Testa ultraskaņas apstrāde – The Assay-At-Once Sonicator UIP400MTP
Ultraskaņas apstrāde ir būtiska metode laboratorijas protokolos, īpaši tādiem lietojumiem kā hromatīna imūnprecipitācijas (ChIP) testi. Izmantojot ultraskaņas enerģiju, lai sadalītu šūnas, bīdītu DNS un izšķīdinātu hromatīnu, ultraskaņas apstrāde ļauj pētniekiem efektīvāk un reproducējamāk sagatavot paraugus. Hielscher vairāku urbumu plākšņu ultraskaņas aparāti ir vieni no vismodernākajiem un efektīvākajiem rīkiem, kas pieejami šim nolūkam, racionalizējot augstas caurlaidspējas darbplūsmas, pielāgojot līdz pat 96 urbumu plāksnēm.
Galvenās vairāku urbumu plākšņu ultraskaņas savienojumu priekšrocības testiem
Hielscher bezkontakta 96 urbumu plāksnes ultraskaņas aparāti, piemēram, UIP400MTP, piedāvā ļoti uzticamu un kontrolētu pieeju šūnu līzei un hromatīna nobīdei. Šis bezkontakta dizains nodrošina, ka katrs urbums tiek apstrādāts vienādi, nodrošinot konsekventus rezultātus lielā paraugu skaitā. Izmantojot šo sonikatoru, pētnieki var veikt vairākus procesus, tostarp:
- Šūnu līze: Efektīva ultraskaņas apstrāde izjauc atvērtās šūnu membrānas, atbrīvojot šūnu saturu.
- DNS un RNS nobīde: Augstas intensitātes ultraskaņas viļņi fragmentē DNS un RNS līdz vēlamajiem izmēriem, kas ir būtiski pakārtotajiem testiem.
- Hromatīna fragmentācija: Hromatīna sadalīšana mazākos gabalos lejupējām analīzēm, piemēram, hromatīna imūnprecipitācijai (ChIP), DNS sekvencēšanai vai citiem epiģenētiskiem pētījumiem. Lasiet vairāk par hromatīna sadrumstalotību, izmantojot UIP400MTP!
- Šķīdināšana: Uzlabo parauga komponentu šķīdību, palīdzot sagatavot vienveidīgus, reproducējamus pārbaudes paraugus.
Šīs funkcijas ir būtiskas augstas caurlaidspējas paraugu sagatavošanai un paraugu miniaturizācijai, jo tās ļauj pētniekiem apstrādāt vairākus paraugus ar minimālu savstarpējas inficēšanās risku.
Ultraskaņas apstrādes nozīme ChIP testos
Hromatīna imūnprecipitācijas (ChIP) testi ir atkarīgi no precīzas hromatīna nobīdes, lai iegūtu optimāla izmēra DNS fragmentus, parasti no 200 līdz 600 bāzu pāriem (bp). Šie fragmenti ir nepieciešami efektīvai imūnprecipitācijai, precīzai maksimālajai izšķirtspējai un ticamiem rezultātiem ChIP-Seq testos. Hielscher UIP400MTP Assay-At-Once sonikators ir īpaši piemērots ChIP protokoliem, nodrošinot vienmērīgu hromatīna sadrumstalotību vairākās akās. Šīs precizitātes priekšrocības ChIP darbplūsmās ir šādas:
- Augsts hromatīna daudzums: Efektīva ultraskaņas apstrāde atbrīvo lielāku hromatīna daudzumu no katra parauga.
- Konsekvence starp paraugiem: Vairāku urbumu sonikators saglabā konsekventus fragmentu izmērus visās akās, samazinot mainīgumu ChIP testos.
- Uzlabota jutība un izšķirtspēja ChIP-Seq: Pareizi sadrumstalota DNS nodrošina skaidrāku maksimālo izšķirtspēju, kas ir kritisks faktors precīzas olbaltumvielu un DNS mijiedarbības noteikšanā.
