Sonication tərəfindən asanlaşdırılan genomik tədqiqat

Genomik tədqiqatlar bioloji sistemlər haqqında anlayışımızda inqilab etdi, müxtəlif xəstəliklərin və əlamətlərin altında yatan mürəkkəb genetik mexanizmləri aydınlaşdırmağa imkan verdi. Hüceyrə membranlarının pozulması üçün əvvəlcə işlənib hazırlanmış bir texnika olan sonikasiya genomik tədqiqatlarda geniş istifadəni tapmışdır. Bu məqalə genomik tədqiqatlarda, o cümlədən DNT-nin təcrid edilməsi və parçalanması, xromatin immunoprecipitation (ChIP) və növbəti nəsil ardıcıllıq kitabxanalarının hazırlanmasında sonikasiyanın tətbiqinə dair ümumi məlumat verir. Bu məqalə genomik tədqiqatda sonikasiyanın prinsipləri, metodologiyaları və tətbiqləri haqqında ümumi məlumat verir və sizi genomik tədqiqatlar üçün ən uyğun sonikatorlarla tanış edir.

Genomik Tədqiqatda Sonicatorlar

Bioloji nümunələrin hazırlanması üçün zond tipli sonikator UP100H, məsələn, DNT fraqmentasiyası, xromatinin kəsilməsi, hüceyrə lizisi.Genomik tədqiqatlar son onilliklərdə yüksək məhsuldarlıqlı sekvensiya texnologiyalarının və innovativ eksperimental metodologiyaların inkişafı ilə bağlı nəzərəçarpacaq irəliləyişlərə məruz qalmışdır. Bu irəliləyişlər genomların, epigenomların və transkriptomların hərtərəfli təhlilini asanlaşdıraraq, xəstəliklərin, təkamülün və fenotipik dəyişkənliyin genetik əsasları haqqında anlayışlar təqdim etdi.
Sonikasiya, molekulyar strukturları pozmaq üçün ultrasəsin fiziki qüvvələrinin tətbiqini əhatə edən mexaniki proses, genomik tədqiqatda çox yönlü bir vasitə kimi ortaya çıxdı. Sonikasiya DNT-nin parçalanması, xromatinin kəsilməsi və NGS kitabxanasının hazırlanması üçün istifadə edilən yaxşı qurulmuş bir texnikadır.

İnformasiya tələbi




Bizimlə əlaqə saxlayın Gizlilik Siyasəti.


 

Bu dərslik lizis, hüceyrənin pozulması, zülal izolyasiyası, laboratoriyalarda DNT və RNT fraqmentasiyası, analiz və tədqiqat kimi nümunə hazırlama tapşırıqlarınız üçün hansı tip sonikatorun ən yaxşı olduğunu izah edir. Tətbiqiniz, nümunə həcmi, nümunə sayı və ötürmə qabiliyyəti üçün ideal sonikator tipini seçin. Hielscher Ultrasonics sizin üçün ideal ultrasəs homojenizatoruna malikdir!

Elm və təhlildə hüceyrənin pozulması və zülal çıxarılması üçün mükəmməl sonikatoru necə tapmaq olar

Video Miniatür

 

Genomik Tədqiqatlarda Sonikasiyanın Tətbiqləri

Sonikasiya bioloji nümunələrə analizlərdən, analizlərdən əvvəl və ya sonrakı aşağı proseslərə hazırlıq üçün nümunə hazırlamaq üçün tətbiq edilir. Sonikasiyadan istifadə edən ən çox yayılmış nümunə hazırlayıcı tətbiqlərə aşağıdakılar daxildir:

  • DNT fraqmentasiyası: Təhlillər və digər analiz üsulları üçün hazırlıq mərhələsi olaraq, genomik DNT fraqmentlərin müəyyən edilmiş ölçüsünə qədər kəsilməlidir.
    Sonikasiya genomik DNT-nin dəqiq parçalanması üçün istifadə olunur, PCR, klonlaşdırma və Southern blotting daxil olmaqla müxtəlif aşağı axın tətbiqləri üçün istədiyiniz ölçülərdə DNT fraqmentlərinin yaradılmasına imkan verir. Sonication, fraqment ölçüsü və paylanması üzərində çevik nəzarət etməyə imkan verdiyi üçün enzimatik üsullarla müqayisədə üstünlüklər təklif edir. UIP400MTP plitə sonikatoru ilə yüksək məhsuldarlıqlı nümunənin hazırlanması böyük nümunə nömrələrinin işlənməsini asanlaşdırır.
    Ultrasəs haqqında daha çox oxuyun DNT parçalanmasıPlazmid parçalanması!
  • Xromatin İmmunoprecipitation (ChIP): ChIP, histon modifikasiyası və transkripsiya faktorunun bağlanması kimi zülal-DNT qarşılıqlı təsirlərini araşdırmaq üçün geniş istifadə olunan bir texnikadır. Sonikasiya xromatinin immunoprecipitasiyaya münasib olan kiçik fraqmentlərə (~200-1000 əsas cüt) parçalanmasında mühüm rol oynayır. Bu, maraq doğuran zülallarla əlaqəli spesifik genomik bölgələrin təcrid edilməsinə və təhlilinə imkan verir.
  • Növbəti Nəsil Sıralama (NGS): Illumina və Ion Torrent kimi yüksək məhsuldarlıqlı sekvensiya texnologiyaları . Sonication, sonradan kitabxana tikintisi üçün istifadə olunan vahid ölçülü DNT fraqmentləri yaratmaq üçün genomik DNT-nin idarə olunan parçalanmasını asanlaşdırır. Bu, genomik məzmunun dəqiq təmsil olunmasını təmin edir və ardıcıllığın səmərəliliyini artırır.
    Next Gen Sequencing üçün sonication istifadəsi haqqında daha çox oxuyun!
  • Tam VialTweeter quraşdırma: ultrasəs prosessor VialTweeter sonotrode UP200St

    VialTweeter sonikatoru birdən çox flakonun eyni vaxtda nümunə hazırlanması üçün

    DNT ilə əlaqəli tədqiqatım üçün ən yaxşı sonikatoru necə seçə bilərəm?

    müddət “sonication” ultrasəs tətbiqinin müxtəlif modifikasiyası üçün istifadə olunur. Ən çox yayılmış üsullar ultrasəs vannası və zond tipli sonikatordur. Aşağıda, nə üçün doğru sonikator seçiminin tədqiqatınızın keyfiyyətini və etibarlılığını artıracağını kəşf edəcəksiniz.

    Müxtəlif ultrasəs cihazı modelləri, onların üstünlükləri və məhdudiyyətləri arasındakı fərqlər haqqında məlumat əldə edin. Burada genomik tədqiqatlar üçün ən çox istifadə edilən sonikator modellərinə girəcəyik.

    Vanna Sonikasiyası: Niyə vanna tipli sonikatorlar sizə etibarsız, təkrar olunmayan nəticələr verir? Genomik nümunələr su anbarının dibinə bərkidilmiş bir neçə ultrasəs çeviricisi ilə təchiz olunmuş su banyosuna yerləşdirilir. Akustik kavitasiya ləkələri tank vasitəsilə çox qeyri-bərabər şəkildə meydana gəlir və ardıcıl ultrasəs gücünü təmin etmir. Bu üsul nümunələri müxtəlif intensivliklə müalicə edir və DNT fraqmentasiyası kimi nümunənin hazırlanmasında təkrarlana bilən nəticələr vermir. Bu qeyri-bərabər müalicə nəticəsində DNT fraqmentinin ölçüsünə nəzarət verilmir. Ümumi ultrasəs vannası ilə etibarlı, təkrarlanan tədqiqat qeyri-mümkündür.
    Zond tipli sonikator və ultrasəs vannası haqqında daha çox öyrənmək istəyirsiniz? Bura basın!

