Lyse van gistcellen in microplaten met behulp van ultrasone behandeling met hoge intensiteit
Microbiologen en onderzoekers op het gebied van de levenswetenschappen die zich bezighouden met sacharomyces cerevisiae, Pichia pastoris / Komagataella phaffii, en andere gistsystemen kennen deze uitdaging: gistcellen zijn robuust, het is soms moeilijk om ze op een reproduceerbare manier te lyseren, en het handmatig breken van monsters wordt al snel een knelpunt wanneer er veel stammen, klonen, kweekomstandigheden of expressieconstructen moeten worden gescreend.
Gistlysis met hoge doorvoercapaciteit voor microbiologie, moleculaire biologie en eiwitanalyse
De microplaat-sonicatoren van Hielscher, zoals de UIP400MTP (400 W) en de UIP550MTP (550 W), bieden een oplossing met hoge doorvoercapaciteit voor het mechanisch lyseren van gistcellen, rechtstreeks in microplaten. In plaats van monsters één voor één met een sonde te verwerken, kunnen volledige microplaten onder uniforme omstandigheden worden gesoniceerd. Dit maakt ultrasone gistlysis sneller, beter reproduceerbaar en gemakkelijker te integreren in moderne microbiologie, eiwitexpressie, enzymscreening en omics-workflows.
Of u nu recombinante eiwitten uit P. pastoris wilt vrijmaken, gistlysaten wilt bereiden voor enzymatische testen, S. cerevisiae wilt afbreken voor eiwitanalyse of tientallen gistklonen tegelijkertijd wilt screenen: de microplaat-sonicators van Hielscher zorgen voor een krachtige, op cavitatie gebaseerde celafbraak met nauwkeurige procesregeling.
Er is behoefte aan een reproduceerbare lysis van Bakkersgist, De vader van de dominee, of andere giststammen in microplaten? Geef ons het formaat van uw platen, het monstervolume, de celdichtheid en de te analyseren stof door. Wij helpen u bij het bepalen van geschikte ultrasone behandelingsparameters voor uw UIP400MTP- of UIP550MTP-workflow.
Waarom gistcellen een efficiënte mechanische lysis nodig hebben
Gistcellen zijn moeilijker te lyseren dan veel bacteriële of zoogdiercellen, omdat ze worden beschermd door een stevige celwand die voornamelijk bestaat uit polysacchariden, glucanen, mannoproteïnen en chitine. Deze celwand zorgt voor mechanische stabiliteit, maar beperkt ook het vrijkomen van intracellulaire eiwitten, nucleïnezuren, metabolieten en enzymen.
Tot de conventionele methoden voor het lyseren van gist behoren het bead-beating, enzymatische afbraak, vries-dooicycli, chemische lysis en sonicatie met sondes. Deze methoden kunnen effectief zijn, maar hebben ook hun beperkingen. Bead beating kan deeltjesresten en opwarming veroorzaken, enzymatische afbraak kan extra kosten en variabiliteit met zich meebrengen, en sondesonicatie van afzonderlijke monsters is tijdrovend wanneer grote aantallen monsters moeten worden verwerkt.
Gerichte ultrasone cavitatie met hoge intensiteit overwint deze beperkingen door intense mechanische schuifkrachten, drukschommelingen en microstreaming op de gistsuspensie uit te oefenen. Dit leidt tot een snelle afbraak van celwanden en membranen, een verbeterde intracellulaire afgifte en een zeer reproduceerbare monstervoorbereiding in plaatformaat.
Sonicatie van microplaten voor de parallelle voorbereiding van gistmonsters
De Hielscher UIP400MTP en UIP550MTP zijn ontworpen voor een gelijkmatige ultrasone behandeling van microplaten, multiwell-platen, PCR-platen en geschikte monsterrekken. In tegenstelling tot ultrasone behandeling met een sonde hoeven de monsters niet afzonderlijk te worden behandeld. De volledige plaat wordt blootgesteld aan gecontroleerde ultrasone energie, waardoor de workflow uitermate geschikt is voor parallelle monsterverwerking.
