Protokol stanovenia minimálnej inhibičnej koncentrácie (MIC)
Stanovenie minimálnej inhibičnej koncentrácie (MIC) na základe biofilmu je nevyhnutnou metódou na hodnotenie účinnosti antimikrobiálnych látok proti mikroorganizmom asociovaným s biofilmom, ktoré vykazujú zvýšenú rezistenciu vďaka svojej ochrannej extracelulárnej matrix. Kľúčovým krokom v tomto stanovení je odtrhnutie štruktúr biofilmu na uvoľnenie zabudovaných buniek pre presné posúdenie životaschopnosti. Sonikátor pre viacdôlkové platne UIP400MTP uľahčuje tento proces použitím zameraného ultrazvuku na generovanie kontrolovanej kavitácie, čím účinne uvoľňuje bunky biofilmu a disperguje ich do homogénnej suspenzie. Toto presné a reprodukovateľné narušenie biofilmu zvyšuje spoľahlivosť a priepustnosť stanovení MIC, čím sa UIP400MTP stáva nevyhnutným nástrojom pri pokroku vo výskume biofilmov.
Prečo by som mal používať sonikáciu počas stanovení MIC?
- Presné, reprodukovateľné údaje: Získajte homogénne bunkové suspenzie, ktoré eliminujú ochranu matrix, čím zabezpečíte, že vaše počty kolónií a merania optickej hustoty skutočne odrážajú antimikrobiálnu účinnosť.
- Vysoká priepustnosť: Spracujte celú 96-dôlkovú platňu súčasne len za 1–3 minúty a nahraďte pomalé, nekonzistentné ručné škrabanie zefektívneným pracovným postupom.
- Zachovaná životaschopnosť buniek: Jemne uvoľnite zabudované bunky bez fyzického poškodenia spôsobeného škrabaním, čím zachováte vyššie miery prežitia pre spoľahlivé výpočty MIC/MBEC.
- Nulové riziko krížovej kontaminácie: Využívajte výhody nedotykovej konštrukcie pohára s rohom, ktorá rovnomerne ošetruje všetky dôlky bez toho, aby sondy kontaktovali jednotlivé vzorky alebo dôlky.
- Súlad so štandardmi: Zosúlaďte svoju metodiku s overenými priemyselnými protokolmi, ako je ASTM E2799-22, čím dodáte svojim údajom väčšiu vierohodnosť na regulačné alebo publikačné účely.
- Spoľahlivé skríningy liekov a liečby: Dôverujte svojim výsledkom citlivosti a prijímajte rozumnejšie rozhodnutia o antimikrobiálnej účinnosti, profilovaní rezistencie alebo terapeutickom vývoji.
Zvýšte výkon svojej laboratória pri zachovaní životaschopnosti buniek. Povedzte nám typ svojej mikroplatne a získajte odporúčania pre efektívne odtrhnutie biofilmu a disperziu buniek pomocou vysokopriepustnej sonikácie.
Sonikátor mikroplatní UIP400MTP pre presne kontrolovateľné odtrhnutie biofilmu pri stanoveniach MIC a MBEC.
Sonikácia na odtrhnutie biofilmu
Stanovenie MIC na základe biofilmu zvyčajne meria životaschopnosť baktérií alebo inhibíciu rastu pomocou metód, ako je kultivácia na platniach, počítanie kolónií alebo meranie optickej hustoty. Sonikácia je kritickým krokom v stanoveniach MIC na základe biofilmu pri hodnotení antimikrobiálnej citlivosti mikroorganizmov asociovaných s biofilmom. Jej primárnou funkciou je odtrhnúť a dispergovať bunky zabudované v matrix biofilmu do homogénnej suspenzie pre presnú analýzu.