Uzticamas ultraskaņas loma veiksmīgos testos
Testiem, kas ietver lielu paraugu skaitu, piemēram, klīniskajā diagnostikā vai zāļu atklāšanā, būtiska ir reproducējamība un caurlaidspēja. Hielscher vairāku urbumu plāksnes ultraskaņas aparāti nodrošina risinājumu, veicinot vienmērīgu paraugu sagatavošanu daudzās akās. Šī konsekvence ne tikai uzlabo testa izturību, bet arī uzlabo vispārējo darbplūsmas efektivitāti, ietaupot laiku un resursus laboratorijā.
Hielscher vairāku urbumu plākšņu ultraskaņas aparāti ir nenovērtējami pārbaudes protokolos, īpaši tajos, kuriem nepieciešama augstas caurlaidspējas apstrāde. Nodrošinot uzticamu šūnu līzi, DNS nobīdi un šķīdināšanu, šie ultraskaņas apstrādātāji optimizē paraugu sagatavošanu precīziem un reproducējamiem rezultātiem. Pētniekiem, kas strādā ar ChIP testiem, UIP400MTP sonikators piedāvā spēcīgu rīku, kas uzlabo hromatīna ražu, fragmentu konsistenci un testa jutību, galu galā nodrošinot veiksmīgākus eksperimentus un skaidrākus ieskatus.
Vairāku urbumu plāksnes ultraskaņas UIP400MTP atvieglo augstas caurlaidspējas paraugu sagatavošanu, racionalizējot pētniecības darbu un testus.
UIP400MTP Multiwell Sonicator galvenās iezīmes
| augstas caurlaidspējas ultraskaņas apstrāde | Lieliski piemērots 96 urbumiem un citām daudzprofilu plāksnēm, UIP400MTP ļauj vienlaicīgi, identiski apstrādāt ar ultraskaņu vairākiem paraugiem, ievērojami saīsinot paraugu sagatavošanas ilgumu un palielinot lielu paraugu skaita testēšanas caurlaidspēju. |
| Izmantojiet izvēlēto Multiwell plāksni | UIP400MTP ir paredzēts, lai apstrādātu visas standarta daudzvietīgās plāksnes, PCR plāksnes vai mikrotitrēšanas plāksnes. Jūs izvēlaties saviem eksperimentiem vispiemērotāko plati. Tā kā UIP400MTP nav nepieciešami patentēti palīgmateriāli, tas ietaupa daudz naudas! |
| Bezkontakta ultrasonikācija | Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP izmanto intensīvu ultraskaņu, neko neievietojot paraugā. Jūs varat apstrādāt ealed daudzviet plāksnes, slēgtus traukus un flakonus. Hielscher piegādā jums pielāgotus paraugu turētājus visiem nestandarta flakoniem vai traukiem. |
| Precizitāte un kontrole | Precīza kontrole un viedā programmatūra ļauj optimāli iestatīt ultraskaņas parametrus, kas atbilst jūsu īpašajām apstrādes vajadzībām. Jūs saņemat maksimālu ultraskaņas apstrādes efektivitāti un efektivitāti katram eksperimentam. |
| temperatūras kontrole | Iestatiet noteiktu temperatūru jūsu ultraskaņas apstrādei. UIP400MTP plāksnes sonikators var uzraudzīt parauga temperatūru un attiecīgi pielāgot ultraskaņu. Recirkulācijas dzesēšanas šķidrums atdzesē katru iedobi platē, lai precīzi kontrolētu temperatūru. |
