Mikrobiomfuerschung a klinesch Analys duerch Ultraschallbehandlung vereinfacht
D’Ultraschallbehandlung ass eng leeschtungsstaark Technik, déi an der Mikrobiomfuerschung an an der klinescher Analys breet agesat gëtt an d’Proufvirbereedung mat héijem Duerchsaz erliichtert. D’Ultraschallmethod ass besonnesch wierksam fir d’Veraarbechtung vu komplexe biologesche Prouwen, zum Beispill vu Prouwen, déi Mikroorganismen enthalen. Den Asaz vun Ultraschall erliichtert d’Zelllyse souwéi d’Extraktioun an d’Analys vun Nukleinsaieren, Proteinnen a Metabolitten an erméiglecht esou e méi déift Verständnis vu mikrobielle Gemeinschaften an hire Rollen a Gesondheet a Krankheet. D’Hielscher Ultraschallapparater fir héije Proufduerchsaz si bekannt fir hir Präzisioun, Effizienz a reproduzéierbar Resultater, wat si zu enger exzellenter Wiel fir Mikrobiomstudie mécht.
Profitéiert vun der Ultraschallbehandlung mat héijem Proufduerchsaz an der Mikrobiomfuerschung
Den Ultraschallapparat UIP400MTP fir Placke mat 96 Verdéiwungen vereinfacht d’Mikrobiomfuerschung duerch Proufvirbereedung mat héijem Duerchsaz
Proufvirbereedung mat héijem Duerchsaz mam Ultraschallapparat UIP400MTP fir Placke mat 96 Verdéiwungen
Uwendunge vun der Ultraschallbehandlung an der Mikrobiomfuerschung
Effizient Zelllyse
D’Ultraschallbehandlung ass héichwierksam fir mikrobiell Zellen ze lyséieren, och déi mat robuste Zellwänn, wéi grampositiv Bakterien a Pilzen. D’Ultraschallwellen erzeugen an der Prouf Kavitatiounsblosen, déi zesummefalen a Schockwellen erzeugen, déi Zellwänn a Membranen opbriechen. Dëse Prozess garantéiert e grëndlechen Zellopschloss an eng effizient Fräisetzung vun intrazelluläre Bestanddeeler, wéi DNA, RNA a Proteinnen.
Kontrolléiert DNA-Fragmentéierung
Fir Uwendunge wéi Next-Generation-Sequenzéierung ass et dacks néideg, DNA duerch Schéierkräften a méi kleng, eenheetlech Fragmenter ze zerleeën. D’Ultraschallbehandlung erméiglecht eng prezis Kontroll vum Fragmentéierungsprozess, soudatt Fuerscher DNA-Fragmenter vun der gewënschter Gréisst kréie kënnen. Dës Kontroll ass entscheedend fir Sequenzéierungsbibliothéike virzebereeden a qualitativ héichwäerteg Sequenzdaten ze garantéieren.
Verbessert Proufhomogeniséierung
An der Mikrobiomfuerschung enthalen d’Prouwen dacks eng villfälteg Mëschung vu Mikroorganismen. D’Ultraschallbehandlung hëlleft, eng eenheetlech Verdeelung vun dëse Mikroorganismen an der Prouf z’erreechen, a garantéiert esou konsequent a reproduzéierbar Resultater. Dës Homogeniséierung ass entscheedend fir eng genee quantitativ Analys, wéi d’Bestëmmung vun der Heefegkeet vu Mikroorganismen oder d’Miessung vu spezifesche metaboleschen Aktivitéiten.
Zouverlässeg Metabolittenextraktioun
Déi zouverlässeg Metabolittenextraktioun duerch Ultraschallbehandlung ass eng Technik, déi an der Metabolomik breet agesat gëtt, fir kleng Moleküllen aus biologesche Prouwen z’isoléieren. D’Ultraschallbehandlung benotzt mechanesch Schwéngungen, déi Zellmembranen opbriechen an esou d’Fräisetzung vun intrazelluläre Metabolitten an e Léisungsmëttel erliichteren. Dës Method ass effizient, reproduzéierbar a mat verschiddene Prouftyppe kompatibel, wat si zu engem wäertvollen Instrument fir metabolomesch Studie mat héijem Proufduerchsaz a fir geziilt metabolomesch Studie mécht. Liest méi iwwer d’Metabolittenextraktioun mat Ultraschall!
