متابولومیک تسهیل شده توسط فراصوت با توان بالا
متابولومیک حوزه تحقیقاتی است که از تکنیک های با توان عملیاتی بالا برای توصیف و تعیین کمیت مولکول های کوچک در سیالات زیستی مختلف مانند ادرار، سرم، پلاسما، مدفوع و بزاق استفاده می کند و از امضاهای متابولیکی منحصر به فردی پرده برداری می کند. UIP400MTP فراصوت با توان عملیاتی بالا، طراحی شده برای صفحات چند چاه، ابزاری قدرتمند برای لیز کردن سلول ها در این نمونه ها است، تسهیل انتشار متابولیت ها برای تجزیه و تحلیل پایین دست. این رویکرد دقیق و قابل اعتماد برای متابولومیک ضروری است، جایی که طراحی دقیق مطالعه، آماده سازی دقیق نمونه، راه اندازی پلت فرم بهینه، تجزیه و تحلیل جامع داده ها و تفسیر بیولوژیکی معنی دار از اهمیت بالایی برخوردار است. متابولومیک از هر دو رویکرد هدفمند استفاده می کند که بر کلاس های خاصی از مولکول ها مانند کربوهیدرات ها، لیپیدها و اسیدهای آمینه تمرکز دارد و تکنیک های غیر هدفمند که نمای کلی گسترده ای از پروفایل های متابولیک درون یک نمونه را ارائه می دهد و پیچیدگی پیچیده سیگنالینگ متابولیک را آشکار می کند.
این UIP400MTP یک ماسونیک بدون تماس و با توان بالا برای لیز سلولی و استخراج متابولیت در صفحات چند چاه است
آماده سازی نمونه با توان بالا با سونیکاتور صفحه 96 چاهی UIP400MTP
با استفاده از UIP400MTP فراصوت غیر تماسی در ترکیب با صفحات 96 چاه یک روش کارآمد برای همگن سازی با توان بالا و استخراج متابولیت است. این تنظیم از تماس مستقیم با نمونه جلوگیری می کند و خطر آلودگی متقابل را در حین پردازش چندین نمونه به طور همزمان کاهش می دهد.
پروتکل گام به گام برای همگن سازی با UIP400MTP سونیکاتور 96 چاه
- تهیه نمونه های متابولومیک
قرار دادن نمونه: هر نمونه (به عنوان مثال، مدفوع، بافت روده یا محتویات لومینال) را در چاه های جداگانه یک صفحه 96 چاهی یا میکروپلیت پخش کنید.
حلال: حلال های آلی مانند متانول، اتانول، استونیتریل ، کلروفرم و مخلوط (آبی) آنها برای استخراج متابولیت ضروری هستند و به آزاد شدن متابولیت های داخل سلولی از ماتریکس سلولی کمک می کنند. از 100-300 میکرولیتر حلال در هر چاه استفاده کنید و از حجم کافی برای غوطه ور شدن کامل نمونه اطمینان حاصل کنید.
استانداردهای داخلی: به صورت اختیاری، استانداردهای داخلی را به هر چاه برای نرمال سازی در طول تجزیه و تحلیل متابولومیک پایین دست اضافه کنید. - راه اندازی متوسط کوپلینگ
سطح آب: محل صفحه 96well بر روی پلت فرم فراصوت پر شده با آب (محیط کوپلینگ) همانطور که در کتابچه راهنمای کاربر توضیح داده شده است. - پیکربندی پارامتر UIP400MTP
تنظیمات برق: دامنه اولتراسونیک را به 50-80٪ حداکثر توان برای همگن سازی کارآمد تنظیم کنید.
حالت پالس: تنظیم چرخه فراصوت به پالس های متناوب (به عنوان مثال، 30 ثانیه روشن، 30 ثانیه خاموش) اجازه می دهد برای خنک شدن و جلوگیری از گرم شدن بیش از حد نمونه.
زمان کل: 4-10 دقیقه، بسته به پیچیدگی و چقرمگی نمونه.
کنترل دما: استفاده از چیلر آزمایشگاه برای حفظ آب در 4-8 درجه سانتیگراد در طول فراصوت برای محافظت از متابولیت های حساس به حرارت. - فرایند فراصوت
شروع UIP400MTP برای چرخه فراصوت.
فرآیند را از طریق رابط UIP400MTP نظارت کنید.
اثر کاویتاسیون نمونه ها و سلول های لیز را در چاه ها همگن می کند و متابولیت های داخل سلولی را در حلال آزاد می کند. - PostSonication
سانتریفیوژ: پس از فراصوت ، در صورت نیاز محتویات صفحه را به لوله های جمع آوری منتقل کنید. سانتریفیوژ در دمای 4000-6000 × گرم به مدت 10 دقیقه برای گلوله کردن زباله های نامحلول و مواد سلولی.