    Bir ultrasəs vannasından fərqli olaraq, Hielscher güclü ultrasəs verən dəqiq idarə olunan sonikatorlardır. Bioloji nümunələrin arzuolunmaz deqradasiyasının qarşısını almaq üçün sonikasiyanın intensivliyi tətbiqə tam uyğunlaşdırıla bilər. Nümunələrin işlənməsi zamanı nuklein turşularının və digər biomolekulların optimal qorunmasını təmin edir. Bu, nümunənin bütövlüyünün aşağı axın analizi üçün kritik olduğu genomik tədqiqatlar üçün xüsusilə əlverişlidir. Proqramlaşdırıla bilən parametr, brauzerin uzaqdan idarə edilməsi və məlumatların avtomatik qeydə alınması kimi ağıllı funksiyalar laboratoriyalarda tədqiqat işini asanlaşdırır.

    Genomik Tədqiqat üçün Hielscher Sonicator Modelləri

    • Prob tipli sonikasiya: Bir sonication zondu birbaşa nümunə borusuna daxil edilir, lokallaşdırılmış sonikasiyaya və parçalanma parametrləri üzərində dəqiq nəzarətə imkan verir. Bu üsula tək flakonlar və ya stəkanlar kimi kiçik nümunə nömrələri üçün üstünlük verilir.
      DNT parçalanması və nümunə hazırlığı üçün bütün zond tipli sonikatorları burada tapın!
    • CupHorn və UIP400MTP: Hielscher sonicator modelləri Ultrasonik Cuphorn və UIP400MTP Plate Sonicator ümumi ultrasəs vanna və ya təmizləyici tankdan əhəmiyyətli dərəcədə fərqlənir. İlk baxışdan ultrasəs dalğalarının su banyosundan dolayı ötürülməsi prinsipi oxşar görünür. – Hielscher ultrasəs kuboku və ya boşqab sonikatoru ilə ümumi ultrasəs vannası arasındakı fərq daha böyük ola bilməzdi! Hielscher sistemlərində kubok və boşqab sonikatorunun tam dibi güclü ultrasəs ilə bərabər şəkildə qarışdırılır. Bu o deməkdir ki, tam səth eyni amplituda və tezlikdə titrəyir. Ölü, səssiz ləkə tapılmır, bütün nümunələr eyni intensivlikdə səslənir! Bu, ultrasəs nümunəsinin hazırlanmasında vahid, təkrarlana bilən nəticələri təmin edir.
      Burada ultrasəs kuboku haqqında daha çox məlumat tapa bilərsiniz!
      Plaka-sonikator UIP400MTP haqqında daha ətraflı məlumatı burada tapa bilərsiniz!
    • VialTweeter: VialTweeter, ultrasəs enerjisini su banyosuna və ya digər mühitə batırmağa ehtiyac olmadan birbaşa nümunə flakonlarına ötürmək üçün titrəyici flakon saxlayan blok sonotrodunun unikal dizaynından istifadə edir. Bu dolayı, lakin yüksək effektiv sonikasiya üsulu 10-a qədər qapalı flakonun müalicəsi üçün idealdır və çarpaz çirklənmənin qarşısını alır.
      TheVialTweeter ilə 10-a qədər qapalı flakonun çirklənmədən sonikasiyası haqqında ətraflı oxuyun!
    5-ə qədər qapalı borunun və flakonun vahid və intensiv sonikasiyası üçün ultrasəs qabığı.

    Ultrasonik cuphorn steril DNT fraqmentasiyası üçün qapalı boruların və flakonların intensiv sonikasiyası üçün.

    İnformasiya tələbi




    Bizimlə əlaqə saxlayın Gizlilik Siyasəti.