“Ech schreiwen Iech, fir Iech Merci ze soe fir eis fantastesch Erfarung mam Asaz vun Ärem Ultraschallapparat UIP400MTP fir eng eenheetlech a konsequent bakteriell Lyse vu fekale Mikrobiomprouwen. Mir dreiwen d’Grenze vun der Lysetechnologie mat héijem Proufduerchsaz weider, an Ären Apparat ass fir dës Aufgab gutt gëeegent. E puer vun de wichtegste Virdeeler sinn:
- Einfach Bedéngung – den Apparat ass einfach ze benotzen, an d’Upassung iwwer d’Menüoptiounen ass onkomplizéiert
- Héije Proufduerchsaz – exzellent fir d’Veraarbechtung vu Placken, mat 96 Prouwe gläichzäiteg
- Gläichméisseg Ultraschallbehandlung vun alle Gefäässer – den Apparat konnt all Verdéiwungen am selwechte Mooss mat Ultraschall behandelen, wat fir eis Uwendung entscheedend war
- Ënnerstëtzung vum Hielscher Team – d’Ënnerstëtzung war exzellent, Dir waart ëmmer fir eis do, bei der Formatioun, fir eis Froen ze beäntweren a Problemer unzegoen, mat Virschléi, déi eis gehollef hunn, eist Zil z’erreechen.
Nach eng Kéier Merci fir Är Hëllef an Ënnerstëtzung, wärend mir un der Optimiséierung vun eise Protokoller geschafft hunn.”
Mark D. Driscoll, Ph.D. – Wëssenschaftlechen Direkter – Intus Biosciences
Wéi gëtt d’Ultraschallbehandlung an der Mikrobiomfuerschung an an der Diagnostik agesat?
Metabolomik, Metagenomik a Metaproteomik si mateneen an der Mikrobiomfuerschung verbonnen, well si zesummen en ëmfaassend Verständnis vu mikrobielle Gemeinschaften an hire Funktiounen erméiglechen. Lys, Proteinrengegung an DNA- / RNA-Fragmentéierung si wesentlech Schrëtt vun der Prouwevirbereedung, déi duerch den Asaz vum Sonikator UIP400MTP fir 96-Well-Placke vereinfacht ginn.
Metabolomik a Metabolomanalys
D’Metabolomik ëmfaasst déi systematesch Ënnersichung vun de klengmolekulare Metabolitten an engem biologesche System. An der Mikrobiomfuerschung gëtt d’Sonikatioun benotzt, fir mikrobiell Zellen ze lyséieren an dobäi intrazellulär Metabolitte fräizesetzen. Mam Sonikator UIP400MTP fir 96-Well-Placke kënne grouss Zuele vu Prouwe séier verschafft ginn. Déi extrahéiert Metabolitte ginn duerno mat fortgeschrattenen Technike wéi Massespektrometrie (MS) a Kärspinresonanzspektroskopie (NMR) quantifizéiert. Déi doraus resultéierend Date liwweren eng Momentopnam vum metaboleschen Zoustand vun engem Mikrobiom a ginn Abléck an déi biocheemesch Aktivitéiten an Interaktiounen a mikrobielle Gemeinschaften.
Metagenomik a Metatranskriptomik
D’Metagenomik ëmfaasst déi ëmfaassend Analys vu geneteschem Material, dat direkt aus Ëmweltprouwe gewonnen ass. D’Sonikatioun spillt eng entscheedend Roll an dësem Prozess, andeems si mikrobiell Zelle lyséiert, fir héichwäerteg DNA ze extrahéieren, déi duerno sequenzéiert gëtt, fir déi present mikrobiell Aarten z’identifizéieren an ze quantifizéieren. An der Metatranskriptomik gëtt RNA mat änleche Sonikatiounsmethoden extrahéiert, fir Genexpressiounsprofiller a verschiddene mikrobielle Gemeinschaften z’ënnersichen. Fir d’DNA- an d’RNA-Sequenzéierung mussen d’Nukleinsaieren op eng bestëmmte Längt a Basepuer fragmentéiert ginn. All dës Aufgabe gi vum Sonikator UIP400MTP mat héijem Prouwenduerchsaz zouverlässeg a séier ausgeféiert!