Biofilmy sú výrazne odolnejšie voči antimikrobiálnym látkam v porovnaní s planktonickými bunkami, čo robí správne odtrhnutie kritickým pre presnú analýzu. Počas tohto procesu ultrazvukové vlny generujú kontrolovanú kavitáciu, ktorá rozrušuje matrix biofilmu a uvoľňuje zabudované bunky do homogénnej suspenzie v regeneračnom médiu. Tento krok umožňuje presné posúdenie životaschopnosti buniek dispergovaných z biofilmu pomocou metód, ako je kultivácia na platniach, riedenie a počítanie kolónií. Správne narušenie biofilmu prostredníctvom sonikácie zabraňuje tomu, aby zvyškové zložky matrix chránili bunky, čo by inak mohlo viesť k podhodnoteniu antimikrobiálnej aktivity. Sonikátor pre viacdôlkové platne UIP400MTP je na tento účel obzvlášť vhodný a ponúka presné a reprodukovateľné podmienky sonikácie na zabezpečenie spoľahlivej a vysokopriepustnej prípravy analytických platní.
Prečo je sonikácia nevyhnutná pri stanoveniach minimálnej inhibičnej koncentrácie na základe biofilmu
Pre merania životaschopnosti a počítanie buniek je potrebné úplné a spoľahlivé odtrhnutie a disperzia jednotlivých buniek. UIP400MTP podporuje homogénne, nepoškodzujúce odtrhnutie biofilmu a disperziu buniek pre robustné výsledky stanovenia.
- Komplexnosť biofilmu: Biofilmy sú štruktúrované mikrobiálne komunity obalené v matrici extracelulárnych polymérnych látok (EPS), ktorá chráni mikroorganizmy a robí ich odolnejšími voči antimikrobiálnym látkam.
- Jednotné rozptýlenie: Na presné meranie životaschopnosti buniek zabudovaných v biofilme alebo ich citlivosti na antimikrobiálne látky musí byť biofilm najprv uvoľnený a rozložený na homogénnu suspenziu.
Zatiaľ čo štandardný test MIC meria rezistenciu planktonických buniek, sonikácia je nevyhnutná pri testoch Biofilm-MIC a MBEC na zabezpečenie správneho obnovenia počiatočného stavu buniek.
Protokol testu minimálnej inhibičnej koncentrácie (MIC) založený na biofilmoch
Test minimálnej inhibičnej koncentrácie (MIC) určuje najnižšiu koncentráciu antimikrobiálnej látky potrebnú na inhibíciu viditeľného rastu mikroorganizmov. Tento protokol je určený pre mikroorganizmy asociované s biofilmom a na narušenie biofilmu využíva sonikátor viacdôlkových platní UIP400MTP.
Krok 1: Príprava bakteriálneho inokula
- Pripravte bakteriálnu suspenziu:
Pestujte baktérie v vhodných médiách do strednej logaritmickej fázy.
Zriedte kultúru na dosiahnutie štandardizovanej hustoty buniek (napr. 0,5 McFarlandov štandard alebo OD600 ~0,1). - Pripravte antimikrobiálne roztoky:
Zriedte antimikrobiálnu látku vo vhodnom médiu na vytvorenie rozsahu koncentrácií (napr. dvojnásobné sériové riedenia). - Naplnite do 96-dôlkovej platne:
Pridajte antimikrobiálne roztoky do dôlok štandardnej 96-dôlkovej platne s konečným objemom v dôlke ~150–200 µL.
Zahrňte rastové kontroly (bez antimikrobiálnej látky) a sterilitné kontroly (bez bakteriálneho inokula).
Krok 2: Tvorba biofilmu na viečku s kolíkmi
- Nasaďte viečku s kolíkmi:
Umiestnite špecializovanú viečku s kolíkmi na inokulované dôlky a uistite sa, že kolíky sú úplne ponorené v bakteriálnej suspenzii. - Inkubujte platňu:
Inkubujte pri vhodnej teplote (napr. 37°C) po stanovenú dobu (napr. 24 hodín) za statických podmienok, aby sa umožnila tvorba biofilmu na kolíkoch. - Opláchnite kolíky:
Vyberte viečku s kolíkmi z bakteriálnej suspenzie a jemne ju opláchnite v sterilnom fyziologickom roztoku alebo PBS na odstránenie voľne viazaných planktonických buniek. - Exponujte antimikrobiálnym látkam:
Preneste viečku s kolíkmi do novej 96-dôlkovej platne obsahujúcej antimikrobiálne riedenia pripravené skôr.
Inkubujte po definovanú dobu (napr. 24 hodín) za statických podmienok, aby antimikrobiálna látka pôsobila na biofilmy.
