Analīžu miniaturizācija, ko nodrošina augstas veiktspējas sonikācija
Testu miniaturizācija ir noteicošā tendence mūsdienu dzīvības zinātņu pētniecībā. Tā kā laboratorijas cenšas apstrādāt lielāku paraugu skaitu, vienlaikus samazinot reaģentu patēriņu un eksperimentu izmaksas, arvien biežāk tradicionālos uz mēģenēm balstītos testus aizstāj mazāki reakciju apjomi un uz mikroplatēm balstītas darba plūsmas. Šī pāreja uz pārbaužu miniaturizāciju ļauj pētniekiem paātrināt pārbaužu izstrādi, saīsināt eksperimentu ciklus un, pateicoties lielākam paraugu blīvumam, iegūt stabilākas datu kopas.
Izaicinājumi testu miniaturizācijas jomā
Miniatūrās analīzes rada arī tehniskus izaicinājumus. Darbs ar maziem paraugu apjomiem liela blīvuma mikroplatēs prasa ļoti konsekventu paraugu sagatavošanu visās iedobēs. Apstrādes apstākļu variācijas var ātri novest pie pretrunīgiem rezultātiem, jo īpaši darba plūsmās, kas ietver šūnu izjaukšanu, nukleīnskābju ekstrakciju, proteīnu izolāciju vai nanodaļiņu dispersiju. Tāpēc, lai saglabātu datu ticamību un eksperimentu reproducējamību, ļoti svarīgi ir nodrošināt vienādu visu paraugu apstrādi.
Ar UIP400MTP pārvariet testēšanas miniaturizācijas problēmas
Mikroplatīšu sonikators UIP400MTP risina šīs problēmas, nodrošinot augstas veiktspējas sonikāciju tieši standarta daudznodalījumu platēs. Tā vietā, lai paraugus apstrādātu atsevišķi, sistēma vienlaicīgi izmanto ultraskaņas enerģiju visā mikroplatē. Šī pieeja nodrošina vienādus sonikācijas apstākļus katrai iedobei, vienlaikus ievērojami palielinot apstrādes ātrumu. Rezultātā pētnieki var integrēt ultraskaņas paraugu sagatavošanu mūsdienīgās augstas veiktspējas darba plūsmās.
Ultraskaņas apstrāde jau sen ir pārbaudīta metode dzīvības zinātņu laboratorijās. Ultraskaņa efektīvi izjauc šūnu membrānas, fragmentē DNS, ekstrahē iekššūnu biomolekulas un izkliedē daļiņas. Tomēr tradicionālajām sonikācijas metodēm bieži vien ir nepieciešamas sistēmas, kas balstītas uz zondēm, vai apstrāde pa mēģenēm, kas, strādājot ar lielu paraugu skaitu, var ierobežot caurlaides spēju. Turpretī UIP400MTP ļauj laboratorijām apstrādāt veselas mikroplates uzreiz, novēršot vajadzību pēc atkārtotas atsevišķu paraugu apstrādes un nodrošinot patiesi mērogojamu darba plūsmu.
Mikrodaļiņu sonikatora UIP400MTP priekšrocības
UIP400MTP galvenā priekšrocība ir tā spēja nodrošināt vienmērīgu ultraskaņas enerģijas sadalījumu pa visām mikroplates iedobēm. Vienmērīgi sonikācijas apstākļi ir būtiski, lai saglabātu reproducējamību augstas veiktspējas testos, jo īpaši, ja vienā eksperimentā salīdzina simtiem paraugu. Vienlaikus apstrādājot visas iedobes ar vienādiem parametriem, UIP400MTP nodrošina, ka katram paraugam tiek piemēroti vienādi apstrādes apstākļi.
Šī spēja atbalsta plašu dabaszinātņu lietojumu klāstu, kas balstās uz kontrolētu ultraskaņas apstrādi. Pētnieki izmanto augstas veiktspējas sonikāciju, lai veiktu šādus uzdevumus:
- šūnu līze un šūnu šķīdināšana molekulārai analīzei.
- DNS un RNS ekstrakcija no bioloģiskajiem paraugiem
- DNS fragmentācija genoma darba plūsmām
- proteīnu ekstrakcija proteomikas un bioķīmiskiem pētījumiem.
- nākamās paaudzes sekvencēšanas (NGS) bibliotēku sagatavošana.
- nanodaļiņu dispersija nanobiotehnoloģiju pētniecībā.
- šūnu vai biofilmu atdalīšanās no virsmām.
