Hielscher Ultrasonics
Մենք ուրախ կլինենք քննարկել ձեր գործընթացը:
Զանգահարեք մեզ՝ +49 3328 437-420
Փոստ մեզ՝ info@hielscher.com

C. Elegans նմուշների ուլտրաձայնային պատրաստում

Կենսաբանության մեջ լայնորեն կիրառվող մոդելային օրգանիզմ է C. elegans-ը, նեմատոդ որդը։ Նմուշի պատրաստումը նախքան վերլուծությունը պահանջում է լիզի, սպիտակուցի և լիպիդների արդյունահանում, ինչպես նաև ՌՆԹ-ի մասնատում, որը կարող է հուսալիորեն իրականացվել ձայնային լուծույթի միջոցով: Ուլտրաձայնային բջիջների խանգարիչները հուսալի, բարդ և հեշտ օգտագործվող սարքեր են C. elegans նմուշների արագ պատրաստման համար:

C. Elegans նմուշների ուլտրաձայնային պատրաստում

C. elegans-ը կլոր որդերն են, որոնք լայնորեն օգտագործվում են հետազոտական լաբորատորիաներում՝ գենոմիկայի, զարգացման կենսաբանության և հիվանդությունների ուսումնասիրության համար: C. elegans-ի գենոմի շատ գեներ ունեն մարդկանց ֆունկցիոնալ նմանակներ: Այսպիսով, նեմատոդ որդը չափազանց օգտակար մոդել է մարդու հիվանդությունների համար։ C. elegans-ի լայն կիրառման մյուս առավելություններն են՝ նրա հեշտ և էժան աճեցումը բակտերիաներ պարունակող ափսեների վրա (օրինակ՝ E. coli), թափանցիկությունը, հարմար մշակումը, ինչպես նաև որդերն ավելի երկար սառեցնելու և պահելու հնարավորությունը:
Սպիտակուցների և լիպիդների վերլուծությունը սովորական ընթացակարգեր են լաբորատորիաներում, և ուլտրաձայնային նմուշի պատրաստումը հաստատված մեթոդ է C. elegans նեմատոդների լիզավորման համար զարգացման յուրաքանչյուր փուլում (այսինքն՝ սաղմերը, L1-L4 թրթուրները, մեծահասակները): Քանի որ C. elegans-ը նաև օգտագործվում է որպես սպիտակուցային արտահայտման համակարգ՝ նպատակային սպիտակուցների գերարտահայտման համար, պահանջվում է հուսալի, վերարտադրելի լիզի և սպիտակուցի արդյունահանման մեթոդ, որը տալիս է սպիտակուցի բարձր ելք: Ուլտրաձայնային բջիջների խանգարման և արդյունահանման համակարգերը հասանելի են որպես զոնդային տիպի հոմոգենիզատորներ և որպես բազմակի նմուշային ուլտրաձայնիչներ: Նմուշների հարմար պատրաստման և բոլոր տեսակի նմուշների չափերի թվերի համար՝ Hielscher Ultrasonics-ն ունի իդեալական ուլտրաձայնային բջիջների խանգարող ձեր լաբորատոր ընթացակարգի համար:
C. elegans-ը կենսաբանական հետազոտություններում լայնորեն կիրառվող մոդելային օրգանիզմ է: Ուլտրաձայնային լիզը բարդ, հուսալի, վերարտադրվող և արագ տեխնիկա է C. elegans-ից բարձրորակ սպիտակուցային քաղվածքներ պատրաստելու համար:

Ուլտրաձայնային C. elegans Lysis-ի համար

  • Ճիճու միաձույլների պատրաստում
  • սպիտակուցի արդյունահանում
  • լիպիդների արդյունահանում
  • Սպիտակուցների քանակականացում
  • Իմունային տեղումներ
  • Western Blotting
  • ՌՆԹ արդյունահանում
  • Ֆերմենտային փորձարկումներ
VialTweeter UP200ST ուլտրաձայնային պրոցեսորում

VialTweeter 10 փորձանոթների միաժամանակյա արտահոսքի ձայնագրման համար բազմակի նմուշի պատրաստման միավոր:

Տեղեկատվության հարցում







Ուլտրաձայնային արձանագրություններ C. Elegans-ի խափանումների և լիզիսի համար

C. elegans-ի ուլտրաձայնային համասեռացումը և լիզը, ինչպես նաև սպիտակուցների և լիպիդների հետագա արդյունահանումը կարող են իրականացվել տարբեր պրոցեդուրաների միջոցով՝ օգտագործելով տարբեր համասեռացման և լիզի բուֆերներ և այլն: Լիզիզի բոլոր արձանագրություններն ընդհանուր են, որ նմուշները պետք է անընդհատ պահվեն սառույցի վրա՝ կանխելու սպիտակուցի քայքայումը: Ստորև ձեզ ենք ներկայացնում մի քանի հուսալի և արագ ուլտրաձայնային լիզի և արդյունահանման արձանագրություններ՝ բարձրորակ սպիտակուց կամ լիպիդ պարունակող C. elegans նմուշների պատրաստման համար:

Ուլտրաձայնային C. elegans Lysis-ի առավելությունները

  • Հուսալի
  • վերարտադրելի
  • ճշգրիտ վերահսկվող ջերմաստիճանը
  • գործընթացի հուսալի վերահսկում
  • նուրբ մեթոդ
  • հեշտ է կիրառել
  • Անվտանգ

Ուլտրաձայնային սպիտակուցի արդյունահանում C. elegans նմուշներից

C. elegans որդերի ուլտրաձայնային լիզը և սպիտակուցի արդյունահանումը կարող են իրականացվել տարբեր արձանագրությունների միջոցով: Ստորև ձեզ ենք ներկայացնում մի քանի վստահելի և արագ լիզի արձանագրություններ՝ վերարտադրվող սպիտակուցի արդյունահանման արդյունքների համար:

