Ultraheli peptiidisüntees TAGGING-tehnika abil
Peptiidisüntees on farmaatsia teadus- ja arendustegevuse (R+D) nurgakivi, kuid tavapärased meetodid – tahkefaasiline peptiidisüntees (SPPS) ja klassikaline lahusefaasiline kuplemine – on endiselt töömahukad, reagentide osas raiskavad ja raskesti skaleeritavad. Tõhusama alternatiivina on esile kerkinud kahe ortogonaalse strateegia kombinatsioon: TAGGING (ajutise ankurdusrühma) tehnika lahusefaasilise peptiidide kokkupanemise jaoks ning ultraheli (sonokeemiline) töötlus kuplemis-, kaitserühma eemaldamise ja töötlusetappide kiirendamiseks. Koos võimaldavad need toota terapeutilisi peptiide – näiteks antibakteriaalset/vähivastast lipopeptiidi lipobaktiini – grammi- kuni suurtootmismahus, saavutades kõrge puhtuse, väiksema puhastuskoormuse ja oluliselt vähem käsitsi tehtavaid operatsioone.
Millised eelised on ultraheli peptiidsünteesil?
- Lahusefaasi majanduslikkus: Reaktsioonid kulgevad lahuses ning aminohappe kulu on oluliselt väiksem kui tahkefaasilises peptiidsünteesis
- Filtreerimisel põhinev puhastamine: TAG-iga seotud peptiid sadeneb polaarsetes lahustites, mistõttu vaheühendid eraldatakse lihtsa filtreerimisega – kolonnkromatograafiat ega iga etapi iseloomustamist ei ole vaja.
- Suur tööjõusääst: Vaheühendite puhastamise ja spektraalkontrollide ärajätmine säästab kogu sünteesikampaania jooksul märkimisväärselt inimtunde.
- Sonokeemiline kiirendamine: Ultraheli töötlus (sonikeerimine) lühendab iga kriitilist etappi – Fmoc-rühma eemaldamist, külgahela kuplemist, tsükliseerimist ja globaalset kaitserühmade eemaldamist – selektiivsust kahjustamata.
- Kõrge saagis, kõrge puhtus: Iga fragmendi kuplemine ja lõplik lipobaktiini kokkupanek kulgevad kõrge saagisega; globaalne kaitserühmade eemaldamine annab sihtühendi saagisega ~83 %.
- Valmisolek suurtootmiseks: TAGGING-tehnikat kirjeldatakse selgesõnaliselt kui meetodit, mis võimaldab peptiide suures mahus valmistada ülima puhtusega, muutes selle praktiliseks teeks terapeutiliselt oluliste lipopeptiidide grammi- ja kilogrammikoguste saamiseks.
- Täielik meetodite ühilduvus: See lähenemine on täielikult ühilduv tavapärase SPPS-i ja lahusefaasilise keemiaga, mistõttu olemasolevad kaitserühmade strateegiad (Fmoc, Alloc, Pbf, tBu) ja kuplemisreagendid (T3P, HATU, COMU, DIC/DMAP) kehtivad muutumatul kujul.
Rääkige meile oma peptiidisünteesi protsessi väljakutsetest. Meie ultraheli töötluse eksperdid soovitavad teile teie peptiidide tootmiseesmärkidele ideaalset sonikaatori konfiguratsiooni!
Tööstuslik sonikaator UIP2000hdT koos farmaatsia-partiireaktoriga täiustatud peptiidsünteesiks
Mis on TAGGING-tehnika?
TAG-lähenemises ankurdatakse peptiidifragment kovalentselt eemaldatava vaigutaolise ankurrühma (TAG) külge, mis jääb lahusesse. See võimaldab kasvavat ahelat käsitseda nagu tahkefaasilist peptiidi, kuid vedelfaasis:
- Pärast iga kuplemist või kaitserühma eemaldamist saadakse TAG-iga seotud peptiid tahke ainena kätte lihtsa filtreerimise või sadestamise teel polaarses/antilahusti keskkonnas, samal ajal kui lahustuvad lisandid ja kõrvalsaadused pestakse välja.
- Kuna peptiid jääb linkeri külge seotuks, on kolonnkromatograafia ja iga vaheühendi täielik iseloomustamine suures osas välistatud, mis säästab märkimisväärselt aega ja inimtööd.
- Reaktsioone saab läbi viia lahusefaasis, kasutades palju vähem aminohapet kui SPPS-is, ning lõppsaadus vabastatakse TAG-rühma lõhustamisega sünteesi lõpu lähedal.