Krok 3: Expozícia antimikrobiálnym látkam
Sonikátor viacdôlkových platní UIP400MTP pre vysokokapacitnú prípravu vzoriek
Krok 4: Sonikácia pomocou sonikátora mikrotitračných platní UIP400MTP
Krok sonikácie je kritický na uvoľnenie biofilmov z viečok s kolíkmi na posúdenie životaschopnosti. Postupujte podľa týchto krokov pre sonikátor UIP400MTP:
- Pripravte nastavenie:
Naplnite čerstvú 96-dôlkovú platňu regeneračným médiom (napr. neutralizačným bujónom alebo sterilným rastovým médiom) do každej dôlky. - Preneste viečku s kolíkmi:
Vyberte viečku s kolíkmi z platne s antimikrobiálnou liečbou.
Opláchnite viečku s kolíkmi v sterilnom fyziologickom roztoku alebo PBS na odstránenie zvyšných antimikrobiálnych látok. - Umiestnite platňu do sonikátora:
Nasaďte viečku s kolíkmi na platňu s regeneračným médiom.
Vložte platňu s regeneračným médiom do sonikátora UIP400MTP a uistite sa, že platňa je centrovaná a stabilná podľa popisu v návode. - Nastavte parametre sonikácie:
Nastavte parametre sonikácie na UIP400MTP (nastavenia môžu byť prispôsobené biofilmu):
Amplitúda: 70–100 %.
Čas sonikácie: 1–3 minúty (prispôsobte podľa štruktúry biofilmu) v cyklickom režime. - Sonikujte:
Spustite proces sonikácie. Ultrazvukové vlny narušia matricu biofilmu a uvoľnia bunky do regeneračného média. - Monitorujte proces:
Použite odpojitelný teplotný senzor na monitorovanie teploty vzorky v dôlkach. UIP400MTP môže byť pripojený k laboratórnemu chladeniu na chladenie. - Manipulácia po sonikácii:
Okamžite preneste regeneračné médium obsahujúce uvoľnené biofilmy do čerstvej sterilnej platne na následnú analýzu.
(A) Miska obsahujúca TSB s 2 % glukózy použitá na tvorbu biofilmu, obnovu buniek a stanovenie MIC a MBEC; (B) Kryt s kolíkmi na tvorbu stafylokokových biofilmov.
Bunky biofilmu vytvorené na kolíkoch boli uvoľnené sonikáciou (Hielscher Ultrasound Technology) počas 5 minút v 96-jamkových miskách obsahujúcich čerstvé kultivačné médium na obnovu buniek.
(Obrázok a štúdia: ©de Oliveira et al., 2016)
Krok 4: Posúdenie životaschopnosti
Naneste a kultivujte uvoľnené biofilmy:
- Vykonajte sériové riedenie obnovovacieho média a naneste na agar na enumeráciu kolónie tvoriacich jednotiek (CFU).
- Vyhodnoťte MIC:
Určite MIC ako najnižšiu koncentráciu antimikrobiálneho činidla, ktorá úplne inhibuje viditeľný mikrobiálny rast v obnovovacom médiu.
Prejdite na presnú bezkontaktnú sonikáciu, aby ste zabezpečili uniformnú bunkovú suspenziu a dôveryhodné výsledky MIC!
Kto má prospech zo sonikácie počas testov MIC?
- Výrobcovia zdravotníckych pomôcok: Na testovanie účinnosti povrchových náterov a validáciu čistiacich protokolov pre zariadenia náchylné na tvorbu biofilmov.
- Klinickí mikrobiológovia: Na presnú diagnostiku infekcií spojených s implantátmi (ako je PJI) obnovou baktérií z medicínskych hardvérových komponentov.
- Farmaceutickí vývojári: Na vyhodnotenie účinnosti nových antimikrobiálnych činidiel proti odolným patogénom zabudovaným v biofilme.
- Akademickí výskumníci: Na vykonávanie vysoko priepustných, reprodukovateľných štúdií o biológii biofilmov a mechanizmoch antimikrobiálnej rezistencie.
