การสร้างไฟบริลแอมีลอยด์ด้วยเครื่องโซนิเคเตอร์สำหรับไมโครเพลต UIP400MTP
ไฟบริลแอมีลอยด์ก่อตัวผ่านกระบวนการเกิดนิวเคลียสและการเติบโตในลำดับถัดมาเช่นเดียวกับผลึก อย่างไรก็ตาม เนื่องจากการเกิดนิวเคลียสมีอุปสรรคพลังงานอิสระสูง การก่อตัวของไฟบริลแอมีลอยด์ที่เกิดขึ้นเองจึงเกิดขึ้นได้เฉพาะหลังจากผ่านระยะหน่วงที่ยาวนานเท่านั้น การใช้คลื่นอัลตราโซนิกได้กลายเป็นเครื่องมือที่ทรงประสิทธิภาพในการเหนี่ยวนำการเกิดนิวเคลียสของแอมีลอยด์ จึงช่วยเร่งการก่อตัวของไฟบริลได้อย่างมาก เมื่อใช้ร่วมกับเครื่องอ่านไมโครเพลตที่ตรวจวัดการเรืองแสงของ thioflavin T (ThT) การใช้คลื่นอัลตราโซนิกช่วยให้ตรวจหาไฟบริลแอมีลอยด์ในตัวอย่างหลายตัวอย่างพร้อมกันได้ด้วยอัตราการประมวลผลตัวอย่างสูง
การสร้างไฟบริลแอมีลอยด์ที่เหนี่ยวนำด้วยคลื่นอัลตราโซนิกโดยใช้เครื่องโซนิเคเตอร์สำหรับไมโครเพลต UIP400MTP
เครื่องโซนิเคเตอร์สำหรับเพลตหลายหลุม UIP400MTP ช่วยให้สังเคราะห์ไฟบริลแอมีลอยด์ที่มีคุณภาพเท่ากันในปริมาณมากได้อย่างรวดเร็วเพื่อใช้ในการวิจัย แนวทางที่มีประสิทธิภาพนี้ช่วยให้ศึกษาความสามารถของโปรตีนในการก่อแอมีลอยด์ได้ เทคนิคนี้ช่วยให้เกิดไฟบริลแอมีลอยด์ได้อย่างรวดเร็วและทำซ้ำได้ ดังที่แสดงให้เห็นด้วย β2-microglobulin (β2-m) ซึ่งเป็นโปรตีนที่ก่อแอมีลอยด์และเกี่ยวข้องกับโรคแอมีลอยโดซิสที่สัมพันธ์กับการฟอกไต
แนวทางการทดลองอย่างง่าย: การเกิดไฟบริลแอมีลอยด์ที่เหนี่ยวนำด้วยคลื่นอัลตราโซนิก
เพื่อเหนี่ยวนำการก่อตัวของไฟบริล ได้วางไมโครเพลตชนิด 96 หลุมไว้ตรงกลางเครื่องโซนิเคเตอร์สำหรับเพลตหลายหลุม UIP400MTP ซึ่งทำให้ทุกหลุมได้รับคลื่นอัลตราโซนิกอย่างสม่ำเสมอ เงื่อนไขการทดลองมีดังนี้:
- แต่ละหลุมบรรจุสารละลาย β2-microglobulin ปริมาตร 0.2 ml (0.3 mg/ml, pH 2.5) ที่เติม ThT ความเข้มข้น 5 μM
- เพลตได้รับการบำบัดด้วยคลื่นอัลตราโซนิกเป็นรอบ เช่น ใช้คลื่นอัลตราโซนิกเป็นเวลา 1 นาที ตามด้วยการพัก 9 นาที
- หลังการบำบัดด้วยคลื่นอัลตราโซนิก ได้วัดการเรืองแสงของ ThT ด้วยเครื่องอ่านไมโครเพลต
(ดูประกอบ So et al., 2011)
การเปรียบเทียบกับการเขย่าแบบทั่วไป
เมื่อเปรียบเทียบกับวิธีการเขย่าแบบดั้งเดิม การใช้คลื่นอัลตราโซนิกช่วยลดระยะหน่วงของการก่อตัวของไฟบริลได้อย่างมาก ภายใต้เงื่อนไขการเขย่าไมโครเพลตแบบทั่วไป มีเพียง 1 จาก 10 หลุมเท่านั้นที่แสดงการเรืองแสงของ ThT เพิ่มขึ้นหลังผ่านไป 20 ชั่วโมง ในทางตรงกันข้าม เมื่อใช้คลื่นอัลตราโซนิกเป็นรอบ (ใช้คลื่นอัลตราโซนิก 15 นาที ตามด้วยการปล่อยให้อยู่นิ่ง 5 นาที) ตรวจพบการเรืองแสงของ ThT เพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญทันทีหลังการบำบัดด้วยคลื่นอัลตราโซนิกครั้งแรก
