Ultraljudsljus för Western Blotting

  • Den västra blot är ett analytiskt förfarande för detektion av specifika proteiner i ett prov av vävnad Homogenatet eller cell extrakt.
  • För att köra en västerländsk blot eller för att mäta enzym aktivitet kräver många analyser till gång till materialen (t. ex. proteiner, DNA, subcellulära fragment) som är anhållna i cellen.
  • Ultraljudsbehandling är en pålitlig och lätt att hantera metod för kontrollerad cell störningar och Lys.

Ultraljud cell störningar

Protein utvinning från vävnader och odlade celler är det första steget för många biologiska, biokemiska och analytiska tekniker (PAGE, Western blotting, ELISA, masspektrometri, etc.) eller protein rening. För att få en hög protein avkastning måste cell materialet och vävnaden effektivt störas/lyseras. Oavsett om växten cell eller djur vävnad, ultraljudsbehandling är metoden för att förbereda din cell lysate enkelt och snabbt.

Fördelar med ultraljudsbehandling

  • Snabb & Effektiv
  • enkel hantering
  • hög protein avkastning
  • reproducerbara/repeterbara
  • kontrol leras noggrant
  • Skalbar

Informationsförfrågan




Notera vår Integritetspolicy.


Hielscher's VialTweeter is ideal for the lysis of multiple samples

VialTweeter sonicator för ultraljudsprovberedning, såsom cellstörning och proteinisolering;

Immunutfällning protokoll för Western Immunoblotting

A. reagenser

För beredning av lösningarna, Använd renat vatten som Milli-Q.

  • 1X fosfatbuffrad saltlösning (PBS)
  • 1X Celllysbuffert: 20 mM tris (pH 7,5), 150 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM EGTA, 1% Triton X-100, 2,5 mM natriumpyrofosfat, 1 mM β-glycerofosfat, 1 mM Na3VO4 μg/ml Leupeptin
    Viktigt: tillsätt 1 mM PMSF omedelbart före användning.
  • 15 μl protein A + 15 μl protein G är tillräckligt för IP, men det kan bero på din primära anti kropp och prov volym. Du kan också använda pre-blandade protein a/G AGA Ros (t. ex. protein a för kanin IgG dra ner och protein G för mus IgG dra ner)
  • 3x SDS provbuffert: 187,5 mm Tris-HCl (pH 6,8 vid 25 ° c), 6% w/v SDS, 30% glycerol, 150 mm DTT, 0,03% w/v bromfenolblått blå

B. beredning av Celllysater

  • Skörda cellerna. För att skörda celler under nondenaturering förhållanden, ta bort media och skölj celler en gång med iskall PBS.
  • Ta bort PBS och tillsätt 0,5 ml iskalla 1X celllyssningsbuffert till varje platta (10 cm) och inkubera plattorna på is i 5 minuter.
  • Skrapa bort cellerna från plattorna och överför till mikrocentrifugrör. Håll på isen.
  • Sonikera två gånger i 10 sekunder i iskalla immunprecipitationsbuffert (IP-buffert: 50 mM Tris-HCl [pH 7,4], 150 mM NaCl, 5 mM EDTA, 0,1% NP-40 och proteashämmare Mix). För ultraljudsbehandling, VialTweeter eller en sond ultrasonicator som UP100H eller Uf200 ः t är mest lämpade.
  • Centrifugera lysaterna vid 15 000 g i 10 minuter vid 4 ° c.
  • Överför supernatanten till ett nytt rör. (Vid behov kan lysat förvaras vid – 80 ° c.)
  • Tillsätt den primära anti kroppen till supernatanten. Supernatanten med den primära anti kroppen inkuberas i 1 h vid 4 ° c under lätt omrörning. Primär anti kropp tillsätts vanligt vis i ett belopp 10x mer koncentrerad än vad som används för Western blotting. (Du kan börja med 1μg per 100 μL.)
  • Supernatanten inkuberas därefter vidare med blandningen av lika stora mängder protein A-AGA Ros (Invitrogen) och protein G AGA ros för en annan 1 h.
  • Tvätta AGA ros pellets tre gånger med IP-buffert. Efteråt, extrahera bundna proteiner med SDS-PAGE lastning buffert genom upphettning vid 95 ° c i 5 minuter.

