Ultraskaņas DNS fragmentācija nākamās paaudzes sekvencēšanai
Nākamās paaudzes sekvencēšanai (NGS) ir nepieciešama uzticama genoma DNS nobīde un fragmentācija, lai sekvencētu genoma DNS pavedienus un izveidotu genoma bibliotēkas. Kontrolēta DNS fragmentēšana DNS fragmentos ir būtisks parauga sagatavošanas posms, kas nepieciešams pirms DNS sekvencēšanas. Ultrasonication ir pierādīts kā efektīvs un uzticams paņēmiens noteikta garuma DNS sadrumstalotībai. Ultraskaņas DNS fragmentācijas protokoli sasniedz reproducējamus fragmentācijas rezultātus. Hielscher ultrasonikatori spēj radīt plašu genoma DNS fragmentu izmēru sadalījumu, kas precīzi kontrolējams, izmantojot darbības parametrus. Tā kā Hielscher ultraskaņas DNS nobīdes sistēmas ir pieejamas vienam un vairākiem flakoniem, kā arī mikroplatēm, paraugu sagatavošana kļūst ļoti efektīva.
UIP400MTP plāksnes Sonicator augstas caurlaidspējas paraugu sagatavošanai vienmērīgi apstrādā paraugus vairāku iedobju, mikrotitru platēs un 96 iedobju platēs
- atkārtojami / reproducējami rezultāti
- precīzi regulējams, lai iegūtu noteiktu fragmenta garumu
- Ātra apstrāde
- konsekventi DNS fragmentācijas rezultāti
- ierīces jebkuram parauga tilpumam (piemēram, vairāki flakoni vai mikroplates)
- augsta caurlaidspēja
- precīza temperatūras kontrole
- vienkārša, lietotājam draudzīga darbība
Nākamās paaudzes sekvencēšana: ultraskaņas DNS fragmentācija bibliotēkas sagatavošanai
Lai veiktu nākamās paaudzes sekvencēšanu, ir jāveic trīs pamata soļi: (1) bibliotēkas sagatavošana, (2) sekvencēšana un (3) datu analīze. Bibliotēkas sagatavošanas laikā DNS tiek sadrumstalota, pēc tam fragmentu gali tiek salaboti (pulēti), pievienojot vienu adenīna bāzi, un mērķa fragmenti tiek pārvērsti par divslāņu DNS. Visbeidzot, tā sauktie adapteri tiek piestiprināti ar ligāciju, PCR vai tagmentāciju, lai galīgo bibliotēkas DNS produktu varētu kvantitatīvi noteikt sekvencēšanai.
DNS sadrumstalotība, izmantojot ultraskaņu: Jo īpaši, ja īsas lasīšanas sekvencēšanas tehnoloģijas, piemēram, Illumina, kas nevar viegli nolasīt garākus DNS fragmentus, DNS statīviem jābūt sadrumstalotiem līdz noteiktam izmēram, ko var droši sasniegt ar ultrasonication.
Ultrasonication var droši izmantot DNS, RNS un hromatīna sadrumstalotībai.
Nākamās paaudzes sekvencēšana – Bibliotēkas sagatavošana
Ultraskaņas DNS fragmentācija parasti tiek izmantota DNS sekvencēšanas bibliotēku sagatavošanā nākamās paaudzes sekvencēšanas (NGS) platformām. Šī metode tiek izmantota, lai sadalītu DNS molekulas mazākos fragmentos ar vēlamo izmēru diapazonu, kas atvieglo turpmākos bibliotēkas sagatavošanas soļus. Ultraskaņas DNS fragmentācija parasti ir nepieciešama NGS darbplūsmu bibliotēkas sagatavošanas posmā, lai sadalītu genoma DNS mazākos gabalos, kas piemēroti pakārtotai apstrādei un sekvencēšanai. Tam ir izšķiroša nozīme, lai nodrošinātu sekvencēšanas eksperimenta panākumus, ģenerējot DNS fragmentus atbilstošā izmēru diapazonā konkrētajai izmantotajai sekvencēšanas platformai.
