Ултразвукова обработка със сонда за подготовка на проби: изчерпателно ръководство
Ултразвуковата обработка със сонда е мощен инструмент за разрушаване на клетките, срязване на ДНК и диспергиране на частици в течни проби. Както всички техники в биологичните науки, микробиологията и клиничния анализ, ултразвуковата обработка изисква внимателно оптимизиране, за да се избегне увреждане на пробите, особено при работа с термочувствителни материали. Като следвате съвети – например да държите пробите върху лед, да контролирате амплитудата на ултразвуковата обработка, да използвате импулсен режим и да оптимизирате дълбочината на потапяне на сонотрода – можете да постигнете ефективни и възпроизводими резултати. В крайна сметка добре оптимизираният протокол за ултразвукова обработка гарантира успеха на последващите приложения и запазва целостта на ценните ви проби.
Ултразвукова обработка – незаменима стъпка в подготовката на проби
Ултразвуковата обработка със сонда е широко използвана техника за подготовка на проби в биологичните и химичните изследвания и в изследванията на материали. Процесът включва използване на ултразвукова енергия за разрушаване на клетките, срязване на ДНК, диспергиране на наночастици или емулгиране на разтвори. Чрез предаване на високоенергийни ултразвукови вълни през течна проба посредством сонда (сонотрод, ултразвуков рог, ултразвукова сонда) ултразвуковата обработка със сонда създава локализирани области с високо налягане, турбулентност и кавитация, които механично разрушават клетъчните структури или хомогенно диспергират частиците. Техниката обаче изисква внимателно оптимизиране, за да се избегне увреждане на пробата, особено на чувствителни биологични материали като протеини и нуклеинови киселини. Това ръководство за ултразвукова обработка със сонда дава практически съвети за ефективна подготовка на проби.
Ултразвуковият лабораторен хомогенизатор UP200Ht е популярен в изследователските лаборатории за подготовка на проби, лизис, екстракция, фрагментиране на ДНК и разтваряне.
- Регулирайте настройките на амплитудата
Амплитудата на ултразвуковата обработка се отнася до големината на вибрациите, генерирани от сондата. По-високите амплитуди предават по-интензивна ултразвукова енергия, но генерират повече топлина, което увеличава риска от разграждане на пробата. За разлика от тях по-ниските амплитуди осигуряват по-щадяща ултразвукова обработка, като намаляват натрупването на топлина и същевременно запазват целостта на пробата.
В зависимост от конкретното ви приложение използването на по-ниска амплитуда за по-дълъг период може да даде по-добри резултати от прилагането на много висока амплитуда на кратки импулси. Този подход намалява вероятността от термично разграждане, като същевременно осигурява достатъчно разрушаване или смесване на пробата. - Използвайте автоматично регистриране на данни
Интелигентното меню на всички цифрови ултразвукови апарати Hielscher предлага автоматично записване на данни. В момента, в който включите ултразвуковия апарат, се следят всички важни данни, като внесена енергия (обща и нетна), амплитуда, мощност, време – дори температура и налягане, ако сте свързали сензорите за температура и налягане. Всички данни се записват с дата и час като CSV файл върху вградена SD карта. - Оптимизиране на внесената енергия: осигурете правилното количество ултразвукова мощност
Оптимизирането на ултразвуковата обработка според специфичната внесена енергия (Ws/mL) предлага по-възпроизводим и количествено измерим подход от протоколите, основани на време. Макар продължителността на ултразвуковата обработка да остава фактор, именно общата предадена енергия на единица обем в крайна сметка определя степента на разрушаване на пробата. Недостатъчната внесена енергия може да доведе до непълен лизис или непълно диспергиране, докато прекомерното количество може да причини молекулно разграждане, денатурация на протеините или прегряване – особено в чувствителни биологични или полимерни системи.
