Protokol testa minimalne inhibitorne koncentracije (MIC)
Test minimalne inhibitorne koncentracije (MIC) zasnovan na biofilmu ključna je metoda za procjenu djelotvornosti antimikrobnih agenasa protiv mikroorganizama povezanih s biofilmom, koji zbog zaštitnog ekstracelularnog matriksa pokazuju pojačanu otpornost. Ključni korak u ovom testu je odvajanje struktura biofilma radi oslobađanja ugrađenih ćelija za tačnu procjenu vijabilnosti. Sonikator za višejažične ploče UIP400MTP olakšava ovaj postupak primjenom fokusiranog ultrazvuka za stvaranje kontrolirane kavitacije, koja efikasno odvaja ćelije biofilma i raspršuje ih u ujednačenu suspenziju. Ovo precizno i ponovljivo razgrađivanje biofilma povećava pouzdanost i propusnost MIC testova, zbog čega je UIP400MTP nezaobilazan alat u unapređenju istraživanja biofilma.
Zašto trebam koristiti ultrazvučnu obradu (sonikaciju) tokom MIC testova?
- Tačni i ponovljivi podaci: Dobijte ujednačene suspenzije ćelija koje uklanjaju zaštitu matriksa, čime se osigurava da broj kolonija i očitanja optičke gustoće zaista odražavaju antimikrobnu djelotvornost.
- Visoka propusnost: Obradite cijelu ploču sa 96 jažica istovremeno za samo 1–3 minute, čime se spora i nedosljedna ručna struganja zamjenjuju pojednostavljenim radnim tokom.
- Očuvana vijabilnost ćelija: Nježno odvojite ugrađene ćelije bez fizičkih oštećenja koja uzrokuje struganje, uz očuvanje većeg postotka preživljavanja za pouzdane proračune MIC/MBEC.
- Nula rizika od unakrsne kontaminacije: Iskoristite prednosti bezkontaktnog dizajna s posudastom sonotrodom (cup-horn) koji ravnomjerno obrađuje sve jažice, bez sondi koje dodiruju pojedinačne uzorke ili jažice.
- Usklađenost sa standardima: Uskladite svoju metodologiju s validiranim industrijskim protokolima poput ASTM E2799-22, čime vaši podaci dobijaju veću vjerodostojnost u regulatorne svrhe ili za objavljivanje.
- Pouzdan probir lijekova i tretmana: Pouzdajte se u rezultate osjetljivosti kako biste donosili pametnije odluke o antimikrobnoj djelotvornosti, profiliranju otpornosti ili razvoju terapija.
Povećajte učinak svog laboratorija uz očuvanje vijabilnosti ćelija. Recite nam koji tip mikroploče koristite i dobijte preporuke za efikasno odvajanje biofilma i raspršivanje ćelija ultrazvučnom obradom velike propusnosti.
UIP400MTP sonikator za mikroploče za precizno kontrolirano odvajanje biofilma u MIC i MBEC testovima.
Ultrazvučna obrada za odvajanje biofilma
MIC test zasnovan na biofilmu obično mjeri vijabilnost bakterija ili inhibiciju rasta metodama kao što su zasijavanje na podlogu, brojanje kolonija ili mjerenje optičke gustoće. Ultrazvučna obrada je ključni korak u MIC testovima zasnovanim na biofilmu pri procjeni antimikrobne osjetljivosti mikroorganizama povezanih s biofilmom. Njena primarna funkcija je da odvoji ćelije ugrađene u matriks biofilma i rasprši ih u ujednačenu suspenziju radi tačne analize.