E. coli EDL933 genoma DNS elektroforētiskās analīzes pakļautas 0 – 15 min ultrasonikācijai. L norāda DNS kāpnes. (Basselet et al. 2008)
Nākamās paaudzes sekvencēšana – Procesa darbības:
- Ultraskaņas DNS fragmentācija: Pirms bibliotēkas celtniecības genoma DNS tiek sadalīta mazākos, vieglāk pārvaldāmos gabalos. Ultraskaņas sadrumstalotība ietver augstfrekvences skaņas viļņu izmantošanu, lai DNS molekulas nobīdītu vēlamā izmēra diapazona fragmentos. Šis solis ir izšķirošs, jo tas palīdz nodrošināt, ka vēlāk ģenerētie sekvencēšanas nolasījumi būs atbilstoša garuma izmantotajai sekvencēšanas platformai. Fragmentu izmēru diapazonu var pielāgot, pamatojoties uz sekvencēšanas eksperimenta īpašajām prasībām.
- Klonu pastiprināšana ar PCR: Pēc ultraskaņas fragmentācijas DNS fragmenti tiek pakļauti gala remontam, adaptera ligācijai un PCR pastiprināšanai, lai ģenerētu galīgās DNS sekvencēšanas bibliotēkas. Šie soļi sagatavo fragmentētās DNS molekulas sekvencēšanas procesam, pievienojot adapteru sekvences, kas nepieciešamas saistīšanai ar sekvencēšanas platformu, un nodrošinot gruntēšanas vietas PCR pastiprināšanai.
- DNS sekvencēšana ar sintēzi: Kad sekvencēšanas bibliotēkas ir sagatavotas, sākas DNS sekvencēšanas sintēzes (SBS) process. SBS laikā DNS sekvenci nosaka, secīgi pievienojot nukleotīdus komplementārajam pavedienam. Šis solis ietver nukleotīdu iekļaušanas, attēlveidošanas un šķelšanās cikliskās reakcijas, ļaujot noteikt DNS secību, pamatojoties uz fluorescējošiem signāliem, ko izstaro iekļautie nukleotīdi.
- Masveidā paralēla sekvencēšana: Pēdējā solī telpiski segregētās, pastiprinātās DNS veidnes tiek sekvencētas vienlaicīgi masveidā paralēlā veidā. Šī augstas caurlaidspējas sekvencēšanas pieeja ļauj ģenerēt miljoniem līdz miljardiem sekvencēšanas nolasījumu vienā sekvencēšanas reizē, ļaujot efektīvi un ātri noteikt DNS sekvences.
Kā darbojas ultraskaņas DNS sadrumstalotība?
Ultraskaņas apstrāde, kas pazīstama arī kā akustisko paraugu apstrāde, ir plaši izmantota metode DNS fragmentēšanai. Ultraskaņas DNS nobīdei paraugi tiek pakļauti ultraskaņas viļņiem kontrolētā stāvoklī. Ultraskaņas DNS sadrumstalotības darba princips ir balstīts uz ultraskaņas viļņu radītajām vibrācijām un kavitāciju. Bīdes spēki, kas rodas ultraskaņas (akustiskās) kavitācijas rezultātā, izjauc augstas molekulmasas DNS molekulas. Ultraskaņas iestatīšana, piemēram, intensitāte (amplitūda, ilgums), pulsācijas režīms un temperatūra, ļauj precīzi DNS fragmentēt līdz noteiktam vēlamajam DNS fragmentu garumam. Lai gan DNS bieži tiek samazināta līdz 100 līdz 600 bp, izmantojot ultrasonication, var iegūt ilgākus DNS fragmentus līdz 1300 bp, ja tiek izmantoti vieglāki ultraskaņas apstākļi.