Нашият съвет: Започнете с ниски стойности на специфичната внесена енергия – обикновено в диапазона 10–50 Ws/mL, в зависимост от вида на пробата – и ги увеличавайте постепенно според необходимостта. Следете процеса, като оценявате физическите промени (например мътност, вискозитет, диспергиране на частиците), и наблюдавайте за признаци на прекомерна ултразвукова обработка, като прекомерно образуване на пяна, повишаване на температурата или промяна в цвета на пробата. Регулирайте съответно амплитудата, импулсния цикъл и продължителността, за да достигнете целевата енергийна доза, като сведете до минимум термичното или механичното натоварване. - Използвайте импулсен режим, за да сведете до минимум натрупването на топлина
Ултразвуковите апарати Hielscher могат да работят в импулсен режим, който е особено полезен за чувствителни към температурата проби. Импулсният режим редува фази на ултразвукова обработка и пауза, което позволява на пробата да се охлажда между импулсите. Това предотвратява резки температурни скокове и свежда до минимум риска от разграждане, предизвикано от топлина. - Значението на температурния контрол: поддържайте пробите си охладени
Ултразвуковата обработка предава ултразвукова енергия в течността, като генерира топлина вследствие на турбулентността и триенето. Ако това не се контролира, може да доведе до повишаване на температурата, което може да разгради чувствителни биологични проби, като протеини, ензими и нуклеинови киселини. За ограничаване на този ефект температурният контрол е от решаващо значение по време на ултразвуковата обработка.
Един от най-простите и най-ефективните начини за предотвратяване на прегряване е да държите пробите си върху лед през целия процес на ултразвукова обработка. Това помага за поддържане на стабилна ниска температура и предпазва пробата ви от термично разграждане.
Всички цифрови ултразвукови апарати Hielscher разполагат с наблюдение на температурата. Свързваем температурен сензор непрекъснато измерва температурата в пробата. Съобразно зададената в програмата температурна граница ултразвуковият апарат автоматично спира, когато бъде достигната горната температурна граница, и продължава ултразвуковата обработка веднага щом бъде достигната долната граница на зададената температурна разлика.
Освен това можете да:- Поставите епруветката с пробата върху лед, преди да започнете процеса на ултразвукова обработка.
- Прекъсвате периодично ултразвуковата обработка, за да осигурите охлаждане, ако са необходими продължителни обработки.
- Държите пробата върху лед след ултразвуковата обработка, за да я стабилизирате допълнително.
Това е особено важно за протеиновите проби, тъй като протеините могат бързо да денатурират при повишени температури. Като поддържате пробите си студени, запазвате функционалната им цялост за последващи приложения, като уестърн блотинг, ензимни анализи или масспектрометрия.
- Правилният размер на сонотрода за вашата проба
Изборът на правилния размер на сонотрода за ултразвукова обработка на проби в биологичните науки и микробиологията е от решаващо значение за осигуряване на оптимално предаване на енергия и ефективно разрушаване на клетките или биомолекулите. Сонотродът с подходящ размер позволява ефективна кавитация, която е съществена за разрушаване на клетъчните стени, лизис на клетките и хомогенизиране на пробите. Ако сонотродът е твърде голям или твърде малък за обема или вида на пробата, това може да доведе до неравномерна ултразвукова обработка, прекомерно нагряване или недостатъчно разрушаване на клетките, което потенциално може да компрометира експерименталните резултати. Следователно изборът на подходящ размер на сонотрода помага да се запази целостта на пробата и осигурява възпроизводимост на експериментите. - Правилна дълбочина на сондата: избягвайте образуването на пяна и равномерното въздействие
Позиционирането на сондата е критичен, но често пренебрегван фактор при ултразвуковата обработка. Правилната дълбочина на сондата осигурява ефективно предаване на енергия и смесване на пробата. Ако сондата е потопена твърде плитко, може да възникне прекомерно образуване на пяна, която може да задържа въздушни мехурчета и да намали ефективността на ултразвуковата обработка. Ако сондата е потопена твърде дълбоко, може да не постигнете достатъчна циркулация, което води до неравномерна ултразвукова обработка на пробата.
Идеалната дълбочина на сондата обикновено е между 1/4 и 1/3 от височината на течността в епруветката или съда. Експериментирайте с различни дълбочини, за да намерите оптималната позиция, която максимизира предаването на енергия, без да причинява образуване на пяна.
При голям съд за проби бавното придвижване на сонотрода през пробата може да бъде полезно за осигуряване на равномерна ултразвукова обработка на цялата проба.
