UIP400MTP माइक्रोप्लेट सोनिकेटर का उपयोग करके एमिलॉइड तंतुकों का निर्माण
एमिलॉइड तंतुक, क्रिस्टलों की तरह ही, नाभिकन और उसके बाद होने वाली वृद्धि की प्रक्रिया से बनते हैं। हालांकि, नाभिकन के उच्च मुक्त-ऊर्जा अवरोध के कारण, स्वतः एमिलॉइड तंतुक निर्माण केवल एक लंबे विलंब चरण के बाद होता है। अल्ट्रासोनिकेशन एमिलॉइड नाभिकन प्रेरित करने के एक शक्तिशाली साधन के रूप में उभरा है, जिससे तंतुक निर्माण में उल्लेखनीय तेजी आती है। थायोफ्लेविन T (ThT) प्रतिदीप्ति का उपयोग करने वाले माइक्रोप्लेट रीडर के साथ संयोजित होने पर, अल्ट्रासोनिकेशन एक साथ कई नमूनों में उच्च नमूना प्रसंस्करण क्षमता के साथ एमिलॉइड तंतुकों का पता लगाना संभव बनाता है।
UIP400MTP माइक्रोप्लेट सोनिकेटर के साथ अल्ट्रासोनिक रूप से प्रेरित एमिलॉइड तंतुक निर्माण
UIP400MTP मल्टी-वेल प्लेट सोनिकेटर से अनुसंधान के उद्देश्यों के लिए एकसमान गुणवत्ता वाले एमिलॉइड तंतुकों को बड़ी मात्रा में तेजी से संश्लेषित किया जा सकता है। यह कुशल पद्धति प्रोटीन की एमिलॉइड बनाने की प्रवृत्ति का अध्ययन करना संभव बनाती है। यह तकनीक तीव्र और पुनरुत्पादनीय एमिलॉइड तंतुक निर्माण को सुगम बनाती है, जैसा कि डायलिसिस-संबंधी एमिलॉइडोसिस से जुड़े एमिलॉइड बनाने वाले प्रोटीन β2-माइक्रोग्लोबुलिन (β2-m) के साथ प्रदर्शित किया गया है।
सरल प्रायोगिक पद्धति: अल्ट्रासोनिक रूप से प्रेरित एमिलॉइड तंतुक निर्माण
तंतुक निर्माण प्रेरित करने के लिए, एक 96-वेल माइक्रोप्लेट को UIP400MTP मल्टी-वेल प्लेट सोनिकेटर के केंद्र में रखा गया, जो सभी वेल में एकसमान अल्ट्रासोनिक प्रभाव सुनिश्चित करता है। प्रायोगिक स्थितियां इस प्रकार थीं:
- प्रत्येक वेल में 0.2 ml β2-माइक्रोग्लोबुलिन विलयन (0.3 mg/ml, pH 2.5) था, जिसमें 5 μM ThT मिलाया गया था।
- प्लेट को अल्ट्रासोनिकेशन चक्रों के अधीन रखा गया, जैसे 1 मिनट का अल्ट्रासोनिकेशन और उसके बाद 9 मिनट का विराम।
- सोनिकेशन के बाद, माइक्रोप्लेट रीडर का उपयोग करके ThT प्रतिदीप्ति मापी गई।
(तुलना करें: So et al., 2011)
पारंपरिक हिलाने की विधियों से तुलना
पारंपरिक हिलाने की विधियों की तुलना में, अल्ट्रासोनिकेशन ने तंतुक निर्माण के विलंब चरण को बहुत कम कर दिया। माइक्रोप्लेट को हिलाने की पारंपरिक स्थितियों में, 20 घंटे के बाद 10 में से केवल 1 वेल में ThT प्रतिदीप्ति में वृद्धि दिखाई दी। इसके विपरीत, चक्रीय अल्ट्रासोनिकेशन (15 मिनट का सोनिकेशन और उसके बाद 5 मिनट की स्थिर अवस्था) का उपयोग करने पर, पहले सोनिकेशन उपचार के तुरंत बाद ThT प्रतिदीप्ति में उल्लेखनीय वृद्धि का पता चला।
तंतुक निर्माण की गतिकी में तीव्र तेजी
So et al. (2011) से प्राप्त परिणामों ने प्रदर्शित किया कि अल्ट्रासोनिकेशन से pH 2.5 पर β2-माइक्रोग्लोबुलिन के स्वतः तंतुक निर्माण में लगने वाला समय कई घंटों से घटाकर केवल 10–15 मिनट किया जा सकता है।
परमाणु बल सूक्ष्मदर्शिकी (AFM) छवियों ने पुष्टि की कि हर 15 मिनट में 10 मिनट के अल्ट्रासोनिकेशन से बने तंतुक, आकारिकी की दृष्टि से हर 10 मिनट में 1 मिनट के अल्ट्रासोनिकेशन से बने तंतुकों से अलग नहीं थे। यह अल्ट्रासोनिक रूप से प्रेरित एमिलॉइड तंतुक निर्माण की पुनरुत्पादनीयता और सुदृढ़ता को रेखांकित करता है।