Biofilmovi su znatno otporniji na antimikrobne agense u poređenju s planktonskim ćelijama, pa je pravilno odvajanje ključno za tačnu analizu. Tokom ovog procesa ultrazvučni talasi stvaraju kontroliranu kavitaciju, razbijaju matriks biofilma i oslobađaju ugrađene ćelije u ujednačenu suspenziju unutar medija za oporavak. Ovaj korak omogućava preciznu procjenu vijabilnosti ćelija raspršenih iz biofilma metodama kao što su zasijavanje na podlogu, razrjeđivanje i brojanje kolonija. Pravilno razgrađivanje biofilma ultrazvučnom obradom sprječava da zaostale komponente matriksa štite ćelije, što bi inače moglo dovesti do podcjenjivanja antimikrobne aktivnosti. Sonikator za višejažične ploče UIP400MTP posebno je pogodan za ovu svrhu jer nudi precizne i ponovljive uslove ultrazvučne obrade, čime se osigurava pouzdana priprema test ploča velike propusnosti.
Zašto je ultrazvučna obrada neophodna u testovima minimalne inhibitorne koncentracije zasnovanim na biofilmu
Za mjerenje vijabilnosti i brojanje ćelija potrebno je potpuno i pouzdano odvajanje i raspršivanje pojedinačnih ćelija. UIP400MTP omogućava ujednačeno odvajanje biofilma i raspršivanje ćelija bez oštećenja, za pouzdane rezultate testa.
- Složenost biofilma: Biofilmovi su strukturirane mikrobne zajednice obavijene matriksom ekstracelularne polimerne supstance (EPS), koji štiti mikroorganizme i čini ih otpornijima na antimikrobne agense.
- Ujednačeno raspršivanje: Da bi se tačno izmjerila vijabilnost ćelija ugrađenih u biofilm ili njihova osjetljivost na antimikrobne agense, biofilm se prvo mora odvojiti i razgraditi u homogenu suspenziju.
Iako standardni MIC mjeri planktonsku otpornost, ultrazvučna obrada je neophodna za Biofilm-MIC i MBEC testove kako bi se osiguralo da se povrati ispravna početna vrijednost ćelija.
Protokol testa minimalne inhibitorne koncentracije zasnovanog na biofilmu
Test minimalne inhibitorne koncentracije (MIC) određuje najnižu koncentraciju antimikrobnog agensa potrebnu za inhibiciju vidljivog rasta mikroorganizama. Ovaj protokol je namijenjen mikroorganizmima povezanim s biofilmom i koristi sonikator za višejažične ploče UIP400MTP za razgrađivanje biofilma.
Korak 1: Priprema bakterijskog inokuluma
- Pripremite bakterijsku suspenziju:
Uzgajajte bakterije u odgovarajućim podlogama do sredine logaritamske faze.
Razrijedite kulturu kako biste postigli standardiziranu gustoću ćelija (npr. 0,5 McFarlandov standard ili OD600 ~0,1). - Pripremite antimikrobne otopine:
Razrijedite antimikrobni agens u odgovarajućem mediju kako biste dobili niz koncentracija (npr. dvostruka serijska razrjeđenja). - Rasporedite u ploču sa 96 jažica:
Dodajte antimikrobne otopine u jažice standardne ploče sa 96 jažica, uz konačni volumen jažice od ~150–200 µL.
Uključite kontrole rasta (bez antimikrobnog agensa) i kontrole sterilnosti (bez bakterijskog inokuluma).
Korak 2: Stvaranje biofilma na poklopcu s klinovima
- Postavite poklopac s klinovima:
Postavite specijalni poklopac s klinovima na inokulirane jažice i pazite da klinovi budu potpuno uronjeni u bakterijsku suspenziju. - Inkubirajte ploču:
Inkubirajte na odgovarajućoj temperaturi (npr. 37°C) tokom određenog vremena (npr. 24 sata) u statičkim uslovima kako bi se omogućilo stvaranje biofilma na klinovima. - Isperite klinove:
Uklonite poklopac s klinovima iz bakterijske suspenzije i nježno ga isperite u sterilnom fiziološkom rastvoru ili PBS-u kako biste uklonili slabo vezane planktonske ćelije. - Izložite antimikrobnim agensima:
Prenesite poklopac s klinovima na novu ploču sa 96 jažica koja sadrži ranije pripremljena antimikrobna razrjeđenja.
Inkubirajte tokom definiranog perioda (npr. 24 sata) u statičkim uslovima kako bi antimikrobni agens mogao djelovati na biofilmove.
