Ultrazvuková analýza – Sonnikátor naraz UIP400MTP
Sonikácia je základnou technikou v laboratórnych protokoloch, najmä pre aplikácie, ako sú testy chromatínovej imunoprecipitácie (ChIP). Použitím ultrazvukovej energie na rozklad buniek, strihanie DNA a rozpustenie chromatínu umožňuje sonikácia výskumníkom efektívnejšie a reprodukovateľnejšie pripravovať vzorky. Viacjamkové doštičkové sonikátory Hielscher patria medzi najpokročilejšie a najefektívnejšie nástroje dostupné na tento účel, ktoré zefektívňujú vysokovýkonné pracovné postupy umiestnením až 96-jamkových platní.
Kľúčové výhody viacjamkových doštičkových sonikátorov pre testy
Bezkontaktné 96-jamkové doštičkové sonikátory Hielscher, ako je napríklad UIP400MTP, ponúkajú vysoko spoľahlivý a kontrolovaný prístup k lýze buniek a strihu chromatínu. Táto bezkontaktná konštrukcia zaisťuje, že každá jamka je ošetrená rovnomerne, čo poskytuje konzistentné výsledky pri vysokom počte vzoriek. S týmto sonikátorom môžu výskumníci vykonávať viacero procesov, vrátane:
- Lýza buniek: Účinná sonikácia rozbíja otvorené bunkové membrány a uvoľňuje bunkový obsah.
- Strihanie DNA a RNA: Ultrazvukové vlny s vysokou intenzitou fragmentujú DNA a RNA na požadované veľkosti, čo je nevyhnutné pre následné testy.
- Fragmentácia chromatínu: Strihanie chromatínu na menšie kúsky pre následné analýzy, ako je imunoprecipitácia chromatínu (ChIP), sekvenovanie DNA alebo iné epigenetické štúdie. Prečítajte si viac o fragmentácii chromatínu pomocou UIP400MTP!
- Solubilizácia: Zvyšuje rozpustnosť zložiek vzorky a pomáha pri príprave jednotných, reprodukovateľných vzoriek testov.
Tieto funkcie sú nevyhnutné pre vysokovýkonnú prípravu vzoriek a miniaturizáciu vzoriek, pretože umožňujú výskumníkom spracovať viacero vzoriek s minimálnym rizikom krížovej kontaminácie.
Význam sonikácie v testoch ChIP
Testy chromatínovej imunoprecipitácie (ChIP) závisia od presného strihu chromatínu, aby sa získali fragmenty DNA optimálnej veľkosti, zvyčajne medzi 200-600 pármi báz (bp). Tieto fragmenty sú potrebné pre účinnú imunoprecipitaciu, presné špičkové rozlíšenie a spoľahlivé výsledky v testoch ChIP-Seq. Sonnikátor Hielscher UIP400MTP Assay-At-Once je obzvlášť vhodný pre protokoly ChIP a poskytuje rovnomernú fragmentáciu chromatínu vo viacerých jamkách. Výhody tejto presnosti v pracovných postupoch ChIP zahŕňajú:
- Vysoký výťažok chromatínu: Efektívna sonikácia uvoľňuje väčšie množstvo chromatínu z každej vzorky.
- Konzistencia naprieč vzorkami: Viacjamkový sonikátor udržuje konzistentné veľkosti fragmentov vo všetkých jamkách, čím znižuje variabilitu testov ChIP.
- Zvýšená citlivosť a rozlíšenie v ChIP-Seq: Správne fragmentovaná DNA zaisťuje jasnejšie rozlíšenie vrcholu, čo je kritický faktor pri detekcii presných interakcií proteín-DNA.
Úloha spoľahlivej sonikácie v úspešných testoch
Pri testoch, ktoré zahŕňajú vysoký počet vzoriek, napríklad pri klinickej diagnostike alebo objavovaní liekov, je nevyhnutná reprodukovateľnosť a priepustnosť. Viacjamkové doštičkové sonikátory Hielscher poskytujú riešenie tým, že uľahčujú rovnomernú prípravu vzoriek vo veľkom počte jamiek. Táto konzistencia nielenže zlepšuje robustnosť testu, ale tiež zvyšuje celkovú efektivitu pracovného postupu, čím šetrí čas a zdroje v laboratóriu.