Proteomik
Proteomesch Analysen erfuerderen d’Extraktioun vu Proteinnen aus mikrobielle Zellen. D’Sonikatioun gëtt effektiv agesat, fir Zellen opzeschléissen an dobäi Proteinnen an d’Léisung fräizesetzen. Dës Proteinne kënnen duerno gerengegt an analyséiert ginn, fir hir funktionell Rollen an engem Mikrobiom an hir Bedeelegung u metabolesche Weeër ze verstoen. Mam Sonikator UIP400MTP fir Multiwell-Placke kënnt Dir d’Lys an d’Proteinextraktioun bannent Minutten duerchféieren an dobäi reproduzéierbar Resultater erreechen, fir Abléck an déi biologesch Prozesser ze kréien, déi vu Proteinnen a mikrobielle Gemeinschaften ugedriwwe ginn.
Metaproteomik
D’Metaproteomik erweidert d’proteomesch Analys op ganz mikrobiell Gemeinschaften an ënnersicht dobäi de gesamte Proteinbestand, fir déi funktionell Expressioun an d’Interaktiounen am Mikrobiom ze verstoen. D’Sonikatioun gëtt benotzt, fir Zellen ze lyséieren an dobäi d’Proteinne fräizesetzen, déi duerno gerengegt a mat Technike wéi Massespektrometrie analyséiert ginn. Dës Approche gëtt detailléiert Abléck an déi aktiv biologesch Prozesser an d’Upassunge vu mikrobielle Gemeinschaften a verschiddenen Ëmfeld.
Profitéiert vun der Veraarbechtungskapazitéit mat héijem Prouwenduerchsaz vum Sonikator UIP400MTP fir Multiwell-Placken a vereinfacht Är Mikrobiomfuerschung an -analys!
Sonikator UIP400MTP mat héijem Prouwenduerchsaz fir d’Mikrobiomfuerschung a Multiwell-Placken, 96-Well-Placken, Réierer a Petrischuelen.
Sonikator UIP400MTP fir Multiwell-Placke fir d’Prouwevirbereedung mat héijem Duerchsaz an der Mikrobiomdiagnostik.
De Sonikator UIP400MTP fir Multiwell-Placke vereinfacht d’Prouwevirbereedung mat héijem Duerchsaz, z. B. an der Mikrobiomfuerschung an -diagnostik.
Sonikator UIP400MTP fir 96-Well-Placken: D’Flëssegkeet, déi den Ultraschall iwwerdréit, ëmgëtt all Verdéiwungen a suergt fir eng gläichméisseg Sonikatioun vun all Prouf
Haaptcharakteristike vum Sonikator UIP400MTP fir Multiwell-Placken
| Sonikatioun mat héijem Prouwenduerchsaz | Den UIP400MTP ass perfekt fir 96-Well-Placken an aner Multiwell-Placke gëeegent an erméiglecht déi gläichzäiteg, identesch Sonikatioun vu méi Prouwen, wouduerch d’Dauer vun der Prouwevirbereedung däitlech verkierzt an den Duerchsaz bei Tester mat grousse Prouwenzuelen erhéicht gëtt. |
| Benotzt d’Multiwell-Plack vun Ärer Wiel | Den UIP400MTP ass fir d’Sonikatioun vun alle Standard-Multiwell-Placken, PCR-Placken oder Mikrotiterplacken entwéckelt. Dir wielt déi Plack, déi am beschte fir Är Experimenter gëeegent ass. Well den UIP400MTP keng proprietär Verbrauchsmaterialie brauch, spuert Dir domat vill Suen! |
| Kontaktfräi Ultraschallbehandlung | De Multiwell-Placken-Ultraschallapparat UIP400MTP setzt intensiven Ultraschall an, ouni eppes an d’Prouf anzeféieren. Dir kënnt versigelt Multiwell-Placken, zoue Gefässer a Fläsche mat Ultraschall behandelen. Hielscher liwwert Iech personaliséiert Proufhalter fir all Fläschen oder Gefässer, déi net dem Standard entspriechen. |
| Prezisioun a Kontroll | Eng prezis Steierung an intelligent Software erlaben Iech, d’Ultraschallparameter optimal op Är spezifesch Veraarbechtungsbedierfnesser ofzestëmmen. Dir kritt maximal Effizienz a Wierksamkeet vun der Ultraschallbehandlung fir all Experiment. |
