Lýza kvasinkových buniek v mikrotitračných platničkách pomocou sonikácie s vysokou intenzitou
Mikrobiológovia a výskumníci v oblasti vied o živej prírode, ktorí pracujú s Saccharomyces cerevisiae, Pichia pastoris / Komagataella phaffii, a ďalšími kvasinkovými systémami poznajú tento problém: kvasinkové bunky sú odolné, dosiahnutie reprodukovateľnej lýzy môže byť náročné a manuálne rozrušovanie vzoriek sa rýchlo stáva úzkym miestom, keď je potrebné skríningom preveriť mnoho kmeňov, klonov, kultivačných podmienok alebo expresných konštruktov.
Lýza kvasiniek s vysokou priepustnosťou vzoriek pre mikrobiológiu, molekulárnu biológiu a analýzu proteínov
Sonikátory Hielscher pre mikrotitračné platničky, ako sú UIP400MTP (400 W) a UIP550MTP (550 W), poskytujú riešenie s vysokou priepustnosťou vzoriek na mechanickú lýzu kvasinkových buniek priamo v mikrotitračných platničkách. Namiesto spracúvania vzoriek sondou po jednej možno sonikovať celé mikrotitračné platničky za rovnomerných podmienok. Vďaka tomu je ultrazvuková lýza kvasiniek rýchlejšia, reprodukovateľnejšia a jednoduchšie sa začleňuje do moderných pracovných postupov v mikrobiológii, expresii proteínov, skríningu enzýmov a omických analýzach.
Či už potrebujete uvoľniť rekombinantné proteíny z P. pastoris, pripraviť kvasinkové lyzáty na enzýmové testy, rozrušiť S. cerevisiae na analýzu proteínov alebo paralelne skríningom preveriť desiatky kvasinkových klonov, sonikátory Hielscher pre mikrotitračné platničky zabezpečujú účinné rozrušovanie buniek založené na kavitácii s presným riadením procesu.
Potrebujete reprodukovateľnú lýzu S. cerevisiae, P. pastoris, alebo iných kvasinkových kmeňov v mikrotitračných platničkách? Oznámte nám formát platničky, objem vzorky, hustotu buniek a cieľový analyt. Pomôžeme vám určiť vhodné parametre sonikácie pre váš pracovný postup s UIP400MTP alebo UIP550MTP.
Sonikátor Hielscher pre viacjamkové platničky na lýzu kvasiniek – príprava vzoriek s vysokou priepustnosťou
Prečo kvasinkové bunky vyžadujú účinnú mechanickú lýzu
Kvasinkové bunky sa lyzujú ťažšie než mnohé bakteriálne alebo cicavčie bunky, pretože ich chráni pevná bunková stena zložená najmä z polysacharidov, glukánov, manoproteínov a chitínu. Táto bunková stena zabezpečuje mechanickú stabilitu, ale zároveň obmedzuje uvoľňovanie vnútrobunkových proteínov, nukleových kyselín, metabolitov a enzýmov.
Medzi konvenčné metódy lýzy kvasiniek patrí rozrušovanie pomocou guľôčok, enzymatické štiepenie, cykly zmrazovania a rozmrazovania, chemická lýza a sonikácia sondou. Tieto metódy môžu byť účinné, ale majú aj obmedzenia. Rozrušovanie pomocou guľôčok môže do vzorky vnášať úlomky a spôsobovať zahrievanie, enzymatické štiepenie môže zvyšovať náklady a variabilitu a sonikácia jednotlivých vzoriek sondou je časovo náročná, keď je potrebné spracovať veľký počet vzoriek.
Fokusovaná ultrazvuková kavitácia s vysokou intenzitou prekonáva tieto obmedzenia pôsobením intenzívnych mechanických šmykových síl, tlakových výkyvov a mikroprúdenia na kvasinkovú suspenziu. Výsledkom je rýchle rozrušenie bunkových stien a membrán, lepšie uvoľňovanie vnútrobunkového obsahu a vysoko reprodukovateľná príprava vzoriek vo formáte platničiek.
Sonikácia mikrotitračných platničiek na paralelnú prípravu kvasinkových vzoriek
Prístroje Hielscher UIP400MTP a UIP550MTP sú navrhnuté na rovnomernú sonikáciu mikrotitračných platničiek, viacjamkových platničiek, PCR platničiek a vhodných stojanov na vzorky. Na rozdiel od sonikácie sondou nie je potrebné vzorky ošetrovať jednotlivo. Celá platnička je vystavená riadenej ultrazvukovej energii, vďaka čomu je tento pracovný postup veľmi vhodný na paralelné spracovanie vzoriek.
