Lisis Sel Ragi dalam Mikroplat Menggunakan Sonikasi Berintensitas Tinggi
Ahli mikrobiologi dan peneliti ilmu hayati yang bekerja dengan Saccharomyces cerevisiae, Pichia pastoris / Komagataella phaffii, dan sistem ragi lainnya memahami tantangannya: sel ragi kuat, lisis yang reproduktif dapat sulit dicapai, dan disrupsi sampel secara manual dengan cepat menjadi hambatan ketika banyak galur, klon, kondisi kultur, atau konstruk ekspresi harus ditapis.
Lisis Ragi dengan Kapasitas Pemrosesan Sampel yang Tinggi untuk Mikrobiologi, Biologi Molekuler, dan Analisis Protein
Sonikator mikroplat Hielscher seperti UIP400MTP (400 W) dan UIP550MTP (550 W) menyediakan solusi berkapasitas pemrosesan sampel tinggi untuk lisis mekanis sel ragi langsung dalam mikroplat. Alih-alih memproses sampel satu per satu dengan probe, seluruh mikroplat dapat disonikasi dalam kondisi yang seragam. Hal ini membuat lisis ragi secara ultrasonik lebih cepat, lebih reproduktif, dan lebih mudah diintegrasikan ke dalam alur kerja mikrobiologi modern, ekspresi protein, penapisan enzim, dan omik.
Baik Anda perlu melepaskan protein rekombinan dari P. pastoris, menyiapkan lisat ragi untuk uji enzim, mendisrupsi S. cerevisiae untuk analisis protein, maupun menapis puluhan klon ragi secara paralel, sonikator mikroplat Hielscher menghasilkan disrupsi sel berbasis kavitasi yang kuat dengan kontrol proses yang presisi.
Memerlukan lisis yang reproduktif untuk S. cerevisiae, P. pastoris, atau galur ragi lainnya dalam mikroplat? Beri tahu kami format plat, volume sampel, kepadatan sel, dan analit target Anda. Kami akan membantu Anda menentukan parameter sonikasi yang sesuai untuk alur kerja UIP400MTP atau UIP550MTP Anda.
Sonikator Plat Multisumur Hielscher untuk lisis ragi – preparasi sampel dengan kapasitas pemrosesan sampel yang tinggi
Mengapa Sel Ragi Memerlukan Lisis Mekanis yang Efisien
Sel ragi lebih sulit dilisis daripada banyak sel bakteri atau mamalia karena dilindungi oleh dinding sel kaku yang terutama tersusun atas polisakarida, glukan, manoprotein, dan kitin. Dinding sel ini memberikan stabilitas mekanis, tetapi juga membatasi pelepasan protein intraseluler, asam nukleat, metabolit, dan enzim.
Metode lisis ragi konvensional mencakup penghancuran dengan manik, pencernaan enzimatis, siklus pembekuan–pencairan, lisis kimia, dan sonikasi tipe probe. Metode-metode ini dapat efektif, tetapi juga memiliki keterbatasan. Penghancuran dengan manik dapat menghasilkan debris dan pemanasan, pencernaan enzimatis dapat menambah biaya dan variabilitas, dan sonikasi probe untuk satu sampel memakan waktu ketika banyak sampel harus diproses.
Kavitasi ultrasonik terfokus berintensitas tinggi mengatasi keterbatasan ini dengan memberikan gaya geser mekanis yang kuat, fluktuasi tekanan, dan aliran mikro pada suspensi ragi. Hasilnya adalah disrupsi cepat pada dinding dan membran sel, peningkatan pelepasan komponen intraseluler, dan preparasi sampel yang sangat reproduktif dalam format plat.
Sonikasi Mikroplat untuk Preparasi Sampel Ragi Secara Paralel
Hielscher UIP400MTP dan UIP550MTP dirancang untuk sonikasi seragam pada mikroplat, plat multisumur, plat PCR, dan rak sampel yang sesuai. Berbeda dengan sonikasi probe, sampel tidak perlu diperlakukan satu per satu. Seluruh plat dipaparkan pada energi ultrasonik yang terkontrol, sehingga alur kerja ini sangat sesuai untuk pemrosesan sampel secara paralel.