Dit is met name handig voor:
- screening Bakkersgist mutanten of expressiestammen
- Lyse van De vader van de dominee / K. phaffii klonen na expressie van recombinant eiwit
- Bereiding van gistlysaten voor enzymatische testen
- Eiwitextractie voor SDS-PAGE, Western blot, ELISA, LC-MS/MS of activiteitstesten
- Afgifte van intracellulaire metabolieten voor metabolomica
- Voorbereiding van DNA- en RNA-monsters na een geschikte verdere zuivering
- Optimalisatie met hoge doorvoercapaciteit van lysisbuffers, additieven en extractieomstandigheden
Hoe ultrasone cavitatie gistcellen vernietigt
Tijdens ultrasone behandeling wekt gerichte, krachtige ultrasone straling afwisselende compressie- en verdunningscycli op in het vloeibare monster. Bij voldoende intensiteit veroorzaken deze drukschommelingen akoestische cavitatie. Er ontstaan cavitatiebellen die trillen en vervolgens instorten, waardoor plaatselijke schuifkrachten, microstralen, turbulentie en sterke drukgradiënten ontstaan.
In gistsuspensies verzwakken deze mechanische effecten de celwand en het celmembraan en zorgen ze ervoor dat deze scheuren. Intracellulaire eiwitten, enzymen, nucleïnezuren en metabolieten komen vrij in de lysisbuffer. Aangezien het proces mechanisch is, kan het worden toegepast met veel verschillende buffersystemen en kan het worden gecombineerd met proteaseremmers, reductiemiddelen, detergenten, zouten of een milde enzymatische voorbehandeling.
Algemeen protocol: afbraak van gistcellen in microplaten
Het onderstaande protocol biedt een praktisch uitgangspunt voor het lyseren van gist met behulp van de Hielscher UIP400MTP- of UIP550MTP-sonicator voor microplaten. De parameters moeten worden geoptimaliseerd op basis van de giststam, de celdichtheid, het doelmolecuul, de samenstelling van de buffer, het type plaat en de daaropvolgende test.
1. Gistcellen oogsten en wassen
Kweek Saccharomyces, Pichia, Hansenula, Debaryomyces of een andere giststam onder de gewenste kweekomstandigheden. Oogst de cellen door middel van centrifugeren en verwijder het kweekmedium. Was het pellet met koud gedestilleerd water, PBS of de gekozen lysisbuffer om resten van mediumcomponenten te verwijderen die de verdere analyse zouden kunnen verstoren.
Houd de monsters tijdens de eiwitextractie koel en werk snel. Als er een risico op proteasen bestaat, koel dan alle buffers en verbruiksartikelen vooraf.
2. Breng het celpellet opnieuw in suspensie
Herschud de gistpellet in een geschikte koude lysisbuffer. Voor een efficiënte eiwitafgifte is een hoge celconcentratie vaak gunstig. Gebruik als uitgangspunt ongeveer 10–20% w/v natte celpellet of een dichte suspensie die overeenkomt met OD600 > 10, afhankelijk van de test.
Een typische lysisbuffer voor gisteiwitten kan het volgende bevatten:
- buffersysteem zoals Tris-HCl, fosfaatbuffer of HEPES
- zout, zoals NaCl of KCl
- proteaseremmer-cocktail
- een eventueel reductiemiddel, zoals DTT of β-mercaptoethanol
- optioneel reinigingsmiddel zoals Triton X-100, NP-40, SDS of CHAPS, afhankelijk van de compatibiliteit met de volgende processtappen
- optionele fosfatase-remmers voor fosforylatieonderzoek
Bij moeilijke giststammen of voor een zeer zachte eiwitextractie kan vóór de ultrasone behandeling een korte voorbehandeling met Zymolyase, Lyticase of een ander celwandafbrekend enzym worden toegepast. Deze enzymatische voorbehandeling is optioneel, maar kan de lysisefficiëntie verbeteren of de benodigde ultrasone intensiteit verlagen.
3. Breng de monsters over naar een geschikte microplaat
Breng de gistsuspensie aan in een voor ultrasone behandeling geschikte microplaat. Platen met ronde bodem hebben vaak de voorkeur, omdat deze de monsterafname verbeteren en dode zones verminderen. Gebruik gelijke monstervolumes in alle putjes om de reproduceerbaarheid te verbeteren.