Lipobaktiini puhul kasutati retrosünteesis kolme fragmenti – Fmoc-Ala-Arg-TAG, Alloc-Thr(Ile-Fmoc)-OH ja lipiidifragment C₁₁H₂₃CONH-Ile-Ser(OᵗBu)-OH –, mis kuplati fragmentide kondensatsiooni strateegia abil, et saada pikk peptiid väga kõrge saagisega. (vrd Ramya et al., 2025)
TAG-abil läbi viidud lipobaktiini peptiidi täissünteesi kiirendab ultraheli töötlus (sonikeerimine).
(Uuring: Ramya et al., 2025)
Kuidas ultraheli töötlus parandab peptiidide lahusefaasilist sünteesi
Ultraheli töötlust kasutatakse lahusefaasi võtmeetappide intensiivistamiseks ja lühendamiseks. Ramya et al. (2025) kirjeldatud lipobaktiini sünteesis rakendatakse sonikeerimist järgmistel etappidel:
Kuna TAG-keemia annab vaheühendid juba filtreeritavate tahkete ainetena, täiendavad ultraheli töötlus ja TAGGING teineteist: ultraheli kiirendab massiülekannet, segunemist ja reaktsioonikineetikat, samal ajal kui ankur hoiab peptiidi taaskasutatava tahke ainena puhta ja kromatograafiavaese töövoo jaoks.
Sonikaator UP200St: ultrahelisegamisega reaktor kiirendatud peptiidsünteesiks.
Kõrge puhtusastmega peptiidide lihtne skaleerimine ultraheli töötlusega
Sage väljakutse peptiidi- ja peptiidravimiprotsesside viimisel laborist tootmisse on sonokeemilise efekti säilitamine suuremate mahtude ja pideva vooluhulga korral. Hielscher lahendab selle pideva ultraheliprotsessorite valikuga laborist täismahulise tööstusliku skaalani, pakkudes valideeritud, reprodutseeritavat võimsust ja dokumenteeritud protsessijuhtimist.
Tööstuslik sonikaator UIP4000hdT (4000W, 20kHz) ultraheliga tõhustatud peptiidsünteesiks
Korduma kippuvad küsimused ultraheliga toetatud TAG-peptiidsünteesi kohta
Mis on vedelfaasiline peptiidsüntees (LPPS)?
Vedelfaasiline peptiidsüntees (LPPS) on meetod peptiidide sammhaaval ehitamiseks lahuses klassikaliste orgaanilise keemia vahendite abil. See on üks neljast peamisest peptiidide valmistamise meetodist ning on tuntud kulutõhususe, skaleeritavuse ja selle poolest, et on peptiidisünteesi lähenemistest kõige keskkonnasõbralikum. See sobib eriti hästi lühemate peptiidide jaoks, kuigi pikemate järjestuste puhul võib esineda raskusi, mis tulenevad ühtlaste reaktsioonide säilitamise, lahustuvuse ja soovimatute kõrvalproduktide eemaldamise keerukusest.
Kuidas ultraheli parandab vedelfaasilist peptiidsünteesi?
Ultraheli (sonikeerimine) parandab LPPS-i, kiirendades nii sidumis- kui ka kaitse eemaldamise etappe. Ultraheli lained parandavad massiülekannet ja reaktsioonikineetikat, mis viib järgmiseni:
- Lühemad reaktsiooniajad: sidumis- ja kaitse eemaldamise tsükleid on võimalik oluliselt lühendada
- Suuremad saagised: täielikum muundumine igal etapil
- Parem toorprodukti puhtus: vähem mittetäieliku sidumise kõrvalsaadusi
- Väiksem reagentide tarbimine: kiiremate ja tõhusamate reaktsioonide tõttu on vaja vähem ekvivalente sidumisreagente ja aminohappeid
Mis on TAG-toetatud peptiidsüntees (TAPS)?
TAG-toetatud peptiidsüntees (Tag-Assisted Peptide Synthesis, TAPS) on vedelfaasilise peptiidsünteesi erijuht, kus peptiide ehitatakse sammhaaval lahuses, kasutades tahke kandja asemel lahustuvaid orgaanilisi märgiseid. Need märgised, mis on analoogsed SPPS-i tahkete kandjatega, lihtsustavad isoleerimist pärast iga sünteesietappi, võimaldades eraldamist sadestamise, filtreerimise või ekstraheerimise teel. Märgised peavad lahustuma orgaanilistes lahustites, jäädes samal ajal teistest materjalidest eristatavaks.
Kuidas ultraheli parandab TAGGING-protsessi?
