Як ультразвукова обробка може посилити дію лізоциму для лізису бактеріальних клітин
, Kathrin Hielscher, опубліковано в розділі Новини Hielscher
Руйнування бактеріальних клітин є критичним етапом у біотехнології, фармацевтичних дослідженнях та виробництві білків. Один із найпоширеніших інструментів для цієї мети – лізоцим, фермент, який послаблює клітинні стінки бактерій. Але хоча лізоцим є ефективним, сам по собі він часто не є достатньо швидким або потужним – особливо при роботі з щільними культурами або бактеріями, спроектованими для надмірної експресії білків.
Саме тут на допомогу приходить ультразвукова обробка. Дослідники дедалі частіше покладаються на ультразвукову обробку для суттєвого покращення лізису клітин на основі лізоциму. При спільному використанні лізоцим і ультразвукова обробка утворюють високоефективну, комплементарну систему, яка забезпечує швидші, більш повні та відтворювані результати.
Чому лізоцим сам по собі часто не дає бажаного ефекту
Лізоцим діє, руйнуючи пептидоглікан – ключовий структурний компонент клітинних стінок бактерій. Цей ферментативний підхід є м’яким і широко використовується, особливо для E. coli. Однак в реальних лабораторних умовах обробка лише лізоцимом може бути обмеженою.
Типові проблеми включають:
- Неповне руйнування клітин у культурах високої щільності або з агрегацією
- Тривалі часи інкубації
- Знижена ефективність у бактерій з надмірною експресією або адаптованих до стресу
- Варіабельність від партії до партії
Ці обмеження можуть негативно впливати на наступні процеси, такі як екстракція білків, очищення та рафінування – зрештою знижуючи вихід і стабільність.
Наука за синергією лізоциму та ультразвукової обробки
Ультразвукова обробка вносить високі інтенсивності ультразвукових хвиль у рідкий зразок. Ці хвилі генерують мікроскопічні бульбашки, які швидко колапсують у процесі, відомому як кавітація. Отримані зсувні сили, зміни тиску та мікрострумені фізично руйнують клітинні структури.
Коли ультразвукова обробка застосовується після – або одночасно з – обробкою лізоцимом, два методи підсилюють один одного кількома важливими способами:
- Легший доступ до клітинної стінки
Лізоцим послаблює бактеріальну клітинну стінку, роблячи її значно вразливішою до механічних сил, створених ультразвуком. - Швидший лізис клітин
Ультразвукова енергія суттєво скорочує час, необхідний для досягнення повного руйнування клітин, порівняно з лише ферментативною обробкою. - Більш однорідна обробка
Ультразвукова обробка покращує змішування, забезпечуючи, щоб усі клітини зазнавали послідовного впливу як лізоциму, так і механічного навантаження. - Вищі виходи білків
Більш повний лізис означає більше вивільнення внутрішньоклітинних білків, ферментів та метаболітів – покращуючи загальне відновлення.
Типовий робочий процес ультразвукової обробки за участю лізоциму
У лабораторіях, що працюють з бактеріальними штамами з надмірною експресією, добре встановлений робочий процес поєднує ферментативний та ультразвуковий лізис:
- Пересуспензія клітин
Зібрані бактеріальні осади пересуспензують у відповідному буфері для лізису, що містить лізоцим, зазвичай у концентраціях 0,1–1 mg/mL. Помірна ультразвукова обробка сприяє швидкій та однорідній пересуспензії клітин. - Ферментативна попередня обробка
Суспензію інкубують протягом 10–30 хвилин при контрольованих температурах (зазвичай між 4 °C та 25 °C), дозволяючи лізоциму послабити клітинну стінку. - Ультразвукове руйнування
Попередньо оброблену суспензію піддають ультразвуковій обробці за допомогою ультразвукового процесора Hielscher з оптимізованою амплітудою, імпульсним режимом та охолодженням. - Очищення
Клітинні уламки видаляють за допомогою центрифугування або фільтрації, залишаючи очищений лізат, багатий на цільові білки.
Чому дослідники обирають ультразвукові обробники Hielscher
Ультразвукові обробники Hielscher особливо добре підходять для лізису клітин за участю лізоциму завдяки своїй точності та гнучкості. Ключові переваги включають:
- Регульована амплітуда та вхідна енергія для відтворюваної обробки
- Робота в імпульсному режимі для зменшення накопичення тепла
- Ефективна кавітація у широкому діапазоні об’ємів та в’язкостей
- Легке масштабування від мікролітрових лабораторних зразків до промислового виробництва
Ця комбінація робить системи Hielscher цінними інструментами як у дослідницьких лабораторіях, так і в середовищах великомасштабного виробництва.