Korak 3: Izlaganje antimikrobnom agensu
Sonikator za višejažične ploče UIP400MTP za pripremu uzoraka velike propusnosti
Korak 4: Ultrazvučna obrada sonikatorom za mikroploče UIP400MTP
Korak ultrazvučne obrade je ključan za odvajanje biofilmova s poklopaca s klinovima radi procjene vijabilnosti. Slijedite ove korake za sonikator UIP400MTP:
- Pripremite postavku:
Napunite svaku jažicu nove ploče sa 96 jažica medijem za oporavak (npr. neutralizirajućim bujonom ili sterilnim medijem za rast). - Prenesite poklopac s klinovima:
Uklonite poklopac s klinovima s ploče za antimikrobni tretman.
Isperite poklopac s klinovima u sterilnom fiziološkom rastvoru ili PBS-u kako biste uklonili zaostale antimikrobne agense. - Postavite ploču u sonikator:
Pričvrstite poklopac s klinovima na ploču s medijem za oporavak.
Stavite ploču s medijem za oporavak u sonikator UIP400MTP i pazite da ploča stoji centrirano i stabilno, kako je opisano u priručniku. - Podesite parametre ultrazvučne obrade:
Postavite parametre ultrazvučne obrade na UIP400MTP (postavke se mogu prilagoditi biofilmu):
Amplituda: 70–100%.
Vrijeme ultrazvučne obrade: 1–3 minute (prilagodite prema strukturi biofilma) u cikličkom načinu rada. - Provedite ultrazvučnu obradu:
Pokrenite proces ultrazvučne obrade. Ultrazvučni talasi će razgraditi matriks biofilma i odvojiti ćelije u medij za oporavak. - Nadzirite proces:
Koristite priključni temperaturni senzor za praćenje temperature uzorka u jažicama. UIP400MTP se može povezati s laboratorijskim hladnjakom radi hlađenja. - Postupanje nakon ultrazvučne obrade:
Odmah prenesite medij za oporavak koji sadrži odvojene biofilmove na novu sterilnu ploču za naknadnu analizu.
(A) Ploča koja sadrži TSB s 2% glukoze, korištena za stvaranje biofilma, oporavak ćelija i određivanje MIC-a i MBEC-a; (B) Poklopac s klinovima za stvaranje stafilokoknih biofilmova.
Ćelije biofilma stvorene na klinovima odvojene su ultrazvučnom obradom (Hielscher Ultrasound Technology) tokom 5 min u pločama sa 96 jažica koje sadrže svjež hranjivi medij za oporavak ćelija.
(Slika i studija: ©de Oliveira et al., 2016)
Korak 4: Procjena vijabilnosti
Zasijte i uzgajajte odvojene biofilmove:
- Napravite serijska razrjeđenja medija za oporavak i zasijte ih na agar radi brojanja jedinica koje formiraju kolonije (CFU).
- Procijenite MIC:
Odredite MIC kao najnižu antimikrobnu koncentraciju koja potpuno inhibira vidljivi rast mikroorganizama u mediju za oporavak.
Pređite na preciznu bezkontaktnu ultrazvučnu obradu kako biste osigurali ujednačenu suspenziju ćelija i pouzdane MIC rezultate!
Ko ima koristi od ultrazvučne obrade tokom MIC testova?
- Proizvođači medicinskih sredstava: Za ispitivanje djelotvornosti površinskih premaza i validaciju protokola čišćenja za sredstva sklona stvaranju biofilma.
- Klinički mikrobiolozi: Za tačnu dijagnostiku infekcija povezanih s implantatima (kao što je PJI) izdvajanjem bakterija iz medicinskih komponenti.
- Razvojni inženjeri u farmaciji: Za procjenu djelotvornosti novih antimikrobnih agenasa protiv otpornih patogena ugrađenih u biofilm.
- Akademski istraživači: Za provođenje ponovljivih studija velike propusnosti o biologiji biofilma i mehanizmima antimikrobne otpornosti.
