Обработка ультразвуком с помощью зонда для подготовки образцов: подробное руководство
Обработка ультразвуком с помощью зонда – мощный инструмент для разрушения клеток, сдвиговой фрагментации ДНК и диспергирования частиц в жидких образцах. Как и все методы в науках о жизни, микробиологии и клиническом анализе, обработка ультразвуком требует тщательной оптимизации, чтобы избежать повреждения образцов, особенно при работе с термочувствительными материалами. Следуя рекомендациям – например, поддерживая образцы на льду, контролируя амплитуду ультразвуковых колебаний, используя импульсный режим и оптимизируя глубину погружения сонотрода, – вы можете получить эффективные и воспроизводимые результаты. В конечном итоге хорошо оптимизированный протокол обработки ультразвуком обеспечивает успешное выполнение последующих процедур и сохраняет целостность ваших ценных образцов.
Обработка ультразвуком – незаменимый этап подготовки образцов
Обработка ультразвуком с помощью зонда – широко используемый метод подготовки образцов в биологических, химических и материаловедческих исследованиях. В этом процессе ультразвуковая энергия используется для разрушения клеток, сдвиговой фрагментации ДНК, диспергирования наночастиц или эмульгирования растворов. При передаче высокоэнергетических ультразвуковых волн через жидкий образец с помощью зонда (сонотрода, ультразвукового концентратора, ультразвукового зонда) создаются локальные области высокого давления, турбулентности и кавитации, которые механически разрушают клеточные структуры или обеспечивают однородное диспергирование частиц. Однако этот метод требует тщательной оптимизации, чтобы избежать повреждения образца, особенно чувствительных биологических материалов, таких как белки и нуклеиновые кислоты. Это руководство по обработке ультразвуком с помощью зонда содержит практические рекомендации для эффективной подготовки образцов.
Лабораторный ультразвуковой гомогенизатор UP200Ht популярен в исследовательских лабораториях для подготовки образцов, лизиса, экстракции, фрагментации ДНК и растворения.
- Настройте амплитуду
Амплитуда при обработке ультразвуком характеризует величину колебаний, создаваемых зондом. Более высокие амплитуды обеспечивают более интенсивную передачу ультразвуковой энергии, но выделяют больше тепла, повышая риск деградации образца. Напротив, более низкие амплитуды обеспечивают более мягкую обработку ультразвуком, уменьшая накопление тепла и сохраняя целостность образца.
В зависимости от вашей конкретной задачи использование более низкой амплитуды в течение более длительного времени может дать лучшие результаты, чем применение очень высокой амплитуды короткими импульсами. Такой подход снижает вероятность термической деградации, обеспечивая при этом достаточное разрушение или перемешивание образца. - Используйте автоматическое протоколирование данных
Интеллектуальное меню всех цифровых ультразвуковых аппаратов Hielscher предусматривает автоматическую запись данных. С момента включения ультразвукового аппарата отслеживаются все важные данные, такие как подведённая энергия (общая и полезная), амплитуда, мощность, время – и даже температура и давление, если вы подключили датчики температуры и давления. Все данные записываются с отметками даты и времени в виде CSV-файла на встроенную SD-карту. - Оптимизация подводимой энергии: обеспечьте нужную ультразвуковую мощность
Оптимизация ультразвуковой обработки по удельной подведённой энергии (Ws/mL) обеспечивает более воспроизводимый и поддающийся количественной оценке подход, чем протоколы, основанные на времени обработки. Хотя продолжительность обработки ультразвуком остаётся значимым фактором, именно общая энергия, переданная на единицу объёма, в конечном итоге определяет степень разрушения образца. Недостаточная подведённая энергия может привести к неполному лизису или диспергированию, тогда как избыточная энергия может вызвать деградацию молекул, денатурацию белков или перегрев – особенно в чувствительных биологических или полимерных системах.