Viacjamkové doštičkové sonikátory Hielscher sú neoceniteľné v testovacích protokoloch, najmä tých, ktoré vyžadujú vysokovýkonné spracovanie. Zabezpečením spoľahlivej lýzy buniek, strihania DNA a solubilizácie tieto sonikátory optimalizujú prípravu vzoriek pre presné a reprodukovateľné výsledky. Pre výskumníkov pracujúcich s testami ChIP ponúka sonikátor UIP400MTP robustný nástroj, ktorý zvyšuje výťažok chromatínu, konzistenciu fragmentov a citlivosť testu - v konečnom dôsledku vedie k úspešnejším experimentom a jasnejším poznatkom.
Viacjamkový doštičkový sonikátor UIP400MTP uľahčuje vysokovýkonnú prípravu vzoriek a zefektívňuje výskumnú prácu a testy.
Kľúčové vlastnosti UIP400MTP Multiwell Sonicator
| vysokovýkonná sonikácia | Dokonale sa hodí pre 96-jamkové a iné viacjamkové platne, UIP400MTP umožňuje súčasnú, identickú sonikáciu viacerých vzoriek, čím sa výrazne skracuje trvanie prípravy vzoriek a zvyšuje sa priepustnosť testovania s vysokým počtom vzoriek. |
| Použite viacjamkovú dosku podľa vlastného výberu | UIP400MTP je určený na sonikáciu akýchkoľvek štandardných viacjamkových platničiek, PCR platničiek alebo mikrotitračných platničiek. Vyberiete si tanier, ktorý je pre vaše experimenty najvhodnejší. Keďže UIP400MTP nevyžaduje proprietárny spotrebný materiál, ušetrí vám to veľa peňazí! |
| Bezkontaktná ultrazvuková signalizácia | Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP aplikuje intenzívny ultrazvuk bez toho, aby sa čokoľvek vložilo do vzorky. Môžete sonikovať viacjamkové platne, uzavreté nádoby a injekčné liekovky. Spoločnosť Hielscher vám dodáva prispôsobené držiaky vzoriek pre akékoľvek neštandardné liekovky alebo nádoby. |
| Presnosť a kontrola | Presné ovládanie a inteligentný softvér vám umožňujú nastaviť ultrazvukové parametre tak, aby optimálne vyhovovali vašim špecifickým potrebám spracovania. Získate maximálnu účinnosť a účinnosť sonikácie pre každý experiment. |
| regulácia teploty | Nastavte konkrétnu teplotu pre vašu sonikáciu. Sonikátor UIP400MTP platne dokáže monitorovať teplotu vzorky a podľa toho upraviť sonikáciu. Recirkulujúca chladiaca kvapalina ochladzuje každú jamku v doske pre presnú reguláciu teploty. |
| Protokolovanie a diaľkové ovládanie | Každé sonikovanie je možné ovládať z počítača. Nie je potrebná žiadna inštalácia softvéru. Na diaľkové ovládanie a monitorovanie UIP400MTP môžete použiť svoj štandardný prehliadač (napr. Chrome, Firefox, Edge alebo Safari) v akomkoľvek operačnom systéme (napr. MacOS, Windows, Android, iOS alebo Linux). Každé sonikačné spustenie vytvára podrobný protokol o sonikácii na vyhodnotenie a dokumentáciu. Súbor protokolu je v neproprietárnom formáte CSV, ktorý môžete otvoriť pomocou preferovaného programu, napr. Microsoft Excel, Apple Numbers alebo OpenOffice Calc. |
| Robustný a spoľahlivý | Navrhnutý a vyrobený v Nemecku podľa najvyšších štandardov kvality, UIP400MTP je nielen výkonný, ale aj pozoruhodne odolný. Jeho dizajn spĺňa priemyselné štandardy a ľahko odoláva náročným podmienkam každodenného používania v náročnom laboratórnom prostredí. UIP400MTP môžete používať nepretržite 24 hodín denne, 7 dní v týždni vo vysokovýkonných prevádzkach. |
Ako UIP400MTP uľahčuje miniaturizáciu testov
Hielscher multi-jamkový sonikátor UIP400MTP hrá kľúčovú úlohu pri miniaturizácii testov a umožňuje vedcom a lekárom zmenšiť objemy testov bez toho, aby bola ohrozená presnosť alebo presnosť. Táto schopnosť je neoceniteľná v oblastiach, ako je mikrobiológia, objavovanie liekov, diagnostika, personalizovaná medicína a klinická diagnostika, kde miniaturizované testy umožňujú efektívnejšie, nákladovo efektívnejšie a rýchlejšie testovanie.
