Ultralydsbaseret peptidsyntese ved hjælp af TAGGING-teknikken
Peptidsyntese er en hjørnesten i den farmaceutiske forskning og udvikling, men de konventionelle metoder – peptidsyntese i fast fase (SPPS) og klassisk kobling i opløsningsfase – er stadig arbejdskrævende, medfører spild af reagenser og er vanskelige at skalere. Et mere effektivt alternativ er opstået gennem kombinationen af to ortogonale strategier: TAGGING-teknikken (temporary anchoring group) til peptidsamling i opløsningsfase og ultralydsbehandling (sonokemisk) til at fremskynde koblings-, afbeskyttelses- og oparbejdningstrinene. Tilsammen muliggør de produktion af terapeutiske peptider i mængder fra gram til store mængder. – såsom det antibiotiske og kræftbekæmpende lipopeptid lipobactin – med høj renhed, mindre arbejdsbyrde i forbindelse med rensning og markant færre manuelle arbejdsgange.
Hvilke fordele er der ved ultralydsbaseret peptidsyntese?
- Økonomi i opløsningsfasen: Reaktionerne foregår i opløsning med et betydeligt lavere forbrug af aminosyrer end ved peptidsyntese i fast fase
- Rensning ved hjælp af filtrering: Det TAG-bundne peptid udfældes i polære opløsningsmidler, så mellemprodukterne isoleres ved simpel filtrering – Der er ikke behov for kolonnekromatografi eller karakterisering efter hvert trin.
- Enorm arbejdsbesparelse: Ved at undgå mellemliggende oprensninger og spektralkontroller spares der betydeligt mange mandetimer i løbet af en hel synteseforløb.
- Sonokemisk acceleration: Ultralydsbehandling forkorter hvert eneste afgørende trin – Fmoc-afbeskyttelse, kobling af sidekæder, cyklisering og global afbeskyttelse – uden at gå på kompromis med selektiviteten.
- Høje udbytter, høj renhed: Hver fragmentkobling og den afsluttende lipobactin-samling foregår med højt udbytte; den samlede afbeskyttelse giver målemolekylet med et udbytte på ca. 83 %.
- Beredskab i stor skala: TAGGING-teknikken beskrives udtrykkeligt som en metode, der muliggør fremstilling af peptider i stor skala med den højeste renhed, hvilket gør den til en praktisk fremgangsmåde til fremstilling af gram- og kilogram-mængder af terapeutisk vigtige lipopeptider.
- Fuld metodekompatibilitet: Metoden er fuldt ud kompatibel med konventionel SPPS og opløsningsfase-kemi, så eksisterende beskyttelsesgruppestrategier (Fmoc, Alloc, Pbf, tBu) og koblingsmidler (T3P, HATU, COMU, DIC/DMAP) kan anvendes uændret.
Fortæl os om udfordringerne i jeres peptidsynteseproces. Vores eksperter inden for ultralydsbehandling anbefaler den optimale ultralydskonfiguration til jeres mål for peptidproduktion!
Industriel soniker UIP2000hdT med en reaktor til farmaceutiske batch-produktioner med henblik på forbedret peptidsyntese
Hvad er TAGGING-teknikken?
I TAG-metoden forankres et peptidfragment kovalent til en aftagelig, harpiksagtig forankringsgruppe (TAG), som forbliver i opløsningen. Dette gør det muligt at håndtere den voksende kæde som et fastfasepeptid, men i væskefasen:
- Efter hver kobling eller afbeskyttelse udvindes det TAG-bundne peptid som et fast stof ved simpel filtrering eller udfældning i polære medier eller antisolventer, mens opløselige urenheder og biprodukter skylles væk.
- Da peptidet forbliver bundet til linkeren, undgås kolonnekromatografi og en fuldstændig karakterisering af hvert mellemprodukt i vid udstrækning, hvilket sparer betydelig tid og arbejdskraft.
- Reaktionerne kan udføres i opløsningsfase, hvor der anvendes langt mindre aminosyre end ved SPPS, og slutproduktet frigøres ved spaltning af TAG-gruppen mod slutningen af syntesen.