    Avtomatlaşdırılmış sistemlərdə sonikatorlar – Sadə İnteqrasiya

    Hielscher ultrasəs cihazları brauzer nəzarəti vasitəsilə uzaqdan idarə oluna bilər. Sonication parametrləri izlənilə və proses tələblərinə dəqiq uyğunlaşdırıla bilər.Hielscher sonikatorları avtomatlaşdırılmış sistemlərə inteqrasiya oluna bilər. Açıq şəbəkə interfeysi və proqramlaşdırma xüsusiyyətləri ilə Hielscher sonicatorları avtomatlaşdırma üçün uyğundur. Avtomatlaşdırma və robototexnika ilə inteqrasiya genomik nümunələrin yüksək məhsuldarlıqla emalına imkan verir, genişmiqyaslı tədqiqatları və fərdiləşdirilmiş tibb təşəbbüslərini asanlaşdırır. Sonicatorunuzu avtomatlaşdırılmış nümunə hazırlama sisteminə inteqrasiya etmək imkanı nümunənin işlənməsini optimallaşdırır və müxtəlif tətbiqlər və nümunə növləri üzrə səmərəli, təkrarlana bilən və təhlükəsiz nümunə emalını təmin edəcəkdir.

    Niyə Hielscher ultrason?

    • yüksək effektivliyi
    • Ən müasir texnologiya
    • etibarlılıq & qoluzorluluq
    • tənzimlənən, dəqiq proses nəzarəti
    • dəstə & xətdə
    • hər hansı bir cild üçün
    • ağıllı proqram
    • ağıllı funksiyalar (məsələn, proqramlaşdırıla bilən, məlumatların protokollaşdırılması, uzaqdan idarəetmə)
    • İstifadəsi asan və təhlükəsizdir
    • aşağı istismar
    • CIP (yerində təmiz)

    Dizayn, İstehsalat və Konsaltinq – Keyfiyyətli Almaniya istehsalı

    Hielscher ultrasəs cihazları ən yüksək keyfiyyət və dizayn standartları ilə tanınır. Sağlamlıq və asan əməliyyat ultrasəs aparatlarımızın sənaye obyektlərinə rahat inteqrasiyasına imkan verir. Kobud şərtlər və tələbkar mühitlər Hielscher ultrasəs cihazları tərəfindən asanlıqla idarə olunur.

    Hielscher Ultrasonics, ISO sertifikatlı bir şirkətdir və ən müasir texnologiya və istifadəçi dostu olan yüksək performanslı ultrasəs cihazlarına xüsusi diqqət yetirir. Əlbəttə ki, Hielscher ultrasəs cihazları CE-yə uyğundur və UL, CSA və RoHs tələblərinə cavab verir.

    Aşağıdakı cədvəl DNT və RNT fraqmentasiyası, hüceyrə lizisi, həmçinin DNT və zülal izolyasiyası kimi nümunə hazırlama işləri üçün ideal olan laboratoriya ultrasəs aparatlarımızın təxmini emal qabiliyyətinin göstəricisini verir:

    Qurğu Güc [W] Tipi Volume [ml]
    UIP400MTP 400 mikroplakalar üçün 6 – 3456 quyu
    VialTweeter 200 10 flakona qədər, üstəgəl sıxma imkanı 0.5 – 1.5
    UP50H 50 Probe tipli 0.01 – 250
    UP100H 100 Probe tipli 0.01 – 500
    Uf200 ः t 200 Probe tipli 0.1 – 1000
    UP200St 200 Probe tipli 0.1 – 1000
    UP400St 400 Probe tipli 5.0 – 2000
    Cuphorn 200 CupHorn, sonoreactor 10 – 200
    GDmini2 200 çirklənmə-pulsuz axını mobil

    Bizimlə əlaqə saxlayın! Bizdən soruşun!

    Daha ətraflı məlumat üçün müraciət edin

    Ultrasəs prosessorları, tətbiqləri və qiyməti haqqında əlavə məlumat tələb etmək üçün aşağıdakı formadan istifadə edin. Prosesinizi sizinlə müzakirə etməkdən və tələblərinizə cavab verən ultrasəs sistemi təklif etməkdən şad olarıq!