C. elegans Worms-ից ցիտոզոլային էքստրակտի արագ պատրաստում Sonication-ով

Հետևյալ արձանագրությամբ դուք կարող եք պատրաստել C. elegans լիզատները 30 րոպեից պակաս ժամանակում:
C. elegans-ի հավաքածու
Ընտրեք ցանկալի C. elegans որդերը 1,5 մլ խողովակային ֆոսֆատով բուֆերացված ֆիզիոլոգիական լուծույթի մեջ (PBS) կամ լվացեք դրանք ափսեից 1,5 մլ PBS-ով: Ցենտրիֆուգեք 1 րոպե 2000 պտույտ/րոպե արագությամբ դեպի գնդիկավոր: Նմուշները մշտապես պահեք սառույցի վրա:
Այնուհետև որդերը երկու անգամ լվացեք PBS-ով:
Այնուհետև որդերը երկու անգամ լվանալ ddH-ով2Օ.
Կրկին կասեցրեք որդերը առնվազն 500 մլ հոմոգենացման բուֆերի (HB) մեջ: Որդի նմուշներն այժմ պատրաստ են ուլտրաձայնային լուծարման:
Սպիտակուցի էքստրակտի ավելի բարձր որակի համար դուք կարող եք նվազեցնել բակտերիալ աղտոտվածությունը՝ յուրաքանչյուրը 5 րոպե լվանալով որդերը PBS-ով և ստերիլ, ծայրահեղ մաքուր ջրով (ddH):2O) կամ կատարել սախարոզայի լողացում: Որդիների նմուշները անընդհատ սառույցի վրա պահեք:

Ուլտրաձայնային C. elegans Lysis արձանագրություն

  • Համոզվեք, որ նախապես պատրաստում եք ուլտրաձայնային սարքը, որպեսզի ուլտրաձայնային հոմոգենիզատորը պատրաստ լինի օգտագործման (զոնդը տեղադրված է, նախապես տեղադրված է ձայնագրման ծրագիրը):
  • Ուլտրաձայնային սարք UP200Ht (200 վտ, 26 կՀց) միկրո ծայրով S26d2 կենսաբանական նմուշների պատրաստման համարԵթե ձեր ուլտրաձայնային սարքը կանգնած է, տեղադրեք սառցե բաղնիքը ձեր նմուշի խողովակների հետ ուլտրաձայնային զոնդի տակ և մտցրեք ուլտրաձայնային զոնդը 1,5 մլ խողովակի մեջ:

  • UP200St կամ UP200Ht-ով C. elegans լիզիսի դեպքում ուլտրաձայնային ախտորոշումը պետք է կատարվի՝ օգտագործելով միկրոծածկույթ (օրինակ՝ 2 մմ զոնդ S26d2, տես ձախ նկարը) 40% ամպլիտուդով 1 վրկ 30 վրկ դադարներով: 5 ձայնային ցիկլեր յուրաքանչյուր 1 վայրկյանի համար 30 վրկ դադարներով իդեալական են C. elegans lysis-ի համար: Եթե դուք կատարում եք լիզի առաջին անգամ, դուք կարող եք ստուգել լիզի առաջընթացը նմուշի փոքր մասերում յուրաքանչյուր իմպուլսից հետո՝ օգտագործելով մանրադիտակ:
  • Լիզիսը հաջողությամբ ավարտվում է, երբ որդերն ընդհատվում են: Over-sonication-ը հանգեցնում է միջուկների կոտրմանը և տեսանելի է դառնում, երբ նմուշը դառնում է մածուցիկ կամ փրփուր: Նմուշի քայքայումը կանխելու համար անհրաժեշտության դեպքում օգտագործեք ավելի շատ իմպուլսներ: Մի ավելացրեք յուրաքանչյուր ուլտրաձայնային զարկերակային ցիկլի ժամանակը բարձրորակ սպիտակուցային քաղվածքներ ստանալու համար:
  • Մաքրել բջիջների լիզատը՝ ցենտրիֆուգելով ուլտրաձայնային լուծվող որդերը 14000 պտ/րոպե արագությամբ 10 րոպե 4ºC-ում:
  • Այնուհետև տեղափոխեք վերին նյութը թարմ խողովակի մեջ և պատրաստվեք իմունային նստվածքի կամ այլ փորձաքննության:

Նշում համասեռացման բուֆերի համար. Պատրաստեք համասեռացման բուֆերը վերը նշված ուլտրաձայնային լիզի արձանագրության համար հետևյալ կերպ.

  • 15 մՄ Hepes pH 7.6 – 15 մլ 0,5 մ
  • 10 մՄ KCl – 2,5 մլ 2 Մ
  • 1,5 մՄ MgCl2 – 0.75 մլ 1 Մ
  • 0.1 մմ EDTA – 100 ուլ 0,5 Մ
  • 0.5 մմ EGTA – 2,5 մլ 0,1 Մ
  • 44 մՄ սախարոզա – 14,7 մլ 50%
  • Օգտագործելուց անմիջապես առաջ ավելացրեք՝ 1մՄ DTT – 1000x 1M
  • գումարած պրոթեզերոնի ինհիբիտոր

 

Այս ձեռնարկը բացատրում է, թե որ տեսակի sonicator-ն է լավագույնը ձեր նմուշի պատրաստման առաջադրանքների համար, ինչպիսիք են լիզիսը, բջիջների խանգարումը, սպիտակուցի մեկուսացումը, ԴՆԹ-ի և ՌՆԹ-ի մասնատումը լաբորատորիաներում, վերլուծություններ և հետազոտություններ: Ընտրեք իդեալական sonicator տեսակը ձեր դիմումի, նմուշի ծավալի, նմուշի համարի և թողունակության համար: Hielscher Ultrasonics-ը ձեզ համար ունի իդեալական ուլտրաձայնային հոմոգենիզատոր:

Ինչպես գտնել կատարյալ Sonicator բջիջների խանգարման և սպիտակուցի արդյունահանման համար գիտության և վերլուծության մեջ

Տեսանյութի մանրապատկեր

 

C. elegans-ի բարձր թողունակության լուծարումը 96 ջրհորի թիթեղներում՝ օգտագործելով UIP400MTP Plate Sonicator

C. elegans Lysis (չափահաս նեմատոդներ)
UIP400MTP 80% ամպլիտուդ, 20 ցիկլ (յուրաքանչյուր ձայնային ցիկլ՝ 30 վ միացված, 30 վայրկյան անջատված)
Լիզիսի բուֆեր.

