Protokol testu MBEC s využitím sonikátoru pro 96jamkové destičky UIP400MTP
Test MBEC se používá ke stanovení koncentrace antimikrobiálních látek potřebné k eliminaci biofilmů vytvořených na víčkách s kolíčky. Pro posouzení viability biofilmu je nutné biofilmy nejprve oddělit od víček s kolíčky 96jamkové destičky. Sonikace je pro toto oddělení nejspolehlivější a nejúčinnější metodou. Sonikátor pro vícejamkové destičky UIP400MTP je speciálně navržen ke zpracování testovacích destiček s maximální účinností a pohodlím, čímž zjednodušuje a urychluje vysokokapacitní testy MBEC.
Sonikace pro oddělení biofilmu
Sonikace je klíčovým krokem testů minimální koncentrace eradikující biofilm (MBEC), který umožňuje účinné uvolnění buněk biofilmu z povrchu, k němuž jsou přichyceny. Biofilmy jsou ze své podstaty strukturovaná společenství mikroorganismů uzavřená v extracelulární matrix, díky čemuž jsou ve srovnání s planktonními buňkami výrazně odolnější vůči antimikrobiálním látkám. Během testů MBEC využívá sonikace ultrazvukové vlny k vytvoření řízené kavitace, která narušuje matrix biofilmu a uvolňuje zabudované buňky do suspenze. Tento krok zajišťuje rovnoměrné rozptýlení buněk biofilmu v regeneračním médiu, což usnadňuje přesné hodnocení viability výsevem, ředěním nebo spektrofotometrickými metodami. Bez řádného oddělení biofilmu by zbytkové složky matrix mohly buňky chránit, což by vedlo k podhodnocení antimikrobiální účinnosti. Sonikace je proto nepostradatelná pro získání spolehlivých a reprodukovatelných hodnot MBEC, které odrážejí skutečný eradikační potenciál testovaných látek. Sonikátor pro vícejamkové destičky UIP400MTP umožňuje snadnou vysokokapacitní přípravu vzorků v testovacích destičkách.
Sonikátor pro vícejamkové destičky UIP400MTP usnadňuje vysokokapacitní přípravu vzorků v testovacích destičkách.
Protokol testu minimální koncentrace eradikující biofilm (MBEC)
Krok 1: Tvorba biofilmu
- Připravte bakteriální suspenzi:
Kultivujte bakterie ve vhodném médiu do logaritmické fáze růstu.
Zřeďte bakteriální kulturu na definovanou optickou hustotu (např. OD600 ~0,1). - Inokulujte 96jamkovou destičku:
Do každé jamky standardní 96jamkové mikrotitrační destičky přidejte bakteriální suspenzi (např. 150–200 µL). - Nasaďte víčko s kolíčky:
Umístěte víčko s kolíčky na inokulovanou destičku, aby se na povrchu kolíčků mohl vytvořit biofilm. - Inkubujte destičku:
Inkubujte sestavu při vhodné teplotě (např. 37°C) po dobu 24–48 hodin bez třepání, aby se podpořil růst biofilmu.
Krok 2: Ošetření antimikrobiálními látkami
- Připravte antimikrobiální roztoky:
Připravte řadu antimikrobiálních koncentrací v čerstvém médiu.
Vystavte biofilmy antimikrobiálním látkám:
Vyjměte víčko s kolíčky z bakteriální kultury a opláchněte jej ve sterilním fyziologickém roztoku nebo PBS, abyste odstranili planktonní buňky.
Umístěte víčko s kolíčky do nové 96jamkové destičky obsahující antimikrobiální roztoky. - Inkubujte destičku:
Inkubujte po definovanou dobu (např. 24 hodin), aby mohlo proběhnout antimikrobiální působení.
Sonikátor pro vícejamkové destičky UIP400MTP pro vysokokapacitní přípravu vzorků
Krok 3: Sonikace pomocí sonikátoru pro 96jamkové destičky UIP400MTP
Krok sonikace je zásadní pro oddělení biofilmů od víček s kolíčky za účelem posouzení viability. U sonikátoru UIP400MTP postupujte podle těchto kroků:
- Připravte sestavu:
Naplňte každou jamku čerstvé 96jamkové destičky regeneračním médiem (např. neutralizačním bujónem nebo čerstvým růstovým médiem). - Přeneste víčko s kolíčky:
Vyjměte víčko s kolíčky z destičky s antimikrobiálním ošetřením.
Opláchněte víčko s kolíčky ve sterilním fyziologickém roztoku nebo PBS, abyste odstranili zbytky antimikrobiálních látek. - Umístěte destičku a sonikátor:
Nasaďte víčko s kolíčky na destičku s regeneračním médiem.
Umístěte destičku s regeneračním médiem na platformu sonikátoru UIP400MTP a zajistěte, aby byla destička vystředěná a stabilní. - Nastavte parametry sonikace:
Nastavte parametry sonikace na UIP400MTP (nastavení lze přizpůsobit biofilmu):
Amplituda: 70–100%.
