સ્ટેફાયલોકોકસ બાયોફિલ્મ ખેતી અને ડિટેચમેન્ટ પ્રોટોકોલ
વિશ્વસનીય સંશોધન પરિણામો માટે પ્રમાણભૂત પદ્ધતિઓ આવશ્યક છે. અહીં તમે સ્ટેફાયલોકોકલ બાયોફિલ્મ્સ માટે ખેતી અને ટુકડી પ્રોટોકોલ શોધી શકો છો. આ પ્રોટોકોલ 96-વેલ પ્લેટ્સમાં કાર્યક્ષમ, ઉચ્ચ-થ્રુપુટ બાયોફિલ્મ ડિટેચમેન્ટ માટે UIP400MTP મલ્ટિ-વેલ પ્લેટ સોનીકેટરનો ઉપયોગ કરીને સુવ્યવસ્થિત ઉચ્ચ-થ્રુપુટ નમૂનાની તૈયારી પર ધ્યાન કેન્દ્રિત કરે છે. પ્રોટોકોલમાં બાયોફિલ્મની ખેતી, ધોવા અને વિઝ્યુલાઇઝેશન માટેના મુખ્ય પગલાં પણ છે, જેમાં પરિવર્તનક્ષમતા ઘટાડવા અને પુનઃઉત્પાદનક્ષમતા સુનિશ્ચિત કરવા પર ધ્યાન કેન્દ્રિત કરવામાં આવ્યું છે.
સ્ટેફાયલોકોકસ બાયોફિલ્મ અને એન્ટિબાયોટિક સંશોધન
સ્ટેફાયલોકોકસ બાયોફિલ્મ્સ એન્ટિબાયોટિક્સ અને રોગપ્રતિકારક પ્રતિભાવો સામેના તેમના પ્રતિકારને કારણે સતત ચેપમાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવે છે. બાયોફિલ્મની રચના બેક્ટેરિયા માટે રક્ષણાત્મક વાતાવરણ પૂરું પાડે છે, જે ચેપને સારવાર માટે મુશ્કેલ બનાવે છે. પ્રાયોગિક વર્કફ્લોને સુવ્યવસ્થિત કરવા માટે ઉચ્ચ-થ્રુપુટ પદ્ધતિઓ પર ભાર સાથે, બાયોફિલ્મ્સમાં સંશોધન ઘણીવાર તેમની રચના, વર્તન અને એન્ટિમાઇક્રોબાયલ્સની સંવેદનશીલતાને સમજવા પર ધ્યાન કેન્દ્રિત કરે છે.
UIP400MTP મલ્ટી-વેલ પ્લેટ સોનિકેટર 96-વેલ પ્લેટ્સમાંથી બાયોફિલ્મ્સની ઝડપી અને કાર્યક્ષમ ટુકડીને સક્ષમ કરીને બાયોફિલ્મ સંશોધનમાં નોંધપાત્ર લાભ પ્રદાન કરે છે. આ ઉપકરણ બધા કુવાઓને એકસમાન અલ્ટ્રાસોનિક ઉર્જા પ્રદાન કરે છે, પરિવર્તનક્ષમતાને ઘટાડીને સુસંગત પરિણામોની ખાતરી આપે છે.
સ્ટેફાયલોકોકસ બાયોફિલ્મ ખેતી અને ટુકડી માટે પ્રોટોકોલ
નીચે, અમે સ્ટેફાયલોકોકસ બાયોફિલ્મની ખેતી અને અલગ કરવાની પ્રક્રિયા દ્વારા પગલું-દર-પગલાની સૂચનાઓ સાથે તમને માર્ગદર્શન આપીએ છીએ. અનુકરણીય વિશ્લેષણાત્મક પગલા તરીકે, અમે તમને બતાવીએ છીએ કે કેવી રીતે ક્રિસ્ટલ વાયોલેટ સ્ટેનિંગ દ્વારા સ્પેક્ટ્રોફોટોમેટ્રિક રીતે ઉગાડવામાં આવેલા બાયોમાસનું પ્રમાણ નક્કી કરવું.
સ્ટેફાયલોકોકસ બાયોફિલ્મની ખેતી
જરૂરી સામગ્રી:
- જંતુરહિત ફ્લેટ-બોટમવાળી 96-વેલ પોલિસ્ટરીન ટિશ્યુ કલ્ચર-ટ્રીટેડ માઇક્રોટાઇટર પ્લેટ્સ ઢાંકણા સાથે
- 0.25% ગ્લુકોઝ સાથે ટ્રિપ્ટિક સોયા બ્રોથ (TSB).