  • Տարբերակ 1) 4% SDS, 0.1 M Tris/HCl pH 8.0, 1 mM EDTA
  • Տարբերակ 2) համատեղ իմունային նստվածքի համար (co-IP). 10 mM Tris HCl (pH 7.5), 150 mM NaCl, 0.5 mM EDTA, 0.5 % NP-40 (Complete proteinase inhibitor cocktail)

Բարձր թողունակությամբ ԴՆԹ-ի մասնատում
C. elegans (չափահաս նեմատոդներ) ԴՆԹ 200-300bp՝ UIP400MTP թիթեղների ձայնային սարք – սահմանել 80% ամպլիտուդ, 30 իմպուլս – յուրաքանչյուրը 30 վայրկյան միացված, 30 վայրկյան անջատված

UIP400MTP Plate Sonicator բարձր թողունակությամբ նմուշների պատրաստման համար. UIP400MTP-ը միատեսակ ձայնակցում է նմուշները բազմաբնակարան, միկրոտիտրային թիթեղներում և 96 հորատանցքերի թիթեղներում՝ խանգարելով բջիջները, արդյունահանելով սպիտակուցներ, մասնատելով ԴՆԹ, ՌՆԹ և ալֆա-սինուկլեինի մանրաթելեր:

UIP400MTP Plate Sonicator բարձր թողունակությամբ նմուշների պատրաստման համար նմուշները միատեսակ հնչյունավորում է բազմաբնույթ, միկրոտիտրային թիթեղներում և 96 ջրհորի թիթեղներում

C. elegans-ի ուլտրաձայնային լիզիսը հարաբերության քանակական մաքրման վերլուծությունների համար

C. elegans-ի սաղմերը (մեկ կրկնակի մոտ 2 միլիոն) թարմ հավաքվել են կենսաբանական եռակի՝ սպիտակեցնելով երիտասարդ հղի հերմաֆրոդիտները և սառույցի վրա հնչյունավորվել (ցիկլ՝ 0,5 վրկ, ամպլիտուդ՝ 40–45%, 5 հարված/սեսիա, 5 սեանս, սեանսների միջև ընդմիջում։ 30 վրկ; UP200S ուլտրաձայնային պրոցեսոր միկրո ծայրով S26d2 (Hielscher Ultrasonics GmbH)) լիզի բուֆերում (ընդհանուր ծավալը՝ ~600 μl; 50 մմ Tris-HCl, pH 7.4, 100 մմ KCl, 1 մմ MgCl2, 1 մմ EGTA, 1 մմ DTT, 10% DTT, 10% , պրոթեզերոնի ինհիբիտորների խառնուրդ, 0.1% Nonidet P-40 փոխարինող): Sonication-ից հետո Nonidet P-40 Substitute-ը ավելացվել է մինչև 1% և լիզատները ինկուբացվել են գլխի վրայով պոչով պտտմամբ 4°C-ում 30 րոպե, որին հաջորդել է ցենտրիֆուգացիա 20000 × գ 20 րոպե 4°C-ում: Այնուհետև մաքրված լիզատը ասպիրացվել է առանց վերին լիպիդային շերտը խանգարելու և կիսով չափ կիսվել կամ հակա-GFP ագարոզայի ուլունքների կամ արգելափակված հսկիչ բշտիկների (40-50 մկլ): 60–90 րոպե 4°C ջերմաստիճանում պտտվելուց հետո ուլունքները մեկ անգամ լվացվել են լիզի բուֆերով, որը պարունակում է 0,1% Nonidet P-40 փոխարինող, որին հաջորդել է երկու անգամ լվանալ I-ի բուֆերում (25 մմ Tris-HCl, pH): 7.4, 300 մմ NaCl, 1 մմ MgCl2) կամ բուֆեր II (1 մմ Tris-HCl, pH 7.4, 150 մմ NaCl, 1 մմ MgCl2) կամ երկուսն էլ: GFP:MBK-2 pull-down-ների համար երկու առանձին փորձեր են իրականացվել՝ օգտագործելով լվացման տարբեր պայմաններ: Սպիտակուցները զտվել են ուղեծրային թափահարմամբ 50 մկլ 6 մ urea/2 M թիուրիա սենյակային ջերմաստիճանում: MBK-1::GFP pull-down փորձերի համար սպիտակուցները երկու անգամ զտվել են՝ թափահարելով 50 մկլ 8 մ գուանիդինիումի քլորիդում 90°C-ում, որին հաջորդել է էթանոլային տեղումները: Էլյուտացված սպիտակուցի նմուշներն այնուհետև մարսվել են լուծույթում:
(տես Chen et al., 2016)

Sonotrode MTP-24-8-96-ն ունի ութ ուլտրաձայնային զոնդ միկրոտիտրային թիթեղների հորերի sonication-ի համար:

Sonotrode MTP-24-8-96-ն ունի ութ ուլտրաձայնային զոնդ միկրոտիտրային թիթեղների հորերի sonication-ի համար:

Ուլտրաձայնային ճիճուների համասեռացում և լիզիս

C.elegans lysis-ի և սպիտակուցի արդյունահանման ընթացակարգի համար մեկ նմուշի համար հավաքվել է համապատասխան փուլի 30000 նեմոտոդ և լվացվել սառցե S-basal-ով, կենտրոնացված ցենտրիֆուգմամբ 1500 rpm-ում 2 րոպե, վեց անգամ լվանալ սառույցով սառը S-ով: բազալ՝ մնացորդային բակտերիաները հեռացնելու համար, այնուհետև պահվում է սառույցի վրա մինչև օգտագործման պատրաստ լինելը: Սպիտակուցի արդյունահանման համար հղիության ընթացքում հասուն որդերին թույլատրվեց ձևավորել կոմպակտ գնդիկ վերջին S-basal լվացումից հետո: Որդիների գնդիկները այնուհետև կրկին կասեցվել են 1 մլ սառույցով արդյունահանման բուֆերի մեջ [20 մՄ կալիումի ֆոսֆատ, pH 7.4, 2 մՄ EDTA, 1% Triton-X-100, պրոթեզերոնի ինհիբիտորներ (Sigma P2714)] և անմիջապես մշակվել:
∼30,000 հղիության ընթացքում հասուն ճիճուներ (համապատասխանում է ~100 մգ թաց քաշին), սառույցի վրա ձայնագրվել են aa զոնդի տիպի ուլտրաձայնային սարքի միջոցով (օրինակ՝ UP50H MS2 միկրո ծայրով) 40% ամպլիտուդով 10 ցիկլով 3 վայրկյան, 30 վայրկյանում: 1 մլ սառույցով արդյունահանման բուֆեր: (տես Բասխարան և այլք 2012 թ.)

