Hielscher Ultrasonics
Радо ћемо разговарати о вашем процесу.
Позовите нас: +49 3328 437-420
Пишите нам: [email protected]

Ултразвучна лиза E. coli

  • Бактерије E. coli су најчешће коришћене бактерије у микробиологији и биотехнологији.
  • Ултразвучни уређаји за разарање ћелија обезбеђују поуздане и поновљиве резултате при лизи E. coli.
  • Интензивна кавитација и силе смицања, које се ипак могу прецизно контролисати, доводе до потпуног разарања и високих приноса екстракције (нпр. протеина, ДНК).

Зашто је ултразвучно разарање ћелија E. coli пожељна метода?

Ултразвучни хомогенизатори или ултразвучни уређаји са сондом нуде више предности за лизу E. coli, јер интензиван ултразвук ефикасно разара ћелијске зидове и мембране. Ултразвучни уређаји са сондом широко се користе за лизу E. coli из следећих разлога:

  • Ефикасно разарање ћелијских зидова: E. coli има полукрут ћелијски зид састављен од пептидогликана, који може бити тешко разорити традиционалним методама лизе. Ултразвучни уређај са сондом генерише интензивне ултразвучне таласе који стварају кавитационе мехуриће у течности која окружује ћелије. Када ови мехурићи колабирају, стварају млазеве течности велике брзине и ударне таласе који доводе до механичког разарања ћелијских зидова, ефикасно ослобађајући ћелијски садржај, попут биомолекула.
  • Побољшано продирање: Ултразвучни таласи које генерише сонда / сонотрода могу продрети дубоко у узорак, допирући до већег броја ћелија E. coli и равномерно их третирајући. То помаже да се обезбеди уједначенија лиза у целом узорку, што доводи до веће ефикасности разарања ћелија.
  • Скраћено време обраде: Енергија коју испоручује ултразвучни уређај са сондом веома је концентрисана и локализована, што доводи до брзе и ефикасне лизе ћелија. У поређењу са другим методама, попут механичког разарања куглицама или ензимске лизе, соникацијом се лиза E. coli може постићи за неколико минута или чак секунди. Док многе алтернативне технике, попут замрзавања и одмрзавања, захтевају неколико циклуса третмана, ултразвучна лиза отвара ћелије у једном процесном кораку.
  • Контрола температуре: Најсавременији ултразвучни уређаји опремљени су температурним сензорима и паметним софтвером који омогућава подешавање максималне температуре процеса. Ултразвучни уређај аутоматски паузира када се достигне гранична температура и покреће процес соникације када се достигне задата температура. Хлађење узорака у леденом купатилу једноставан је начин да се температура узорка одржи ниском и спречи разградња узорка изазвана топлотом.
  • Могућност повећања размера процеса: Ултразвучни уређаји са сондом доступни су у различитим величинама, од ручних уређаја до великих индустријских модела. Због тога су погодни за обраду малих запремина у лабораторији или за повећање размера процеса за примене у биопроцесирању већег обима, нпр. производњу вакцина или биосинтезу молекула.
  • Свестраност: Ултразвучни уређаји могу се користити за различите примене поред лизе ћелија, као што су фрагментација ДНК смицањем, екстракција протеина, хомогенизација ткива, дисперговање наночестица и емулговање. Стога улагање у ултразвучни уређај са сондом омогућава свестрану примену у истраживачком или индустријском окружењу.
  • Ултрасоникатори са сондом, као што је UP200St, поуздани су хомогенизатори ткива и разарачи ћелија, па се широко користе за припрему узорака у генетици, нпр. за лизу E.coli

    Екстракција протеина из ћелија E.coli ефикасно се обавља помоћу ултразвучне сонде UP200St

    Ултразвучни уређај са сондом нуди бројне предности за лизу E. coli. Поуздана и прецизна контрола параметара ултразвучног процеса омогућава оптимизацију радних параметара, као што су снага, трајање и руковање узорком, ради постизања жељених резултата.
     