Hal ini sangat berguna untuk:
- Penapisan S. cerevisiae mutan atau galur ekspresi
- Lisis P. pastoris / K. phaffii dalam bentuk klon setelah ekspresi protein rekombinan
- Preparasi lisat ragi untuk uji enzim
- Ekstraksi protein untuk SDS-PAGE, Western blot, ELISA, LC-MS/MS, atau pengujian aktivitas
- Pelepasan metabolit intraseluler untuk metabolomik
- Preparasi sampel DNA dan RNA setelah pemurnian lanjutan yang sesuai
- Optimasi bufer lisis, aditif, dan kondisi ekstraksi dengan kapasitas pemrosesan sampel yang tinggi
Bagaimana Kavitasi Ultrasonik Mendisrupsi Sel Ragi
Selama sonikasi, ultrasonik terfokus berdaya tinggi menghasilkan siklus kompresi dan rarefaksi yang bergantian dalam sampel cair. Pada intensitas yang memadai, fluktuasi tekanan ini menghasilkan kavitasi akustik. Gelembung kavitasi terbentuk, berosilasi, dan runtuh, menghasilkan gaya geser lokal, jet mikro, turbulensi, dan gradien tekanan yang kuat.
Dalam suspensi ragi, efek mekanis ini melemahkan dan merobek dinding serta membran sel. Protein intraseluler, enzim, asam nukleat, dan metabolit dilepaskan ke dalam bufer lisis. Karena proses ini bersifat mekanis, proses ini dapat digunakan dengan berbagai sistem bufer dan dapat dikombinasikan dengan inhibitor protease, agen pereduksi, detergen, garam, atau praperlakuan enzimatis ringan.
Protokol Umum: Lisis Sel Ragi dalam Mikroplat
Protokol berikut memberikan titik awal praktis untuk lisis ragi menggunakan sonikator mikroplat Hielscher UIP400MTP atau UIP550MTP. Parameter harus dioptimalkan sesuai dengan galur ragi, kepadatan sel, molekul target, komposisi bufer, jenis plat, dan uji lanjutan.
1. Panen dan Cuci Sel Ragi
Tumbuhkan Saccharomyces, Pichia, Hansenula, Debaryomyces, atau galur ragi lainnya dalam kondisi kultur yang diinginkan. Panen sel dengan sentrifugasi dan buang medium kultur. Cuci pelet dengan air suling dingin, PBS, atau bufer lisis yang dipilih untuk menghilangkan sisa komponen medium yang dapat mengganggu analisis lanjutan.
Untuk ekstraksi protein, jaga sampel tetap dingin dan bekerja dengan cepat. Jika protease menjadi perhatian, dinginkan terlebih dahulu semua bufer dan bahan habis pakai.
2. Suspensikan Kembali Pelet Sel
Suspensikan kembali pelet ragi dalam bufer lisis dingin yang sesuai. Untuk pelepasan protein yang efisien, kepadatan sel yang tinggi sering kali menguntungkan. Sebagai titik awal, gunakan sekitar 10–20% w/v pelet sel basah atau suspensi pekat yang setara dengan OD600 > 10, bergantung pada uji yang digunakan.
Bufer lisis protein ragi yang umum dapat mengandung:
- sistem bufer seperti Tris-HCl, bufer fosfat, atau HEPES
- garam seperti NaCl atau KCl
- campuran inhibitor protease
- agen pereduksi opsional seperti DTT atau β-merkaptoetanol
- detergen opsional seperti Triton X-100, NP-40, SDS, atau CHAPS, bergantung pada kompatibilitas dengan proses lanjutan
- inhibitor fosfatase opsional untuk studi fosforilasi
Untuk galur ragi yang sulit dilisis atau ekstraksi protein yang sangat lembut, praperlakuan singkat dengan Zymolyase, Lyticase, atau enzim pencerna dinding sel lainnya dapat digunakan sebelum sonikasi. Praperlakuan enzimatis ini bersifat opsional, tetapi dapat meningkatkan efisiensi lisis atau mengurangi intensitas ultrasonik yang diperlukan.