Kui ultraheli töötlust kombineeritakse TAG-abistatud sünteesiga, on eeliseid järgmised:
- Kiiremad sidumis- ja kaitsegrupi eemaldamise tsüklid – ultraheli kiirendab lahusefaasi reaktsioone, lühendades ühele sammule kuluvat aega
- Parem lahustuvus ja massiülekanne – ultraheli kavitatsioon aitab säilitada märgisega peptiidi homogeensust lahuses, mis on kriitilise tähtsusega, kuna lahustuvus on TAPS-i peamine eelis SPPS-i ees
- Väiksem reagentide kasutus – suurem reaktsioonide efektiivsus tähendab, et aminohappeid ja sidumisreagente on vaja vähem ekvivalente
- Täielikumad reaktsioonid – vähem mittetäieliku sidumise kõrvalsaadusi, mis toob kaasa suurema toorproduktide puhtuse ja lihtsustatud järgneva puhastamise
Tähelepanuväärne näide on lipobaktiini TAG-abistatud ja ultraheli töötlusega vahendatud totaalssüntees, mis näitas, et TAGGING-tehnika sobib täielikult kokku lahusefaasi meetoditega ning et ultraheli töötlus vahendab kõrgeid saagiseid kõigis etappides. (vt Ramya et al., 2025)
Millise pikkusega peptiide on ultraheliabistatud TAPS-iga võimalik saada?
Lühikesed kuni keskmise pikkusega peptiidid (~5–20 jääki) on optimaalne vahemik, kus TAPS tagab kõrge puhtuse ja usaldusväärsed tulemused.
Pikemaid peptiide on võimalik saada fragmentide kondensatsiooni strateegia abil: väiksemad fragmendid (6–10-meerid) sünteesitakse märgisel ja seejärel seotakse kokku, et ehitada üles täispikk sihtmolekul.
Väga pikkade või keerukate sihtmolekulide puhul võib kasutada hübriidset SPPS/TAPS-lähenemist.
Uurige, kuidas ultraheli töötlus parandas tahkefaasilist peptiidsünteesi (SPPS)!
Kas ultraheliabistatud vedelfaasilist peptiidsünteesi saab skaleerida tööstuslikuks tootmiseks?
Jah, tööstuslikke sonikaatoreid – näiteks Hielscheri mudeleid UIP2000hdT või UIP4000hdT – saab integreerida partiireaktoritesse ja läbivoolukambritesse, mis võimaldab suuremahulist peptiidide tootmist. Olemasolevatesse reaktoritesse järelpaigaldamine võimaldab täiustada väljakujunenud peptiidsünteesi protsesse.
Millised on ultraheliabistatud LPPS-i peamised eelised tavapärase LPPS-iga võrreldes?
- Kiirus: reaktsiooniajad lühenevad iga sidumis- ja kaitsegrupi eemaldamise sammu juures drastiliselt.
- Efektiivsus: suuremad saagised sammu kohta toovad mitme jäägiga peptiidide puhul kaasa suurema üldsaagise.
- Jätkusuutlikkus: vähem reagentide ekvivalente ja potentsiaalselt vähem lahustit tänu kiiremetele reaktsioonidele.
- Kättesaadavus: nõuab ainult tavalist ultrahelivanni, spetsiaalseid seadmeid ei ole vaja.
- Ühilduvus: töötab tavapäraste sidumisreagentide (DIC, HATU, TBTU, Oksüma jne) ja kaitsegruppide strateegiatega (Boc, Fmoc).
Kirjandus / viited
- M. Ramya, Veeranjaneyulu Avula, S. Nandeesh, B. Kirankumar, G. Nagendra (2025): TAG assisted and ultrasonication mediated total synthesis of lipobactin. Results in Chemistry, Volume 18, 2025, 102842.
- Andrew M. Bray; Liana M. Lagniton; Robert M. Valerio; N.Joe Maeji (1994): Sonication-assisted cleavage of hydrophobic peptides. Application in multipin peptide synthesis. Tetrahedron Letters 35(48), 1994. 9079–9082.
- Raheem, Shvan J; Schmidt, Benjamin W; Solomon, Viswas Raja; Salih, Akam K; Price, Eric W (2020): Ultrasonic-Assisted Solid-Phase Peptide Synthesis of DOTA-TATE and DOTA-linker-TATE Derivatives as a Simple and Low-Cost Method for the Facile Synthesis of Chelator-Peptide Conjugates. ACS Bioconjugate Chemistry, 2020.
- M.V. Anuradha, B. Ravindranath (1995): Ultrasound in peptide synthesis. 4: Rapid cleavage of polymer-bound protected peptides by alkali and alkanolamines. Tetrahedron Volume 51, Issue 19, 1995. 5675-5680.
Ultraheli CupHorn suletud katseklaaside ja viaalide intensiivseks sonikeerimiseks steriilse peptiidi ultraheli töötluse jaoks.
Hielscher Ultrasonics toodab suure jõudlusega ultraheli homogenisaatoreid alates laborist kuni tööstusliku suuruseni.