Ако използвате моделите ултразвукови апарати за множество проби CupHorn или UIP400MTP, напълнете CupHorn, както е описано в ръководството. - Оптимизирайте процеса на ултразвукова обработка: съобразете го с вашата проба
Ключът към успешната ултразвукова обработка със сонда е оптимизирането. Тъй като различните проби, включително клетки, тъкани и химични вещества, реагират по различен начин на ултразвуковата енергия, важно е да съобразите процеса с конкретните си нужди. Факторите, които трябва да вземете предвид при оптимизирането, включват:
Обем на пробата: По-големите обеми може да изискват по-дълго време за ултразвукова обработка или по-високи амплитуди.
Вискозитет на пробата: Вискозните проби може да се нуждаят от по-интензивна ултразвукова обработка, за да се постигне достатъчно разрушаване.
Желан резултат: Ако извършвате лизис на устойчиви тъкани, може да е необходим по-интензивен режим на ултразвукова обработка, докато за срязване на ДНК може да е достатъчна по-кратка ултразвукова обработка.
Чрез систематично изпитване и прецизиране на параметрите – като амплитуда, продължителност и дълбочина на сондата – можете да оптимизирате процеса на ултразвукова обработка за вашата конкретна проба.
Намерете правилния ултразвуков апарат за вашата задача по подготовка на проби
Hielscher Ultrasonics предлага пълна гама от ултразвукови апарати за вашата задача по подготовка на проби. Споделете с нас важни фактори, като вида на пробата, обема и конкретното приложение, по което работите. Нашият екип от експерти с удоволствие ще ви консултира, като ви предложи най-подходящия ултразвуков хомогенизатор за вашите изследователски експерименти.
Таблицата по-долу ви дава представа за приблизителния капацитет за обработка на нашите лабораторни ултразвукови апарати:
| Препоръчителни устройства | Обем при партидна обработка | Дебит |
|---|---|---|
| Ултразвуков апарат за плаки с 96 гнезда UIP400MTP | многогнездови / микротитърни плаки | n.a. |
| Ултразвуков CupHorn | CupHorn за флакони или лабораторна чаша | n.a. |
| GDmini2 | ултразвуков микропроточен реактор | n.a. |
| VialTweeter | 0,5 до 1,5mL | n.a. |
| UP100H | 1 до 500mL | 10 до 200mL/min |
| UP200Ht, UP200St | 10 до 1000mL | 20 до 200mL/min |
| UP400St | 10 до 2000mL | 20 до 400mL/min |
| Ултразвуков ситов вибратор | n.a. | n.a. |
Hielscher Ultrasonics е компания, сертифицирана по ISO, и поставя специален акцент върху високопроизводителни ултразвукови апарати, които се отличават с най-съвременна технология и удобство за потребителя. Разбира се, ултразвуковите апарати Hielscher съответстват на изискванията за CE и отговарят на изискванията на UL, CSA и RoHs.
Hielscher Ultrasonics доставя мощни безконтактни ултразвукови апарати за подготовка на проби и клиничен анализ. Ултразвуковият апарат за многогнездови плаки UIP400MTP, VialTweeter, CupHorn и проточният ултразвуков апарат GDmini2 обработват пробите, без да ги докосват.
- висока ефективност
- най-съвременна технология
- надеждност и здравина
- регулируем, прецизен контрол на процеса
- партидна обработка и обработка в линия
- за всякакъв обем
- интелигентен софтуер
- интелигентни функции (например програмируемост, регистриране на данни, дистанционно управление)
- лесна и безопасна работа
- минимална поддръжка
- CIP (почистване на място)
Ултразвуков апарат VialTweeter за едновременна ултразвукова обработка на 10 проби, например за разрушаване на клетките, извличане на протеини и срязване на ДНК
Литература / Източници
- Claudia Lindemann, Nataliya Lupilova, Alexandra Müller, Bettina Warscheid, Helmut E. Meyer, Katja Kuhlmann, Martin Eisenacher, Lars I. Leichert (2013): Redox Proteomics Uncovers Peroxynitrite-Sensitive Proteins that Help Escherichia coli to Overcome Nitrosative Stress. J Biol Chem. 2013 Jul 5; 288(27): 19698–19714.