การเร่งจลนพลศาสตร์ของการเกิดไฟบริลอย่างรวดเร็ว
ผลการศึกษาของ So et al. (2011) แสดงให้เห็นว่าสามารถใช้คลื่นอัลตราโซนิกเร่งการก่อตัวของไฟบริลที่เกิดขึ้นเองของ β2-microglobulin ที่ pH 2.5 จากหลายชั่วโมงให้เหลือเพียง 10–15 นาทีได้
ภาพจากกล้องจุลทรรศน์แรงอะตอม (AFM) ยืนยันว่าไฟบริลที่สร้างโดยใช้คลื่นอัลตราโซนิกเป็นเวลา 10 นาทีทุก 15 นาที มีสัณฐานวิทยาที่ไม่สามารถแยกความแตกต่างจากไฟบริลที่สร้างโดยใช้คลื่นอัลตราโซนิกเป็นเวลา 1 นาทีทุก 10 นาทีได้ ผลนี้เน้นย้ำถึงความสามารถในการทำซ้ำและความคงเส้นคงวาของการเกิดไฟบริลแอมีลอยด์ที่เหนี่ยวนำด้วยคลื่นอัลตราโซนิก
ภาพ AFM ของไฟบริลแอมีลอยด์ที่สร้างโดยใช้คลื่นอัลตราโซนิกเป็นเวลา 1 min ทุก 10 min (i) โดยใช้คลื่นอัลตราโซนิกเป็นเวลา 10 min ทุก 15 min (ii) และโดยปฏิกิริยาที่ใช้เมล็ดตั้งต้นโดยไม่ใช้คลื่นอัลตราโซนิก (iii) แถบมาตราส่วนสีขาวแสดงความยาว 1 μm
การศึกษาและภาพ: ©So et al., 2011
การเกิดไฟบริลภายใต้สภาวะ pH เป็นกลาง
แม้ภายใต้สภาวะ pH เป็นกลาง ก็สามารถทำให้เกิดไฟบริลได้หลังจากระยะหน่วง 1.5 ชั่วโมง ซึ่งแสดงให้เห็นว่าการใช้คลื่นอัลตราโซนิกช่วยลดอุปสรรคด้านพลังงานของการเกิดนิวเคลียสและการเติบโตได้อย่างมาก ผลนี้ยังสนับสนุนสมมติฐานที่ว่าการเกิดไฟบริลแอมีลอยด์เป็นปฏิกิริยาทางกายภาพเป็นหลัก โดยส่วนใหญ่ถูกจำกัดด้วยอุปสรรคด้านพลังงานของการเกิดนิวเคลียส ซึ่งการใช้คลื่นอัลตราโซนิกช่วยลดได้อย่างมีประสิทธิภาพ
ผลต่อการวิจัยโรคที่เกี่ยวข้องกับแอมีลอยด์
การสร้างไฟบริลแอมีลอยด์ได้อย่างง่ายดายและเชื่อถือได้ด้วยเครื่องโซนิเคเตอร์สำหรับไมโครเพลต UIP400MTP มีนัยสำคัญอย่างยิ่งต่อการวิจัยโรคอัลไซเมอร์ (AD) และโรคอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องกับแอมีลอยด์ เช่น โรคพาร์กินสัน โรคเบาหวานชนิด II และโรคแอมีลอยโดซิสทั่วร่างกาย ในโรค AD การรวมตัวของแอมีลอยด์-β (Aβ) เป็นลักษณะบ่งชี้ทางพยาธิวิทยาที่สำคัญ แต่การศึกษาจลนพลศาสตร์ของการเกิดไฟบริลยังคงมีความท้าทายเนื่องจากระยะหน่วงที่ยาวนานและความแปรปรวนของวิธีการแบบทั่วไป การสร้างไฟบริลด้วยคลื่นอัลตราโซนิกช่วยเร่งการเกิดนิวเคลียส