Metabolomik lettet af sonikering med høj prøvekapacitet

Metabolomik er det forskningsområde, der anvender teknikker med høj prøvekapacitet til at karakterisere og kvantificere små molekyler i forskellige biologiske væsker såsom urin, serum, plasma, fæces og spyt og derved afdækker unikke metaboliske signaturer. Ultralydsapparatet UIP400MTP med høj prøvekapacitet, der er udviklet til flerbrøndsplader, er et effektivt værktøj til at lysere celler i disse prøver og dermed lette frigivelsen af metabolitter til efterfølgende analyse. Denne præcise og pålidelige tilgang er afgørende for metabolomik, hvor nøjagtigt studiedesign, omhyggelig prøveforberedelse, optimeret platformopsætning, omfattende dataanalyse og meningsfuld biologisk fortolkning er af største betydning. Metabolomik anvender både målrettede tilgange, som fokuserer på specifikke klasser af molekyler såsom kulhydrater, lipider og aminosyrer, og ikke-målrettede teknikker, som giver et bredt overblik over de metaboliske profiler i en prøve og afslører den indviklede kompleksitet i metabolisk signalering.

Prøveforberedelse med høj prøvekapacitet med ultralydsapparatet UIP400MTP til 96-brøndsplader

Brug af det berøringsfri ultralydsapparat UIP400MTP i kombination med 96-brøndsplader er en effektiv metode til homogenisering og metabolitekstraktion med høj prøvekapacitet. Denne opsætning undgår direkte kontakt med prøven og reducerer dermed risikoen for krydskontaminering, mens flere prøver behandles samtidigt.

Trinvis protokol til homogenisering med ultralydsapparatet UIP400MTP til 96-brøndsplader

1. Forberedelse af metabolomiske prøver
   Placering af prøver: Fordel hver prøve (f.eks. fæces, tarmvæv eller indhold fra tarmlumen) i individuelle brønde i en 96-brøndsplade eller mikroplade.
   Opløsningsmiddel: Organiske opløsningsmidler såsom methanol, ethanol, acetonitril, chloroform og deres (vandige) blandinger er afgørende for metabolitekstraktion og hjælper med at frigive intracellulære metabolitter fra den cellulære matrix. Brug 100–300 µL opløsningsmiddel pr. brønd, og sørg for, at volumenet er tilstrækkeligt til at nedsænke prøven helt.
   Interne standarder: Tilsæt eventuelt interne standarder til hver brønd til normalisering under den efterfølgende metabolomiske analyse.
2. Opsætning af koblingsmedium
   Vandniveau: Placer 96-brøndspladen på sonikeringsplatformen, der er fyldt med vand (koblingsmediet), som beskrevet i manualen.
3. Konfiguration af parametre for UIP400MTP
   Effektindstillinger: Indstil ultralydsamplituden til 50–80% af den maksimale effekt for at opnå effektiv homogenisering.
   Pulstilstand: Indstil sonikeringscyklussen til skiftende pulser (f.eks. 30 sekunder TIL, 30 sekunder FRA) for at muliggøre afkøling og forhindre overophedning af prøverne.
   Samlet tid: 4–10 minutter afhængigt af prøvens kompleksitet og sejhed.
   Temperaturstyring: Brug en laboratoriekøler til at holde vandet på 4–8°C under sonikeringen for at beskytte varmefølsomme metabolitter.
4. Sonikeringsproces
   Start UIP400MTP for at udføre sonikeringscyklusser.
   Overvåg processen via grænsefladen på UIP400MTP.
   Kavitationseffekten homogeniserer prøverne og lyserer cellerne i brøndene, så intracellulære metabolitter frigives til opløsningsmidlet.
5. Efter sonikering
   Centrifugering: Overfør om nødvendigt pladens indhold til opsamlingsrør efter sonikeringen. Centrifugér ved 4.000–6.000 × g i 10 minutter for at bundfælde uopløselige rester og cellemateriale som en pellet.
   Opsamling af supernatant: Overfør forsigtigt supernatanten fra hver brønd til nye rør eller plader til analyse.
   Valgfri tørring: Tør supernatanterne med en vakuumkoncentrator (f.eks. SpeedVac), hvis koncentrering er nødvendig, og genopløs derefter i et lille volumen af det passende opløsningsmiddel.

Udnyt den høje prøvebehandlingskapacitet i ultralydsapparatet UIP400MTP til flerbrøndsplader, og gør din metabolomiske forskning og analyse lettere!

Princippet bag berøringsfri sonikering med UIP400MTP

UIP400MTP tilfører ultralydsbølger til brøndene i en 96-brøndsplade indirekte via et koblingsmedium (f.eks. vand). Disse bølger skaber kavitation, som nedbryder celler og frigiver metabolitter uden fysisk kontakt mellem ultralydsapparatets probe og prøven.

Design, fremstilling og rådgivning – kvalitet fremstillet i Tyskland

Hielschers ultralydsapparater er kendt for deres højeste kvalitets- og designstandarder. Robusthed og nem betjening muliggør problemfri integration af vores ultralydsapparater i industrianlæg. Hielschers ultralydsapparater håndterer nemt barske forhold og krævende miljøer.

Hielscher Ultrasonics er en ISO-certificeret virksomhed og lægger særlig vægt på højtydende ultralydsapparater med den nyeste teknologi og brugervenlighed. Hielschers ultralydsapparater er naturligvis CE-kompatible og opfylder kravene fra UL, CSA og RoHs.