Staphylococcus bioplyonkasini oʻstirish va ajratish protokoli
Standartlashtirilgan usullar ishonchli tadqiqot natijalari uchun zarur. Bu yerda stafilokokk bioplyonkalarini oʻstirish va ajratish protokolini topishingiz mumkin. Ushbu protokol 96 uyachali plastinkalarda bioplyonkalarni samarali va yuqori unumdorlik bilan ajratish uchun UIP400MTP koʻp uyachali plastinkalar uchun ultratovush qurilmasidan foydalanib, namunalarni yuqori unumdorlik bilan tayyorlash jarayonini soddalashtirishga qaratilgan. Protokolda oʻzgaruvchanlikni minimallashtirish va natijalarning takrorlanuvchanligini taʼminlashga eʼtibor qaratilgan holda bioplyonkalarni oʻstirish, yuvish va vizualizatsiya qilishning asosiy bosqichlari ham keltirilgan.
Staphylococcus bioplyonkalari va antibiotiklar boʻyicha tadqiqotlar
Staphylococcus bioplyonkalari antibiotiklar va immun javoblarga chidamliligi tufayli uzoq davom etuvchi infeksiyalarda muhim rol oʻynaydi. Bioplyonka hosil boʻlishi bakteriyalar uchun himoya muhitini yaratib, infeksiyalarni davolashni qiyinlashtiradi. Bioplyonkalar boʻyicha tadqiqotlar koʻpincha ularning hosil boʻlishi, xatti-harakati va mikroblarga qarshi vositalarga sezgirligini tushunishga qaratiladi; bunda tajriba jarayonlarini soddalashtirish uchun yuqori unumdorlikdagi usullarga alohida eʼtibor beriladi.
UIP400MTP koʻp uyachali plastinkalar uchun ultratovush qurilmasi 96 uyachali plastinkalardan bioplyonkalarni tez va samarali ajratish imkonini berib, bioplyonka tadqiqotlarida katta afzallik yaratadi. Ushbu qurilma barcha uyachalarga bir xil ultratovush energiyasini yetkazib, oʻzgaruvchanlikni minimallashtirgan holda izchil natijalarni taʼminlaydi.
Staphylococcus bioplyonkasini oʻstirish va ajratish protokoli
Quyida stafilokokk bioplyonkasini oʻstirish va ajratish jarayonini bosqichma-bosqich tushuntiramiz. Namunaviy tahlil bosqichi sifatida oʻstirilgan biomassani kristall binafsha bilan boʻyash orqali spektrofotometrik usulda miqdoriy aniqlashni koʻrsatamiz.
Staphylococcus bioplyonkasini oʻstirish
Kerakli materiallar:
- Steril tekis taglikli 96 quduqli polistirolli to’qimalar kulturasi bilan ishlov berilgan qopqoqli mikrotitr plitalari
- Tryptic Soy Broth (TSB) with 0,25% glucose
- Biologik xavfsizlik shkafi
Bosqichlar:
- Prepare a sterile working environment in a biological safety cabinet to minimize contamination.
- Add TSB containing 0,25% glucose to the microtiter plate wells. TSB without glucose does not generally support biofilm formation and should only be used as a control if required.
- Quduqlarni quyida ta’riflanganidek tayyorlangan bakteriya shtammlari bilan inokulyatsiya qiling:
- Bakterial suspenziyalarni tayyorlang, bunda oldindan mavjud bo’lgan hujayra klasterlari yo’qligiga ishonch hosil qiling, suspenziyalarni sonikatsiya yordamida bir hil holga keltiring yoki klasterlarni 23 kalibrli igna va qisqa vorteks bilan parchalang.
- Plastinani qopqog’i bilan yoping va biofilm hosil bo’lishi uchun maqbul sharoitlarda (masalan, 24 soat davomida 37 ° C) inkubatsiya qiling.
- Ishonchliligini ta’minlash uchun har bir bakteriya shtammi (har bir shtammda uchta quduq) uchun tajribani uch nusxada bajaring.
- Salbiy nazorat uchun har bir plastinka uchun oltita quduq ajrating. 96 quduqli plastinka uchun 30 tagacha shtammni tekshirish mumkin.
Bioplyonkani vizualizatsiya qilish va yuvish
- Inkubatsiyadan so’ng, biofilmni bezovta qilmaslik uchun vositani ehtiyotkorlik bilan tashlang.
- Planktonik bakteriyalarni olib tashlash uchun har bir quduqni fiziologik sho’r suv bilan to’rt marta yuving.
- Uyachalar tubida bioplyonka mavjudligini koʻrsatuvchi oq dogʻlar bor-yoʻqligini tekshiring.
