Hielscher Ultrasonics
Mir wäerte frou Äre Prozess ze diskutéieren.
Rufft eis un: +49 3328 437-420
Mail eis: info@hielscher.com

FFPE High-Throughput Sample Prep: Protein Extraktioun an Nukleinsäure Scheren

Mat dem High-Throughput Ultrasonicator UIP400MTP adresséiert Hielscher Ultrasonics d'Erausfuerderunge vun der Formalin Fixatioun a Paraffin embedded (FFPE) Tissue Virbereedung. Léiert wéi d'Ultraschall FFPE Probe a groussen Zuelen veraarbecht fir FFPE Deparaffiniséierung, Tissuelysis, Homogeniséierung, Proteinextraktioun an DNA / RNA Scheren! Profitéiert vun Ultraschall FFPE Tissue Virbereedung – Veraarbechtung grouss Prouf Zuelen an multiwell Placke! Kritt héichqualitativ Echantillon a kritt héich Probezuelen fir zouverlässeg Fuerschungsresultater! A leschter awer net zulescht Zäit a Suen spueren!

FFPE Sample Virbereedung Facilitéiert duerch High-Throughput Sonication

Formalin Fixatioun a Paraffin Embedding (FFPE) ass déi heefegst Method fir zolidd Stoffer ze konservéieren an ze archivéieren. D'Extraktioun vu Biomolekülen aus FFPE Tissueproben stellt dacks bedeitend Erausfuerderunge vir wéinst der Qualitéit vun de gespäicherte Proben. Dës Echantillon, déi wäertvoll Verméigen an der molekulare Biologie a klinescher Fuerschung sinn, bidden eng räich Quell vu biologescher Informatioun fir retrospektiv Studien an diagnostesch Biomarker Validatioun. Wéi och ëmmer, de Prozess vun der Formalin Fixatioun an der Paraffin Embedding, wärend Tissuearchitektur a Morphologie behalen, komplizéiert d'Extraktioun vu qualitativ héichwäerteg Nukleinsäuren a Proteinen. Formalin induzéiert d'Verknüpfung vun Nukleinsäuren a Proteinen, wat zu molekulare Fragmentatioun a chemesche Modifikatioune féiert. Léiert wéi den High-Throughput Ultrasonicator UIP400MTP d'Erausfuerderunge vun der FFPE Probe Virbereedung iwwerwannt!

Ultrasonicator fir effizient FFPE Sample Virbereedung

  • Einfach ze benotzen Workflow: Vereinfacht Prozesser déi userfrëndlech sinn.
  • Deparafiniséierung, Protein Extraktioun, DNA / RNA Scheren
  • Rapid High-Throughput Veraarbechtung: Effizient Handhabung vu Multi-Well Placke.
  • Effektiv Deparaffiniséierung: Verbessert Solubiliséierung vu Proteinen.
  • Net-gëfteg Léisungsmëttel: Vermeit d'Benotzung vu schiedlechen organesche Léisungsmëttel wéi Xylen.

 

Den UIP400MTP Multiwell Plack Ultrasonicator kann FFPE Proben an High-Throughput fir Proteinextraktioun an DNA a RNA Scheren veraarbechten

UIP400MTP High-Throughput Sonicator fir High-Duerchschnëtt FFPE Prouf Veraarbechtung an multiwell Placke

Informatiounen Ufro




Notéiert eis Privatsphär Politik.




 
FFPE Sample Preparation using Ultrasonication - UIP400MTP multwell plate sonicator by Hielscher
 

Fortschrëtter an Protein Extraktioun Techniken aus FFPE Tissue

Hielscher Ultrasonics adresséiert d'Erausfuerderunge bei der High-Throughput FFPE Probe Virbereedung. Sonication benotzt Ultraschallwellen fir mechanesch Schwéngungen a fokusséiert Kavitatioun ze generéieren, effektiv Zellstrukturen ze stéieren an d'Solubiliséierung vu Biomolekülen ze verbesseren. Dës Technik huet Popularitéit gewonnen fir seng Fäegkeet fir d'Effizienz an d'Ausbezuelung vun der Nukleinsäure a Proteinextraktioun aus FFPE Stoffer ze erhéijen, souwéi DNA an RNA Scheren fir d'Bibliothéikpräparatioun. Et ass ganz wichteg ze ënnersträichen datt d'Ultraschall mat der UIP400MTP Multiwell Platte Sonicator d'Integritéit vun dëse Biomoleküle fir Downstream Uwendungen behält.