3. Pindahkan Sampel ke Mikroplat yang Sesuai
Distribusikan suspensi ragi ke dalam mikroplat yang kompatibel dengan sonikasi. Plat berdasar bulat sering lebih disukai karena meningkatkan pengumpulan sampel dan mengurangi zona mati. Gunakan volume sampel yang sama di semua sumur untuk meningkatkan reproduktibilitas.
Tutup rapat plat dengan matras atau film penyegel yang sesuai untuk mencegah penguapan, pembentukan aerosol, dan kontaminasi silang. Pastikan penyegel kompatibel dengan suhu dan kondisi sonikasi yang dipilih.
Volume kerja yang umum bergantung pada format plat dan aplikasi. Format yang lazim mencakup plat 96 sumur, plat bersumur dalam, plat PCR, atau rak tabung yang sesuai.
4. Siapkan Pendinginan
Lisis ragi memerlukan intensitas ultrasonik yang tinggi, dan disrupsi mekanis menghasilkan panas. Oleh karena itu, kontrol suhu sangat penting, terutama untuk analisis protein, enzim, RNA, atau fosforilasi.
Gunakan strategi pendinginan yang sesuai, seperti:
- bufer lisis yang telah didinginkan
- mikroplat yang telah didinginkan
- jeda pendinginan di antara interval sonikasi
- pendinginan eksternal pada platform sonikasi, jika dapat diterapkan
Tujuannya adalah menjaga sampel cukup dingin untuk mencegah denaturasi protein, inaktivasi enzim, degradasi RNA, dan variabilitas sampel akibat panas.
5. Sonikasi Suspensi Ragi
Tempatkan plat yang telah disegel ke dalam sonikator mikroplat Hielscher UIP400MTP atau UIP550MTP dan pilih program sonikasi berpulsa. Penggunaan pulsa disarankan karena memungkinkan disrupsi mekanis selama fase ON dan pelepasan panas selama fase OFF.
Sebagai titik awal untuk lisis sel ragi:
| Parameter | Rentang Awal yang Disarankan | Tujuan |
|---|---|---|
| Amplitudo | 60–100% | Intensitas kavitasi tinggi untuk sel ragi yang kuat |
| Mode Pulsa | 10–30 sec ON / 30–60 sec OFF | Lisis yang efisien dengan akumulasi panas yang terkontrol |
| Waktu ON Kumulatif | 5–15 min | Sesuaikan dengan galur, kepadatan, dan molekul target |
| Suhu | Jaga sampel tetap dingin | Lindungi protein, enzim, RNA, dan metabolit |
| Penyegelan Plat | Disarankan | Mencegah penguapan, pembentukan aerosol, dan kontaminasi silang |
Untuk suspensi ragi yang sangat resistan, biomassa P. pastoris yang padat, atau ekstraksi protein rekombinan yang sulit, tingkatkan waktu ON kumulatif secara bertahap. Untuk protein yang peka terhadap panas atau uji enzim, gunakan pulsa yang lebih singkat, jeda pendinginan yang lebih lama, dan amplitudo awal yang lebih rendah.
Lisis ragi dengan kapasitas pemrosesan sampel yang tinggi dalam plat multisumur menggunakan UIP400MTP
6. Jernihkan Lisat
Setelah sonikasi, sentrifugasi mikroplat atau pindahkan sampel ke tabung untuk sentrifugasi. Pisahkan debris sel dengan sentrifugasi pada kecepatan dan suhu yang sesuai. Kumpulkan supernatan untuk analisis lanjutan.
Bergantung pada aplikasinya, lisat dapat digunakan untuk:
- kuantifikasi protein
- uji aktivitas enzim
- SDS-PAGE dan Western blotting
- ELISA dan imunoasai
- proteomik LC-MS/MS
- analisis metabolit
- pemurnian DNA atau RNA
7. Optimalkan dan Dokumentasikan Metode
Untuk lisis ragi yang reproduktif, dokumentasikan semua parameter yang relevan, termasuk galur, kondisi kultur, OD600, massa sel basah, komposisi bufer, jenis plat, volume sampel, amplitudo, siklus pulsa, waktu ON kumulatif, metode pendinginan, dan suhu akhir sampel.
Jika sonikator Hielscher dilengkapi dengan perekaman data otomatis, data proses dapat digunakan untuk dokumentasi, pengembangan metode, peningkatan skala, dan kontrol mutu.
