Protokol MBEC Assay Protocol využívajúci 96-jamkový zvukový UIP400MTP
Test MBEC sa používa na stanovenie koncentrácie antimikrobiálnych látok potrebných na odstránenie biofilmov vytvorených na viečkach kolíkov. Na posúdenie životaschopnosti biofilmu sa biofilmy musia najskôr oddeliť od kolíkových viečok 96-jamkovej platne. Sonikácia je najspoľahlivejšou a najúčinnejšou metódou pre toto oddelenie. Viacjamkový doštičkový sonikátor UIP400MTP je špeciálne navrhnutý na spracovanie testovacích dosiek s maximálnou účinnosťou a pohodlím, zefektívňujúc a urýchľujúc vysokovýkonné testy MBEC.
Sonikácia na oddelenie biofilmu
Sonikácia je kľúčovým krokom v testoch minimálnej koncentrácie eradikacie biofilmu (MBEC), ktorý umožňuje efektívne vytlačenie buniek biofilmu z ich povrchového pripojenia. Biofilmy sú vo svojej podstate štruktúrované spoločenstvá mikroorganizmov uzavreté v extracelulárnej matrici, čo ich robí výrazne odolnejšími voči antimikrobiálnym látkam v porovnaní s planktónovými bunkami. Počas testov MBEC sonikácia využíva ultrazvukové vlny na generovanie riadenej kavitácie, narúša matricu biofilmu a uvoľňuje vložené bunky do suspenzie. Tento krok zaisťuje, že bunky biofilmu sú rovnomerne rozptýlené v regeneračnom médiu, čo uľahčuje presné hodnotenie životaschopnosti pomocou pokovovania, riedenia alebo spektrofotometrických metód. Bez správneho oddelenia biofilmu by zvyškové zložky matrice mohli chrániť bunky, čo by viedlo k podhodnoteniu antimikrobiálnej účinnosti. Preto je sonikácia nevyhnutná na získanie spoľahlivých a reprodukovateľných hodnôt MBEC, ktoré odrážajú skutočný eradikačný potenciál testovaných látok. Viacjamkový doštičkový sonikátor UIP400MTP umožňuje jednoduchú vysokovýkonnú prípravu vzoriek v testovacích platniach.
Viacjamkový doštičkový sonikátor UIP400MTP uľahčuje vysokovýkonnú prípravu vzoriek v testovacích doskách.
Protokol o stanovení minimálnej koncentrácie eradikacie biofilmu (MBEC)
Krok 1: Tvorba biofilmu
- Pripravte bakteriálnu suspenziu:
Pestujte baktérie vo vhodných médiách, aby ste zaznamenali rast fázy.
Bakteriálna kultúra sa zriedi na definovanú optickú hustotu (napr. OD600 ~ 0,1). - Naočkujte 96-jamkovú platňu:
Pridajte bakteriálnu suspenziu (napr. 150–200 μl) do každej jamky štandardnej 96-jamkovej mikrotitračnej platničky. - Nasaďte veko kolíka:
Umiestnite veko kolíka na naočkovanú platňu, aby sa na povrchoch kolíkov vytvoril biofilm. - Inkubujte tanier:
Inkubujte zariadenie pri vhodnej teplote (napr. 37 °C) po dobu 24 – 48 hodín bez pretrepávania, aby ste podporili rast biofilmu.
Krok 2: Liečba antimikrobiálnymi látkami
- Pripravte antimikrobiálne roztoky:
Pripravte si celý rad antimikrobiálnych koncentrácií v čerstvom médiu.
Vystavte biofilmy antimikrobiálnym látkam:
Odstráňte veko kolíka z bakteriálnej kultúry a opláchnite ho v sterilnom fyziologickom roztoku alebo PBS, aby ste odstránili planktónové bunky.
Umiestnite veko kolíka do novej 96-jamkovej platne obsahujúcej antimikrobiálne roztoky. - Inkubujte tanier:
Inkubujte na definované obdobie (napr. 24 hodín), aby sa umožnila expozícia antimikrobiálnym látkam.
Viacjamkový doštičkový sonikátor UIP400MTP na vysokovýkonnú prípravu vzoriek
Krok 3: Sonikácia pomocou 96-jamkového sonikátora UIP400MTP
Krok sonikácie je rozhodujúci pre oddelenie biofilmov z viečok kolíkov na posúdenie životaschopnosti. Pre UIP400MTP sonikátor postupujte podľa týchto krokov:
- Pripravte nastavenie:
Do každej jamky naplňte čerstvú 96-jamkovú platňu regeneračným médiom (napr. neutralizačným vývarom alebo čerstvým rastovým médiom). - Preneste veko kolíka:
Odstráňte veko kolíka z antimikrobiálnej ošetrovacej dosky.
Opláchnite veko kolíka v sterilnom fyziologickom roztoku alebo PBS, aby ste odstránili zvyšky antimikrobiálnych látok. - Umiestnite platňu a sonikátor:
Pripevnite veko kolíka k doske regeneračného média.
Umiestnite dosku regeneračného média na platformu UIP400MTP sonikátora a uistite sa, že je platňa vycentrovaná a stabilná. - Upravte parametre sonikácie:
Nastavte parametre sonikácie na UIP400MTP (Nastavenia je možné upraviť podľa biofilmu):
Amplitúda: 70–100%.
Čas sonikácie: 1–3 minúty (upravte na základe robustnosti biofilmu) v režime cyklu. - Sonikujte:
Spustite proces sonikácie. Ultrazvukové vibrácie uvoľnia biofilmy z povrchov kolíkov do regeneračného média. - Sledujte proces:
Pomocou zásuvného snímača teploty monitorujte teplotu vzorky v jamkách. UIP400MTP je možné pripojiť k laboratórnemu chladiču na chladenie. - Manipulácia po sonikácii:
Regeneračné médium (teraz obsahujúce oddelené biofilmy) sa okamžite prenesie do čerstvej sterilnej platne na následnú analýzu.