To je obzvlášť užitočné pri týchto aplikáciách:
- Skríning mutantov S. cerevisiae alebo expresných kmeňov
- Lýza klonov P. pastoris / K. phaffii po expresii rekombinantných proteínov
- Príprava kvasinkových lyzátov na enzýmové testy
- Extrakcia proteínov na SDS-PAGE, Western blot, ELISA, LC-MS/MS alebo testovanie aktivity
- Uvoľňovanie vnútrobunkových metabolitov na metabolomické analýzy
- Príprava vzoriek DNA a RNA po vhodnom následnom čistení
- Optimalizácia lyzačných pufrov, prísad a extrakčných podmienok s vysokou priepustnosťou vzoriek
Ako ultrazvuková kavitácia rozrušuje kvasinkové bunky
Počas sonikácie vytvára sústredený vysokovýkonný ultrazvuk v kvapalnej vzorke striedavé cykly stláčania a zrieďovania. Pri dostatočnej intenzite tieto tlakové výkyvy vyvolávajú akustickú kavitáciu. Kavitačné bubliny vznikajú, oscilujú a kolabujú, pričom vytvárajú lokálne šmykové sily, mikrotrysky, turbulenciu a silné tlakové gradienty.
V suspenziách kvasiniek tieto mechanické účinky oslabujú a narúšajú bunkovú stenu a bunkovú membránu. Vnútrobunkové proteíny, enzýmy, nukleové kyseliny a metabolity sa uvoľňujú do lyzačného pufra. Keďže ide o mechanický proces, možno ho použiť s mnohými rôznymi pufrovými systémami a kombinovať s inhibítormi proteáz, redukčnými činidlami, detergentmi, soľami alebo miernou enzymatickou predúpravou.
Všeobecný protokol: Lýza kvasinkových buniek v mikrotitračných platničkách
Nasledujúci protokol poskytuje praktický východiskový postup na lýzu kvasiniek pomocou sonikátora pre mikrotitračné platničky Hielscher UIP400MTP alebo UIP550MTP. Parametre by sa mali optimalizovať podľa kmeňa kvasiniek, hustoty buniek, cieľovej molekuly, zloženia pufra, typu platničky a následného analytického stanovenia.
1. Získajte a premyte kvasinkové bunky
Kultivujte Saccharomyces, Pichia, Hansenula, Debaryomyces alebo iný kmeň kvasiniek za požadovaných kultivačných podmienok. Získajte bunky centrifugáciou a odstráňte kultivačné médium. Premyte sediment studenou destilovanou vodou, PBS alebo zvoleným lyzačným pufrom, aby ste odstránili zvyškové zložky média, ktoré môžu interferovať s následnou analýzou.
Pri extrakcii proteínov udržiavajte vzorky v chlade a pracujte rýchlo. Ak proteázy predstavujú problém, vopred ochlaďte všetky pufre a spotrebný materiál.
2. Resuspendujte bunkový sediment
Resuspendujte sediment kvasiniek vo vhodnom studenom lyzačnom pufri. Na účinné uvoľňovanie proteínov je často výhodná vysoká hustota buniek. Ako východiskovú hodnotu použite približne 10–20% w/v vlhkého bunkového sedimentu alebo hustú suspenziu zodpovedajúcu OD600 > 10, v závislosti od analytického stanovenia.
Typický lyzačný pufer na získavanie proteínov z kvasiniek môže obsahovať:
- pufrový systém, napríklad Tris-HCl, fosfátový pufer alebo HEPES
- soľ, napríklad NaCl alebo KCl
- zmes inhibítorov proteáz
- voliteľne redukčné činidlo, napríklad DTT alebo β-merkaptoetanol
- voliteľne detergent, napríklad Triton X-100, NP-40, SDS alebo CHAPS, v závislosti od kompatibility s následnými postupmi
- voliteľne inhibítory fosfatáz na štúdium fosforylácie
Pri ťažko lyzovateľných kmeňoch kvasiniek alebo pri veľmi šetrnej extrakcii proteínov možno pred sonikáciou použiť krátku predúpravu enzýmom Zymolyase, Lyticase alebo iným enzýmom štiepiacim bunkovú stenu. Táto enzymatická predúprava je voliteľná, môže však zlepšiť účinnosť lýzy alebo znížiť požadovanú intenzitu ultrazvuku.
