellen of weefsels te lyseren en zo doeleiwitten vrij te maken.
- Assays met de polymerasekettingreactie (PCR): PCR en varianten daarvan (zoals qPCR en RT-PCR) amplificeren DNA of RNA en maken zo snelle detectie en kwantificatie van specifiek genetisch materiaal mogelijk. Deze assays zijn cruciaal voor de detectie van ziekteverwekkers, genetisch onderzoek en diagnostiek. Sonicatie wordt gebruikt voor DNA-extractie uit cellen of weefsels, vooral bij onderzoek naar microbiële of eukaryote cellen met stevige celwanden of membranen.
- Westernblotting: Deze techniek detecteert en kwantificeert specifieke eiwitten in een monster en levert informatie over eiwitexpressie, molecuulgewicht en posttranslationele modificaties. De techniek wordt op grote schaal gebruikt in de moleculaire biologie en bij onderzoek naar ziekten. Sonicatie wordt gebruikt om cellen of weefsels te lyseren, zodat eiwitten vrijkomen en door afschuiving worden gefragmenteerd ter voorbereiding op de analyse.
- Reportergenassays: Deze assays meten genexpressie en regulerende activiteit door reportergenen zoals GFP of luciferase in cellen in te brengen. Ze worden veel gebruikt om genexpressie, promotoractiviteit en de effecten van geneesmiddelen op signaalroutes te onderzoeken. Sonicatie wordt soms gebruikt wanneer cellen worden gelyseerd om reportergenproducten, zoals enzymen als luciferase, in celgebaseerde assays te analyseren.
- Assays voor chromatine-immunoprecipitatie (ChIP): ChIP-assays onderzoeken interacties tussen eiwitten en DNA en stellen onderzoekers in staat transcriptiefactoren, histonmodificaties en epigenetische regulatie van genexpressie te bestuderen. Dit is belangrijk bij onderzoek naar genregulatie en ziekten. Sonicatie is een cruciale stap om chromatine door afschuiving tot geschikte fragmentgroottes te verkleinen, waardoor effectieve immunoprecipitatie mogelijk wordt. Lees meer over ultrasone chromatinefragmentatie!
- Luminex-assays: Deze multiplexassays op basis van beads meten gelijktijdig meerdere analyten (bijv. cytokinen, hormonen) in één monster en zijn nuttig in de immunologie, oncologie en bij het ontdekken van biomarkers. Sonicatie wordt gebruikt voor het voorbereiden van cel- of weefsellysaten om intracellulaire analyten te meten, maar is niet vereist voor plasma- of serummonsters.
Hielscher Ultrasonics produceert ultrasone homogenisatoren met hoge prestaties van laboratoriumformaat tot industrieel formaat.