مجموعه مایع رویی: مایع رویی را با دقت از هر چاه به لوله ها یا صفحات جدید برای تجزیه و تحلیل منتقل کنید.
خشک کردن اختیاری: مایع رویی خشک با استفاده از یک متمرکز کننده خلاء (به عنوان مثال، SpeedVac) در صورت نیاز به غلظت، سپس در حجم کمی از حلال مناسب بازسازی کنید.
استفاده از ظرفیت پردازش با توان بالا از UIP400MTP چند چاه صفحه فراصوت و تسهیل تحقیقات و تجزیه و تحلیل متابولوم خود را!
UIP400MTP سونیکاتور با توان بالا برای تحقیقات متابولومیک در صفحات چند چاه، صفحات 96 چاهی، لوله ها و ظروف پتری.
UIP400MTP Multiwell Plate Sonicator برای آماده سازی نمونه با توان عملیاتی بالا در تحقیقات متابولومی.
اصل فراصوت غیر تماسی با UIP400MTP
این UIP400MTP امواج اولتراسونیک را به چاه های یک صفحه 96 چاهی به طور غیرمستقیم از طریق یک محیط اتصال (به عنوان مثال، آب) اعمال می کند. این امواج ایجاد حفره ، که سلول ها را مختل می کند و متابولیت ها را بدون تماس فیزیکی بین پروب فراصوت و نمونه آزاد می کند.
“من می نویسم تا از شما برای تجربه فوق العاده ما با استفاده از سونیکاتور UIP400MTP شما برای لیز باکتریایی یکنواخت و سازگار نمونه های میکروبیوم مدفوع تشکر کنم. ما در حال فشار دادن پاکت برای فناوری لیز با توان بالا هستیم و ابزار شما برای این کار مناسب است. برخی از نکات کلیدی عبارتند از:
- سهولت کار – استفاده از ابزار آسان است و سفارشی سازی با استفاده از گزینه های منو ساده است
- توان عملیاتی بالا – عالی برای جابجایی صفحات، با 96 نمونه در یک زمان
- حتی فراصوت از تمام عروق – این دستگاه قادر به ارائه همان مقدار فراصوت به تمام چاه ها بود که برای برنامه ما بسیار مهم بود
- پشتیبانی از تیم Hielscher – پشتیبانی عالی بود، شما همیشه در تمرینات در کنار ما بودید، برای پاسخگویی به سوالات ما و رفع مشکلات، با پیشنهاداتی که به ما کمک کرد تا به هدفمان برسیم.
باز هم از کمک و کمک شما در حالی که برای بهینه سازی پروتکل های خود تلاش می کردیم سپاسگزاریم.”
مارک دی دریسکول ، دکتری – مدیر ارشد علمی – اینتوس علوم زیستی
فراصوت صفحه چند چاه UIP400MTP آماده سازی نمونه با توان بالا را تسهیل می کند، به عنوان مثال در تحقیق و تجزیه و تحلیل متابولیت.
UIP400MTP سونیکاتور صفحه 96 چاه: مایع انتقال سونوگرافی تمام چاه ها را احاطه کرده و فراصوت یکنواخت هر نمونه را فراهم می کند
ویژگی های کلیدی UIP400MTP چند چاه صفحه Sonicator
| فراصوت با توان بالا | کاملا مناسب برای 96 چاه و دیگر صفحات چند چاه، UIP400MTP اجازه می دهد تا برای فراصوت همزمان و یکسان از نمونه های متعدد، به طور قابل توجهی کوتاه مدت زمان آماده سازی نمونه و افزایش توان آزمایش تعداد نمونه بالا. |
| از صفحه چند چاهی مورد نظر خود استفاده کنید | UIP400MTP طراحی شده است برای فراصوت هر صفحه چند چاه استاندارد، صفحات PCR، و یا صفحات میکروتیتر. شما مناسب ترین صفحه را برای آزمایش های خود انتخاب می کنید. از آنجایی که UIP400MTP به مواد مصرفی اختصاصی نیاز ندارد، این باعث صرفه جویی زیادی در هزینه شما می شود! |
| اولتراسونیک غیر تماسی | Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP سونوگرافی شدید را بدون قرار دادن چیزی در نمونه اعمال می کند. شما می توانید صفحات چند چاهی ealed ، عروق بسته و ویال ها را فراصوت کنید. Hielscher شما دارندگان نمونه سفارشی را برای هر ویال یا ظروف غیر استاندارد عرضه می کند. |
| دقت و کنترل | کنترل دقیق و نرم افزار هوشمند به شما امکان می دهد پارامترهای اولتراسونیک را متناسب با نیازهای پردازش خاص خود به طور بهینه تنظیم کنید. شما حداکثر کارایی فراصوت و اثربخشی را برای هر آزمایش دریافت می کنید. |