 

De Video weist den Ultraschall-Probe-Preparatiounssystem UIP400MTP, deen d'verlässlech Probepräparatioun vun all Standard Multi-Well Placke mat héijer Intensitéit Ultraschall erlaabt. Typesch Uwendunge vun der UIP400MTP enthalen Zelllysis, DNA, RNA, a Chromatin Scheren souwéi Proteinextraktioun.

Ultrasonicator UIP400MTP fir Multi-Well Platte sonication

Video Thumbnail

 

Nukleinsäure Schéier mat High-Throughput Ultrasonication

96-Well Placke an aner Multiwell Placke sinn am beschte veraarbecht mam Sonicator UIP400MTP. Dësen Ultraschallsystem ass ideal fir Lysis, DNA Fragmentatioun an Zellsolubiliséierungsveraarbechtungsproben am High-Throughput.De Multi-Well Ultrasonicator UIP400MTP fir d'Benotzung an High-Throughput-Astellungen bréngt d'Virbereedung vun FFPE-Proben op neien Niveau. Dës Multiwell-Plack-Sonicatiounsmethod bitt eng effizient an zouverlässeg Léisung fir déi simultan Veraarbechtung vu verschidde Proben. Et erliichtert déi séier a reproduzéierbar Extraktioun vun DNA, RNA a Proteinen, déi kritesch sinn fir verschidden analytesch Techniken, dorënner Next-Generatioun Sequencing (NGS), quantitativ PCR, a proteomesch Analysen. Optimiséierung vu Sonikatiounsparameter, wéi Amplituden, Dauer an Temperatur, verbessert d'Qualitéit an d'Quantitéit vun den extrahéierten Biomolekülen weider.

Den UIP400MTP Sonicator fir Multiwell Placke bitt bedeitend Virdeeler fir d'Fragmentatioun an d'Schéier vun DNA a RNA aus FFPE Tissu. Ee vun de Standout Feature vun dësem System ass seng Fäegkeet fir schmuel Fragmentgréissten vun DNA a RNA z'erreechen, déi präzis Tunabilitéit vun der Sonikatiounsintensitéit ubitt fir kuerz Fragmenter vun 150-200 Basepairen (bp) oder méi laang Fragmenter vu 15-20 Kilobasepaar ze kréien ( kbp). Dës Villsäitegkeet mécht den UIP400MTP indispensabel fir béid kuerz-liesen a laang gelies Sequenzéierungsapplikatiounen, fir qualitativ héichwäerteg Resultater fir d'nächst Generatioun Sequenzéierung (NGS) a Ganzgenom Sequenzéierung (WGS) ze garantéieren. Seng präzis Kontroll iwwer Fragmentgréisst ass entscheedend fir Fuerscher an alle Beräicher vun der Genomik, well et erlaabt Proben no Spezifikatioune virzebereeden.

Kontaktéiert eis fir fortgeschratt Léisungen am FFPE Tissue

Entdeckt den UIP400MTP Multiwell Platte-Sonicator fir effizient Biomolekül Erhuelung vu FFPE Proben, d'Integritéit vun extrahéierten Nukleinsäuren a Proteinen z'erhalen an d'Reproduzibilitéit vun de Resultater ze garantéieren. Dës Technologie integréiert nahtlos mat anere präparativen an analyteschen Workflows, streamlinéiert a verbessert molekulare Ermëttlungen mat FFPE Tissuearchiven.

Informatiounen Ufro




Notéiert eis Privatsphär Politik.




Fixativen an hir Effekter

Fixatioun ass e entscheedende Schrëtt an der Probepräparatioun déi cellulär Strukturen erhaalt, biochemesch Reaktiounen stoppt a Verschlechterung verhënnert. Verschidde Fixativer gi benotzt ofhängeg vun de spezifesche experimentellen Ufuerderunge. Déi zwee heefegst Fixativer si Formaldehyd a Paraformaldehyd, déi Proteinen an Nukleinsäuren crosslink, d'Morphologie an d'Antigenizitéit vun Zellen a Stoffer erhalen. Aner Fixativer, wéi Ethanol, Methanol, a Glutaraldehyd, gi fir spezifesch Uwendungen benotzt.