3. Preneste vzorky do vhodnej mikrotitračnej platničky
Nadávkujte suspenziu kvasiniek do mikrotitračnej platničky kompatibilnej so sonikáciou. Často sa uprednostňujú platničky s okrúhlym dnom, pretože zlepšujú odber vzoriek a obmedzujú mŕtve zóny. Na zlepšenie reprodukovateľnosti používajte vo všetkých jamkách rovnaké objemy vzoriek.
Utesnite platničku vhodnou tesniacou podložkou alebo fóliou, aby ste zabránili odparovaniu, tvorbe aerosólov a krížovej kontaminácii. Uistite sa, že tesnenie je kompatibilné so zvolenou teplotou a podmienkami sonikácie.
Typické pracovné objemy závisia od formátu platničky a aplikácie. Medzi bežné formáty patria 96-jamkové platničky, platničky s hlbokými jamkami, PCR platničky alebo vhodné stojany na skúmavky.
4. Pripravte chladenie
Lýza kvasiniek vyžaduje vysokú intenzitu ultrazvuku a pri mechanickom narúšaní vzniká teplo. Regulácia teploty je preto zásadná, najmä pri analýze proteínov, enzýmov, RNA alebo fosforylácie.
Použite vhodný spôsob chladenia, napríklad:
- vopred vychladený lyzačný pufer
- vopred ochladené mikrotitračné platničky
- prestávky na chladenie medzi intervalmi sonikácie
- externé chladenie sonikačnej platformy, ak je možné
Cieľom je udržiavať vzorku dostatočne studenú, aby sa zabránilo denaturácii proteínov, inaktivácii enzýmov, degradácii RNA a variabilite vzoriek vyvolanej teplom.
5. Sonikujte suspenziu kvasiniek
Vložte utesnenú platničku do sonikátora pre mikrotitračné platničky Hielscher UIP400MTP alebo UIP550MTP a vyberte program pulznej sonikácie. Pulzný režim sa odporúča, pretože umožňuje mechanické rozrušovanie počas fáz zapnutia (ON) a odvádzanie tepla počas fáz vypnutia (OFF).
Ako východiskové nastavenie na lýzu kvasinkových buniek:
| Parameter | Odporúčaný východiskový rozsah | Účel |
|---|---|---|
| Amplitúda | 60–100% | Vysoká intenzita kavitácie pre odolné kvasinkové bunky |
| Pulzný režim | 10–30 sec ON / 30–60 sec OFF | Účinná lýza s kontrolovaným hromadením tepla |
| Kumulatívny čas zapnutia (ON) | 5–15 min | Upravte podľa kmeňa, hustoty a cieľovej molekuly |
| Teplota | Udržiavajte vzorky v chlade | Chráňte proteíny, enzýmy, RNA a metabolity |
| Utesnenie platničky | Odporúčané | Zabraňuje odparovaniu, tvorbe aerosólov a krížovej kontaminácii |
Pri vysoko odolných suspenziách kvasiniek, hustej biomase P. pastoris alebo náročnej extrakcii rekombinantných proteínov postupne predlžujte kumulatívny čas zapnutia (ON). Pri proteínoch citlivých na teplo alebo pri stanoveniach enzýmovej aktivity používajte kratšie pulzy, dlhšie prestávky na chladenie a nižšiu východiskovú amplitúdu.
Vysokokapacitná lýza kvasiniek vo viacjamkových platničkách pomocou UIP400MTP
6. Vyčírenie lyzátu
Po sonikácii centrifugujte mikrotitračnú platničku alebo preneste vzorky do skúmaviek na centrifugáciu. Odstráňte bunkové zvyšky centrifugáciou pri vhodnej rýchlosti a teplote. Odoberte supernatant na následnú analýzu.
V závislosti od aplikácie možno lyzát použiť na:
- kvantifikáciu proteínov
- stanovenia enzýmovej aktivity
- SDS-PAGE a Western blotting
- ELISA a imunologické stanovenia
- proteomiku pomocou LC-MS/MS
- analýzu metabolitov
- purifikáciu DNA alebo RNA
7. Optimalizácia a zdokumentovanie metódy
Na zabezpečenie reprodukovateľnej lýzy kvasiniek zdokumentujte všetky relevantné parametre vrátane kmeňa, kultivačných podmienok, OD600, hmotnosti mokrej bunkovej biomasy, zloženia pufra, typu platničky, objemu vzorky, amplitúdy, pulzného cyklu, kumulatívneho času zapnutia (ON), spôsobu chladenia a konečnej teploty vzorky.
