96 Kuyucuklu Plaka Sonikatörü UIP400MTP ile MBEC Test Protokolü
MBEC testi, pimli kapaklarda oluşan biyofilmleri ortadan kaldırmak için gereken antimikrobiyal ajan konsantrasyonunu belirlemek amacıyla kullanılır. Biyofilm canlılığını değerlendirmek için biyofilmler önce 96 kuyucuklu bir plakanın pimli kapağından ayrılmalıdır. Sonikasyon, bu ayırma işlemi için en güvenilir ve en verimli yöntemdir. Çok kuyucuklu plaka sonikatörü UIP400MTP, test plakalarını maksimum verimlilik ve kullanım kolaylığıyla işlemek üzere özel olarak tasarlanmıştır; yüksek numune işleme kapasiteli MBEC testlerini kolaylaştırır ve hızlandırır.
Biyofilmlerin Ayrılması için Sonikasyon
Sonikasyon, Minimum Biyofilm Eradikasyon Konsantrasyonu (MBEC) testlerinde kritik bir adımdır ve biyofilm hücrelerinin tutundukları yüzeyden etkili biçimde ayrılmasını mümkün kılar. Biyofilmler, doğaları gereği hücre dışı bir matriks içinde bulunan yapılandırılmış mikroorganizma topluluklarıdır; bu özellik onları planktonik hücrelere kıyasla antimikrobiyal ajanlara karşı önemli ölçüde daha dirençli kılar. MBEC testleri sırasında sonikasyon, kontrollü kavitasyon oluşturmak için ultrasonik dalgalar kullanarak biyofilm matriksini parçalar ve matriks içindeki hücreleri bir süspansiyona serbest bırakır. Bu adım, biyofilm hücrelerinin geri kazanım besiyerinde homojen biçimde dağılmasını sağlayarak ekim, seyreltme veya spektrofotometrik yöntemlerle doğru canlılık değerlendirmeleri yapılmasını kolaylaştırır. Biyofilmler uygun biçimde ayrılmadığında, kalan matriks bileşenleri hücreleri koruyabilir ve antimikrobiyal etkinliğin olduğundan düşük değerlendirilmesine yol açabilir. Bu nedenle sonikasyon, test edilen ajanların gerçek eradikasyon potansiyelini yansıtan güvenilir ve tekrarlanabilir MBEC değerleri elde etmek için vazgeçilmezdir. Çok kuyucuklu plaka sonikatörü UIP400MTP, test plakalarında yüksek numune işleme kapasitesiyle kolay numune hazırlamaya olanak tanır.
Çok kuyucuklu plaka sonikatörü UIP400MTP test plakalarında yüksek numune işleme kapasitesiyle numune hazırlamayı kolaylaştırır.
Minimum Biyofilm Eradikasyon Konsantrasyonu (MBEC) Test Protokolü
Adım 1: Biyofilm Oluşumu
- Bakteri süspansiyonunu hazırlayın:
Bakterileri uygun besiyerlerinde logaritmik büyüme fazına kadar büyütün.
Bakteri kültürünü belirli bir optik yoğunluğa (ör. OD600 ~0,1) kadar seyreltin. - 96 kuyucuklu plakayı inoküle edin:
Standart bir 96 kuyucuklu mikrotitre plakasının her kuyucuğuna bakteri süspansiyonunu (ör. 150–200 µL) ekleyin. - Pimli kapağı takın:
Pim yüzeylerinde biyofilm oluşumuna olanak tanımak için pimli kapağı inoküle edilmiş plakanın üzerine yerleştirin. - Plakayı inkübe edin:
Biyofilm büyümesini desteklemek için düzeneği uygun bir sıcaklıkta (ör. 37°C), çalkalamadan 24–48 saat inkübe edin.
Adım 2: Antimikrobiyal Ajanlarla İşlem
- Antimikrobiyal çözeltileri hazırlayın:
Taze besiyerlerinde farklı konsantrasyonlarda antimikrobiyal çözeltiler hazırlayın.
Biyofilmleri antimikrobiyal ajanlara maruz bırakın:
Pimli kapağı bakteri kültüründen çıkarın ve planktonik hücreleri uzaklaştırmak için steril salin veya PBS ile durulayın.