Formaldehyd a Paraformaldehyd Fixativer bilden Methylenbrécke tëscht Aminogruppen, wat zu Proteinvernetung resultéiert. Dëse Prozess immobiliséiert effektiv cellulär Komponenten, bewahrt hir Integritéit während de spéideren Analyse Schrëtt. D'Effekter vun dëse Fixativen kënne vu Faktore wéi Konzentratioun, pH an Temperatur beaflosst ginn, an dës Parameteren optimiséieren ass entscheedend fir eng optimal Erhaalung vun de celluläre Strukturen ze garantéieren.

 
Virdeeler vun Ultraschall FFPE Virbereedung
 

Ultrasonication ass eng mächteg Technik fir fixéiert Zellen a Stoffer ze stéieren, déi konventionell Techniken excels. Et bitt verschidde bemierkenswäert Virdeeler iwwer traditionell Lysismethoden:

  • Geschwindegkeet an Effizienz: Ultrasonic Lysis bitt séier Ënnerbriechung vun Zellen a Stoffer, reduzéiert d'Veraarbechtungszäit wesentlech am Verglach mat mechanesche oder chemesche Lysismethoden. Héichfrequenz Tounwellen, déi vun der Ultraschallsonde generéiert ginn, kreéieren mechanesch Schéierkräften, déi Stéierunge vun de fixéierte celluläre Strukturen verursaachen. Dës séier an effizient Stéierung erméiglecht d'Fuerscher grouss Probevolumen bannent engem kuerzen Zäitframe ze veraarbecht.
  • sanft a justierbar: Ultrasonic Lysis bitt e sanfte Stéierungsmechanismus, deen Schued u sensiblen Biomoleküle wéi Proteinen, Nukleinsäuren an Enzyme miniméiert. Am Géigesaz zu mechanesche Methoden, déi exzessiv Hëtzt oder Schéierkräften generéieren, benotzt Ultraschalllysis kontrolléiert Kavitatioun fir Zellen ze stéieren, wärend d'Integritéit an d'Funktionalitéit vun den intrazelluläre Komponenten erhalen.
  • Villsäitegkeet: Ultrasonic Lysis kann op verschidde Fixativen applizéiert ginn, wat d'Fuerscher erlaabt mat enger breet Palette vu fixéierte Proben ze schaffen. Egal ob Formaldehyd, Paraformaldehyd oder alternativ Fixativer benotzt, Ultraschalllysis liwwert konsequent effizient Stéierungen, garantéiert eng optimal Erhuelung vun celluläre Komponenten.
  • Héich Rendement a Qualitéit: Ultrasonic Lysis erliichtert héich Ausbezuelen vun intakten celluläre Komponenten wéinst senger Fäegkeet fir fixéiert Zellen a Stoffer uniform ze stéieren. Dëst erméiglecht Downstream Uwendungen wéi Proteinanalyse, Nukleinsäureextraktioun, an enzymatesch Assays fir zouverlässeg a reproduzéierbar Resultater z'erreechen.
  • Automatisatiounskompatibilitéit: Ultrasonic Lysis kann einfach an automatiséiert Systemer integréiert ginn, wat fir High-Throughput Probeveraarbechtung erlaabt. Dës Kompatibilitéit erméiglecht d'Fuerscher hir Workflow ze streamlinéieren an d'Produktivitéit ze erhéijen, besonnesch a grousse Studien.
96-Well Plate Sonicator UIP400MTP fir Zelllysis, DNA Extraktioun, DNA Fragmentatioun, Zellsolubiliséierung a Proteinreinigung.

96-Well Placke sonicator UIP400MTP fir d'Sonicatioun vu Mikrotiter a Multiwell Placken

Ultrasonic Lysis huet d'Stéierung vun fixéierten Zellen a Stoffer revolutionéiert, a bitt vill Virdeeler iwwer traditionell Lysismethoden. Seng Geschwindegkeet, Effizienz, Selektivitéit, Villsäitegkeet, héije Rendement, an Automatiséierungskompatibilitéit maachen et zu engem onverzichtbare Tool an der Molekulare Biologie a Biotechnologie Fuerschung. Bitt net-Kontakt Sonicatoren souwéi Sonde-Typ Sonicator, Hielscher Ultrasonics bitt de passenden Ultraschallhomogenisator fir Är Liewenswëssenschaftsapplikatioun. Egal ob Dir eenzel Proben, Multiple Probe oder ganz héich Probezuelen gläichzäiteg veraarbecht wëllt, bidde mir Iech dee beschten Sonicator deen Är Fuerschung an Diagnosefuerderunge passt.
Liest méi iwwer Hielscher Net-Kontakt Sonicatoren fir Multi-Probe an High-Throughput Probe Virbereedung!