Ուլտրաձայնային լիպիդների հեռացում C. elegans-ից

Լիպիդոմիկայի մեջ՝ մետաբոլոմիկայի ճյուղ, կենսաբանական համակարգերի լիպիդային կոմպլեմենտը բնութագրվում և վերլուծվում է։ C. elegans-ը լայնորեն օգտագործվում է լիպիդոմիկայի մեջ՝ ուսումնասիրելու մետաբոլիկ լիպիդների փոխազդեցությունը և դրանց ազդեցությունը առողջության և կյանքի տեւողության վրա:
Ուլտրաձայնային լուծույթը և արդյունահանումը օգտագործվում է C. elegans-ի սաղմերից, թրթուրներից և հասուն որդերից լիպիդներ, ինչպիսիք են սֆինգոլիպիդները, ազատելու համար: Ultrasonication-ը օգտագործվում է ճիճուների համասեռացման պատրաստման և հետագայում նմուշից լիպիդները հանելու համար:
Արձանագրություն C. elegans-ից ուլտրաձայնային լիպիդների արդյունահանման համար
Հալեցրեք C. elegans գնդիկը սառույցի վրա և նորից կասեցրեք 0,5 մլ ուլտրաջրով: C. elegans-ի նմուշները 1,5 մլ փորձանոթների մեջ լուծարեք՝ միաժամանակ պահելով նմուշները սառույցի վրա:
Sonication կարող է իրականացվել օգտագործելով զոնդ-ուլտրաձայնային, ինչպիսիք են UP200Ht, ուլտրաձայնային նմուշի պատրաստման միավորը VialTweeter (10 նմուշի միաժամանակյա ձայնագրում) կամ UIP400MTP (բազմահոր թիթեղների, ինչպիսիք են 96 ջրհորի թիթեղները, ձայնագրման համար): UP200Ht-ով ուլտրաձայնային լուծարման համար օգտագործեք S26d2 միկրո ծայրը: Նախապես սահմանեք ուլտրաձայնային ցիկլի ռեժիմը թվային ընտրացանկում: Սահմանեք ամպլիտուդը 10% և ձայնային ցիկլի ռեժիմը 2 վրկ իմպուլսների 20 ցիկլով 30 վրկ դադարով: յուրաքանչյուր ուլտրաձայնային պուլսացիայի պայթյունի միջև:
Սուպերնատենտները տեղափոխեք պտուտակավոր գլխարկով ապակե խողովակների մեջ: Կատարեք Folch-ի արդյունահանում` յուրաքանչյուր ապակե խողովակին ավելացնելով 1 մլ ուլտրաջուր, որից հետո յուրաքանչյուր ապակե խողովակին ավելացնելով 6 մլ քլորոֆորմ/մեթանոլ (հարաբերակցությունը = 2:1):
Յուրաքանչյուր ապակե խողովակ պտտեցնել 30 վայրկյան 4 անգամ: Խողովակները ցենտրիֆուգեք 1258 xg-ով 15 րոպե (Eppendorf, 5810 R)՝ ֆազային տարանջատումը հետագա ուժեղացնելու համար: Ստորին հիդրոֆոբ մասնիկը տեղափոխեք մաքուր ապակյա խողովակի մեջ ապակե Պաստերի պիպետտի միջոցով: Չորացնել ստորին հիդրոֆոբ մասնիկը ազոտի հոսքի տակ ազոտի գոլորշիացման սարքում: Չորացրած գնդիկը պահեք -80 °C սառնարանում մինչև օգտագործելը:

Ճիճու լիզատների ուլտրաձայնային պատրաստում

Որդի լիզատ. L4 փուլի որդերը հավաքվել և երեք անգամ լվացվել են M9 բուֆերով (42,26 մՄ Na2HPO4, 22,04 մՄ ԿՀ2PO485,56 մՄ NaCl և 0,87 մՄ MgSO4) բոլոր բակտերիաները հեռացնելու համար: M9 բուֆերի հնարավորինս շատ հեռացումից հետո որդերը կրկին կասեցվել են լիզի բուֆերում՝ 50 մՄ HEPES, 50 մՄ KCl, 1 մՄ EDTA, 1 մՄ EGTA, 5 մՄ ֆոսֆատ β-գլիցերին, 0,1% (v/v) Triton X-100, 50 մՄ նատրիումի ֆտորիդ, 1 մՄ նատրիումի օրթովանադատ, 5 մՄ նատրիումի պիրոֆոսֆատ, 0,2 մՄ ֆենիլմեթանասուլֆոնիլֆտորիդ և պրոթեզերոնի արգելակիչ: Որդերը սառեցվել են հեղուկ ազոտի մեջ և հալվել 37°C ջերմաստիճանում երեք անգամ, այնուհետև որդերը չոր սառույցի վրա ձայնագրվել են ուլտրաձայնային VialTweeter միավորով՝ 10 նմուշի խողովակների միաժամանակյա պատրաստման համար: Sonication-ը իրականացվել է 50% ամպլիտուդով 2 վրկ 10 ցիկլով: 30 վրկ դադարով` ձայնային ցնցումների միջև ընկած ժամանակահատվածում: Այնուհետև նմուշները ցենտրիֆուգվել են 12000 rpm 4°C-ում 15 րոպե: Սուպերնաթանտը հավաքվել և պահվել է -70°C ջերմաստիճանում: Բրեդֆորդի վերլուծության միջոցով սպիտակուցի քանակական որոշման համար օգտագործվել է մասնիկ:
Ընդհանուր գլուտատիոնի, GSH-ի և GSSG-ի որոշում. գլուտատիոնի քանակականացման համար լիզատները և որոշումը կատարվել են նույն օրը: Գլյուկոզայով սնված և հսկիչ L4 թրթուրները հավաքվել և երեք անգամ լվացվել են M9 բուֆերով: M9 բուֆերը որքան հնարավոր է հեռացնելուց հետո որդերը նորից կախեցին սառցե մետաֆոսֆորական թթուում (5% վ/վ), այնուհետև որդերը սառույցի մեջ ձայնագրվեցին ուլտրաձայնային VialTweeter-ով 50% ամպլիտուդով տասը ձայնային ցիկլերի 2 վայրկյանում: 30 վրկ. դադար յուրաքանչյուր ցիկլի միջև: Այնուհետև ցենտրիֆուգում են 12000 rpm 4 ̊C-ում 15 րոպե:
(տես Alcántar-Fernández et al., 2018)