    Захтев за информације



     

    Како одабрати идеалан соникатор за разарање ћелија и екстракцију протеина у науци и анализиОво упутство објашњава који тип соникатора најбоље одговара вашим задацима припреме узорака, као што су лиза, разарање ћелија, изолација протеина и фрагментација ДНК и РНК у лабораторијама, анализи и истраживању. Одаберите идеалан тип соникатора према својој примени, запремини и броју узорака и капацитету обраде. Hielscher Ultrasonics има идеалан ултразвучни хомогенизатор за вас!
    Ово упутство објашњава који тип соникатора најбоље одговара вашим задацима припреме узорака, као што су лиза, разарање ћелија, изолација протеина и фрагментација ДНК и РНК у лабораторијама, анализи и истраживању. Одаберите идеалан тип соникатора према својој примени, запремини и броју узорака и капацитету обраде. Hielscher Ultrasonics има идеалан ултразвучни хомогенизатор за вас!
    Ултразвучна фрагментација ДНК често се користи као корак припреме узорака у секвенцирању нове генерације (NGS)

    Електрофоретичке анализе геномске ДНК E. coli EDL933 подвргнуте ултразвучном третману у трајању од 0 – 15 min. L означава ДНК лествицу.
    (студија и слика: ©Basselet et al. 2008)

    Разарање ћелија применом ултразвучне кавитације

    Ултразвучни хомогенизатори са сондом раде са приближно 20.000 циклуса у секунди (при 20kHz) и изазивају кавитацију у течностима или суспензијама. Акустичка кавитација ствара микроскопске области са притисцима блиским вакууму и високим температурама које разарају ћелије. Иако температуре могу достићи неколико хиљада степени Целзијуса, запремине кавитационих области су толико мале да не доводе до значајног загревања током процеса. Акустичка кавитација и силе смицања које ствара ултразвук перфорирају или разарају ћелијску мембрану бактеријских ћелија као што је E.coli. Hielscher ултразвучни уређаји омогућавају прецизну контролу параметара процеса као што су интензитет ултразвука, амплитуда, унос енергије и температура. Тиме се процес ултразвучне лизе може оптимално прилагодити типу ћелија, ћелијској култури и циљу процеса.
     

    Предности ултразвучне лизе

    • прецизна контрола лизе (интензитет, амплитуда, температура)
    • поуздани, поновљиви резултати
    • оптимално прилагођавање специфичним узорцима
    • контрола температуре
    • за веома мале до веома велике узорке (од µL до литара)
    • искључиво механичка обрада
    • једноставно и безбедно руковање
    • линеарно повећање размера процеса од лабораторије до производње
    Ултразвучни уређај VialTweeter омогућава истовремену припрему узорака у до 10 бочица под истим процесним условима. (Кликните за увећање!)

    VialTweeter за ултразвучну лизу

    Захтев за информације



    Ултразвучни хомогенизатор у поређењу са другим техникама лизе

    Док хемијска и ензимска лиза могу бити проблематичне – јер хемијска лиза може изменити структуре протеина и изазвати проблеме при пречишћавању, а ензимска лиза захтева дуго време инкубације и није поновљива – ултразвучно разарање је софистицирана, брза метода разарања ћелија.
    Ултразвучна лиза заснива се искључиво на механичким силама. Не додају се хемикалије, а соникација разара ћелијски зид силама смицања. Хемијска лиза може изменити структуру протеина и изазвати проблеме при пречишћавању. Ензимско разарање захтева дуго време инкубације и није поновљиво. Ултразвучно разарање ћелија бактерије E.coli је брзо, једноставно, поуздано и поновљиво. Зато се Hielscher ултразвучни уређаји користе у биолошким и биохемијским лабораторијама широм света за припрему узорака, преаналитику, ин витро дијагностику и разноврсне тестове.

    Опште препоруке за ултразвучну лизу

    Соникација је најпопуларнија техника за лизу веома малих, средњих и великих количина ћелијских суспензија – од пиколитара до 100L/hr (уз употребу ултразвучне проточне ћелије). Ћелије се лизирају смицањем у течности и кавитацијом. ДНК се такође фрагментише смицањем током соникације, па није потребно додавати ДНазу у ћелијску суспензију.
     

