Mikrobiome Fuerschung a klinesch Analyse Streamlined duerch Sonication
Sonication ass eng mächteg Technik déi wäit an der Mikrobiomefuerschung a klinescher Analyse benotzt gëtt, déi eng High-Throughput Probe Virbereedung erliichtert. D'Ultraschallmethod ass besonnesch effektiv fir komplex biologesch Proben ze veraarbecht, sou wéi déi mat Mikroorganismen. D'Benotzung vun der Sonikatioun erliichtert d'Zelllysis, d'Extraktioun an d'Analyse vun Nukleinsäuren, Proteinen a Metaboliten, wat e méi déif Verständnis vu mikrobielle Gemeinschaften an hir Rollen an der Gesondheet a Krankheet erméiglecht. Hielscher High-Throughput Sonicatoren sinn bekannt fir hir Präzisioun, Effizienz a reproduzéierbar Resultater, sou datt se eng exzellent Wiel fir Mikrobiomestudien maachen.
Profitéiert vun High-Throughput Sonication an der Mikrobiomefuerschung
Den 96-Well Platte Sonicator UIP400MTP streamlines d'Mikrobiomefuerschung duerch High-Throughput Probe Virbereedung
High-Throughput Sample Virbereedung mam 96-Well Plate Sonicator UIP400MTP
Uwendungen vun Sonication an Microbiome Fuerschung
Effikass Zell Lysis
Sonication ass héich effektiv fir d'Lyséierung vun mikrobiellen Zellen, och déi mat haarden Zellmaueren, wéi Gram-positiv Bakterien a Pilze. D'Ultraschallwellen generéieren Kavitatiounsblasen an der Probe, déi kollapsen a Schockwellen kreéieren, déi Zellmauer a Membranen opbriechen. Dëse Prozess garantéiert eng ëmfaassend Zellstéierung an effizient Verëffentlechung vun intrazellulären Inhalter, wéi DNA, RNA, a Proteinen.
Kontrolléiert DNA Fragmentatioun
Fir Uwendungen wéi d'Sequenzéierung vun der nächster Generatioun ass et dacks noutwendeg fir DNA a méi kleng, eenheetlech Fragmenter ze schneiden. Sonication bitt präzis Kontroll iwwer de Fragmentatiounsprozess, wat d'Fuerscher erlaabt DNA Fragmenter vun der gewënschter Gréisst ze kréien. Dës Kontroll ass kritesch fir Sequenzéierungsbibliothéike virzebereeden an héichqualitativ Sequenzdaten ze garantéieren.
Verbesserte Sample Homogeniséierung
An der Mikrobiomefuerschung enthalen Proben dacks eng divers Mëschung vu Mikroorganismen. Sonication hëlleft eng eenheetlech Verdeelung vun dëse Mikroorganismen bannent der Probe z'erreechen, fir konsequent a reproduzéierbar Resultater ze garantéieren. Dës Homogeniséierung ass entscheedend fir eng korrekt quantitativ Analyse, sou wéi d'Bestëmmung vun der mikrobieller Heefegkeet oder d'Messung vun spezifesche metaboleschen Aktivitéiten.
Zuverlässeg Metabolit Extraktioun
Zuverlässeg Metabolitextraktioun duerch Sonikatioun ass eng wäit benotzt Technik an der Metabolomik fir kleng Moleküle aus biologesche Proben ze isoléieren. Sonication benotzt mechanesch Schwéngungen déi Zellmembranen stéieren, d'Verëffentlechung vun intrazelluläre Metaboliten an e Léisungsmëttel erliichtert. Dës Method ass effizient, reproduzéierbar a kompatibel mat verschiddene Probetypen, sou datt et e wäertvollt Tool fir High-Throughput a geziilte metabolomesch Studien ass. Liest méi iwwer Ultraschall Metabolit Extraktioun!
“Ech schreiwen Iech Merci fir eis fantastesch Erfahrung mat Ärem UIP400MTP Sonicator fir eenheetlech a konsequent bakteriell Lysis vu fecal Mikrobiom Proben. Mir drécken d'Enveloppe fir héich Débit Lysis Technologie, an Ärem Instrument ass gutt geegent fir d'Aufgab. E puer vun de Schlëssel Highlights sinn:
- Einfach Operatioun - Instrument ass einfach ze benotzen, an Personnalisatioun ass einfach mat de Menüwahlen
- Héich Débit- exzellent fir Plättercher Ëmgank, mat 96 Echantillon op enger Zäit
- Och sonication vun alle Schëffer- den Apparat konnt déi selwecht Quantitéit vun sonication zu all de Wells ze liwweren, déi entscheedend war fir eis Applikatioun
- Ënnerstëtzung vum Hielscher Team- Ënnerstëtzung war excellent, Dir waart ëmmer fir eis am Training do, fir eis Froen ze beäntweren a Problemer ze beäntweren, mat Virschléi déi eis gehollef hunn op eist Zil ze kommen.