- Tímy priemyselnej kontroly kvality: Na posúdenie biofoulingu a účinnosti dezinfekčných prostriedkov v priemyselných prostrediach (napr. s použitím noriem ASTM E2799-22).
Návrh, výroba a poradenstvo – Kvalita Made in Germany
Hielscher ultrasonifikátory sú známe svojou najvyššou kvalitou a dizajnovými štandardmi. Robustnosť a jednoduchá prevádzka umožňujú hladkú integráciu našich ultrasonifikátorov do priemyselných zariadení. Hielscher sonifikátory ľahko zvládajú drsné podmienky a náročné prostredia.
Hielscher Ultrasonics je spoločnosťou s certifikátom ISO a kladie osobitný dôraz na vysokovýkonné ultrasonifikátory s najmodernejšou technológiou a používateľskou prívetivosťou. Samozrejme, Hielscher ultrasonifikátory sú v súlade s CE a spĺňajú požiadavky UL, CSA a RoHs.
Zefektívniť prípravu vzoriek v 96-jamkových miskách a miskách na testy pomocou sonifikátora viacerých jamiek UIP400MTP
Literatúra / Referencie
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Často kladené otázky
Čo je test MIC?
Test minimálnej inhibičnej koncentrácie (MIC) je štandardizovaný test používaný na určenie najnižšej koncentrácie antimikrobiálneho činidla potrebnej na inhibíciu viditeľného rastu mikroorganizmu. Bežne sa vykonáva pomocou metód mikroriedenia v bujone alebo riedenia v agare, kde sú mikroorganizmy vystavené sériovým riedeniam antimikrobiálneho činidla. Testy MIC sú kritické pre hodnotenie antimikrobiálnej účinnosti, usmerňovanie klinickej liečby a posudzovanie úrovne rezistencie u planktonických aj biofilmom asociovaných mikroorganizmov.
Aký je rozdiel medzi testom minimálnej inhibičnej koncentrácie založeným na biofilme a testom MBIC?
Biofilm-based Minimum Inhibitory Concentration (MIC) assay and Minimum Biofilm Inhibitory Concentration (MBIC) assay are related but distinct in their purpose and methodology.
Test MIC na báze biofilmu hodnotí najnižšiu koncentráciu antimikrobiálneho činidla potrebného na inhibíciu viditeľného rastu alebo životaschopnosti biofilmu, pričom sa zameriava skôr na bunky spojené s biofilmom ako na planktónové baktérie. Naproti tomu test MBIC špecificky meria schopnosť antimikrobiálneho činidla zabrániť tvorbe biofilmu, a nie liečiť vopred vytvorené biofilmy. Zatiaľ čo oba testy sa zaoberajú baktériami spojenými s biofilmom, test MIC na báze biofilmu sa zaoberá liečbou a test MBIC kladie dôraz na prevenciu, čo z nich robí doplnkové nástroje na štúdium antimikrobiálnej účinnosti proti biofilmom.
What Biofilms are Used in MIC Assays?
Mikrobiálne biofilmy a planktónové bunky sa používajú v testoch minimálnej inhibičnej koncentrácie (MIC) na štúdium antimikrobiálnej účinnosti za rôznych podmienok.
- Planktonic Cells:
Planktónové bunky sú voľne plávajúce, jednotlivé mikrobiálne bunky, ktoré slúžia ako štandardný model pre tradičné testy MIC. Medzi bežné mikroorganizmy patria Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus a Candida albicans. Tieto testy určujú MIC potrebný na inhibíciu rastu voľne žijúcich buniek a sú rozhodujúce pre počiatočný antimikrobiálny skríning. - Biofilm-Associated Cells:
Biofilmové bunky sú mikroorganizmy uložené v extracelulárnej matrici, čo výrazne zvyšuje ich odolnosť voči antimikrobiálnym látkam. Testy biofilmu MIC často zahŕňajú:- Gramnegatívne baktérie: Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa a Klebsiella pneumoniae, známe tvorbou biofilmu pri infekciách a priemyselnom prostredí.
- Grampozitívne baktérie: Staphylococcus aureus (vrátane MRSA), Staphylococcus epidermidis a Enterococcus faecalis, ktoré sa bežne podieľajú na infekciách súvisiacich so zariadením.