(A) Doštička obsahujúca TSB s 2 % glukózy používaná na tvorbu biofilmu, obnovu buniek a
stanovenie MIC a MBCB; (B) Veko s kolíkmi na tvorbu stafylokokových biofilmov. stanovenie MIC a MBCB; (B) Veko s kolíkmi na tvorbu stafylokokových biofilmov.
Biofilmové bunky vytvorené na kolíkoch boli uvoľnené sonikáciou (Hielscher Ultrasound Technology) na 5 minút v 96-jamkových platniach obsahujúcich čerstvé kultivačné médium na obnovu buniek.
(Obrázok a štúdia: ©de Oliveira a kol., 2016)
Krok 4: Posúdenie životaschopnosti
Biofilmy oddelené od platní a kultúry:
- Vykonajte sériové riedenia regeneračného média a platne na agar, aby ste vymenovali jednotky tvoriace kolónie (CFU).
Prípadne použite kolorimetrický alebo fluorescenčný test životaschopnosti. - Rekordné výsledky:
Určte MBEC ako najnižšiu koncentráciu antimikrobiálnej látky, ktorá odstránila zistiteľnú životaschopnosť biofilmu.
Dizajn, výroba a poradenstvo – Kvalita vyrobená v Nemecku
Ultrazvukové prístroje Hielscher sú známe svojou najvyššou kvalitou a dizajnovými štandardmi. Robustnosť a jednoduchá obsluha umožňujú bezproblémovú integráciu našich ultrazvukových prístrojov do priemyselných zariadení. Drsné podmienky a náročné prostredie ľahko zvládnu sonikátory Hielscher.
Hielscher Ultrasonics je spoločnosť s certifikáciou ISO a kladie osobitný dôraz na vysokovýkonné ultrazvukové prístroje s najmodernejšou technológiou a užívateľskou prívetivosťou. Ultrazvukové prístroje Hielscher sú samozrejme v súlade s CE a spĺňajú požiadavky UL, CSA a RoHs.
Zefektívnenie prípravy vzoriek v 96-jamkových platniach a testovacích platniach Použitie viacjamkového doštičkového sonikátora UIP400MTP
Literatúra / Referencie
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Microplate Sonicator Validated in Peer-Reviewed Proteomics Study
často kladené otázky
Čo je test MBEC?
Test minimálnej koncentrácie eradikacie biofilmu (MBEC) je štandardizovaná metóda používaná na stanovenie najnižšej koncentrácie antimikrobiálneho činidla potrebného na eradikáciu baktérií spojených s biofilmom. Zahŕňa pestovanie biofilmov na špecializovaných povrchoch, ich vystavenie rôznym antimikrobiálnym koncentráciám a hodnotenie životaschopnosti oddelených buniek po narušení biofilmu, zvyčajne sonikáciou, aby sa vyhodnotila účinnosť liečby.
Aký je rozdiel medzi MBIC a MBEC?
Minimálna inhibičná koncentrácia biofilmu (MBIC) je najnižšia koncentrácia antimikrobiálneho činidla potrebná na zabránenie tvorby biofilmu, zatiaľ čo minimálna koncentrácia na eradikáciu biofilmu (MBEC) je najnižšia koncentrácia potrebná na eradikáciu zavedeného biofilmu. MBIC sa zameriava na prevenciu biofilmu, zatiaľ čo MBEC hodnotí účinnosť liečby proti zrelým biofilmom.
Aké platne sa bežne používajú na testy MBEC?
Mikrotitračné platne bežne používané na testy MBEC sú zvyčajne 96-jamkové platne vyrobené z polystyrénu alebo polypropylénu. Tieto materiály poskytujú vhodný povrch na tvorbu biofilmu a sú chemicky odolné voči antimikrobiálnym látkam testovaným počas testu. Polystyrénové platne sú široko preferované kvôli ich optickej čistote, čo je výhodné pre následné analýzy, ako sú spektrofotometrické alebo fluorescenčné merania. Konštrukcia týchto platní zahŕňa odnímateľné kolíkové viečka, ktoré sú nevyhnutné pre test, pretože na kolíkoch, ktoré sú ponorené do jamiek obsahujúcich rastové médium, sa tvoria biofilmy. Štandardizované platne, ako sú tie, ktoré sú v súlade s testovacím protokolom MBEC, sú špeciálne navrhnuté tak, aby zabezpečili reprodukovateľnosť a kompatibilitu s UIP400MTP sonikátorom alebo iným spracovateľským zariadením.
Čo sú to dosky PEG-Veko?
Dosky s vekom PEG sú špecializované systémy s viacerými jamkami, kde je veko vybavené malými kolíkami alebo kolíkmi s polyetylénglykolom (PEG) siahajúcimi do každej jamky. Tieto kolíky poskytujú povrch pre tvorbu mikrobiálneho biofilmu za kontrolovaných podmienok a napodobňujú rast biofilmu v reálnom svete. Konštrukcia umožňuje vývoj biofilmov na kolíkoch, zatiaľ čo jamky obsahujú rastové médiá alebo antimikrobiálne látky, čo umožňuje vysokovýkonné testovanie citlivosti biofilmu na ošetrenie, ako sú testy MBEC a MBIC.
Spoločnosť Hielscher Ultrasonics vyrába vysokovýkonné ultrazvukové homogenizátory od laboratórium do priemyselná veľkosť.