Sluit de plaat af met een geschikte afdichtingsmat of -folie om verdamping, de vorming van aerosolen en kruisbesmetting te voorkomen. Zorg ervoor dat de afdichting geschikt is voor de gekozen temperatuur en ultrasone behandelingsomstandigheden.
De gebruikelijke werkvolumes zijn afhankelijk van het plaatformaat en de toepassing. Veelgebruikte formaten zijn onder meer 96-wells-platen, deep-wells-platen, PCR-platen of geschikte buisrekken.
4. Koeling instellen
Voor het afbreken van gist is een hoge ultrasone intensiteit nodig, en mechanische afbraak leidt tot warmteontwikkeling. Temperatuurregeling is daarom van cruciaal belang, met name bij analyses van eiwitten, enzymen, RNA of fosforylatie.
Pas een geschikte koelstrategie toe, zoals:
- vooraf gekoelde lysisbuffer
- voorgekoelde microplaten
- koelpauzes tussen de ultrasone behandelingsintervallen
- externe koeling van het ultrasoonplatform, indien van toepassing
Het doel is om het monster voldoende koud te houden om denaturatie van eiwitten, inactivering van enzymen, afbraak van RNA en door warmte veroorzaakte variabiliteit in het monster te voorkomen.
5. De gistsuspensie met ultrasone trillingen behandelen
Plaats de afgesloten plaat in de Hielscher UIP400MTP- of UIP550MTP-microplaat-sonicator en selecteer een gepulseerd sonicatieprogramma. Pulsering wordt aanbevolen omdat dit mechanische afbraak tijdens de AAN-fasen en warmteafvoer tijdens de UIT-fasen mogelijk maakt.
Als uitgangspunt voor de lysis van gistcellen:
| Parameter | Aanbevolen startbereik | Doel |
|---|---|---|
| amplitude | 60–100 % | Hoge cavitatie-intensiteit voor robuuste gistcellen |
| pulsmodus | 10–30 sec AAN / 30–60 sec UIT | Efficiënte lysis met gecontroleerde warmteontwikkeling |
| Totale inbedrijfstellingstijd | Vijf tot vijftien minuten | Pas aan op basis van de spanning, dichtheid en het doelmolecuul |
| temperatuur | Bewaar de monsters koel | Bescherm eiwitten, enzymen, RNA en metabolieten |
| Afdichting van platen | Aanbevolen | Voorkomt verdamping, de vorming van aerosolen en kruisbesmetting |
Bij zeer resistente gistsuspensies, dichte P. pastoris-biomassa of moeilijke extractie van recombinante eiwitten dient u de cumulatieve ON-tijd stapsgewijs te verhogen. Bij warmtegevoelige eiwitten of enzymtesten dient u kortere pulsen, langere afkoelpauzes en een lagere startamplitude te gebruiken.
6. Het lysaat zuiveren
Centrifugeer de microplaat na de ultrasone behandeling, of breng de monsters over naar buisjes om ze te centrifugeren. Verwijder celresten door te centrifugeren bij een geschikte snelheid en temperatuur. Verzamel het supernatant voor verdere analyse.
Afhankelijk van de toepassing kan het lysaat worden gebruikt voor:
- Eiwitkwantificering
- enzymactiviteitstesten
- SDS-PAGE en Western blotting
- ELISA en immunoassays
- LC-MS/MS-proteomica
- metabolietanalyse
- DNA- of RNA-zuivering
7. De methode optimaliseren en documenteren
Om de lysering van gist op een reproduceerbare manier te kunnen uitvoeren, dient u alle relevante parameters vast te leggen, waaronder de stam, de kweekomstandigheden en de OD600, natte celmassa, buffersamenstelling, plaattype, monstervolume, amplitude, pulscyclus, cumulatieve inschakeltijd, koelmethode en eindtemperatuur van het monster.
Als de Hielscher-sonicator is uitgerust met automatische gegevensregistratie, kunnen de procesgegevens worden gebruikt voor documentatie, methodeontwikkeling, opschaling en kwaliteitscontrole.
Tips voor het optimaliseren van de lysering van gist
Voor een maximale eiwitafgifte gebruikt u dichte gistsuspensies, een hoge ultrasone intensiteit en een voldoende lange cumulatieve inschakeltijd. Bij gevoelige eiwitten verlaagt u de amplitude, verlengt u de koelpauzes en houdt u de plaat gedurende de gehele run koud.