Ultraskaņas DNS nobīde ChIP laikā – hromatīna imūnprecipitācija
Adaptēts no Jkwchui saskaņā ar CC-BY-SA.03
Temperatūras kontrole, lai novērstu DNS noārdīšanos
DNS divvirzienu molekulārā forma ir ļoti jutīga pret paaugstinātu temperatūru, tāpēc precīza temperatūras kontrole parauga sagatavošanas posmos ir izšķirošs faktors ticamiem analīzes rezultātiem.
Neatkarīgi no tā, vai izmantojat Hielscher zondes ultrasonikatorus, VialTweeter vai UIP400MTP – Nepārtraukta temperatūras uzraudzība un kontrole tiek nodrošināta, pateicoties pievienojamam temperatūras sensoram un viedierīces programmatūrai. Lai uzturētu temperatūru noteiktā diapazonā, varat iestatīt augšējo un apakšējo temperatūras robežu. Līdz ar to ultrasonikators apstāsies, tiklīdz šī temperatūras robeža tiks pārsniegta, un automātiski turpinās apstrādāt ar ultraskaņu, kad temperatūra ir pazeminājusies par iestatītu ∆T.
Hielscher ultrasonikatoru izsmalcinātā programmatūra nodrošina uzticamu ideālu paraugu apstrādes apstākļu uzturēšanu.
Masas parauga DNS fragmentācija ar UIP400MTP Multi-Well Plate Ultrasonicator
Paraugu skaits zinātnē par dzīvību pēdējo desmit gadu laikā ir ievērojami pieaudzis. Tas nozīmē, ka paraugu sagatavošanas un analīzes laikā konsekventi vienādos apstākļos jāapstrādā ļoti liels paraugu skaits (piemēram, 384, 1536 vai 3456 iedobes uz mikroplati), lai iegūtu salīdzināmus un derīgus rezultātus. Ar UIP400MTP Hielscher Ultrasonics seko masveida paraugu apstrādes tendencei. UIP400MTP ir ultrasonikators paraugu sagatavošanai, izmantojot mikroplates. UIP400MTP var apstrādāt plāksnes ar 6, 12, 24, 48, 96, 384, 1536 vai 3456 akām. Atkarībā no mikroplates veida katrā iedobē parasti var būt parauga tilpums no desmitiem nanolitru līdz vairākiem mililitriem. Plaši izmantots dzīvības zinātņu pētījumos, UIP400MTP ļoti bieži izmanto paraugu sagatavošanai pirms tādiem testiem kā ELISA (ar fermentiem saistīts imūnsorbcijas tests) vai PCR, pirms olbaltumvielu analīzes, kā arī hromatīna sagatavošanai pirms CHiP un CHiP-seq, histonu modifikācijas identifikācijai un citām analītiskām procedūrām (piemēram, gēla elektroforēze, masas spektrometrija).
Lasiet vairāk par PCR plākšņu augstas caurlaidspējas apstrādi!
VialTweeter parauga preparācijai līdz 10 flakoniem
VialTweeter ir plaši izmantots laboratorijas ultrasonicator VialTweeter, kas ļauj efektīvi un ērti apstrādāt ar ultraskaņu līdz 10 flakoniem vienlaicīgi. Tā kā flakoni un mēģenes (piemēram, Eppendorf flakoni, krio flakoni, centrifūgas mēģenes) netieši apstrādā ar ultraskaņu, tiek novērsta jebkāda savstarpēja kontaminācija. Tā kā katram paraugam tiek piegādāta tāda pati ultraskaņas intensitāte, visi ultraskaņas apstrādes rezultāti ir viendabīgi un reproducējami. VialTweeter piedāvā visas viedās funkcijas, tāpat kā citas mūsu digitālās ierīces (piemēram, viedo izvēlni, programmējamus iestatījumus, temperatūras kontroli, tālvadības pulti utt.), Lai nodrošinātu visaugstāko lietotāja komfortu.