    Xahiş edirik unutmayın Gizlilik Siyasəti.


    Bu video klipdə laboratoriyalarda nümunə hazırlamaq üçün geniş istifadə olunan ultrasəs cihazı olan Hielscher ultrasəs homogenizatoru UP100H göstərilir.

    Ultrasonik Homojenizator UP100H

    Video Miniatür



    Genomika və Sonikasiya Haqqında Tez-tez Verilən Suallar

    Burada ultrasəs və genomik tədqiqatlara gəldikdə ən çox verilən sualın cavablarını tapın.

    DNT üçün sonikasiya nə edir?

    Sonication mexaniki qüvvələr yaradan yüksək tezlikli səs dalğalarını tətbiq edərək DNT-ni daha kiçik parçalara ayırır və DNT zəncirlərinin təsadüfi nöqtələrdə qırılmasına səbəb olur. Sonikasiya intensivliyinin tənzimlənməsi sonrakı emal və təhlil üçün tələblərdən asılı olaraq daha böyük və ya daha kiçik DNT fraqmentləri yaratmağa imkan verir.

    DNT parçalanması üçün sonikasiya protokolu nədir?

    DNT parçalanması üçün tipik sonikasiya protokolu, nümunənin qızdırılmasının qarşısını almaq üçün bir sıra qısa partlayışlar üçün bufer məhlulunda DNT nümunələrinə ultrasəs dalğalarının tətbiqini və sonra soyutma intervallarını əhatə edir. Amplituda, müddət və dövr sayı kimi parametrlər nümunə növü və istədiyiniz fraqment ölçüsü əsasında optimallaşdırılır.

    DNT kəsimi üçün sonication necə işləyir?

    DNT kəsmə üçün sonikasiya ultrasəs dalğalarından istifadə edərək DNT molekullarına idarə olunan mexaniki qüvvələrin tətbiqini nəzərdə tutur. Bu qüvvələr DNT zəncirlərini bir yerdə saxlayan hidrogen bağlarını və digər qarşılıqlı təsirləri pozur, nəticədə DNT-nin təsadüfi qırılmaları və daha kiçik parçalara parçalanması baş verir.

    DNT nümunələrini nə qədər müddətə sonikləşdirməlisiniz?

    DNT nümunələri üçün sonikasiya müddəti nümunənin həcmi, konsentrasiyası və istədiyiniz fraqment ölçüsü kimi amillərdən asılıdır. Tipik olaraq, sonikasiya nümunənin həddindən artıq istiləşməsinin qarşısını almaq üçün soyutma intervalları ilə bir neçə saniyədən bir neçə dəqiqəyə qədər dəyişən qısa partlayışlar üçün həyata keçirilir.

    DNT izolyasiyası üçün ən yaxşı sonikator hansıdır?

    DNT izolyasiyası üçün ən yaxşı sonikatorun seçimi nümunənin həcmi, ötürmə qabiliyyəti və istədiyiniz fraqment ölçüsü kimi amillərdən asılıdır. Bəzi populyar variantlara Hielscher UIP400MTP plitə-sonikatoru, VialTweeter, CupHorn və ultrasəs zondu UP100H daxildir. Bu sonicatorlar sonication parametrləri üzərində dəqiq nəzarət təklif edir və tədqiqat laboratoriyalarında müxtəlif DNT izolyasiya tətbiqləri üçün uyğundur.

    Genomika nədir?

