Nümunələrin hazırlanması üçün zond tipli sonikasiya: əhatəli bələdçi
Zond tipli sonikasiya maye nümunələrdə hüceyrələrin parçalanması, DNT-nin kəsici qüvvələrlə fraqmentləşdirilməsi və hissəciklərin dispersləşdirilməsi üçün güclü vasitədir. Həyat elmlərində, mikrobiologiyada və klinik analizdə istifadə olunan bütün üsullar kimi, sonikasiya da nümunənin zədələnməsinin qarşısını almaq üçün, xüsusilə istiliyə həssas materiallarla işləyərkən, diqqətlə optimallaşdırılmalıdır. Nümunələri buz üzərində saxlamaq, sonikasiya amplitudasına nəzarət etmək, impuls rejimindən istifadə etmək və sonotrodun batırılma dərinliyini optimallaşdırmaq kimi tövsiyələrə əməl etməklə effektiv və təkrar əldə edilə bilən nəticələrə nail ola bilərsiniz. Nəticə etibarilə, yaxşı optimallaşdırılmış sonikasiya protokolu sonrakı tətbiqlərin uğurunu təmin edir və qiymətli nümunələrinizin bütövlüyünü qoruyur.
Sonikasiya – nümunələrin hazırlanmasında əvəzolunmaz mərhələ
Zond tipli sonikasiya bioloji, kimyəvi və materialşünaslıq tədqiqatlarında nümunələrin hazırlanması üçün geniş istifadə olunan üsuldur. Bu proses hüceyrələri parçalamaq, DNT-ni kəsici qüvvələrlə fraqmentləşdirmək, nanohissəcikləri dispersləşdirmək və ya məhlulları emulsiyalaşdırmaq üçün ultrasəs enerjisindən istifadəni nəzərdə tutur. Zond (sonotrod, ultrasəs buynuzu, sonozond) vasitəsilə yüksək enerjili ultrasəs dalğalarını maye nümunədən keçirən zond tipli sonikasiya yüksək təzyiq, turbulentlik və kavitasiyanın lokal sahələrini yaradır; bunlar hüceyrə strukturlarını mexaniki şəkildə parçalayır və ya hissəcikləri homogen şəkildə dispersləşdirir. Bununla belə, nümunənin, xüsusilə zülallar və nuklein turşuları kimi həssas bioloji materialların zədələnməsinin qarşısını almaq üçün üsul diqqətlə optimallaşdırılmalıdır. Zond tipli sonikasiyaya dair bu bələdçi nümunələrin effektiv hazırlanması üçün praktik tövsiyələr verir.
UP200Ht ultrasəs laboratoriya homogenizatoru tədqiqat laboratoriyalarında nümunələrin hazırlanması, lizis, ekstraksiya, DNT-nin fraqmentləşdirilməsi və həll etmə üçün geniş istifadə olunur.
- Amplituda parametrlərini tənzimləyin
Sonikasiya amplitudası zondun yaratdığı rəqslərin böyüklüyünü ifadə edir. Daha yüksək amplitudalar daha intensiv ultrasəs enerjisi ötürür, lakin daha çox istilik yaradır və nümunənin deqradasiya riskini artırır. Əksinə, daha aşağı amplitudalar nümunənin bütövlüyünü qorumaqla istiliyin yığılmasını azaldan daha yumşaq sonikasiya təmin edir.
Konkret tətbiqinizdən asılı olaraq, daha uzun müddət ərzində daha aşağı amplitudadan istifadə etmək çox yüksək amplitudanın qısa impulslarla tətbiqindən daha yaxşı nəticələr verə bilər. Bu yanaşma nümunənin yetərli dərəcədə parçalanmasını və ya qarışdırılmasını təmin etməklə termiki deqradasiya ehtimalını azaldır. - Məlumatların avtomatik qeydə alınmasından istifadə edin
Bütün Hielscher rəqəmsal sonikatorlarının ağıllı menyusunda məlumatların avtomatik qeydə alınması funksiyası mövcuddur. Sonikatorunuzu işə saldığınız andan etibarən ötürülən enerji (ümumi və xalis), amplituda, güc və vaxt kimi bütün mühüm məlumatlar izlənilir – temperatur və təzyiq sensorlarını qoşmusunuzsa, hətta temperatur və təzyiq də izlənilir. Bütün məlumatlar tarix və vaxt nişanı ilə daxili SD kartına CSV faylı şəklində yazılır. - Ötürülən enerjinin optimallaşdırılması: düzgün ultrasəs gücü səviyyəsinə nail olun
Ultrasəslə emalın xüsusi enerji girişi (Ws/mL) əsasında optimallaşdırılması vaxta əsaslanan protokollardan daha təkrar əldə edilə bilən və kəmiyyətcə ölçülə bilən yanaşma təqdim edir. Sonikasiya müddəti bir amil olaraq qalsa da, nümunənin parçalanma dərəcəsini son nəticədə vahid həcmə ötürülən ümumi enerji müəyyən edir. Qeyri-kafi enerji girişi natamam lizis və ya dispersləşmə ilə nəticələnə bilər, həddindən artıq enerji girişi isə, xüsusilə həssas bioloji və ya polimer sistemlərdə, molekulyar deqradasiyaya, zülal denaturasiyasına və ya həddindən artıq qızmaya səbəb ola bilər.