C. Immunutfällning

  • Ta 200 μl celllysat och tillsätt primär anti kropp. Inkubera med mild gungande över natten vid 4 ° c.
  • Tillsätt antingen protein A eller G AGA ros pärlor (20 μl 50% pärlslurry). Inkubera med mild vagga i 1 – 3 timmar vid 4 ° c.
  • Mikrocentrifug i 30 sekunder vid 4 ° c. Tvätta pelleten fem gånger med 500 μl 1X celllyssningsbuffert. Håll på isen under tvättningarna.
  • Omsuspendera pelleten med 20 μl 3X SDS exempelbuffert. Vortex, sedan mikrocentrifug i 30 sekunder.
  • Värm provet till 95 – 100 ° c i 2 – 5 minuter och mikrocentrifug i 1 minut vid 14 000 X g.
  • Fyll på provet (15 – 30 μl) på SDS-PAGE gel (12 – 15%).
  • Analysera prov genom Western blotting.

Western Blot Analys med Sonicator UP50H

Följande protokoll med sond-typ sonicator UP50H användes i studie av Kriebisch et al. (2011):
Ultraljud sond-typ homogenisator UP50H används ofta för cellavbrott och proteinisolering som provberedning steg före Western BlottingTotalt protein isolerades från MC3T3-E1-celler som behandlades med 1,25 (OH)2D3 (10− 8 M) eller fordon. Cellerna lyserat med en buffert innehåll ande 50 mm Tris HCl, pH 8 (Sigma-Aldrich); 150 mM NaCl (Fisher Scientific); 0,1% natriumdodecylsulfat (SDS) (Fisher Scientific); 1% IGEPAL CA-630 (Sigma-Aldrich) och 0,5% natriumdeoxycholat (Merck). Cellen lysate var sonicated för 2 × 10 s vid cykel 1 och amplitud 80 med UP50H ultraljud processor (Hielscher, ultraljud Technology, Teltow, Tyskland). Därefter centrifugerades materialet i 10 min vid 14 000 rpm och supernatanten användes för Western blotting. Tjugofem μg protein kokas i provbuffert och reducerande medel (Invitrogen) och därefter separeras av SDS-PAGE med 4 – 12% polyakrylamidgeler (Invitrogen) och överförs till ett nitrocellulosamembran (GE-hälsovård). Membranet blockerades för 1 h med TBS (10 mM Tris-HCl; pH 7,6; 150 mM NaCl) innehåll ande 1% kasein (Sigma-Aldrich) och 1% tris (1 M). Efter blockering, var membranet inkuberas med lätt agitation över natten vid 4 ° c med den primära anti kroppen (kanin anti-mänskliga CBS 1/500, som utvecklats i labbet av prof. R. Banerjee, Ann Arbor, MI, USA). Inkubation med en peppar rots peroxidas (HPR)-konjugerad sekundär anti kropp (Dako) utfördes för 1 h vid rums temperatur. Alla blotting utvecklades av förstärkt Kemiluminiscens (Perkin Elmer).
 

Denna handledning förklarar vilken typ av sonicator som är bäst för dina provberedningsuppgifter som lys, cellstörning, proteinisolering, DNA- och RNA-fragmentering i laboratorier, analys och forskning. Välj den perfekta ljudbehandlingstypen för din applikation, provvolym, provnummer och genomströmning. Hielscher Ultrasonics har den perfekta ultraljud homogenisator för dig!

Hur man hittar den perfekta Sonicator för cellstörningar och proteinutvinning i vetenskap och analys

Video miniatyr

 

Klicka här för att läsa mer om bästa praxis för ultraljudscelllys och extraktion, lysatberedning och rekommendationer för processförbättringar!
 