| Protokols un tālvadība | Katru ultraskaņas darbību var kontrolēt no datora. Programmatūras instalēšana nav nepieciešama. Varat izmantot savu standarta pārlūkprogrammu (piemēram, Chrome, Firefox, Edge vai Safari) jebkurā operētājsistēmā (piemēram, MacOS, Windows, Android, iOS vai Linux), lai attālināti vadītu un uzraudzītu UIP400MTP. Katrs ultraskaņas apstrādes posms rada detalizētu ultraskaņas apstrādes protokolu novērtēšanai un dokumentācijai. Protokola fails ir nepatentētā CSV formātā, kuru var atvērt ar vēlamo programmu, piemēram, Microsoft Excel, Apple Numbers vai OpenOffice Calc. |
| Izturīgs un uzticams | Projektēts un būvēts Vācijā atbilstoši augstākajiem kvalitātes standartiem, UIP400MTP ir ne tikai jaudīgs, bet arī ļoti izturīgs. Tā dizains atbilst rūpniecības standartiem un viegli iztur ikdienas lietošanas stingrību prasīgā laboratorijas vidē. Jūs varat izmantot UIP400MTP nepārtraukti 24 stundas 7 dienas nedēļā augstas caurlaidspējas operācijās. |
Kā UIP400MTP atvieglo testa miniaturizāciju
Hielscher vairāku urbumu plates ultraskaņas UIP400MTP ir izšķiroša loma testu miniaturizācijā, ļaujot zinātniekiem un klīnicistiem samazināt testa apjomus, neapdraudot precizitāti vai precizitāti. Šī spēja ir nenovērtējama tādās jomās kā mikrobioloģija, zāļu atklāšana, diagnostika, personalizēta medicīna un klīniskā diagnostika, kur miniaturizēti testi ļauj veikt efektīvāku, rentablāku un ātrāku testēšanu.
- Bezkontakta ultraskaņas apstrāde 96 urbumu plāksnēs
UIP400MTP bezkontakta ultraskaņas tehnoloģija ir ideāli piemērota miniaturizētiem testa formātiem. Uzņemot 96 urbumu plāksnes, šis sonikators var apstrādāt ļoti mazus paraugu apjomus vienlaikus vairākās akās. Tradicionālās ultraskaņas metodes bieži cīnās ar konsekvenci zemākos apjomos nevienmērīga enerģijas sadalījuma dēļ, bet UIP400MTP nodrošina vienotus ultraskaņas viļņus visās akās, saglabājot ticamus rezultātus pat miniaturizētos formātos. - Precizitāte un viendabīgums starp paraugiem
Miniaturizācijai nepieciešama precīza paraugu sagatavošanas kontrole, jo mazāki tilpumi var būt jutīgāki pret variācijām. UIP400MTP fokusētā ultraskaņas apstrāde nodrošina, ka katrs urbums saņem identisku ultraskaņas apstrādes līmeni, kas ir būtisks, lai saglabātu precizitāti un reproducējamību visos paraugos. Šī konsekvence ir būtiska tādās jomās kā zāļu atklāšana un klīniskā diagnostika, kur pat nelielas variācijas var ietekmēt rezultātus. Lasiet vairāk par fokusētu ultraskaņu! - Efektīva šūnu līze un DNS nobīde samazinātos apjomos
Ar mazākiem apjomiem efektīva šūnu līze un DNS nobīde kļūst arvien sarežģītāka, tomēr tām ir izšķiroša nozīme augstas kvalitātes testa rezultātu ģenerēšanā. UIP400MTP augstas intensitātes ultraskaņas viļņi ir pietiekami spēcīgi, lai panāktu efektīvus šūnu traucējumus un DNS nobīdi pat samazinātos apjomos. Šī iespēja ļauj pētniekiem iegūt nepieciešamo lizātu un DNS fragmentu kvalitāti bez nepieciešamības palielināt apjomus, padarot to par ideālu rīku miniaturizētām darbplūsmām. - Izmaksu ietaupījums un resursu efektivitāte