हर 10 min में 1-min अल्ट्रासोनिकेशन (i), हर 15 min में 10-min सोनिकेशन (ii), और अल्ट्रासोनिकेशन के बिना सीडिंग अभिक्रिया (iii) से निर्मित एमिलॉइड तंतुकों की AFM छवियां। सफेद पैमाना पट्टी 1 μm दर्शाती है।
अध्ययन और छवियां: ©So et al., 2011
उदासीन pH स्थितियों में तंतुक निर्माण
उदासीन pH स्थितियों में भी, 1.5 घंटे के विलंब समय के बाद तंतुक निर्माण प्राप्त हुआ, जो दर्शाता है कि अल्ट्रासोनिकेशन नाभिकन और वृद्धि के ऊर्जा अवरोध को उल्लेखनीय रूप से कम करता है। यह इस परिकल्पना को और समर्थन देता है कि एमिलॉइड तंतुक निर्माण मुख्यतः एक भौतिक अभिक्रिया है, जो काफी हद तक नाभिकन ऊर्जा अवरोध से सीमित होती है, जिसे अल्ट्रासोनिकेशन प्रभावी रूप से कम करता है।
एमिलॉइड-संबंधी रोगों के अनुसंधान पर प्रभाव
UIP400MTP माइक्रोप्लेट सोनिकेटर का उपयोग करके एमिलॉइड तंतुकों का सरल और विश्वसनीय निर्माण अल्ज़ाइमर रोग (AD) के अनुसंधान तथा पार्किंसन रोग, टाइप II मधुमेह और प्रणालीगत एमिलॉइडोसिस जैसे अन्य एमिलॉइड-संबंधी विकारों के लिए महत्वपूर्ण निहितार्थ रखता है। AD में, एमिलॉइड-β (Aβ) का समुच्चयन एक प्रमुख रोगात्मक पहचान है, फिर भी पारंपरिक विधियों में लंबे विलंब चरणों और परिवर्तनशीलता के कारण इसके तंतुक निर्माण की गतिकी का अध्ययन चुनौतीपूर्ण बना हुआ है। अल्ट्रासोनिकेशन द्वारा संचालित तंतुक निर्माण नाभिकन को तेज करता है, जिससे उच्च पुनरुत्पादनीयता और कम परिवर्तनशीलता सुनिश्चित होती है, जो संभावित अवरोधकों की स्क्रीनिंग और एमिलॉइड बनाने वाले तंत्रों को समझने के लिए अत्यंत महत्वपूर्ण है। इसके अतिरिक्त, UIP400MTP की उच्च नमूना प्रसंस्करण क्षमता प्रोटीन के गलत वलन और समुच्चयन की बड़े पैमाने पर जांच संभव बनाती है, जिससे ऐसे चिकित्सीय कारकों की खोज सुगम होती है जो तंतुक निर्माण को नियंत्रित कर सकते हैं और संभावित रूप से तंत्रिका अपक्षय की प्रगति को कम कर सकते हैं।
यह अध्ययन UIP400MTP मल्टी-वेल प्लेट सोनिकेटर का उपयोग करके किए जाने वाले अल्ट्रासोनिकेशन को एमिलॉइड तंतुक निर्माण में तेजी लाने की एक अत्यंत कुशल विधि के रूप में स्थापित करता है। इस पद्धति के प्रमुख लाभों में शामिल हैं:
- तंतुक निर्माण के विलंब समय में भारी कमी।
- सभी वेल में एकसमान अल्ट्रासाउंड प्रभाव, जिससे पुनरुत्पादनीय तंतुक निर्माण संभव होता है।
- उच्च नमूना प्रसंस्करण क्षमता के साथ स्क्रीनिंग की सुविधा, जो इसे पूरे जीनोम में प्रोटीन की एमिलॉइड बनाने की प्रवृत्ति की खोज के लिए उपयुक्त बनाती है।
अल्ट्रासोनिकेशन को ThT प्रतिदीप्ति पहचान के साथ एकीकृत करके, यह विधि एमिलॉइड तंतुक निर्माण के अध्ययन के लिए एक तीव्र, विस्तार योग्य और विश्वसनीय मंच प्रदान करती है। इसकी दक्षता और उच्च नमूना प्रसंस्करण क्षमता की संभावना को देखते हुए, यह पद्धति जैवभौतिकीय और औषधीय अनुसंधान के लिए एमिलॉइड तंतुकों के सरल संश्लेषण को सुगम बना सकती है, जिससे एमिलॉइड-संबंधी अध्ययनों और औषधि स्क्रीनिंग के लिए एक आशाजनक साधन मिलता है।
उच्च नमूना प्रसंस्करण क्षमता के साथ EM निष्कर्षण 96-वेल प्लेट सोनिकेटर UIP400MTP की सहायता से
साहित्य / संदर्भ
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Masatomo So, Hisashi Yagi, Kazumasa Sakurai, Hirotsugu Ogi, Hironobu Naiki, Yuji Goto (2011): Ultrasonication-Dependent Acceleration of Amyloid Fibril Formation. Journal of Molecular Biology, Volume 412, Issue 4, 2011. 568-577.