C. elegans Նմուշի պատրաստում նախքան իմունային տեղումները և Western Blotting-ը

Կարճ ասած, սաղմնային էքստրակտների համար C. elegans L1 թրթուրներն աճեցվել են լայնածավալ հեղուկ S-միջին կուլտուրաներում մինչև հասուն տարիք: Սաղմերը հավաքվել են սպիտակեցնող ստանդարտ մեթոդի կիրառմամբ և կասեցվել լիզի բուֆերի մեջ (50 մՄ Տրիս, pH 7,5, 100 մՄ KCl, 1 մՄ EDTA, 1 մՄ MgCl2, 8,7% գլիցերին, 0,05% NP-40, 1 Հիբիթեյթ, 100 մՄ KCl, 1 mM MgCl2, 8,7% գլիցերին, 0,05% NP-40, 1, 1, 1, 1, 1, 200,000,000 mM) 1 * Ֆոսֆատազի արգելակող կոկտեյլ I և II), արագ սառեցված հեղուկ ազոտի մեջ և լուծարվեց ուլտրաձայնային բջիջների խախտմամբ՝ օգտագործելով ուլտրաձայնային սարք՝ միկրոծածկույթով, ինչպիսին է UP200Ht S26d2-ով 10 վրկ 10 իմպուլսների համար 30% ամպլիտուդով: Եթե ավելի մեծ քանակությամբ նմուշներ պետք է պատրաստվեն ուլտրաձայնային VialTweeter կամ MultiSample-Ultrasonicator UIP400MTP-ը լավ թիթեղների համար խորհուրդ է տրվում: Sonication-ից հետո քաղվածքները նախապես մաքրվել են ցենտրիֆուգմամբ 30000 գ-ում 20 րոպե 4°C-ում: Նախապես մաքրված էքստրակտը (300 մկգ ընդհանուր սպիտակուց) ինկուբացվել է 40 մկ * գ հակա-CDC-25.1 հարաբերակցությամբ մաքրված հակամարմինով (այս ուսումնասիրությունը)՝ խաչաձև կապված A-ագարոզայի սպիտակուցի հետ կամ որպես հսկողություն՝ ճագարի իմունոգլոբուլինի նման քանակություն։ (Ig)G, որը խաչաձև կապված է սպիտակուցի A-agarose-ի հետ, օգտագործվել է 1% NP-40 պարունակող 200 մկլ լիզի բուֆերի ընդհանուր ծավալում, որի ընդգրկումը նվազեցրել է սպիտակուցների ոչ սպեցիֆիկ կապը մատրիցին: Նմուշները պտտվել են 1 ժամ 4°C-ում, ուլունքները երեք անգամ լվացվել են լիզի բուֆերով և զտվել 30 մկլ գլիցին/HCl և 200 մՄ NaCl, pH 2,2: Իմունային նստվածքից հետո էլուատները նոսրացվեցին 30 µ*l SDS նմուշի բուֆերի մեջ, տաքացրին մինչև 95°C 4 րոպե, և սովորաբար ընդհանուրի 3%-ը մուտքագրման համար և 30%-ը լուծվող նյութերի համար կիրառվում էին SDS-PAGE-ի վրա, որին հաջորդում էր Western blotting հակահայկական -CDC-25.1 (1:400), հակա-LIN-23 (1:750), հակա-ուբիկվիտին (1:1000), հակա-GSK3 * (1:500) կամ հակա-***β-ակտին (1: 2000) հակամարմիններ. Այն դեպքում, երբ քաղվածքները չեն ենթարկվել իմունային նստվածքի, այդ քաղվածքներից ստացված ընդհանուր սպիտակուցի նույն քանակությունը կրկին կասեցվել է SDS նմուշի բուֆերում, տաքացվել մինչև 95°C, այնուհետև ուղղակիորեն կիրառվել SDS-PAGE-ի վրա և վերլուծվել Western blotting-ով: (տես Segref et al. 2020)

Զոնդի տիպի ինսոնիֆիկատոր UP200St լիզիսի համար

Ուլտրաձայնային բջիջների խանգարիչ UP200St S26d2 միկրո ծայրով լիզի և սպիտակուցի արդյունահանման համար

Ուլտրաձայնային լիզիս ճշգրիտ ջերմաստիճանի հսկողության ներքո

VialTweeter-ը MultiSample Ultraonicator է, որը թույլ է տալիս հուսալի նմուշ պատրաստել ճշգրիտ վերահսկվող ջերմաստիճանի պայմաններում:Ջերմաստիճանի ճշգրիտ և հուսալի հսկողությունը կարևոր է կենսաբանական նմուշների հետ աշխատելիս: Բարձր ջերմաստիճանները նմուշներում սկսում են ջերմային ազդեցությամբ առաջացած սպիտակուցի քայքայումը:
Ինչպես բոլոր մեխանիկական նմուշների պատրաստման մեթոդները, այնպես էլ sononication-ը ջերմություն է ստեղծում: Այնուամենայնիվ, նմուշների ջերմաստիճանը կարելի է լավ վերահսկել VialTweeter-ն օգտագործելիս: Մենք ձեզ ենք ներկայացնում տարբեր տարբերակներ՝ վերահսկելու և վերահսկելու ձեր նմուշների ջերմաստիճանը, մինչդեռ դրանք պատրաստում եք VialTweeter-ի և VialPress-ի միջոցով վերլուծության համար:

  1. Նմուշի ջերմաստիճանի մոնիտորինգ. UP200St ուլտրաձայնային պրոցեսորը, որը վարում է VialTweeter-ը, հագեցած է խելացի ծրագրաշարով և խցանվող ջերմաստիճանի սենսորով: Միացրեք ջերմաստիճանի ցուցիչը UP200St-ի մեջ և տեղադրեք ջերմաստիճանի սենսորի ծայրը նմուշի խողովակներից մեկում: Թվային գունավոր սենսորային էկրանի միջոցով դուք կարող եք UP200St-ի ընտրացանկում սահմանել հատուկ ջերմաստիճանի միջակայք ձեր նմուշի ձայնային ախտահանման համար: Ուլտրաձայնային սարքը ավտոմատ կերպով կդադարի, երբ առավելագույն ջերմաստիճանը հասնի և կդադարի մինչև նմուշի ջերմաստիճանը իջնի սահմանված ջերմաստիճանի Δ-ի ցածր արժեքին: Այնուհետև նորից ինքնաբերաբար կսկսվի ձայնագրումը: Այս խելացի հատկությունը կանխում է ջերմային դեգրադացիան:
  2. VialTweeter բլոկը կարող է նախապես սառեցվել: Տեղադրեք VialTweeter բլոկը (միայն sonotrode-ն առանց փոխարկիչի!) սառնարանի կամ սառնարանի մեջ, որպեսզի նախապես հովացվի տիտանի բլոկը, որն օգնում է հետաձգել ջերմաստիճանի բարձրացումը նմուշում: Հնարավորության դեպքում, նմուշն ինքնին կարող է նաև նախապես սառեցնել:
  3. Օգտագործեք չոր սառույցը սառչելու համար՝ ձայնային ախտահանման ժամանակ: Օգտագործեք չոր սառույցով լցված մակերեսային սկուտեղ և տեղադրեք VialTweeter-ը չոր սառույցի վրա, որպեսզի ջերմությունը արագորեն ցրվի:

Գտեք օպտիմալ ուլտրաձայնային բջիջների խանգարիչը ձեր Lysis հավելվածի համար

Hielscher Ultrasonics-ը լաբորատորիաների, նստարանների և արդյունաբերական մասշտաբների համակարգերի համար բարձր արդյունավետության ուլտրաձայնային բջիջների խանգարողների և համասեռացուցիչների երկարամյա փորձառու արտադրող է: Ձեր բակտերիալ բջիջների կուլտուրայի չափը, ձեր հետազոտության կամ արտադրության նպատակը և մեկ ժամում կամ օրում մշակվող բջիջների ծավալը էական գործոններ են ձեր կիրառման համար ուլտրաձայնային բջիջների ճիշտ խանգարող գտնելու համար:
Hielscher Ultrasonics-ն առաջարկում է տարբեր լուծումներ բազմակի նմուշների (մինչև 10 սրվակ), ինչպես նաև զանգվածային նմուշների (այսինքն՝ միկրոտիտրային թիթեղներ / 96 ջրհորի թիթեղներ) միաժամանակյա ձայնագրման համար, դասական զոնդի տիպի լաբորատոր ուլտրաձայնային սարք՝ 50-ից մինչև տարբեր հզորության մակարդակներով։ 400 Վտ մինչև լիովին արդյունաբերական ուլտրաձայնային պրոցեսորներ մինչև 16000 վտ հզորությամբ մեկ միավորի համար առևտրային բջիջների խզման և սպիտակուցի արդյունահանման համար մեծ արտադրության մեջ: Hielscher-ի բոլոր ուլտրաձայնային սարքերը կառուցված են 24/7/365 աշխատանքի համար՝ լրիվ ծանրաբեռնվածության ներքո: Ամուրությունն ու հուսալիությունը մեր ուլտրաձայնային սարքերի հիմնական հատկանիշներն են:
Բոլոր թվային ուլտրաձայնային հոմոգենիզատորները հագեցած են խելացի ծրագրաշարով, գունավոր հպման էկրանով և տվյալների ավտոմատ արձանագրումով, որոնք ուլտրաձայնային սարքը դարձնում են հարմար աշխատանքային գործիք լաբորատորիայում և արտադրական օբյեկտներում:
Տեղեկացրեք մեզ, թե ինչպիսի բջիջներ, ինչ ծավալով, ինչ հաճախականությամբ և ինչ թիրախով պետք է մշակեք ձեր կենսաբանական նմուշները։ Մենք ձեզ խորհուրդ կտանք ուլտրաձայնային բջիջների ամենահարմար խանգարիչը ձեր գործընթացի պահանջներին համապատասխան:

Ստորև բերված աղյուսակը ցույց է տալիս մեր ուլտրաձայնային համակարգերի մոտավոր մշակման հզորությունը՝ կոմպակտ ձեռքի հոմոգենիզատորներից և MultiSample Ultrasonicators-ից մինչև արդյունաբերական ուլտրաձայնային պրոցեսորներ առևտրային կիրառությունների համար.

Խմբաքանակի ծավալը Հոսքի արագություն Առաջարկվող սարքեր
96 ջրհոր / միկրոտիտրային թիթեղներ ԱԺ UIP400MTP
10 սրվակ 0,5-ից 1,5 մլ ԱԺ VialTweeter-ը UP200 St
0.01-ից 250մլ 5-ից 100 մլ/րոպե UP50H
0.01-ից 500մլ 10-ից 200 մլ / րոպե UP100H
10-ից 2000 մլ 20-ից 400 մլ / րոպե UP200Ht, UP400 Փ
0.1-ից 20լ 0.2-ից 4լ/րոպե UIP2000hdT
10-ից 100 լ 2-ից 10 լ / րոպե UIP4000hdT
ԱԺ 10-ից 100 լ / րոպե UIP16000
ԱԺ ավելի մեծ կլաստերի UIP16000

Կապ մեզ հետ: / Հարցրեք մեզ:

Հարցրեք լրացուցիչ տեղեկությունների համար

Խնդրում ենք օգտագործել ստորև բերված ձևը՝ ուլտրաձայնային պրոցեսորների, հավելվածների և գնի մասին լրացուցիչ տեղեկություններ ստանալու համար: Մենք ուրախ կլինենք քննարկել ձեր գործընթացը ձեզ հետ և առաջարկել ձեզ ուլտրաձայնային համակարգ, որը համապատասխանում է ձեր պահանջներին:









Խնդրում ենք նկատի ունենալ մեր Գաղտնիության քաղաքականություն.




