Ուլտրաձայնային ԴՆԹ -ի մասնատում հաջորդ սերնդի հաջորդականության համար

Հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը (NGS) պահանջում է գենոմային ԴՆԹ -ի հուսալի կտրում և մասնատում `գենոմային ԴՆԹ -ի թելերը հաջորդականացնելու և գենոմի գրադարաններ ստեղծելու համար: ԴՆԹ -ի վերահսկվող մասնատումը ԴՆԹ -ի բեկորների մեջ նմուշի պատրաստման կարևոր քայլ է, որը պահանջվում է ԴՆԹ -ի հաջորդականացումից առաջ: Ուլտրաձայնայնությունն ապացուցված է որպես որոշակի երկարության ԴՆԹ -ի մասնատման արդյունավետ և հուսալի տեխնիկա: Ուլտրաձայնային ԴՆԹ -ի մասնատման արձանագրությունները հասնում են վերարտադրելի մասնատման արդյունքների: Hielscher ուլտրաձայնային սարքերն ունակ են արտադրել ԴՆԹ -ի գենոմային բեկորների չափի բաշխման լայն տեսականի, ճշգրիտ վերահսկելի գործառնական պարամետրերի միջոցով: Քանի որ Hielscher- ի ուլտրաձայնային ԴՆԹ -ի խուզման համակարգերը հասանելի են միայնակ և բազմակի սրվակների, ինչպես նաև միկրոշրջանների համար, նմուշի պատրաստումը դառնում է բարձր արդյունավետ:

Տեղեկատվության պահանջ





Ultrasonic DNA fragmentation is frequently used as sample preparation step in Next Generation Sequencing (NGS)

Electrophoretic վերլուծությունները genomic ԴՆԹ E. coli EDL933 ենթարկված 0 - 15 min ultrasonication. L ցույց է տալիս ԴՆԹ սանդուղք. (Basselet et al., 2008):

Ուլտրաձայնային ԴՆԹ -ի մասնատման առավելությունները

  • կրկնվող / վերարտադրվող արդյունքներ
  • ճշգրիտ կարգավորելի `բեկորների որոշակի երկարություն ստանալու համար
  • արագ մշակման գործընթացը
  • ԴՆԹ -ի մասնատման հետևողական արդյունքներ
  • սարքեր ցանկացած նմուշի ծավալների համար (օրինակ ՝ բազմաթիվ սրվակներ կամ միկրոշարներ)
  • բարձր թողունակություն
  • ջերմաստիճանի ճշգրիտ վերահսկում
  • պարզ, օգտագործողի համար հարմար գործողություն

Հաջորդ սերնդի հաջորդականություն. ԴՆԹ-ի ուլտրաձայնային մասնատում գրադարանի պատրաստման համար

Հաջորդ սերնդի հաջորդականացում իրականացնելու համար պետք է կատարվեն (1) գրադարանի պատրաստման, (2) հաջորդականության և (3) տվյալների վերլուծության երեք հիմնական քայլերը: Գրադարանի պատրաստման ընթացքում ԴՆԹ-ն մասնատվում է, այնուհետև բեկորի ծայրերը նորոգվում (հղկվում) `ավելացնելով մեկ ադենինային հիմք, և թիրախային բեկորները վերածվում են երկշղթայական ԴՆԹ-ի: Ի վերջո, այսպես կոչված ադապտերները կցվում են կապի, ՊՇՌ-ի կամ դրոշմավորման միջոցով, որպեսզի գրադարանային ԴՆԹ-ի վերջնական արտադրանքը կարողանա քանակականացվել հաջորդականության համար:
ԴՆԹ -ի մասնատում Sonication- ի միջոցով. Հատկապես այն դեպքում, երբ կարճ ընթերցվող հաջորդականության տեխնոլոգիաները, ինչպիսին է Illumina- ն, որը չի կարող հեշտությամբ կարդալ ավելի երկար ԴՆԹ-ի բեկորներ, ԴՆԹ-ի հիմքերը պետք է մասնատված լինեն որոշակի չափի, որը կարելի է արժանահավատորեն ձեռք բերել ուլտրաձայնային հետազոտության միջոցով:
Ուլտրաձայնայնությունը կարելի է հուսալիորեն օգտագործել ԴՆԹ -ի, ՌՆԹ -ի և քրոմատինի մասնատման համար:

Ինչպե՞ս է աշխատում ուլտրաձայնային ԴՆԹ -ի մասնատումը:

Sonication- ը, որը նաև հայտնի է որպես ակուստիկ նմուշների մշակում, ԴՆԹ -ի մասնատման լայն կիրառվող մեթոդ է: Ուլտրաձայնային ԴՆԹ -ի կտրման համար նմուշները ենթարկվում են ուլտրաձայնային ալիքների `վերահսկվող վիճակում: Ուլտրաձայնային ԴՆԹ -ի մասնատման աշխատանքի սկզբունքը հիմնված է ուլտրաձայնային ալիքների առաջացրած թրթռումների և խոռոչի վրա: Ուլտրաձայնային (ակուստիկ) կավիտացիայի արդյունքում առաջացող կտրող ուժերը կոտրում են բարձր մոլեկուլային քաշով ԴՆԹ մոլեկուլները: Սոնիկացիայի կարգավորումն, ինչպիսիք են ինտենսիվությունը (ամպլիտուդ, տևողություն), պուլսացիոն ռեժիմը և ջերմաստիճանը, թույլ են տալիս ճշգրիտ ԴՆԹ -ի մասնատում մինչև ԴՆԹ բեկորների որոշակի ցանկալի երկարություն: Մինչդեռ ուլտրաձայնային հետազոտության միջոցով հաճախ ԴՆԹ -ն կրճատվում է մինչև 100-600 bp, մինչև 1300 bp երկարությամբ ավելի երկար ԴՆԹ բեկորներ կարելի է ձեռք բերել, երբ կիրառվում են ավելի մեղմ ուլտրաձայնային պայմաններ:

Ultrasonic homogenizers are reliable for DNA shearing

ՉԻՊ -ի ընթացքում ուլտրաձայնային ԴՆԹ -ի կտրում – քրոմատինի immunoprecipitation
Հարմարեցված է Jkwchui- ից CC-BY-SA.03-ի ներքո

DNAերմաստիճանի վերահսկում ԴՆԹ -ի դեգրադացիան կանխելու համար

ԴՆԹ-ի երկշղթայական մոլեկուլային ձևը չափազանց զգայուն է բարձր ջերմաստիճանի նկատմամբ, այնպես որ նմուշի պատրաստման փուլերում ջերմաստիճանի ճշգրիտ վերահսկումը վճռորոշ գործոն է հուսալի վերլուծության արդյունքների համար:
Անկախ նրանից, թե դուք օգտագործում եք Hielscher- ի զոնդի ուլտրաձայնային սարքերը, VialTweeter- ը կամ UIP400MTP- ը – ջերմաստիճանի շարունակական մոնիտորինգը և վերահսկումն ապահովվում է միացվող ջերմաստիճանի տվիչի և խելացի սարքի ծրագրակազմի շնորհիվ: Որոշակի միջակայքում ջերմաստիճանը պահպանելու համար կարող եք սահմանել վերին և ստորին ջերմաստիճանի սահման: Հետևաբար, ուլտրաձայնային հետազոտողը կդադարի, երբ այս ջերմաստիճանի սահմանը գերազանցվի և ինքնաբերաբար կշարունակի ձուլվել, երբ ջերմաստիճանը իջեցվի մի շարք ∆T- ով:
Hielscher ultrasonicators- ի բարդ ծրագրակազմը ապահովում է նմուշի բուժման իդեալական պայմանների հուսալի պահպանումը:

Samանգվածային ԴՆԹ-ի մասնատում UIP400MTP Multi-Well Plate Ultrasonicator- ով

Ultrasonic Multi-Sample Preparation Unit UIP400MTP for multi-well plate sonicationԿյանքի գիտության նմուշների թիվը զգալիորեն աճել է վերջին տասնամյակի ընթացքում: Սա նշանակում է, որ շատ մեծ թվով նմուշներ (օրինակ ՝ 384, 1536 կամ 3456 հորեր մեկ միկրոշրջանի վրա) պետք է մշակվեն նմուշի պատրաստման և վերլուծության ընթացքում `հետևողականորեն հավասար պայմաններում` համադրելի և վավեր արդյունքներ ստանալու համար: UIP400MTP- ով Hielscher Ultrasonics- ը հետևում է զանգվածային նմուշների մշակման միտումին: UIP400MTP- ը ուլտրաձայնային սարք է `միկրոշարների միջոցով նմուշի պատրաստման համար: UIP400MTP- ն կարող է ափսեներ մշակել 6, 12, 24, 48, 96, 384, 1536 կամ 3456 հորերով: Կախված միկրոշրջանի տեսակից ՝ յուրաքանչյուր ջրհոր սովորաբար կարող է պահել նմուշի ծավալները տասնյակ նանոլիտրերից մինչև մի քանի միլիլիտր: Լայնորեն կիրառվում է կենսաբանական հետազոտությունների մեջ, UIP400MTP- ն շատ հաճախ օգտագործվում է նմուշների պատրաստման համար `նախքան անալիզները, ինչպիսիք են` ELISA (ֆերմենտների հետ կապված իմունոսորբենտային անալիզը) կամ PCR- ը, սպիտակուցների վերլուծությունից առաջ, ինչպես նաև քրոմատինի պատրաստման համար մինչև CHiP և CHiP-seq, հիստոնի փոփոխություն: նույնականացում և այլ վերլուծական բուժումներ (օրինակ ՝ գելային էլեկտրոֆորեզ, զանգվածային սպեկտրոմետրիա):

VialTweeter- ը մինչև 10 սրվակ նմուշի պատրաստման համար

Complete VialTweeter setup: VialTweeter sonotrode է ուլտրաձայնային պրոցեսոր UP200StThe VialTweeter- ը լայնորեն կիրառվող լաբորատոր ուլտրաձայնային VialTweeter- ն է, որը թույլ է տալիս արդյունավետ և հարմարավետ սոնիկացիա կատարել մինչև 10 սրվակի միաժամանակ: Քանի որ սրվակները և փորձանոթները (օրինակ ՝ Eppendorf սրվակները, կրիո սրվակները, ցենտրիֆուգայի խողովակները) անուղղակիորեն են սոնիկացվում, ցանկացած խաչաձև աղտոտում խուսափում է: Քանի որ յուրաքանչյուր նմուշին տրվում է նույն ուլտրաձայնային ինտենսիվությունը, սոնիկացիայի բոլոր արդյունքները միատարր են և վերարտադրելի: VialTweeter- ն առաջարկում է բոլոր խելացի հնարավորությունները, ինչպես մեր այլ թվային սարքերը (օրինակ ՝ խելացի մենյու, ծրագրավորվող պարամետրեր, ջերմաստիճանի վերահսկում, հեռակառավարիչ և այլն), որպեսզի ապահովվի օգտագործողի առավելագույն հարմարավետությունը:

Multi-Finger զոնդեր Microwell ափսեների համար

4 probe heads or 4 sonotrodes for simultaneous sonication of 4 samples at the same intensity with the Hielscher 200 watts ultrasonicator models UP200ST and UP200HTԱռկա են UP200Ht և UP200St ուլտրաձայնային զոնդի համասեռացուցիչների համար, 4 կամ 8 մատներով բազմ մատնաչափ զոնդերը միևնույն պայմաններում միաժամանակ մի քանի նմուշ սոնիկացնելու հարմարավետ տարբերակ են: Օրինակ, sonotrode MTP-24-8-96- ը ութ մատով զոնդ է, որն իդեալական է ավտոմատացված համակարգերին ինտեգրվելու կամ բազմահոր սալերի հորերի արդյունավետ ձեռքով նմուշ պատրաստելու համար: Բազմաթեք սոնոտրոդը իդեալական է ավտոմատացված լաբորատորիաների համար, որտեղ մշակվում են հիմնականում բաժակներ և փորձանոթներ `օգտագործելով ստանդարտ ուլտրաձայնային սոնոտրոդ: Մատնաչափ և ստանդարտ զոնդերը կարող են արագ փոխվել մի քանի րոպեի ընթացքում ՝ մեկ զոնդի ուլտրաձայնային սարքը վերածելով ուլտրաձայնային խափանիչի բազմակի զոնդի:

Տեղեկատվության պահանջ





Hielscher ուլտրաձայնային սարքեր ԴՆԹ -ի մասնատման համար

Hielscher Ultrasonics- ն առաջարկում է տարբեր ուլտրաձայնային հարթակներ ԴՆԹ-ի, ՌՆԹ-ի և քրոմատինի մասնատման համար: Այս տարբեր հարթակները ներառում են ուլտրաձայնային զոնդեր (սոնոտրոդներ), անուղղակի ձայնամեկուսիչ լուծույթներ `մի քանի խողովակների կամ բազմահոր սալերի նմուշի պատրաստման համար (օր. ՝ 96 հորատանցք, միկրոիտրիտային թիթեղներ), սոնորեակտորներ և ուլտրաձայնային գավազաններ: ԴՆԹ-ի կտրման բոլոր հարթակները սնուցվում են հաճախականությամբ կարգավորվող, բարձրորակ ուլտրաձայնային պրոցեսորներով, որոնք ճշգրիտ վերահսկելի են և տալիս են վերարտադրելի արդյունքներ:

Ուլտրաձայնային պրոցեսորներ ցանկացած նմուշի և չափի համար

Hielscher- ի բազմալեզու ուլտրաձայնային սարքերով VialTweeter (մինչև 10 փորձնական խողովակների համար) և UIP400MTP- ով (միկրոշրջանների/ բազմաշերտ թիթեղների համար) հեշտությամբ հնարավոր է դառնում նվազեցնել նմուշի մշակման ժամանակը `ինտենսիվ և ճշգրիտ վերահսկելի ուլտրաձայնային հետազոտության շնորհիվ` միաժամանակ ստանալով ԴՆԹ-ի բեկորների չափի բաշխումը և բերքատվությունը: . Ուլտրաձայնային ԴՆԹ -ի մասնատումը նմուշի պատրաստումը դարձնում է արդյունավետ, հուսալի և մասշտաբելի: Արձանագրությունները կարող են գծային կերպով ընդլայնվել մեկից մինչև բազմաթիվ նմուշներ ՝ կիրառելով անընդհատ վերահսկվող ուլտրաձայնային հետազոտություն:
Մեկից հինգ մատներով ուլտրաձայնային հետազոտիչները իդեալական են փոքր ընտրանքային թվերի պատրաստման համար: Hielscher- ի լաբորատոր ուլտրաձայնային սարքերը հասանելի են տարբեր չափերի, որպեսզի մենք կարողանանք ձեզ խորհուրդ տալ իդեալական սարք `ձեր կիրառման և պահանջների համար:

ճշգրիտ գործընթացը հսկող

Hielscher ultrasonicators can be remotely controlled via browser control. Sonication parameters can be monitored and adjusted precisely to the process requirements.Սոնիկացիայի ճշգրիտ վերահսկելի կարգավորումները վճռորոշ նշանակություն ունեն, քանի որ սպառիչ սոնֆիկացիան կարող է ոչնչացնել ԴՆԹ -ն, ՌՆԹ -ն և քրոմատինը, սակայն ուլտրաձայնային կտրվածքի անբավարար արդյունքը հանգեցնում է ԴՆԹ -ի և քրոմատինի չափազանց երկար բեկորների: Hielscher- ի թվային ուլտրաձայնային սարքերը կարելի է հեշտությամբ սահմանել ճշգրիտ ձայնամեկուսացման պարամետր: Ձայնայնացման հատուկ կարգավորումները կարող են պահպանվել նաև որպես ծրագրավորված կարգավորում ՝ նույն ընթացակարգի արագ կրկնության համար:
Բոլոր ձայնագրությունները ինքնաբերաբար պրոտոկոլացվում են և պահվում են որպես CSV ֆայլ ՝ ներկառուցված SD քարտի վրա: Սա թույլ է տալիս ճշգրիտ փաստաթղթավորել կատարված փորձարկումները և հնարավորություն է տալիս հեշտությամբ վերանայել ձայնագրման աշխատանքները:
Browserննարկչի հեռակառավարման վահանակի միջոցով բոլոր թվային ուլտրաձայնային սարքերը կարող են գործարկվել և վերահսկվել ցանկացած ստանդարտ բրաուզերի միջոցով: Լրացուցիչ ծրագրաշարի տեղադրում չի պահանջվում, քանի որ LAN կապը թույլ է տալիս շատ պարզ plug-n-play կարգավորում:

Ուլտրաձայնային նմուշի պատրաստման ամենաբարձր օգտագործողի բարեկամականությունը

Բոլոր Hielscher ուլտրաձայնային սարքերը նախագծված են բարձրորակ ուլտրաձայնային հետազոտություն իրականացնելու համար, միևնույն ժամանակ միշտ լինելով շատ օգտագործողի համար հարմար և հեշտ աշխատելի: Բոլոր պարամետրերը լավ կառուցված են հստակ ընտրացանկում, որը հեշտությամբ հասանելի է գունավոր հպման էկրանով կամ դիտարկիչի հեռակառավարմամբ: Խելացի ծրագրաշարը `ծրագրավորվող պարամետրերով և տվյալների ավտոմատ գրանցմամբ, ապահովում է ձայնայնացման օպտիմալ կարգավորումներ` հուսալի և վերարտադրելի արդյունքների համար: Մաքուր և հեշտ օգտագործվող ընտրացանկի միջերեսը Hielscher ուլտրաձայնային սարքերը վերածում է օգտագործողի համար հարմար և արդյունավետ սարքերի:
Ստորև բերված աղյուսակը ցույց է տալիս մեր լաբորատոր ուլտրաձայնային սարքերի մոտավոր մշակման կարողությունը, որոնք իդեալական են նմուշների պատրաստման առաջադրանքների համար, ինչպիսիք են ԴՆԹ -ն և ՌՆԹ -ն մասնատումը, բջիջների լիզը, ինչպես նաև սպիտակուցների արդյունահանումը.

սարք Հզորությունը [Վտ] Տիպ Ծավալը [մլ]
UIP400MTP 400 միկրոշրջանների համար 6 – 3456 հորեր
VialTweeter- ը 200 մինչև 10 սրվակ գումարած սեղմիչ հնարավորության դեպքում 05 – 1.5
UP50H- ը 50 Probe տիպի 0.01 – 250
UP100H 100 Probe տիպի 0.01 – 500
Uf200 ः տ 200 Probe տիպի 01 – 1000
UP200St 200 Probe տիպի 01 – 1000
UP400St 400 Probe տիպի 5.0 – 2000 թ
Cuphorn 200 Գավաթակիր, գորգագործ 10 – 200
GDmini2 200 աղտոտման ազատ հոսքի բջիջ

Կապ մեզ հետ | / Հարցրեք մեզ!

Հարցրեք ավելին

Խնդրում ենք օգտագործել ստորև բերված ձևը `ուլտրաձայնային պրոցեսորների, ծրագրերի և գնի վերաբերյալ լրացուցիչ տեղեկություններ ստանալու համար: Մենք ուրախ կլինենք ձեզ հետ քննարկել ձեր գործընթացը և առաջարկել ձեզ ուլտրաձայնային համակարգ, որը բավարարում է ձեր պահանջները:









Խնդրում ենք նկատի ունենալ մեր Գաղտնիության քաղաքականություն,


The VialTweeter is a MultiSample Ultraonicator that allows for reliable sample preparation under precisely controlled temperature conditions.

Ուլտրաձայնային բազմաքանակ նմուշի պատրաստման միավոր VialTweeter- ը թույլ է տալիս միաժամանակյա sonication մինչև 10 սրվակի: Ամրացուցիչ սարքի VialPress- ի միջոցով կարող է սեղմվել մինչև 4 լրացուցիչ խողովակ `ինտենսիվ ձայնազերծման համար:


Sonotrode MTP-24-8-96- ը ունի ութ ուլտրաձայնային զոնդ `միկրոտիտր ափսեների հորերի sonication- ի համար:

Sonotrode MTP-24-8-96- ը ունի ութ ուլտրաձայնային զոնդ `միկրոտիտր ափսեների հորերի sonication- ի համար:



Գրականություն / Հղումներ

Փաստեր Worth Իմանալով

Ի՞նչ է հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը:

Հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը, ինչպես նաև հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը (NGS), բարձր թողունակությամբ հաջորդականությունը կամ երկրորդ սերնդի հաջորդականությունը, վերաբերում է զանգվածային զուգահեռ հաջորդականության հաջորդող մոտեցմանը, որտեղ զուգահեռաբար միաժամանակ հաջորդականացվում են միլիոնավոր բեկորների ԴՆԹ-ի շատ մեծ (զանգվածային) քանակներ: մեկ վազքի համար:
Հաջորդ սերնդի հաջորդականացում իրականացնելու համար պետք է կատարվեն (1) գրադարանի պատրաստման, (2) հաջորդականության և (3) տվյալների վերլուծության երեք հիմնական քայլերը: Գրադարանի պատրաստման ընթացքում ԴՆԹ -ի տողերը պետք է մասնատված լինեն որոշակի երկարության ԴՆԹ -ի բեկորների: Sonication- ը ԴՆԹ -ի մասնատման նախընտրելի մեթոդներից մեկն է:
ԴՆԹ -ի հաջորդականության գործընթացում ԴՆԹ -ում նուկլեոտիդների կարգը – հայտնի է որպես նուկլեինաթթվի հաջորդականություն - որոշվում է: Նուկլեինաթթվի հաջորդականությունը կազմված է չորս նուկլեոտիդային հիմքերից ՝ ադենին, ցիտոզին, գուանին, թիմին – տեղեկատվության ո՞ր ծածկագիրն է:
Հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը առաջ է մղում կենսաբանական և անհատականացված բժշկության հետազոտությունները, քանի որ ԴՆԹ-ի և ՌՆԹ-ի հաջորդականությունը մեծապես օգտագործվում են գենոմային հետազոտությունների, քաղցկեղի հետազոտությունների, հազվագյուտ և բարդ հիվանդությունների հետազոտությունների, մանրէաբանական հետազոտությունների, ագրիգենոմիկայի և շատ այլ հետազոտական ոլորտներում:

Հաջորդ սերնդի հաջորդականություն ընդդեմ Sanger հաջորդականության

Մինչ հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը (NGS) հնարավոր է հաջորդականացնել զանգվածային թվով գենոմային նմուշներ, Sanger Sequencing- ը (հայտնի է նաև որպես շղթայի դադարեցման մեթոդ կամ Առաջին սերնդի հաջորդականություն) ունի միայն փոքր նմուշների թվեր հաջորդականացնելու ունակություն: Սենգերի հաջորդականությունը միայն ԴՆԹ -ի մեկ հատվածի հաջորդականությունն է միաժամանակ և կարող է իրականացվել մեկ օրվա ընթացքում: Իր ճշգրտության պատճառով Sanger հաջորդականությունը համարվում է նաև ոսկու ստանդարտ տեխնոլոգիա, որն օգտագործվում է Հաջորդ սերնդի հաջորդականությամբ ստացված արդյունքների ստուգման համար:
Sanger- ի հաջորդականությունը հասնում է մոտ 800bp ընթերցման երկարության (սովորաբար 500-600bp ոչ հարստացված ԴՆԹ-ով): Sanger- ի հաջորդականությամբ ընթերցման ավելի երկար տևողությունները զգալի առավելություններ են տալիս հաջորդականության հաջորդ մեթոդների նկատմամբ, հատկապես գենոմի կրկնվող շրջանների հաջորդականացման առումով: Կարճ ընթերցված հաջորդականության տվյալների մարտահրավերը հատկապես խնդիր է նոր գենոմների հաջորդականությունը (de novo) և գերադասված գենոմի հատվածների հաջորդականությունը, որոնք սովորաբար հանդիպում են քաղցկեղի գենոմների կամ քրոմոսոմների այն շրջաններում, որոնք ցուցադրում են կառուցվածքային տատանումներ: [նշ. Մորոզովան և Մառրան, 2008]


High performance ultrasonics! Hielscher's product range covers the full spectrum from the compact lab ultrasonicator over bench-top units to full-industrial ultrasonic systems.

Hielscher Ultrasonics- ը արտադրում է բարձրորակ ուլտրաձայնային հոմոգենացնողներից ` Լաբորատորիա դեպի արդյունաբերական չափը