Extrazellulär Matrix Extraktioun mam 96-Well Sonicator UIP400MTP
Traditionell Extracellular Matrix (EM) Extraktiounsmethoden enthalen dacks verschidde Schrëtt fir d'Biofilm Matrix ze stéieren. Wéi och ëmmer, dës Technike kënnen ze laang an onkonsequent sinn, wat zu Verännerlechkeet an de Resultater féiert. Mat dem 96-Well Platte-Sonicator UIP400MTP gëtt den EM-Extraktiounsprozess wesentlech erliichtert, déi héich effizient, präzis an eenheetlech Biofilm-Stéierung an High-Throughput-Formater ubitt. D'UIP400MTP benotzt fokusséiert Ultraschall fir kontrolléiert Kavitatioun ze generéieren, effektiv d'Biofilm Matrix ofbriechen, während d'Viabilitéit an d'Integritéit vu Biofilm-embedded Zellen erhalen. D'Benotzung vum UIP400MTP verbessert d'Reproduzibilitéit an d'Genauegkeet vun Downstream Assays, sou wéi metabolomesch a proteomesch Analysen, Viabilitéitstester, an antimikrobieller Empfindlechkeetsstudien. Duerch d'Em-Extraktioun ze streamlinéieren, erméiglecht d'UIP400MTP d'Fuerscher fir konsequent a qualitativ héichwäerteg Resultater z'erreechen, déi méi déif Abléck an d'Biofilmdynamik an d'Interaktioune mat externen Agenten ubidden.
Extrazellulär Matrix Extraktioun
Déi extrazellulär Matrix (EM) ass e kritesche Bestanddeel vu Biofilme geformt vu Mikroorganismen wéi Candida albicans. Komponéiert aus Polysacchariden, Proteinen, Lipiden an extrazellulärer DNA, stellt d'EM strukturell Integritéit, vermëttelt Adhäsioun op Surfaces a dréit bedeitend zur antimikrobieller Resistenz bäi. Den EM extrahéieren an analyséieren ass wesentlech fir d'Biofilmbiologie ze verstoen, Mechanismen vun der Drogenresistenz z'erklären an nei therapeutesch Ziler z'identifizéieren.
Protokoll fir extrazellulär Matrix (EM) Extraktioun vu Candida albicans Biofilme mat UIP400MTP
Dëse Protokoll konzentréiert sech op d'Extraktioun vun der extrazellulärer Matrix (EM) vu statesche Candida albicans Biofilmen. D'Integratioun vum UIP400MTP Sonicator fir traditionell Schrauwen oder Enzym-baséiert Schrëtt ze ersetzen fir verbessert Effizienz a Reproduktioun.
Material néideg
Schrëtt-vun-Schrëtt Instruktioune fir EM Extraktioun
- Bildung vu statesche Biofilm
Fir statesch Biofilmer, inokuléiert C. albicans an de Wells vun enger 96-Well Plack mat RPMI-1640 Medium. All Well soll e konsequent Volumen vun Inokulum enthalen (zB 200 μL pro Well).
Inkubéiert d'Plack bei 37 ° C ënner statesche Bedéngungen fir 24 Stonnen fir Biofilmbildung op de Wellflächen z'erméiglechen. - Biofilm Virbereedung fir Extraktioun
No der Inkubatioun, aspiréiert sanft a werfen dat verbrauchte Medium aus all Brunn ouni de Biofilm ze stéieren.
Spült all gutt suergfälteg mat sterile PBS (zB 200 µL) fir locker befestegt Zellen a planktonesch Debris ze entfernen. Widderhuelen dëse Schrëtt zweemol.
Füügt frësche PBS oder den Extraktiounsbuffer (zB 200 μL) an all Brunn fir op d'Sonicatioun ze preparéieren. - Sonication mat UIP400MTP
Setzt d'96-Well Plack mat PBS oder Extraktiounsbuffer an den UIP400MTP Sonicator Schacht. Fir d'Multi-Well Plack richteg ze placéieren, befollegt d'Instruktioune vum Handbuch.
Sonicate fir 5-6 Minutten an engem sanfte Kader (60% Amplitude, Pulsmodus), garantéiert eenheetlech Stéierung vun der Biofilmstruktur a Verëffentlechung vun EM Komponenten.
Benotzt d'Temperaturkontrolle vum UIP400MTP Sonicator (Temperatursensor an Astellungen) fir exzessiv Heizung oder Probeschued ze vermeiden. - Cation Exchange Resin (CER) Behandlung
Transfert déi sonikéiert Flëssegkeet vun all Brunn op eng nei 96-Well Plack.
Füügt en zweefalt Volumen vun der CER Suspensioun (virbereet a PBS oder Puffer) an all Well (zB 400 µL Gesamtvolumen pro Brunn).
Versiegelt d'Plack an inkubéiert se op engem Plack Shaker oder Rotator bei 400 rpm fir 3 Stonnen fir Bindung an Isolatioun vun EM Komponenten z'erméiglechen. - Trennung a Filtratioun
Zentrifuge d'Plack bei 2.000 × g fir 10 Minutten fir d'Harz an d'Zellen aus dem Supernatant ze trennen.
