Protokol testu MBEC s použitím sonikátora pre 96- jamkové platne UIP400MTP
Test MBEC sa používa na určenie koncentrácie antimikrobiálnych látok potrebných na elimináciu biofilmov vytvorených na viečkach s kolíkmi. Na posúdenie životaschopnosti biofilmu musia byť biofilmy najprv oddelené od viečok s kolíkmi 96-jamkovej platne. Sonikácia je najspoľahlivejšia a najefektívnejšia metóda pre toto oddelenie. Sonikátor pre viacjamkové platne UIP400MTP je špeciálne navrhnutý na spracovanie testovacích platní s maximálnou efektivitou a pohodlím, čím zjednodušuje a urýchľuje testy MBEC s vysokou priepustnosťou.
Sonikácia na oddelenie biofilmu
Sonikácia je kľúčovým krokom v testoch minimálnej eradikačnej koncentrácie biofilmu (MBEC), ktorá umožňuje účinné uvoľnenie buniek biofilmu z ich povrchového ukotvenia. Biofilmy sú prirodzene štruktúrované komunity mikroorganizmov obalené v extracelulárnej matrici, čo ich robí výrazne odolnejšími voči antimikrobiálnym látkam v porovnaní s planktonickými bunkami. Počas testov MBEC sonikácia využíva ultrazvukové vlny na generovanie kontrolovanej kavitácie, ktorá narúša matricu biofilmu a uvoľňuje zabudované bunky do suspenzie. Tento krok zabezpečuje, že bunky biofilmu sú rovnomerne rozptýlené v regeneračnom médiu, čo uľahčuje presné posúdenie životaschopnosti prostredníctvom platňových metód, riedenia alebo spektrofotometrických metód. Bez správneho oddelenia biofilmu by zvyšné zložky matrice mohli chrániť bunky, čo by viedlo k podceneniu antimikrobiálnej účinnosti. Preto je sonikácia nevyhnutná na získanie spoľahlivých a reprodukovateľných hodnôt MBEC, ktoré odrážajú skutočný eradikačný potenciál testovaných látok. Sonikátor pre viacjamkové platne UIP400MTP umožňuje jednoduchú prípravu vzoriek s vysokou priepustnosťou v testovacích platniach.
Sonikátor pre viacjamkové platne UIP400MTP uľahčuje prípravu vzoriek s vysokou priepustnosťou v testovacích platniach.
Protokol testu minimálnej eradikačnej koncentrácie biofilmu (MBEC)
Krok 1: Tvorba biofilmu
- Pripravte bakteriálnu suspenziu:
Pestujte baktérie v vhodných médiách do logaritmickej fázy rastu.
Zrieďte bakteriálnu kultúru na definovanú optickú hustotu (napr. OD600 ~0,1). - Inokulujte 96-jamkovú platňu:
Pridajte bakteriálnu suspenziu (napr. 150–200 µL) do každej jamky štandardnej 96-jamkovej mikrotitračnej platne. - Nasaďte viečko s kolíkmi:
Umiestnite viečko s kolíkmi na inokulovanú platňu, aby sa umožnila tvorba biofilmu na povrchoch kolíkov. - Inkubujte platňu:
Inkubujte nastavenie pri vhodnej teplote (napr. 37°C) po dobu 24–48 hodín bez miešania, aby sa podporil rast biofilmu.
Krok 2: Ošetrenie antimikrobiálnymi látkami
- Pripravte antimikrobiálne roztoky:
Pripravte rozsah antimikrobiálnych koncentrácií v čerstvom médiu.
Exponujte biofilmy antimikrobiálnym látkam:
Odstráňte viečko s kolíkmi z bakteriálnej kultúry a opláchnite ho v sterilnom fyziologickom roztoku alebo PBS na odstránenie planktonických buniek.
Umiestnite viečko s kolíkmi do novej 96-jamkovej platne obsahujúcej antimikrobiálne roztoky. - Inkubujte platňu:
Inkubujte po definovanú dobu (napr. 24 hodín), aby sa umožnila antimikrobiálna expozícia.
Sonikátor pre viacjamkové platne UIP400MTP na prípravu vzoriek s vysokou priepustnosťou
Krok 3: Sonikácia so sonikátorom pre 96-jamkové platne UIP400MTP
Krok sonikácie je kritický pre oddelenie biofilmov od viečok s kolíkmi na posúdenie životaschopnosti. Postupujte podľa týchto krokov pre sonikátor UIP400MTP:
- Pripravte nastavenie:
Naplňte čerstvú 96-jamkovú platňu regeneračným médiom (napr. neutralizačným bujónom alebo čerstvým rastovým médiom) v každej jamke. - Preneste viečko s kolíkmi:
Odstráňte viečko s kolíkmi z platne na antimikrobiálne ošetrenie.
Opláchnite viečko s kolíkmi v sterilnom fyziologickom roztoku alebo PBS na odstránenie zvyšných antimikrobiálnych látok. - Umiestnite platňu a sonikátor:
Nasaďte viečko s kolíkmi na platňu s regeneračným médiom.
Umiestnite platňu s regeneračným médiom na platformu sonikátora UIP400MTP a uistite sa, že je platňa vycentrovaná a stabilná. - Nastavte parametre sonikácie:
Nastavte parametre sonikácie na UIP400MTP (nastavenia môžu byť upravené podľa biofilmu):
Amplitúda: 70–100 %.