Tabellen nedan ger dig en indikation på den ungefärliga bearbetningskapaciteten hos våra ultrasonicators i laboratoriestorlek:

Rekommenderade Devices batch Volym Flödeshastighet
UIP400MTP 96-brunns platta sonicator multi-well / microtiter plattor n.a.
Ultraljud CupHorn CupHorn för injektionsflaskor eller bägare n.a.
GDmini2 Ultraljud mikroflödesreaktor n.a.
VialTweeter 0.5 till 1,5 ml n.a.
UP100H 1 till 500 ml 10 till 200 ml / min
Uf200 ः t, UP200St 10 till 1000 ml 20 till 200 ml/min
UP400St 10 till 2000 ml 20 till 400 ml / min
ultraljud sikt shaker n.a. n.a.

Kontakta oss! / Fråga oss!

Be om mer information

Använd formuläret nedan för att begära ytterligare information om våra sonicators för provberedning före Western Blots, detaljerade applikationsprotokoll och pris. Vi kommer gärna att diskutera din provberedningsprocess med dig och erbjuda dig ett ultraljudssystem som uppfyller dina krav!









Observera att våra Integritetspolicy.


Mikroplattor, flerbrunnsplattor, PCR-plattor och 96-brunnsplattor kan bekvämt och enhetligt sonikeras med hjälp av UIP400MTP-plattans sonicator

UIP400MTP Plate Sonicator för ultraljudsbehandling med hög genomströmning av 96-brunnsplattor



Om Western blotting

Blots är analytiska procedurer där DNA, RNA och proteiner överförs till en bärare så att de kan separeras.
Den södra blot används för detektion av DNA, den nordliga blot för RNA och den västerländska blot för proteiner.
Western blotting kallas också proteinimmunoblotting eftersom en anti kropp används för att specifikt upptäcka dess antigen. Western blotting är en av de viktigaste analys metoderna för att detektera specifika proteiner i provet. I Western blot, proteinerna är orörliga på membran för att upptäcka dem med hjälp av monoklonala eller polyklon anti kroppar.
Av SDS-polyakrylamid gel elektrofores (SDS-Page) infödda proteiner separeras av 3-D struktur eller denaturerade proteiner av längden på polypeptid. Proteinerna överförs sedan till ett membran (typiskt nitrocellulosa eller PVDF), där de är färgade med anti kroppar som är specifika för mål proteinet. Gel elektrofores steg ingår i västra blot-analys för att lösa problemet med kors reaktivitet av anti kroppar.
Efteråt är de separerade proteiner uppsvälld på en matris (främst på en nitrocellulosa eller PVDF membran), där de är färgade med anti kroppar. Anti kropparna fungerar som en sond och väljs specifikt till mål proteinet. Analysen av placeringen och intensiteten av den specifika reaktionen avslöjar uttrycks Detaljer för mål proteiner i det givna provet. Western blotting kunde upptäcka mål protein som är så låg som 1ng på grund av hög upplösning av gel elektrofores och stark specificitet och hög känslighet av immunoassay. Western blot-metoden används inom molekylärbiologi, biokemi, immunogenetik och andra molekyl ära forsknings områden.
Andra relaterade tekniker inkluderar dot blot analys, immunhistokemi och immuncytochemistry där anti kroppar används för att upptäcka proteiner i vävnader och celler genom immunofärgning, och enzymkopplad immunosorbent assay (ELISA).


Litteratur / Referenser

Komplett VialTweeter setup: VialTweeter sonotrode på ultraljud processor UP200St

VialTweeter sonicator för samtidig provberedning av flera injektionsflaskor

Kontakta oss! / Fråga oss!





Observera att våra Integritetspolicy.


Ultraljudsbehandling är ett viktigt steg under prov beredning

UP200St med mikro-tips för prov ultraljudsbehandling

Vi diskuterar gärna din process.

Låt oss komma i kontakt.