| Temperaturkontroll | Leet eng spezifesch Temperatur fir Är Ultraschallbehandlung fest. De Placken-Ultraschallapparat UIP400MTP kann d’Prouftemperatur iwwerwaachen an d’Ultraschallbehandlung deementspriechend upassen. Eng zirkuléierend Killflëssegkeet killt all Vertéiwung an der Plack fir eng prezis Temperaturkontroll. |
| Protokolléierung a Fernsteierung | All Ultraschallbehandlung kann iwwer e Computer gesteiert ginn. Et ass keng Softwareinstallatioun néideg. Dir kënnt Äre Standardbrowser (z. B. Chrome, Firefox, Edge oder Safari) op all Betribssystem (z. B. MacOS, Windows, Android, iOS oder Linux) benotzen, fir den UIP400MTP aus der Distanz ze steieren an ze iwwerwaachen. All Ultraschallbehandlung generéiert en detailléierte Protokoll vun der Ultraschallbehandlung fir d’Auswäertung an d’Dokumentatioun. D’Protokolldatei ass an engem net proprietäre CSV-Format, dat Dir mat Ärem bevorzugte Programm, z. B. Microsoft Excel, Apple Numbers oder OpenOffice Calc, opmaache kënnt. |
| Robust an zouverlässeg | Den UIP400MTP gouf an Däitschland no den héchste Qualitéitsstandarden entwéckelt a gebaut an ass net nëmme leeschtungsstaark, mee och bemierkenswäert laanglieweg. Seng Konstruktioun erfëllt industriell Standarden an hält de Belaaschtunge vum deegleche Gebrauch an engem usprochsvolle Laborëmfeld liicht stand. Dir kënnt den UIP400MTP kontinuéierlech 24 Stonnen den Dag, 7 Deeg an der Woch a Betrib mat héijem Proufduerchsaz benotzen. |
- héich Effizienz
- Technologie um neiste Stand
- Zouverlässegkeet & Robustheet
- astellbar, prezis Prozesssteierung
- intelligent Software
- intelligent Funktiounen (z. B. Programméierbarkeet, Dateprotokolléierung, Fernsteierung)
- einfach a sécher ze bedéngen
- wéineg Ënnerhalt néideg
- CIP (Botzen op der Plaz)
Entwécklung, Fabrikatioun a Berodung – Qualitéit aus Däitschland
Hielscher Ultraschallapparater si fir hir héchst Qualitéits- a Konstruktiounsstandarde bekannt. Robustheet an einfach Bedéngung erlaben eng reiwungslos Integratioun vun eisen Ultraschallapparater an industriell Anlagen. Hielscher Ultraschallapparater gi liicht mat haarde Bedéngungen an usprochsvollen Ëmfelder eens.
Hielscher Ultrasonics ass en ISO-zertifizéiert Betrib a leet besonnesche Wäert op héichleeschtungsfäeg Ultraschallapparater, déi sech duerch Technologie um neiste Stand a Benotzerfrëndlechkeet auszeechnen. Selbstverständlech sinn Hielscher Ultraschallapparater CE-konform an erfëllen d’Ufuerderunge vun UL, CSA a RoHs.
Kontaktfräien Ultraschallapparat UIP400MTP fir d’Virbereedung vu Mikrobiomprouwen a Multiwell-Placken.
Literatur / Referenzen
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- InfoGraphic UIP400MTP – 96-well plate Ultrasonicator for High-Throughput Sample Prep – english – Hielscher Ultrasonics
- Jannike L. Krause, Sven-Bastiaan Haange, Stephanie S. Schäpe, Beatrice Engelmann, Ulrike Rolle-Kampczyk, Katarina Fritz-Wallace, Zhipeng Wang, Nico Jehmlich, Dominique Türkowsky, Kristin Schubert, Judith Pöppe, Katrin Bote, Uwe Rösler, Gunda Herberth, Martin von Bergen (2020): The glyphosate formulation Roundup® LB plus influences the global metabolome of pig gut microbiota in vitro. Science of The Total Environment, Volume 745, 2020.
