تحقیقات میکروبیوم و تجزیه و تحلیل بالینی ساده توسط فراصوت
فراصوت یک تکنیک قدرتمند است که به طور گسترده ای در تحقیقات میکروبیوم و تجزیه و تحلیل بالینی استفاده می شود و آماده سازی نمونه با توان بالا را تسهیل می کند. روش اولتراسونیک به ویژه برای پردازش نمونه های بیولوژیکی پیچیده، مانند نمونه های حاوی میکروارگانیسم ها موثر است. استفاده از فراصوت تسهیل لیز سلول, استخراج و تجزیه و تحلیل اسیدهای نوکلئیک, پروتئین, و متابولیت ها, امکان درک عمیق تر از جوامع میکروبی و نقش خود را در سلامت و بیماری. Hielscher با توان بالا فراصوت برای دقت, بهره وری, و نتایج تکرارپذیر خود را مشهور, و آنها را به یک انتخاب عالی برای مطالعات میکروبیوم.
استفاده از فراصوت با توان بالا در تحقیقات میکروبیوم
سونیکاتور صفحه 96 چاه UIP400MTP تحقیقات میکروبیوم را با آماده سازی نمونه با توان بالا ساده می کند
آماده سازی نمونه با توان بالا با سونیکاتور صفحه 96 چاهی UIP400MTP
کاربردهای فراصوت در تحقیقات میکروبیوم
لیز سلولی کارآمد
فراصوت در لیز کردن سلول های میکروبی، از جمله سلول های دارای دیواره سلولی سخت، مانند باکتری ها و قارچ های گرم مثبت بسیار موثر است. امواج اولتراسونیک حباب های حفره ای را در نمونه تولید می کنند که فرو می ریزند و امواج شوک ایجاد می کنند که دیواره ها و غشاهای سلولی را باز می کند. این فرآیند اختلال جامع سلولی و انتشار کارآمد محتویات داخل سلولی مانند DNA، RNA و پروتئین ها را تضمین می کند.
تکه تکه شدن DNA کنترل شده
برای کاربردهایی مانند توالی یابی نسل بعدی، اغلب لازم است DNA را به قطعات کوچکتر و یکنواخت برش دهید. فراصوت کنترل دقیقی بر روند تکه تکه شدن فراهم می کند و به محققان اجازه می دهد تا قطعات DNA را با اندازه دلخواه به دست آورند. این کنترل برای آماده سازی کتابخانه های توالی یابی و اطمینان از داده های توالی با کیفیت بالا بسیار مهم است.
همگن سازی نمونه پیشرفته
در تحقیقات میکروبیوم، نمونه ها اغلب حاوی ترکیب متنوعی از میکروارگانیسم ها هستند. فراصوت به دستیابی به توزیع یکنواخت این میکروارگانیسم ها در نمونه کمک می کند و نتایج سازگار و قابل تکرار را تضمین می کند. این همگن سازی برای تجزیه و تحلیل کمی دقیق، مانند تعیین فراوانی میکروبی یا اندازه گیری فعالیت های متابولیکی خاص بسیار مهم است.
استخراج متابولیت قابل اعتماد
استخراج متابولیت قابل اعتماد توسط فراصوت یک تکنیک به طور گسترده ای در متابولومیک برای جداسازی مولکول های کوچک از نمونه های بیولوژیکی است. فراصوت از ارتعاشات مکانیکی استفاده می کند که غشای سلولی را مختل می کند و انتشار متابولیت های داخل سلولی را به یک حلال تسهیل می کند. این روش کارآمد، تکرارپذیر و سازگار با انواع نمونه است و آن را به ابزاری ارزشمند برای مطالعات متابولومیک با توان عملیاتی بالا و هدفمند تبدیل می کند. اطلاعات بیشتر در مورد استخراج متابولیت مافوق صوت!