Tövsiyəmiz: Aşağı xüsusi enerji girişi səviyyələrindən başlayın – nümunənin növündən asılı olaraq, adətən 10–50 Ws/mL diapazonunda – və ehtiyac olduqca tədricən artırın. Fiziki dəyişiklikləri (məsələn, bulanıqlıq, özlülük, hissəciklərin dispersləşməsi) qiymətləndirərək prosesi izləyin və həddindən artıq köpüklənmə, temperatur artımı və ya nümunənin rənginin dəyişməsi kimi həddindən artıq sonikasiya əlamətlərinə diqqət yetirin. Termiki və ya mexaniki gərginliyi minimuma endirməklə hədəf enerji dozasına çatmaq üçün amplitudanı, impuls dövrünü və müddəti müvafiq şəkildə tənzimləyin. - İstiliyin yığılmasını minimuma endirmək üçün impuls rejimindən istifadə edin
Hielscher sonikatorları impuls rejimində işlədilə bilər; bu rejim temperatura həssas nümunələr üçün xüsusilə faydalıdır. İmpuls rejimi sonikasiya və fasilə mərhələlərini növbələşdirərək nümunənin impulslar arasında soyumasına imkan verir. Bu, temperaturun sürətli sıçrayışlarının qarşısını alaraq istiliyin səbəb olduğu deqradasiya riskini minimuma endirir. - Temperatura nəzarətin əhəmiyyəti: nümunələrinizi sərin saxlayın
Sonikasiya ultrasəs enerjisini mayeyə ötürür və turbulentlik və sürtünmə nəticəsində istilik yaradır. Nəzarətsiz qaldıqda bu, temperaturun yüksəlməsinə gətirib çıxara bilər və zülallar, fermentlər və nuklein turşuları kimi həssas bioloji nümunələrin deqradasiyasına səbəb ola bilər. Bunu azaltmaq üçün sonikasiya zamanı temperatura nəzarət mühüm əhəmiyyət daşıyır.
Həddindən artıq qızmanın qarşısını almağın ən sadə və ən effektiv yollarından biri nümunələrinizi bütün sonikasiya prosesi boyunca buz üzərində saxlamaqdır. Bu, sabit, aşağı temperaturun saxlanmasına kömək edir və nümunənizi termiki deqradasiyadan qoruyur.
Bütün Hielscher rəqəmsal sonikatorlarında temperaturun izlənməsi funksiyası mövcuddur. Qoşula bilən temperatur sensoru nümunədəki temperaturu fasiləsiz ölçür. Proqramda təyin edilmiş temperatur həddinə uyğun olaraq, yuxarı temperatur həddinə çatdıqda sonikator avtomatik fasilə verir və təyin edilmiş temperatur fərqinin aşağı həddinə çatan kimi sonikasiyanı davam etdirir.
Əlavə olaraq, aşağıdakıları edə bilərsiniz:- Sonikasiya prosesinə başlamazdan əvvəl nümunə sınaq borusunu buz üzərinə qoyun.
- Uzunmüddətli seanslar zəruridirsə, soyumağa imkan vermək üçün sonikasiyaya vaxtaşırı fasilə verin.
- Nümunəni daha da stabilləşdirmək üçün sonikasiyadan sonra onu buz üzərində saxlayın.
Bu, zülal nümunələri üçün xüsusilə vacibdir, çünki zülallar yüksək temperaturda sürətlə denaturasiya edə bilər. Nümunələrinizi soyuq saxlamaqla onların funksional bütövlüyünü Western blot analizi, ferment analizləri və ya kütlə spektrometriyası kimi sonrakı tətbiqlər üçün qoruyursunuz.
