Ultrasonikasyon ile Hazırlanan Tampon Çözeltileri
Lizis tamponları, ultrasonik doku homojenizatörleri kullanılarak verimli ve hızlı bir şekilde hazırlanabilir. Ultrasonicators karıştırma, çözme ve dağıtma için bir rüya aracı olduğundan, lizis tamponlarının güvenilir ve kullanıcı dostu bir şekilde hazırlanmasına izin verirler.
Lizis Tamponlarının Ultrasonik Hazırlanması
Ultrasonik doku homojenizatörleri, hücre bozulması, parçalanması ve ekstraksiyonu için yaygın bir araçtır, bu nedenle çoğu laboratuvarda mevcuttur. Prob tipi ultrasonikatörler için ikincil bir uygulama, lizis tamponlarının hazırlanmasıdır.
Lizis tamponu, hücreleri açmak (parçalamak) ve içeriklerini aşağı akış analizi için serbest bırakmak için kullanılan bir çözeltidir. Lizis tamponunun spesifik bileşimi, parçalanan hücrelerin tipine ve aşağı akış uygulamasına bağlı olarak değişebilir. Bununla birlikte, tipik bir lizis tamponu, deterjanlar, tuzlar ve proteaz inhibitörleri gibi bileşenler içerir. Tamponlama tuzları (örneğin Tris-HCl) ve iyonik tuzlar (örneğin NaCl), lizatın pH'ını ve ozmolaritesini düzenlemek için yaygın olarak kullanılır.
Bir lizis tamponu yapmak için, bileşenler uygun konsantrasyonlarda ve pH'da karıştırılır. Karışım genellikle bileşenler çözülene ve çözelti homojen olana kadar karıştırılır veya çalkalanır.
Ultrasonik homojenizasyon, bileşenlerin karıştırılmasını ve çözünmesini iyileştirerek iyi bir lizis tamponu oluşturmaya yardımcı olmak için kullanılabilecek bir yöntemdir. Bu yöntemde ultrason dalgaları – normalde 20 ila 30 kHz aralığında – çöken ve yoğun yerel enerji üreten kavitasyon kabarcıkları oluşturan, bileşenlerin mekanik olarak kesilmesine ve karıştırılmasına yol açan karışıma uygulanır.
Ultrasonik homojenizasyon işlemi, bileşenlerin herhangi bir kümesini veya agregasını parçalamaya yardımcı olabilir ve çözeltinin düzgün bir şekilde karıştırılmasını sağlayabilir. Sonuç olarak, bu tür geliştirilmiş lizis tamponu, daha verimli hücre bozulmasına ve ekstrakte edilen materyalin daha yüksek verimine yol açabilir. Ek olarak, ultrasonik homojenizasyon, geleneksel karıştırma veya çalkalama yöntemlerine kıyasla bir lizis tamponu yapmak için gereken süreyi azaltabilir.
Genel olarak, ultrasonik homojenizasyon, lizis tamponu hazırlığının kalitesini ve verimliliğini artırmak için güçlü bir araçtır.
Ultrasonik Lizis Tamponu Hazırlama Protokolü
Bu, bir prob tipi ultrasonicator kullanarak bir lizis tamponu yapmak için genel bir protokoldür:
Malzeme:
- Tercih edilen deterjan(lar) (ör. Triton X-100, SDS, CHAPS)
- Tercih edilen tuz(lar) (örneğin NaCl, KCl)
- Proteaz inhibitörleri (ör. PMSF, aprotinin, leupeptin)
- ultrasonikatör
- Karıştırıcı
- Deiyonize su
- pH metre veya pH şeritleri
Adım Adım Talimatlar:
- Parçalama tamponunun bileşimini, parçalayacağınız hücrelere veya dokuya ve lizatı kullanacağınız aşağı akış uygulamalarına göre belirleyin. Deterjanların, tuzların ve proteaz inhibitörlerinin stok çözeltilerini istenen konsantrasyonlarda hazırlayın.
- Deterjanların, tuzların ve proteaz inhibitörlerinin stok çözeltilerini bir behere veya şişeye ekleyin.
- Hacmi istenen tampon miktarına getirmek için deiyonize su ekleyin.
- Ön karışım çözeltisi elde etmek için bileşenleri bir karıştırıcı kullanarak karıştırın.
- Bir pH metre veya pH şeritleri kullanarak tamponun pH'ını ölçün ve pH'ı az miktarda asit veya baz ile gerektiği gibi ayarlayın.
- Ön karışım çözeltisini homojenize etmek için prob tipi ultrasonicator kullanın, böylece oldukça homojen bir çözelti elde edilir. Bu nedenle, çözelti iyice karışana ve herhangi bir küme veya agrega parçalanana kadar çözeltiyi birkaç saniye sonikleştirin. Sonikasyonun süresi ve gücü, kullanılan spesifik lizis tamponu ve ultrasonikatöre göre optimize edilebilir.
- Ultrasonikasyondan sonra, tamponun pH'ını yeniden ölçün ve gerektiği gibi ayarlayın.
- Sonikasyon sırasında oluşmuş olabilecek herhangi bir kalıntı veya agregayı temizlemek için tamponu 0.2 mikronluk bir filtreden süzün.
- Lizis tamponu artık kullanıma hazırdır.
Not: Lizis tamponunun tam bileşimi ve pH'ı, parçalanan hücrelere veya dokuya ve sonraki uygulamalara bağlı olarak değişebilir. Yukarıdaki protokol genel bir kılavuzdur ve belirli uygulamalar için optimize edilmesi gerekebilir.
