Kütlə spektrometriyası üçün nümunələrin ultrasəslə hazırlanması
Kütlə spektrometriyası (MS) müasir tədqiqat və sənayedə ən güclü analitik üsullar arasındadır. Lakin onun effektivliyi əsaslı şəkildə bir kritik ilkin amildən asılıdır: nümunənin hazırlanması. Nümunələrin ultrasəslə hazırlanması – xüsusilə zond tipli və təmassız ultrasəs emalı – səmərəli, təkrarlana bilən və miqyası genişləndirilə bilən kütlə spektrometriyası iş prosesləri üçün qızıl standart yanaşmaya çevrilmişdir.
Nümunənin hazırlanması MS üçün uğuru niyə müəyyən edir
Nümunənin hazırlanması ikinci dərəcəli mərhələ deyil – o, MS həssaslığını, dəqiqliyini və təkrarlana bilməsini birbaşa müəyyən edir. Qeyri-adekvat hazırlıq aşağıdakılara səbəb ola bilər:
- Hüceyrə lizisinin və ya zülal ekstraksiyasının natamam olması
- Parçalanma səmərəliliyinin aşağı olması
- Matris təsirləri və ion siqnalının zəifləməsi
- Nümunənin heterogenliyi və təkrarlana bilmənin aşağı olması
- Az miqdarda olan analitlərin itirilməsi
Müasir MS tətbiqləri – proteomika, metabolomika, lipidomika, əczaçılıq analizi və klinik diaqnostika – yüksək səmərəli, standartlaşdırılmış və çirklənmədən azad hazırlıq üsulları tələb edir. Ultrasəs emalı molekulyar bütövlüyü dəyişdirmədən ekstraksiyanı, dispersiyanı və reaksiya kinetikasını yaxşılaşdıran idarə olunan mexaniki enerji ötürməklə bu tələbləri qarşılayır.
MS aparılmadan əvvəl nümunələrin ultrasəslə emalı: üstünlüklər və faydalar
Nümunələrin ultrasəslə hazırlanması intensiv sürüşmə qüvvələri və lokal enerji yaratmaq üçün akustik kavitasiyaya – mikroskopik qabarcıqların əmələ gəlməsinə və çökməsinə – əsaslanır. Bu mexanizm mexaniki və ya yalnız kimyəvi üsullarla müqayisədə bir sıra üstünlüklər təmin edir.
MS iş prosesləri üçün əsas faydalar
- Səmərəli hüceyrə dağıdılması və ekstraksiya: Ultrasəs hüceyrələrin, toxumaların və mikroorqanizmlərin sürətli və tam lizisini mümkün edir, zülalların, metabolitlərin, lipidlərin və nuklein turşularının yüksək çıxımını təmin edir.
- Təkmilləşdirilmiş enzimatik parçalanma: Ultrasəs emalı substratın əlçatanlığını və kütlə ötürülməsini yaxşılaşdırmaqla proteolitik parçalanmanı (məsələn, tripsinə əsaslanan iş proseslərində) sürətləndirir və çox vaxt parçalanma müddətini saatlardan dəqiqələrə endirir. Nümunələrin ultrasəslə təkmilləşdirilmiş parçalanması haqqında daha ətraflı oxuyun!
- Təkmilləşdirilmiş homogenləşdirmə və dispersiya: Hissəciklərin və damcıların bərabər paylanması nümunənin heterogenliyini minimuma endirir və analitik nəticələrin təkrarlana bilməsini yaxşılaşdırır.
- Kimyəvi əlavələrin azaldılması: Ultrasəs ionlaşmaya mane olan və ya əlavə təmizləmə mərhələləri tələb edən sərt təsirli detergentləri və həllediciləri əvəz edə və ya onların istifadəsini azalda bilər.
- Miqyasın genişləndirilməsi və standartlaşdırma: Dəqiq idarə oluna bilən amplituda, verilən enerji və emal müddəti, eləcə də hermetik bağlanmış nümunələrin təmassız ultrasəs emalı üsulun tədqiqat və işlənmədən rutin analizə keçirilməsinə imkan verir.
Mikroplitələr üçün UIP400MTP sonikatoru nümunələrin etibarlı hazırlanmasını və mövcud laboratoriya iş proseslərinə asan inteqrasiyanı təmin edir
MS üçün nümunələrin ultrasəslə hazırlanmasına dair nümunəvi protokol
Aşağıda proteomika və metabolomika iş prosesləri üçün uyğun ümumiləşdirilmiş protokol verilmişdir. Parametrlər nümunənin növünə və sonrakı MS mərhələsinin tələblərinə əsasən optimallaşdırılmalıdır.
Nümunə: ultrasəslə hüceyrə lizisi və zülal ekstraksiyası
Nümunə: məməli hüceyrələri və ya toxuması
Həcm: 200–1000 µL
Bufer: MS ilə uyğun lizis buferi (məsələn, ammonium bikarbonat əsaslı)
Prosedur:
- Nümunəni uyğun sınaq borusuna və ya flakona yerləşdirin (lazım gələrsə, buz üzərində).
- Ultrasəs zondunu daxil edin və ya sınaq borusunu təmassız ultrasəs emalı üçün tutacağa yerləşdirin.
- İmpuls rejimindən istifadə edərək ultrasəslə emal edin (məsələn, 5–10 saniyə aktiv / 5–10 saniyə fasilə).