ทำให้มั่นใจได้ถึงความสามารถในการทำซ้ำที่สูงและความแปรปรวนที่ลดลง ซึ่งมีความสำคัญอย่างยิ่งต่อการคัดกรองสารที่อาจมีฤทธิ์ยับยั้งและการทำความเข้าใจกลไกการก่อแอมีลอยด์ นอกจากนี้ ความสามารถในการประมวลผลตัวอย่างด้วยอัตราสูงของ UIP400MTP ยังช่วยให้ศึกษาการพับตัวผิดรูปและการรวมตัวของโปรตีนในระดับขนาดใหญ่ได้ เอื้อต่อการค้นพบสารรักษาที่สามารถปรับการก่อตัวของไฟบริลและอาจบรรเทาการดำเนินของภาวะเสื่อมของระบบประสาทได้
การศึกษานี้แสดงให้เห็นว่าการใช้คลื่นอัลตราโซนิกด้วยเครื่องโซนิเคเตอร์สำหรับเพลตหลายหลุม UIP400MTP เป็นวิธีที่มีประสิทธิภาพสูงในการเร่งการก่อตัวของไฟบริลแอมีลอยด์ ข้อได้เปรียบสำคัญของแนวทางนี้ ได้แก่:
- ลดระยะหน่วงของการเกิดไฟบริลได้อย่างมาก
- ทุกหลุมได้รับคลื่นอัลตราโซนิกอย่างสม่ำเสมอ ทำให้การสร้างไฟบริลสามารถทำซ้ำได้
- มีความสามารถในการคัดกรองตัวอย่างด้วยอัตราสูง จึงเหมาะสำหรับการค้นหาความสามารถของโปรตีนในการก่อแอมีลอยด์ทั่วทั้งจีโนม
เมื่อผสานการใช้คลื่นอัลตราโซนิกเข้ากับการตรวจวัดการเรืองแสงของ ThT วิธีนี้ให้แพลตฟอร์มที่รวดเร็ว สามารถขยายขนาดได้ และเชื่อถือได้สำหรับการศึกษาการเกิดไฟบริลแอมีลอยด์ ด้วยประสิทธิภาพและศักยภาพในการประมวลผลตัวอย่างด้วยอัตราสูง แนวทางนี้อาจช่วยให้สังเคราะห์ไฟบริลแอมีลอยด์ได้อย่างง่ายดายสำหรับการวิจัยด้านชีวฟิสิกส์และเภสัชศาสตร์ โดยเป็นเครื่องมือที่มีแนวโน้มดีสำหรับการศึกษาที่เกี่ยวข้องกับแอมีลอยด์และการคัดกรองยา
การสกัด EM ด้วยอัตราการประมวลผลตัวอย่างสูง ด้วยเครื่องโซนิเคเตอร์สำหรับเพลต 96 หลุม UIP400MTP
วรรณกรรม / เอกสารอ้างอิง
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Masatomo So, Hisashi Yagi, Kazumasa Sakurai, Hirotsugu Ogi, Hironobu Naiki, Yuji Goto (2011): Ultrasonication-Dependent Acceleration of Amyloid Fibril Formation. Journal of Molecular Biology, Volume 412, Issue 4, 2011. 568-577.
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
คำถามที่พบบ่อย
การเกิดนิวเคลียสปฐมภูมิของแอมีลอยด์คืออะไร?
การเกิดนิวเคลียสปฐมภูมิของแอมีลอยด์เป็นขั้นตอนเริ่มต้นที่กำหนดอัตราของการก่อตัวของไฟบริลแอมีลอยด์ โดยโปรตีนในรูปมอนอเมอร์เกิดการเปลี่ยนแปลงโครงรูปและประกอบตัวเองเป็นนิวเคลียสวิกฤต นิวเคลียสนี้ทำหน้าที่เป็นแม่แบบสำหรับการรวมตัวในลำดับถัดมา
ไฟบริลก่อตัวอย่างไรในโรคแอมีลอยโดซิส?