FFPE Sample Prep mam UIP400MTP Multiwell-Plate Sonicator

  • eemoleg Investitioun
  • benotzen Är eege consumables
  • keng reoccurring Käschten fir propriétaire Accessoiren an consumables
  • héich Duerchschnëtt
  • Präzisioun Kontroll
  • Staat-vun-der-Konscht Technologie
  • Zouverlässegkeet & Robustheet
  • justierbar, präzis Prozess Kontroll
  • industriell Schouljoer: kann kontinuéierlech bedreift 24/7
  • einfach a sécher ze bedreiwen
  • niddereg Ënnerhalt

 
Liest méi iwwer d'Applikatioune vu Sonicatoren an der Liewenswëssenschaft!

Sonicator fir High-Throughput Probe Virbereedung! Den UIP400MTP Plack Sonicator erliichtert Lysis, Protein Extraktioun, DNA Fragmentatioun an Zellsolubiliséierung vu biologesche Proben an 96-Well Placken.

Plate Sonicator UIP400MTP fir all 96-Well Placke, Mikrotiterplacke a Multi-Well Placken.

Design, Fabrikatioun a Berodung – Qualitéit Made in Germany

Hielscher Ultraschaller si bekannt fir hir héchst Qualitéit an Designnormen. Robustheet an einfach Operatioun erlaben déi glat Integratioun vun eisen Ultraschaller an industriellen Ariichtungen. Rau Konditiounen an erfuerderlech Ëmfeld ginn einfach vun Hielscher Ultraschaller gehandhabt.

Hielscher Ultrasonics ass eng ISO zertifizéiert Firma a setzt spezielle Wäert op High-Performance Ultrasonicatoren mat modernste Technologie a Benotzerfrëndlechkeet. Natierlech sinn Hielscher Ultraschaller CE konform an entspriechen d'Ufuerderunge vun UL, CSA a RoHs.

Kontaktéiert eis! / Frot eis!

Frot méi Informatiounen

Benotzt w.e.g. de Formulaire hei ënnen fir zousätzlech Informatioun iwwer den UIP400MTP Multi-Well Platen Ultrasonicator ze froen, seng Uwendungen an FFPE Probe Prep a Präisser. Mir freeën eis Är Uwendung an der Genomik a Proteomik mat Iech ze diskutéieren!









Notéiert w.e.g. eis Privatsphär Politik.




High-Throughput RNA-Sequencing a Multi-Well-Plate

UIP400MTP Ultraschall: High-Throughput FFPE Probe Prep a Multi-Well-Plate



FAQ
Drënner äntweren mir dacks gefrot Froen, déi relevant sinn fir FFPE Tissue Virbereedung an Ultraschall vun FFPE Echantillon.

Wéi gëtt FFPE Tissu virbereet?

Schrëtt fir FFPE Tissue Virbereedung: Déi virsiichteg Handhabung an Veraarbechtung vu frësche Tissue si kritesch fir qualitativ héichwäerteg FFPE Proben ze generéieren. Assuréieren d'Erhaalung vun der cellulärer Architektur, Nukleinsäuren a Proteinen ass essentiell fir eng korrekt Downstream Analyse. All Schrëtt - vu Sammlung bis Embedding - erfuerdert Präzisioun fir d'Integritéit vun der Probe fir verschidden Analysen z'erhalen, dorënner histologesch Untersuchung, Immunhistochemie a molekulare Studien. Richteg ausgefouert, garantéiert dëse Fixéierungs- an Embeddingprozess datt de konservéierten Tissu den in vivo Zoustand präzis reflektéiert, wat zouverlässeg diagnostesch a Fuerschungsresultater erméiglecht.
Mir ginn Iech duerch déi 6 grouss Schrëtt vum Embedding Prozess vun FFPE Tissue Echantillon.