Ուլտրաձայնային բարձր կտրվածքային հոմոգենիզատորները օգտագործվում են լաբորատոր, նստարանային, փորձնական և արդյունաբերական մշակման մեջ:

Hielscher Ultrasonics-ը արտադրում է բարձր արդյունավետության ուլտրաձայնային հոմոգենիզատորներ՝ լաբորատոր, փորձնական և արդյունաբերական մասշտաբով կիրառական կիրառությունների խառնուրդի, ցրման, էմուլսացման և արդյունահանման համար:

Գրականություն / Հղումներ



Փաստեր, որոնք արժե իմանալ

Caenorhabditis elegans

C. elegans-ը մոտ 1 մմ երկարությամբ ազատ ապրող թափանցիկ նեմատոդ է (կլոր որդ), որը սնվում է բակտերիաներով (օրինակ՝ E. coli) և ունի համեմատաբար կարճ կյանքի ցիկլ։ 20 °C ջերմաստիճանում C. elegans-ի (N2) լաբորատոր ցեղատեսակի կյանքի տևողությունը միջինը կազմում է 2–3 շաբաթ, իսկ գեներացման ժամանակը` 3-ից 4 օր: Երբ C. elegans-ը աճեցվում է մեծ քանակությամբ, ինչը կարելի է հեշտությամբ կատարել ճշգրիտ վերահսկվող լաբորատոր պայմաններում, դրանք կարող են հեշտությամբ ստուգվել նոր դեղամիջոցների աշխատանքի սկզբունքի, ինչպես նաև մարդկային հիվանդությունների բարդ մոլեկուլային գործընթացներում դրանց ազդեցության և փոխազդեցության համար: Կարճ գենոմը, կյանքի կարճ ցիկլը և լաբորատոր պայմաններում պարզ կառավարումը C. elegans-ին դարձնում են իդեալական մոդել օրգանիզմ այնպիսի հետազոտությունների համար, ինչպիսիք են գենոմիկան, պրոտեոմիկան, զարգացման կենսաբանությունը, հիվանդությունների հետազոտությունը, դեղերի մշակումը և այլն:
Caenorhabditis elegans ճիճուները կարող են լինել արական կամ հերմաֆրոդիտ: Հերմաֆրոդիտներն ունեն և՛ արական, և՛ էգ վերարտադրողական օրգաններ։ Այնուամենայնիվ, էգ որդեր գոյություն չունեն։ Հերմաֆրոդիտները կարող են կամ ինքնաբեղմնավորվել, կամ կարող են նաև բազմանալ արու որդերով: C. elegans-ը կարող է ամեն օր արտադրել ավելի քան 1000 ձու:
Քանի որ C. elegans-ը նյարդային համակարգ ունեցող ամենապարզ օրգանիզմներից է, նեմատոդ որդն օգտագործվում է 1963 թվականից որպես հետազոտության մոդելային օրգանիզմ: Նեյրոնները չեն արձակում գործողության պոտենցիալները և չեն արտահայտում լարման սահմանափակող նատրիումային ալիքներ: Հերմաֆրոդիտում այս համակարգը ներառում է 302 նեյրոն, որի օրինաչափությունը համապարփակ քարտեզագրված է, որը հայտնի է որպես կոնեկտոմ:
C. elegans-ի գենոմի գեներից շատերն ունեն մարդկանց ֆունկցիոնալ նմանակներ, ինչը այն դարձնում է չափազանց օգտակար մոդել մարդկային հիվանդությունների համար և օգտագործվում է, օրինակ, զարգացման կենսաբանությունը, ծերացումը և երկարակեցության վրա ազդող գործոնները ուսումնասիրելու համար: Ավելին, C. elegans մուտանտները մոդելներ են տրամադրում մարդու բազմաթիվ հիվանդությունների համար, այդ թվում՝ նյարդաբանական խանգարումների (օրինակ՝ Ալցհեյմերի), բնածին սրտի և երիկամների հիվանդությունների համար:
Այս գործոնները C. elegans-ին դարձրին շատ արժեքավոր մոդել բազմաթիվ հետազոտական ոլորտների համար: Հետևաբար, C. elegans-ը առաջին բազմաբջիջ օրգանիզմն էր, որի ամբողջ գենոմի հաջորդականությունը կատարվեց: Գենոմը պարունակում է մոտ 20,470 սպիտակուցներ կոդավորող գեն: C. elegans-ի գեների մոտ 35%-ն ունեն մարդու հոմոլոգներ: Հատկանշական է, որ բազմիցս ապացուցվել է, որ մարդկային գեները փոխարինում են իրենց C. elegans հոմոլոգներին, երբ ներմուծվում են C. elegans-ում: Ընդհակառակը, C. elegans-ի շատ գեներ կարող են գործել այնպես, ինչպես կաթնասունների գեները:

C. elegans-ի կյանքի տեւողությունը մոտ. 3 շաբաթ և բաղկացած է կյանքի վեց փուլերից՝ էմբրիոգենեզ (ձվի փուլ), չորս թրթուրային փուլեր (L1-ից L4) և հասուն փուլ: Նեմատոդները դուրս են գալիս ձվերից որպես L1 թրթուրներ, որոնք բաղկացած են 560 բջիջներից: Յուրաքանչյուր թրթուրի փուլում աճը տեղի է ունենում բջիջների բաժանման և բջիջների հիպերտրոֆիայի միջոցով: Կուկիկուլյար ձուլումը կետադրում է թրթուրների յուրաքանչյուր փուլ: Եթե շրջակա միջավայրի կոշտ պայմաններն ազդարարում են զարգացող որդին, որ պայմանները դժվար թե նպաստեն մեծահասակների պտղաբերությանը, C. elegans-ը կարող է փոխել նրա զարգացումը և ձևավորել այլընտրանքային L3 թրթուրային փուլ, որտեղ թրթուրները անցնում են դաուեր փուլ: Այս վիճակում կենդանիները ծայրահեղ հանդուրժող են սթրեսի նկատմամբ և երկարակյաց են և կարող են գոյատևել երեքից ինը ամիս: Dauer թրթուրները մեկուսացնում են իրենց դժբախտություններից՝ փակելով և՛ բուկալային, և՛ հետանցքային խոռոչները, փոքրացնելով աղիքները և միացնելով daf-16/FOXO-ից կախված գենետիկական ծրագիրը, որը, ի թիվս այլ բաների, հանգեցնում է դաուերին հատուկ կուտիկուլի արտահայտմանը: (տես Henderson et al., 2006 թ.)