Tā kā ultraskaņas apstrāde tiek veikta vienmērīgi pa visu plāksni, eksperimentālā mainība tiek samazināta līdz minimumam, un pakārtotās analītiskās darba plūsmas iegūst lielāku uzticamību.
Vēl viens svarīgs pārbaužu miniaturizācijas aspekts ir laboratoriju automatizācijas un robotizētu darbstaciju arvien plašāka ieviešana. Automatizētas šķidrumu apstrādes sistēmas un integrētas robotizētas platformas ļauj laboratorijām apstrādāt lielu skaitu paraugu ar minimālu manuālu iejaukšanos. Lai atbalstītu šādas vides, laboratorijas iekārtas jāprojektē tā, lai tās varētu bez problēmām integrēt automatizētās sistēmās.
Integrācija automatizētās laboratorijas darbstacijās
UIP400MTP tika izstrādāts, ņemot vērā šo prasību. Tā tīrais strukturālais dizains, kompaktā izmēra un ļoti izturīgais ierīces korpuss ļauj to viegli integrēt automatizētās laboratorijas darba stacijās. Sistēmu var integrēt robotizētās darba plūsmās kopā ar automatizētiem šķidrumu apstrādes iekārtām, mikroplatīšu nolasītājiem un citiem augstas veiktspējas analītiskiem instrumentiem. Šī savietojamība padara to īpaši piemērotu laboratorijām, kas veic automatizētus šūnu testus, genomu darba plūsmas vai skrīninga eksperimentus, kur reproducējamībai un mērogojamībai ir būtiska nozīme. Uzziniet vairāk par UIP400MTP integrēšanu automatizētās šķidrumu apstrādes sistēmās!
| Sonicator: Galvenās priekšrocības robotizētai automatizācijai | Kāpēc tas ir svarīgi |
| Standarta plāksnes atbalsts | Darbojas ar SBS formātiem, ar kuriem roboti jau strādā. |
| augsta caurlaidspēja | Paralēlā sonikācija samazina cikla laiku. |
| tālvadības pults & mežizstrāde | Iespējama neuzraudzīta darbība un izsekojamība. |
| bezkontakta ultraskaņas apstrāde | Mazāks piesārņojuma risks un labāka plākšņu blīvēšana. |
| temperatūras kontrole | Uztur parauga integritāti automātiskajos darbos. |
| mērogojama dažādiem urbumu formātiem | Atbilst mainīgajām automatizācijas caurlaidspējas vajadzībām. |
Savietojamība ar laboratorijas programmatūru
Papildus mehāniskajai integrācijai UIP400MTP atbalsta arī digitālo savienojamību automatizētai kontrolei un datu apmaiņai. Mūsdienu laboratoriju vidē arvien biežāk tiek izmantoti tīklā savienoti instrumenti, kurus var attālināti kontrolēt, uzraudzīt un integrēt laboratorijas informācijas sistēmās. Tāpēc mikroplatīšu sonikatoram ir vairākas labi dokumentētas atvērtas saskarnes, kas atvieglo saziņu ar automatizācijas platformām un vadības programmatūru.
Galvenās saziņas un integrācijas funkcijas:
- tālvadība, izmantojot XML un JSON komunikācijas protokolus.
- savietojamība ar ModBUS rūpniecības un laboratoriju automatizācijas sistēmām.
- SYSLOG atbalsts notikumu reģistrēšanai un sistēmas uzraudzībai
Šīs atvērtā standarta saskarnes ļauj laboratorijām iekļaut UIP400MTP sarežģītās automatizētās darba plūsmās un digitālo laboratoriju infrastruktūrās. Rezultātā pētnieki var īstenot pilnībā automatizētus procesus, kuros mikroplatīšu sonikācija kļūst par integrētu posmu plašākā eksperimentālā ciklā.
Advanced Life Science un pētniecība ar Assay Sonicator
Tā kā dzīvības zinātņu pētījumi turpina virzīties uz lielāku caurlaides spēju, mazāku reakciju apjomu un automatizētu darba procesu, arvien svarīgākas kļūst tehnoloģijas, kas atbalsta pārbaužu miniaturizāciju. Uzticama paraugu sagatavošana joprojām ir galvenais faktors, lai nodrošinātu eksperimentu panākumus, jo īpaši tad, ja vienādos apstākļos jāapstrādā simtiem vai tūkstošiem paraugu.