  • Tissue Collection
    Biopsie vu liewegen Mamendéieren an Tissuekulturen si béid liewensfäeg Quelle fir frësch Tissue fir FFPE Probe Virbereedung ze kréien.
    Et ass wichteg eng aseptesch Technik ze benotzen: Benotzt steril Instrumenter a Handschuesch fir Kontaminatioun ze vermeiden. Ideal, sammelen Stoffer an engem sterile Ëmfeld, sou wéi eng chirurgesch Suite oder laminar Flow Hood.
    Well d'Exemplar ganz fragil ass, ass seng sensibel Handhabung essentiell: Verzögerungen an der Veraarbechtung minimiséieren an direkt no der Tissuveraarbechtung no der Ausgruewung ufänken. Dëst ass entscheedend fir Autolyse an Degradatioun ze vermeiden. Halt den Tissu bei Raumtemperatur; Vermeit d'Gefrierung well et d'Äiskristallbildung an d'Gewëssschued verursaache kann.
  • Tissue Fixatioun
    Als éischt gëtt de Tissu mat enger fixativer Léisung behandelt: Benotzt 10% neutralgebufferter Formalin (NBF), wat entsprécht 4% Formaldehyd am Waasser, gebuffert op en neutralen pH.
    Ënnerdaach den Tissu komplett a Formalin. Vergewëssert Iech e Fixativ-zu-Tissue-Volumenverhältnis vu mindestens 10:1. D'Fixatiounszäit variéiert typesch vu 6 bis 24 Stonnen, ofhängeg vun der Tissuart a Gréisst. Et ass wichteg datt de Fixativ grëndlech an d'Tissue penetréiert. Wéi och ëmmer, Iwwer-Fixatioun kann zu Cross-Linking féieren, déi d'Antigen-Erhuelung komplizéiert, während Ënner-Fixatioun kann zu enger schlechter Tissuekonservatioun féieren.
  • Tissue Trimmen
    Zweetens, Trimm de Tissu op eng Dicke vun ongeféier 3-5 mm fir adäquat Penetratioun vum Fixativ z'erméiglechen. Sécherstellen déi richteg Orientéierung vum Tissu fir relevant histologesch Strukturen z'erfaassen. Dëst erliichtert den Extraktiounsprozess wann den Tissu méi spéit fir Analyse benotzt gëtt.
  • Veraarbechtung vun der fixéierter Sample
    Elo muss de fixen Tissu dehydratiséiert ginn: No der Fixatioun muss de Tissu dehydréiert ginn fir eng grëndlech Penetratioun vum Paraffinwachs ze garantéieren. Passéiert den Tissu duerch eng gradéiert Serie vun Ethanol (70%, 80%, 90% an 100%) fir Waasser ze entfernen.
    Clearing mat Xylen: Paraffinwachs ass onopléisbar am Waasser, awer löslech am Xylen. Dofir muss d'Waasser am Tissu mat Xylen ersat ginn. Wéi och ëmmer, Xylen selwer ass onopléisbar am Waasser awer löslech am Alkohol, wat en Zwësche Schrëtt erfuerdert, wou Waasser fir d'éischt mat Alkohol ersat gëtt. Taucht den Tissu an Xylen oder e Xylen Ersatz fir Ethanol ze entfernen an d'Tissue fir Paraffininfiltratioun virzebereeden.
    Infiltratioun mat Paraffin: Embed de Tissu a geschmollte Paraffinwachs, fir eng komplett Infiltratioun ze garantéieren. Dëse Schrëtt beinhalt typesch e puer Ännerungen vum Paraffin fir eng grëndlech Imprägnatioun ze garantéieren.
  • Den Tissue anzebezéien
    An dësem Schrëtt gëtt de Tissu an e Tissueblock geformt: Place de Tissu an eng Schimmel mat der gewënschter Orientéierung a schëdden geschmoltenem Paraffin driwwer. Loosst de Paraffin duerch Ofkillung bei Raumtemperatur oder op enger kaler Plack festleeën.
  • Sektioun a Montage
    Mikrotomie: Fir den agebaute Tissue ze schneiden, benotzt e Mikrotom fir dënn Sektiounen (typesch 4-5 Mikrometer) aus dem Paraffinblock ze schneiden. Duerno gëtt d'Probe montéiert, d'Sektiounen op Glas Rutschen plazéiert fir spéider Färzen a mikroskopesch Analyse.
    Schlussendlech kontrolléiert d'Qualitéit vun der Histologie: Evaluéiert déi éischt Sektiounen ënner engem Mikroskop fir eng korrekt Fixatioun a Veraarbechtung ze garantéieren. Passt d'Protokoller un wéi néideg baséiert op Tissuetyp an observéierter Qualitéit.

