Cisalhamento da cromatina: Elevado rendimento e precisão sem contacto
O corte da cromatina é um passo crítico em muitos fluxos de trabalho de biologia molecular, permitindo a fragmentação da cromatina em tamanhos precisos para aplicações como ChIP e NGS. O sonicador de placas multipoços UIP400MTP revoluciona este processo com a sua tecnologia de alto rendimento e sem contacto, oferecendo uma eficiência, reprodutibilidade e integridade da amostra inigualáveis. Este artigo explora a forma como o UIP400MTP simplifica e melhora o corte da cromatina, satisfazendo as exigências da investigação moderna.
Corte de cromatina em ciências da vida
O corte da cromatina, o processo de fragmentação da cromatina em tamanhos manejáveis, é um passo essencial na biologia molecular, especialmente para a investigação epigenética, imunoprecipitação da cromatina (ChIP) e sequenciação de nova geração (NGS). Esta técnica é utilizada para isolar complexos ADN-proteína, estudar modificações de histonas e identificar proteínas de ligação ao ADN. A obtenção de uma fragmentação consistente e reprodutível da cromatina é fundamental para a obtenção de dados de elevada qualidade, o que depende em grande medida do equipamento e dos métodos utilizados durante o processo de corte.
Os métodos tradicionais de corte da cromatina apresentam frequentemente desafios como a contaminação das amostras, resultados variáveis e ineficiências de tempo. À medida que a investigação aumenta, especialmente em ambientes de elevado rendimento, há uma procura crescente de soluções inovadoras que garantam resultados consistentes em várias amostras. O UIP400MTP Multi-Well Plate Sonicator oferece uma abordagem avançada, de elevado rendimento e sem contacto, estabelecendo um novo padrão no corte da cromatina.
Simplifique o corte da cromatina com o Sonicador de Placas Mutli-Well UIP400MTP
O sonicador de elevado rendimento UIP400MTP destaca-se entre as técnicas de corte de cromatina, ultrapassando os métodos tradicionais como a digestão enzimática e o corte mecânico. Ao combinar a eficiência de alto rendimento com a sonicação sem contacto, oferece uma reprodutibilidade, velocidade e integridade da amostra superiores, tornando-o a escolha preferida para fluxos de trabalho de investigação modernos.
- Eficiência de alto rendimento
A capacidade da UIP400MTP para processar várias amostras em simultâneo permite poupar tempo e esforço consideráveis. Elimina a necessidade de manuseamento manual e repetitivo de amostras, permitindo que os investigadores se concentrem nas análises a jusante e aumentando a produtividade global. - Sonicação sem contacto para integridade da amostra
A sonicação sem contacto não só protege as amostras da contaminação, como também minimiza o risco de desgaste mecânico do equipamento. Isto assegura que as amostras biológicas sensíveis são processadas num ambiente controlado e estéril. - Fragmentação uniforme
A reprodutibilidade é uma pedra angular da investigação fiável. O UIP400MTP assegura que cada poço recebe uma exposição ultra-sónica idêntica, produzindo fragmentos de cromatina uniformes. Esta uniformidade é crucial para experiências como ChIP e NGS, em que a consistência na preparação de amostras tem um impacto direto na qualidade dos dados. - Escalabilidade e flexibilidade
O UIP400MTP é adequado tanto para experiências em pequena escala como para estudos em grande escala. Os investigadores podem ajustar facilmente o sistema para diferentes volumes de amostras, tornando-o numa ferramenta versátil para várias aplicações. - Redução do risco de contaminação cruzada
Os métodos tradicionais que envolvem contacto direto, como a sonicação da sonda, implicam um risco de contaminação de amostra para amostra. A abordagem sem contacto do UIP400MTP elimina este risco, tornando-o particularmente adequado para aplicações sensíveis como os estudos epigenéticos.
Aplicações do corte de cromatina com o UIP400MTP
O UIP400MTP é ideal para:
- Imunoprecipitação da cromatina (ChIP): O corte preciso da cromatina garante uma ligação óptima dos anticorpos a complexos específicos de ADN-proteína.
- Sequenciação de nova geração (NGS): A fragmentação uniforme do ADN é fundamental para a preparação da biblioteca de sequenciação, garantindo leituras de elevada qualidade.