UIP400MTP koʻp uyachali plastinkalar uchun ultratovush qurilmasi yordamida bioplyonkani ajratish
Qurilmani sozlash va parametrlar:
- UIP400MTP koʻp uyachali plastinkalar uchun ultratovush qurilmasi
- Operatsion sozlamalari: 60% amplituda, 60 soniya ON / 30 soniya o’chirish bilan aylanish rejimi
Bosqichlar:
- Yuvilgan mikrotitr plitasini UIP400MTP platformasiga joylashtiring.
- Namunalarni tavsiya etilgan sozlamalarda soniklashtiring (60% amplituda, 60 soniya ON, 30 soniya OFF). Sozlamalarni bakteriyalar shtammiga moslang.
- Biofilmni ajratish uchun sonikatsiya jarayonini boshlang. Ultrasonik to’lqinlar biofilm matritsasini buzadi va yopishgan bakteriyalarni chiqaradi.
- UIP400MTP ajratish natijalari izchil boʻlishi uchun barcha uyachalarga bir xil taʼsirni taʼminlaydi.
Tahlil bosqichi: ajratilgan Staphylococcus bioplyonkasi biomassasini kristall binafsha (CV) yordamida miqdoriy aniqlash
Kerakli materiallar:
- 0,1% kristall binafsha (CV) eritmasi
- 95% etanol yoki 30% sirka kislotasi (eritish uchun)
- 570 nm da oʻlchash imkoniga ega mikroplastinka oʻquvchi qurilma
- Boʻyash uchun steril mikrotitr plastinkalari
Bosqichlar:
- Boʻyash plastinkasini tayyorlash: ultratovush bilan ishlov berilgan plastinkaning har bir uyachasidan 100 µL ajratilgan bioplyonka suspenziyasini toza, steril 96 uyachali mikrotitr plastinkasining mos uyachalariga oʻtkazing. Bu boʻyash uchun toza va bir xil muhitni taʼminlaydi.
- Ajratilgan bioplyonkani boʻyash: ajratilgan bioplyonka suspenziyasi mavjud har bir uyachaga 150 µL 0,1% kristall binafsha eritmasini qoʻshing. Bioplyonka suspenziyasi va kristall binafshaning bir tekis aralashishini taʼminlash uchun pipetka bilan ehtiyotkorlik bilan aralashtiring.
- Inkubatsiya: kristall binafsha biomassani samarali boʻyashi uchun plastinkani xona haroratida 15 daqiqa inkubatsiya qiling.
- Yuvish: inkubatsiyadan keyin biomassaga tegmagan holda uyachalardagi kristall binafsha eritmasini ehtiyotkorlik bilan toʻkib tashlang. Bogʻlanmagan boʻyoqni olib tashlash uchun har bir uyachani steril fiziologik eritma bilan uch marta yuving.
- Quritish: plastinkani xona haroratida yoki steril havo oqimi shkafida havoda quriting. Qizdirmang, chunki bu natijalarni oʻzgartirishi mumkin.
- Eritish: bogʻlangan kristall binafshani eritish uchun har bir uyachaga 200 µL 95% etanol (yoki laboratoriyaning standart amaliyotlariga qarab 30% sirka kislotasi) qoʻshing. Xona haroratida 10 daqiqa davomida pipetka bilan yoki plastinkani chayqatib ehtiyotkorlik bilan aralashtiring.
- Oʻlchash: mikroplastinka oʻquvchi qurilma yordamida eritilgan kristall binafsha eritmasining optik zichligini (OD) 570 nm da oʻlchang.
- Maʼlumotlarni tahlil qilish: fon boʻyalishini hisobga olish uchun tajriba uyachalarining qiymatlaridan manfiy nazoratlarning (TSB mavjud, ammo bakterial inokulum boʻlmagan uyachalar) oʻrtacha OD570 qiymatini ayiring. Maʼlumotlarni qayd eting va tahlil qiling.
Izoh: natijalarning takrorlanuvchanligini taʼminlash uchun tajribani har bir sharoitda uch takrorda bajaring. Xavfsizlik va utilizatsiya protokollariga rioya qilib, kristall binafsha va etanol bilan toʻgʻri muomala qilishni taʼminlang.
UIP400MTP ning asosiy afzalliklariga qisqacha nazar:
- Yuqori unumdorlikdagi ishlov berish: Aynan koʻp uyachali plastinkalar uchun ishlab chiqilgan boʻlib, bir vaqtning oʻzida bir nechta namunaga ishlov berish imkonini beradi.
- Ultratovushning bir tekis taqsimlanishi: Uyachalarda bir xil ultratovush intensivligini taʼminlab, barcha namunalarda izchil natijalar beradi.
- Istalgan standart plastinkadan foydalaning: UIP400MTP istalgan standart koʻp uyachali plastinkalar, Petri kosachalari va probirka shtativlari bilan ishlay oladi. Qimmat maxsus ishlab chiqaruvchi plastinkalari talab qilinmaydi!