Наш совет: Начните с низких значений удельной подведённой энергии – обычно в диапазоне 10–50 Ws/mL, в зависимости от типа образца, – и при необходимости постепенно увеличивайте их. Контролируйте процесс, оценивая физические изменения (например, мутность, вязкость, диспергирование частиц), и следите за признаками чрезмерной обработки ультразвуком, такими как избыточное пенообразование, повышение температуры или изменение цвета образца. Соответствующим образом регулируйте амплитуду, импульсный цикл и продолжительность, чтобы достичь целевой дозы энергии, сводя к минимуму термическую или механическую нагрузку. - Используйте импульсный режим, чтобы свести к минимуму накопление тепла
Ультразвуковые аппараты Hielscher могут работать в импульсном режиме, что особенно полезно для термочувствительных образцов. В импульсном режиме фазы обработки ультразвуком чередуются с паузами, позволяя образцу охлаждаться между импульсами. Это предотвращает резкие скачки температуры, сводя к минимуму риск деградации под действием тепла. - Важность контроля температуры: поддерживайте образцы охлаждёнными
Обработка ультразвуком передаёт ультразвуковую энергию в жидкость, вызывая выделение тепла вследствие турбулентности и трения. Без контроля это может привести к повышению температуры, которое может вызвать деградацию чувствительных биологических образцов, таких как белки, ферменты и нуклеиновые кислоты. Для уменьшения этого риска контроль температуры во время обработки ультразвуком имеет решающее значение.
Один из самых простых и эффективных способов предотвратить перегрев – держать образцы на льду на протяжении всего процесса обработки ультразвуком. Это помогает поддерживать стабильную низкую температуру и защищает образец от термической деградации.
Все цифровые ультразвуковые аппараты Hielscher оснащены функцией контроля температуры. Подключаемый датчик температуры непрерывно измеряет температуру образца. В соответствии с заданным в программе температурным пределом ультразвуковой аппарат автоматически приостанавливает работу при достижении верхнего предела температуры и возобновляет обработку ультразвуком, как только достигается нижний предел заданного температурного интервала.
Дополнительно вы можете:- Поместить пробирку с образцом на лёд перед началом обработки ультразвуком.
- Периодически приостанавливать обработку ультразвуком для охлаждения, если необходимы длительные сеансы.
- Держать образец на льду после обработки ультразвуком для его дальнейшей стабилизации.
Это особенно важно для белковых образцов, поскольку белки могут быстро денатурировать при повышенных температурах. Поддерживая образцы охлаждёнными, вы сохраняете их функциональную целостность для последующих процедур, таких как вестерн-блоттинг, анализы ферментативной активности или масс-спектрометрия.
- Правильный размер сонотрода для вашего образца
Выбор правильного размера сонотрода для обработки образцов ультразвуком в науках о жизни и микробиологии имеет решающее значение для обеспечения оптимальной передачи энергии и эффективного разрушения клеток или биомолекул. Сонотрод подходящего размера обеспечивает эффективную кавитацию, необходимую для разрушения клеточных стенок, лизиса клеток и гомогенизации образцов. Если сонотрод слишком велик или слишком мал для объёма или типа образца, это может привести к неравномерной обработке ультразвуком, чрезмерному нагреву или недостаточному разрушению клеток, потенциально снижая достоверность результатов эксперимента. Поэтому выбор подходящего размера сонотрода помогает сохранить целостность образца и обеспечивает воспроизводимость экспериментов. - Правильная глубина погружения зонда: избегайте пенообразования и равномерного воздействия
Положение зонда – важнейший фактор обработки ультразвуком, которому часто не уделяют должного внимания. Правильная глубина погружения зонда обеспечивает эффективную передачу энергии и перемешивание образца. При слишком малой глубине погружения зонда возможно чрезмерное пенообразование, которое может удерживать пузырьки воздуха и снижать эффективность обработки ультразвуком. Если зонд погружён слишком глубоко, достаточная циркуляция может не достигаться, что приводит к неравномерной обработке образца ультразвуком.
Оптимальная глубина погружения зонда обычно составляет от 1/4 до 1/3 высоты жидкости в пробирке или ёмкости. Попробуйте разные глубины, чтобы найти оптимальное положение, обеспечивающее максимальную передачу энергии без пенообразования.
При использовании большой ёмкости для образца может быть полезно медленно перемещать сонотрод через образец, чтобы обеспечить равномерную обработку ультразвуком всего образца.