- Nümunəniz üçün düzgün sonotrod ölçüsü
Həyat elmlərində və mikrobiologiyada nümunələrin sonikasiyası üçün düzgün sonotrod ölçüsünün seçilməsi optimal enerji ötürülməsini və hüceyrələrin və ya biomolekulların effektiv parçalanmasını təmin etmək baxımından mühüm əhəmiyyət daşıyır. Uyğun ölçülü sonotrod effektiv kavitasiyaya imkan verir; bu isə hüceyrə divarlarının parçalanması, hüceyrələrin lizisi və nümunələrin homogenləşdirilməsi üçün vacibdir. Sonotrod nümunənin həcmi və ya növü üçün həddindən artıq böyük və ya kiçikdirsə, bu, qeyri-bərabər sonikasiyaya, həddindən artıq qızmaya və ya hüceyrələrin qeyri-kafi parçalanmasına səbəb ola və eksperiment nəticələrinə mənfi təsir göstərə bilər. Buna görə də uyğun sonotrod ölçüsünün seçilməsi nümunənin bütövlüyünün qorunmasına kömək edir və eksperimentlərdə nəticələrin təkrar əldə edilməsini təmin edir. - Zondun düzgün dərinliyi: köpüklənmədən və bərabər təsirə məruz qalmadan çəkinin
Zondun yerləşdirilməsi sonikasiyada mühüm, lakin çox vaxt nəzərdən qaçırılan amildir. Zondun düzgün dərinliyi effektiv enerji ötürülməsini və nümunənin qarışmasını təmin edir. Zond çox dayaz yerləşdirilərsə, həddindən artıq köpüklənmə baş verə bilər; bu, hava qabarcıqlarını tutub saxlaya və sonikasiyanın effektivliyini azalda bilər. Zond çox dərin yerləşdirilərsə, yetərli sirkulyasiyaya nail olmaya bilərsiniz və bu, nümunənin qeyri-bərabər sonikasiyasına gətirib çıxara bilər.
Zondun ideal dərinliyi adətən sınaq borusunda və ya qabda mayenin hündürlüyünün 1/4 və 1/3 hissəsi arasında olur. Köpüklənməyə səbəb olmadan enerji ötürülməsini maksimuma çatdıran optimal mövqeyi tapmaq üçün müxtəlif dərinlikləri sınaqdan keçirin.
Böyük nümunə qabında bütün nümunənin bərabər sonikasiyasını təmin etmək üçün sonotrodun nümunə daxilində yavaş-yavaş hərəkət etdirilməsi faydalı ola bilər.
CupHorn və ya UIP400MTP çoxnümunəli sonikator modellərindən istifadə edirsinizsə, cuphorn-u təlimatda təsvir olunduğu kimi doldurun. - Sonikasiya prosesini optimallaşdırın: nümunənizə uyğunlaşdırın
Uğurlu zond tipli sonikasiyanın açarı optimallaşdırmadır. Hüceyrələr, toxumalar və kimyəvi maddələr daxil olmaqla müxtəlif nümunələr ultrasəs enerjisinə fərqli reaksiya verdiyindən, prosesi konkret ehtiyaclarınıza uyğunlaşdırmaq vacibdir. Optimallaşdırma zamanı nəzərə alınmalı amillərə aşağıdakılar daxildir:
Nümunənin həcmi: Daha böyük həcmlər daha uzun sonikasiya müddətləri və ya daha yüksək amplitudalar tələb edə bilər.
Nümunənin özlülüyü: Özlü nümunələrdə yetərli parçalanmaya nail olmaq üçün daha intensiv sonikasiya lazım ola bilər.
Arzu olunan nəticə: Möhkəm toxumaları lizisə uğradırsınızsa, daha intensiv sonikasiya rejimi tələb oluna bilər, DNT-nin kəsici qüvvələrlə fraqmentləşdirilməsi üçün isə daha qısa sonikasiya kifayət edə bilər.
Amplituda, müddət və zondun dərinliyi kimi parametrləri sistematik şəkildə sınaqdan keçirərək və dəqiqləşdirərək sonikasiya prosesini özünəməxsus nümunəniz üçün optimallaşdıra bilərsiniz.
Nümunə hazırlama işiniz üçün düzgün sonikatoru tapın
Hielscher Ultrasonics nümunə hazırlama işiniz üçün tam spektri əhatə edən sonikator çeşidi təklif edir. Nümunənin növü, həcmi və üzərində işlədiyiniz konkret tətbiq kimi mühüm amilləri bizə bildirin. Mütəxəssislərdən ibarət komandamız tədqiqat eksperimentləriniz üçün ən uyğun ultrasəs homogenizatorunu təklif edərək sizə məmnuniyyətlə məsləhət verəcək.