Багатоямковий ультразвуковий обробник UIP400MTP для високопродуктивної підготовки зразків
Ключові фактори для оптимізації результатів
Щоб отримати максимум від ультразвукової обробки за участю лізоциму, дослідники ретельно налаштовують кілька параметрів:
- Концентрація лізоциму: Використовуйте найнижчу ефективну дозу для контролю витрат та мінімізації втручання на наступних етапах.
- Ультразвукова енергія: Застосовуйте достатню потужність, щоб забезпечити повний лізис без пошкодження чутливих білків.
- Керування температурою: Системи охолодження або ледяні ванни допомагають захистити термочутливі цілі.
- Налаштування імпульсів: Переривчаста ультразвукова обробка покращує ефективність кавітації та стабільність зразка.
Посилюйте лізоцими за допомогою ультразвукової обробки!
Поєднання лізоциму з ультразвуковим руйнуванням пропонує надійне, високопродуктивне рішення для лізису бактеріальних клітин. Ультразвукова обробка посилює ефективність ферментативної обробки, забезпечуючи швидшу обробку, більш повне руйнування та вищі виходи внутрішньоклітинних продуктів.
Завдяки точно контрольованим та масштабованим ультразвуковим системам, таким як ті від Hielscher, дослідники можуть тонко налаштовувати свої робочі процеси для задоволення вимог сучасної біотехнології – чи то у невеликій лабораторії, чи на промисловій виробничій лінії.
Лізис бактерій у високопродуктивному режимі за допомогою багатоямкового ультразвукового обробника UIP400MTP
Література / Посилання
- Ghosh, A., Bhar, K. & Siddhanta, A. (2019): Oxygen sequestration by Leghemoglobin is positively regulated via its interaction with another late nodulin, Nlj16 of Lotus japonicus. Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology 28, 2019. 414–423.
- Hannah K. Lembke; Adeline Espinasse; Mckenna G. Hanson; Christian J. Grimme;Zhe Tan; Theresa M. Reineke; Erin E. Carlson (2023): Cationic Polymers Enable Internalization of Negatively Charged Chemical Probes into Bacteria. ACS Chem Biol . 2023 September 15; 18(9): 2063–2072.
- Müller MRA, Ehrmann MA, Vogel RF (2000): Multiplex PCR for the Detection ofLactobacillus pontis and Two Related Species in a Sourdough Fermentation. Applied Environmental Microbiology 66, 2000.
- Di Giosia, Matteo; Bomans, Paul; Bottoni, Andrea; Cantelli, Andrea; Falini, Giuseppe; Franchi, Paola; Guarracino, Giuseppe; Friedrich, Heiner; Lucarini, Marco; Paolucci, Francesco; Rapino, Stefania; Sommerdijk, Nico; Soldà, Alice; valle, Francesco ; Zerbetto, Francesco; Calvaresi, Matteo (2018): Proteins as Supramolecular Hosts for C60: A True Solution of C60 in Water. Nanoscale 10(21); 2018.
Часто задавані питання
Що таке лізоцими?
Лізоцими – це антимікробні ферменти, які каталізують гідроліз β(1→4) глікозидних зв’язків у пептидоглікані, ключовому структурному компоненті клітинних стінок бактерій, що призводить до послаблення клітинної стінки та лізису, особливо у грампозитивних бактерій та пермеабілізованих грамнегативних клітин.
Які переваги та обмеження лізису клітин за допомогою лізосом?
Лізис клітин за допомогою лізоцимів пропонує переваги, такі як м’які умови реакції, збереження функціональності білків та низьке механічне навантаження, але він обмежений повільною кінетикою, неповним лізисом у щільних або стійких бактеріальних культурах, зниженою ефективністю проти ціліших зовнішніх мембран грамнегативних бактерій та варіабельністю залежно від фізіології клітин та умов росту.
Як ультразвукова обробка посилює лізоцими?
Ультразвукова обробка посилює активність лізоциму, механічно руйнуючи та пермеабілізуючи бактеріальні клітинні стінки через зсувні сили, викликані кавітацією, що збільшує доступ ферменту до пептидоглікану, прискорює кінетику лізису та призводить до більш повного та однорідного руйнування клітин.