Miniaturizēti testi patērē mazāk reaģentu un samazina paraugu atkritumus, kas ir īpaši izdevīgi, strādājot ar retiem vai dārgiem paraugiem. UIP400MTP to atbalsta, ļaujot sagatavot augstas caurlaidspējas paraugus nelielos apjomos, ļaujot zinātniekiem maksimāli palielināt savus resursus. Tādās jomās kā personalizētā medicīna, kur pacientu iegūtos paraugus var ierobežot, šī efektivitāte ir īpaši izdevīga. - Palielināta caurlaidspēja un ātrums
Samazinot testu apjomus, UIP400MTP palīdz laboratorijām apstrādāt vairāk paraugu īsākā laika posmā, ievērojami palielinot caurlaidspēju. Šī ātrā apstrāde ir ļoti svarīga tādās ļoti pieprasītās jomās kā diagnostika un zāļu atklāšana, kur laika ziņā jutīgi rezultāti var tieši ietekmēt pacientu aprūpi vai pētījumu rezultātus. Miniaturizēti testi apvienojumā ar UIP400MTP augstas caurlaidspējas jaudu ļauj veikt ātrāku liela mēroga testēšanu un analīzi. - Atbalsta automatizāciju un augstas caurlaidspējas pārbaudi
UIP400MTP saderība ar visiem standarta vairāku urbumu plākšņu formātiem nodrošina nevainojamu integrāciju ar automatizētām sistēmām, ko izmanto augstas caurlaidspējas skrīningā. Šī integrācija ir liela priekšrocība tādās jomās kā mikrobioloģija un zāļu atklāšana, kur ātra, automatizēta apstrāde ir būtiska, lai pārbaudītu lielas savienojumu bibliotēkas vai analizētu daudzus mikrobu celmus.
UIP400MTP atvieglo testa miniaturizāciju, nodrošinot uzticamu ultraskaņu maziem apjomiem, nodrošinot precizitāti un konsekvenci starp paraugiem. Tās spēja apstrādāt miniaturizētus testus ar augstu precizitāti, reproducējamību un efektivitāti ļauj zinātniekiem un klīnicistiem samazināt apjomus, vienlaikus sasniedzot ātrākus, rentablākus un augstas kvalitātes rezultātus dažādās pētniecības un klīniskajās jomās.
Testi, ko veicina UIP400MTP Multi-Well Plate Sonicator
Vairāku urbumu plates ultraskaņas UIP400MTP tiek izmantots testiem, kas saistīti ar šūnu darbības traucējumiem, lai atbrīvotu proteīnus un biomolekulas, bioplēves pētījumiem un antimikrobiālajiem testiem, piemēram:
- ELISA: Ultraskaņas apstrāde tiek izmantota, ja parauga sagatavošana ietver atvērtu šūnu sadalīšanu, lai iegūtu olbaltumvielu ekstraktus.
- MBEC (minimālā bioplēves izskaušanas koncentrācija) testi: Lai noteiktu antimikrobiālo līdzekļu koncentrāciju, kas vajadzīga, lai izskaustu izveidotās bioplēves. Uzziniet vairāk par UIP400MTP izmantošanu MBEC testiem, tostarp protokolam.
- MBIC (minimālā bioplēves inhibējošā koncentrācija) testi: Lai novērtētu antimikrobiālo līdzekļu spēju novērst bioplēves veidošanos.
- Bioplēves kvantitatīvās noteikšanas testi: Biofilmu izjaukšanai, lai izmērītu biomasu vai šūnu dzīvotspēju, izmantojot tādas metodes kā KVV skaits vai spektrofotometrija.
- Augstas caurlaidspējas zāļu skrīnings: Lai novērtētu antimikrobiālo savienojumu efektivitāti pret bioplēvi veidojošām baktērijām vairāku urbumu formātos.
- Ekstracelulārās matricas ekstrakcija: ECM ekstrakcija ir būtisks paraugu sagatavošanas posms pirms daudziem testiem. Atrodiet protokolu augstas izšķirtspējas ekstracelulārās matricas ekstrakcijai ar UIP400MTP šeit!
