Protokol stanovení minimální inhibiční koncentrace (MIC)
Stanovení minimální inhibiční koncentrace (MIC) založené na biofilmu je zásadní metodou pro hodnocení účinnosti antimikrobiálních látek proti mikroorganismům asociovaným s biofilmem, které vykazují zvýšenou rezistenci díky své ochranné extracelulární matrix. Klíčovým krokem tohoto testu je oddělení struktur biofilmu, při kterém se uvolní zabudované buňky pro přesné hodnocení viability. Sonikátor pro vícejamkové destičky UIP400MTP tento proces usnadňuje tím, že využívá fokusovaný ultrazvuk ke generování řízené kavitace, čímž efektivně uvolňuje buňky biofilmu a disperguje je do homogenní suspenze. Toto přesné a reprodukovatelné narušení biofilmu zvyšuje spolehlivost a kapacitu zpracování testů MIC, a činí tak z UIP400MTP zásadní nástroj pro rozvoj výzkumu biofilmů.
Proč byste měli při testech MIC používat sonikaci?
- Přesná, reprodukovatelná data: Získejte homogenní buněčné suspenze, které eliminují stínění matrix, takže vaše počty kolonií a hodnoty optické hustoty skutečně odrážejí antimikrobiální účinnost.
- Efektivita vysokokapacitního zpracování: Zpracujte celou 96jamkovou destičku současně za pouhé 1–3 minuty a nahraďte pomalé, nekonzistentní ruční seškrabávání zefektivněným pracovním postupem.
- Zachovaná viabilita buněk: Šetrně uvolněte zabudované buňky bez fyzického poškození způsobeného seškrabáváním a zachovejte vyšší míru přežití pro spolehlivé výpočty MIC/MBEC.
- Nulové riziko křížové kontaminace: Využijte bezkontaktní konstrukci typu cup-horn, která ošetřuje všechny jamky rovnoměrně, aniž by se sondy dotýkaly jednotlivých vzorků nebo jamek.
- Připravenost na shodu se standardy: Sjednoťte svou metodiku s validovanými průmyslovými protokoly, jako je ASTM E2799-22, a dodejte svým datům větší věrohodnost pro regulatorní nebo publikační účely.
- Spolehlivý screening léčiv a léčebných postupů: Důvěřujte svým výsledkům citlivosti a dělejte chytřejší rozhodnutí o antimikrobiální účinnosti, profilování rezistence nebo vývoji terapií.
Zvyšte výkon své laboratoře při zachování viability buněk. Sdělte nám typ své mikrotitrační destičky a získejte doporučení pro efektivní oddělení biofilmu a dispergaci buněk pomocí vysokokapacitní sonikace.
Sonikátor pro mikrodestičky UIP400MTP pro přesně řiditelné oddělování biofilmu v testech MIC a MBEC.
Sonikace pro oddělení biofilmu
Test MIC založený na biofilmu obvykle měří viabilitu bakterií nebo inhibici růstu pomocí metod, jako je výsev na plotny, počítání kolonií nebo měření optické hustoty. Sonikace je kritickým krokem v testech MIC založených na biofilmu při hodnocení antimikrobiální citlivosti mikroorganismů asociovaných s biofilmem. Její hlavní funkcí je oddělit a dispergovat buňky zabudované v matrix biofilmu do homogenní suspenze pro přesnou analýzu.
Biofilmy jsou ve srovnání s planktonními buňkami výrazně odolnější vůči antimikrobiálním látkám, a proto je řádné oddělení pro přesnou analýzu kritické. Během tohoto procesu generují ultrazvukové vlny řízenou kavitaci, která rozrušuje matrix biofilmu a uvolňuje zabudované buňky do homogenní suspenze v regeneračním médiu. Tento krok umožňuje přesné hodnocení viability buněk uvolněných z biofilmu metodami, jako je výsev na plotny, ředění a počítání kolonií. Řádné narušení biofilmu sonikací zabraňuje tomu, aby zbytkové složky matrix stínily buňky, což by jinak mohlo vést k podhodnocení antimikrobiální aktivity. Sonikátor pro vícejamkové destičky UIP400MTP je pro tento účel obzvláště vhodný, protože nabízí přesné a reprodukovatelné podmínky sonikace, které zajišťují spolehlivou a vysokokapacitní přípravu testovacích destiček.
Proč je sonikace nezbytná v testech minimální inhibiční koncentrace založených na biofilmu
Pro měření viability a počítání buněk je nutné úplné a spolehlivé oddělení a dispergace jednotlivých buněk. UIP400MTP podporuje rovnoměrné, nepoškozující oddělení biofilmu a dispergaci buněk pro robustní výsledky testů.
- Komplexnost biofilmu: Biofilmy jsou strukturovaná mikrobiální společenstva uzavřená v matrix extracelulární polymerní substance (EPS), která chrání mikroorganismy a činí je odolnějšími vůči antimikrobiálním látkám.