Als de lysis onvolledig is, verleng dan de ultrasone bewerkingstijd stapsgewijs, probeer een enzymatische voorbehandeling, verlaag de viscositeit van het monster of optimaliseer de buffer. Als eiwitten afbreken of hun activiteit verliezen, zorg dan voor betere koeling, verkort de ON-intervallen, voeg remmers toe en controleer of het detergentsysteem compatibel is met het doeleiwit.
Aangezien giststammen aanzienlijk van elkaar verschillen wat betreft celwandstructuur, groeifase, expressiesysteem en biomassadichtheid, wordt een korte optimalisatiematrix aanbevolen. Test bijvoorbeeld drie amplitudes, twee pulscycli en twee totale ON-tijden, en evalueer vervolgens de lysis-efficiëntie en de eiwitintegriteit.
Of u nu een paar assayplaten verwerkt of een gist-screening met hoge doorvoercapaciteit uitvoert, Hielscher kan u helpen bij het kiezen van de juiste microplaat-sonicator en het ontwikkelen van een robuust lysisprotocol. Neem contact met ons op en geef uw giststam, workflow en vereisten qua doorvoercapaciteit door!
Voordelen van Hielscher-microplaat-sonicatoren voor het lyseren van gist
De microplaat-sonicatoren van Hielscher zijn ideaal voor laboratoria die behoefte hebben aan reproduceerbare lysis bij een groot aantal monsters. Ze maken een einde aan de trage verwerking van één monster per keer bij sonicatie met een sonde en verminderen de variabiliteit die wordt veroorzaakt door handmatige positionering van de sonde, de dompeldiepte en verschillen in de behandeling van monster tot monster.
De belangrijkste voordelen zijn:
- Snelle verwerking: Behandel meerdere gistmonsters tegelijkertijd met ultrasone trillingen in microplaten of geschikte monsterhouders.
- Reproduceerbare omstandigheden: Dezelfde ultrasone behandelingsvoorwaarden in alle putjes voor uniforme, vergelijkbare lyseringsresultaten.
- Geen kruisbesmetting door de sonde: De monsters blijven tijdens de ultrasone behandeling verzegeld, waardoor kruisbesmetting en het aantal reinigingsstappen worden beperkt.
- Geschikt voor robuuste cellen: Ultrasoon geluid met hoge intensiteit draagt bij aan het afbreken van de celwanden van gistcellen.
- Efficiënte werkstroom: Ideaal voor het screenen van stammen, klonen, expressieomstandigheden en lysisbuffers.
- Efficiënte werkstroom: Programmeerbare instellingen, geautomatiseerde gegevensregistratie en geschikt voor laboratoriumautomatisering.
Toepassingen in de gistbiotechnologie en het onderzoek op het gebied van de levenswetenschappen
Ultrasone gistlysis in microplaten ondersteunt talrijke onderzoeks- en screeningworkflows. Bij de expressie van recombinante eiwitten kunnen klonen van P. pastoris en S. cerevisiae parallel worden gelyseerd om expressieniveaus of enzymactiviteit te vergelijken. In de systeembiologie en de omics verbetert gestandaardiseerde lysis de vergelijkbaarheid tussen verschillende omstandigheden. In de microbiologie maakt ultrasone behandeling een snelle bereiding mogelijk van lysaten afkomstig van meerdere stammen, onder verschillende mediumomstandigheden of na stressbehandelingen.
Typische toepassingsgebieden zijn onder meer:
- gisteiwitwinning
- screening van recombinante eiwitten
- screening van enzymactiviteit
- selectie van klonen na transformatie
- optimalisatie van het gistingsproces
- monstervoorbereiding voor proteomica
- monstervoorbereiding voor metabolomica
- onderzoek naar de afbraak van celwanden
- microbiologische tests met hoge doorvoercapaciteit
Betrouwbare gistlysis begint met gecontroleerde ultrasone behandeling
Het lyseren van gist kan lastig zijn wanneer het aantal monsters toeneemt, maar de microplaat-sonicatoren van Hielscher maken het proces sneller, schoner en beter reproduceerbaar. Met de UIP400MTP en UIP550MTP kunnen onderzoekers complete platen onder vastgestelde ultrasone omstandigheden verwerken, waardoor de doorvoer wordt verbeterd en handmatige handelingen worden verminderd.