Merci nach eng Kéier fir Är Hëllef an Hëllef wéi mir geschafft hunn fir eis Protokoller ze optimiséieren.”
Mark D. Driscoll, Ph.D. – Chief Scientific Officer – Intus Biosciences
Wéi gëtt Sonication an der Mikrobiome Fuerschung an Diagnostik applizéiert?
Metabolomics, Metagenomics, a Metaproteomics sinn an der Mikrobiomefuerschung verwéckelt well se kollektiv e verständlecht Verständnis vu mikrobielle Gemeinschaften an hir Funktiounen ubidden. Lysis, Proteinreinigung an DNA / RNA Fragmentatioun si wesentlech Probepräparatiounsschrëtt déi streamlined gi mat der 96-Well Platte Sonicator UIP400MTP.
Metabolomics an Metabolome Analyse
Metabolomics involvéiert déi systematesch Studie vun de klenge Molekül Metaboliten an engem biologesche System. An der Mikrobiomefuerschung gëtt Sonikatioun benotzt fir mikrobiellen Zellen ze lyséieren, intrazellulär Metaboliten ze befreien. Héich Probezuelen kënne séier veraarbecht ginn mat dem 96-Well Platte Sonicator UIP400MTP. Déi extrahéiert Metaboliten ginn dann quantifizéiert mat fortgeschratt Techniken wéi Massespektrometrie (MS) an Nuklearmagnetesch Resonanz (NMR) Spektroskopie. Déi resultéierend Donnéeën liwweren e Snapshot vum metabolesche Zoustand vun engem Mikrobiom, enthüllen Abléck an d'biochemesch Aktivitéiten an d'Interaktiounen bannent mikrobielle Gemeinschaften.
Metagenomics a Metatranscriptomics
Metagenomics involvéiert déi ëmfaassend Analyse vum genetesche Material dat direkt aus Ëmweltproben erholl gëtt. Sonication spillt eng entscheedend Roll an dësem Prozess andeems d'mikrobiellen Zellen lyséiert fir qualitativ héichwäerteg DNA ze extrahieren, déi dann sequenzéiert gëtt fir déi präsent mikrobiell Spezies z'identifizéieren an ze quantifizéieren. An der Metatranskriptomik gëtt RNA extrahéiert mat ähnlechen Sonikatiounsmethoden fir Genausdrockprofiler iwwer verschidde mikrobielle Gemeinschaften ze studéieren. Fir DNA an RNA Sequenzéierung mussen d'Nukleinsäuren op eng gewësse Basepaar Längt fragmentéiert ginn. All dës Aufgab ginn zouverlässeg a séier vum UIP400MTP High-Throughput Sonicator gemaach!
proteomics
Proteomesch Analysen erfuerderen d'Extraktioun vu Proteinen aus mikrobiellen Zellen. Sonication gëtt effektiv benotzt fir Zellen ze stéieren, Proteinen an d'Léisung ze befreien. Dës Proteine kënnen dann gereinegt an analyséiert ginn fir hir funktionell Rollen an engem Mikrobiom an hir Bedeelegung u metabolesche Weeër ze verstoen. Mat dem UIP400MTP Multi-Well Plate Sonicator, kënnt Dir d'Aufgab vun der Lysis a Protein Extraktioun bannent Minutten ausféieren, fir reproduzéierbar Resultater ze kreéieren fir Abléck an déi biologesch Prozesser ze kréien, déi vu Proteinen a mikrobielle Gemeinschaften gedriwwe ginn.
metaproteomics
Metaproteomics erweidert proteomesch Analyse op ganz mikrobielle Gemeinschaften, studéiert de kollektive Proteingehalt fir funktionell Ausdrock an Interaktiounen am Mikrobiom ze verstoen. Sonication gëtt benotzt fir Zellen ze lyséieren, d'Proteine befreit, déi dann gereinegt an analyséiert ginn duerch Techniken wéi Massespektrometrie. Dës Approche bitt detailléiert Abléck an déi aktiv biologesch Prozesser an Adaptatiounen vu mikrobiellen Gemeinschaften a verschiddenen Ëmfeld.
Profitéiert vun der High-Throughput Veraarbechtungskapazitéit vum UIP400MTP Multi-Well Platte Sonicator a erliichtert Är Mikrobiom Fuerschung an Analyse!
UIP400MTP High-Throughput Sonicator fir Mikrobiomefuerschung a Multi-Well Placken, 96-Well Placken, Réier a Petri Platen.
UIP400MTP Multiwell Plate Sonicator fir High-Throughput Probe Virbereedung an der Mikrobiomediagnostik.