- Bezkontaktná sonikácia v 96-jamkových platniach
Bezkontaktná technológia sonikácie UIP400MTP je ideálna pre miniaturizované formáty testov. Umiestnením 96-jamkových platní môže tento sonikátor spracovať veľmi malé objemy vzoriek súčasne vo viacerých jamkách. Tradičné metódy sonikácie často zápasia s konzistenciou pri nižších objemoch kvôli nerovnomernému rozloženiu energie, ale UIP400MTP poskytuje rovnomerné ultrazvukové vlny vo všetkých jamkách a zachováva spoľahlivé výsledky aj v miniaturizovaných formátoch. - Presnosť a rovnomernosť naprieč vzorkami
Miniaturizácia si vyžaduje presnú kontrolu nad prípravou vzoriek, pretože menšie objemy môžu byť citlivejšie na odchýlky. Sústredená sonikácia dodávaná UIP400MTP zaisťuje, že každá jamka dostane rovnakú úroveň sonikácie, čo je nevyhnutné pre udržanie presnosti a reprodukovateľnosti vo všetkých vzorkách. Táto konzistentnosť je kľúčová v oblastiach, ako je objavovanie liekov a klinická diagnostika, kde aj malé odchýlky môžu ovplyvniť výsledky. Prečítajte si viac o sústredenej sonikácii! - Efektívna lýza buniek a strihanie DNA v znížených objemoch
S menšími objemami sa efektívna lýza buniek a strihanie DNA stávajú náročnejšími, napriek tomu sú rozhodujúce pre generovanie vysokokvalitných výsledkov testov. Ultrazvukové vlny s vysokou intenzitou UIP400MTP sú dostatočne silné na dosiahnutie účinného narušenia buniek a strihu DNA aj pri znížených objemoch. Táto schopnosť umožňuje výskumníkom získať potrebnú kvalitu lyzátov a fragmentov DNA bez potreby zväčšovania objemov, čo z nej robí ideálny nástroj pre miniaturizované pracovné postupy. - Úspora nákladov a efektívne využívanie zdrojov
Miniaturizované testy spotrebujú menej činidiel a znižujú plytvanie vzorkami, čo je obzvlášť výhodné pri práci so vzácnymi alebo drahými vzorkami. UIP400MTP to podporuje tým, že umožňuje vysokovýkonnú prípravu vzoriek v malých objemoch, čo umožňuje vedcom maximalizovať svoje zdroje. V oblastiach, ako je personalizovaná medicína, kde môžu byť vzorky získané od pacientov obmedzené, je táto účinnosť obzvlášť výhodná. - Zvýšená priepustnosť a rýchlosť
Znížením objemu testov UIP400MTP pomáha laboratóriám spracovať viac vzoriek v kratšom časovom rámci, čím sa výrazne zvyšuje priepustnosť. Toto rýchle spracovanie je kľúčové v oblastiach s vysokým dopytom, ako je diagnostika a objavovanie liekov, kde časovo citlivé výsledky môžu priamo ovplyvniť starostlivosť o pacientov alebo výsledky výskumu. Miniaturizované testy v kombinácii s vysokou kapacitou UIP400MTP umožňujú rýchlejšie testovanie a analýzu vo veľkom meradle. - Podporuje automatizáciu a vysokovýkonný skríning
Kompatibilita UIP400MTP s akýmikoľvek štandardnými formátmi viacjamkových platní umožňuje bezproblémovú integráciu s automatizovanými systémami používanými pri vysokovýkonnom skríningu. Táto integrácia je hlavnou výhodou v oblastiach, ako je mikrobiológia a objavovanie liekov, kde je rýchle a automatizované spracovanie nevyhnutné na skríning veľkých knižníc zlúčenín alebo analýzu mnohých mikrobiálnych kmeňov.
