Protokol testu minimálnej inhibičnej koncentrácie (MIC)
Test minimálnej inhibičnej koncentrácie (MIC) na báze biofilmu je základnou metódou na hodnotenie účinnosti antimikrobiálnych látok proti mikroorganizmom spojeným s biofilmom, ktoré vykazujú zvýšenú rezistenciu vďaka svojej ochrannej extracelulárnej matrici. Rozhodujúcim krokom v tomto teste je narušenie štruktúr biofilmu s cieľom uvoľniť vložené bunky na presné posúdenie životaschopnosti. Viacjamkový doštičkový sonikátor UIP400MTP uľahčuje tento proces tým, že využíva sústredený ultrazvuk na generovanie riadenej kavitácie, účinne oddeľuje bunky biofilmu a rozptyľuje ich do rovnomernej suspenzie. Toto presné a reprodukovateľné narušenie biofilmu zvyšuje spoľahlivosť a priepustnosť testov MIC, vďaka čomu je UIP400MTP základným nástrojom pri pokroku vo výskume biofilmu.
Sonikácia na oddelenie biofilmu
Test MIC na báze biofilmu zvyčajne meria životaschopnosť baktérií alebo inhibíciu rastu pomocou metód, ako je pokovovanie, počítanie kolónií alebo meranie optickej hustoty. Sonikácia je kritickým krokom v testoch MIC na báze biofilmu pri hodnotení antimikrobiálnej citlivosti mikroorganizmov spojených s biofilmom. Jeho primárnou funkciou je oddeliť a rozptýliť bunky vložené do matrice biofilmu do rovnomernej suspenzie pre presnú analýzu.
Biofilmy sú výrazne odolnejšie voči antimikrobiálnym látkam v porovnaní s planktónovými bunkami, takže správne oddelenie je rozhodujúce pre presnú analýzu. Počas tohto procesu ultrazvukové vlny vytvárajú riadenú kavitáciu, rozbíjajú matricu biofilmu a uvoľňujú vložené bunky do rovnomernej suspenzie v regeneračnom médiu. Tento krok umožňuje presné posúdenie životaschopnosti buniek dispergovaných v biofilme pomocou metód, ako je pokovovanie, riedenie a počítanie kolónií. Správne narušenie biofilmu pomocou sonikácie zabraňuje zvyškovým zložkám matrice chrániť bunky, čo by inak mohlo viesť k podhodnoteniu antimikrobiálnej aktivity. Na tento účel je obzvlášť vhodný UIP400MTP sonikátor s viacjamkovými doštičkami, ktorý ponúka presné a reprodukovateľné podmienky sonikácie na zabezpečenie spoľahlivej a vysokovýkonnej prípravy testovacích platní.
UIP400MTP sonikátor mikrodoštičiek pre presne kontrolovateľné oddelenie biofilmu v testoch MIC a MBEC.
Prečo je sonikácia potrebná pri testoch minimálnej inhibitronej koncentrácie na báze biofilmu
Na meranie životaschopnosti a počítanie buniek je potrebné úplné a spoľahlivé oddelenie a rozptýlenie jednotlivých buniek. UIP400MTP podporuje rovnomerné, nepoškodzujúce oddelenie biofilmu a bunkovú disperziu pre robustné výsledky testu.
- Zložitosť biofilmu: Biofilmy sú štruktúrované mikrobiálne spoločenstvá uzavreté v matrici extracelulárnej polymérnej látky (EPS), ktorá chráni mikroorganizmy a zvyšuje ich odolnosť voči antimikrobiálnym látkam.
- Rovnomerný rozptyl: Na presné meranie životaschopnosti buniek vložených do biofilmu alebo ich náchylnosti na antimikrobiálne látky sa biofilm musí najskôr uvoľniť a rozložiť na homogénnu suspenziu.
Protokol o stanovení minimálnej inhibičnej koncentrácie na báze biofilmu
Test minimálnej inhibičnej koncentrácie (MIC) určuje najnižšiu koncentráciu antimikrobiálneho činidla potrebnú na inhibíciu viditeľného rastu mikroorganizmov. Tento protokol je určený pre mikroorganizmy spojené s biofilmom, pričom na narušenie biofilmu sa používa UIP400MTP sonikátor s viacjamkovými platňami.
Krok 1: Príprava bakteriálneho inokula
- Pripravte bakteriálnu suspenziu:
Pestujte baktérie vo vhodných médiách do strednej logaritmickej fázy.
