Nghiên cứu Microbiome và phân tích lâm sàng được sắp xếp hợp lý bởi sonication

Sonication là một kỹ thuật mạnh mẽ được sử dụng rộng rãi trong nghiên cứu microbiome và phân tích lâm sàng tạo điều kiện cho việc chuẩn bị mẫu thông lượng cao. Phương pháp siêu âm đặc biệt hiệu quả để xử lý các mẫu sinh học phức tạp, chẳng hạn như các mẫu có chứa vi sinh vật. Việc sử dụng sonication tạo điều kiện ly giải tế bào, chiết xuất và phân tích axit nucleic, protein và chất chuyển hóa, cho phép hiểu sâu hơn về cộng đồng vi sinh vật và vai trò của chúng đối với sức khỏe và bệnh tật. Máy sonicators thông lượng cao Hielscher nổi tiếng với độ chính xác, hiệu quả và kết quả có thể tái tạo, khiến chúng trở thành một lựa chọn tuyệt vời cho các nghiên cứu về hệ vi sinh vật.
 
 
Tận dụng lợi thế của sonication thông lượng cao trong nghiên cứu microbiome

Chuẩn bị mẫu thông lượng cao với Sonicator tấm 96 giếng UIP400MTP

Ứng dụng của Sonication trong nghiên cứu Microbiome

Ly giải tế bào hiệu quả
Sonication có hiệu quả cao trong việc lysing các tế bào vi sinh vật, bao gồm cả những tế bào có thành tế bào cứng, chẳng hạn như vi khuẩn gram dương và nấm. Các sóng siêu âm tạo ra bong bóng xâm thực trong mẫu, làm sụp đổ và tạo ra sóng xung kích phá vỡ các bức tường và màng tế bào mở. Quá trình này đảm bảo sự gián đoạn tế bào toàn diện và giải phóng hiệu quả các nội dung nội bào, chẳng hạn như DNA, RNA và protein.

Phân mảnh DNA có kiểm soát
Đối với các ứng dụng như giải trình tự thế hệ tiếp theo, thường cần phải cắt DNA thành các đoạn nhỏ hơn, đồng nhất. Sonication cung cấp kiểm soát chính xác quá trình phân mảnh, cho phép các nhà nghiên cứu thu được các đoạn DNA có kích thước mong muốn. Kiểm soát này rất quan trọng để chuẩn bị các thư viện trình tự và đảm bảo dữ liệu trình tự chất lượng cao.

Tăng cường đồng nhất mẫu
Trong nghiên cứu microbiome, các mẫu thường chứa hỗn hợp vi sinh vật đa dạng. Sonication giúp đạt được sự phân bố đồng đều của các vi sinh vật này trong mẫu, đảm bảo kết quả nhất quán và có thể tái tạo. Sự đồng nhất hóa này rất quan trọng để phân tích định lượng chính xác, chẳng hạn như xác định sự phong phú của vi sinh vật hoặc đo lường các hoạt động trao đổi chất cụ thể.

Làm thế nào là Sonication áp dụng trong nghiên cứu Microbiome và chẩn đoán?

Metabolomics, metagenomics và metaproteomics được đan xen trong nghiên cứu microbiome vì chúng cung cấp sự hiểu biết toàn diện về cộng đồng vi sinh vật và chức năng của chúng. Lysis, tinh chế protein và phân mảnh DNA / RNA là các bước chuẩn bị mẫu thiết yếu được sắp xếp hợp lý bằng cách sử dụng UIP400MTP sonicator tấm 96 giếng.