Если вы используете модели ультразвуковых аппаратов для обработки нескольких образцов CupHorn или UIP400MTP, заполните CupHorn, как описано в руководстве. - Оптимизируйте процесс обработки ультразвуком: адаптируйте его к вашему образцу
Ключ к успешной обработке ультразвуком с помощью зонда – оптимизация. Поскольку разные образцы, включая клетки, ткани и химические вещества, по-разному реагируют на ультразвуковую энергию, важно адаптировать процесс к вашим конкретным потребностям. При оптимизации следует учитывать следующие факторы:
Объём образца: Большие объёмы могут требовать более длительной обработки ультразвуком или более высоких амплитуд.
Вязкость образца: Вязким образцам может потребоваться более интенсивная обработка ультразвуком для достижения достаточного разрушения.
Желаемый результат: При лизисе прочных тканей может потребоваться более интенсивный режим обработки ультразвуком, тогда как для сдвиговой фрагментации ДНК может быть достаточно более короткой обработки.
Систематически проверяя и уточняя параметры – такие как амплитуда, продолжительность и глубина погружения зонда, – вы можете оптимизировать процесс обработки ультразвуком для вашего конкретного образца.
Подберите подходящий ультразвуковой аппарат для вашей задачи подготовки образцов
Hielscher Ultrasonics предлагает полный спектр ультразвуковых аппаратов для вашей задачи подготовки образцов. Сообщите нам важные параметры, такие как тип образца, объём и конкретное применение, над которым вы работаете. Наша команда специалистов с удовольствием проконсультирует вас и предложит наиболее подходящий ультразвуковой гомогенизатор для ваших исследовательских экспериментов.
Приведённая ниже таблица даёт представление о приблизительных возможностях обработки наших лабораторных ультразвуковых аппаратов:
| Рекомендуемые устройства | Объём партии | Расход |
|---|---|---|
| Ультразвуковой аппарат UIP400MTP для 96-луночных планшетов | многолуночные / микротитрационные планшеты | не применимо |
| Ультразвуковой CupHorn | CupHorn для флаконов или лабораторного стакана | не применимо |
| GDmini2 | ультразвуковой микропроточный реактор | не применимо |
| VialTweeter | от 0,5 до 1,5mL | не применимо |
| UP100H | от 1 до 500mL | от 10 до 200mL/min |
| UP200Ht, UP200St | от 10 до 1000mL | от 20 до 200mL/min |
| UP400St | от 10 до 2000mL | от 20 до 400mL/min |
| Ультразвуковой ситовой вибратор | не применимо | не применимо |
Hielscher Ultrasonics – компания, сертифицированная по ISO, которая уделяет особое внимание высокопроизводительным ультразвуковым аппаратам, отличающимся передовыми технологиями и удобством использования. Разумеется, ультразвуковые аппараты Hielscher соответствуют требованиям CE и отвечают требованиям UL, CSA и RoHs.
Hielscher Ultrasonics поставляет мощные бесконтактные ультразвуковые аппараты для подготовки образцов и клинического анализа. Ультразвуковой аппарат UIP400MTP для многолуночных планшетов, VialTweeter, CupHorn и проточный ультразвуковой аппарат GDmini2 обрабатывают образцы без непосредственного контакта с ними.
- высокая эффективность
- передовые технологии
- надёжность и прочность
- регулируемое, точное управление процессом
- периодическая и поточная обработка
- для любого объёма
- интеллектуальное программное обеспечение
- интеллектуальные функции (например, программирование, протоколирование данных, дистанционное управление)
- простота и безопасность эксплуатации
- минимальное техническое обслуживание
- CIP (очистка без разборки)
Ультразвуковой аппарат VialTweeter для одновременной обработки ультразвуком 10 образцов, например, для разрушения клеток, экстракции белков и сдвиговой фрагментации ДНК
Литература / источники
- Claudia Lindemann, Nataliya Lupilova, Alexandra Müller, Bettina Warscheid, Helmut E. Meyer, Katja Kuhlmann, Martin Eisenacher, Lars I. Leichert (2013): Redox Proteomics Uncovers Peroxynitrite-Sensitive Proteins that Help Escherichia coli to Overcome Nitrosative Stress. J Biol Chem. 2013 Jul 5; 288(27): 19698–19714.