Aşağıdakı cədvəl laboratoriya ölçülü ultrasəs cihazlarımızın təxmini emal tutumu haqqında təsəvvür yaradır:
| Tövsiyə olunan cihazlar | Partiya həcmi | Axın sürəti |
|---|---|---|
| UIP400MTP 96-yuvalı lövhə sonikatoru | çoxyuvalı / mikrotitr lövhələri | n.a. |
| Ultrasəs CupHorn | Flakonlar və ya laboratoriya stəkanı üçün CupHorn | n.a. |
| GDmini2 | ultrasəs mikroaxın reaktoru | n.a. |
| VialTweeter | 0,5–1,5mL | n.a. |
| UP100H | 1–500mL | 10–200mL/min |
| UP200Ht, UP200St | 10–1000mL | 20–200mL/min |
| UP400St | 10–2000mL | 20–400mL/min |
| Ultrasəs ələk silkələyicisi | n.a. | n.a. |
Hielscher Ultrasonics ISO sertifikatlı şirkətdir və ən müasir texnologiyaya malik, istifadəsi rahat olan yüksək məhsuldarlıqlı ultrasəs cihazlarına xüsusi diqqət yetirir. Əlbəttə, Hielscher ultrasəs cihazları CE tələblərinə uyğundur və UL, CSA və RoHs tələblərinə cavab verir.
Hielscher Ultrasonics nümunələrin hazırlanması və klinik analiz üçün güclü təmassız sonikatorlar təchiz edir. Çoxyuvalı lövhə sonikatoru UIP400MTP, VialTweeter, CupHorn və GDmini2 axın sonikatoru nümunələri onlara toxunmadan emal edir.
- yüksək səmərəlilik
- ən müasir texnologiya
- etibarlılıq və möhkəmlik
- tənzimlənə bilən, dəqiq proses nəzarəti
- partiya və axın xəttində emal
- istənilən həcm üçün
- ağıllı proqram təminatı
- ağıllı funksiyalar (məsələn, proqramlaşdırılma, məlumatların qeydə alınması, uzaqdan idarəetmə)
- asan və təhlükəsiz istifadə
- az texniki qulluq tələbi
- CIP (yerində təmizləmə)
10 nümunənin eyni vaxtda sonikasiyası üçün VialTweeter sonikatoru, məsələn, hüceyrələri parçalamaq, zülalları ekstraksiya etmək və DNT-ni kəsici qüvvələrlə fraqmentləşdirmək üçün
Ədəbiyyat / İstinadlar
- Claudia Lindemann, Nataliya Lupilova, Alexandra Müller, Bettina Warscheid, Helmut E. Meyer, Katja Kuhlmann, Martin Eisenacher, Lars I. Leichert (2013): Redox Proteomics Uncovers Peroxynitrite-Sensitive Proteins that Help Escherichia coli to Overcome Nitrosative Stress. J Biol Chem. 2013 Jul 5; 288(27): 19698–19714.
- Turrini, Federica; Donno, Dario; Beccaro, Gabriele; Zunin, Paola; Pittaluga, Anna; Boggia, Raffaella (2019): Pulsed Ultrasound-Assisted Extraction as an Alternative Method to Conventional Maceration for the Extraction of the Polyphenolic Fraction of Ribes nigrum Buds: A New Category of Food Supplements Proposed by The FINNOVER Project. Foods. 8. 466; 2019
- Giricz Z., Varga Z.V., Koncsos G., Nagy C.T., Görbe A., Mentzer R.M. Jr, Gottlieb R.A., Ferdinandy P. (2017): Autophagosome formation is required for cardioprotection by chloramphenicol. Life Science Oct 2017. 11-16.
- Hemida, Yasmine (2016): Effect of Rapamycin as an Inhibitor of the mTOR Cell Cycle Entry Complex on the Selective Lysis of Human Leukemia Cells Lines in Vitro Using 20 kHz Pulsed Low-Frequency Ultrasound. Honors Capstone Projects – All. 942, 2016.
- Fernandes, Luz; Santos, Hugo; Nunes-Miranda, J.; Lodeiro, Carlos; Capelo, Jose (2011): Ultrasonic Enhanced Applications in Proteomics Workflows: single probe versus multiprobe. Journal of Integrated OMICS 1, 2011.