    Контрола температуре током ултразвучне лизе E.coli
    Ултразвучни разарач ћелија UP100H (100W) за разарање ћелија и екстракцију биљних једињења.Претходним хлађењем узорка и његовим држањем на леду током соникације лако се може спречити термичка разградња узорка.
    Идеално би било да се узорци током лизе одржавају на температури леда, али је за већину узорака довољно да температура не порасте изнад температуре културе или ткива из којег потичу. Зато се препоручује држање суспензије на леду и соникација у неколико кратких ултразвучних импулса од 5–10 sec са паузама од 10–30 sec. Током пауза топлота може да се одведе како би се поново успоставила ниска температура. За веће узорке ћелија доступни су различити проточни реактори са расхладним омотачима.
    Овде прочитајте детаљне савете и препоруке за успешну ултразвучну лизу!

    Протоколи за ултразвучну припрему лизата E. coli

    Истраживачи користе Hielscher ултразвучне хомогенизаторе за разарање ћелија E.coli. У наставку можете пронаћи различите испитане и проверене протоколе за лизу E.coli помоћу Hielscher ултразвучних хомогенизатора за различите примене повезане са E. coli.
     

    Ултразвучни хомогенизатор UP100HОвај видео-снимак приказује ултразвучни хомогенизатор Hielscher UP100H, уређај који се широко користи за припрему узорака у лабораторијама.

    Раст ћелија, унакрсно повезивање и припрема ћелијских екстраката E. coli помоћу ултразвука

    За ChIP-Chip анализу SeqA и РНК полимеразе, E. coli MG1655 или MG1655 ΔseqA узгајана је на 37°C до OD600 од око 0,15 у 50 ml LB (+ 0,2% глукозе), након чега је додато 27 μl формалдехида (37%) по ml подлоге (коначна концентрација 1%). Умрежавање је изведено уз благо протресање (100 rpm) на собној температури током 20 min, након чега је реакција заустављена додавањем 10 ml глицина концентрације 2,5 M (коначна концентрација 0,5 M). За експерименте са топлотним шоком, E. coli MG1655 је узгајана у 65 ml LB подлоге на 30°C до OD600 од око 0,3. Затим је 30 ml културе пренето у претходно загрејану тиквицу на 43°C, а остатак је задржан на 30°C. Умрежавање и заустављање реакције изведени су као што је горе описано, осим што су ћелије држане на 30 или 43°C током 5 min пре даљег благог протресања на собној температури. Ћелије су сакупљене центрифугирањем и два пута испране хладним TBS (pH7.5). Након ресуспендовања у 1 ml пуфера за лизу (10 mM Tris (pH 8,0), 20% сахарозе, 50 mM NaCl, 10 mM EDTA, 10 mg/ml лизозима) и инкубације на 37°C током 30 min, након које је додато 4 ml IP пуфера, ћелије су сонициране на леду 12 пута по 30 sec уз паузе од 30 sec, помоћу ултразвучног процесора Hielscher UP400St при подешеној снази од 100%. Након центрифугирања током 10 min на 9000 g, аликвоти супернатанта од 800 μl чувани су на -20°C. (Waldminghaus 2010)
     

    Прекомерна производња и пречишћавање ензима помоћу ултразвучне сонде

    Ултрасоникатор UP100H је лабораторијски хомогенизатор који се често користи за припрему узорака у плочама за ћелијске културе.За прекомерну производњу протеина обележених декахистидинском (His10) ознаком, E. coli BL21(DE3) је трансформисана конструктима pET19b. Прекултура узгајана преко ноћи сакупљена је центрифугирањем, а 1% је употребљен за инокулацију културе за експресију. Ћелије које носе pET19mgtB узгајане су на 22°C до оптичке густине на 600 nm (OD600) од 0,7. Култура је пребачена на 17°C, а експресија је индукована са 100 μM IPTG. Након 16 h, култура је сакупљена центрифугирањем на 7.500 × g при 4°C. Ћелије су ресуспендоване у 50 mM физиолошком раствору пуферованом фосфатом (PBS) са 0,3 M NaCl при pH 7,4 и разорене ултразвучним третманом помоћу сонотроде са микроврхом S2 на ултразвучном уређају Hielscher UP200St, при циклусу од 0,5 и амплитуди од 75%.
    Прекомерна производња GtfC обележеног декахистидинском ознаком индукована је на 37°C при OD600 од 0,6 са 100 μM IPTG. Ћелије су затим инкубиране током 4 h, сакупљене и лизиране као што је горе наведено за MgtB.
    Сирови ћелијски екстракти су центрифугирани на 15.000 × g и 4°C ради таложења ћелијских остатака. Избистрени екстракти су нанети на колоне HisTrap FF Crude запремине 1 ml помоћу система ÄKTAprime Plus. Ензими су пречишћени према протоколу произвођача за градијентно елуирање протеина са His ознаком. Елуирани раствори протеина су два пута дијализовани према 1.000 запремина 50 mM PBS, pH 7,4, са 0,3 M NaCl на 4°C. Пречишћавање је анализирано помоћу 12% SDS-PAGE. Концентрација протеина одређена је Бредфордовом методом уз употребу Roti-Quant. (Rabausch et al. 2013)
     