- જૈવિક સલામતી કેબિનેટ
પગલાં:
- દૂષણ ઘટાડવા માટે જૈવિક સલામતી કેબિનેટમાં જંતુરહિત કાર્યકારી વાતાવરણ તૈયાર કરો.
- માઇક્રોટાઇટર પ્લેટ કુવાઓમાં 0.25% ગ્લુકોઝ ધરાવતું TSB ઉમેરો. ગ્લુકોઝ વિના TSB સામાન્ય રીતે બાયોફિલ્મ રચનાને સમર્થન આપતું નથી અને જો જરૂરી હોય તો જ તેનો ઉપયોગ નિયંત્રણ તરીકે થવો જોઈએ.
- નીચે વર્ણવ્યા પ્રમાણે તૈયાર કરેલ બેક્ટેરિયલ સ્ટ્રેઈન સાથે કુવાઓને ઈનોક્યુલેટ કરો:
- બેક્ટેરિયલ સસ્પેન્શન તૈયાર કરો, સોનિકેશનનો ઉપયોગ કરીને સસ્પેન્શનને એકરૂપ બનાવીને અથવા 23-ગેજની સોય અને સંક્ષિપ્ત વમળ વડે ક્લસ્ટરોને તોડીને, કોઈ પૂર્વ-અસ્તિત્વમાં રહેલા સેલ ક્લસ્ટરો ન હોવાની ખાતરી કરો.
- પ્લેટને તેના ઢાંકણ સાથે સીલ કરો અને બાયોફિલ્મ બનાવવા માટે શ્રેષ્ઠ સ્થિતિમાં (દા.ત., 24 કલાક માટે 37°C) માં પકાવો.
- વિશ્વસનીયતા સુનિશ્ચિત કરવા માટે દરેક બેક્ટેરિયલ તાણ (તાણ દીઠ ત્રણ કુવાઓ) માટે ત્રિપુટીમાં પ્રયોગ કરો.
- નકારાત્મક નિયંત્રણો માટે પ્લેટ દીઠ છ કુવાઓ ફાળવો. 96-વેલ પ્લેટ દીઠ 30 જેટલા સ્ટ્રેન્સનું પરીક્ષણ કરી શકાય છે.
બાયોફિલ્મ વિઝ્યુલાઇઝેશન અને ધોવા
- ઇન્ક્યુબેશન પછી, બાયોફિલ્મને ખલેલ પહોંચાડવાનું ટાળવા માટે માધ્યમને કાળજીપૂર્વક કાઢી નાખો.
- પ્લેન્કટોનિક બેક્ટેરિયાને દૂર કરવા માટે દરેક કૂવાને ચાર વખત શારીરિક ખારાથી ધોઈ લો.
- બાયોફિલ્મની હાજરીના સૂચક સફેદ પેચ માટે કૂવાના તળિયાનું નિરીક્ષણ કરો.
મલ્ટી-વેલ પ્લેટ સોનીકેટર UIP400MTP નો ઉપયોગ કરીને બાયોફિલ્મ ડિટેચમેન્ટ
ઉપકરણ સેટઅપ અને પરિમાણો:
- UIP400MTP મલ્ટિ-વેલ પ્લેટ સોનિકેટર
- ઓપરેટિંગ સેટિંગ્સ: 60% કંપનવિસ્તાર, 60 સેકન્ડ ચાલુ / 30 સેકન્ડ બંધ સાથે ચક્ર મોડ
પગલાં:
- ધોવાઇ માઇક્રોટાઇટર પ્લેટને UIP400MTP પ્લેટફોર્મ પર મૂકો.
- ભલામણ કરેલ સેટિંગ્સ પર નમૂનાઓને સોનિકેટ કરો (60% કંપનવિસ્તાર, 60 સેકન્ડ ચાલુ, 30 સેકન્ડ બંધ). બેક્ટેરિયાના તાણ માટે સેટિંગ્સને સમાયોજિત કરો.
- બાયોફિલ્મને અલગ કરવા માટે સોનિકેશન પ્રક્રિયા શરૂ કરો. અલ્ટ્રાસોનિક તરંગો બાયોફિલ્મ મેટ્રિક્સને વિક્ષેપિત કરે છે, આનુષંગિક બેક્ટેરિયાને મુક્ત કરે છે.
- UIP400MTP સાતત્યપૂર્ણ ડિટેચમેન્ટ પરિણામો માટે તમામ કુવાઓમાં એકસમાન એક્સપોઝરની ખાતરી કરે છે.