- Rovnoměrná dispergace: Aby bylo možné přesně změřit viabilitu buněk zabudovaných v biofilmu nebo jejich citlivost na antimikrobiální látky, musí být biofilm nejprve uvolněn a rozrušen na homogenní suspenzi.
Zatímco standardní MIC měří rezistenci planktonních buněk, sonikace je nezbytná pro testy MIC biofilmu a MBEC, aby byl získán správný výchozí stav buněk.
Protokol testu minimální inhibiční koncentrace založeného na biofilmu
Test minimální inhibiční koncentrace (MIC) stanovuje nejnižší koncentraci antimikrobiální látky potřebnou k inhibici viditelného růstu mikroorganismů. Tento protokol je určen pro mikroorganismy asociované s biofilmem a k narušení biofilmu využívá sonikátor pro vícejamkové destičky UIP400MTP.
Krok 1: Příprava bakteriálního inokula
- Připravte bakteriální suspenzi:
Kultivujte bakterie ve vhodném médiu do střední logaritmické fáze.
Nařeďte kulturu na standardizovanou hustotu buněk (např. 0,5 McFarlandova standardu nebo OD600 ~0,1). - Připravte antimikrobiální roztoky:
Nařeďte antimikrobiální látku ve vhodném médiu tak, abyste získali řadu koncentrací (např. dvojnásobná sériová ředění). - Napipetujte do 96jamkové destičky:
Přidejte antimikrobiální roztoky do jamek standardní 96jamkové destičky s konečným objemem jamky ~150–200 µL.
Zahrňte kontroly růstu (bez antimikrobiální látky) a kontroly sterility (bez bakteriálního inokula).
Krok 2: Tvorba biofilmu na víčku s kolíčky
- Nasaďte víčko s kolíčky:
Umístěte specializované víčko s kolíčky na inokulované jamky a zajistěte, aby byly kolíčky zcela ponořeny v bakteriální suspenzi. - Inkubujte destičku:
Inkubujte při vhodné teplotě (např. 37°C) po stanovenou dobu (např. 24 hodin) za statických podmínek, aby se na kolíčcích mohl vytvořit biofilm. - Opláchněte kolíčky:
Vyjměte víčko s kolíčky z bakteriální suspenze a šetrně je opláchněte ve sterilním fyziologickém roztoku nebo PBS, abyste odstranili volně ulpívající planktonní buňky. - Exponujte antimikrobiálním látkám:
Přeneste víčko s kolíčky do nové 96jamkové destičky obsahující dříve připravená ředění antimikrobiálních látek.
Inkubujte po definovanou dobu (např. 24 hodin) za statických podmínek, aby antimikrobiální látka mohla působit na biofilmy.
Krok 3: Expozice antimikrobiálním látkám
Sonikátor pro vícejamkové destičky UIP400MTP pro vysokokapacitní přípravu vzorků
Krok 4: Sonikace pomocí sonikátoru pro mikrodestičky UIP400MTP
Krok sonikace je kritický pro oddělení biofilmů od kolíčků víčka za účelem hodnocení viability. Se sonikátorem UIP400MTP postupujte podle těchto kroků:
- Připravte sestavu:
Naplňte každou jamku nové 96jamkové destičky regeneračním médiem (např. neutralizačním bujónem nebo sterilním růstovým médiem). - Přeneste víčko s kolíčky:
Sejměte víčko s kolíčky z destičky s antimikrobiálním ošetřením.
Opláchněte víčko s kolíčky ve sterilním fyziologickém roztoku nebo PBS, abyste odstranili zbytky antimikrobiálních látek. - Umístěte destičku do sonikátoru:
Nasaďte víčko s kolíčky na destičku s regeneračním médiem.
Vložte destičku s regeneračním médiem do sonikátoru UIP400MTP a zajistěte, aby destička seděla vystředěně a stabilně, jak je popsáno v návodu. - Nastavte parametry sonikace:
Nastavte parametry sonikace na UIP400MTP (nastavení lze přizpůsobit biofilmu):
Amplituda: 70–100%.
Doba sonikace: 1–3 minuty (upravte podle struktury biofilmu) v cyklickém režimu. - Sonikujte:
Spusťte proces sonikace. Ultrazvukové vlny naruší matrix biofilmu a uvolní buňky do regeneračního média. - Monitorujte proces:
Pomocí zásuvného teplotního čidla monitorujte teplotu vzorků v jamkách. UIP400MTP lze pro chlazení připojit k laboratornímu chladiči. - Manipulace po sonikaci:
Regenerační médium obsahující oddělené biofilmy ihned přeneste do nové sterilní destičky k následné analýze.