UIP400MTP uľahčuje miniaturizáciu testov tým, že poskytuje spoľahlivú sonikáciu pre malé objemy, čím zaisťuje presnosť a konzistenciu medzi vzorkami. Jeho schopnosť spracovávať miniaturizované testy s vysokou presnosťou, reprodukovateľnosťou a efektívnosťou umožňuje vedcom a lekárom znižovať objemy a zároveň dosahovať rýchlejšie, nákladovo efektívne a vysokokvalitné výsledky v rôznych výskumných a klinických oblastiach.
Testy uľahčené UIP400MTP Multi-jamkovým doštičkovým sonikátorom
Viacjamkový sonikátor UIP400MTP sa používa na testy zahŕňajúce narušenie buniek na uvoľnenie proteínov a biomolekúl, výskum biofilmu a antimikrobiálne testovanie, ako napríklad:
- ELISA: Sonikácia sa používa, keď príprava vzorky zahŕňa rozbitie buniek na získanie proteínových extraktov.
- Skúšky MBEC (minimálna koncentrácia eradikacie biofilmu): Na stanovenie koncentrácie antimikrobiálnych látok potrebných na eradikáciu zavedených biofilmov. Prečítajte si viac o používaní UIP400MTP pre testy MBEC vrátane protokolu.
- Testy MBIC (minimálna inhibičná koncentrácia biofilmu): Na posúdenie schopnosti antimikrobiálnych látok zabrániť tvorbe biofilmu.
- Kvantifikačné testy biofilmu: Na narušenie biofilmov na meranie biomasy alebo životaschopnosti buniek pomocou metód, ako sú počty CFU alebo spektrofotometria.
- Vysokovýkonný skríning liekov: Na hodnotenie účinnosti antimikrobiálnych zlúčenín proti baktériám tvoriacim biofilm vo formátoch s viacerými jamkami.
- Extrakcia extracelulárnej matrice: Extrakcia ECM je základným krokom prípravy vzorky pred mnohými testami. Nájdite protokol pre extrakciu extracelulárnej matrice s vysokým priechodom s UIP400MTP tu!
- PMCA: Cyklická amplifikácia nesprávneho skladania proteínov je nevyhnutným krokom pre spoľahlivú detekciu priónov. Zistite, ako UIP400MTP uľahčuje vysokovýkonný PMCA pre robustné výsledky!
Literatúra / Referencie
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- UIP400MTP-Multi-well-Plate-Sonicator-Infographic
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
často kladené otázky
Čo je ultrazvuková analýza?
Ultrazvuková analýza je technika, ktorá využíva ultrazvukové vlny na narušenie buniek, strihanie DNA a rozpustenie proteínov alebo chromatínu, čo umožňuje efektívnu prípravu vzoriek na biochemické testy.
Čo je to test?
Test je laboratórny postup používaný na meranie prítomnosti, množstva alebo aktivity konkrétnej látky alebo analyzovanej látky vo vzorke, často na posúdenie biologických, chemických alebo biochemických vlastností. Testy sú bežným postupom v klinických laboratóriách, biologických vedách, molekulárnej biológii, farmakológii, environmentálnej biológii a baníctve.
Aký je rozdiel medzi testom a testom?
Podmienky “Test” a “test” sa často používajú zameniteľne, ale vo vedeckých kontextoch majú odlišný význam:
- Test: Test je presný, kvantitatívny alebo semikvantitatívny analytický postup určený na meranie prítomnosti, množstva alebo funkčnej aktivity konkrétnej látky (analyzovanej látky) vo vzorke. Testy sú zvyčajne dobre definované, reprodukovateľné protokoly používané na hodnotenie čistoty, koncentrácie alebo biologickej aktivity. Často sa používajú v biochemických, farmakologických alebo chemických analýzach.
- Test: Test je širší pojem, ktorý sa vzťahuje na akúkoľvek metódu alebo proces používaný na vyhodnotenie vlastností alebo funkčnosti vzorky alebo systému. Testy môžu byť kvalitatívne alebo kvantitatívne a môžu siahať od jednoduchých hodnotení (napr. test pH) až po zložitejšie hodnotenia. Na rozdiel od testov nemusia testy vyžadovať taký vysoký stupeň špecifickosti alebo kvantitatívneho merania.
Stručne povedané, zatiaľ čo všetky testy sú testy, nie všetky testy sú testy. Testy sú zvyčajne špecifickejšie a kvantitatívnejšie, zatiaľ čo testy môžu zahŕňať širokú škálu postupov s rôznou špecifickosťou a detailmi.
Aké sú tri typy testov?