- Turrini, Federica; Donno, Dario; Beccaro, Gabriele; Zunin, Paola; Pittaluga, Anna; Boggia, Raffaella (2019): Pulsed Ultrasound-Assisted Extraction as an Alternative Method to Conventional Maceration for the Extraction of the Polyphenolic Fraction of Ribes nigrum Buds: A New Category of Food Supplements Proposed by The FINNOVER Project. Foods. 8. 466; 2019
- Giricz Z., Varga Z.V., Koncsos G., Nagy C.T., Görbe A., Mentzer R.M. Jr, Gottlieb R.A., Ferdinandy P. (2017): Autophagosome formation is required for cardioprotection by chloramphenicol. Life Science Oct 2017. 11-16.
- Hemida, Yasmine (2016): Effect of Rapamycin as an Inhibitor of the mTOR Cell Cycle Entry Complex on the Selective Lysis of Human Leukemia Cells Lines in Vitro Using 20 kHz Pulsed Low-Frequency Ultrasound. Honors Capstone Projects — All. 942, 2016.
- Fernandes, Luz; Santos, Hugo; Nunes-Miranda, J.; Lodeiro, Carlos; Capelo, Jose (2011): Ultrasonic Enhanced Applications in Proteomics Workflows: single probe versus multiprobe. Journal of Integrated OMICS 1, 2011.
- Priego-Capote, Feliciano; Castro, María (2004): Analytical uses of ultrasound — I. Sample preparation. TrAC Trends in Analytical Chemistry 23, 2004. 644-653.
- Welna, Maja; Szymczycha-Madeja, Anna; Pohl, Pawel (2011): Quality of the Trace Element Analysis: Sample Preparation Steps. In: Wide Spectra of Quality Control; InTechOpen 2011.
Часто задаваемые вопросы
Какова цель обработки ультразвуком?
Цель обработки ультразвуком – использовать звуковые волны, обычно ультразвукового диапазона, для приведения частиц в образце в движение, облегчая такие процессы, как разрушение клеток, гомогенизация и разрушение молекулярных структур. Этот метод широко применяется в биологии, химии и материаловедении для улучшения перемешивания, стимулирования реакций или высвобождения содержимого клеток.
В чём заключается метод обработки ультразвуком?
Метод обработки ультразвуком предполагает использование интенсивных ультразвуковых волн (обычно с частотами в диапазоне 20–30 kHz) для создания быстрых колебаний в жидкой среде. Эти колебания вызывают образование и схлопывание микроскопических пузырьков – процесс, известный как акустическая кавитация. Эта кавитация создаёт локальные области высокого давления и температуры, которые могут разрушать клетки, диспергировать частицы или способствовать химическим реакциям. Метод обработки ультразвуком широко используется в лабораториях для таких задач, как лизис клеток, экстракция, сдвиговая фрагментация ДНК, гомогенизация и синтез наночастиц.
Как подготовить образец к обработке ультразвуком?
Для подготовки образца к обработке ультразвуком материал образца (обычно жидкость или взвешенные твёрдые частицы) помещают в подходящую ёмкость, часто в стеклянную колбу, пластиковую пробирку или многолуночный планшет, с достаточным объёмом для ультразвуковых колебаний и предотвращения проливания. При необходимости образец разбавляют буфером или растворителем, чтобы поддерживать желаемую концентрацию и предотвращать перегрев во время обработки ультразвуком. Для термочувствительных образцов ёмкость затем частично погружают в ледяную баню или охлаждающую рубашку для отвода тепла, выделяемого ультразвуковыми волнами. Зонд ультразвукового аппарата устанавливают в правильное положение для обеспечения эффективной передачи энергии. Такие параметры, как амплитуда, время и импульсный режим, задают исходя из конкретных требований эксперимента.
Разрушает ли обработка ультразвуком ДНК?
Да, обработка ультразвуком может разрушать ДНК. Высокоэнергетические ультразвуковые волны, возникающие во время обработки, могут вызывать сдвиговую фрагментацию молекул ДНК, создавая локальные области высокого давления и нагрева, которые приводят к механической нагрузке на цепи ДНК. В результате ДНК фрагментируется на более мелкие части. Степень разрушения ДНК зависит от продолжительности и интенсивности обработки ультразвуком. В некоторых экспериментах, например при иммунопреципитации хроматина (ChIP) или подготовке библиотек для секвенирования нового поколения (NGS), обработка ультразвуком используется как надёжный метод контролируемой сдвиговой фрагментации ДНК.
Hielscher Ultrasonics производит высокопроизводительные ультразвуковые гомогенизаторы от лабораторных до промышленных размеров.