- PMCA: Olbaltumvielu nepareiza cikliskā pastiprināšana ir neaizstājams solis uzticamai prionu noteikšanai. Uzziniet, kā UIP400MTP veicina augstas caurlaidspējas PMCA, lai iegūtu stabilus rezultātus!
Literatūra / Atsauces
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- UIP400MTP-Multi-well-Plate-Sonicator-Infographic
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Biežāk uzdotie jautājumi
Kas ir Assay Sonication?
Ultraskaņas apstrāde ar ultraskaņu ir metode, kas izmanto ultraskaņas viļņus, lai izjauktu šūnas, bīdes DNS un šķīdinātu proteīnus vai hromatīnu, ļaujot efektīvi sagatavot paraugus bioķīmiskiem testiem.
Kas ir tests?
Pārbaude ir laboratorijas procedūra, ko izmanto, lai izmērītu konkrētas vielas vai analizējamās vielas klātbūtni, daudzumu vai aktivitāti paraugā, bieži vien, lai novērtētu bioloģiskās, ķīmiskās vai bioķīmiskās īpašības. Testi ir izplatīta procedūra klīniskajās laboratorijās, zinātnēs par dzīvību, molekulārajā bioloģijā, farmakoloģijā, vides bioloģijā un kalnrūpniecībā.
Kāda ir atšķirība starp testu un testu?
Noteikumi “Pārbaude” un “tests” bieži tiek lietoti savstarpēji aizstājami, bet tiem ir atšķirīgas nozīmes zinātniskos kontekstos:
- Pārbaude: Pārbaude ir precīza, kvantitatīva vai puskvantitatīva analītiska procedūra, kas paredzēta konkrētas vielas (analizējamās vielas) klātbūtnes, daudzuma vai funkcionālās aktivitātes mērīšanai paraugā. Testi parasti ir precīzi definēti, reproducējami protokoli, ko izmanto, lai novērtētu tīrību, koncentrāciju vai bioloģisko aktivitāti. Tos bieži izmanto bioķīmiskās, farmakoloģiskās vai ķīmiskās analīzēs.
- Tests: Tests ir plašāks termins, kas attiecas uz jebkuru metodi vai procesu, ko izmanto, lai novērtētu parauga vai sistēmas īpašības vai funkcionalitāti. Testi var būt kvalitatīvi vai kvantitatīvi, un tie var būt no vienkāršiem novērtējumiem (piemēram, pH tests) līdz sarežģītākiem novērtējumiem. Atšķirībā no testiem testiem var nebūt nepieciešama tik augsta specifiskuma pakāpe vai kvantitatīvi mērījumi.
Kopumā, lai gan visi testi ir testi, ne visi testi ir testi. Testi parasti ir specifiskāki un kvantitatīvāki, savukārt testi var ietvert plašu procedūru klāstu ar atšķirīgu specifiskumu un detalizāciju.
Kādi ir trīs testu veidi?
Trīs galvenie testu veidi ir:
- Bioķīmiskie testi: Šie testi mēra specifisku molekulu (piemēram, fermentu, substrātu vai metabolītu) aktivitāti vai koncentrāciju bioķīmiskās reakcijās. Tos plaši izmanto, lai analizētu fermentu kinētiku, saistīšanās afinitātes un vielmaiņas ceļus.
- Šūnu testi: Uz šūnām balstīti testi novērtē savienojumu, olbaltumvielu vai citu vielu ietekmi uz dzīvām šūnām. Tie mēra tādus parametrus kā šūnu dzīvotspēja, proliferācija, citotoksicitāte, signalizācijas ceļi un gēnu ekspresija, sniedzot ieskatu šūnu reakcijās un zāļu iedarbībā.
- Imūnanalīzes: Imūnanalīzēs izmanto antivielas, lai noteiktu un kvantificētu specifiskus antigēnus vai analizējamās vielas paraugā. Izplatītākie veidi ir ELISA (ar fermentiem saistīts imūnsorbcijas tests), western bloting un immunofluorescence. Šie testi tiek plaši izmantoti diagnostikā un pētījumos, lai noteiktu proteīnus, hormonus un patogēnus.