“من می نویسم تا از شما برای تجربه فوق العاده ما با استفاده از سونیکاتور UIP400MTP شما برای لیز باکتریایی یکنواخت و سازگار نمونه های میکروبیوم مدفوع تشکر کنم. ما در حال فشار دادن پاکت برای فناوری لیز با توان بالا هستیم و ابزار شما برای این کار مناسب است. برخی از نکات کلیدی عبارتند از:
- سهولت کار - استفاده از ابزار آسان است و سفارشی سازی با استفاده از گزینه های منو ساده است
- توان عملیاتی بالا - عالی برای جابجایی صفحات ، با 96 نمونه در یک زمان
- حتی فراصوت از تمام عروق- دستگاه قادر به ارائه همان مقدار فراصوت به تمام چاه ها بود, که برای برنامه ما بسیار مهم بود
- پشتیبانی از تیم Hielscher - پشتیبانی عالی بود ، شما همیشه در آموزش در کنار ما بودید ، برای پاسخ به سوالات ما و رسیدگی به مشکلات ، با پیشنهاداتی که به ما کمک کرد تا به هدف خود برسیم.
باز هم از کمک و کمک شما در حالی که برای بهینه سازی پروتکل های خود تلاش می کردیم سپاسگزاریم.”
مارک دی دریسکول ، دکتری – مدیر ارشد علمی – اینتوس علوم زیستی
چگونه فراصوت در تحقیقات میکروبیوم و تشخیص کاربرد دارد؟
متابولومیک ها، متاژنومیک ها و متاپروتئومیکس در تحقیقات میکروبیوم در هم تنیده شده اند زیرا در مجموع درک جامعی از جوامع میکروبی و عملکرد آنها ارائه می دهند. لیز، تصفیه پروتئین و تکه تکه شدن DNA / RNA مراحل ضروری آماده سازی نمونه است که با استفاده از UIP400MTP سونیکاتور صفحه 96 چاهی ساده می شوند.
متابولومیک و تجزیه و تحلیل متابولوم
متابولومیک شامل مطالعه سیستماتیک متابولیت های مولکول کوچک در یک سیستم بیولوژیکی است. در تحقیقات میکروبیوم, فراصوت استفاده می شود به لیز سلول های میکروبی, آزاد متابولیت های داخل سلولی. تعداد نمونه های بالا را می توان به سرعت با استفاده از UIP400MTP سونیکاتور صفحه 96 چاهی پردازش کرد. سپس متابولیت های استخراج شده با استفاده از تکنیک های پیشرفته ای مانند طیف سنجی جرمی (MS) و طیف سنجی تشدید مغناطیسی هسته ای (NMR) کمی سازی می شوند. داده های به دست آمده تصویری از وضعیت متابولیک میکروبیوم ارائه می دهد و بینش هایی را در مورد فعالیت های بیوشیمیایی و فعل و انفعالات در جوامع میکروبی نشان می دهد.
متاژنومیک و متاترانسکریپتومیکس
متاژنومیک شامل تجزیه و تحلیل جامع مواد ژنتیکی است که مستقیما از نمونه های محیطی بازیابی می شود. فراصوت نقش مهمی در این فرآیند با لیز کردن سلول های میکروبی برای استخراج DNA با کیفیت بالا ایفا می کند، که سپس برای شناسایی و تعیین کمیت گونه های میکروبی موجود توالی یابی می شود. در metatranscriptomics، RNA با استفاده از روش های فراصوت مشابه برای مطالعه پروفایل های بیان ژن در جوامع مختلف میکروبی استخراج می شود. برای توالی یابی DNA و RNA، اسیدهای نوکلئیک باید به طول جفت پایه مشخصی تکه تکه شوند. همه این وظایف به طور قابل اعتماد و سریع توسط UIP400MTP سونیکاتور با توان بالا انجام!