Tips Optimasi Lisis Ragi
Untuk pelepasan protein yang maksimal, gunakan suspensi ragi pekat, intensitas ultrasonik tinggi, dan waktu ON kumulatif yang memadai. Untuk protein sensitif, kurangi amplitudo, perpanjang jeda pendinginan, dan jaga plat tetap dingin sepanjang proses.
Jika lisis tidak lengkap, tingkatkan waktu sonikasi secara bertahap, uji praperlakuan enzimatis, kurangi viskositas sampel, atau optimalkan bufer. Jika protein terdegradasi atau kehilangan aktivitas, tingkatkan pendinginan, persingkat interval ON, tambahkan inhibitor, dan pastikan sistem detergen kompatibel dengan protein target.
Karena galur ragi sangat berbeda dalam struktur dinding sel, fase pertumbuhan, sistem ekspresi, dan kepadatan biomassa, matriks optimasi singkat disarankan. Misalnya, uji tiga amplitudo, dua siklus pulsa, dan dua total waktu ON, kemudian evaluasi efisiensi lisis dan integritas protein.
Baik Anda memproses beberapa plat uji maupun menjalankan penapisan ragi dengan kapasitas pemrosesan sampel yang tinggi, Hielscher dapat membantu Anda memilih sonikator mikroplat yang tepat dan mengembangkan protokol lisis yang andal. Hubungi kami dengan informasi tentang galur ragi, alur kerja, dan kebutuhan kapasitas pemrosesan sampel Anda!
Keunggulan Sonikator Mikroplat Hielscher untuk Lisis Ragi
Sonikator mikroplat Hielscher ideal untuk laboratorium yang memerlukan lisis reproduktif pada banyak sampel. Sonikator ini menghilangkan penanganan lambat satu sampel pada satu waktu dalam sonikasi probe dan mengurangi variabilitas yang disebabkan oleh penempatan probe secara manual, kedalaman pencelupan, dan perbedaan penanganan antarsampel.
Keunggulan utamanya mencakup:
- Pemrosesan dengan kapasitas pemrosesan sampel yang tinggi: Sonikasi banyak sampel ragi secara paralel dalam mikroplat atau rak sampel yang kompatibel.
- Kondisi yang reproduktif: Kondisi sonikasi yang sama di semua sumur untuk hasil lisis yang seragam dan dapat dibandingkan.
- Tanpa kontaminasi silang melalui probe: Sampel tetap tersegel selama sonikasi, sehingga mengurangi perpindahan residu antarsampel dan langkah pembersihan.
- Sesuai untuk sel yang kuat: Ultrasonik berintensitas tinggi mendukung disrupsi dinding sel ragi.
- Alur kerja yang efisien: Ideal untuk penapisan galur, klon, kondisi ekspresi, dan bufer lisis.
- Alur kerja yang efisien: Pengaturan yang dapat diprogram, pencatatan data otomatis, dan sesuai untuk otomasi laboratorium.
Aplikasi dalam Bioteknologi Ragi dan Penelitian Ilmu Hayati
Lisis ragi secara ultrasonik dalam mikroplat mendukung banyak alur kerja penelitian dan penapisan. Dalam ekspresi protein rekombinan, klon P. pastoris dan S. cerevisiae dapat dilisis secara paralel untuk membandingkan tingkat ekspresi atau aktivitas enzim. Dalam biologi sistem dan omik, lisis terstandar meningkatkan keterbandingan antarkondisi. Dalam mikrobiologi, sonikasi mendukung preparasi cepat lisat dari berbagai galur, kondisi medium, atau perlakuan stres.
Bidang aplikasi yang umum mencakup:
- ekstraksi protein ragi
- penapisan protein rekombinan
- penapisan aktivitas enzim
- seleksi klon setelah transformasi
- optimasi fermentasi
- preparasi sampel proteomik
- preparasi sampel metabolomik
- studi disrupsi dinding sel
- uji mikrobiologi dengan kapasitas pemrosesan sampel yang tinggi
Lisis Ragi yang Andal Dimulai dengan Sonikasi Terkontrol
Lisis ragi dapat menjadi sulit ketika jumlah sampel meningkat, tetapi sonikator mikroplat Hielscher membuat proses ini lebih cepat, lebih bersih, dan lebih reproduktif. UIP400MTP dan UIP550MTP memungkinkan peneliti memproses seluruh plat dalam kondisi ultrasonik yang ditetapkan, sehingga meningkatkan kapasitas pemrosesan sampel sekaligus mengurangi penanganan manual.