Iwwerdroe virsiichteg den EM-haltege Supernatant vun all Brunn op eng nei 96-Well Plack.
Filter den Supernatant duerch en 0,22 µm Filter mat engem Plattebaséierte Vakuum Manifold System oder gläichwäerteg fir e propperen EM Extrait ze kréien. - Analyse vun EM
Benotzt Techniken wéi UPLC-Q-TOF-MS fir ongeziilt Metabolitprofiléierung, oder benotzt spezifesch Assays (zB BCA fir Proteinen, Triglyceriden a Kohlenhydratquantifikatiounskits) fir EM Komponenten ze charakteriséieren.
High-Throughput Extracellular Matrix Extraction
Déi héich Effizienz vun der extrazellulärer Matrix (EM) Extraktioun mam UIP400MTP Sonicator huet d'Probepräparatioun fir Assays revolutionéiert, déi präzis Analyse vu Biofilmeigenschaften erfuerderen. D'UIP400MTP benotzt Ultraschallwellen fir präzis an eenheetlech d'Biofilm Matrix ze stéieren, déi effektiv Verëffentlechung vun EM Komponenten erméiglechen, während d'Zellliewensfäegkeet an d'Integritéit behalen. Dës Approche verbessert wesentlech d'Zouverlässegkeet vun Assays wéi Biofilm Viabilitéitstester, proteomesch a metabolomesch Studien, an antimikrobieller Empfindlechkeet Bewäertungen.
Fir Biofilm Erhuelung Assays, wéi Kolonie-forméierend Eenheet (CFU) zielen, EM Extraktioun mat der UIP400MTP suergt unobstructed Zougang vun Reagenz zu biofilm-embedded Zellen. Ähnlech profitéiere proteomesch a metabolomesch Analysen, wéi UPLC-Q-TOF-MS, vun der High-Yield Isolatioun vu Proteinen, Lipiden a Metaboliten. D'UIP400MTP ënnerstëtzt och präzis antimikrobiell Empfindlechkeetstest, wat et erméiglecht eng korrekt Bestëmmung vu Biofilm MIC a MBEC Wäerter. Ausserdeem hëlleft déi effizient Extraktioun erliichtert vun der UIP400MTP bei Enzymaktivitéitsassays, Komponentquantifikatioun a strukturell Studien, bitt wäertvoll Abléck an d'Roll vun extrazelluläre Matrixen an der Biofilmarchitektur, Adhäsioun a Resistenzmechanismen.
Dës High-Throughput, reproduzéierbar Extraktiounsmethod optiméiert EM Virbereedung, garantéiert super Resultater iwwer eng Rei vu Biofilm-relatéierten Assays.
High-Throughput EM Extraktioun mat der 96-Well Placke sonicator UIP400MTP
Literatur / Referenzen
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Oft gestallten Froen
Wat ass den Zweck vun der extrazellulärer Matrix?
Déi extrazellulär Matrix (EM oder ECM) bitt strukturell Ënnerstëtzung fir Zellen, reguléiert interzellulär Kommunikatioun an beaflosst d'Zellverhalen.
Wat mécht extrazellulär Matrix fir Tissue?
Fir Tissue déngt den EM als Steigerung deen strukturell Integritéit behält, mechanesch Widderstandsfäegkeet erliichtert, a biochemesch Signaliséierung vermëttelt fir Prozesser wéi Wuesstum, Differenzéierung a Reparatur ze regléieren.
Wat ass extrazellulär Matrix Adhäsioun?
Extrazellulär Matrix Adhäsioun bezitt sech op d'Interaktioun tëscht Zellen an der EM, haaptsächlech vermëttelt duerch Zellfläch Adhäsiounsmoleküle wéi Integrinen, wat Zellverankerung, Signaltransduktioun a Migratioun erméiglecht.
Firwat gëtt d'extrazellulär Matrix extrahéiert fir Assays?
EM gëtt extrahéiert fir Assays fir seng Zesummesetzung ze studéieren, seng Roll an celluläre Prozesser ze verstoen an hiren Afloss op d'Krankheetsprogressioun z'ënnersichen, dorënner Biofilmbildung an antimikrobial Resistenz.
Wat sinn allgemeng Extraktiounsprozeduren fir extrazellulär Matrix?
Gemeinsam Extraktiounsprozeduren enthalen physesch Methoden wéi Ultraschall, chemesch Behandlungen mat Detergenten oder Salzer, an enzymatesch Verdauung fir EM Komponenten ze isoléieren wärend hir Integritéit behalen.
Wat ass Decellularized Extracellular Matrix (dECM)?
Decellulariséierter extrazellulärer Matrix (dECM) gëtt kritt andeems se cellulärt Material aus Stoffer entfernt, wärend d'EM strukturell a biochemesch Eegeschafte behalen. Et gëtt an der regenerativer Medizin als Stee fir Tissuetechnik an Zellkultur benotzt.
Liest méi iwwer ultraschall-ënnerstëtzt Dezellulariséierung vun der extrazellulärer Matrix!
Hielscher Ultrasonics fabrizéiert High-Performance Ultrasonic Homogenisatoren aus Labo zu industriell Gréisst.