پروتئومیکس
تجزیه و تحلیل پروتئومیک نیاز به استخراج پروتئین از سلول های میکروبی دارد. فراصوت به طور موثر برای مختل کردن سلول ها استفاده می شود و پروتئین ها را به محلول آزاد می کند. سپس این پروتئین ها را می توان خالص و تجزیه و تحلیل کرد تا نقش عملکردی آنها در میکروبیوم و دخالت آنها در مسیرهای متابولیکی را درک کند. با UIP400MTP چند چاه صفحه فراصوت، شما می توانید کار لیز و استخراج پروتئین در عرض چند دقیقه انجام دهید و نتایج قابل تکرار را برای به دست آوردن بینش در مورد فرآیندهای بیولوژیکی هدایت شده توسط پروتئین ها در جوامع میکروبی ایجاد کنید.
متاپروتئومیکس
Metaproteomics تجزیه و تحلیل پروتئومیک را به کل جوامع میکروبی گسترش می دهد و محتوای پروتئین جمعی را برای درک بیان عملکردی و فعل و انفعالات درون میکروبیوم مطالعه می کند. فراصوت استفاده می شود به لیز سلول, آزاد پروتئین است که پس از آن خالص و تجزیه و تحلیل از طریق تکنیک هایی مانند طیف سنجی جرمی. این رویکرد بینش دقیقی در مورد فرآیندهای بیولوژیکی فعال و سازگاری جوامع میکروبی در محیط های مختلف ارائه می دهد.
استفاده از ظرفیت پردازش با توان بالا از UIP400MTP چند چاه صفحه فراصوت و تسهیل تحقیق و تجزیه و تحلیل میکروبیوم خود را!
UIP400MTP سونیکاتور با توان بالا برای تحقیقات میکروبیوم در صفحات چند چاه, صفحات 96 چاهی, لوله ها و ظروف پتری.
UIP400MTP Multiwell Plate Sonicator برای آماده سازی نمونه با توان بالا در تشخیص میکروبیوم.
UIP400MTP فراصوت صفحه چند چاه آماده سازی نمونه با توان بالا را تسهیل می کند، به عنوان مثال در تحقیقات میکروبیوم و تشخیص.
UIP400MTP سونیکاتور صفحه 96 چاه: مایع انتقال سونوگرافی تمام چاه ها را احاطه کرده و فراصوت یکنواخت هر نمونه را فراهم می کند
ویژگی های کلیدی UIP400MTP چند چاه صفحه Sonicator
| فراصوت با توان بالا | کاملا مناسب برای 96 چاه و دیگر صفحات چند چاه، UIP400MTP اجازه می دهد تا برای فراصوت همزمان و یکسان از نمونه های متعدد، به طور قابل توجهی کوتاه مدت زمان آماده سازی نمونه و افزایش توان آزمایش تعداد نمونه بالا. |
| از صفحه چند چاهی مورد نظر خود استفاده کنید | UIP400MTP طراحی شده است برای فراصوت هر صفحه چند چاه استاندارد، صفحات PCR، و یا صفحات میکروتیتر. شما مناسب ترین صفحه را برای آزمایش های خود انتخاب می کنید. از آنجایی که UIP400MTP به مواد مصرفی اختصاصی نیاز ندارد، این باعث صرفه جویی زیادی در هزینه شما می شود! |
| اولتراسونیک غیر تماسی | Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP سونوگرافی شدید را بدون قرار دادن چیزی در نمونه اعمال می کند. شما می توانید صفحات چند چاهی ealed ، عروق بسته و ویال ها را فراصوت کنید. Hielscher شما دارندگان نمونه سفارشی را برای هر ویال یا ظروف غیر استاندارد عرضه می کند. |
| دقت و کنترل | کنترل دقیق و نرم افزار هوشمند به شما امکان می دهد پارامترهای اولتراسونیک را متناسب با نیازهای پردازش خاص خود به طور بهینه تنظیم کنید. شما حداکثر کارایی فراصوت و اثربخشی را برای هر آزمایش دریافت می کنید. |