Vairāku pirkstu zondes Microwell plāksnēm
Pieejams ultraskaņas zondes homogenizatoriem UP200Ht un UP200St, vairāku pirkstu zondes ar 4 vai 8 pirkstiem ir ērta iespēja vienlaikus apstrādāt vairākus paraugus vienādos apstākļos. Piemēram, sonotrode MTP-24-8-96 ir astoņu pirkstu zonde, kas ir ideāli piemērota integrācijai automatizētās sistēmās vai efektīvai vairāku urbumu plākšņu urbumu manuālai paraugu sagatavošanai. Vairāku pirkstu sonotrode ir ideāli piemērots automatizētām laboratorijām, kur galvenokārt tiek apstrādātas vārglāzes un mēģenes, izmantojot standarta ultraskaņas sonotrode. Vairāku pirkstu un standarta zondes dažu minūšu laikā var ātri mainīt, pārveidojot vienas zondes ultrasonikatoru par vairāku zondu ultraskaņas traucētāju.
Hielscher Ultrasonicators DNS sadrumstalotībai
Hielscher Ultrasonics piedāvā dažādas ultraskaņas platformas DNS, RNS un hromatīna sadrumstalotībai. Šīs dažādās platformas ietver ultraskaņas zondes (sonotrodes), netiešās ultraskaņas risinājumus vairāku cauruļu vai vairāku urbumu plākšņu vienlaicīgai paraugu sagatavošanai (piemēram, 96 urbumu plāksnes, mikrotitrēšanas plāksnes), sonoreaktori un ultraskaņas cuphorns. Visas DNS nobīdes platformas darbina frekvences noregulēti, augstas veiktspējas ultraskaņas procesori, kas ir precīzi kontrolējami un nodrošina reproducējamus rezultātus.
Ultraskaņas procesori jebkuram paraugu skaitam un lielumam
Ar Hielscher vairāku paraugu ultrasonikatoriem VialTweeter (līdz 10 mēģenēm) un UIP400MTP (mikroplatēm / multiwell plāksnēm) kļūst viegli iespējams samazināt paraugu apstrādes laiku, pateicoties intensīvai un precīzi kontrolējamai ultrasonikācijai, vienlaikus iegūstot vēlamo DNS fragmentu izmēru, sadalījumu un ražu. Ultraskaņas DNS sadrumstalotība padara paraugu sagatavošanu efektīvu, uzticamu un mērogojamu. Protokolus var lineāri mērogot no viena līdz daudziem paraugiem, izmantojot pastāvīgi kontrolētu ultraskaņu.
Zondes ultrasonatori ar vienu līdz pieciem pirkstiem ir ideāli piemēroti mazāku paraugu skaita sagatavošanai. Hielscher laboratorijas ultrasonikatori ir pieejami dažādos izmēros, lai mēs varētu ieteikt jums ideālu ierīci jūsu lietojumam un prasībām.
Precīza procesa kontrole
Precīzi kontrolējami ultraskaņas iestatījumi ir izšķiroši, jo pilnīga sonifikācija var iznīcināt DNS, RNS un hromatīnu, bet nepietiekama ultraskaņas nobīde rada pārāk garus DNS un hromatīna fragmentus. Hielscher digitālos ultrasonikatorus var viegli iestatīt uz precīzu ultraskaņas parametru. Konkrētus ultraskaņas iestatījumus var saglabāt arī kā ieprogrammētu iestatījumu, lai ātri atkārtotu to pašu procedūru.
Visas ultraskaņas apstrāde tiek automātiski protokolēta un saglabāta kā CSV fails iebūvētajā SD kartē. Tas ļauj precīzi dokumentēt veiktos izmēģinājumus un ļauj viegli pārskatīt ultraskaņas braucienus.
Izmantojot pārlūka tālvadības pulti, visus digitālos ultrasonatorus var darbināt un uzraudzīt, izmantojot jebkuru standarta pārlūkprogrammu. Papildu programmatūras instalēšana nav nepieciešama, jo LAN savienojums ļauj veikt ļoti vienkāršu plug-n-play iestatīšanu.