Zrieďte kultúru, aby ste dosiahli štandardizovanú hustotu buniek (napr. 0,5 McFarlandovho štandardu alebo OD600 ~ 0,1). - Pripravte antimikrobiálne roztoky:
Antimikrobiálne činidlo sa zriedi vo vhodnom médiu, aby sa vytvoril rozsah koncentrácií (napr. dvojité sériové riedenia). - Dávkovajte do 96jamkovej platne:
Pridajte antimikrobiálne roztoky do jamiek štandardnej 96-jamkovej platne s konečným objemom jamiek ~150–200 μl.
Zahŕňajú kontrolu rastu (bez antimikrobiálnych látok) a kontrolu sterility (bez bakteriálneho inokula).
Krok 2: Tvorba biofilmu na veku kolíka
- Nasaďte veko kolíka:
Umiestnite špecializované veko kolíka na naočkované jamky a uistite sa, že kolíky sú úplne ponorené v bakteriálnej suspenzii. - Inkubujte tanier:
Inkubujte pri vhodnej teplote (napr. 37 °C) počas stanoveného obdobia (napr. 24 hodín) za statických podmienok, aby sa umožnila tvorba biofilmu na kolíkoch. - Opláchnite kolíky:
Odstráňte viečko kolíčka z bakteriálnej suspenzie a jemne opláchnite sterilným fyziologickým roztokom alebo PBS, aby ste odstránili voľne pripojené planktónové bunky. - Vystavte antimikrobiálnym látkam:
Preneste veko kolíka do novej 96jamkovej platne obsahujúcej predtým pripravené antimikrobiálne riedenia.
Inkubujte po stanovenú dobu (napr. 24 hodín) za statických podmienok, aby antimikrobiálne činidlo mohlo pôsobiť na biofilmy.
Krok 3: Expozícia antimikrobiálnym látkam
Viacjamkový doštičkový sonikátor UIP400MTP na vysokovýkonnú prípravu vzoriek
Krok 4: Sonikácia pomocou Microplate Sonicator UIP400MTP
Krok sonikácie je rozhodujúci pre oddelenie biofilmov z viečok kolíkov na posúdenie životaschopnosti. Pre UIP400MTP sonikátor postupujte podľa týchto krokov:
- Pripravte nastavenie:
Naplňte čerstvú 96-jamkovú platňu regeneračným médiom (napr. neutralizačným vývarom alebo sterilným rastovým médiom) do každej jamky. - Preneste veko kolíka:
Odstráňte veko kolíka z antimikrobiálnej ošetrovacej dosky.
Opláchnite veko kolíka v sterilnom fyziologickom roztoku alebo PBS, aby ste odstránili zvyšky antimikrobiálnych látok. - Umiestnite platňu do sonikátora:
Pripevnite veko kolíka k doske regeneračného média.
Vložte dosku regeneračného média do UIP400MTP sonikátora a uistite sa, že doska sedí v strede a stabilne, ako je popísané v návode. - Upravte parametre sonikácie:
Parametre sonikácie nastavte na UIP400MTP (nastavenia je možné upraviť podľa biofilmu):
Amplitúda: 70–100%.
Čas sonikácie: 1–3 minúty (upravte na základe štruktúry biofilmu) v režime cyklu. - Sonikujte:
Spustite proces sonikácie. Ultrazvukové vlny narušia matricu biofilmu a uvoľnia bunky do regeneračného média. - Sledujte proces:
Pomocou zásuvného snímača teploty monitorujte teplotu vzorky v jamkách. UIP400MTP je možné pripojiť k laboratórnemu chladiču na chladenie. - Manipulácia po sonikácii:
Regeneračné médium obsahujúce oddelené biofilmy sa ihneď prenesie do čerstvej sterilnej platne na následnú analýzu.
(A) platňa obsahujúca TSB s 2 % glukózy používaná na tvorbu biofilmu, regeneráciu buniek a stanovenie MIC a MBEC; (B) Veko s kolíkmi na tvorbu stafylokokových biofilmov.
Biofilmové bunky vytvorené na kolíkoch boli uvoľnené sonikáciou (Hielscher Ultrasound Technology) na 5 minút v 96-jamkových platniach obsahujúcich čerstvé kultivačné médium na obnovu buniek.