Ved retro-syntesen af lipobactin blev der anvendt tre fragmenter – Fmoc-Ala-Arg-TAG, Alloc-Thr(Ile-Fmoc)-OH og lipidfragmentet C₁₁H₂₃CONH-Ile-Ser(OᵗBu)-OH – kombineret med en fragmentkondensationsstrategi for at opnå det lange peptid med meget høje udbytter. (jf. Ramya et al., 2025)
Den TAG-assisterede fuldstændige syntese af peptidet lipobactin fremskyndes ved ultralydsbehandling.
(Undersøgelse: Ramya m.fl., 2025)
Hvordan ultralydsbehandling forbedrer syntesen af peptider i opløsningsfase
Ultralydbehandling anvendes til at intensivere og forkorte de centrale trin i opløsningsfasen. I lipobactinsyntesen, som beskrevet af Ramya et al. (2025), anvendes ultralydbehandling til:
Da TAG-kemien i forvejen leverer mellemprodukter i form af filtrerbare faste stoffer, supplerer ultralydsbehandling og TAGGING hinanden: Ultralyd fremskynder masseoverførsel, blanding og reaktionskinetik, mens ankeret sikrer, at peptidet forbliver et genvindeligt fast stof, hvilket muliggør en ren arbejdsgang med et minimalt behov for kromatografi.
Sonicator UP200St: Reaktor med ultralydsomrøring til fremskyndet peptidsyntese.
Enkel opskalering af peptider med høj renhed ved hjælp af ultralydsbehandling
En hyppig udfordring i forbindelse med overførslen af peptid- og peptidlægemiddelprocesser fra laboratoriet til produktionen er at bevare den sonokemiske effekt ved større volumener og kontinuerlig gennemstrømning. Hielscher løser dette problem med et komplet sortiment af ultralydsprocessorer, der dækker alt fra laboratorie- til fuld industriel skala, og som leverer valideret, reproducerbar effekt samt dokumenteret processtyring.
Industriel ultralydsapparat UIP4000hdT (4000 W, 20 kHz) til ultralydsforstærket peptidsyntese
Ofte stillede spørgsmål om ultralydsassisteret TAG-peptidsyntese
Hvad er peptidsyntese i væskefase (LPPS)?
Peptidsyntese i væskefase (LPPS) er en metode til trinvis opbygning af peptider i opløsning ved hjælp af klassiske redskaber fra den organiske kemi. Det er en af de fire vigtigste metoder til fremstilling af peptider og er kendt for at være omkostningseffektiv, skalerbar og den mest miljøvenlige blandt peptidsyntesemetoderne. Den er særligt velegnet til kortere peptider, selvom der kan opstå vanskeligheder med længere sekvenser på grund af udfordringer med at opretholde ensartede reaktioner, opløselighed og fjernelse af uønskede biprodukter.
Hvordan forbedrer ultralyd peptidsyntesen i væskefase?
Ultralyd (sonikering) forbedrer LPPS ved at fremskynde både koblings- og afbeskyttelsesfaserne. Ultralydsbølgerne forbedrer masseoverførslen og reaktionskinetikken, hvilket fører til:
- Kortere reaktionstider: Koblings- og afbrydercyklusserne kan forkortes betydeligt
- Højere udbytter: en mere fuldstændig konvertering i hvert trin
- Forbedret renhed af råprodukter: færre ufuldstændige koblingsbiprodukter
- Lavere reagensforbrug: Der kræves færre mængder af koblingsreagenser og aminosyrer, da reaktionerne foregår hurtigere og mere effektivt
Hvad er TAG-assisteret peptidsyntese (TAPS)?
Tag-Assisted Peptide Synthesis (TAPS) er et særligt tilfælde af peptidsyntese i væskefase, hvor peptider opbygges trin for trin i opløsning ved hjælp af opløselige organiske tags i stedet for et fast bærestof. Disse mærker, der svarer til de faste bærere i SPPS, forenkler isoleringen efter hvert syntesetrin ved at muliggøre adskillelse gennem udfældning, filtrering eller ekstraktion. Mærkerne skal kunne opløses i organiske opløsningsmidler, samtidig med at de forbliver adskilte fra andre stoffer.
Hvordan forbedrer ultralyd TAGGING-processen?
