การสร้างอะไมลอยด์ไฟบริลโดยใช้เครื่องโซนิคเตอร์ไมโครเพลท UIP400MTP
เส้นใยอะไมลอยด์เหมือนกับผลึกก่อตัวขึ้นผ่านกระบวนการสร้างนิวเคลียสและการเจริญเติบโตที่ตามมา อย่างไรก็ตามเนื่องจากอุปสรรคพลังงานอิสระสูงของการเกิดนิวเคลียสการสร้างอะไมลอยด์ที่เกิดขึ้นเองจึงเกิดขึ้นหลังจากระยะล่าช้าเป็นเวลานานเท่านั้น อัลตราโซนิกได้กลายเป็นเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพในการกระตุ้นให้เกิดนิวเคลียสอะไมลอยด์ซึ่งจะช่วยเร่งการสร้างไฟบริกได้อย่างมีนัยสําคัญ เมื่อรวมกับเครื่องอ่านไมโครเพลทโดยใช้การเรืองแสงไทโอฟลาวิน T (ThT) อัลตราโซนิกช่วยให้สามารถตรวจจับเส้นใยอะไมลอยด์ในหลายตัวอย่างพร้อมกันได้
การก่อตัวของเส้นใยอะไมลอยด์ที่เหนี่ยวนําด้วยอัลตราโซนิกด้วยเครื่องโซนิคเตอร์ไมโครเพลท UIP400MTP
ด้วยเครื่อง sonicator แผ่นหลายหลุม UIP400MTP อะไมลอยด์ไฟบริลที่มีคุณภาพเท่ากันในปริมาณมากสามารถสังเคราะห์ได้อย่างรวดเร็วเพื่อวัตถุประสงค์ในการวิจัย วิธีการที่มีประสิทธิภาพนี้ช่วยให้สามารถศึกษาการเกิดอะไมลอยด์ของโปรตีนได้ เทคนิคนี้ช่วยอํานวยความสะดวกในการเกิดภาวะหัวใจแบบอะไมลอยด์อย่างรวดเร็วและทําซ้ําได้ ดังที่แสดงให้เห็นกับ β2-microglobulin (β2-m) ซึ่งเป็นโปรตีนอะไมลอยด์เจนิกที่เกี่ยวข้องกับอะไมลอยโดซิสที่เกี่ยวข้องกับการฟอกไต
วิธีการทดลองอย่างง่าย: การสั่นสะเทือนของอะไมลอยด์ที่เกิดจากอัลตราโซนิก
เพื่อกระตุ้นให้เกิดเส้นใยไมโครเพลท 96 หลุมถูกวางไว้ที่กึ่งกลางของเครื่องสะท้อนเสียงแบบหลายหลุม UIP400MTP ซึ่งช่วยให้มั่นใจได้ว่าการเปิดรับแสงอัลตราโซนิกสม่ําเสมอในทุกหลุม เงื่อนไขการทดลองมีดังนี้:
- แต่ละหลุมมีสารละลาย β2-microglobulin 0.2 มล. (0.3 มก./มล., pH 2.5) เสริมด้วย 5 μM ThT
- แผ่นอยู่ภายใต้รอบอัลตราโซนิกเช่นอัลตราโซนิก 1 นาทีตามด้วยการหยุดชั่วคราว 9 นาที
- หลังการ sonication การเรืองแสง ThT ถูกวัดโดยใช้เครื่องอ่านไมโครเพลท
(อ้างอิง So et al., 2011)
เปรียบเทียบกับการกวนแบบธรรมดา
เมื่อเทียบกับวิธีการกวนแบบดั้งเดิมอัลตราโซนิกช่วยลดระยะล่าช้าของการก่อตัวของเส้นใยได้อย่างมาก ภายใต้สภาวะการเขย่าไมโครเพลททั่วไป มีเพียง 1 ใน 10 หลุมเท่านั้นที่แสดงการเรืองแสง ThT ที่เพิ่มขึ้นหลังจากผ่านไป 20 ชั่วโมง ในทางตรงกันข้ามการใช้อัลตราโซนิกแบบหมุนเวียน (sonication 15 นาทีตามด้วยความสงบ 5 นาที) ตรวจพบการเรืองแสง ThT ที่เพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสําคัญทันทีหลังจากการรักษาด้วยคลื่นเสียงครั้งแรก
การเร่งความเร็วอย่างรวดเร็วของจลนศาสตร์ Fibrillation
ผลลัพธ์ที่ได้จาก So et al. (2011) แสดงให้เห็นว่าการก่อตัวของเส้นใยที่เกิดขึ้นเองของ β2-microglobulin ที่ pH 2.5 สามารถเร่งได้จากหลายชั่วโมงเหลือเพียง 10-15 นาทีด้วยอัลตราโซนิก
ภาพกล้องจุลทรรศน์แรงอะตอม (AFM) ยืนยันว่าเส้นใยที่เกิดจากอัลตราโซนิก 10 นาทีทุกๆ 15 นาทีนั้นแยกไม่ออกจากสัณฐานวิทยาจากที่เกิดจากอัลตราโซนิก 1 นาทีทุกๆ 10 นาที สิ่งนี้เน้นย้ําถึงความสามารถในการทําซ้ําและความทนทานของการสั่นสะเทือนของอะไมลอยด์ที่เกิดจากอัลตราโซนิก