(Obrázok a štúdia: ©de Oliveira a kol., 2016)
Krok 4: Posúdenie životaschopnosti
Biofilmy oddelené od platní a kultúry:
- Vykonajte sériové riedenia regeneračného média a platne na agar, aby ste vymenovali jednotky tvoriace kolónie (CFU).
- Vyhodnoťte MIC:
Určte MIC ako najnižšiu antimikrobiálnu koncentráciu, ktorá úplne inhibuje viditeľný mikrobiálny rast v regeneračnom médiu.
Dizajn, výroba a poradenstvo – Kvalita vyrobená v Nemecku
Ultrazvukové prístroje Hielscher sú známe svojou najvyššou kvalitou a dizajnovými štandardmi. Robustnosť a jednoduchá obsluha umožňujú bezproblémovú integráciu našich ultrazvukových prístrojov do priemyselných zariadení. Drsné podmienky a náročné prostredie ľahko zvládnu sonikátory Hielscher.
Hielscher Ultrasonics je spoločnosť s certifikáciou ISO a kladie osobitný dôraz na vysokovýkonné ultrazvukové prístroje s najmodernejšou technológiou a užívateľskou prívetivosťou. Ultrazvukové prístroje Hielscher sú samozrejme v súlade s CE a spĺňajú požiadavky UL, CSA a RoHs.
Zefektívnenie prípravy vzoriek v 96-jamkových platniach a testovacích platniach Použitie viacjamkového doštičkového sonikátora UIP400MTP
Literatúra / Referencie
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
často kladené otázky
Čo je test MIC?
Test minimálnej inhibičnej koncentrácie (MIC) je štandardizovaný test používaný na stanovenie najnižšej koncentrácie antimikrobiálneho činidla potrebného na inhibíciu viditeľného rastu mikroorganizmu. Bežne sa vykonáva pomocou metód mikroriedenia bujónu alebo riedenia agaru, kde sú mikroorganizmy vystavené sériovému riedeniu antimikrobiálneho činidla. Testy MIC sú rozhodujúce pre hodnotenie antimikrobiálnej účinnosti, usmerňovanie klinickej liečby a hodnotenie úrovní rezistencie u mikroorganizmov spojených s planktónom aj biofilmom.
Aký je rozdiel medzi testom minimálnej inhibičnej koncentrácie na báze biofilmu a testom MBIC?
Test minimálnej inhibičnej koncentrácie (MIC) na báze biofilmu a test minimálnej inhibičnej koncentrácie biofilmu (MBIC) spolu súvisia, ale líšia sa svojím účelom a metodikou.
Test MIC na báze biofilmu hodnotí najnižšiu koncentráciu antimikrobiálneho činidla potrebného na inhibíciu viditeľného rastu alebo životaschopnosti biofilmu, pričom sa zameriava skôr na bunky spojené s biofilmom ako na planktónové baktérie. Naproti tomu test MBIC špecificky meria schopnosť antimikrobiálneho činidla zabrániť tvorbe biofilmu, a nie liečiť vopred vytvorené biofilmy. Zatiaľ čo oba testy sa zaoberajú baktériami spojenými s biofilmom, test MIC na báze biofilmu sa zaoberá liečbou a test MBIC kladie dôraz na prevenciu, čo z nich robí doplnkové nástroje na štúdium antimikrobiálnej účinnosti proti biofilmom.
Aké biofilmy sa používajú v testoch MIC?
Mikrobiálne biofilmy a planktónové bunky sa používajú v testoch minimálnej inhibičnej koncentrácie (MIC) na štúdium antimikrobiálnej účinnosti za rôznych podmienok.
- Planktónové bunky:
Planktónové bunky sú voľne plávajúce, jednotlivé mikrobiálne bunky, ktoré slúžia ako štandardný model pre tradičné testy MIC. Medzi bežné mikroorganizmy patria Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus a Candida albicans. Tieto testy určujú MIC potrebný na inhibíciu rastu voľne žijúcich buniek a sú rozhodujúce pre počiatočný antimikrobiálny skríning. - Bunky spojené s biofilmom:
Biofilmové bunky sú mikroorganizmy uložené v extracelulárnej matrici, čo výrazne zvyšuje ich odolnosť voči antimikrobiálnym látkam. Testy biofilmu MIC často zahŕňajú:- Gramnegatívne baktérie: Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa a Klebsiella pneumoniae, známe tvorbou biofilmu pri infekciách a priemyselnom prostredí.