Ak je sonikátor Hielscher vybavený automatickým zaznamenávaním údajov, procesné údaje možno použiť na dokumentáciu, vývoj metódy, zväčšovanie mierky a kontrolu kvality.
Tipy na optimalizáciu lýzy kvasiniek
Na maximálne uvoľnenie proteínov používajte husté suspenzie kvasiniek, vysokú intenzitu ultrazvuku a dostatočný kumulatívny čas zapnutia (ON). Pri citlivých proteínoch znížte amplitúdu, predĺžte prestávky na chladenie a udržiavajte platničku v chlade počas celého procesu.
Ak je lýza neúplná, postupne predlžujte čas sonikácie, otestujte enzymatickú predúpravu, znížte viskozitu vzorky alebo optimalizujte pufer. Ak sa proteíny degradujú alebo strácajú aktivitu, zlepšite chladenie, skráťte intervaly zapnutia (ON), pridajte inhibítory a overte, či je detergentový systém kompatibilný s cieľovým proteínom.
Keďže sa kmene kvasiniek výrazne líšia štruktúrou bunkovej steny, rastovou fázou, expresným systémom a hustotou biomasy, odporúča sa malá optimalizačná matica. Otestujte napríklad tri amplitúdy, dva pulzné cykly a dva celkové časy zapnutia (ON), potom vyhodnoťte účinnosť lýzy a integritu proteínov.
Či už spracúvate niekoľko platničiek na stanovenia, alebo vykonávate vysokokapacitný skríning kvasiniek, Hielscher vám môže pomôcť vybrať vhodný sonikátor pre mikrotitračné platničky a vyvinúť robustný protokol lýzy. Kontaktujte nás a uveďte svoj kmeň kvasiniek, pracovný postup a požiadavky na kapacitu spracovania vzoriek!
Výhody sonikátorov Hielscher pre mikrotitračné platničky pri lýze kvasiniek
Sonikátory Hielscher pre mikrotitračné platničky sú ideálne pre laboratóriá, ktoré potrebujú reprodukovateľnú lýzu veľkého počtu vzoriek. Eliminujú pomalé spracovanie jednotlivých vzoriek pri sondovej sonikácii a znižujú variabilitu spôsobenú manuálnym polohovaním sondy, hĺbkou ponorenia a rozdielmi v manipulácii s jednotlivými vzorkami.
Medzi hlavné výhody patria:
- Vysokokapacitné spracovanie: Sonikujte veľký počet vzoriek kvasiniek paralelne v mikrotitračných platničkách alebo kompatibilných stojanoch na vzorky.
- Reprodukovateľné podmienky: Rovnaké podmienky sonikácie vo všetkých jamkách na dosiahnutie rovnomerných a porovnateľných výsledkov lýzy.
- Žiadna krížová kontaminácia prostredníctvom sondy: Vzorky zostávajú počas sonikácie utesnené, čím sa obmedzuje prenos materiálu medzi vzorkami a znižuje počet krokov čistenia.
- Vhodné pre odolné bunky: Ultrazvuk s vysokou intenzitou podporuje rozrušovanie bunkových stien kvasiniek.
- Efektívny pracovný postup: Ideálny na skríning kmeňov, klonov, podmienok expresie a lyzačných pufrov.
- Efektívny pracovný postup: Programovateľné nastavenia, automatizované zaznamenávanie údajov a vhodnosť na laboratórnu automatizáciu.
Aplikácie v biotechnológii kvasiniek a vo výskume v oblasti vied o živote
Ultrazvuková lýza kvasiniek v mikrotitračných platničkách podporuje mnohé výskumné a skríningové pracovné postupy. Pri expresii rekombinantných proteínov možno klony P. pastoris a S. cerevisiae lyzovať paralelne na porovnanie úrovní expresie alebo enzýmovej aktivity. V systémovej biológii a omických disciplínach štandardizovaná lýza zlepšuje porovnateľnosť medzi rôznymi podmienkami. V mikrobiológii sonikácia podporuje rýchlu prípravu lyzátov z viacerých kmeňov, z kultivácií pri rôznych podmienkach média alebo po rôznych stresových ošetreniach.