    Ултразвучна екстракција протеина из бактерија E. coli
    Протеин мамац од интереса (у овом случају MTV1 из Arabidopsis thaliana) спаја се са GST ознаком и експримира у ћелијама Escherichia coli (E. coli) BL21.

    1. Узмите по један талог GST-MTV1 и GST (који одговара 50 ml бактеријске културе) и сваки ресуспендујте у 2,5 mL ледено хладног пуфера за екстракцију.
    2. Користите ултразвучни уређај UP100H (опремљен сонотродом са микроврхом MS3 за мале запремине од приближно 2–5mL) за разарање бактеријских ћелија све док се не лизирају, на шта указују смањена замућеност и повећана вискозност. Ово се мора изводити на леду, а препоручује се соникација у интервалима (нпр. 10 sec соникације, затим 10 sec паузе на леду и тако даље). Треба водити рачуна да интензитет соникације не буде превисок. Ако се примети пенушање или стварање белог талога, интензитет треба смањити.
    3. Пренесите раствор лизираних бактерија у микроцентрифужне епрувете од 1,5 mL и центрифугирајте на 4°C, при 16.000 x g током 20 min.

     

    Ултразвучне сонде користе силе акустичне кавитације за разарање ћелија и екстракцију молекула и ДНК из E.coli.

    Ултразвучни уређаји са сондом, као што је UP400St, користе принцип акустичне кавитације за ефикасну лизу E.coli.

    Анализа експресије и пречишћавање рекомбинантног протеина помоћу соникације

    Талог ћелија E. coli сонициран је ултразвучним уређајем Hielscher UP100H. У ту сврху, ћелијски талог је ресуспендован у охлађеном пуферу за лизу (50 mM Tris-HCl pH=7,5, 100 mM NaCl, 5 mM DTT, 1 mM PMSF) и хлађен на леду током 10 min. Затим је ћелијска суспензија соницирана у 10 кратких импулса од по 10 s, са интервалима од 30 s за хлађење. На крају су ћелијски остаци уклоњени ултрацентрифугирањем на 4°C током 15 min при 14.000 rpm. Ради потврде експресије rPR, супернатант је подвргнут електрофорези на 12% полиакриламидном гелу и анализиран методама SDS-PAGE и вестерн блот. Пречишћавање rPR изведено је помоћу Ni2+-NTA смоле (Invitrogen, САД) према упутству произвођача. У овој фази коришћена је метода пречишћавања у нативним условима. Чистоћа пречишћеног протеина процењена је електрофорезом на 12% полиакриламидном гелу и накнадним бојењем бојом Coomassie blue. Концентрација пречишћеног протеина измерена је комплетом Micro BCA за одређивање протеина (PIERCE, САД). (Azarnezhad et al. 2016)
     

    Ултразвучни Cuphorn (200 вати)Овај видео приказује ултразвучни уређај са чашастом сонотродом снаге 200 вати за дисперговање, хомогенизацију, екстракцију или отплињавање лабораторијских узорака.
    Овај видео приказује ултразвучни уређај са чашастом сонотродом снаге 200 вати за дисперговање, хомогенизацију, екстракцију или отплињавање лабораторијских узорака.