- Huby: Candida albicans a príbuzné druhy, dôležité pri plesňových infekciách súvisiacich s biofilmom.
- Biofilmy zmiešaných druhov: Niekedy sa používajú na replikáciu prírodných polymikrobiálnych biofilmov, ako sú tie, ktoré sa nachádzajú v chronických ranách alebo priemyselnom biologickom znečistení.
Porovnaním hodnôt MIC pre planktónové bunky a bunky spojené s biofilmom môžu vedci posúdiť zvýšenú rezistenciu biofilmov a identifikovať látky účinné proti týmto odolnejším mikrobiálnym komunitám.
Aký je rozdiel medzi MIC a MBEC?
Minimálna inhibičná koncentrácia (MIC) je najnižšia koncentrácia antimikrobiálneho činidla potrebná na zabránenie tvorby biofilmu, zatiaľ čo minimálna koncentrácia eradikačného biofilmu (MBEC) je najnižšia koncentrácia potrebná na eradikáciu zavedeného biofilmu. MIC sa zameriava na prevenciu biofilmu, zatiaľ čo MBEC hodnotí účinnosť liečby proti zrelým biofilmom.
Aké platne sa bežne používajú na testy MBEC?
Mikrotitračné platne bežne používané na testy MBEC sú zvyčajne 96-jamkové platne vyrobené z polystyrénu alebo polypropylénu. Tieto materiály poskytujú vhodný povrch na tvorbu biofilmu a sú chemicky odolné voči antimikrobiálnym látkam testovaným počas testu. Polystyrénové platne sú široko preferované kvôli ich optickej čistote, čo je výhodné pre následné analýzy, ako sú spektrofotometrické alebo fluorescenčné merania. Konštrukcia týchto platní zahŕňa odnímateľné kolíkové viečka, ktoré sú nevyhnutné pre test, pretože na kolíkoch, ktoré sú ponorené do jamiek obsahujúcich rastové médium, sa tvoria biofilmy. Štandardizované platne, ako sú tie, ktoré sú v súlade s testovacím protokolom MBEC, sú špeciálne navrhnuté tak, aby zabezpečili reprodukovateľnosť a kompatibilitu s UIP400MTP sonikátorom alebo iným spracovateľským zariadením.
What are PEG-Lid Plates?
Dosky s PEG viečkami sú špecializované systémy viacdôlkových platní, kde je viečko vybavené malými kolíkmi alebo čapmi z polyetylénglykolu (PEG) zasahujúcimi do každej dôlky. Tieto kolíky poskytujú povrch na tvorbu mikrobiálnych biofilmov za kontrolovaných podmienok, čím imitujú rast biofilmov v reálnom svete. Konštrukcia umožňuje, aby sa biofilmy vyvíjali na kolíkoch, zatiaľ čo dôlky obsahujú rastové média alebo antimikrobiálne látky, čo umožňuje vysokokapacitné testovanie citlivosti biofilmov na liečby, ako je tomu pri stanoveniach MBEC, MBIC a MIC.
Aká je výhoda ultrazvukového odstraňovania biofilmov v porovnaní so škrabaním buniek?
Ultrazvukové odstraňovanie biofilmov ponúka významnú výhodu oproti škrabaniu buniek tým, že poskytuje neinvazívnu, uniformnú a vysoko účinnú metódu na odstraňovanie biofilmov z povrchov. Na rozdiel od škrabania, ktoré môže byť nekonzistentné a poškodiť podkladový povrch alebo bunky, ultrazvukové vlny prenikajú do matrice biofilmu a rozrušujú ju bez toho, aby narušili integritu susedných štruktúr. Táto metóda zabezpečuje reprodukovateľnosť, minimalizuje riziko kontaminácie a je obzvlášť účinná pri aplikáciách vyžadujúcich presné odstránenie biofilmu, ako sú mikrobiologické štúdie alebo testovanie zdravotníckych pomôcok. Prečítajte si viac o tom, ako sonikátor UIP400MTP predčí škrabanie buniek!
Hielscher Ultrasonics vyrába vysokovýkonné ultrazvukové homogenizátory od laboratórnej po priemyselnú veľkosť.