વિશ્લેષણાત્મક પગલું: ક્રિસ્ટલ વાયોલેટ (સીવી) નો ઉપયોગ કરીને અલગ સ્ટેફાયલોકોકસ બાયોફિલ્મ બાયોમાસનું પ્રમાણીકરણ
જરૂરી સામગ્રી:
- 0.1% ક્રિસ્ટલ વાયોલેટ (CV) સોલ્યુશન
- 95% ઇથેનોલ અથવા 30% એસિટિક એસિડ (દ્રાવ્યીકરણ માટે)
- માઇક્રોપ્લેટ રીડર 570 એનએમ પર વાંચવા માટે સક્ષમ છે
- સ્ટેનિંગ માટે જંતુરહિત માઇક્રોટાઇટર પ્લેટો
પગલાં:
- સ્ટેનિંગ પ્લેટની તૈયારી: સોનીકેટેડ પ્લેટના દરેક કૂવામાંથી 100 µL ડિટેચ્ડ બાયોફિલ્મ સસ્પેન્શનને સ્વચ્છ, જંતુરહિત 96-વેલ માઇક્રોટાઇટર પ્લેટના અનુરૂપ કૂવામાં સ્થાનાંતરિત કરો. આ સ્ટેનિંગ માટે સ્પષ્ટ અને સમાન વાતાવરણની ખાતરી કરે છે.
- ડિટેચ્ડ બાયોફિલ્મને સ્ટેનિંગ: ડિટેચ્ડ બાયોફિલ્મ સસ્પેન્શન ધરાવતા દરેક કૂવામાં 0.1% ક્રિસ્ટલ વાયોલેટ સોલ્યુશનનું 150 μL ઉમેરો. બાયોફિલ્મ સસ્પેન્શન અને ક્રિસ્ટલ વાયોલેટનું મિશ્રણ સુનિશ્ચિત કરવા માટે ધીમેધીમે પીપેટ કરો.
- ઇન્ક્યુબેશન: પ્લેટને ઓરડાના તાપમાને 15 મિનિટ સુધી ઉકાળવા દો જેથી કરીને ક્રિસ્ટલ વાયોલેટને બાયોમાસને અસરકારક રીતે ડાઘ કરી શકાય.
- ધોવા: સેવન પછી, બાયોમાસને ખલેલ પહોંચાડ્યા વિના કુવાઓમાંથી ક્રિસ્ટલ વાયોલેટ દ્રાવણને કાળજીપૂર્વક કાઢી નાખો. અનબાઉન્ડ ડાઘ દૂર કરવા માટે જંતુરહિત શારીરિક ખારા સાથે દરેક સારી રીતે ત્રણ વખત ધોવા.
- સૂકવણી: પ્લેટને ઓરડાના તાપમાને અથવા જંતુરહિત એરફ્લો હૂડ હેઠળ સૂકવવા દો. ગરમ કરવાનું ટાળો, કારણ કે આ પરિણામોને બદલી શકે છે.
- દ્રાવ્યીકરણ: બાઉન્ડ ક્રિસ્ટલ વાયોલેટને દ્રાવ્ય કરવા માટે દરેક કૂવામાં 95% ઇથેનોલ (અથવા 30% એસિટિક એસિડ, પ્રમાણભૂત પ્રયોગશાળાના આધારે) 200 µL ઉમેરો. ઓરડાના તાપમાને 10 મિનિટ માટે પ્લેટને પાઇપિંગ કરીને અથવા હલાવીને હળવા હાથે મિક્સ કરો.
- માપન: માઇક્રોપ્લેટ રીડરનો ઉપયોગ કરીને 570 એનએમ પર દ્રાવ્ય ક્રિસ્ટલ વાયોલેટ સોલ્યુશનની ઓપ્ટિકલ ડેન્સિટી (OD) માપો.
- ડેટા વિશ્લેષણ: પૃષ્ઠભૂમિ સ્ટેનિંગ માટે પ્રાયોગિક કુવાઓમાંથી નકારાત્મક નિયંત્રણોના સરેરાશ OD570 મૂલ્ય (TSB સાથે કુવાઓ પરંતુ બેક્ટેરિયલ ઇનોક્યુલમ નથી) બાદ કરો. ડેટા રેકોર્ડ કરો અને તેનું વિશ્લેષણ કરો.