Katrs no šiem testiem ir būtisks pētniecībā, diagnostikā un zāļu izstrādē, jo tie sniedz kvantitatīvus vai kvalitatīvus datus par dažādām bioloģiskām vai ķīmiskām īpašībām.
Kādi ir vissvarīgākie testi dzīvības zinātnē un mikrobioloģijā?
- Enzīmu imūnsorbcijas tests (ELISA): ELISA ir plaši izmantota imūnanalīze, lai noteiktu un kvantificētu specifiskus proteīnus, antivielas vai antigēnus bioloģiskos paraugos. Tas ir nenovērtējams slimību diagnosticēšanai, imūnreakciju izsekošanai un biomarķieru noteikšanai. Ultraskaņas apstrāde tiek izmantota, lai lizētu šūnas vai audus, lai atbrīvotu mērķa proteīnus, analizējot intracelulāros komponentus.
- Polimerāzes ķēdes reakcijas (PCR) testi: PCR un tā varianti (piemēram, qPCR un RT-PCR) pastiprina DNS vai RNS, ļaujot ātri noteikt un kvantitatīvi noteikt specifisku ģenētisko materiālu. Šie testi ir ļoti svarīgi patogēnu noteikšanā, ģenētiskajos pētījumos un diagnostikā. Ultraskaņas apstrāde tiek izmantota DNS ekstrakcijai no šūnām vai audiem, īpaši, ja tiek pētītas mikrobu vai eikariotu šūnas ar robustām šūnu sienām vai membrānām.
- Rietumu blotēšana: Šī metode nosaka un kvantificē konkrētus proteīnus paraugā, sniedzot informāciju par olbaltumvielu ekspresiju, molekulmasu un pēctranslācijas modifikācijām. To plaši izmanto molekulārajā bioloģijā un slimību pētniecībā. Ultraskaņas apstrāde tiek izmantota šūnu vai audu lizēšanai, lai atbrīvotu un bīdītu proteīnus, sagatavojot tos analīzei.
- Reportiera gēnu testi: Šie testi mēra gēnu ekspresiju un regulējošo aktivitāti, šūnās ieviešot reportiera gēnus, piemēram, GFP vai luciferāzi. Tos plaši izmanto, lai pētītu gēnu ekspresiju, veicinātāja aktivitāti un zāļu ietekmi uz signalizācijas ceļiem. Ultraskaņas apstrāde dažreiz tiek izmantota, ja lizējot šūnas, lai analizētu reportiera gēnu produktus, piemēram, fermentus, piemēram, luciferāzi, šūnu testos.
- Hromatīna imūnprecipitācijas (ChIP) testi: ChIP testi pēta olbaltumvielu un DNS mijiedarbību, ļaujot pētniekiem pētīt transkripcijas faktorus, histonu modifikācijas un gēnu ekspresijas epiģenētisko regulēšanu, kas ir svarīgi gēnu regulēšanas pētījumos un slimību pētījumos. Ultraskaņas apstrāde ir galvenais solis, lai hromatīnu sadalītu atbilstošos fragmentu izmēros, nodrošinot efektīvu imūnprecipitāciju.
- Luminex testi: Šie multipleksa lodīšu testi vienlaikus mēra vairākus analītus (piemēram, citokīnus, hormonus) vienā paraugā, kas ir noderīgi imunoloģijā, onkoloģijā un biomarķieru atklāšanā. Ultraskaņas apstrāde tiek izmantota šūnu vai audu lizātu sagatavošanai, lai izmērītu intracelulāros analītus, bet tas nav nepieciešams plazmas vai seruma paraugiem.
Hielscher Ultrasonics ražo augstas veiktspējas ultraskaņas homogenizatorus no Lab līdz rūpnieciskais izmērs.