- Priego-Capote, Feliciano; Castro, María (2004): Analytical uses of ultrasound – I. Sample preparation. TrAC Trends in Analytical Chemistry 23, 2004. 644-653.
- Welna, Maja; Szymczycha-Madeja, Anna; Pohl, Pawel (2011): Quality of the Trace Element Analysis: Sample Preparation Steps. In: Wide Spectra of Quality Control; InTechOpen 2011.
Tez-tez verilən suallar
Sonikasiyanın məqsədi nədir?
Sonikasiyanın məqsədi səs dalğalarından, adətən ultrasəs diapazonunda, istifadə edərək nümunədəki hissəcikləri hərəkətə gətirmək və hüceyrələrin parçalanması, homogenləşdirmə və molekulyar strukturların parçalanması kimi prosesləri asanlaşdırmaqdır. Qarışdırmanı yaxşılaşdırmaq, reaksiyaları sürətləndirmək və ya hüceyrə möhtəviyyatını azad etmək üçün biologiya, kimya və materialşünaslıq tətbiqlərində geniş istifadə olunur.
Sonikasiya üsulu nədir?
Sonikasiya üsulu maye mühitdə sürətli rəqslər yaratmaq üçün intensiv ultrasəs dalğalarından (adətən 20–30 kHz tezliklərində) istifadəni nəzərdə tutur. Bu rəqslər mikroskopik qabarcıqların yaranmasına və çökməsinə səbəb olur; bu proses akustik kavitasiya kimi tanınır. Bu kavitasiya lokal yüksək təzyiq və temperatur yaradır ki, bunlar hüceyrələri parçalaya, hissəcikləri dispersləşdirə və ya kimyəvi reaksiyaları asanlaşdıra bilər. Sonikasiya üsulu laboratoriyalarda hüceyrə lizisi, ekstraksiya, DNT-nin kəsici qüvvələrlə fraqmentləşdirilməsi, homogenləşdirmə və nanohissəciklərin sintezi kimi tətbiqlərdə geniş istifadə olunur.
Sonikasiya üçün nümunəni necə hazırlayırsınız?
Sonikasiya üçün nümunə hazırlamaq məqsədilə nümunə materialı (adətən maye və ya suspenziya halındakı bərk maddələr) ultrasəs rəqslərinə imkan verəcək və daşmanın qarşısını alacaq qədər həcmə malik uyğun qaba, çox vaxt şüşə kolbaya, plastik sınaq borusuna və ya çoxyuvalı lövhəyə yerləşdirilir. Lazım gələrsə, arzu olunan konsentrasiyanı saxlamaq və sonikasiya zamanı həddindən artıq qızmanın qarşısını almaq üçün nümunə bufer və ya həlledici ilə durulaşdırılır. İstiliyə həssas nümunələr üçün ultrasəs dalğalarının yaratdığı istiliyi uzaqlaşdırmaq məqsədilə qab daha sonra qismən buz vannasına və ya soyutma köynəyinə batırılır. Effektiv enerji ötürülməsini təmin etmək üçün sonikatorun zondu düzgün yerləşdirilir. Amplituda, vaxt və impuls rejimi kimi parametrlər eksperimentin konkret tələblərinə əsasən təyin edilir.
Sonikasiya DNT-ni parçalayırmı?
Bəli, sonikasiya DNT-ni parçalaya bilər. Sonikasiya zamanı yaranan yüksək enerjili ultrasəs dalğaları lokal yüksək təzyiq və istilik sahələri yaradaraq DNT zəncirlərində mexaniki gərginliyə səbəb ola və DNT molekullarını kəsici qüvvələrlə fraqmentləşdirə bilər. Bu, DNT-nin daha kiçik hissələrə fraqmentləşməsi ilə nəticələnir. DNT-nin parçalanma dərəcəsi sonikasiyanın müddətindən və intensivliyindən asılıdır. Xromatinin immunopresipitasiyası (ChIP) və ya yeni nəsil sekvensləmə (NGS) kitabxanasının hazırlanması kimi bəzi eksperimentlərdə sonikasiya DNT-nin nəzarətli şəkildə kəsici qüvvələrlə fraqmentləşdirilməsi üçün etibarlı üsul kimi istifadə olunur.
Hielscher Ultrasonics yüksək məhsuldarlıqlı ultrasəs homogenizatorlarını laboratoriya ölçülərindən başlayaraq sənaye ölçülərinə qədər istehsal edir.