ภาพ AFM ของอะไมลอยด์ไฟบริลที่ผลิตโดยอัลตราโซนิก 1 นาทีทุกๆ 10 นาที (i) โดยการ sonication 10 นาทีทุกๆ 15 นาที (ii) และโดยปฏิกิริยาการเพาะเมล็ดโดยไม่มีอัลตราโซนิก (iii) แถบมาตราส่วนสีขาวหมายถึง 1 μm
การศึกษาและภาพ: ©So et al., 2011
การเกิดอาการสั่นพลิ้วที่สภาวะ pH เป็นกลาง
แม้จะอยู่ภายใต้สภาวะ pH ที่เป็นกลางการสร้างเส้นใยก็ทําได้หลังจากเวลาล่าช้า 1.5 ชั่วโมงซึ่งแสดงให้เห็นว่าอัลตราโซนิกช่วยลดอุปสรรคด้านพลังงานในการเกิดนิวเคลียสและการเจริญเติบโตได้อย่างมีนัยสําคัญ สิ่งนี้สนับสนุนสมมติฐานที่ว่าการสั่นสะเทือนของอะไมลอยด์เป็นปฏิกิริยาทางกายภาพเป็นหลักซึ่งส่วนใหญ่ถูก จํากัด โดยอุปสรรคพลังงานนิวเคลียสซึ่งอัลตราโซนิกช่วยลดได้อย่างมีประสิทธิภาพ
ผลกระทบต่อการวิจัยโรคที่เกี่ยวข้องกับอะไมลอยด์
การก่อตัวของเส้นใยอะไมลอยด์ที่ง่ายและเชื่อถือได้โดยใช้เครื่อง sonicator ไมโครเพลท UIP400MTP มีนัยสําคัญสําหรับการวิจัยโรคอัลไซเมอร์ (AD) และความผิดปกติอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องกับอะไมลอยด์เช่นโรคพาร์กินสันเบาหวานชนิดที่ 2 และอะไมลอยด์ในระบบ ใน AD การรวมตัวของ amyloid-β (Aβ) เป็นจุดเด่นทางพยาธิวิทยาที่สําคัญ แต่การศึกษาจลนศาสตร์ของการสั่นสะเทือนยังคงท้าทายเนื่องจากระยะล่าช้าและความแปรปรวนในวิธีการทั่วไป การสร้างเส้นใยที่ขับเคลื่อนด้วยอัลตราโซนิกช่วยเร่งการสร้างนิวเคลียสทําให้มั่นใจได้ถึงความสามารถในการทําซ้ําสูงและลดความแปรปรวนซึ่งเป็นสิ่งสําคัญสําหรับการคัดกรองสารยับยั้งที่อาจเกิดขึ้นและทําความเข้าใจกลไก amyloidogenic นอกจากนี้ ความสามารถด้านปริมาณงานสูงของ UIP400MTP ยังช่วยให้สามารถตรวจสอบปริมาณโปรตีนที่พับและการรวมตัวกันในวงกว้าง ซึ่งอํานวยความสะดวกในการค้นพบสารบําบัดที่สามารถปรับการสร้างเส้นใยและอาจลดความก้าวหน้าของระบบประสาทเสื่อม
การศึกษานี้สร้างอัลตราโซนิกโดยใช้เครื่องโซนิกแผ่นหลายหลุม UIP400MTP เป็นวิธีที่มีประสิทธิภาพสูงในการเร่งการสร้างเส้นใยอะไมลอยด์ ข้อได้เปรียบที่สําคัญของแนวทางนี้ ได้แก่ :
- ลดเวลาล่าช้าสําหรับการเกิดภาวะเต้นผิดจังหวะลงอย่างมาก
- การเปิดรับอัลตราซาวนด์ที่สม่ําเสมอในทุกหลุมทําให้สามารถสร้างเส้นใยที่ทําซ้ําได้
- ความสามารถในการคัดกรองปริมาณงานสูง ทําให้เหมาะสําหรับการค้นหาการเกิดโปรตีนอะไมลอยด์ทั่วทั้งจีโนม
ด้วยการรวมอัลตราโซนิกเข้ากับการตรวจจับการเรืองแสง ThT วิธีนี้เป็นแพลตฟอร์มที่รวดเร็วปรับขนาดได้และเชื่อถือได้สําหรับการศึกษาภาวะหัวใจแบบอะไมลอยด์ ด้วยประสิทธิภาพและศักยภาพในการรับส่งข้อมูลสูงวิธีการนี้อาจอํานวยความสะดวกในการสังเคราะห์เส้นใยอะไมลอยด์ที่ง่ายดายสําหรับการวิจัยทางชีวฟิสิกส์และเภสัชกรรมซึ่งเป็นเครื่องมือที่มีแนวโน้มสําหรับการศึกษาที่เกี่ยวข้องกับอะไมลอยด์และการคัดกรองยา
การสกัด EM ปริมาณงานสูง ด้วยเครื่องสะท้อนเสียงแบบแผ่น 96 หลุม UIP400MTP
วรรณกรรม / อ้างอิง
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Masatomo So, Hisashi Yagi, Kazumasa Sakurai, Hirotsugu Ogi, Hironobu Naiki, Yuji Goto (2011): Ultrasonication-Dependent Acceleration of Amyloid Fibril Formation. Journal of Molecular Biology, Volume 412, Issue 4, 2011. 568-577.