Voor microbiologen, moleculair biologen, eiwitonderzoekers en biotechnologische laboratoria is ultrasone behandeling van microplaten een krachtig hulpmiddel om intracellulaire gistcomponenten op een efficiënte en reproduceerbare manier vrij te maken.
Veelgestelde vragen over de afbraak van gistcellen door middel van ultrasone behandeling in microplaten
Kunnen gistcellen door middel van ultrasone behandeling worden afgebroken?
Ja. Gistcellen zoals Saccharomyces cerevisiae en Pichia pastoris kunnen door middel van ultrasone behandeling met hoge intensiteit worden afgebroken. Door ultrasone cavitatie ontstaan sterke mechanische schuifkrachten die de celwand en het celmembraan van de gistcellen beschadigen, waardoor eiwitten, enzymen, nucleïnezuren en metabolieten vrijkomen.
Waarom zijn gistcellen moeilijker te lyseren dan bacteriële cellen?
Gistcellen hebben een dikke en mechanisch resistente celwand die voornamelijk bestaat uit glucanen, mannoproteïnen en chitine. Door deze stijve structuur is gist moeilijker te breken dan veel bacteriële of zoogdiercellen. Daarom vereist de lysis van gist doorgaans een hogere intensiteit, een langere verwerkingstijd of een optionele enzymatische voorbehandeling.
Welke Hielscher-sonicatoren zijn geschikt voor het lyseren van gist in microplaten?
De Hielscher UIP400MTP en UIP550MTP zijn geschikt voor het op grote schaal lyseren van gist in microplaten. De UIP400MTP is ideaal voor routinematige parallelle monstervoorbereiding, terwijl de UIP550MTP een hoger ultrasoon vermogen biedt voor veeleisende lysis-taken, dichte suspensies en robuuste giststammen.
Kan Pichia pastoris in een microplaat-sonicator worden afgebroken?
Ja. Pichia pastoris, ook bekend als Komagataella phaffii, kan worden afgebroken door middel van ultrasone behandeling met hoge intensiteit in microplaten. Aangezien P. pastoris een dichte biomassa kan vormen en een robuuste celwand heeft, wordt aanbevolen om de amplitude, de pulscyclus, de koeling en de totale ultrasone behandeltijd te optimaliseren.
Wat zijn de gebruikelijke ultrasone parameters voor het lyseren van gist?
Een geschikt startbereik is een amplitude van 50–80%, een gepulseerde werking (bijvoorbeeld 10–30 seconden AAN en 30–60 seconden UIT) en een cumulatieve AAN-tijd van 5–15 minuten. De exacte parameters zijn afhankelijk van de giststam, de celdichtheid, het monstervolume, het type plaat, de buffer en het doelmolecuul.
Waarom moet het afbreken van gist in de pulsmodus worden uitgevoerd?
De pulsmodus vermindert de warmteontwikkeling tijdens de ultrasone behandeling. Tijdens de AAN-fase worden de cellen door ultrasone cavitatie afgebroken. Tijdens de UIT-fase kan het monster afkoelen. Dit is belangrijk omdat overmatige warmte eiwitten kan denatureren, de enzymactiviteit kan verminderen, RNA kan afbreken en de reproduceerbaarheid in gevaar kan brengen.
Is een enzymatische voorbehandeling nodig voordat gistcellen met ultrasone trillingen worden behandeld?
Een enzymatische voorbehandeling is niet altijd nodig, maar kan de efficiëntie van de lysis wel verbeteren. Enzymen zoals Zymolyase of Lyticase breken de celwand van de gist gedeeltelijk af en kunnen de ultrasone intensiteit of de tijd die nodig is voor volledige lysis verminderen. Dit kan nuttig zijn bij gevoelige eiwitten of lastige stammen.
Hoe kan oververhitting tijdens het sonificeren van gist worden voorkomen?
Gebruik vooraf gekoelde buffers, de pulsmodus, koelpauzes en een gekoelde microplaatopstelling. Houd de microplaat afgesloten en houd de temperatuur waar mogelijk in de gaten. Gebruik voor gevoelige eiwitten kortere AAN-intervallen, langere UIT-intervallen en verwerk de monsters onder koude omstandigheden.