Čas sonikácie: 1–3 minúty (upravte podľa robustnosti biofilmu) v cyklickom režime. - Sonikujte:
Spustite proces sonikácie. Ultrazvukové vibrácie uvoľnia biofilmy z povrchov kolíkov do regeneračného média. - Monitorujte proces:
Použite odpojiteľný teplotný senzor na monitorovanie teploty vzorky v jamkách. UIP400MTP môže byť pripojený k laboratórnemu chladiču na chladenie. - Manipulácia po sonikácii:
Okamžite preneste regeneračné médium (teraz obsahujúce oddelené biofilmy) do čerstvej sterilnej platne na následnú analýzu.
(A) Platňa obsahujúca TSB s 2 % glukózy použitá na tvorbu biofilmu, regeneráciu buniek a
určenie MIC a MBCB; (B) Viečko s kolíkmi na tvorbu stafylokokových biofilmov. určenie MIC a MBCB; (B) Viečko s kolíkmi na tvorbu stafylokokových biofilmov.
Bunky biofilmu vytvorené na kolíkoch boli uvoľnené sonikáciou (Hielscher Ultrasound Technology) po dobu 5 minút v 96-jamkových platniach obsahujúcich čerstvé kultivačné médium na regeneráciu buniek.
(Obrázok a štúdia: ©de Oliveira et al., 2016)
Krok 4: Posúdenie životaschopnosti
Naneste a pestujte oddelené biofilmy:
- Vykonajte sériové riedenia regeneračného média a naneste ich na agar na enumeráciu kolónie-tvoriacich jednotiek (CFU).
Alternatívne použite kolorimetrický alebo fluorescenčný test životaschopnosti. - Zaznamenajte výsledky:
Určite MBEC ako najnižšiu koncentráciu antimikrobiálnej látky, ktorá eradikovala detegovateľnú životaschopnosť biofilmu.
Návrh, výroba a poradenstvo – Kvalita Made in Germany
Hielscher ultrazvukové zariadenia sú známe svojou najvyššou kvalitou a dizajnovými štandardmi. Robustnosť a jednoduchá prevádzka umožňujú hladkú integráciu našich ultrazvukových zariadení do priemyselných zariadení. Hielscher sonikátory si ľahko poradia s drsnými podmienkami a náročnými prostrediami.
Hielscher Ultrasonics je spoločnosť s certifikátom ISO a osobitný dôraz kladie na vysokovýkonné ultrazvukové zariadenia s najmodernejšou technológiou a používateľskou prívetivosťou. Samozrejme, Hielscher ultrazvukové zariadenia sú v súlade s CE a spĺňajú požiadavky UL, CSA a RoHs.
Zjednodušite prípravu vzoriek v 96-jamkových platniach a testovacích platniach pomocou sonikátora pre viacjamkové platne UIP400MTP
Literatúra / Referencie
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Microplate Sonicator Validated in Peer-Reviewed Proteomics Study
Často kladené otázky
Čo je test MBEC?
Test minimálnej eradikačnej koncentrácie biofilmu (MBEC) je štandardizovaná metóda používaná na určenie najnižšej koncentrácie antimikrobiálnej látky potrebnej na eradikáciu baktérií spojených s biofilmom. Zahŕňa pestovanie biofilmov na špecializovaných povrchoch, ich exponovanie rôznym antimikrobiálnym koncentráciám a posudzovanie životaschopnosti oddelených buniek po narušení biofilmu, typicky prostredníctvom sonikácie, na vyhodnotenie účinnosti ošetrenia.
Aký je rozdiel medzi MBIC a MBEC?
Minimálna inhibičná koncentrácia biofilmu (MBIC) je najnižšia koncentrácia antimikrobiálnej látky potrebná na zabránenie tvorby biofilmu, zatiaľ čo minimálna eradikačná koncentrácia biofilmu (MBEC) je najnižšia koncentrácia potrebná na eradikáciu established biofilmu. MBIC sa zameriava na prevenciu biofilmu, zatiaľ čo MBEC posudzuje účinnosť ošetrenia proti zrelým biofilmom.
Aké platne sa bežne používajú pre testy MBEC?
Mikrotitračné platne bežne používané pre testy MBEC sú typicky 96-jamkové platne vyrobené z polystyrénu alebo polypropylénu. Tieto materiály poskytujú vhodný povrch na tvorbu biofilmu a sú chemicky odolné voči antimikrobiálnym látkam testovaným počas testu. Polystyrénové platne sú široko preferované pre svoju optickú čírosť, ktorá je výhodná pre následné analýzy, ako sú spektrofotometrické alebo fluorescenčné merania. Dizajn týchto platní obsahuje odnímateľné viečka s kolíkmi, ktoré sú pre test nevyhnutné, pretože biofilmy sa tvoria na kolíkoch ponorených v jamkách obsahujúcich rastové médiá. Štandardizované platne, ako sú tie, ktoré sú v súlade s protokolom testu MBEC, sú špeciálne konštruované tak, aby zabezpečili reprodukovateľnosť a kompatibilitu so sonikátorom UIP400MTP alebo iným spracovateľským zariadením.
Čo sú PEG-viečkové platne?
PEG-viečkové platne sú špecializované systémy viacjamkových platní, kde je viečko vybavené malými kolíkmi alebo špendlíkmi z polyetylénglykolu (PEG) zasahujúcimi do každej jamky. Tieto kolíky poskytujú povrch na tvorbu mikrobiálnych biofilmov pod kontrolovanými podmienkami, čím imitujú rast biofilmov v reálnom svete. Dizajn umožňuje, aby sa biofilmy vyvíjali na kolíkoch, zatiaľ čo jamky obsahujú rastové médiá alebo antimikrobiálne látky, čo umožňuje testovanie citlivosti biofilmov na ošetrenia s vysokou priepustnosťou, ako je tomu pri testoch MBEC a MBIC.
Hielscher Ultrasonics vyrába vysokovýkonné ultrazvukové homogenizátory od laboratória po priemyselnú veľkosť.