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
คําถามที่พบบ่อย
การเกิดนิวเคลียสปฐมภูมิของ Amyloid คืออะไร?
นิวเคลียสปฐมภูมิของอะไมลอยด์เป็นขั้นตอนเริ่มต้นที่จํากัดอัตราในการสร้างอะไมลอยด์ไฟบริล ซึ่งโปรตีนโมโนเมอร์มีการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างและประกอบตัวเองเป็นนิวเคลียสที่สําคัญ นิวเคลียสนี้ทําหน้าที่เป็นแม่แบบสําหรับการรวมเพิ่มเติม
Fibril เกิดขึ้นใน Amyloidosis ได้อย่างไร?
ในอะไมลอยโดซิส โปรตีนที่พับผิดจะรวมตัวกันผ่านพอลิเมอไรเซชันที่ขึ้นกับนิวเคลียส เมื่อนิวเคลียสก่อตัวขึ้นโมโนเมอร์จะยืดออกอย่างรวดเร็วเป็นเส้นใยที่อุดมไปด้วยแผ่น β ผ่านการสร้างนิวเคลียสทุติยภูมิและการเจริญเติบโตแบบแม่แบบซึ่งนําไปสู่การสะสมของอะไมลอยด์
Amyloid Fibril Polymorphism คืออะไร?
ความหลากหลายของอะไมลอยด์ไฟบริลหมายถึงการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของเส้นใยที่เกิดจากโปรตีนเดียวกัน ความแตกต่างในสัณฐานวิทยาของเส้นใย การจัดเรียงเส้นใยต้น และการบรรจุโมเลกุลเกิดขึ้นเนื่องจากสภาพแวดล้อม การกลายพันธุ์ หรือเส้นทางการรวมตัวที่แตกต่างกัน
อะไรคือความแตกต่างระหว่าง Amyloid Fibrils และ Plaques?
อะไมลอยด์ไฟบริลเป็นมวลรวมของโปรตีนที่อุดมด้วยแผ่น β เชิงเส้นในขณะที่คราบอะไมลอยด์เป็นแหล่งสะสมนอกเซลล์ของเส้นใยรวมซึ่งมักผสมกับไขมันโลหะและเศษเซลล์ดังที่เห็นในโรคระบบประสาทเช่นอัลไซเมอร์
อะไรคือความแตกต่างระหว่าง Alpha-Synuclein และ Amyloid?
อัลฟา-ซินยูคลีนเป็นโปรตีนเซลล์ประสาทที่เกี่ยวข้องกับการทํางานของไซแนปติก แต่ในสภาวะทางพยาธิวิทยา มันจะพับผิดและก่อตัวเป็นเส้นใยคล้ายอะไมลอยด์ “อะไมลอยด์” เป็นคําทั่วไปสําหรับการรวมตัวของโปรตีนเส้นใยที่พับผิดในขณะที่เส้นใยอัลฟา-ซินนิวคลีนมีความเฉพาะเจาะจงสําหรับโรคเช่นพาร์กินสัน
โปรตีนฟิบริลคืออะไร?
เส้นใยโปรตีนเป็นมวลรวมที่เป็นเส้นใยที่มีลําดับสูง β แผ่น ซึ่งเกิดจากโปรตีนที่พับผิดหรือกางออกบางส่วน โดยทั่วไปแล้วเส้นใยเหล่านี้จะไม่ละลายน้ําและเกิดขึ้นจากพอลิเมอไรเซชันที่ขึ้นกับนิวเคลียส พวกเขาเกี่ยวข้องกับเงื่อนไขทางพยาธิวิทยาต่างๆ รวมถึงอะไมโลอิโดสและโรคทางระบบประสาท (เช่น อัลไซเมอร์ พาร์กินสัน) อย่างไรก็ตาม เส้นใยโปรตีนที่ใช้งานได้บางชนิดมีอยู่ในระบบชีวภาพ เช่น เส้นใย curli ในแบคทีเรียและเส้นใยไหมในแมงมุม
Hielscher Ultrasonics ผลิตโฮโมจีไนเซอร์อัลตราโซนิกประสิทธิภาพสูงจาก ห้องทดลอง ถึง ขนาดอุตสาหกรรม