    Ултразвучни хомогенизатори за лизу E. coli

    Hielscher Ultrasonics пројектује, производи и испоручује ултразвучне хомогенизаторе високих перформанси за поуздану и ефикасну лизу бактерија E. coli и других типова ћелија, ткива и ћелијских култура.
    Широк асортиман ултразвучних сонди, као и система за индиректну соникацију, омогућава нам да вам понудимо идеалан ултразвучни хомогенизатор ткива за вашу примену разарања ћелија и екстракције.

    Пројектовање, производња и саветовање – квалитет произведен у Немачкој

    Ултрасоникаторима Hielscher може се управљати даљински путем прегледача. Параметри соникације могу се пратити и прецизно прилагођавати захтевима процеса.Ултразвучни уређаји Hielscher познати су по највишим стандардима квалитета и дизајна. Паметан софтвер, интуитиван мени, програмабилна подешавања и аутоматско бележење података само су неке од карактеристика ултразвучних уређаја Hielscher. Робусност и једноставно руковање омогућавају несметану интеграцију наших ултразвучних уређаја у истраживачке и биотехнолошке установе. Ултразвучни уређаји Hielscher лако раде чак и у тешким условима и захтевним окружењима.

    Hielscher Ultrasonics је компанија са ISO сертификатом и посебан нагласак ставља на ултразвучне уређаје високих перформанси који се одликују најсавременијом технологијом и једноставношћу употребе. Наравно, ултразвучни уређаји Hielscher усклађени су са CE захтевима и испуњавају захтеве UL, CSA и RoHs.

    Табела у наставку даје увид у приближан капацитет обраде наших ултразвучних уређаја:

    Запремина шарже Проток Препоручени уређаји
    плоче са више бунарчића / микротитарске плоче n.a. UIP400MTP
    CupHorn за бочице или лабораторијску чашу n.a. Ultrasonic CupHorn
    ултразвучни микропроточни реактор n.a. GDmini2
    до 10 бочица са 0,5 до 1,5mL n.a. VialTweeter
    0,5 до 1,5mL n.a. VialTweeter
    1 до 500mL 10 до 200mL/min UP100H
    10 до 2000mL 20 до 400mL/min UP200Ht, UP400St
    0,1 до 20L 0,2 до 4L/min UIP2000hdT
    10 до 100L 2 до 10L/min UIP4000
    n.a. 10 до 100L/min UIP16000
    n.a. већи група уређаја UIP16000

    Контактирајте нас! / Питајте нас!

    Затражите више информација

    Молимо Вас да користите образац испод како бисте затражили додатне информације о ултразвучним хомогенизаторима ткива и уређајима за разарање ћелија, применама лизе и ценама. Радо ћемо са Вама размотрити Ваш процес и понудити Вам ултразвучни хомогенизатор који испуњава Ваше захтеве!





    Ултразвучни уређај UIP400MTP за соникацију плоча са више бунарчићаВидео приказује систем за ултразвучну припрему узорака UIP400MTP, који омогућава поуздану припрему узорака у свим стандардним плочама са више бунарчића применом ултразвука високог интензитета. Типичне примене уређаја UIP400MTP обухватају лизу ћелија, фрагментацију ДНК, РНК и хроматина, као и екстракцију протеина.
    Видео приказује систем за ултразвучну припрему узорака UIP400MTP, који омогућава поуздану припрему узорака у свим стандардним плочама са више бунарчића применом ултразвука високог интензитета. Типичне примене уређаја UIP400MTP обухватају лизу ћелија, фрагментацију ДНК, РНК и хроматина, као и екстракцију протеина.