Når ultralydbehandling kombineres med TAG-assisteret syntese, omfatter fordelene:
- Hurtigere koblings- og afsikringscyklusser – ultralyd fremskynder reaktionerne i opløsningsfasen, hvilket reducerer tiden pr. trin
- Forbedret opløselighed og masseoverførsel – Ultralydskavitation bidrager til at opretholde homogeniteten af det mærkede peptid i opløsningen, hvilket er afgørende, da opløselighed er en af de vigtigste fordele ved TAPS i forhold til SPPS
- Reduceret mængde reagens – en højere reaktionseffektivitet betyder, at der kræves færre ækvivalenter af aminosyrer og koblingsreagenser
- Mere omfattende reaktioner – færre ufuldstændige koblingsbiprodukter, hvilket fører til højere råstofrenhed og en forenklet efterfølgende rensning
Et bemærkelsesværdigt eksempel er den TAG-assisterede og ultralydsmedierede totalsyntese af lipobactin, som viste, at TAGGING-teknikken er fuldt ud kompatibel med opløsningsfasemetoder, og at ultralydsbehandling sikrer høje udbytter i hvert trin. (jf. Ramya et al., 2025)
Hvilke peptidlængder kan opnås ved hjælp af ultralydsassisteret TAPS?
Korte til mellemstore peptider (~5–20 aminosyrer) er det optimale anvendelsesområde, hvor TAPS leverer høj renhed og pålidelige resultater.
Man kan fremstille længere peptider ved hjælp af en fragmentkondensationsstrategi: Mindre fragmenter (6–10-mere) syntetiseres med en tag, hvorefter de kobles sammen for at danne måleproteinet i fuld længde.
Ved meget lange eller komplekse mål kan der anvendes en hybrid SPPS/TAPS-tilgang.
Oplev, hvordan ultralydsbehandling har forbedret peptidsyntese i fast fase (SPPS)!
Kan ultralydsassisteret peptidsyntese i væskefase skaleres op til industriel produktion?
Ja, industrielle ultralydsapparater – såsom Hielscher-modellerne UIP2000hdT eller UIP4000hdT – kan integreres i batchreaktorer og gennemstrømningsceller, hvilket muliggør peptidproduktion i stor skala. Eftermontering i eksisterende reaktorer gør det muligt at forbedre etablerede peptidsyntese-processer.
Hvad er de vigtigste fordele ved ultralyds-LPPS i forhold til konventionel LPPS?
- Fart: Reaktionstiderne reduceres markant ved hvert koblings- og afbeskyttelsestrin.
- Effektivitet: Højere udbytter pr. trin medfører et højere samlet udbytte for peptider med flere rester.
- Bæredygtighed: færre reagensækvivalenter og muligvis mindre opløsningsmiddel på grund af hurtigere reaktioner.
- Tilgængelighed: kræver kun et almindeligt ultralydsbad, ingen specialudstyr.
- Kompatibilitet: fungerer med standardkoblingsreagenser (DIC, HATU, TBTU, Oxyma osv.) og beskyttelsesgruppestrategier (Boc, Fmoc).
Litteratur / Referencer
- M. Ramya, Veeranjaneyulu Avula, S. Nandeesh, B. Kirankumar, G. Nagendra (2025): TAG assisted and ultrasonication mediated total synthesis of lipobactin. Results in Chemistry, Volume 18, 2025, 102842.
- Andrew M. Bray; Liana M. Lagniton; Robert M. Valerio; N.Joe Maeji (1994): Sonication-assisted cleavage of hydrophobic peptides. Application in multipin peptide synthesis. Tetrahedron Letters 35(48), 1994. 9079–9082.
- Raheem, Shvan J; Schmidt, Benjamin W; Solomon, Viswas Raja; Salih, Akam K; Price, Eric W (2020): Ultrasonic-Assisted Solid-Phase Peptide Synthesis of DOTA-TATE and DOTA-linker-TATE Derivatives as a Simple and Low-Cost Method for the Facile Synthesis of Chelator-Peptide Conjugates. ACS Bioconjugate Chemistry, 2020.
- M.V. Anuradha, B. Ravindranath (1995): Ultrasound in peptide synthesis. 4: Rapid cleavage of polymer-bound protected peptides by alkali and alkanolamines. Tetrahedron Volume 51, Issue 19, 1995. 5675-5680.
Ultralyd CupHorn til intensiv ultralydsbehandling af lukkede rør og hætteglas til steril ultralydsbehandling af peptider.
Hielscher Ultrasonics fremstiller højtydende ultralydshomogenisatorer fra Lab til industriel størrelse.