Bagi ahli mikrobiologi, ahli biologi molekuler, ilmuwan protein, dan laboratorium bioteknologi, sonikasi mikroplat merupakan alat yang ampuh untuk melepaskan komponen intraseluler ragi secara efisien dan reproduktif.
Pertanyaan yang Sering Diajukan tentang Lisis Sel Ragi dengan Sonikasi Mikroplat
Dapatkah sel ragi dilisis dengan sonikasi?
Ya. Sel ragi seperti Saccharomyces cerevisiae dan Pichia pastoris dapat dilisis dengan sonikasi berintensitas tinggi. Kavitasi ultrasonik menghasilkan gaya geser mekanis yang kuat yang mendisrupsi dinding dan membran sel ragi, sehingga melepaskan protein, enzim, asam nukleat, dan metabolit.
Mengapa sel ragi lebih sulit dilisis daripada sel bakteri?
Sel ragi memiliki dinding sel yang tebal dan tahan secara mekanis, yang terutama tersusun atas glukan, manoprotein, dan kitin. Struktur kaku ini membuat ragi lebih sulit didisrupsi daripada banyak sel bakteri atau mamalia. Oleh karena itu, lisis ragi biasanya memerlukan intensitas yang lebih tinggi, pemrosesan yang lebih lama, atau praperlakuan enzimatis opsional.
Sonikator Hielscher mana yang sesuai untuk lisis ragi dalam mikroplat?
Hielscher UIP400MTP dan UIP550MTP sesuai untuk lisis ragi dengan kapasitas pemrosesan sampel yang tinggi dalam mikroplat. UIP400MTP ideal untuk preparasi sampel paralel rutin, sedangkan UIP550MTP memberikan daya ultrasonik yang lebih tinggi untuk tugas lisis yang menuntut, suspensi pekat, dan galur ragi yang kuat.
Dapatkah Pichia pastoris dilisis dalam sonikator mikroplat?
Ya. Pichia pastoris, yang juga dikenal sebagai Komagataella phaffii, dapat dilisis menggunakan sonikasi mikroplat berintensitas tinggi. Karena P. pastoris dapat membentuk biomassa padat dan memiliki dinding sel yang kuat, optimasi amplitudo, siklus pulsa, pendinginan, dan total waktu sonikasi disarankan.
Apa parameter sonikasi yang umum untuk lisis ragi?
Rentang awal yang berguna adalah amplitudo 50–80%, operasi berpulsa seperti 10–30 detik ON dan 30–60 detik OFF, serta waktu ON kumulatif 5–15 menit. Parameter tepatnya bergantung pada galur ragi, kepadatan sel, volume sampel, jenis plat, bufer, dan molekul target.
Mengapa lisis ragi sebaiknya dilakukan dengan mode pulsa?
Mode pulsa mengurangi akumulasi panas selama sonikasi. Selama fase ON, kavitasi ultrasonik mendisrupsi sel. Selama fase OFF, sampel dapat mendingin. Hal ini penting karena panas berlebihan dapat menyebabkan denaturasi protein, mengurangi aktivitas enzim, mendegradasi RNA, dan mengganggu reproduktibilitas.
Apakah praperlakuan enzimatis diperlukan sebelum meny sonikasi sel ragi?
Praperlakuan enzimatis tidak selalu diperlukan, tetapi dapat meningkatkan efisiensi lisis. Enzim seperti Zymolyase atau Lyticase mencerna sebagian dinding sel ragi dan dapat mengurangi intensitas ultrasonik atau waktu yang diperlukan untuk lisis lengkap. Hal ini dapat berguna untuk protein sensitif atau galur yang sulit dilisis.
Bagaimana pemanasan berlebihan dapat dicegah selama sonikasi ragi?