| کنترل دما | دمای خاصی را برای فراصوت خود تنظیم کنید. سونیکاتور صفحه UIP400MTP می تواند دمای نمونه را کنترل کرده و بر این اساس فراصوت را تنظیم کند. یک مایع خنک کننده چرخشی هر چاه را در صفحه برای کنترل دقیق دما سرد می کند. |
| پروتکل سازی و کنترل از راه دور | هر فراصوت اجرا را می توان از یک کامپیوتر کنترل. نیازی به نصب نرم افزار نیست. می توانید از مرورگر استاندارد خود (مانند کروم، فایرفاکس، اج یا سافاری) در هر سیستم عاملی (مانند MacOS، Windows، Android، iOS یا Linux) برای کنترل و نظارت بر UIP400MTP از راه دور استفاده کنید. هر اجرای فراصوت تولید یک پروتکل فراصوت دقیق برای ارزیابی و مستندسازی. فایل پروتکل در قالب CSV غیر اختصاصی است که می توانید آن را با برنامه دلخواه خود باز کنید، به عنوان مثال Microsoft Excel، Apple Numbers یا OpenOffice Calc. |
| قوی و قابل اعتماد | این UIP400MTP که در آلمان با بالاترین استانداردهای کیفیت طراحی و ساخته شده است، نه تنها قدرتمند است، بلکه به طور قابل توجهی بادوام است. طراحی آن استانداردهای صنعتی را برآورده می کند و به راحتی در برابر سختی های استفاده روزانه در یک محیط آزمایشگاهی سخت مقاومت می کند. شما می توانید از UIP400MTP به طور مداوم 24 ساعت و 7 روز هفته در عملیات با توان بالا استفاده کنید. |
- راندمان بالا
- تکنولوژی روز
- قابلیت اطمینان & نیرومندی
- کنترل فرآیند قابل تنظیم و دقیق
- نرم افزار هوشمند
- ویژگی های هوشمند (به عنوان مثال، قابل برنامه ریزی، پروتکل داده ها، کنترل از راه دور)
- آسان و ایمن برای کار
- تعمیر و نگهداری کم
- CIP (تمیز کردن در محل)
طراحی، ساخت و مشاوره – کیفیت ساخت آلمان
مافوق صوت Hielscher به خوبی برای بالاترین کیفیت و استانداردهای طراحی خود را شناخته شده. استحکام و بهره برداری آسان اجازه می دهد تا ادغام صاف از ultrasonicators ما به امکانات صنعتی. شرایط خشن و محیط های خواستار به راحتی توسط مافوق صوت Hielscher رسیده.
Hielscher اولتراسونیک یک شرکت دارای گواهینامه ISO است و تاکید ویژه ای بر مافوق صوت با کارایی بالا با ویژگی های دولت از هنر فن آوری و کاربر پسند قرار داده است. البته، مافوق صوت Hielscher مطابق با CE و دیدار با الزامات UL، CSA و RoHs.
UIP400MTP صوتی بدون تماس برای تهیه نمونه میکروبیوم در صفحات چند چاه.
ادبیات / منابع
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- InfoGraphic UIP400MTP – 96-well plate Ultrasonicator for High-Throughput Sample Prep – english – Hielscher Ultrasonics
- Jannike L. Krause, Sven-Bastiaan Haange, Stephanie S. Schäpe, Beatrice Engelmann, Ulrike Rolle-Kampczyk, Katarina Fritz-Wallace, Zhipeng Wang, Nico Jehmlich, Dominique Türkowsky, Kristin Schubert, Judith Pöppe, Katrin Bote, Uwe Rösler, Gunda Herberth, Martin von Bergen (2020): The glyphosate formulation Roundup® LB plus influences the global metabolome of pig gut microbiota in vitro. Science of The Total Environment, Volume 745, 2020.