    Додатни протоколи за ултразвучну лизу E. coli

    Протеини модификовани алицином у E. coli уз употребу ултразвучног уређаја VialTweeter

    VialTweeter на ултразвучном процесору UP200STОдређивање садржаја сулфхидрилних група тестом са 5,5′-дитиобис(2-нитробензоевом киселином) (DTNB)
    Култура E. coli MG1655 узгајана преко ноћи коришћена је за инокулацију минималне подлоге MOPS (1:100). Култура је узгајана аеробно док није достигнута вредност A600 од 0,4. Култура је подељена на три културе од по 15-ml за третман стресом. Нетретирана култура служила је као негативна контрола. Једној од преостале две културе додато је 0,79 mM алицина (128 μg ml-1), а другој 1 mM диамида. Културе су инкубиране током 15 min. Из сваке културе узето је 5 ml и центрифугирано ради сакупљања ћелија (8.525 × g, 4°C, 10 min). Ћелије су два пута испране са 1 ml PBS (137 mM NaCl, 2,7 mM KCl, 10 mM Na2HPO4, 2 mM KH2PO4, pH 7,4, чуваног у анаеробним условима пре употребе) и центрифугиране (13.000 × g, 4°C, 10 min). Ћелије су ресуспендоване у пуферу за лизу (PBS са 6 mM гванидинијум-хидрохлорида, pH 7,4) пре разарања на 4°C ултразвучном обрадом (VialTweeter ултразвучни хомогенизатор, Hielscher GmbH, Немачка) (3 × 1 min). Ћелијски остаци су исталожени центрифугирањем (13.000 × g, 4 °C, 15 min). Супернатант је пребачен у QS-макро кивету запремине 3,5-ml (10 mm) са магнетним штапићем за мешање и помешан са 1 ml пуфера за лизу. Екстинкција узорака праћена је на 412 nm помоћу спектрофотометра Jasco V-650 опремљеног термостатираним држачем кивета PSC-718, на собној температури. Додато је 100μl раствора дитиобис(2-нитробензојеве киселине) концентрације 3 mM. Екстинкција је праћена док није достигла засићење. Концентрација тиола израчуната је помоћу коефицијента екстинкције ϵ412 = 13.700 M-1 cm-1 за тио-2-нитробензојеву киселину (TNB). Ћелијске концентрације тиола израчунате су на основу запремине ћелија E. coli од 6,7 × 10-15 литара и густине ћелија од A600 = 0,5 (што одговара 1 × 108 ћелија ml-1 културе). (Müller et al. 2016)
     

    Одређивање глутатиона in vivo помоћу ултразвучног разарача ћелија

    E.coli MG1655 је узгајана у минималној подлози MOPS у укупној запремини од 200ml док A600 није достигла 0,5. Култура је подељена на културе запремине 50-ml за третман стресом. После 15 min инкубације са 0,79 mM алицина, 1 mM диамида или диметил-сулфоксидом (контрола), ћелије су сакупљене центрифугирањем при 4.000g на 4°C током 10 min. Ћелије су двапут испране пуфером KPE пре ресуспендовања талога у 700µl пуфера KPE. За депротеинизацију је додато 300l 10% (w/v) сулфосалицилне киселине пре разарања ћелија ултразвучним третманом (3 x 1 min; VialTweeter ултразвучни хомогенизатор). Супернатанти су сакупљени након центрифугирања (30 min, 13.000g, 4°C). Концентрације сулфосалицилне киселине смањене су на 1% додавањем 3 запремине пуфера KPE. Мерења укупног глутатиона и GSSG извршена су као што је претходно описано. Ћелијске концентрације глутатиона израчунате су на основу запремине ћелија E. coli од 6,7×10-15 литара и густине ћелија од A600 0,5 (што одговара 1×108 ћелија ml-1 културе). Концентрације GSH израчунате су одузимањем 2[GSSG] од укупног глутатиона. (Müller et al. 2016)