(A) Destička obsahující TSB s 2% glukózy použitá pro tvorbu biofilmu, regeneraci buněk a stanovení MIC a MBEC; (B) víčko s kolíky pro tvorbu stafylokokových biofilmů.
Buňky biofilmu vytvořené na kolících byly uvolněny sonikací (Hielscher Ultrasound Technology) po dobu 5 min v 96jamkových destičkách obsahujících čerstvé kultivační médium pro regeneraci buněk.
(Obrázek a studie: ©de Oliveira et al., 2016)
Krok 4: Hodnocení viability
Výsev a kultivace oddělených biofilmů:
- Proveďte sériová ředění regeneračního média a vysejte je na agar ke stanovení počtu jednotek tvořících kolonie (CFU).
- Vyhodnoťte MIC:
Stanovte MIC jako nejnižší koncentraci antimikrobiální látky, která v regeneračním médiu zcela inhibuje viditelný mikrobiální růst.
Přejděte na přesnou bezkontaktní sonikaci a zajistěte homogenní buněčnou suspenzi a důvěryhodné výsledky MIC!
Komu sonikace při testech MIC přináší výhody?
- Výrobci zdravotnických prostředků: K testování účinnosti povrchových úprav a validaci čisticích protokolů pro prostředky náchylné k tvorbě biofilmu.
- Kliničtí mikrobiologové: K přesné diagnostice infekcí spojených s implantáty (jako je PJI) získáním bakterií ze zdravotnického materiálu.
- Vývojáři léčiv: K hodnocení účinnosti nových antimikrobiálních látek proti odolným patogenům zabudovaným v biofilmu.
- Akademičtí výzkumníci: K provádění vysokokapacitních, reprodukovatelných studií biologie biofilmů a mechanismů antimikrobiální rezistence.
- Týmy průmyslové kontroly kvality: K hodnocení biologického znečištění (biofoulingu) a účinnosti dezinfekčních prostředků v průmyslovém prostředí (např. s využitím standardů ASTM E2799-22).
Design, výroba a poradenství – kvalita Made in Germany
Ultrazvukové přístroje Hielscher jsou dobře známé svou nejvyšší kvalitou a standardy designu. Robustnost a snadná obsluha umožňují hladkou integraci našich ultrazvukových přístrojů do průmyslových zařízení. Sonikátory Hielscher snadno zvládají drsné podmínky a náročná prostředí.
Hielscher Ultrasonics je společnost s certifikací ISO a klade zvláštní důraz na vysoce výkonné ultrazvukové přístroje se špičkovou technologií a uživatelskou přívětivostí. Ultrazvukové přístroje Hielscher samozřejmě splňují požadavky CE a vyhovují požadavkům UL, CSA a RoHs.
Zefektivněte přípravu vzorků v 96jamkových destičkách a testovacích destičkách pomocí sonikátoru pro vícejamkové destičky UIP400MTP
Literatura / Reference
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Často kladené otázky
Co je test MIC?
Test minimální inhibiční koncentrace (MIC) je standardizovaný test používaný ke stanovení nejnižší koncentrace antimikrobiální látky potřebné k inhibici viditelného růstu mikroorganismu. Obvykle se provádí metodou mikrodiluce v bujónu nebo agarovou diluční metodou, při nichž jsou mikroorganismy vystaveny sériovým ředěním antimikrobiální látky. Testy MIC jsou zásadní pro hodnocení antimikrobiální účinnosti, usměrňování klinické léčby a posuzování úrovně rezistence u planktonních mikroorganismů i mikroorganismů asociovaných s biofilmem.
Jaký je rozdíl mezi testem minimální inhibiční koncentrace založeným na biofilmu a testem MBIC?
Test minimální inhibiční koncentrace (MIC) založený na biofilmu a test minimální koncentrace inhibující biofilm (MBIC) spolu souvisejí, ale liší se svým účelem a metodikou.
Test MIC založený na biofilmu hodnotí nejnižší koncentraci antimikrobiální látky potřebnou k inhibici viditelného růstu nebo viability biofilmu, přičemž se zaměřuje na buňky asociované s biofilmem, nikoli na planktonní bakterie. Naproti tomu test MBIC specificky měří schopnost antimikrobiální látky zabránit tvorbě biofilmu, nikoli léčit již vytvořené biofilmy. Ačkoli se oba testy zabývají bakteriemi asociovanými s biofilmem, test MIC založený na biofilmu se zaměřuje na léčbu a test MBIC klade důraz na prevenci, takže jde o vzájemně se doplňující nástroje pro studium antimikrobiální účinnosti proti biofilmům.
Jaké biofilmy se používají v testech MIC?
V testech minimální inhibiční koncentrace (MIC) se používají jak mikrobiální biofilmy, tak planktonní buňky, aby bylo možné studovat antimikrobiální účinnost za různých podmínek.