| کنترل دما | دمای خاصی را برای فراصوت خود تنظیم کنید. سونیکاتور صفحه UIP400MTP می تواند دمای نمونه را کنترل کرده و بر این اساس فراصوت را تنظیم کند. یک مایع خنک کننده چرخشی هر چاه را در صفحه برای کنترل دقیق دما سرد می کند. |
| پروتکل سازی و کنترل از راه دور | هر فراصوت اجرا را می توان از یک کامپیوتر کنترل. نیازی به نصب نرم افزار نیست. می توانید از مرورگر استاندارد خود (مانند کروم، فایرفاکس، اج یا سافاری) در هر سیستم عاملی (مانند MacOS، Windows، Android، iOS یا Linux) برای کنترل و نظارت بر UIP400MTP از راه دور استفاده کنید. هر اجرای فراصوت تولید یک پروتکل فراصوت دقیق برای ارزیابی و مستندسازی. فایل پروتکل در قالب CSV غیر اختصاصی است که می توانید آن را با برنامه دلخواه خود باز کنید، به عنوان مثال Microsoft Excel، Apple Numbers یا OpenOffice Calc. |
| قوی و قابل اعتماد | این UIP400MTP که در آلمان با بالاترین استانداردهای کیفیت طراحی و ساخته شده است، نه تنها قدرتمند است، بلکه به طور قابل توجهی بادوام است. طراحی آن استانداردهای صنعتی را برآورده می کند و به راحتی در برابر سختی های استفاده روزانه در یک محیط آزمایشگاهی سخت مقاومت می کند. شما می توانید از UIP400MTP به طور مداوم 24 ساعت و 7 روز هفته در عملیات با توان بالا استفاده کنید. |
- راندمان بالا
- تکنولوژی روز
- قابلیت اطمینان & نیرومندی
- کنترل فرآیند قابل تنظیم و دقیق
- نرم افزار هوشمند
- ویژگی های هوشمند (به عنوان مثال، قابل برنامه ریزی، پروتکل داده ها، کنترل از راه دور)
- آسان و ایمن برای کار
- تعمیر و نگهداری کم
- CIP (تمیز کردن در محل)
طراحی، ساخت و مشاوره – کیفیت ساخت آلمان
مافوق صوت Hielscher به خوبی برای بالاترین کیفیت و استانداردهای طراحی خود را شناخته شده. استحکام و بهره برداری آسان اجازه می دهد تا ادغام صاف از ultrasonicators ما به امکانات صنعتی. شرایط خشن و محیط های خواستار به راحتی توسط مافوق صوت Hielscher رسیده.
Hielscher اولتراسونیک یک شرکت دارای گواهینامه ISO است و تاکید ویژه ای بر مافوق صوت با کارایی بالا با ویژگی های دولت از هنر فن آوری و کاربر پسند قرار داده است. البته، مافوق صوت Hielscher مطابق با CE و دیدار با الزامات UL، CSA و RoHs.
UIP400MTP صوتی بدون تماس برای آماده سازی نمونه متابولومیک در میکروپلیت.
ادبیات / منابع
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
سوالات متداول در مورد تحقیقات متابولومیک
میکروبیوم چیست؟
میکروبیوم به جامعه جمعی میکروارگانیسم ها ، از جمله باکتری ها ، ویروس ها ، قارچ ها و باستان ها و همچنین مواد ژنتیکی آنها گفته می شود که در یک محیط خاص مانند بدن انسان زندگی می کنند. با تأثیرگذاری بر متابولیسم، عملکرد سیستم ایمنی و محافظت در برابر عوامل بیماری زا، در حالی که توسط عواملی مانند رژیم غذایی، سبک زندگی و محیط شکل می گیرد، نقش مهمی در سلامت میزبان ایفا می کند.
متابولومیک چیست؟
متابولومیک مطالعه جامع متابولیت ها است که مولکول های کوچکی هستند که در طی فرآیندهای متابولیکی در یک سیستم بیولوژیکی تولید می شوند. این شامل شناسایی، کمی سازی و تجزیه و تحلیل این مولکول ها برای درک عملکردهای سلولی، مسیرهای متابولیکی و نحوه پاسخ آنها به تغییرات ژنتیکی، محیطی یا پاتولوژیک است.
Metabolome چیست؟
متابولوم مجموعه کاملی از مولکول های کوچک یا متابولیت ها است که در یک سیستم بیولوژیکی مانند سلول ، بافت یا ارگانیسم در یک زمان معین وجود دارد. این منعکس کننده فعالیت بیوشیمیایی و وضعیت فیزیولوژیکی سیستم است و بینش هایی در مورد متابولیسم و فعل و انفعالات آن با محیط ارائه می دهد.
Hielscher مافوق صوت تولید کننده هموژنایزرهای مافوق صوت با کارایی بالا از ازمایشگاه ها تا اندازه صنعتی.