- Grampozitívne baktérie: Staphylococcus aureus (vrátane MRSA), Staphylococcus epidermidis a Enterococcus faecalis, ktoré sa bežne podieľajú na infekciách súvisiacich so zariadením.
- Huby: Candida albicans a príbuzné druhy, dôležité pri plesňových infekciách súvisiacich s biofilmom.
- Biofilmy zmiešaných druhov: Niekedy sa používajú na replikáciu prírodných polymikrobiálnych biofilmov, ako sú tie, ktoré sa nachádzajú v chronických ranách alebo priemyselnom biologickom znečistení.
Porovnaním hodnôt MIC pre planktónové bunky a bunky spojené s biofilmom môžu vedci posúdiť zvýšenú rezistenciu biofilmov a identifikovať látky účinné proti týmto odolnejším mikrobiálnym komunitám.
Aký je rozdiel medzi MIC a MBEC?
Minimálna inhibičná koncentrácia (MIC) je najnižšia koncentrácia antimikrobiálneho činidla potrebná na zabránenie tvorby biofilmu, zatiaľ čo minimálna koncentrácia eradikačného biofilmu (MBEC) je najnižšia koncentrácia potrebná na eradikáciu zavedeného biofilmu. MIC sa zameriava na prevenciu biofilmu, zatiaľ čo MBEC hodnotí účinnosť liečby proti zrelým biofilmom.
Aké platne sa bežne používajú na testy MBEC?
Mikrotitračné platne bežne používané na testy MBEC sú zvyčajne 96-jamkové platne vyrobené z polystyrénu alebo polypropylénu. Tieto materiály poskytujú vhodný povrch na tvorbu biofilmu a sú chemicky odolné voči antimikrobiálnym látkam testovaným počas testu. Polystyrénové platne sú široko preferované kvôli ich optickej čistote, čo je výhodné pre následné analýzy, ako sú spektrofotometrické alebo fluorescenčné merania. Konštrukcia týchto platní zahŕňa odnímateľné kolíkové viečka, ktoré sú nevyhnutné pre test, pretože na kolíkoch, ktoré sú ponorené do jamiek obsahujúcich rastové médium, sa tvoria biofilmy. Štandardizované platne, ako sú tie, ktoré sú v súlade s testovacím protokolom MBEC, sú špeciálne navrhnuté tak, aby zabezpečili reprodukovateľnosť a kompatibilitu s UIP400MTP sonikátorom alebo iným spracovateľským zariadením.
Čo sú to dosky PEG-Veko?
Dosky s vekom PEG sú špecializované systémy s viacerými jamkami, kde je veko vybavené malými kolíkami alebo kolíkmi s polyetylénglykolom (PEG) siahajúcimi do každej jamky. Tieto kolíky poskytujú povrch pre tvorbu mikrobiálneho biofilmu za kontrolovaných podmienok a napodobňujú rast biofilmu v reálnom svete. Konštrukcia umožňuje vývoj biofilmov na kolíkoch, zatiaľ čo jamky obsahujú rastové médiá alebo antimikrobiálne látky, čo umožňuje vysokovýkonné testovanie citlivosti biofilmu na ošetrenie, ako sú testy MBEC, MBIC a MIC.
Aká je výhoda ultrazvukového uvoľňovania biofilmu v porovnaní so zoškrabovaním buniek?
Ultrazvukové uvoľňovanie biofilmu ponúka významnú výhodu oproti zoškrabovaniu buniek tým, že poskytuje neinvazívnu, rovnomernú a vysoko účinnú metódu odstraňovania biofilmov z povrchov. Na rozdiel od škrabania, ktoré môže byť nekonzistentné a poškodiť podkladový povrch alebo bunky, ultrazvukové vlny prenikajú do matrice biofilmu a rozbíjajú ju bez toho, aby bola narušená integrita susedných štruktúr. Táto metóda zaisťuje reprodukovateľnosť, minimalizuje riziko kontaminácie a je obzvlášť účinná v aplikáciách vyžadujúcich presné odstránenie biofilmu, ako sú mikrobiologické štúdie alebo testovanie zdravotníckych pomôcok. Prečítajte si viac, ako UIP400MTP Sonicator vyniká zoškrabovaním buniek!
Spoločnosť Hielscher Ultrasonics vyrába vysokovýkonné ultrazvukové homogenizátory od laboratórium do priemyselná veľkosť.