De Multi-Well Platte Sonicator UIP400MTP erliichtert High-Throughput Probe Virbereedung, zB an der Mikrobiomefuerschung an der Diagnostik.
96-Well Platte Sonicator UIP400MTP: D'Ultraschall-iwwerdroende Flëssegkeet ëmginn all Brunnen a bitt eenheetlech Sonikatioun vun all Probe
Schlëssel Feature vum UIP400MTP Multi-Well Plate Sonicator
| High-Throughput Sonication | Perfekt gëeegent fir 96-Wells an aner Multiwell Placke, erlaabt d'UIP400MTP gläichzäiteg, identesch Sonikatioun vu verschidde Proben, d'Dauer vun der Probepräparatioun wesentlech ze verkierzen an d'Duerchschnëtt vun héijer Probenummer Tester ze erhéijen. |
| Benotzt de Multiwell Plate vun Ärer Wiel | Den UIP400MTP ass entwéckelt fir all Standard Multiwell Placke, PCR Placke oder Mikrotiter Placken ze sonikéieren. Dir wielt déi Plack déi am meeschte passend ass fir Är Experimenter. Well den UIP400MTP keng propriétaire Verbrauchsmaterial erfuerdert, spuert dat Iech vill Suen! |
| Net-Kontakt Ultraschall | De Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP applizéiert intensiv Ultraschall ouni eppes an d'Probe ze setzen. Dir kënnt ealed Multiwell Placken, zougemaachte Gefässer a Fläschen sonicéieren. Hielscher liwwert Iech personaliséiert Probehalter fir all net-Standard Fläschen oder Schëffer. |
| Präzisioun a Kontroll | Präzisiounskontroll a Smart Software erlaabt Iech d'Ultraschallparameter ze setzen fir Är spezifesch Veraarbechtungsbedürfnisser optimal ze passen. Dir kritt maximal sonication Effizienz an Efficacitéit fir all Experiment. |
| Temperatur Kontroll | Setzt eng spezifesch Temperatur fir Är Sonikatioun. Den UIP400MTP Platte-Sonicator kann d'Probetemperatur iwwerwaachen an d'Sonicatioun deementspriechend upassen. Eng recirkuléierend Ofkillflëssegkeet killt all Well an der Plack fir präzis Temperaturkontrolle. |
| Protokolléierung a Fernsteierung | All Sonication Run kann vun engem Computer kontrolléiert ginn. Keng Softwareinstallatioun ass néideg. Dir kënnt Äre Standardbrowser (zB Chrome, Firefox, Edge oder Safari) op all Betribssystem (zB MacOS, Windows, Android, iOS oder Linux) benotze fir den UIP400MTP op afstand ze kontrolléieren an ze iwwerwaachen. All Sonication Run produzéiert en detailléierte Sonication Protokoll fir Evaluatioun an Dokumentatioun. D'Protokolldatei ass an engem net propriétaire CSV-Format, deen Dir mat Ärem gewënschte Programm opmaache kënnt, zB Microsoft Excel, Apple Numbers oder OpenOffice Calc. |
| Robust an zouverlässeg | Entworf a gebaut an Däitschland op héchste Qualitéitsnormen, ass den UIP400MTP net nëmme mächteg, awer och bemierkenswäert haltbar. Säin Design entsprécht industrielle Standarden a widderstoen einfach d'Strengheete vum alldeegleche Gebrauch an engem usprochsvollen Labo-Ëmfeld. Dir kënnt den UIP400MTP kontinuéierlech 24 Stonnen, 7 Deeg an der Woch an High-Throughput Operatiounen benotzen. |
- héich Effizienz
- Staat-vun-der-Konscht Technologie
- Zouverlässegkeet & Robustheet
- justierbar, präzis Prozess Kontroll
- intelligent Software
- Smart Features (zB programméierbar, Dateprotokolléierung, Fernsteierung)
- einfach a sécher ze bedreiwen
- niddereg Ënnerhalt
- CIP (clean-in-place)
Design, Fabrikatioun a Berodung – Qualitéit Made in Germany
Hielscher Ultraschaller si bekannt fir hir héchst Qualitéit an Designnormen. Robustheet an einfach Operatioun erlaben déi glat Integratioun vun eisen Ultraschaller an industriellen Ariichtungen. Rau Konditiounen an erfuerderlech Ëmfeld ginn einfach vun Hielscher Ultraschaller gehandhabt.
Hielscher Ultrasonics ass eng ISO zertifizéiert Firma a setzt spezielle Wäert op High-Performance Ultrasonicatoren mat modernste Technologie a Benotzerfrëndlechkeet. Natierlech sinn Hielscher Ultraschaller CE konform an entspriechen d'Ufuerderunge vun UL, CSA a RoHs.