 
FFPE Stoffer kënne benotzt ginn fir RNA, DNA a Proteinen ze recuperéieren souwéi Unzeeche vu Kriibs oder aner Krankheeten z'entdecken. Si kënne fir Jore gespäichert ginn, a sinn e wesentleche Bestanddeel vu wéi d'Fuerscher an d'Dokteren Tissueproben fir Diagnos a Fuerschung benotzen.

Wat sinn allgemeng Probleemer an Erausfuerderunge mam FFPE Tissu?

Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded (FFPE) Tissueproben gi wäit an der Fuerschung an Diagnostik benotzt, awer si presentéieren verschidden Erausfuerderungen a gemeinsame Probleemer:

  • Degradatioun vu Biomolekülen: Verlängert Fixatioun kann zu der Degradatioun vun DNA, RNA a Proteinen féieren, wat et schwéier mécht qualitativ héichwäerteg Nukleinsäuren oder Proteine fir Downstream Uwendungen ze extrahieren. Korrekt Fixatioun (evitéiert Ënner- an Iwwerfixatioun) ass essentiell fir Tissuekonservatioun.
  • Cross-linking: Formalin Fixatioun verursaacht d'Verknüpfung vu Proteinen an Nukleinsäuren, wat d'molekulare Analyse behënnere kann an d'Genauegkeet vun der Immunhistochemie an aner Assays beaflossen.

  • Antigen Mask: De Fixatiounsprozess kann antigene Site maskéieren, d'Effizienz vun der Antikörperbindung an der Immunhistochemie an aner immunologesch Assays reduzéieren. Dëst erfuerdert dacks Antigen Erhuelung, eng Prozedur duerch datt d'Maskéierung vun engem Epitop ëmgedréit gëtt an d'Epitop-Antikörperbindung restauréiert gëtt. Wéi och ëmmer, voll Antigenizitéit kann net ëmmer erëm restauréiert ginn.
  • Variabel Fixatiounsqualitéit: D'Ënnerscheeder an de Fixéierungszäiten a Konditioune kënnen zu enger onkonsequenter Probequalitéit féieren, d'Reproduktioun an d'Vergläichbarkeet vun de Resultater beaflossen. Benotzt zouverlässeg Fixéierungsprotokoller a vermeit Ënner- an Iwwerfixatioun.
  • DNA Schued a Fragmentatioun: Formalin Fixatioun vu FFPE Proben kann verschidden Aarte vun DNA Schued verursaachen, dorënner Zytosin Deaminatioun (C bis T Mutatiounen), oxidativen Schued (zB 8-Oxo-Guanin, déi zu G bis T Mutatiounen féiert), souwéi kierperlech Stéierungen wéi Nicken, Lücken, an abasesch Siten déi DNA Polymerase Aktivitéit behënneren. De Formalin Fixéierungsprozess kann d'Fragmentatioun vun der DNA verursaachen, genetesch a genomesch Analysen komplizéiert wéi PCR a Sequenzéierung.
  • RNA Qualitéit: RNA extrahéiert aus FFPE Stoffer ass dacks fragmentéiert a chemesch modifizéiert, wat et usprochsvoll mécht qualitativ héichwäerteg transkriptomesch Analysen auszeféieren.
  • Protein Ännerungen: Formalin kann chemesch Ännerungen an Proteinen induzéieren, hir Struktur a Funktioun beaflossen, wat mat proteomeschen Analysen stéieren kann.
  • Probe Veraarbechtung Artefakt: Wärend dem Embedding- an Sektiounsprozess kënne mechanesche Stress an Hëtzt Artefakte aféieren a weider Schued am Tissu verursaachen.
  • Batch-zu-Batch Variabilitéit: Variatiounen an der Fixatioun an Embedding Protokoller tëscht verschiddene Chargen kënnen zu bedeitende Variabilitéit an de Resultater féieren, komplizéiert Vergläicher tëscht Studien.
  • Storage Problemer: Laangfristeg Lagerung vu FFPE-Blöcke kann zu zousätzlech Degradatioun a Verloscht vun der Nukleinsäure Integritéit iwwer Zäit féieren, wat d'Viabilitéit vun den Archivproben fir retrospektiv Studien beaflosst.