- Foydalanishga qulay interfeys: Sozlash va boshqarish oson boʻlib, laboratoriya unumdorligini oshirish uchun ajoyib vositadir. Dasturlanadigan sozlamalar va avtomatlashtirish jarayonni standartlashtirishni osonlashtiradi!
Bioplyonkalarni yuqori unumdorlik bilan ajratish uchun UIP400MTP 96 uyachali plastinkalar uchun ultratovush qurilmasidan foydalanish
Adabiyotlar / Manbalar
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
Koʻp beriladigan savollar
Hujayradan tashqari polimer moddalar (EPS) nima?
Hujayradan tashqari polimer moddalar (EPS) bioplyonkalardagi mikroorganizmlar ajratib chiqaradigan, asosan polisaxaridlar, oqsillar, nuklein kislotalar va lipidlardan tashkil topgan biopolimerlarning murakkab aralashmasidir. EPS mikroblar hamjamiyatini oʻrab turuvchi himoya matritsasini hosil qiladi; u tuzilmaviy yaxlitlikni taʼminlaydi, yuzalarga yopishishni vositachilik qiladi va hujayralarni atrof-muhitning stress omillaridan, jumladan antibiotiklar va immun javoblardan himoya qiladi.
Plankton bakteriyalar deganda nima tushuniladi?
Plankton bakteriyalar yuzalarga yopishish yoki bioplyonkalar kabi tuzilgan hamjamiyatlar hosil qilish oʻrniga, masalan, suyuq kulturada yoki tana suyuqliklarida suspenziya holida mavjud boʻladigan, erkin suzuvchi bir hujayrali mikroorganizmlardir.
Bioplyonka va plankton bakteriyalar oʻrtasidagi farq nima?
Bioplyonka va plankton bakteriyalar oʻrtasidagi asosiy farq ularning tashkil topishidadir. Bioplyonkalar hujayradan tashqari polimer moddalar (EPS) matritsasiga joylashgan, yuzaga yopishgan, tuzilgan bakteriyalar hamjamiyatlaridir; plankton bakteriyalar esa erkin suzadi va bunday tuzilmaviy tashkil topishga ega emas.
Bioplyonkalardagi bakteriyalarni antibiotiklar bilan davolash plankton bakteriyalarga qaraganda qiyinroqmi?
Bioplyonkalardagi bakteriyalarni antibiotiklar bilan davolash plankton bakteriyalarga qaraganda ancha qiyin. Bioplyonka matritsasi fizik toʻsiq vazifasini bajaradi, uning ichidagi bakteriyalarda esa metabolik holatlar oʻzgaradi va stressga chidamlilik kuchayadi; bu antibiotiklar samaradorligining pasayishiga hissa qoʻshadi.
Bioplyonkalarni antibiotiklar bilan yoʻq qilish mumkinmi?
Bioplyonkalarni baʼzan antibiotiklar bilan butunlay yoʻq qilish mumkin, ammo bu qiyin. Samarali davolash koʻpincha antibiotiklarning yuqori konsentratsiyalarini, muayyan kombinatsiyalarini yoki qoʻshimcha davolash usullarini talab qiladi, chunki EPS matritsasi va bakteriyalarning chidamlilik mexanizmlari bioplyonkani himoya qiladi.
Staphylococcus yopishuvchi bakteriyalarmi?
Staphylococcus bakteriyalari yopishish qobiliyati bilan yaxshi tanilgan. Ular yuzalarga oson yopishib, ayniqsa tibbiy qurilmalar yoki xoʻjayin organizm toʻqimalarida bioplyonkalar hosil qiladi; shu sababli ular uzoq davom etuvchi infeksiyalarning asosiy sababchilaridan hisoblanadi.
Staphylococcus bakteriyalarining qanday turlari mavjud?
Staphylococcus bakteriyalari bir nechta turni oʻz ichiga oladi, ularning eng eʼtiborga loyiqlari Staphylococcus aureus va Staphylococcus epidermidis hisoblanadi. S. aureus patogen boʻlib, ogʻir infeksiyalarni keltirib chiqarishi mumkin, S. epidermidis esa odatda tibbiy qurilmalardagi bioplyonkalar bilan bogʻliq infeksiyalar bilan aloqador.
Kristall binafsha nima?
Kristall binafsha biologik materiallarni boʻyash uchun keng qoʻllaniladigan asosli boʻyoqdir. Mikrobiologiyada u biomassani boʻyash orqali bioplyonka hosil boʻlishini baholash uchun ishlatiladi; keyin bu biomassani spektrofotometrik usulda miqdoriy aniqlash mumkin.
Hielscher Ultrasonics yuqori samarali ultratovushli gomogenizatorlarni laboratoriya oʻlchamidan sanoat oʻlchamigacha ishlab chiqaradi.