Phân tích chuyển hóa và chuyển hóa
Metabolomics liên quan đến nghiên cứu có hệ thống các chất chuyển hóa phân tử nhỏ trong một hệ thống sinh học. Trong nghiên cứu microbiome, sonication được sử dụng để lyse tế bào vi sinh vật, giải phóng các chất chuyển hóa nội bào. Số lượng mẫu cao có thể được xử lý nhanh chóng bằng cách sử dụng UIP400MTP sonicator tấm 96 giếng. Các chất chuyển hóa được chiết xuất sau đó được định lượng bằng các kỹ thuật tiên tiến như khối phổ (MS) và quang phổ cộng hưởng từ hạt nhân (NMR). Dữ liệu thu được cung cấp ảnh chụp nhanh về trạng thái trao đổi chất của hệ vi sinh vật, tiết lộ những hiểu biết sâu sắc về các hoạt động và tương tác sinh hóa trong cộng đồng vi sinh vật.

Metagenomics và Metatranscriptomics
Metagenomics liên quan đến việc phân tích toàn diện vật liệu di truyền được thu hồi trực tiếp từ các mẫu môi trường. Sonication đóng một vai trò quan trọng trong quá trình này bằng cách lysing các tế bào vi sinh vật để trích xuất DNA chất lượng cao, sau đó được giải trình tự để xác định và định lượng các loài vi sinh vật có mặt. Trong metatranscriptomics, RNA được chiết xuất bằng các phương pháp sonication tương tự để nghiên cứu hồ sơ biểu hiện gen trên các cộng đồng vi sinh vật khác nhau. Để giải trình tự DNA và RNA, các axit nucleic phải được phân mảnh theo một chiều dài cặp bazơ nhất định. Tất cả các nhiệm vụ này được thực hiện một cách đáng tin cậy và nhanh chóng bởi sonicator thông lượng cao UIP400MTP!

Proteomics
Phân tích protein đòi hỏi phải chiết xuất protein từ các tế bào vi sinh vật. Sonication được sử dụng hiệu quả để phá vỡ các tế bào, giải phóng protein vào dung dịch. Những protein này sau đó có thể được tinh chế và phân tích để hiểu vai trò chức năng của chúng trong một microbiome và sự tham gia của chúng vào các con đường trao đổi chất. Với sonicator tấm đa giếng UIP400MTP, bạn có thể thực hiện nhiệm vụ ly giải và chiết xuất protein trong vòng vài phút, tạo ra kết quả tái tạo để hiểu rõ hơn về các quá trình sinh học được điều khiển bởi protein trong cộng đồng vi sinh vật.

Metaproteomics
Metaproteomics mở rộng phân tích protein cho toàn bộ cộng đồng vi sinh vật, nghiên cứu hàm lượng protein tập thể để hiểu biểu hiện chức năng và tương tác trong microbiome. Sonication được sử dụng để lyse tế bào, giải phóng các protein sau đó được tinh chế và phân tích thông qua các kỹ thuật như khối phổ. Cách tiếp cận này cung cấp những hiểu biết chi tiết về các quá trình sinh học tích cực và sự thích nghi của các cộng đồng vi sinh vật trong các môi trường khác nhau.

Tận dụng khả năng xử lý thông lượng cao của máy sonicator tấm đa giếng UIP400MTP và tạo điều kiện thuận lợi cho việc nghiên cứu và phân tích microbiome của bạn!

Thiết kế, sản xuất và tư vấn – Chất lượng Sản xuất tại Đức

Hielscher ultrasonicators nổi tiếng với chất lượng cao nhất và tiêu chuẩn thiết kế của họ. Mạnh mẽ và hoạt động dễ dàng cho phép tích hợp trơn tru của ultrasonicators của chúng tôi vào các cơ sở công nghiệp. Điều kiện khắc nghiệt và môi trường đòi hỏi dễ dàng được xử lý bởi Hielscher ultrasonicators.

Hielscher Ultrasonics là một công ty được chứng nhận ISO và đặc biệt nhấn mạnh vào ultrasonicators hiệu suất cao có công nghệ tiên tiến và thân thiện với người dùng. Tất nhiên, Hielscher ultrasonicators là CE tuân thủ và đáp ứng các yêu cầu của UL, CSA và RoHs.