નોંધ: પ્રજનનક્ષમતા સુનિશ્ચિત કરવા માટે દરેક સ્થિતિ માટે ત્રિપુટીમાં પ્રયોગ કરો. સલામતી અને નિકાલ પ્રોટોકોલનું પાલન કરીને, ક્રિસ્ટલ વાયોલેટ અને ઇથેનોલનું યોગ્ય સંચાલન સુનિશ્ચિત કરો.
UIP400MTP ના મુખ્ય ફાયદાઓ એક નજરમાં:
- ઉચ્ચ-થ્રુપુટ પ્રક્રિયા: મલ્ટી-વેલ પ્લેટ્સ માટે ખાસ ડિઝાઇન કરવામાં આવી છે, જે તમને એકસાથે બહુવિધ નમૂનાઓ પર પ્રક્રિયા કરવાની મંજૂરી આપે છે.
- સમાન અલ્ટ્રાસોનિક વિતરણ: કુવાઓમાં સમાન અલ્ટ્રાસોનિક તીવ્રતા સુનિશ્ચિત કરે છે, તમામ નમૂનાઓમાં સુસંગત પરિણામો પ્રદાન કરે છે.
- કોઈપણ પ્રમાણભૂત પ્લેટનો ઉપયોગ કરો: UIP400MTP કોઈપણ પ્રમાણભૂત મલ્ટિ-વેલ પ્લેટ્સ, પેટ્રી ડીશ અને ટ્યુબ રેક્સને હેન્ડલ કરી શકે છે. કોઈ ખર્ચાળ માલિકીની પ્લેટની જરૂર નથી!
- વપરાશકર્તા મૈત્રીપૂર્ણ ઇન્ટરફેસ: સેટઅપ અને નિયંત્રણમાં સરળ, તેને લેબ ઉત્પાદકતા વધારવા માટે એક ઉત્તમ સાધન બનાવે છે. પ્રોગ્રામેબલ સેટિંગ્સ અને ઓટોમેશન પ્રક્રિયા માનકીકરણની સુવિધા આપે છે!
ઉચ્ચ-થ્રુપુટ બાયોફિલ્મ ડિટેચમેન્ટ 96-વેલ પ્લેટ સોનિકેટર UIP400MTP સાથે
સાહિત્ય / સંદર્ભો
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
વારંવાર પૂછાતા પ્રશ્નો
એક્સ્ટ્રા સેલ્યુલર પોલિમરીક સબસ્ટન્સ (ઇપીએસ) શું છે?
એક્સ્ટ્રાસેલ્યુલર પોલિમરીક સબસ્ટન્સ (ઇપીએસ) એ બાયોપોલિમર્સનું જટિલ મિશ્રણ છે, જે મુખ્યત્વે પોલિસેકરાઇડ્સ, પ્રોટીન, ન્યુક્લિક એસિડ્સ અને લિપિડ્સનું બનેલું છે, જે બાયોફિલ્મ્સમાં સુક્ષ્મસજીવો દ્વારા સ્ત્રાવ થાય છે. EPS એક રક્ષણાત્મક મેટ્રિક્સ બનાવે છે જે માઇક્રોબાયલ સમુદાયને ઘેરી લે છે, માળખાકીય અખંડિતતા પૂરી પાડે છે, સપાટીને મધ્યસ્થી કરે છે અને કોષોને પર્યાવરણીય તાણથી બચાવે છે, જેમાં એન્ટિબાયોટિક્સ અને રોગપ્રતિકારક પ્રતિક્રિયાઓ સામેલ છે.
પ્લાન્કટોનિક બેક્ટેરિયાનો અર્થ શું છે?
પ્લાન્કટોનિક બેક્ટેરિયા એ ફ્રી-ફ્લોટિંગ, એક-કોષીય સુક્ષ્મસજીવો છે જે સસ્પેન્શનમાં અસ્તિત્વ ધરાવે છે, જેમ કે પ્રવાહી સંસ્કૃતિ અથવા શારીરિક પ્રવાહીમાં, સપાટી સાથે જોડાયેલા રહેવાને બદલે અથવા બાયોફિલ્મ્સ જેવા માળખાગત સમુદાયો બનાવવાને બદલે.
બાયોફિલ્મ અને પ્લાન્કટોનિક બેક્ટેરિયા વચ્ચે શું તફાવત છે?