- Planktonní buňky:
Planktonní buňky jsou volně se vznášející jednotlivé mikrobiální buňky, které slouží jako standardní model pro tradiční testy MIC. Mezi běžné mikroorganismy patří Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus a Candida albicans. Tyto testy stanovují MIC potřebnou k inhibici růstu volně žijících buněk a jsou zásadní pro počáteční antimikrobiální screening. - Buňky asociované s biofilmem:
Buňky biofilmu jsou mikroorganismy zabudované v extracelulární matrix, která výrazně zvyšuje jejich rezistenci vůči antimikrobiálním látkám. Testy MIC biofilmu často zahrnují:- Gramnegativní bakterie: Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa a Klebsiella pneumoniae, známé tvorbou biofilmu při infekcích a v průmyslovém prostředí.
- Grampozitivní bakterie: Staphylococcus aureus (včetně MRSA), Staphylococcus epidermidis a Enterococcus faecalis, které se často podílejí na infekcích spojených se zdravotnickými prostředky.
- Houby: Candida albicans a příbuzné druhy, významné u mykotických infekcí spojených s biofilmem.
- Vícedruhové biofilmy: Ty se někdy používají k napodobení přirozených polymikrobiálních biofilmů, jako jsou biofilmy v chronických ranách nebo při průmyslovém biofoulingu.
Porovnáním hodnot MIC pro planktonní buňky a buňky asociované s biofilmem mohou výzkumníci posoudit zvýšenou rezistenci biofilmů a identifikovat látky účinné proti těmto odolnějším mikrobiálním společenstvům.
Jaký je rozdíl mezi MIC a MBEC?
Minimální inhibiční koncentrace (MIC) je nejnižší koncentrace antimikrobiální látky potřebná k zabránění tvorbě biofilmu, zatímco minimální koncentrace eradikující biofilm (MBEC) je nejnižší koncentrace potřebná k eradikaci již vytvořeného biofilmu. MIC se zaměřuje na prevenci biofilmu, zatímco MBEC hodnotí účinnost léčby proti zralým biofilmům.
Jaké destičky se běžně používají pro testy MBEC?
Mikrotitrační destičky běžně používané pro testy MBEC jsou obvykle 96jamkové destičky z polystyrenu nebo polypropylenu. Tyto materiály poskytují vhodný povrch pro tvorbu biofilmu a jsou chemicky odolné vůči antimikrobiálním látkám testovaným během stanovení. Polystyrenové destičky jsou široce preferovány díky své optické čirosti, která je výhodná pro navazující analýzy, jako jsou spektrofotometrická nebo fluorescenční měření. Konstrukce těchto destiček zahrnuje odnímatelná víčka s kolíčky, která jsou pro test nezbytná, protože biofilmy se tvoří na kolíčcích ponořených do jamek obsahujících růstová média. Standardizované destičky, například ty, které vyhovují protokolu testu MBEC, jsou speciálně navrženy tak, aby zajistily reprodukovatelnost a kompatibilitu se sonikátorem UIP400MTP nebo jiným zpracovatelským zařízením.
Co jsou destičky s víčkem PEG?
Destičky s víčkem PEG jsou specializované systémy vícejamkových destiček, u nichž je víčko vybaveno malými kolíčky nebo kolíky z polyethylenglykolu (PEG), které zasahují do každé jamky. Tyto kolíčky poskytují povrch pro tvorbu mikrobiálního biofilmu za řízených podmínek a napodobují růst biofilmu v reálném prostředí. Konstrukce umožňuje, aby se biofilmy vyvíjely na kolíčcích, zatímco jamky obsahují růstová média nebo antimikrobiální látky, což umožňuje vysokokapacitní testování citlivosti biofilmu na ošetření, například v testech MBEC, MBIC a MIC.
Jaká je výhoda ultrazvukového uvolňování biofilmu ve srovnání se seškrabáváním buněk?
Ultrazvukové uvolňování biofilmu nabízí oproti seškrabávání buněk významnou výhodu, protože představuje neinvazivní, rovnoměrnou a vysoce účinnou metodu odstraňování biofilmů z povrchů. Na rozdíl od seškrabávání, které může být nekonzistentní a poškodit podkladový povrch nebo buňky, ultrazvukové vlny pronikají matrix biofilmu a rozrušují ji, aniž by narušily integritu sousedních struktur. Tato metoda zajišťuje reprodukovatelnost, minimalizuje riziko kontaminace a je obzvláště účinná u aplikací vyžadujících přesné odstranění biofilmu, například v mikrobiologických studiích nebo při testování zdravotnických prostředků. Přečtěte si více o tom, jak sonikátor UIP400MTP předčí seškrabávání buněk!
Hielscher Ultrasonics vyrábí vysoce výkonné ultrazvukové homogenizátory od laboratorní až po průmyslovou velikost.