Pimli kapağı, antimikrobiyal çözeltileri içeren yeni bir 96 kuyucuklu plakaya yerleştirin. - Plakayı inkübe edin:
Antimikrobiyal maruziyetin gerçekleşmesi için belirli bir süre (ör. 24 saat) inkübe edin.
Çok kuyucuklu plaka sonikatörü UIP400MTP – yüksek numune işleme kapasitesiyle numune hazırlama için
Adım 3: 96 Kuyucuklu Plaka Sonikatörü UIP400MTP ile Sonikasyon
Sonikasyon adımı, canlılığı değerlendirmek üzere biyofilmleri pimli kapaklardan ayırmak için kritik öneme sahiptir. UIP400MTP sonikatörü için şu adımları izleyin:
- Düzeneği hazırlayın:
Yeni bir 96 kuyucuklu plakanın her kuyucuğunu geri kazanım besiyeriyle (ör. nötralize edici sıvı besiyeri veya taze büyüme besiyeri) doldurun. - Pimli kapağı aktarın:
Pimli kapağı antimikrobiyal işlem plakasından çıkarın.
Kalan antimikrobiyal ajanları uzaklaştırmak için pimli kapağı steril salin veya PBS ile durulayın. - Plakayı ve sonikatörü konumlandırın:
Pimli kapağı geri kazanım besiyeri içeren plakaya takın.
Geri kazanım besiyeri içeren plakayı UIP400MTP sonikatörünün platformuna yerleştirin ve plakanın ortalanmış ve sabit olduğundan emin olun. - Sonikasyon parametrelerini ayarlayın:
UIP400MTP sonikatöründe sonikasyon parametrelerini ayarlayın (ayarlar biyofilme göre uyarlanabilir):
Genlik: %70–100.
Sonikasyon süresi: döngü modunda 1–3 dakika (biyofilmin dayanıklılığına göre ayarlayın). - Sonikasyon uygulayın:
Sonikasyon işlemini başlatın. Ultrasonik titreşim, biyofilmleri pim yüzeylerinden ayırarak geri kazanım besiyerine aktaracaktır. - İşlemi izleyin:
Kuyucuklardaki numune sıcaklığını izlemek için takılabilir sıcaklık sensörünü kullanın. UIP400MTP, soğutma amacıyla bir laboratuvar soğutucusuna bağlanabilir. - Sonikasyon sonrası işlemler:
Geri kazanım besiyerini (artık ayrılmış biyofilmleri içeren) sonraki analizler için hemen yeni bir steril plakaya aktarın.
(A) %2 glikoz içeren TSB bulunan, biyofilm oluşumu, hücrelerin geri kazanılması ve
MIC ve MBCB tayini için kullanılan plaka; (B) Stafilokokal biyofilmlerin oluşumu için pimli kapak. MIC ve MBCB tayini; (B) Stafilokokal biyofilmlerin oluşumu için pimli kapak.
Pimlerde oluşan biyofilm hücreleri, hücrelerin geri kazanılması için taze kültür besiyeri içeren 96 kuyucuklu plakalarda 5 min boyunca sonikasyon (Hielscher Ultrasound Technology) uygulanarak ayrıldı.
(Görsel ve çalışma: ©de Oliveira et al., 2016)
Adım 4: Canlılık Değerlendirmesi
Ayrılmış biyofilmleri ekin ve kültüre alın:
- Koloni oluşturan birimleri (CFU) saymak için geri kazanım besiyerinin seri seyreltmelerini yapın ve agar üzerine ekin.
Alternatif olarak kolorimetrik veya floresans temelli bir canlılık testi kullanın. - Sonuçları kaydedin:
MBEC değerini, saptanabilir biyofilm canlılığını ortadan kaldıran en düşük antimikrobiyal konsantrasyon olarak belirleyin.
Tasarım, Üretim ve Danışmanlık – Almanya’da Üretilen Kalite
Hielscher sonikatörleri, en yüksek kalite ve tasarım standartlarıyla tanınır. Dayanıklılık ve kolay kullanım, sonikatörlerimizin endüstriyel tesislere sorunsuz biçimde entegre edilmesine olanak tanır. Hielscher sonikatörleri, zorlu koşulların ve güçlük yaratan ortamların kolayca üstesinden gelir.