Gunakan bufer yang telah didinginkan, mode pulsa, jeda pendinginan, dan sistem plat yang didinginkan. Jaga mikroplat tetap tersegel dan pantau suhu jika memungkinkan. Untuk protein sensitif, gunakan interval ON yang lebih singkat, interval OFF yang lebih lama, dan proses sampel dalam kondisi dingin.
Dapatkah sonikasi mikroplat menggantikan penghancuran dengan manik untuk lisis ragi?
Dalam banyak alur kerja, ya. Sonikasi mikroplat dapat menggantikan penghancuran dengan manik ketika diperlukan lisis yang bersih, reproduktif, dan paralel. Metode ini menghindari penanganan manik, mengurangi kerumitan penggunaan bahan habis pakai, dan menyederhanakan otomasi. Namun, setiap aplikasi harus divalidasi dengan membandingkan hasil lisis, integritas protein, dan kinerja uji.
Apakah sonikasi mikroplat sesuai untuk ekstraksi protein dari ragi?
Ya. Sonikasi mikroplat sangat sesuai untuk ekstraksi protein dari ragi, terutama ketika banyak klon atau kondisi kultur harus dibandingkan. Inhibitor protease, bufer dingin, dan pengaturan pulsa yang terkontrol membantu menjaga kualitas protein.
Dapatkah metode yang sama digunakan untuk ekstraksi DNA, RNA, dan protein?
Prinsip dasar sonikasi yang sama dapat digunakan, tetapi bufer dan kondisi proses harus disesuaikan dengan molekul target. Alur kerja protein memerlukan inhibisi protease dan kontrol suhu. Alur kerja RNA memerlukan penanganan bebas RNase dan pendinginan yang kuat. Alur kerja DNA mungkin memerlukan kondisi lisis dan pemurnian yang berbeda, bergantung pada apakah yang diinginkan adalah DNA genomik utuh atau DNA terfragmentasi.
Jenis plat apa yang sebaiknya digunakan untuk lisis ragi?
Gunakan mikroplat atau plat bersumur dalam yang kompatibel dengan sonikasi dan memiliki penyegelan yang sesuai. Plat berdasar bulat sering berguna untuk penanganan suspensi. Plat harus mampu menahan kondisi sonikasi, suhu sampel, dan langkah sentrifugasi yang dipilih.
Bagaimana saya mengetahui bahwa lisis ragi sudah lengkap?
Efisiensi lisis dapat diperiksa melalui mikroskopi, hasil perolehan protein, aktivitas enzim, penurunan viskositas, analisis SDS-PAGE, hasil perolehan DNA/RNA, atau perbandingan dengan metode lisis yang telah diketahui. Untuk pengembangan metode, evaluasi hasil perolehan dan kualitas molekul target yang dilepaskan.
UIP400MTP atau UIP550MTP: Sonikator Mikroplat Mana yang Sebaiknya Anda Pilih?
UIP400MTP merupakan sonikator mikroplat yang kuat untuk preparasi sampel rutin dengan kapasitas pemrosesan sampel yang tinggi, termasuk lisis ragi, ekstraksi protein, pemotongan DNA dengan gaya geser, pelepasan biofilm, dan preparasi uji. Sonikator ini sesuai untuk laboratorium yang memerlukan sonikasi reproduktif dalam format plat standar.
UIP550MTP memberikan daya ultrasonik yang lebih tinggi dan disarankan ketika aplikasi yang lebih menuntut memerlukan intensitas akustik yang lebih kuat, waktu pemrosesan yang lebih singkat, beban sampel yang lebih tinggi, atau kondisi disrupsi yang lebih kuat. Untuk lisis ragi, UIP550MTP sangat berguna untuk biomassa padat, galur yang sulit dilisis, volume kerja yang lebih besar, dan penapisan ekspresi dengan kapasitas pemrosesan sampel yang tinggi.
Dapatkah lisis ragi dengan sonikasi mikroplat diotomatisasi?
Ya. Sonikasi berbasis mikroplat sangat sesuai untuk alur kerja laboratorium otomatis karena sampel tetap berada dalam format plat. Hal ini mendukung integrasi dengan sistem pemipetan, penanganan plat, sentrifugasi, preparasi uji, dan alur kerja penapisan dengan kapasitas pemrosesan sampel yang tinggi.
Literatur / Referensi
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP550MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics 2024.