Augstākā lietotājdraudzīgums ultraskaņas paraugu sagatavošanā
Visi Hielscher ultrasonikatori ir paredzēti, lai nodrošinātu augstas veiktspējas ultraskaņu, tajā pašā laikā vienmēr ir ļoti lietotājam draudzīgi un viegli lietojami. Visi iestatījumi ir labi strukturēti skaidrā izvēlnē, kurai var viegli piekļūt, izmantojot krāsainu skārienekrānu vai pārlūkprogrammas tālvadības pulti. Viedā programmatūra ar programmējamiem iestatījumiem un automātisku datu ierakstīšanu nodrošina optimālus ultraskaņas iestatījumus, lai iegūtu uzticamus un reproducējamus rezultātus. Tīrs un viegli lietojams izvēlnes interfeiss pārvērš Hielscher ultrasonikatorus par lietotājam draudzīgām un efektīvām ierīcēm.
Zemāk redzamajā tabulā ir sniegta norāde par mūsu laboratorijas ultrasonikatoru aptuveno apstrādes jaudu, kas ir ideāli piemēroti paraugu sagatavošanas uzdevumiem, piemēram, DNS un RNS sadrumstalotībai, šūnu līzei, kā arī olbaltumvielu ekstrakcijai:
| Ierīce | Jauda [W] | Tips | Tilpums [ml] |
|---|---|---|---|
| UIP400MTP | 400 | mikroplatēm | 6 – 3456 akas | VialTweeter | 200 | līdz 10 flakoniem un iespīlējama iespēja | 0.5 – 1.5 |
| UP50H | 50 | zondes tipa | 0.01 – 250 |
| UP100H | 100 | zondes tipa | 0.01 – 500 |
| UP200Ht | 200 | zondes tipa | 0.1 – 1000 |
| UP200St | 200 | zondes tipa | 0.1 – 1000 |
| UP400St | 400 | zondes tipa | 5.0 – 2000 |
| Cuphorn | 200 | CupHorn, sonoreaktors | 10 – 200 |
| GDmini2 | 200 | no piesārņojuma brīvas plūsmas šūna |
Sazinieties ar mums! / Jautājiet mums!
Ultraskaņas vairāku paraugu sagatavošanas vienība VialTweeter ļauj vienlaicīgi apstrādāt ar ultraskaņu līdz 10 flakoniem. Izmantojot piestiprināmo ierīci VialPress, līdz 4 papildu caurulēm var nospiest uz priekšu, lai intensīvi apstrādātu ultraskaņu.
Sonotrode MTP-24-8-96 ir astoņas ultraskaņas zondes mikrotitru plākšņu aku apstrādei ar ultraskaņu.
Literatūra / Atsauces
- Qiyun Liang, Christoph Ratzke (2025): Lysing diverse bacteria with the Hielscher UIP400MTP for DNA sequencing. Protocol Uni Tübingen 2025.
- Poptsova, M., Il’icheva, I., Nechipurenko, D. et al. (2014): Non-random DNA fragmentation in next-generation sequencing. Scientific Reports 4, 4532; 2014.
- Basselet P., Wegrzyn G., Enfors S.-O., Gabig-Ciminska M. (2008): Sample processing for DNA chip array-based analysis of enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC). Microbial Cell Factories 7:29. 2008.
- Doublier S., Riganti Ch., Voena C., Costamagna C., Aldieri E., Pescarmona G., Ghigo D., Bosia A. (008): RhoA Silencing Reverts the Resistance to Doxorubicin in Human Colon Cancer Cells. Molecular Cancer Research 6(10), 2008.
- Fredlund E., Gidlund A., Olsen M., Börjesson T., Spliid N.H.H., Simonsson M. (2008): Method evaluation of Fusarium DNA extraction from mycelia and wheat for down-stream real-time PCR quantification and correlation to mycotoxin levels. Journal of Microbiological Methods 2008.