- Timovi za industrijsku kontrolu kvaliteta: Za procjenu biološkog obraštanja i djelotvornosti dezinficijensa u industrijskim okruženjima (npr. primjenom standarda ASTM E2799-22).
Dizajn, proizvodnja i savjetovanje – kvalitet proizveden u Njemačkoj
Hielscher ultrazvučni uređaji poznati su po svom najvišem kvalitetu i standardima dizajna. Robusnost i jednostavno rukovanje omogućavaju nesmetanu integraciju naših ultrazvučnih uređaja u industrijska postrojenja. Hielscher sonikatori lako se nose s teškim uslovima i zahtjevnim okruženjima.
Hielscher Ultrasonics je ISO certificirana kompanija i posebnu pažnju posvećuje visokoučinkovitim ultrazvučnim uređajima koji imaju najsavremeniju tehnologiju i jednostavni su za korištenje. Naravno, Hielscher ultrazvučni uređaji u skladu su s CE oznakom i ispunjavaju zahtjeve UL, CSA i RoHs.
Pojednostavite pripremu uzoraka u pločama sa 96 jažica i test pločama pomoću sonikatora za višejažične ploče UIP400MTP
Literatura / reference
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Često postavljana pitanja
Šta je MIC test?
Test minimalne inhibitorne koncentracije (MIC) standardizirano je ispitivanje koje se koristi za određivanje najniže koncentracije antimikrobnog agensa potrebne za inhibiciju vidljivog rasta mikroorganizma. Obično se provodi metodama mikrorazrjeđenja u bujonu ili razrjeđenja u agaru, pri čemu su mikroorganizmi izloženi serijskim razrjeđenjima antimikrobnog agensa. MIC testovi su ključni za procjenu antimikrobne djelotvornosti, usmjeravanje kliničkog liječenja i procjenu nivoa otpornosti kod planktonskih mikroorganizama i mikroorganizama povezanih s biofilmom.
Koja je razlika između testa minimalne inhibitorne koncentracije zasnovanog na biofilmu i MBIC testa?
Test minimalne inhibitorne koncentracije (MIC) zasnovan na biofilmu i test minimalne inhibitorne koncentracije biofilma (MBIC) su srodni, ali se razlikuju po svrsi i metodologiji.
MIC test zasnovan na biofilmu procjenjuje najnižu koncentraciju antimikrobnog agensa potrebnu za inhibiciju vidljivog rasta ili vijabilnosti biofilma, usredotočujući se na ćelije povezane s biofilmom, a ne na planktonske bakterije. Nasuprot tome, MBIC test posebno mjeri sposobnost antimikrobnog agensa da spriječi stvaranje biofilma, a ne da tretira već formirane biofilmove. Iako se oba testa bave bakterijama povezanim s biofilmom, MIC test zasnovan na biofilmu bavi se tretmanom, a MBIC test naglašava prevenciju, zbog čega su komplementarni alati za proučavanje antimikrobne djelotvornosti protiv biofilmova.
Koji se biofilmovi koriste u MIC testovima?
Mikrobni biofilmovi i planktonske ćelije koriste se u testovima minimalne inhibitorne koncentracije (MIC) za proučavanje antimikrobne djelotvornosti u različitim uslovima.
- Planktonske ćelije:
Planktonske ćelije su slobodno plutajuće, pojedinačne mikrobne ćelije koje služe kao standardni model za tradicionalne MIC testove. Uobičajeni mikroorganizmi uključuju Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus i Candida albicans. Ovi testovi određuju MIC potreban za inhibiciju rasta slobodno živućih ćelija i ključni su za početni antimikrobni probir. - Ćelije povezane s biofilmom:
Ćelije biofilma su mikroorganizmi ugrađeni u ekstracelularni matriks, što znatno povećava njihovu otpornost na antimikrobne agense. MIC testovi biofilma često uključuju:- Gram-negativne bakterije: Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa i Klebsiella pneumoniae, poznate po stvaranju biofilma u infekcijama i industrijskim okruženjima.
