Як ультразвукова обробка може перезарядити лізоцим для лізису бактеріальних клітин
, Катрін Хілшеропублікований в Hielscher News
Розкриття бактеріальних клітин - важливий крок у біотехнології, фармацевтичних дослідженнях та виробництві білків. Одним з найпоширеніших інструментів для цієї роботи є лізоцим - фермент, який послаблює клітинні стінки бактерій. Але хоча лізоцим ефективний, він часто недостатньо швидкий і потужний сам по собі – особливо, коли маєш справу з щільними культурами або бактеріями, сконструйованими для надмірної експресії білків.
Ось тут і з'являється ультразвукова обробка. Дослідники все частіше покладаються на ультразвукову обробку, щоб значно покращити лізис клітин на основі лізоциму. При спільному використанні лізоцим та ультразвукова обробка утворюють високоефективну, взаємодоповнюючу систему, яка забезпечує швидші, повніші та більш відтворювані результати.
Чому одного лізоциму часто не вистачає
Лізоцим розщеплює пептидоглікан, ключовий структурний компонент клітинних стінок бактерій. Цей ферментний підхід є щадним і широко використовується, зокрема для лікування кишкової палички. Однак у реальних лабораторних умовах лікування лише лізоцимом може бути обмеженим.
Серед найпоширеніших проблем можна виділити наступні:
- Неповне руйнування клітин у культурах високої щільності або агрегованих культурах
- Тривалий час інкубації
- Знижена ефективність у надмірно експресуючих або адаптованих до стресу бактерій
- Варіабельність від партії до партії
Ці обмеження можуть негативно вплинути на подальші процеси, такі як екстракція білка, освітлення та очищення, що в кінцевому підсумку знижує вихід і консистенцію.
Наука, що стоїть за синергією лізоциму та ультразвуку
Ультразвукова обробка вводить ультразвукові хвилі високої інтенсивності в рідкий зразок. Ці хвилі генерують мікроскопічні бульбашки, які швидко руйнуються в процесі, відомому як кавітація. Сили зсуву, зміни тиску і мікрострумені, що виникають в результаті, фізично руйнують клітинні структури.
Коли ультразвукова обробка застосовується після або поряд з лікуванням лізоцимом, ці два методи підсилюють один одного кількома важливими способами:
- Полегшений доступ до клітинної стінки
Лізоцим послаблює клітинну стінку бактерій, роблячи її набагато вразливішою до механічних сил, що створюються ультразвуком. - Прискорення лізису клітин
Ультразвукова енергія значно скорочує час, необхідний для досягнення повного руйнування клітин, порівняно з ферментативним лікуванням. - Більш рівномірна обробка
Ультразвукова обробка покращує перемішування, гарантуючи, що всі клітини зазнають послідовного впливу як лізоциму, так і механічного стресу. - Вищий вихід білка
Більш повний лізис означає більше вивільнення внутрішньоклітинних білків, ферментів і метаболітів, що покращує загальне одужання.
Типовий робочий процес ультразвукової обробки за допомогою лізоциму
У лабораторіях, що працюють з надмірно експресуючими штамами бактерій, добре налагоджений робочий процес поєднує ферментативний та ультразвуковий лізис:
- Ресуспензія клітин
Зібрані бактеріальні гранули ресуспендують у відповідному буфері для лізису, що містить лізоцим, зазвичай у концентрації 0,1-1 мг/мл. М'яка ультразвукова обробка сприяє швидкому та рівномірному ресуспендуванню клітин. - Ферментативна попередня обробка
Суспензію інкубують протягом 10-30 хвилин при контрольованій температурі (зазвичай від 4 до 25 °C), що дозволяє лізоциму послабити клітинну стінку. - Ультразвуковий зрив
Попередньо оброблена суспензія обробляється ультразвуком за допомогою ультразвукового процесора Hielscher, з оптимізованою амплітудою, імпульсним режимом та охолодженням. - Роз'яснення
Клітинні залишки видаляють за допомогою центрифугування або фільтрації, залишаючи освітлений лізат, багатий на цільові білки.
Чому дослідники обирають сонатори Hielscher
Ультразвукові прилади Hielscher особливо добре підходять для лізису клітин за допомогою лізоциму завдяки своїй точності та гнучкості. Основні переваги включають:
- Регульована амплітуда та вхідна енергія для відтворюваної обробки
- Імпульсний режим роботи для зменшення накопичення тепла
- Ефективна кавітація в широкому діапазоні об'ємів і в'язкості
- Легке масштабування від мікролітрових лабораторних зразків до промислового виробництва
Таке поєднання робить системи Hielscher цінними інструментами як для дослідницьких лабораторій, так і для великомасштабного виробництва.