- Fritsche C., Sitz M., Weiland N., Breitling R., Pohl H.-D. (2007): Characterization of the growth behavior of Leishmania tarentolae – a new expression system for recombinant proteins. Journal of Basic Microbiology 47, 2007. 384–393.
- Ristola M., Arpiainen S., Saleem M. A., Mathieson P. W., Welsh G. I., Lehtonen S., Holthöfer H. (2009): Regulation of Neph3 gene in podocytes – key roles of transcription factors NF-κB and Sp1. BMC Molecular Biology 10:83, 2009.
- Rodriguez J., Vives L., Jorda M., Morales C., Munoz M., Vendrell E., Peinado M. A. (2008): Genome-wide tracking of unmethylated DNA Alu repeats in normal and cancer cells. Nucleic Acids Research Vol. 36, No. 3, 2008. 770-784.
- Weiske J. Huber O. (2006): The Histidine Triad Protein Hint1 Triggers Apoptosis Independent of Its Enzymatic Activity. The Journal of Biological chemistry. Vol. 281, No. 37, 2006. 27356–27366.
Fakti, kurus ir vērts zināt
Kas ir nākamās paaudzes sekvencēšana?
Nākamās paaudzes sekvencēšana, arī Next Gen sekvencēšana (NGS), augstas caurlaidspējas sekvencēšana vai otrās paaudzes sekvencēšana, attiecas uz masveida paralēlas sekvencēšanas pieeju, kur ļoti liels (milzīgs) DNS daudzums no miljoniem fragmentu tiek sekvencēts vienlaicīgi paralēli vienā reizē.
Lai veiktu nākamās paaudzes sekvencēšanu, trīs galvenie soļi
- bibliotēku sagatavošana,
- darbību secību un
- Datu analīze
ir nepieciešami.
Bibliotēkas sagatavošanas laikā DNS pavedieniem jābūt fragmentētiem noteikta garuma DNS fragmentos. Ultraskaņas apstrāde ir viena no vēlamajām metodēm DNS fragmentēšanai.
DNS sekvencēšanas procesā nukleotīdu secība DNS – pazīstams kā nukleīnskābju secība – tiek noteikts. Nukleīnskābju secību veido četras nukleotīdu bāzes – adenīns, citozīns, guanīns, timīns – kurš informācijas kods.
Nākamās paaudzes sekvencēšana veicina pētījumus dzīvības zinātnē un personalizētajā medicīnā, jo DNS un RNS sekvencēšana tiek plaši izmantota genoma pētniecībā, vēža pētniecībā, retu un sarežģītu slimību pētniecībā, mikrobu pētniecībā, agrigenomikā un daudzās citās pētniecības jomās.
Nākamās paaudzes sekvencēšana un Sangera sekvencēšana
Lai gan ar nākamās paaudzes sekvencēšanu (NGS) ir iespējams sekvencēt milzīgu skaitu genoma paraugu, Sanger sekvencēšana (pazīstama arī kā ķēdes izbeigšanas metode vai pirmās paaudzes sekvencēšana) spēj sekvencēt nelielus paraugu skaitus. Sangera sekvencēšana vienlaikus sekvencē tikai vienu DNS fragmentu, un to var paveikt vienā dienā. Pateicoties precizitātei, Sanger sekvencēšana tiek uzskatīta arī par zelta standarta tehnoloģiju, ko izmanto, lai pārbaudītu rezultātus, kas iegūti, izmantojot nākamās paaudzes sekvencēšanu.