Medzi typické oblasti použitia patria:
- extrakcia proteínov z kvasiniek
- skríning rekombinantných proteínov
- skríning enzýmovej aktivity
- selekcia klonov po transformácii
- optimalizácia fermentácie
- príprava vzoriek na proteomiku
- príprava vzoriek na metabolomiku
- štúdie narúšania bunkovej steny
- vysokopriepustné mikrobiologické analýzy
Spoľahlivá lýza kvasiniek sa začína riadenou sonikáciou
Lýza kvasiniek môže byť pri rastúcom počte vzoriek náročná, ale sonikátory Hielscher pre mikrotitračné platničky tento proces zrýchľujú, zvyšujú jeho čistotu a reprodukovateľnosť. UIP400MTP a UIP550MTP umožňujú výskumníkom spracovať celé platničky za definovaných ultrazvukových podmienok, čím zvyšujú priepustnosť spracovania vzoriek a zároveň znižujú potrebu manuálnej manipulácie.
Pre mikrobiológov, molekulárnych biológov, vedcov zaoberajúcich sa proteínmi a biotechnologické laboratóriá je sonikácia mikrotitračných platničiek účinným nástrojom na efektívne a reprodukovateľné uvoľňovanie vnútrobunkových zložiek kvasiniek.
Často kladené otázky o lýze kvasinkových buniek sonikáciou mikrotitračných platničiek
Možno kvasinkové bunky lyzovať sonikáciou?
Áno. Kvasinkové bunky, ako sú Saccharomyces cerevisiae a Pichia pastoris, možno lyzovať sonikáciou s vysokou intenzitou. Ultrazvuková kavitácia vytvára silné mechanické šmykové sily, ktoré narúšajú bunkovú stenu a membránu kvasiniek, čím uvoľňujú proteíny, enzýmy, nukleové kyseliny a metabolity.
Prečo sa kvasinkové bunky lyzujú ťažšie než bakteriálne bunky?
Kvasinkové bunky majú hrubú a mechanicky odolnú bunkovú stenu zloženú najmä z glukánov, manoproteínov a chitínu. Táto pevná štruktúra spôsobuje, že kvasinky sa narúšajú ťažšie než mnohé bakteriálne alebo cicavčie bunky. Lýza kvasiniek preto zvyčajne vyžaduje vyššiu intenzitu, dlhšie spracovanie alebo voliteľné enzymatické predspracovanie.
Ktoré sonikátory Hielscher sú vhodné na lýzu kvasiniek v mikrotitračných platničkách?
Hielscher UIP400MTP a UIP550MTP sú vhodné na vysokopriepustnú lýzu kvasiniek v mikrotitračných platničkách. UIP400MTP je ideálny na rutinnú paralelnú prípravu vzoriek, zatiaľ čo UIP550MTP poskytuje vyšší ultrazvukový výkon na náročné lyzačné úlohy, husté suspenzie a odolné kmene kvasiniek.
Možno Pichia pastoris lyzovať v sonikátore pre mikrotitračné platničky?
Áno. Pichia pastoris, známa aj ako Komagataella phaffii, sa dá lyzovať sonikáciou mikrotitračných platničiek s vysokou intenzitou. Keďže P. pastoris môže vytvárať hustú biomasu a má odolnú bunkovú stenu, odporúča sa optimalizácia amplitúdy, pulzného cyklu, chladenia a celkového času sonikácie.
Aké sú typické parametre sonikácie na lýzu kvasiniek?
Vhodný počiatočný rozsah je amplitúda 50–80%, pulzná prevádzka, napríklad 10–30 sekúnd ON a 30–60 sekúnd OFF, a kumulatívny čas vo fáze ON 5–15 minút. Presné parametre závisia od kmeňa kvasiniek, hustoty buniek, objemu vzorky, typu platničky, pufra a cieľovej molekuly.
Prečo by sa lýza kvasiniek mala vykonávať v pulznom režime?
Pulzný režim znižuje hromadenie tepla počas sonikácie. Počas fázy ON ultrazvuková kavitácia narúša bunky. Počas fázy OFF sa vzorka môže ochladzovať. Je to dôležité, pretože nadmerné teplo môže denaturovať proteíny, znížiť enzýmovú aktivitu, degradovať RNA a zhoršiť reprodukovateľnosť.
Je pred sonikáciou kvasinkových buniek potrebné enzymatické predspracovanie?
Enzymatická predúprava nie je vždy potrebná, ale môže zvýšiť účinnosť lýzy. Enzýmy ako Zymolyase alebo Lyticase čiastočne štiepia bunkovú stenu kvasiniek a môžu znížiť intenzitu ultrazvuku alebo skrátiť čas potrebný na úplnú lýzu. To môže byť užitočné pri citlivých proteínoch alebo ťažko rozrušiteľných kmeňoch.
Ako možno zabrániť prehriatiu pri sonikácii kvasiniek?