    Експресија људске mAspAT у E. coli уз употребу ултразвучног хомогенизатора

    Ултразвучни уређај за разарање ћелија UP400St (400W) за екстракцију унутарћелијског материјала (нпр. протеина, органела, ДНК, РНК итд.)Појединачна колонија E. coli BL21 (DE3) која носи експресиони вектор у 30 mL подлоге Luria-Bertani (LB) са 100μg/mL ампицилина затим је култивисана на 37ºC док оптичка густина (OD600) није достигла 0,6. Ћелије су сакупљене центрифугирањем при 4.000 × g током 10 min и ресуспендоване у 3L свеже подлоге LB са 100μg/mL ампицилина.
    Након тога, експресија протеина индукована је са 1 mM изопропил β-ᴅ-1-тиогалактопиранозида (IPTG) током 20 h на 16ºC. Ћелије су сакупљене центрифугирањем при 8.000 × g током 15 min и испране пуфером A (20 mM NaH2PO4, 0,5 M NaCl, pH 7,4). Из 3 L културе добијено је приближно 45g ћелија (влажна маса). Након центрифугирања, ћелијски талози су ресуспендовани у 40 mL (за 1 L културе) ледено хладног екстракционог пуфера A и лизирани ултразвучним третманом на ледено хладној температури помоћу ултразвучног разарача ћелија Hielscher UP400St. Ћелијски лизат је центрифугиран при 12.000 rpm током 15 min ради раздвајања растворљиве фракције (супернатант) и исталожене фракције (талог). (Jiang et al. 2015)
     



    Чињенице које вреди знати

    E.coli

    Escherichia coli (E. coli) је грам-негативна, факултативно анаеробна, штапићаста, колиформна бактерија рода Escherichia која се обично налази у доњем делу црева топлокрвних организама (ендотерма). Постоји велики број сојева (или подтипова) E. coli са различитим карактеристикама. Већина сојева E. coli је безопасна за људе, нпр. сојеви B и K-12, који се често користе за истраживања у лабораторијама. Међутим, неки сојеви су штетни и могу изазвати озбиљне болести.
    E. coli има важну улогу у савременом биолошком инжењерству и индустријској микробиологији јер је овом бактеријом лако манипулисати. Уобичајене лабораторијске примене које често укључују употребу E. coli обухватају, на пример, стварање рекомбинантне дезоксирибонуклеинске киселине (ДНК) или њену употребу као модел-организма.
    E. coli је веома свестран домаћин за производњу хетерологних протеина, а за производњу рекомбинантних протеина у E. coli доступни су бројни системи за експресију протеина. Употребом плазмида који омогућавају висок ниво експресије протеина, гени се могу унети у бактерије, што омогућава производњу таквих протеина у великим количинама у процесима индустријске ферментације.
    E.coli се користе као ћелијске фабрике за производњу инсулина. Друге примене укључују употребу модификованих ћелија E. coli за развој и производњу вакцина и имобилисаних ензима, за производњу биогорива, као и за биоремедијацију.
    Сој K-12 је мутантни облик E. coli који прекомерно експримира ензим алкалну фосфатазу (ALP). Ова мутација настаје услед дефекта у гену који стално кодира тај ензим. Ако ген производи производ без икакве инхибиције, то се назива конститутивном активношћу. Овај специфични мутантни облик користи се за изолацију и пречишћавање ензима ALP.
    Бактерије E. coli се такође широко користе као ћелијске фабрике. Модификовани микроорганизми (нпр. бактерије) и биљне ћелије могу се користити као такозване ћелијске фабрике. Ове генетички модификоване ћелије производе молекуле, хемикалије, полимере, протеине и друге супстанце које се користе, на пример, у фармацеутској, прехрамбеној и хемијској индустрији. Ради ослобађања молекула произведених у унутрашњости таквих биоинжењерски модификованих ћелија, ултразвучна лиза је уобичајена метода за разарање ћелијских зидова и преношење циљних супстанци у околну течност. Прочитајте више о лизи биоинжењерски модификованих ћелија!

    Ултразвучно смицање ДНК

    Ултразвучне силе смицања се често користе за ослобађање молекула, органела и протеина из унутрашњости ћелија, као и за разбијање ланаца ДНК на делове. Акустична кавитација разара ћелијске зидове и мембране ради екстракције ДНК из ћелија и стварања фрагмената дужине око 600 – 800 bp, што је идеално за анализу.
    Кликните овде да бисте сазнали више о ултразвучним хомогенизаторима за фрагментацију ДНК!

    Литература / Референце


    Ултразвучна технологија високих перформанси! Асортиман производа Hielscher покрива цео спектар од компактног лабораторијског ултразвучног уређаја, преко стоних јединица, до ултразвучних система за индустријску примену у пуном обиму.

    Hielscher Ultrasonics производи ултразвучне хомогенизаторе високих перформанси од лабораторијских до индустријских размера.

    Радо ћемо разговарати о вашем процесу.

    ✕