Sangera sekvencēšana sasniedz nolasīšanas garumu aptuveni 800bp (parasti 500-600bp ar nebagātinātu DNS). Garākas lasīšanas garumi Sangera sekvencēšanā uzrāda ievērojamas priekšrocības salīdzinājumā ar citām sekvencēšanas metodēm, jo īpaši attiecībā uz genoma atkārtoto reģionu sekvencēšanu. Īsas lasīšanas sekvences datu problēma ir īpaši aktuāla, sekvencējot jaunus genomus (de novo) un sekvencējot ļoti pārkārtotus genoma segmentus, parasti tos, kas novēroti vēža genomos vai hromosomu reģionos, kuriem ir strukturālas variācijas. [cp. Morozova un Marra, 2008]
DNS – Dezoksiribonukleīnskābe – Tās formas un funkcijas
Katrai DNS formai ir unikālas īpašības un pielietojumi, kas veicina plašu pētniecības jomu spektru, tostarp onkoloģiju, ģenētiku, kriminālistiku un evolucionāro bioloģiju. Hielscher ultraskaņas apstrādātāji ir ļoti efektīvs un uzticams risinājums, lai izolētu un sadrumstalotu DNS un RNS jūsu analīzes nolūkos. Zemāk esošajā sarakstā mēs izskaidrojam jums īpašās DNS formas un kategorizējam tās, pamatojoties uz to bioloģisko kontekstu un funkcijām:
- Genoma DNS (gDNS)
Genoma DNS (gDNS): Pilns DNS komplekts organismā, ieskaitot gan kodējošos (gēnus), gan nekodējošos reģionus. - Ekstracelulārā DNS
Cirkulējošā audzēja DNS (ctDNS): DNS fragmenti, ko audzēja šūnas izdala asinsritē.
DNS bez šūnām (cfDNS): DNS fragmenti, kas atrasti brīvi cirkulē asinsritē un kuru izcelsme ir dažādi audi. - Ekstrahromosomu cirkulārā DNS (eccDNS): Cirkulārās DNS molekulas, kas atrodamas ārpus hromosomām eikariotu šūnās.
Vīrusu DNS: DNS, kas iegūta no vīrusiem, vai nu integrēta saimniekorganisma genomā, vai kā episomāla DNS. - mitohondriju DNS
Mitohondriju DNS (mtDNS): DNS, kas atrodas mitohondrijos, mantojusi māti un iesaistīta enerģijas ražošanā. - plazmīdu DNS
Plazmīdu DNS: Mazas, cirkulāras DNS molekulas, kas replicējas neatkarīgi no hromosomu DNS, parasti atrodamas baktērijās un tiek izmantotas gēnu inženierijā. - kodola DNS
Kodola DNS (nDNS): DNS, kas atrodas eikariotu šūnu kodolā un kas veido lielāko daļu organisma ģenētiskā materiāla. - Vienšūnas DNS
Vienšūnas DNS (scDNS): DNS, kas ekstrahēta no vienas šūnas, ko izmanto detalizētai genoma analīzei atsevišķu šūnu līmenī. - Rekombinantā DNS
Rekombinantā DNS (rDNS): DNS molekulas, kas veidotas ar ģenētiskās rekombinācijas laboratorijas metodēm, lai apvienotu ģenētisko materiālu no vairākiem avotiem. - Specializētās veidlapas
Vides DNS (eDNS): DNS, kas iegūta no vides paraugiem (augsnes, ūdens), neizolējot avota organismus
Senā DNS (aDNS): DNS, kas iegūta no seniem īpatņiem, sniedzot ieskatu evolucionārajā bioloģijā un senajās populācijās. - Hromosomu DNS
Hromosomu DNS: DNS, kas veido hromosomas šūnas kodolā, aptverot gan kodējošos, gan nekodējošos reģionus. - Vīrusu un sintētiskās formas
Vīrusu DNS: DNS, kas iegūta no vīrusiem, kurus var vai nu integrēt saimniekorganisma genomos, vai arī pastāvēt kā neatkarīgas vienības.
Sintētiskā DNS: Mākslīgi sintezētas DNS sekvences, kas izveidotas ķīmiskos procesos, ko bieži izmanto pētniecībā un biotehnoloģijā.
Hielscher Ultrasonics ražo augstas veiktspējas ultraskaņas homogenizatorus no Lab līdz rūpnieciskais izmērs.