- Gram-pozitivne bakterije: Staphylococcus aureus (uključujući MRSA), Staphylococcus epidermidis i Enterococcus faecalis, koje su često povezane s infekcijama vezanim uz medicinska sredstva.
- Gljivice: Candida albicans i srodne vrste, važne u gljivičnim infekcijama povezanim s biofilmom.
- Biofilmovi miješanih vrsta: Oni se ponekad koriste za replikaciju prirodnih polimikrobnih biofilmova, kao što su oni pronađeni u hroničnim ranama ili industrijskom biološkom obraštanju.
Poređenjem MIC vrijednosti za planktonske ćelije i ćelije povezane s biofilmom, istraživači mogu procijeniti pojačanu otpornost biofilmova i identificirati agense koji su djelotvorni protiv ovih otpornijih mikrobnih zajednica.
Koja je razlika između MIC-a i MBEC-a?
Minimalna inhibitorna koncentracija (MIC) je najniža koncentracija antimikrobnog agensa potrebna za sprječavanje stvaranja biofilma, dok je minimalna koncentracija za eradikaciju biofilma (MBEC) najniža koncentracija potrebna za eradikaciju već uspostavljenog biofilma. MIC se usredotočuje na prevenciju biofilma, dok MBEC procjenjuje djelotvornost tretmana protiv zrelih biofilmova.
Koje se ploče obično koriste za MBEC testove?
Mikrotitarske ploče koje se obično koriste za MBEC testove su tipično ploče sa 96 jažica izrađene od polistirena ili polipropilena. Ovi materijali pružaju pogodnu površinu za stvaranje biofilma i hemijski su otporni na antimikrobne agense ispitivane tokom testa. Polistirenske ploče se široko preferiraju zbog svoje optičke bistrine, koja je korisna za naknadne analize kao što su spektrofotometrijska ili fluorescentna mjerenja. Dizajn ovih ploča uključuje odvojive poklopce s klinovima, koji su ključni za test jer se biofilmovi stvaraju na klinovima uronjenim u jažice koje sadrže hranjive podloge. Standardizirane ploče, poput onih usklađenih s protokolom MBEC testa, posebno su konstruirane kako bi osigurale ponovljivost i kompatibilnost sa sonikatorom UIP400MTP ili drugom opremom za obradu.
Šta su ploče s PEG poklopcem?
Ploče s PEG poklopcem su specijalizirani sistemi višejažičnih ploča kod kojih je poklopac opremljen malim klinovima ili iglama od polietilen glikola (PEG) koji se pružaju u svaku jažicu. Ovi klinovi pružaju površinu za stvaranje mikrobnog biofilma u kontroliranim uslovima, oponašajući rast biofilma u stvarnim uslovima. Dizajn omogućava razvoj biofilmova na klinovima dok jažice sadrže hranjive podloge ili antimikrobne agense, što omogućava ispitivanje osjetljivosti biofilma na tretmane velike propusnosti, kao u MBEC, MBIC i MIC testovima.
Koja je prednost ultrazvučnog odvajanja biofilma u odnosu na struganje ćelija?
Ultrazvučno odvajanje biofilma nudi značajnu prednost u odnosu na struganje ćelija jer pruža neinvazivnu, ujednačenu i visoko efikasnu metodu za uklanjanje biofilmova s površina. Za razliku od struganja, koje može biti nedosljedno i oštetiti podlogu ili ćelije, ultrazvučni talasi prodiru u matriks biofilma i razbijaju ga bez narušavanja integriteta susjednih struktura. Ova metoda osigurava ponovljivost, smanjuje rizik od kontaminacije i posebno je djelotvorna za primjene koje zahtijevaju precizno uklanjanje biofilma, kao što su mikrobiološke studije ili ispitivanje medicinskih sredstava. Pročitajte više o tome kako sonikator UIP400MTP nadmašuje struganje ćelija!
Hielscher Ultrasonics proizvodi visokoučinkovite ultrazvučne homogenizatore od laboratorijskih do industrijskih veličina.