ในโรคแอมีลอยโดซิส โปรตีนที่พับตัวผิดรูปจะรวมตัวกันผ่านการเกิดพอลิเมอร์ที่ขึ้นอยู่กับการเกิดนิวเคลียส เมื่อนิวเคลียสก่อตัวขึ้น มอนอเมอร์จะยืดตัวอย่างรวดเร็วเป็นไฟบริลที่อุดมด้วยแผ่น β ผ่านการเกิดนิวเคลียสทุติยภูมิและการเติบโตตามแม่แบบ นำไปสู่การสะสมของแอมีลอยด์
ภาวะพหุสัณฐานของไฟบริลแอมีลอยด์คืออะไร?
ภาวะพหุสัณฐานของไฟบริลแอมีลอยด์หมายถึงความหลากหลายทางโครงสร้างของไฟบริลที่เกิดจากโปรตีนชนิดเดียวกัน ความแตกต่างของสัณฐานวิทยาของไฟบริล การจัดเรียงโปรโตฟิลาเมนต์ และการจัดเรียงตัวอย่างแน่นของโมเลกุลเกิดจากสภาวะแวดล้อม การกลายพันธุ์ หรือวิถีการรวมตัวที่แตกต่างกัน
ไฟบริลแอมีลอยด์กับคราบแอมีลอยด์แตกต่างกันอย่างไร?
ไฟบริลแอมีลอยด์เป็นกลุ่มโปรตีนที่รวมตัวกันเป็นแนวยาวและอุดมด้วยแผ่น β ส่วนคราบแอมีลอยด์เป็นแหล่งสะสมภายนอกเซลล์ของไฟบริลที่รวมตัวกัน ซึ่งมักผสมกับลิพิด โลหะ และเศษซากเซลล์ ดังที่พบในโรคที่มีการเสื่อมของระบบประสาท เช่น โรคอัลไซเมอร์
แอลฟา-ซินิวคลีอินกับแอมีลอยด์แตกต่างกันอย่างไร?
แอลฟา-ซินิวคลีอินเป็นโปรตีนในเซลล์ประสาทที่เกี่ยวข้องกับการทำงานของไซแนปส์ แต่ในภาวะทางพยาธิวิทยา โปรตีนนี้จะพับตัวผิดรูปและก่อตัวเป็นไฟบริลคล้ายแอมีลอยด์ “แอมีลอยด์” เป็นคำทั่วไปที่ใช้เรียกกลุ่มโปรตีนที่พับตัวผิดรูปและรวมตัวเป็นไฟบริล ส่วนไฟบริลแอลฟา-ซินิวคลีอินมีความจำเพาะต่อโรค เช่น โรคพาร์กินสัน
ไฟบริลโปรตีนคืออะไร?
ไฟบริลโปรตีนเป็นกลุ่มโปรตีนที่รวมตัวกันเป็นเส้นใย มีการจัดเรียงตัวอย่างเป็นระเบียบสูงและอุดมด้วยแผ่น β เกิดจากโปรตีนที่พับตัวผิดรูปหรือคลายตัวบางส่วน โดยทั่วไปไฟบริลเหล่านี้ไม่ละลายและเกิดขึ้นผ่านการเกิดพอลิเมอร์ที่ขึ้นอยู่กับการเกิดนิวเคลียส ไฟบริลเหล่านี้เกี่ยวข้องกับภาวะทางพยาธิวิทยาหลายชนิด รวมถึงโรคแอมีลอยโดซิสและโรคที่มีการเสื่อมของระบบประสาท (เช่น โรคอัลไซเมอร์ โรคพาร์กินสัน) อย่างไรก็ตาม มีไฟบริลโปรตีนบางชนิดที่ทำหน้าที่ในระบบชีวภาพ เช่น เส้นใยเคอร์ลีในแบคทีเรียและไฟบริลไหมในแมงมุม
Hielscher Ultrasonics ผลิตเครื่องโฮโมจีไนเซอร์อัลตราโซนิกสมรรถนะสูง ตั้งแต่ขนาดสำหรับ ห้องปฏิบัติการ ไปจนถึง ขนาดอุตสาหกรรม