Nodrošinot augstas veiktspējas sonikāciju ar vienmērīgu enerģijas sadalījumu pa visām mikroplatēm, UIP400MTP sniedz pētniekiem jaudīgu instrumentu mērogojamai un reproducējamai paraugu sagatavošanai. Tā automatizācijai gatavā konstrukcija, digitālā savienojamība un saderība ar standarta mikroplatēm padara to par ideālu risinājumu laboratorijām, kas vēlas racionalizēt analīžu izstrādi, vienlaikus saglabājot zinātnisko stingrību.
Tādējādi UIP400MTP mikroplatīšu sonikators palīdz vienkāršot vienu no galvenajiem mūsdienu laboratorijas darba plūsmas izaicinājumiem: panākt konsekventu, augstas kvalitātes paraugu sagatavošanu arvien miniaturizētākā un automatizētākā eksperimentālā vidē.
Augstas veiktspējas testu sonikācija ar 96 urbumu plates sonikatoru UIP400MTP
Literatūra / Atsauces
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
Biežāk uzdotie jautājumi
Kas ir tests?
Analīze ir analītiska procedūra, ko izmanto, lai kvalitatīvi noteiktu vai kvantitatīvi izmērītu bioloģiskas molekulas, šūnu populācijas vai bioķīmiska procesa klātbūtni, koncentrāciju, aktivitāti vai funkcionālo ietekmi paraugā. Analīzes ir fundamentāli instrumenti dzīvības zinātnēs, bioķīmijā un farmācijas pētniecībā, kas ļauj zinātniekiem kontrolētos eksperimentālos apstākļos pētīt molekulāro mijiedarbību, enzīmu aktivitāti, gēnu ekspresiju, šūnu dzīvotspēju un daudzus citus bioloģiskos parametrus.
Kādi ir visbiežāk izmantotie testi?
Dzīvības zinātņu pētījumos visbiežāk izmantotie testi ietver enzīmu imūnsorbentu testus (ELISA) olbaltumvielu vai antivielu noteikšanai, polimerāzes ķēdes reakcijas (PCR) un kvantitatīvās PCR (qPCR) testus nukleīnskābju noteikšanai un kvantitatīvai noteikšanai, šūnu dzīvotspējas testus, piemēram, MTT vai resazurīna testus, reportieru gēnu testus, ko izmanto gēnu regulācijas izpētei, un enzīmu aktivitātes testus katalītisko reakciju noteikšanai. Turklāt biotehnoloģijā un farmācijā plaši izmanto DNS/RNS ekstrakcijas testus, olbaltumvielu kvantitatīvo noteikšanu (piemēram, Bredforda vai BCA testus) un augstas veiktspējas skrīninga testus.
Kādi ir 4 testu veidi?
Pamatojoties uz izmantoto analītisko principu, analīzes bieži iedala četros galvenajos veidos.
- bioķīmiskie testi izmērīt biomolekulu, piemēram, fermentu, proteīnu vai metabolītu, aktivitāti vai koncentrāciju kontrolētā reakcijas vidē.
- Šūnu testi novērtēt bioloģiskos procesus dzīvās šūnās, piemēram, šūnu proliferāciju, citotoksicitāti, signalizācijas ceļus vai gēnu ekspresiju.
- Imūnanalīzes izmantot antigēna un antivielas mijiedarbību, lai noteiktu specifiskus proteīnus vai biomarķierus ar augstu specifiskumu.
- Saistīšanās testi analizēt mijiedarbību starp molekulām, piemēram, ligandu un receptoru saistīšanos vai olbaltumvielu un olbaltumvielu mijiedarbību, kas ir īpaši svarīgi zāļu atklāšanā un farmakoloģiskos pētījumos.
Kāda ir atšķirība starp analīzi un testu?
Atšķirība starp analīzi un testu galvenokārt ir to zinātniskajā tvērumā un kontekstā. Tests parasti ir standartizēta analītiska procedūra, kas paredzēta, lai noteiktu konkrētu bioloģisku vai ķīmisku parametru, izmantojot noteiktu metodoloģiju, un ko bieži izmanto pētniecībā, zāļu izstrādē un kvalitātes kontrolē. Tests ir plašāks termins, kas attiecas uz jebkuru novērtējumu vai pārbaudi, ko veic, lai noteiktu kaut kā klātbūtni, stāvokli vai darbību. Zinātniskajā un klīniskajā kontekstā daudzi diagnostikas testi ir balstīti uz testiem, bet termins “tests” var attiekties arī uz neanalītiskiem novērtējumiem vai vienkāršotām diagnostikas procedūrām.
Hielscher Ultrasonics ražo augstas veiktspējas ultraskaņas homogenizatorus no Lab līdz rūpnieciskais izmērs.