Doba sonikace: 1–3 minuty (upravte podle odolnosti biofilmu) v cyklickém režimu. - Sonikujte:
Spusťte proces sonikace. Ultrazvukové vibrace uvolní biofilmy z povrchu kolíčků do regeneračního média. - Sledujte proces:
Ke sledování teploty vzorků v jamkách použijte připojitelné teplotní čidlo. UIP400MTP lze pro chlazení připojit k laboratornímu chladiči. - Zpracování po sonikaci:
Ihned přeneste regenerační médium (nyní obsahující oddělené biofilmy) do čerstvé sterilní destičky pro následnou analýzu.
(A) Destička obsahující TSB s 2% glukózy použitá pro tvorbu biofilmu, získání buněk a
stanovení MIC a MBCB; (B) Víčko s trny pro tvorbu stafylokokových biofilmů. stanovení MIC a MBCB; (B) Víčko s trny pro tvorbu stafylokokových biofilmů.
Buňky biofilmu vytvořené na trnech byly uvolněny sonikací (Hielscher Ultrasound Technology) po dobu 5 min v 96jamkových destičkách obsahujících čerstvé kultivační médium pro získání buněk.
(Obrázek a studie: ©de Oliveira et al., 2016)
Krok 4: Hodnocení viability
Vysejte a kultivujte oddělené biofilmy:
- Proveďte sériová ředění regeneračního média a vysejte je na agar ke stanovení počtu kolonií tvořících jednotek (CFU).
Alternativně použijte kolorimetrický nebo fluorescenční test viability. - Zaznamenejte výsledky:
Stanovte MBEC jako nejnižší koncentraci antimikrobiální látky, která eradikovala detekovatelnou viabilitu biofilmu.
Design, výroba a poradenství – kvalita vyrobená v Německu
Ultrazvukové přístroje Hielscher jsou známé svou nejvyšší kvalitou a standardy designu. Robustnost a snadná obsluha umožňují hladkou integraci našich ultrazvukových přístrojů do průmyslových zařízení. Sonikátory Hielscher snadno zvládají drsné podmínky i náročná prostředí.
Hielscher Ultrasonics je společnost s certifikací ISO a klade zvláštní důraz na vysoce výkonné ultrazvukové přístroje s nejmodernější technologií a uživatelskou přívětivostí. Ultrazvukové přístroje Hielscher jsou samozřejmě v souladu s CE a splňují požadavky UL, CSA a RoHs.
Zjednodušte přípravu vzorků v 96jamkových a testovacích destičkách pomocí sonikátoru pro vícejamkové destičky UIP400MTP
Literatura / Reference
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Microplate Sonicator Validated in Peer-Reviewed Proteomics Study
Často kladené otázky
Co je test MBEC?
Test minimální koncentrace eradikující biofilm (MBEC) je standardizovaná metoda používaná ke stanovení nejnižší koncentrace antimikrobiální látky potřebné k eradikaci bakterií asociovaných s biofilmem. Zahrnuje kultivaci biofilmů na specializovaných površích, jejich vystavení různým antimikrobiálním koncentracím a posouzení viability oddělených buněk po narušení biofilmu, obvykle sonikací, za účelem vyhodnocení účinnosti ošetření.
Jaký je rozdíl mezi MBIC a MBEC?
Minimální koncentrace inhibující biofilm (MBIC) je nejnižší koncentrace antimikrobiální látky potřebná k zabránění tvorbě biofilmu, zatímco minimální koncentrace eradikující biofilm (MBEC) je nejnižší koncentrace potřebná k eradikaci již vytvořeného biofilmu. MBIC se zaměřuje na prevenci biofilmu, zatímco MBEC hodnotí účinnost ošetření proti zralým biofilmům.
Jaké destičky se pro testy MBEC běžně používají?
Mikrotitrační destičky běžně používané pro testy MBEC jsou obvykle 96jamkové destičky z polystyrenu nebo polypropylenu. Tyto materiály poskytují vhodný povrch pro tvorbu biofilmu a jsou chemicky odolné vůči antimikrobiálním látkám testovaným během testu. Polystyrenové destičky jsou široce preferovány pro svou optickou čirost, která je výhodná pro následné analýzy, jako jsou spektrofotometrická nebo fluorescenční měření. Konstrukce těchto destiček zahrnuje odnímatelná víčka s kolíčky, která jsou pro test zásadní, protože biofilmy se tvoří na kolíčcích ponořených do jamek obsahujících růstové médium. Standardizované destičky, například ty, které odpovídají protokolu testu MBEC, jsou speciálně zkonstruovány tak, aby zajistily reprodukovatelnost a kompatibilitu se sonikátorem UIP400MTP nebo jiným zpracovatelským zařízením.
Co jsou destičky s PEG víčkem?
Destičky s PEG víčkem jsou specializované systémy vícejamkových destiček, u nichž je víčko vybaveno malými kolíčky nebo trny z polyethylenglykolu (PEG), které zasahují do každé jamky. Tyto kolíčky poskytují povrch pro tvorbu mikrobiálního biofilmu za řízených podmínek a napodobují růst biofilmu v reálném prostředí. Konstrukce umožňuje, aby se biofilmy vyvíjely na kolíčcích, zatímco jamky obsahují růstové médium nebo antimikrobiální látky, což umožňuje vysokokapacitní testování citlivosti biofilmu na ošetření, například v testech MBEC a MBIC.
Hielscher Ultrasonics vyrábí vysoce výkonné ultrazvukové homogenizátory od laboratorních po průmyslové velikosti.