    Genomika, genomların tam quruluşunu, funksiyalarını, təkamülünü, xəritələşdirilməsini və modifikasiyasını dərk etməyə çalışan çoxsahəli biologiya sahəsidir. Bir genom orqanizmin həm genlərini, həm də mürəkkəb üçölçülü quruluşunu özündə birləşdirən bütün DNT-ni əhatə edir. Fərdi genlərə və onların irsiyyət nümunələrinə diqqət yetirən genetikadan fərqli olaraq, genomika orqanizm daxilindəki bütün genləri hərtərəfli xarakterizə etmək və kəmiyyətcə qiymətləndirmək, onların qarşılıqlı əlaqəsini və bütövlükdə orqanizmə təsirini aydınlaşdırmaq məqsədi daşıyır. Genlər fermentlər və messencer molekullar tərəfindən asanlaşdırılan zülalların sintezini idarə etməkdə mühüm rol oynayır. Bu zülallar da öz növbəsində orqan və toxumaların struktur komponentlərini təşkil edir, biokimyəvi prosesləri tənzimləyir və hüceyrələrarası əlaqəni asanlaşdırır. Genomika, genomların strukturunu və funksiyalarını bütövlükdə deşifrə etmək üçün yüksək məhsuldarlıqlı DNT sıralama üsullarından və bioinformatika vasitələrindən istifadə edərək bütün genomların ardıcıllığını və təhlilini əhatə edir.
    Genomika bir orqanizmin bütün genetik materialını, o cümlədən onun DNT ardıcıllığını, təşkilini, funksiyasını və dəyişkənliyini öyrənir. Bu, genlərin təhlilini, onların qarşılıqlı əlaqəsini və əlamətlərə və davranışlara təsirini əhatə edir. Genomik tədqiqat genomların quruluşunu və funksiyasını, habelə onların sağlamlıq, xəstəlik, təkamül və digər bioloji proseslərdəki rollarını anlamaq üçün müxtəlif üsul və yanaşmaları əhatə edir.

    Genomik tədqiqatın məqsədi:

    • Ardıcıllıq genomları: Bu, orqanizmin DNT-sindəki nukleotidlərin (A, T, C və G) sırasının müəyyən edilməsini əhatə edir. Bu, bütün genom və ya xüsusi maraq bölgələri ola bilər.
    • Genetik dəyişkənliyi təhlil edin: Genomik tədqiqat fərdlər və ya populyasiyalar arasında DNT ardıcıllığında dəyişiklikləri araşdırır ki, bu da xəstəliklərin, əlamətlərin və təkamül proseslərinin genetik əsasları haqqında məlumat verə bilər.
    • Funksional genomika: Bu sahə genlərin bir-biri ilə və ətraf mühitlə necə fəaliyyət göstərdiyini və qarşılıqlı əlaqəsini araşdırır. Buraya transkriptomika (gen ifadəsinin öyrənilməsi), proteomika (zülalların öyrənilməsi) və metabolomika (metabolitlərin öyrənilməsi) daxildir.
    • Müqayisəli genomika: Müxtəlif növlər arasında genomları müqayisə edərək, tədqiqatçılar təkamül əlaqələri aşkar edə, qorunan bölgələri müəyyən edə və bioloji müxtəlifliyin genetik əsaslarını anlaya bilərlər.
    • Tibbi genomika: Tibbdə genomik tədqiqatlar xəstəliklərin genetik əsaslarını anlamağa, xəstəlik riskini proqnozlaşdırmağa və fərdi müalicə və müdaxilələri inkişaf etdirməyə yönəlmişdir.

    Genomik tədqiqatlar tibb, kənd təsərrüfatı, təkamül biologiyası və biotexnologiya kimi sahələrdə əhəmiyyətli irəliləyişlərə səbəb olub, molekulyar səviyyədə həyatı dərk etməyimizə və insan sağlamlığının və rifahının yaxşılaşdırılmasına töhfə verib.

    Ədəbiyyat / İstinadlar


    Yüksək performanslı ultrasəs! Hielscher məhsul çeşidi kompakt laboratoriya ultrasəs cihazından tutmuş tam sənaye ultrasəs sistemlərinə qədər tam spektri əhatə edir.

    Hielscher Ultrasonics, yüksək performanslı ultrasəs homogenizatorları istehsal edir Laboratoriya qədər sənaye ölçüsü.


    Prosesinizi müzakirə etməkdən məmnun olarıq.

    Əlaqə saxlayaq.