- Tröscher-Mußotter, Johanna; Sáenz, Johan; Grindler, Sandra; Meyer, Jennifer; Kononov, Susanne; Mezger, Beate; Borda, Daniel; Frahm, Jana; Dänicke, Sven; Camarinha-Silva, Amelia; Huber, Korinna; Seifert, Jana (2021): Microbiome Clusters Disclose Physiologic Variances in Dairy Cows Challenged by Calving and Lipopolysaccharides. mSystems 2021.
- Jannike Lea Krause, Beatrice Engelmann, Stephanie Serena Schaepe, Ulrike Rolle-Kampczyk, Nico Jehmlich, Hyun-Dong Chang, Ulla Slanina, Maximillian Hoffman, Jörg Lehmann, Ana Claudia Zenclussen, Gunda Herberth, Martin von Bergen, Sven-Bastiaan Haange (2024): DSS treatment does not affect murine colonic microbiota in absence of thehost. Gut Microbes 2024.
Heefeg gestallte Froen iwwer d’Mikrobiomfuerschung
Wat bewierkt eng Ultraschallbehandlung bei Bakterien?
D’Ultraschallbehandlung brécht Bakterienzellen duerch héichfrequent Schallwellen op. Dës verursaache Kavitatioun, déi Stousswellen a mechanesch Kräfte generéiert, wat zu Zelllys an zur Fräisetzung vun intrazellulärem Inhalt féiert.
Wéi eng Methode gi benotzt, fir Mikrobiomen z’ënnersichen?
Zu de Methode fir d’Ënnersiche vu Mikrobiome gehéieren DNA-Sequenzéierungstechnike wéi d’16S-rRNA-Gensequenzéierung an d’Metagenomik souwéi d’Transkriptomik, d’Proteomik an d’Metabolomik, fir mikrobiell Funktiounen an Interaktiounen z’analyséieren. Bioinformatesch Instrumenter ginn agesat, fir déi grouss Quantitéit u generéierten Daten z’interpretéieren.
Wéi eng Technike ginn an der Mikrobiomanalys benotzt?
Zu den Techniken, déi an der Mikrobiomanalys benotzt ginn, gehéieren d’16S-rRNA-Gensequenzéierung fir d’taxonomesch Profiléierung, d’metagenomesch Sequenzéierung fir eng ëmfaassend genetesch Analys, d’Metatranskriptomik fir d’Ënnersiche vun der Genexpressioun, d’Metaproteomik fir d’Analys vu Proteinnen an d’Metabolomik fir d’Identifikatioun vu Stoffwiesselprodukter. Bioinformatesch Instrumenter si fir d’Dateveraarbechtung an d’Interpretatioun essentiell.
Wat si Metabolomik, Metagenomik a Metaproteomik an der Mikrobiomfuerschung?
An der Mikrobiomfuerschung analyséiert d’Metabolomik déi kleng Moleküllen a Metabolitten, déi vu Mikroben produzéiert ginn, a gëtt Ablécker an hir metabolesch Aktivitéiten. D’Metagenomik ëmfaasst d’Sequenzéierung vun de kollektive Genome vu mikrobiellen Communautéiten, fir hir genetesch Zesummesetzung an hiert funktionellt Potenzial ze verstoen. D’Metaproteomik ënnersicht de gesamte Proteingehalt vun engem Mikrobiom a weist dobäi de funktionellen Ausdrock vu Genen an d’Rollen, déi Proteinen an der mikrobieller Communautéit spillen.
Wat si Bakteriekolonien an der Mikrobiomfuerschung?
Bakteriekolonien an der Mikrobiomfuerschung si Gruppe vu Bakterien, déi aus enger eenzeger oder e puer Zellen op engem feste Wuesstemsmedium gewuess sinn a siichtbar Usammlunge bilden. Dës Kolonie stellen klonal Populatiounen duer, déi benotzt ginn, fir d’Eegenschaften, d’Diversitéit an d’Funktioune vu spezifesche Bakteriestämm an enger mikrobieller Communautéit ze ënnersichen.
Hielscher Ultrasonics produzéiert Héichleeschtungsultraschallhomogenisatore vu Laborgréisst bis Industriegréisst.