- Termik parçalanmanın qarşısını almaq üçün temperatur nəzarətini təmin edin.
- Tam lizis və homogenləşdirmə əldə edilənədək ultrasəs emalını davam etdirin.
- Qalıqları kənarlaşdırmaq üçün lazım gələrsə, sentrifuqalayın.
- Parçalanma, təmizləmə və MS analizi mərhələlərinə keçin.
Tipik ultrasəs emalı parametrləri:
- Tezlik: 20–30 kHz
- Amplituda: 20–70% (nümunənin sərtliyindən asılı olaraq)
- Ümumi verilən enerji: Ws/mL ilə müəyyən edilir, üsula xasdır və təkrarlana bilir
MS prosedurunuz üçün ideal sonikatoru necə seçməli
Düzgün sonikatorun seçilməsi analitik məqsədlərdən, nümunənin xüsusiyyətlərindən və nümunə emalı məhsuldarlığına dair tələblərdən asılıdır.
Əsas seçim meyarları
Nümunənin növü və mexaniki davamlılığı:
Sərt toxumalar və mikroorqanizmlər üçün zond tipli sistemlər faydalıdır, həssas və ya çirklənmənin kritik əhəmiyyət daşıdığı nümunələr üçün isə təmassız ultrasəs emalı daha uyğundur.
Nümunənin həcmi və emal məhsuldarlığı:
Kiçik həcmli nümunələrin yüksək məhsuldarlıqla emal edildiyi iş prosesləri çoxsaylı nümunələr üçün tutacaqlar və ya avtomatlaşdırmaya hazır sistemlər tələb edə bilər.
Təkrarlana bilmə və normativ tələblərə uyğunluq:
Rəqəmsal idarəetmə, məlumatların qeydə alınması və enerjinin dəqiq ötürülməsi normativ tələblərlə tənzimlənən MS mühitləri üçün vacibdir.
Temperaturun idarə edilməsi:
Temperatura həssas analitlər impuls rejimində ultrasəs emalı və soyutma aksesuarları tələb edir.
Miqyasın genişləndirilməsi: Protokolu yenidən tərtib etmədən həm üsulun işlənib hazırlanmasını, həm də rutin işi dəstəkləyən platforma seçin.
Hielscher sonikatorları bu meyarlara cavab vermək üçün layihələndirilmişdir və MS laboratoriyaları üçün dayanıqlı iş, dəqiq idarəetmə və uzunmüddətli etibarlılıq təmin edir.
Ədəbiyyat / İstinadlar
- D. López-Ferrer, J. L. Capelo, J. Vázquez (2005): Ultra Fast Trypsin Digestion of Proteins by High Intensity Focused Ultrasound. Journal of Proteome Research 4, 5; 2005. 1569–1574.
- Collins BC, Hunter CL, Liu Y, Schilling B, Rosenberger G, Bader SL, Chan DW, Gibson BW, Gingras AC, Held JM, Hirayama-Kurogi M, Hou G, Krisp C, Larsen B, Lin L, Liu S, Molloy MP, Moritz RL, Ohtsuki S, Schlapbach R, Selevsek N, Thomas SN, Tzeng SC, Zhang H, Aebersold R. (2017): Multi-laboratory assessment of reproducibility, qualitative and quantitative performance of SWATH-mass spectrometry. Nat Commun. 2017 Aug 21;8(1):291.
- Viñas, Pilar; Garcia, Ignacio; Campillo, Natalia; Rivas, Ricardo; Hernández-Córdoba, Manuel (2012): Ultrasound-assisted emulsification microextraction coupled with gas chromatography-mass spectrometry using the Taguchi design method for bisphenol migration studies from thermal printer paper, toys and baby utensils. Analytical and bioanalytical chemistry. 404. 671-8.
- FactSheet VialTweeter Single-Tube Sonicator VT26dxx – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet VialTweeter Multi-Sample Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
Tez-tez verilən suallar
Kütlə spektrometriyasının əsas prinsipi nədir?
Kütlə spektrometriyası molekulları qaz fazasındakı ionlara çevirərək və elektromaqnit sahələrində onların kütləsinin yükünə nisbətini (m/z) ölçərək molekulları müəyyənləşdirir və miqdarını təyin edir.
Kütlə spektrometriyasının 4 mərhələsi hansılardır?
Kütlə spektrometriyasının dörd mərhələsi yüklü hissəciklər yaratmaq üçün nümunənin ionlaşdırılması, ionların elektrik sahəsi ilə sürətləndirilməsi, kütlə analizatorunda ionların kütləsinin yükünə nisbətinə görə ayrılması və ölçülə bilən siqnal yaratmaq üçün ionların aşkarlanmasıdır.
Kütlə spektrometriyasının 3 növü hansılardır?
Kütlə spektrometriyasının üç əsas növü rəqsi elektrik sahələrindən istifadə edərək ionları ayıran kvadrupol kütlə spektrometriyası; ionları sabit məsafə boyunca uçuş müddətinə görə fərqləndirən uçuş müddəti kütlə spektrometriyası; və ionları elektromaqnit sahəsində saxlayan və kütləsinin yükünə nisbətinə görə ardıcıl olaraq buraxan ion tələsi kütlə spektrometriyasıdır.
Hielscher Ultrasonics yüksək məhsuldarlıqlı ultrasəs homogenizatorlarını laboratoriya ölçüsündən başlayaraq sənaye ölçüsünədək istehsal edir.