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
अक्सर पूछे जाने वाले प्रश्न
एमिलॉइड प्राथमिक नाभिकन क्या है?
एमिलॉइड प्राथमिक नाभिकन, एमिलॉइड तंतुक निर्माण का प्रारंभिक, दर-सीमित करने वाला चरण है, जिसमें एकलकी प्रोटीन संरूपणीय परिवर्तनों से गुजरते हैं और स्व-संयोजित होकर एक क्रांतिक नाभिक बनाते हैं। यह नाभिक आगे के समुच्चयन के लिए एक सांचे के रूप में कार्य करता है।
एमिलॉइडोसिस में तंतुक कैसे बनता है?
एमिलॉइडोसिस में, गलत वलित प्रोटीन नाभिकन-निर्भर बहुलकीकरण के माध्यम से समुच्चयित होते हैं। नाभिक बनने के बाद, एकलक द्वितीयक नाभिकन और सांचा-निर्देशित वृद्धि के माध्यम से तेजी से लंबे होकर β-शीट-समृद्ध तंतुकों में बदलते हैं, जिससे एमिलॉइड जमाव बनते हैं।
एमिलॉइड तंतुक बहुरूपता क्या है?
एमिलॉइड तंतुक बहुरूपता का अर्थ एक ही प्रोटीन से बने तंतुकों में संरचनात्मक विविधताओं से है। तंतुकों की आकारिकी, प्रोटोफिलामेंट व्यवस्था और आणविक संकुलन में अंतर पर्यावरणीय स्थितियों, उत्परिवर्तनों या समुच्चयन के अलग-अलग मार्गों के कारण उत्पन्न होते हैं।
एमिलॉइड तंतुकों और प्लाक के बीच क्या अंतर है?
एमिलॉइड तंतुक रैखिक, β-शीट-समृद्ध प्रोटीन समुच्चय होते हैं, जबकि एमिलॉइड प्लाक समुच्चयित तंतुकों के कोशिकाबाह्य जमाव होते हैं, जो अक्सर लिपिड, धातुओं और कोशिकीय मलबे के साथ मिश्रित होते हैं, जैसा कि अल्ज़ाइमर जैसे तंत्रिका अपक्षयी रोगों में देखा जाता है।
अल्फा-सिन्यूक्लिन और एमिलॉइड के बीच क्या अंतर है?
अल्फा-सिन्यूक्लिन एक तंत्रिका कोशिकीय प्रोटीन है जो सिनैप्टिक कार्य में शामिल होता है, लेकिन रोगात्मक स्थितियों में यह गलत ढंग से वलित होकर एमिलॉइड जैसे तंतुक बनाता है। “एमिलॉइड” गलत वलित, तंतुकमय प्रोटीन समुच्चयों के लिए एक सामान्य शब्द है, जबकि अल्फा-सिन्यूक्लिन तंतुक पार्किंसन जैसे रोगों के लिए विशिष्ट होते हैं।
प्रोटीन तंतुक क्या है?
प्रोटीन तंतुक गलत वलित या आंशिक रूप से अवलित प्रोटीनों से बना एक अत्यधिक सुव्यवस्थित, β-शीट-समृद्ध, धागेनुमा समुच्चय है। ये तंतुक सामान्यतः अघुलनशील होते हैं और नाभिकन-निर्भर बहुलकीकरण के माध्यम से बनते हैं। ये एमिलॉइडोसिस और तंत्रिका अपक्षयी रोगों (जैसे, अल्ज़ाइमर, पार्किंसन) सहित विभिन्न रोगात्मक स्थितियों से जुड़े होते हैं। हालांकि, जैविक प्रणालियों में कुछ कार्यात्मक प्रोटीन तंतुक भी मौजूद होते हैं, जैसे जीवाणुओं में कर्ली रेशे और मकड़ियों में रेशम के तंतुक।
Hielscher Ultrasonics उच्च प्रदर्शन वाले अल्ट्रासोनिक होमोजेनाइज़र का निर्माण करता है, जिनके आकार प्रयोगशाला स्तर से औद्योगिक स्तर तक होते हैं।