- Estudos de modificação de histonas: Uma preparação consistente da cromatina permite aos investigadores analisar as interações histona-ADN com elevada precisão.
- Investigação epigenética: O UIP400MTP apoia a investigação de padrões de metilação do ADN e outras modificações epigenéticas através do processamento reprodutível de amostras.
Ultrassons de alto desempenho
- Alta eficiência
- Tecnologia de ponta
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- controlo preciso e ajustável do processo
- lote & em linha
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- software inteligente
- caraterísticas inteligentes (por exemplo, programáveis, protocolo de dados, controlo remoto)
- Fácil e seguro de operar
- Manutenção reduzida
- CIP (limpeza no local)
Conceção, fabrico e consultoria – Qualidade fabricada na Alemanha
Os ultrassons Hielscher são conhecidos pelos seus elevados padrões de qualidade e design. A robustez e a facilidade de operação permitem a integração harmoniosa dos nossos ultrassons nas instalações industriais. As condições difíceis e os ambientes exigentes são facilmente controlados pelos ultrassons Hielscher.
A Hielscher Ultrasonics é uma empresa certificada pela ISO e dá especial ênfase aos ultrassons de alto desempenho com tecnologia de ponta e facilidade de utilização. Naturalmente, os ultrassons da Hielscher estão em conformidade com a CE e cumprem os requisitos da UL, CSA e RoHs.
A tabela abaixo dá-lhe uma indicação da capacidade de processamento aproximada dos nossos ultrassons de laboratório:
| Dispositivos recomendados | Volume do lote | caudal |
|---|---|---|
| Sonicador de placas de 96 poços UIP400MTP | placas multipoços / microtitulação | n.d. |
| CupHorn ultrassónico | CupHorn para frascos ou copo | n.d. |
| GDmini2 | reator de microfluxo ultrassónico | n.d. |
| VialTweeter | 0.5 a 1,5mL | n.d. |
| UP100H | 1 a 500mL | 10 a 200mL/min |
| UP200Ht, UP200St | 10 a 1000mL | 20 a 200mL/min |
| UP400ST | 10 a 2000mL | 20 a 400mL/min |
| Agitador de peneiras por ultra-sons | n.d. | n.d. |
Literatura / Referências
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- UIP400MTP-Multi-well-Plate-Sonicator-Infographic
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
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perguntas frequentes
O que é a Fragmentação da Cromatina?
A fragmentação da cromatina é o processo de decomposição da cromatina, um complexo de ADN e proteínas, em fragmentos mais pequenos e manejáveis. Isto é conseguido para facilitar o estudo das interações ADN-proteína, das modificações das histonas ou da acessibilidade do ADN em aplicações de biologia molecular, como a imunoprecipitação da cromatina (ChIP) e a sequenciação de nova geração (NGS). O processo assegura que a cromatina é fragmentada até um intervalo de tamanho específico, normalmente através de métodos físicos como a sonicação ou a digestão enzimática, preservando simultaneamente a integridade dos complexos ADN-proteína para análise a jusante.
O que é a ligação cruzada da cromatina?
A ligação cruzada da cromatina é um processo bioquímico utilizado para estabilizar as interações entre o ADN e as proteínas ou outras moléculas associadas à cromatina. Envolve a utilização de agentes de reticulação, como o formaldeído, para criar ligações covalentes entre as moléculas em interação, de forma eficaz “congelamento” as suas interações no local. Esta técnica é amplamente utilizada na imunoprecipitação da cromatina (ChIP) e em ensaios relacionados para preservar a estrutura nativa da cromatina e facilitar a identificação das interações ADN-proteína ou proteína-proteína durante a análise a jusante.
O que causa a Compactação da Cromatina?
A compactação da cromatina é causada principalmente por interações entre as histonas e o ADN, bem como por dobramentos de ordem superior mediados por histonas de ligação (como a H1), proteínas associadas à cromatina e modificações epigenéticas como a metilação ou desacetilação das histonas. Estes factores promovem um empacotamento mais apertado dos nucleossomas, reduzindo a acessibilidade ao ADN. As condições celulares, como as concentrações de iões, e processos como a divisão celular ou o silenciamento de genes, também contribuem para a compactação da cromatina.
A Hielscher Ultrasonics fabrica homogeneizadores ultra-sónicos de alto desempenho a partir de laboratório para dimensão industrial.