Mat optimiséierte Protokoller, virsiichteg Probehandhabung, an Uwendung vun fortgeschratten Techniken hëllefen d'Qualitéit an Zouverlässegkeet vun Daten aus FFPE Stoffer ze verbesseren.

Wat ass den Ënnerscheed tëscht FFPE a gefruerenen Tissu?

FFPE (Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded) Tissue gëtt mat Formalin konservéiert fir den Tissu ze fixéieren an dann a Paraffinwachs agebonnen, wat fir laangfristeg Lagerung bei Raumtemperatur erlaabt wärend Tissuemorphologie behalen. Am Géigesaz, gefruerene Tissue gëtt séier duerch Afréiere bewahrt, wat d'Integritéit vun Nukleinsäuren a Proteinen besser behält, awer erfuerdert Lagerung bei ganz niddregen Temperaturen.

Wéi eng Chemikalien gi fir FFPE Embedding benotzt?

D'Chemikalien, déi fir FFPE Embedding benotzt ginn, enthalen normalerweis Formalin fir Fixatioun a Paraffinwachs fir Embedding. Fir FFPE Embedding, Tissue ginn typesch fixéiert mat entweder 10% (v/v) neutral gebufferter Formalin (FA) oder eng frësch preparéiert 4% (w/v) Formaldehyd-Léisung (PFA) aus Paraformaldehyd-Pulver. Formalin, wat eng Léisung vu Formaldehyd am Waasser ass, gëtt op en neutralen pH gebuffert fir Tissuemorphologie ze bewahren an exzessiv Cross-linking ze vermeiden. D'Paraformaldehyd-baséiert Léisung liwwert och effektiv Fixatioun duerch Cross-linking Proteinen, wouduerch d'Tissuestruktur stabiliséiert fir spéider Embedding am Paraffinwachs. Dës Chemikalien si wesentlech fir Tissue Integritéit a Morphologie während der Fixatioun an Embedding Prozess z'erhalen.

Wéi gëtt de Paraffin aus FFPE Proben ewechgeholl?

Fir Paraffin aus FFPE Proben ze entfernen, ginn d'Tissue-Sektiounen typesch eng Serie vu Xylenwäschen ënnerworf, gefollegt vun der Rehydratioun duerch eng gradéiert Serie vun Alkoholen a schliisslech Waasser. Zënter Xylen ass héich gëfteg, stellt Gesondheetsrisiken wéi Atmungsprobleemer, Hautirritatioun a potenziell laangfristeg Effekter mat widderholl Belaaschtung, Ultraschallparaffinentfernung entsteet als villverspriechend Alternativ a ville Laboratoiren. Dës Method benotzt intensiv Ultraschallwellen fir effizient a sécher Paraffin ze läschen ouni de Besoin fir gëfteg Léisungsmëttel wéi Xylen, doduerch de Risiko fir Labopersonal ze reduzéieren an e méi séchert Aarbechtsëmfeld ze kreéieren.

Wéi laang soll ech meng Stoffer fir eng gutt FFPE Probequalitéit fixéieren?

Allgemeng Empfehlungen fir d'Dauer vun der Fixatioun proposéiere typesch Tissueproben a Formalin fir 24 bis 48 Stonnen ze fixéieren. Dës Dauer ass allgemeng genuch fir Tissuemorphologie a cellulär Strukturen ze bewahren wärend Iwwerfixatioun miniméiert, wat zu exzessiver Cross-linking an Degradatioun vun Nukleinsäuren a Proteinen féiere kann. Wéi och ëmmer, déi optimal Fixéierungszäit kann ofhängeg vun der Gréisst an der Aart vum Tissu variéieren, mat méi kleng oder méi delikat Proben déi méi kuerz Fixéierungszäiten erfuerderen. Et ass entscheedend fir adäquat Fixatioun ze balanséieren fir Tissue Autolyse an Degradatioun ze vermeiden wärend länger Fixatioun ze vermeiden déi downstream molekulare Analysen komplizéiere kéint.

Mir wäerte frou Äre Prozess ze diskutéieren.

Let's get in contact.