Používajte vopred vychladené pufre, pulzný režim, prestávky na chladenie a chladenú zostavu na umiestnenie platničky. Mikroplatničku udržiavajte utesnenú a podľa možností monitorujte teplotu. Pri citlivých proteínoch používajte kratšie intervaly zapnutia (ON), dlhšie intervaly vypnutia (OFF) a vzorky spracúvajte za studena.
Môže sonikácia v mikroplatničkách nahradiť mechanické rozrušovanie guľôčkami pri lýze kvasiniek?
V mnohých pracovných postupoch áno. Sonikácia v mikroplatničkách môže nahradiť mechanické rozrušovanie guľôčkami, keď je potrebná čistá, reprodukovateľná a paralelná lýza. Odstraňuje manipuláciu s guľôčkami, znižuje zložitosť práce so spotrebným materiálom a zjednodušuje automatizáciu. Každá aplikácia by sa však mala validovať porovnaním výťažnosti lýzy, integrity proteínov a výkonnosti analytickej metódy.
Je sonikácia v mikroplatničkách vhodná na extrakciu proteínov z kvasiniek?
Áno. Sonikácia v mikroplatničkách je veľmi vhodná na extrakciu proteínov z kvasiniek, najmä keď je potrebné porovnať veľa klonov alebo kultivačných podmienok. Inhibítory proteáz, studené pufre a riadené nastavenia pulzov pomáhajú zachovať kvalitu proteínov.
Možno rovnakú metódu použiť na extrakciu DNA, RNA a proteínov?
Možno použiť rovnaký základný princíp sonikácie, ale pufer a procesné podmienky by sa mali prispôsobiť cieľovej molekule. Pracovné postupy pre proteíny vyžadujú inhibíciu proteáz a reguláciu teploty. Pracovné postupy pre RNA vyžadujú manipuláciu bez prítomnosti RNáz a intenzívne chladenie. Pracovné postupy pre DNA môžu vyžadovať odlišné podmienky lýzy a purifikácie v závislosti od toho, či sa požaduje neporušená genómová DNA alebo fragmentovaná DNA.
Aký typ platničky by sa mal použiť na lýzu kvasiniek?
Použite mikroplatničku alebo platničku s hlbokými jamkami kompatibilnú so sonikáciou a s vhodným utesnením. Platničky s okrúhlym dnom sú často užitočné pri manipulácii so suspenziami. Platnička by mala odolať zvoleným podmienkam sonikácie, teplote vzorky a centrifugačným krokom.
Ako zistím, či je lýza kvasiniek úplná?
Účinnosť lýzy možno overiť mikroskopiou, stanovením výťažku proteínov, enzýmovej aktivity, zníženia viskozity, analýzou SDS-PAGE, stanovením výťažku DNA/RNA alebo porovnaním so známou metódou lýzy. Pri vývoji metódy vyhodnoťte výťažok aj kvalitu uvoľnenej cieľovej molekuly.
UIP400MTP alebo UIP550MTP: Ktorý sonikátor pre mikroplatničky si vybrať?
UIP400MTP je výkonný sonikátor pre mikroplatničky určený na rutinnú vysokokapacitnú prípravu vzoriek vrátane lýzy kvasiniek, extrakcie proteínov, strihového štiepenia DNA, oddeľovania biofilmu a prípravy vzoriek na analýzy. Je vhodný pre laboratóriá, ktoré potrebujú reprodukovateľnú sonikáciu v štandardných formátoch platničiek.
UIP550MTP poskytuje vyšší ultrazvukový výkon a odporúča sa, keď náročnejšie aplikácie vyžadujú vyššiu akustickú intenzitu, kratšie časy spracovania, väčšie množstvá vzoriek alebo razantnejšie podmienky rozrušovania. Pri lýze kvasiniek je UIP550MTP obzvlášť užitočný pre hustú biomasu, ťažko rozrušiteľné kmene, väčšie pracovné objemy a vysokokapacitný skríning expresie.
Možno lýzu kvasiniek sonikáciou v mikroplatničkách automatizovať?
Áno. Sonikácia v mikroplatničkách je veľmi vhodná pre automatizované laboratórne pracovné postupy, pretože vzorky zostávajú vo formáte platničiek. To podporuje integráciu s pipetovacími systémami, manipuláciou s platničkami, centrifugáciou, prípravou vzoriek na analýzy a pracovnými postupmi vysokokapacitného skríningu.
Literatúra / Referencie
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP550MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics 2024.