- Tröscher-Mußotter, Johanna; Sáenz, Johan; Grindler, Sandra; Meyer, Jennifer; Kononov, Susanne; Mezger, Beate; Borda, Daniel; Frahm, Jana; Dänicke, Sven; Camarinha-Silva, Amelia; Huber, Korinna; Seifert, Jana (2021): Microbiome Clusters Disclose Physiologic Variances in Dairy Cows Challenged by Calving and Lipopolysaccharides. mSystems 2021.
- Jannike Lea Krause, Beatrice Engelmann, Stephanie Serena Schaepe, Ulrike Rolle-Kampczyk, Nico Jehmlich, Hyun-Dong Chang, Ulla Slanina, Maximillian Hoffman, Jörg Lehmann, Ana Claudia Zenclussen, Gunda Herberth, Martin von Bergen, Sven-Bastiaan Haange (2024): DSS treatment does not affect murine colonic microbiota in absence of thehost. Gut Microbes 2024.
سوالات متداول در مورد تحقیقات میکروبیوم
فراصوت با باکتری ها چه می کند؟
فراصوت سلول های باکتریایی را با استفاده از امواج صوتی با فرکانس بالا مختل می کند و باعث کاویتاسیون می شود که امواج شوک و نیروهای مکانیکی تولید می کند و منجر به لیز سلولی و آزاد شدن محتویات داخل سلولی می شود.
برای مطالعه میکروبیوم ها از چه روش هایی استفاده می شود؟
روش های مطالعه میکروبیوم ها شامل تکنیک های توالی یابی DNA مانند توالی یابی ژن 16S rRNA و متاژنومیک و همچنین رونوشت، پروتئومیکس و متابولومیک برای تجزیه و تحلیل عملکردها و فعل و انفعالات میکروبی است. ابزارهای بیوانفورماتیک برای تفسیر داده های گسترده تولید شده استفاده می شوند.
تکنیک های مورد استفاده در تجزیه و تحلیل میکروبیوم چیست؟
تکنیک های مورد استفاده در تجزیه و تحلیل میکروبیوم شامل توالی یابی ژن 16S rRNA برای پروفایل طبقه بندی، توالی یابی متاژنومیک برای تجزیه و تحلیل ژنتیکی جامع، متاترانسکریپتومیکس برای مطالعه بیان ژن، متاپروتئومیکس برای تجزیه و تحلیل پروتئین ها و متابولومیک برای شناسایی محصولات متابولیک است. ابزارهای بیوانفورماتیک برای پردازش و تفسیر داده ها ضروری هستند.
متابولومیکس، متاژنومیک و متاپترومیکس در تحقیقات میکروبیوم چیست؟
در تحقیقات میکروبیوم، متابولومیک مولکول ها و متابولیت های کوچک تولید شده توسط میکروب ها را تجزیه و تحلیل می کند و بینش هایی در مورد فعالیت های متابولیکی آنها ارائه می دهد. متاژنومیک شامل توالی یابی ژنوم جمعی جوامع میکروبی برای درک ترکیب ژنتیکی و پتانسیل عملکردی آنها است. Metaproteomics کل محتوای پروتئین یک میکروبیوم را مطالعه می کند و بیان عملکردی ژن ها و نقش پروتئین ها را در جامعه میکروبی نشان می دهد.
کلنی های باکتریایی در تحقیقات میکروبیوم چیست؟
کلنی های باکتریایی در تحقیقات میکروبیوم گروه هایی از باکتری ها هستند که از یک یا چند سلول روی یک محیط رشد جامد رشد می کنند و خوشه های قابل مشاهده ای را تشکیل می دهند. این کلنی ها نشان دهنده جمعیت های کلونال هستند که برای مطالعه ویژگی ها، تنوع و عملکرد سویه های باکتریایی خاص در یک جامعه میکروبی استفاده می شوند.
Hielscher مافوق صوت تولید کننده هموژنایزرهای مافوق صوت با کارایی بالا از ازمایشگاه ها تا اندازه صنعتی.