Tri hlavné typy testov sú:
- Biochemické testy: Tieto testy merajú aktivitu alebo koncentráciu špecifických molekúl (ako sú enzýmy, substráty alebo metabolity) v biochemických reakciách. Sú široko používané na analýzu kinetiky enzýmov, väzbových afinít a metabolických dráh.
- Bunkové testy: Bunkové testy hodnotia účinky zlúčenín, proteínov alebo iných látok na živé bunky. Merajú parametre, ako je životaschopnosť buniek, proliferácia, cytotoxicita, signálne dráhy a génová expresia, čím poskytujú prehľad o bunkových reakciách a účinkoch liekov.
- Imunotesty: Imunotesty používajú protilátky na detekciu a kvantifikáciu špecifických antigénov alebo analytov vo vzorke. Bežné typy zahŕňajú ELISA (enzýmový imunosorbentný test), western blotting a imunofluorescenciu. Tieto testy sú široko používané v diagnostike a výskume na detekciu proteínov, hormónov a patogénov.
Každý z týchto testov je nevyhnutný vo výskume, diagnostike a vývoji liekov, pretože poskytujú kvantitatívne alebo kvalitatívne údaje o rôznych biologických alebo chemických vlastnostiach.
Aké sú najdôležitejšie testy v biologických vedách a mikrobiológii?
- Enzýmový imunosorbentný test (ELISA): ELISA je široko používaný imunotest na detekciu a kvantifikáciu špecifických proteínov, protilátok alebo antigénov v biologických vzorkách. Je neoceniteľný pri diagnostike chorôb, sledovaní imunitných reakcií a detekcii biomarkerov. Sonikacia sa používa na lýzu buniek alebo tkanív na uvoľnenie cieľových proteínov pri analýze intracelulárnych zložiek.
- Testy polymerázovej reťazovej reakcie (PCR): PCR a jej varianty (ako qPCR a RT-PCR) amplifikujú DNA alebo RNA, čo umožňuje rýchlu detekciu a kvantifikáciu špecifického genetického materiálu. Tieto testy sú kľúčové pri detekcii patogénov, genetických štúdiách a diagnostike. Sonikácia sa používa na extrakciu DNA z buniek alebo tkanív, najmä pri štúdiu mikrobiálnych alebo eukaryotických buniek s robustnými bunkovými stenami alebo membránami.
- Western Blotting: Táto technika detekuje a kvantifikuje špecifické proteíny vo vzorke a poskytuje informácie o expresii proteínov, molekulovej hmotnosti a posttranslačných modifikáciách. Vo veľkej miere sa používa v molekulárnej biológii a výskume chorôb. Sonikácia sa používa na lyzáciu buniek alebo tkanív na uvoľnenie a strihanie proteínov a ich prípravu na analýzu.
- Reportér Gene testuje: Tieto testy merajú génovú expresiu a regulačnú aktivitu zavedením reportérových génov, ako je GFP alebo luciferáza, do buniek. Sú široko používané na štúdium génovej expresie, aktivity promótora a účinkov liekov na signálne dráhy. Sonikácia sa niekedy používa pri lyzovaní buniek na analýzu produktov reportérových génov, ako sú enzýmy ako luciferáza, v bunkových testoch.
- Testy chromatínovej imunoprecipitácie (ChIP): Testy ChIP skúmajú interakcie proteín-DNA, čo umožňuje výskumníkom študovať transkripčné faktory, modifikácie histónov a epigenetickú reguláciu génovej expresie, čo je dôležité v štúdiách génovej regulácie a výskume chorôb. Sonikácia je kľúčovým krokom k strihaniu chromatínu na vhodné veľkosti fragmentov, čo umožňuje účinnú imunoprecipitaciu.
- Testy Luminex: Tieto testy na báze multiplexných guľôčok súčasne merajú viacero analytov (napr. cytokíny, hormóny) v rámci jednej vzorky, čo je užitočné v imunológii, onkológii a objavovaní biomarkerov. Sonikácia sa používa na prípravu lyzátov buniek alebo tkanív na meranie intracelulárnych analytov, ale nie je potrebná pre vzorky plazmy alebo séra.
Spoločnosť Hielscher Ultrasonics vyrába vysokovýkonné ultrazvukové homogenizátory od laboratórium do priemyselná veľkosť.