Kan ultrasone behandeling van microplaten het ‘bead beating’-proces vervangen voor het lyseren van gist?
In veel werkprocessen is dat inderdaad het geval. Sonicatie van microplaten kan het gebruik van microsferen vervangen wanneer een zuivere, reproduceerbare en parallelle lysis vereist is. Het maakt het hanteren van microsferen overbodig, vermindert de complexiteit van de verbruiksartikelen en vereenvoudigt de automatisering. Elke toepassing moet echter worden gevalideerd door de lysisopbrengst, de eiwitintegriteit en de testprestaties te vergelijken.
Is ultrasone behandeling van microplaten geschikt voor de extractie van eiwitten uit gist?
Ja. Ultrasone behandeling van microplaten is zeer geschikt voor de extractie van eiwitten uit gist, vooral wanneer veel klonen of kweekomstandigheden met elkaar moeten worden vergeleken. Proteaseremmers, koude buffers en gecontroleerde pulsinstellingen helpen de kwaliteit van de eiwitten te behouden.
Kan dezelfde methode worden gebruikt voor de extractie van DNA, RNA en eiwitten?
Hetzelfde basisprincipe van ultrasone behandeling kan worden toegepast, maar de buffer en de procesomstandigheden moeten worden aangepast aan het doelmolecuul. Bij eiwitwerkprocessen zijn proteaseremming en temperatuurregeling vereist. Bij RNA-werkprocessen is een RNase-vrije hantering en krachtige koeling vereist. Bij DNA-werkprocessen kunnen verschillende lysis- en zuiveringsomstandigheden nodig zijn, afhankelijk van of intact genomisch DNA of gefragmenteerd DNA gewenst is.
Welk type plaat moet worden gebruikt voor het afbreken van gist?
Gebruik een voor ultrasone behandeling geschikte microplaat of deep-well-plaat met een geschikte afdichting. Platen met een ronde bodem zijn vaak handig voor het werken met suspensies. De plaat moet bestand zijn tegen de gekozen ultrasone behandelingsomstandigheden, de temperatuur van het monster en de centrifugeerstappen.
Hoe weet ik of de gistlysis voltooid is?
De efficiëntie van de lysis kan worden gecontroleerd aan de hand van microscopisch onderzoek, de eiwitopbrengst, de enzymactiviteit, de afname van de viscositeit, SDS-PAGE-analyse, de DNA/RNA-opbrengst of een vergelijking met een bekende lysis-methode. Bij de ontwikkeling van een methode moeten zowel de opbrengst als de kwaliteit van het vrijgekomen doelmolecuul worden beoordeeld.
UIP400MTP of UIP550MTP: welke microplaat-sonicator moet u kiezen?
De UIP400MTP is een krachtige microplaat-sonicator voor routinematige monstervoorbereiding met hoge doorvoercapaciteit, waaronder het lyseren van gist, eiwitextractie, het versnipperen van DNA, het losmaken van biofilms en het voorbereiden van assays. Het apparaat is geschikt voor laboratoria die behoefte hebben aan reproduceerbare sonicatie in standaardplaatformaten.
De UIP550MTP levert een hoger ultrasoonvermogen en wordt aanbevolen voor veeleisende toepassingen waarbij een hogere akoestische intensiteit, kortere verwerkingstijden, grotere monsterhoeveelheden of robuustere breekomstandigheden vereist zijn. Voor het lyseren van gist is de UIP550MTP met name geschikt voor dichte biomassa, lastige stammen, grotere werkvolumes en expressiescreening met hoge doorvoer.
Kan de afbraak van gist door middel van ultrasone behandeling in microplaten worden geautomatiseerd?
Ja. Ultrasone behandeling met microplaten is uitermate geschikt voor geautomatiseerde laboratoriumworkflows, omdat de monsters in plaatvorm blijven. Dit maakt integratie mogelijk met pipetteersystemen, plaatverwerking, centrifugeren, de voorbereiding van assays en workflows voor screening met hoge doorvoercapaciteit.
Literatuur / Referenties
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP550MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics 2024.