Багатолунковий пластинчастий сонник UIP400MTP для високопродуктивної пробопідготовки
Ключові фактори для оптимізації результатів
Щоб отримати максимальну віддачу від ультразвукової обробки за допомогою лізоциму, дослідники ретельно налаштовують кілька параметрів:
- Концентрація лізоциму: Використовуйте найнижчу ефективну дозу, щоб контролювати витрати та мінімізувати подальші перешкоди.
- Ультразвукова енергія: Застосуйте достатню потужність, щоб забезпечити повний лізис, не пошкоджуючи чутливі білки.
- Контроль температури: Системи охолодження або крижані ванни допомагають захистити термочутливі цілі.
- Налаштування імпульсів: Переривчаста ультразвукова обробка покращує ефективність кавітації та стабільність зразка.
Підвищуйте рівень лізоциму за допомогою ультразвукової обробки!
Поєднання лізоциму з ультразвуковим руйнуванням пропонує надійне, високоефективне рішення для лізису бактеріальних клітин. Ультразвукова обробка підвищує ефективність ферментативного лікування, забезпечуючи швидшу обробку, більш повне руйнування та вищий вихід внутрішньоклітинних продуктів.
Завдяки точно контрольованим і масштабованим ультразвуковим системам, таким як системи Hielscher, дослідники можуть точно налаштувати свої робочі процеси відповідно до вимог сучасної біотехнології. – чи то в маленькій лабораторії, чи то на промисловому виробництві.
Лізис бактерій з високою пропускною здатністю з ультразвуковим пристроєм для мікропланшетів UIP400MTP
Література / Список літератури
- Ghosh, A., Bhar, K. & Siddhanta, A. (2019): Oxygen sequestration by Leghemoglobin is positively regulated via its interaction with another late nodulin, Nlj16 of Lotus japonicus. Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology 28, 2019. 414–423.
- Hannah K. Lembke; Adeline Espinasse; Mckenna G. Hanson; Christian J. Grimme;Zhe Tan; Theresa M. Reineke; Erin E. Carlson (2023): Cationic Polymers Enable Internalization of Negatively Charged Chemical Probes into Bacteria. ACS Chem Biol . 2023 September 15; 18(9): 2063–2072.
- Müller MRA, Ehrmann MA, Vogel RF (2000): Multiplex PCR for the Detection ofLactobacillus pontis and Two Related Species in a Sourdough Fermentation. Applied Environmental Microbiology 66, 2000.
- Di Giosia, Matteo; Bomans, Paul; Bottoni, Andrea; Cantelli, Andrea; Falini, Giuseppe; Franchi, Paola; Guarracino, Giuseppe; Friedrich, Heiner; Lucarini, Marco; Paolucci, Francesco; Rapino, Stefania; Sommerdijk, Nico; Soldà, Alice; valle, Francesco ; Zerbetto, Francesco; Calvaresi, Matteo (2018): Proteins as Supramolecular Hosts for C60: A True Solution of C60 in Water. Nanoscale 10(21); 2018.
Поширені запитання
Що таке лізоцим?
Лізоцим - це антимікробний фермент, який каталізує гідроліз β(1→4) глікозидних зв'язків у пептидоглікані, ключовому структурному компоненті клітинних стінок бактерій, що призводить до ослаблення та лізису клітинної стінки, особливо у грампозитивних бактерій та проникних грамнегативних клітин.
Які переваги та обмеження лізису клітин за допомогою лізосом?
Лізис клітин за допомогою лізоциму має такі переваги, як м'які умови реакції, збереження функціональності білків і низький механічний тиск, але він обмежений повільною кінетикою, неповним лізисом у щільних або резистентних бактеріальних культурах, зниженою ефективністю проти інтактних зовнішніх мембран грамнегативних бактерій і варіабельністю в залежності від фізіології клітин і умов росту.
Як ультразвукова обробка посилює лізоцим?
Ультразвукова обробка посилює активність лізоциму шляхом механічного руйнування та проникнення бактеріальних клітинних стінок за допомогою сил зсуву, спричинених кавітацією, що збільшує доступ ферменту до пептидоглікану, прискорює кінетику лізису та призводить до більш повного та гомогенного руйнування клітин.