Hielscher Ultrasonics, ISO sertifikalı bir şirkettir ve en son teknolojiye ve kullanıcı dostu özelliklere sahip yüksek performanslı sonikatörlere özel önem verir. Elbette Hielscher sonikatörleri CE gerekliliklerine uygundur ve UL, CSA ve RoHs gerekliliklerini karşılar.
96 kuyucuklu plakalarda ve test plakalarında numune hazırlamayı çok kuyucuklu plaka sonikatörü UIP400MTP kullanarak kolaylaştırın
Literatür / Kaynaklar
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Microplate Sonicator Validated in Peer-Reviewed Proteomics Study
Sıkça Sorulan Sorular
MBEC Testi Nedir?
Minimum Biyofilm Eradikasyon Konsantrasyonu (MBEC) testi, biyofilmle ilişkili bakterileri ortadan kaldırmak için gereken en düşük antimikrobiyal ajan konsantrasyonunu belirlemek amacıyla kullanılan standartlaştırılmış bir yöntemdir. Tedavinin etkinliğini değerlendirmek için özel yüzeylerde biyofilmlerin büyütülmesini, bunların farklı antimikrobiyal konsantrasyonlara maruz bırakılmasını ve genellikle sonikasyon yoluyla gerçekleştirilen biyofilm parçalama işleminden sonra ayrılmış hücrelerin canlılığının değerlendirilmesini içerir.
MBIC ile MBEC Arasındaki Fark Nedir?
Minimum Biyofilm İnhibitör Konsantrasyonu (MBIC), biyofilm oluşumunu önlemek için gereken en düşük antimikrobiyal ajan konsantrasyonudur; Minimum Biyofilm Eradikasyon Konsantrasyonu (MBEC) ise oluşmuş bir biyofilmi ortadan kaldırmak için gereken en düşük konsantrasyondur. MBIC, biyofilm oluşumunun önlenmesine odaklanırken MBEC, olgun biyofilmlere karşı tedavinin etkinliğini değerlendirir.
MBEC Testlerinde Yaygın Olarak Hangi Plakalar Kullanılır?
MBEC testlerinde yaygın olarak kullanılan mikrotitre plakaları genellikle polistiren veya polipropilenden yapılmış 96 kuyucuklu plakalardır. Bu malzemeler, biyofilm oluşumu için uygun bir yüzey sağlar ve test sırasında incelenen antimikrobiyal ajanlara karşı kimyasal olarak dayanıklıdır. Polistiren plakalar, spektrofotometrik veya floresans temelli ölçümler gibi sonraki analizlerde avantaj sağlayan optik berraklıkları nedeniyle yaygın olarak tercih edilir. Bu plakaların tasarımı, çıkarılabilir pimli kapaklar içerir; biyofilmler büyüme besiyeri içeren kuyucuklara daldırılan pimlerde oluştuğu için bu kapaklar test açısından vazgeçilmezdir. MBEC test protokolüne uygun olanlar gibi standartlaştırılmış plakalar, tekrarlanabilirliği ve UIP400MTP sonikatörü veya diğer işleme ekipmanlarıyla uyumluluğu sağlamak üzere özel olarak tasarlanmıştır.
PEG Kapaklı Plakalar Nedir?
PEG kapaklı plakalar, kapağında her kuyucuğa uzanan küçük polietilen glikol (PEG) çıkıntılar veya pimler bulunan özel çok kuyucuklu plaka sistemleridir. Bu çıkıntılar, gerçek dünyadaki biyofilm büyümesini taklit ederek kontrollü koşullar altında mikrobiyal biyofilm oluşumu için bir yüzey sağlar. Tasarım, kuyucuklar büyüme besiyeri veya antimikrobiyal ajanlar içerirken biyofilmlerin çıkıntılar üzerinde gelişmesine olanak tanır; böylece MBEC ve MBIC testlerinde olduğu gibi biyofilmlerin tedavilere duyarlılığı yüksek numune işleme kapasitesiyle test edilebilir.
Hielscher Ultrasonics, yüksek performanslı ultrasonik homojenizatörleri laboratuvar ölçeğinden endüstriyel ölçeğe kadar üretir.