Ultrasonik homojenizatörler, hücre bozulması ve hücre içi moleküllerin ekstraksiyonu için yaygın olarak kullanılır. Bu nedenle, birçok lizis uygulaması, sadece lizis tamponunun hazırlanması için değil, aynı zamanda mekanik hücre bozulması ve ekstraksiyonu için de prob tipi sonikasyon kullanır.
Bu, ultrasonik doku homojenizatörlerini laboratuvarlar için çok yönlü bir araç haline getirir ve ultrasonicators'ın mikrobiyoloji, biyoteknoloji ve yaşam bilimlerinde geniş kullanımını açıklar.
ultrasonik laboratuvar homojenizatörleri
Hielscher Ultrasonics, çeşitli güç derecelerinde ve örnek hacimlerinde ultrasonik homojenizatörler ve problar (sonotrodlar) üretir ve tedarik eder. Bu, numune hazırlığınız için size en uygun ultrasonik bozucuyu sunmamızı sağlar. En yüksek kaliteye, olağanüstü kullanıcı konforuna ve güvenilir sonikasyon sonuçlarına odaklanıyoruz. Tüm dijital ultrasonicators, akıllı yazılım, sonikasyon protokollerinin programlanması ve ön ayarı, tarayıcı uzaktan kumandası, sıcaklık kontrolü, örnek aydınlatması ve dahili bir SD kartta otomatik veri kaydı özelliklerine sahiptir.
Tasarım, İmalat ve Danışmanlık – Almanya'da Üretilen Kalite
Hielscher ultrasonicators en yüksek kalite ve tasarım standartları için iyi bilinir. Sağlamlık ve kolay kullanım, ultrasonicators'ımızın endüstriyel tesislere sorunsuz bir şekilde entegre edilmesini sağlar. Zorlu koşullar ve zorlu ortamlar Hielscher ultrasonicators tarafından kolayca ele alınır.
Hielscher Ultrasonics, ISO sertifikalı bir şirkettir ve en son teknoloji ve kullanıcı dostu özelliklere sahip yüksek performanslı ultrasonicators'a özel önem vermektedir. Tabii ki, Hielscher ultrasonicators CE uyumludur ve UL, CSA ve RoHs gereksinimlerini karşılar.
Aşağıdaki tablo size çeşitli laboratuvar ultrasonicators hakkında genel bir bakış sunar:
UP200St'de VialTweeter | 200W | 26 kHz (26 kHz | küçük şişelerin ultrasonikasyonu, örneğin Eppendorf 1.5mL |
UP50H | 50W | 30 kHz (İngilizce) | El tipi veya standmounted laboratuvar homojenizatörü |
UP100H | 100W | 30 kHz (İngilizce) | El tipi veya standmounted laboratuvar homojenizatörü |
UP200Ht | 200W | 26 kHz (26 kHz | El tipi veya standmounted laboratuvar homojenizatörü |
UP200St | 200W | 26 kHz (26 kHz | Standmounted Lab Homojenizatör |
UP400St | 400W | 24 kHz (24 kHz) | Standmounted Lab Homojenizatör |
SonoStep | 200W | 26 kHz (26 kHz | laboratuvar reaktörü birleştirme, ultrasonikasyon, pompa, karıştırıcı ve kap |
GDmini2 | 200W | 26 kHz (26 kHz | Kontaminasyonsuz akış hücresi |
Kupa boynuzu | 200W | 26 kHz (26 kHz | şişeler ve beherler için yoğun ultrasonik banyo |
UIP400MTP | 400W | 24 kHz (24 kHz) | Çok kuyulu plakalar / mikrotitre plakalar için ultrasonik sistem |
Bizimle İletişime Geçin! / Bize Sor!
Literatür / Referanslar
- Fernandes, Luz; Santos, Hugo; Nunes-Miranda, J.; Lodeiro, Carlos; Capelo, Jose (2011): Ultrasonic Enhanced Applications in Proteomics Workflows: single probe versus multiprobe. Journal of Integrated OMICS 1, 2011.
- Priego-Capote, Feliciano; Castro, María (2004): Analytical uses of ultrasound – I. Sample preparation. TrAC Trends in Analytical Chemistry 23, 2004. 644-653.
- Welna, Maja; Szymczycha-Madeja, Anna; Pohl, Pawel (2011): Quality of the Trace Element Analysis: Sample Preparation Steps. In: Wide Spectra of Quality Control; InTechOpen 2011.
- Nico Böhmer, Andreas Dautel, Thomas Eisele, Lutz Fischer (2012): Recombinant expression, purification and characterisation of the native glutamate racemase from Lactobacillus plantarum NC8. Protein Expr Purif. 2013 Mar;88(1):54-60.
- Brandy Verhalen, Stefan Ernst, Michael Börsch, Stephan Wilkens (2012): Dynamic Ligand-induced Conformational Rearrangements in P-glycoprotein as Probed by Fluorescence Resonance Energy Transfer Spectroscopy. J Biol Chem. 2012 Jan 6;287(2): 1112-27.
- Claudia Lindemann, Nataliya Lupilova, Alexandra Müller, Bettina Warscheid, Helmut E. Meyer, Katja Kuhlmann, Martin Eisenacher, Lars I. Leichert (2013): Redox Proteomics Uncovers Peroxynitrite-Sensitive Proteins that Help Escherichia coli to Overcome Nitrosative Stress. J Biol Chem. 2013 Jul 5; 288(27): 19698–19714.
- Elahe Motevaseli, Mahdieh Shirzad, Seyed Mohammad Akrami, Azam-Sadat Mousavi, Akbar Mirsalehian, Mohammad Hossein Modarressi (2013): Normal and tumour cervical cells respond differently to vaginal lactobacilli, independent of pH and lactate. ed Microbiol. 2013 Jul; 62(Pt 7):1065-1072.