- Turrini, Federica; Donno, Dario; Beccaro, Gabriele; Zunin, Paola; Pittaluga, Anna; Boggia, Raffaella (2019): Pulsed Ultrasound-Assisted Extraction as an Alternative Method to Conventional Maceration for the Extraction of the Polyphenolic Fraction of Ribes nigrum Buds: A New Category of Food Supplements Proposed by The FINNOVER Project. Foods. 8. 466; 2019
- Giricz Z., Varga Z.V., Koncsos G., Nagy C.T., Görbe A., Mentzer R.M. Jr, Gottlieb R.A., Ferdinandy P. (2017): Autophagosome formation is required for cardioprotection by chloramphenicol. Life Science Oct 2017. 11-16.
- Hemida, Yasmine (2016): Effect of Rapamycin as an Inhibitor of the mTOR Cell Cycle Entry Complex on the Selective Lysis of Human Leukemia Cells Lines in Vitro Using 20 kHz Pulsed Low-Frequency Ultrasound. Honors Capstone Projects – All. 942, 2016.
- Fernandes, Luz; Santos, Hugo; Nunes-Miranda, J.; Lodeiro, Carlos; Capelo, Jose (2011): Ultrasonic Enhanced Applications in Proteomics Workflows: single probe versus multiprobe. Journal of Integrated OMICS 1, 2011.
- Priego-Capote, Feliciano; Castro, María (2004): Analytical uses of ultrasound – I. Sample preparation. TrAC Trends in Analytical Chemistry 23, 2004. 644-653.
- Welna, Maja; Szymczycha-Madeja, Anna; Pohl, Pawel (2011): Quality of the Trace Element Analysis: Sample Preparation Steps. In: Wide Spectra of Quality Control; InTechOpen 2011.
Често задавани въпроси
Каква е целта на ултразвуковата обработка?
Целта на ултразвуковата обработка е да използва звукови вълни, обикновено в ултразвуковия диапазон, за да приведе в движение частиците в пробата, като улеснява процеси като разрушаване на клетките, хомогенизиране и разрушаване на молекулни структури. Тя се използва често в биологични и химични приложения и в материалознанието за подобряване на смесването, подпомагане на реакциите или освобождаване на клетъчното съдържимо.
В какво се състои техниката на ултразвуковата обработка?
Техниката на ултразвуковата обработка включва използване на интензивни ултразвукови вълни (обикновено при честоти между 20 – 30 kHz) за генериране на бързи вибрации в течна среда. Тези вибрации причиняват образуване и колапс на микроскопични мехурчета – процес, известен като акустична кавитация. Тази кавитация създава локално високо налягане и висока температура, които могат да разрушават клетките, да диспергират частици или да улесняват химични реакции. Техниката на ултразвуковата обработка се използва широко в лабораториите за приложения като клетъчен лизис, екстракция, срязване на ДНК, хомогенизиране и синтез на наночастици.
Как се подготвя проба за ултразвукова обработка?
За да се подготви проба за ултразвукова обработка, материалът на пробата (обикновено течност или суспендирани твърди частици) се поставя в подходящ съд, често стъклена колба, пластмасова епруветка или многогнездова плака, с достатъчен обем, за да поеме ултразвуковите вибрации и да предотврати разливане. Ако е необходимо, пробата се разрежда с буфер или разтворител, за да се поддържа желаната концентрация и да се предотврати прегряване по време на ултразвуковата обработка. За термочувствителни проби съдът след това се потапя частично в ледена баня или охлаждаща риза, за да се отвежда топлината, генерирана от ултразвуковите вълни. Сондата на ултразвуковия апарат се позиционира правилно, за да се осигури ефективно предаване на енергия. Параметрите, като амплитуда, време и импулсен режим, се задават въз основа на конкретните изисквания на експеримента.
Разрушава ли ултразвуковата обработка ДНК?
Да, ултразвуковата обработка може да разруши ДНК. Високоенергийните ултразвукови вълни, генерирани по време на ултразвуковата обработка, могат да срязват молекулите на ДНК, като създават локализирани области с високо налягане и топлина, което води до механично натоварване на ДНК веригите. Това води до фрагментиране на ДНК на по-малки части. Степента на разрушаване на ДНК зависи от продължителността и интензивността на ултразвуковата обработка. В някои експерименти, като имунопреципитация на хроматин (ChIP) или подготовка на библиотеки за секвениране от ново поколение (NGS), ултразвуковата обработка се използва като надеждна техника за контролирано срязване на ДНК.
Hielscher Ultrasonics произвежда високопроизводителни ултразвукови хомогенизатори от лабораторен до промишлен мащаб.