Net-Kontakt Sonicator UIP400MTP fir Mikrobiom Probe Virbereedung a Multi-Well Placken.
Literatur / Referenzen
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- InfoGraphic UIP400MTP – 96-well plate Ultrasonicator for High-Throughput Sample Prep – english – Hielscher Ultrasonics
- Jannike L. Krause, Sven-Bastiaan Haange, Stephanie S. Schäpe, Beatrice Engelmann, Ulrike Rolle-Kampczyk, Katarina Fritz-Wallace, Zhipeng Wang, Nico Jehmlich, Dominique Türkowsky, Kristin Schubert, Judith Pöppe, Katrin Bote, Uwe Rösler, Gunda Herberth, Martin von Bergen (2020): The glyphosate formulation Roundup® LB plus influences the global metabolome of pig gut microbiota in vitro. Science of The Total Environment, Volume 745, 2020.
- Tröscher-Mußotter, Johanna; Sáenz, Johan; Grindler, Sandra; Meyer, Jennifer; Kononov, Susanne; Mezger, Beate; Borda, Daniel; Frahm, Jana; Dänicke, Sven; Camarinha-Silva, Amelia; Huber, Korinna; Seifert, Jana (2021): Microbiome Clusters Disclose Physiologic Variances in Dairy Cows Challenged by Calving and Lipopolysaccharides. mSystems 2021.
- Jannike Lea Krause, Beatrice Engelmann, Stephanie Serena Schaepe, Ulrike Rolle-Kampczyk, Nico Jehmlich, Hyun-Dong Chang, Ulla Slanina, Maximillian Hoffman, Jörg Lehmann, Ana Claudia Zenclussen, Gunda Herberth, Martin von Bergen, Sven-Bastiaan Haange (2024): DSS treatment does not affect murine colonic microbiota in absence of thehost. Gut Microbes 2024.
Heefeg gestallte Froen iwwer Mikrobiome Fuerschung
Wat mécht Sonication mat Bakterien?
Sonication stéiert bakteriell Zellen duerch d'Benotzung vun héichfrequenz Tounwellen, verursaacht Kavitatioun, déi Schockwellen a mechanesch Kräfte generéiert, wat zu Zelllysis an der Verëffentlechung vun intrazellulären Inhalter féiert.
Wéi eng Methode gi benotzt fir Mikrobiome ze studéieren?
Methoden fir Mikrobiome ze studéieren enthalen DNA Sequenzéierungstechnike wéi 16S rRNA Gen Sequenzéierung a Metagenomics, souwéi Transkriptomik, Proteomik, a Metabolomik fir mikrobielle Funktiounen an Interaktiounen ze analyséieren. Bioinformatik Tools gi benotzt fir déi grouss generéiert Daten ze interpretéieren.
Wat sinn d'Techniken déi an der Mikrobiom Analyse benotzt ginn?
Techniken, déi an der Mikrobiomeanalyse benotzt ginn, enthalen 16S rRNA Gen Sequenzéierung fir taxonomesch Profiléierung, metagenomesch Sequenzéierung fir ëmfaassend genetesch Analyse, Metatranskriptomik fir Genausdrock ze studéieren, Metaproteomik fir Proteinen ze analyséieren, a Metabolomik fir metabolesch Produkter z'identifizéieren. Bioinformatik Tools si wesentlech fir Datenveraarbechtung an Interpretatioun.
Wat sinn Metabolomics, Metagenomics a Metaproteomics an der Mikrobiomefuerschung?
An der Mikrobiomefuerschung analyséiert Metabolomik déi kleng Molekülen a Metaboliten, déi vu Mikroben produzéiert ginn, a liwwert Abléck an hir metabolesch Aktivitéiten. Metagenomics involvéiert d'Sequenzéierung vun de kollektive Genome vu mikrobielle Gemeinschaften fir hir genetesch Zesummesetzung a funktionell Potenzial ze verstoen. Metaproteomics studéiert de ganze Proteingehalt vun engem Mikrobiom, weist de funktionnellen Ausdrock vun Genen an d'Rollen déi Proteinen an der mikrobieller Gemeinschaft spillen.
Wat sinn Bakteriekolonien an der Mikrobiomefuerschung?
Bakteriell Kolonien an der Mikrobiomefuerschung si Gruppe vu Bakterien, déi aus enger eenzeger oder e puer Zellen op engem festen Wuesstumsmedium ugebaut ginn, a bilden siichtbar Cluster. Dës Kolonie representéieren klonal Populatiounen déi benotzt gi fir d'Charakteristiken, Diversitéit a Funktiounen vu spezifesche Bakteriestämme bannent enger mikrobieller Gemeinschaft ze studéieren.
Hielscher Ultrasonics fabrizéiert High-Performance Ultrasonic Homogenisatoren aus Labo zu industriell Gréisst.