બાયોફિલ્મ અને પ્લાન્કટોનિક બેક્ટેરિયા વચ્ચેનો મુખ્ય તફાવત તેમની સંસ્થામાં રહેલો છે. બાયોફિલ્મ્સ સ્ટ્રક્ચર્ડ, એક્સ્ટ્રાસેલ્યુલર પોલિમરીક સબસ્ટન્સ (ઇપીએસ) મેટ્રિક્સમાં જડિત બેક્ટેરિયાના સપાટીથી જોડાયેલા સમુદાયો છે, જ્યારે પ્લાન્કટોનિક બેક્ટેરિયા ફ્રી-ફ્લોટિંગ છે અને આવા માળખાકીય સંગઠનનો અભાવ છે.
શું બાયોફિલ્મમાં બેક્ટેરિયા પ્લાન્કટોનિક બેક્ટેરિયા કરતાં એન્ટિબાયોટિક્સ સાથે સારવાર કરવી વધુ મુશ્કેલ છે?
પ્લાન્કટોનિક બેક્ટેરિયાની તુલનામાં બાયોફિલ્મ્સમાંના બેક્ટેરિયાને એન્ટિબાયોટિક્સ સાથે સારવાર કરવી નોંધપાત્ર રીતે વધુ મુશ્કેલ છે. બાયોફિલ્મ મેટ્રિક્સ ભૌતિક અવરોધ તરીકે કામ કરે છે, અને અંદરના બેક્ટેરિયા બદલાયેલી મેટાબોલિક સ્થિતિઓ અને ઉન્નત તણાવ પ્રતિકાર દર્શાવે છે, જે એન્ટિબાયોટિકની અસરકારકતામાં ઘટાડો કરવામાં ફાળો આપે છે.
શું બાયોફિલ્મ્સ એન્ટીબાયોટીક્સ દ્વારા મારી શકાય છે?
બાયોફિલ્મ ક્યારેક એન્ટિબાયોટિક્સ દ્વારા નાબૂદ કરી શકાય છે, પરંતુ આ પડકારજનક છે. અસરકારક સારવાર માટે ઘણીવાર ઉચ્ચ એન્ટિબાયોટિક સાંદ્રતા, ચોક્કસ સંયોજનો અથવા સહાયક ઉપચારની જરૂર પડે છે, કારણ કે EPS મેટ્રિક્સ અને બેક્ટેરિયલ પ્રતિકાર પદ્ધતિઓ બાયોફિલ્મને રક્ષણ આપે છે.
શું સ્ટેફાયલોકોકસ અનુયાયી બેક્ટેરિયા છે?
સ્ટેફાયલોકોકસ બેક્ટેરિયા તેમની પાલન ક્ષમતાઓ માટે જાણીતા છે. તેઓ સપાટીઓ સાથે સરળતાથી જોડાય છે, બાયોફિલ્મ બનાવે છે, ખાસ કરીને તબીબી ઉપકરણો અથવા યજમાન પેશીઓ પર, તેમને સતત ચેપમાં મુખ્ય ફાળો આપે છે.
સ્ટેફાયલોકોકસ બેક્ટેરિયા કયા પ્રકારના હોય છે?
સ્ટેફાયલોકોકસ બેક્ટેરિયામાં ઘણા પ્રકારોનો સમાવેશ થાય છે, જેમાં સૌથી નોંધપાત્ર સ્ટેફાયલોકોકસ ઓરીયસ અને સ્ટેફાયલોકોકસ એપિડર્મિડિસ છે. S. aureus રોગકારક છે અને ગંભીર ચેપનું કારણ બની શકે છે, જ્યારે S. epidermidis સામાન્ય રીતે બાયોફિલ્મ-સંબંધિત ઉપકરણ ચેપ સાથે સંકળાયેલ છે.
ક્રિસ્ટલ વાયોલેટ શું છે?
ક્રિસ્ટલ વાયોલેટ એ મૂળભૂત રંગ છે જેનો ઉપયોગ સામાન્ય રીતે જૈવિક સામગ્રીને ડાઘાવા માટે કરવામાં આવે છે. માઇક્રોબાયોલોજીમાં, તેનો ઉપયોગ બાયોમાસને સ્ટેનિંગ કરીને બાયોફિલ્મની રચનાનું મૂલ્યાંકન કરવા માટે થાય છે, જે પછી સ્પેક્ટ્રોફોટોમેટ્રિક રીતે માપી શકાય છે.
Hielscher Ultrasonics થી ઉચ્ચ-પ્રદર્શન અલ્ટ્રાસોનિક હોમોજેનાઇઝર્સનું ઉત્પાદન કરે છે પ્રયોગશાળા પ્રતિ ઔદ્યોગિક કદ.