C. elegans Dauer Larvae

Dauer larvae տերմինն է նեմատոդների թրթուրների համար, որոնք մտել են այլընտրանքային զարգացման փուլ: «Dauer larvae» տերմինը հատկապես օգտագործվում է ռաբդիտիդների ընտանիքի որդերի համար, ներառյալ Caenorhabditis elegans-ը: «Դաուեր» բառը գերմանական ծագում ունի և նշանակում է «տեւողություն»:” -ի իմաստով “մի ժամանակահատված»: Դաուերի թրթուրները անցնում են մի տեսակ լճացման և կարող են գոյատևել ծանր պայմաններում: Եթե և երբ թրթուրը մտնում է դաուերի փուլ, կախված է շրջակա միջավայրի պայմաններից: Դաուերի թրթուրները լայնորեն ուսումնասիրվում են կենսաբանության մեջ, քանի որ թրթուրները ցույց են տալիս կոշտ միջավայրում գոյատևելու և երկար ժամանակ ապրելու արտասովոր ունակություն: Օրինակ, C. elegans dauer larvae-ն կարող է գոյատևել մինչև չորս ամիս, ինչը շատ ավելի երկար է, քան նրանց միջին կյանքի տևողությունը՝ մոտ երեք շաբաթ, նորմալ վերարտադրողական զարգացման ընթացքում:

C. elegans կյանքի ցիկլի ակնարկ

C. elegans Զարգացում բարենպաստ միջավայրում.
Caenorhabditis elegans-ը (C. elegans) բարենպաստ և անբարենպաստ շրջակա միջավայրի պայմաններում ցույց է տալիս զարգացման տարբեր առաջընթաց:
 
C. elegans Արձագանք բարենպաստ պայմաններին.
Բարենպաստ պայմաններում մանրադիտակային կլոր որդան Caenorhabditis elegans (C. elegans) ընթանում է զարգացման հստակ սահմանված ճանապարհով։ Նեմատոդը սովորաբար անցնում է իր կյանքի ցիկլը բավականին արագ, երբ շրջակա միջավայրի պայմանները օպտիմալ են, սովորաբար 15°C-ից մինչև 20°C ջերմաստիճանում:

  1. Վերարտադրողական զարգացում. C. elegans-ը սկսում է իր կյանքի ցիկլը որպես սաղմ: Այնուհետև այն անցնում է չորս տարբեր թրթուրների փուլերով, որոնք կրճատվում են որպես L1-ից L4:
  2. Մեծահասակների փուլ. Չորս թրթուրային փուլերն ավարտելուց հետո C. elegans-ը հասնում է հասուն փուլին ընդամենը 3-5 օրվա ընթացքում: Այս փուլում նրանք ունակ են վերարտադրվելու և շարունակում են ապրել ևս 2-3 շաբաթ՝ կախված շրջակա միջավայրի գործոններից։

 
C. elegans արձագանքը անբարենպաստ պայմաններին.

Այնուամենայնիվ, C. elegans-ը տոկուն օրգանիզմ է և կարող է հարմարվել անբարենպաստ պայմաններին դաուերի ձևավորում կոչվող գործընթացի միջոցով:

  1. Դաուերի ձևավորում. Երբ շրջակա միջավայրի պայմանները դառնում են անբարենպաստ, ինչպիսիք են գերբնակեցումը, սննդի սահմանափակ մատակարարումը կամ բարձր ջերմաստիճանը, C. elegans-ը կարող է անցնել արտասովոր երրորդ թրթուրային փուլ, որը կոչվում է. “դաուեր,” կրճատ՝ L3d:
  2. Dauer Survival: Դաուերի թրթուրները հատուկ հարմարեցված են ծանր պայմաններում գոյատևելու համար: Նրանք կարող են մի քանի ամիս ապրել այս փուլում՝ խնայելով էներգիան և դիմակայելով դժվար միջավայրերին:

 

Վերականգնում բարենպաստ միջավայրում.
C. elegans-ի ուշագրավ կողմը նրա կարողությունն է վերադառնալ նորմալ կյանքի ցիկլի, երբ պայմանները բարելավվեն:

  1. Վերադարձ դեպի Բարենպաստ պայմաններ. Երբ C. elegans dauer larvae-ն կրկին հանդիպում է բարենպաստ պայմանների, ինչպիսիք են առատ սնունդը, բնակչության ավելի ցածր խտությունը և հարմար ջերմաստիճանը, նրանք զգում են շրջակա միջավայրի փոփոխությունը:
  2. Վերականգնում և վերարտադրում. Այս բարելավված պայմաններին ի պատասխան՝ dauer larvae ենթարկվում են գործընթացի, որը կոչվում է “վերականգնում։” Վերականգնման ընթացքում նրանք վերադառնում են թրթուրային փուլերին և, ի վերջո, դառնում են վերարտադրողական չափահասներ՝ նորմալ կյանքի տեւողությամբ:

 
Շրջակա միջավայրի պայմաններին ի պատասխան զարգացման փուլերի միջև անցնելու այս ունակությունը C. elegans կենսաբանության հատուկ ասպեկտն է: Այն թույլ է տալիս նրանց գոյատևել և արդյունավետ կերպով վերարտադրվել մի շարք պայմաններում, ինչը նրանց դարձնում է արժեքավոր օրինակելի օրգանիզմ գիտական հետազոտությունների համար, մասնավորապես զարգացման, գենետիկայի և ծերացման ուսումնասիրության համար:

Մենք ուրախ կլինենք քննարկել ձեր գործընթացը:

Let's get in contact.