Протокол аналізу MBEC із використанням ультразвукового пристрою UIP400MTP для 96-лункових планшетів
Аналіз MBEC використовують для визначення концентрації антимікробних засобів, необхідної для усунення біоплівок, сформованих на кришках зі штифтами. Щоб оцінити життєздатність біоплівок, їх спочатку потрібно відокремити від кришок зі штифтами 96-лункового планшета. Ультразвукова обробка є найнадійнішим і найефективнішим методом такого відокремлення. Ультразвуковий пристрій UIP400MTP для багатолункових планшетів спеціально розроблено для обробки аналітичних планшетів із максимальною ефективністю та зручністю, що спрощує та прискорює високопродуктивні аналізи MBEC.
Ультразвукова обробка для відокремлення біоплівок
Ультразвукова обробка є надзвичайно важливим етапом аналізів мінімальної концентрації ерадикації біоплівки (MBEC), забезпечуючи ефективне відокремлення клітин біоплівки від поверхні, до якої вони прикріплені. Біоплівки за своєю природою є структурованими угрупованнями мікроорганізмів, оточеними позаклітинним матриксом, що робить їх значно стійкішими до антимікробних засобів порівняно з планктонними клітинами. Під час аналізів MBEC ультразвукова обробка за допомогою ультразвукових хвиль створює контрольовану кавітацію, руйнуючи матрикс біоплівки та вивільняючи вбудовані в нього клітини в суспензію. Цей етап забезпечує рівномірне диспергування клітин біоплівки в середовищі для відновлення, сприяючи точному оцінюванню життєздатності за допомогою висівання, розведення або спектрофотометричних методів. Без належного відокремлення біоплівки залишкові компоненти матриксу можуть захищати клітини, призводячи до недооцінювання ефективності антимікробних засобів. Тому ультразвукова обробка незамінна для отримання надійних і відтворюваних значень MBEC, які відображають справжній ерадикаційний потенціал досліджуваних засобів. Ультразвуковий пристрій UIP400MTP для багатолункових планшетів дає змогу легко виконувати високопродуктивну підготовку зразків в аналітичних планшетах.
Ультразвуковий пристрій UIP400MTP для багатолункових планшетів полегшує високопродуктивну підготовку зразків в аналітичних планшетах.
Протокол аналізу мінімальної концентрації ерадикації біоплівки (MBEC)
Етап 1: Формування біоплівки
- Підготуйте бактеріальну суспензію:
Вирощуйте бактерії у відповідних середовищах до логарифмічної фази росту.
Розведіть бактеріальну культуру до визначеної оптичної густини (наприклад, OD600 ~0,1). - Інокулюйте 96-лунковий планшет:
Додайте бактеріальну суспензію (наприклад, 150–200 µL) у кожну лунку стандартного 96-лункового мікротитраційного планшета. - Установіть кришку зі штифтами:
Установіть кришку зі штифтами на інокульований планшет, щоб забезпечити формування біоплівки на поверхнях штифтів. - Інкубуйте планшет:
Інкубуйте систему за відповідної температури (наприклад, 37°C) протягом 24–48 годин без струшування, щоб сприяти росту біоплівки.
Етап 2: Обробка антимікробними засобами
- Підготуйте розчини антимікробних засобів:
Приготуйте у свіжих середовищах розчини антимікробних засобів із низкою концентрацій.
Піддайте біоплівки дії антимікробних засобів:
Зніміть кришку зі штифтами з планшета з бактеріальною культурою та промийте її в стерильному фізіологічному розчині або PBS, щоб видалити планктонні клітини.
Помістіть кришку зі штифтами в новий 96-лунковий планшет, що містить розчини антимікробних засобів. - Інкубуйте планшет:
Інкубуйте протягом визначеного періоду (наприклад, 24 годин), щоб забезпечити дію антимікробних засобів.
Ультразвуковий пристрій UIP400MTP для багатолункових планшетів для високопродуктивної підготовки зразків
Етап 3: Ультразвукова обробка за допомогою пристрою UIP400MTP для 96-лункових планшетів
Етап ультразвукової обробки є критично важливим для відокремлення біоплівок від кришок зі штифтами з метою оцінювання життєздатності. Виконайте наведені нижче дії для ультразвукового пристрою UIP400MTP:
- Підготуйте систему:
Додайте середовище для відновлення (наприклад, нейтралізувальний бульйон або свіже поживне середовище) у кожну лунку нового 96-лункового планшета. - Перенесіть кришку зі штифтами:
Зніміть кришку зі штифтами з планшета для обробки антимікробними засобами.
Промийте кришку зі штифтами в стерильному фізіологічному розчині або PBS, щоб видалити залишки антимікробних засобів. - Розмістіть планшет і ультразвуковий пристрій:
Установіть кришку зі штифтами на планшет із середовищем для відновлення.
Помістіть планшет із середовищем для відновлення на платформу ультразвукового пристрою UIP400MTP, переконавшись, що планшет розташований по центру та стійко встановлений. - Налаштуйте параметри ультразвукової обробки:
Установіть параметри ультразвукової обробки на UIP400MTP (налаштування можна адаптувати до біоплівки):
Амплітуда: 70–100%.
Час ультразвукової обробки: 1–3 хвилини (коригуйте залежно від міцності біоплівки) у циклічному режимі. - Виконайте ультразвукову обробку:
Запустіть процес ультразвукової обробки. Ультразвукові коливання відокремлять біоплівки від поверхонь штифтів у середовище для відновлення. - Контролюйте процес:
Використовуйте під’єднуваний датчик температури для контролю температури зразків у лунках. Для охолодження UIP400MTP можна під’єднати до лабораторного чилера. - Дії після ультразвукової обробки:
Негайно перенесіть середовище для відновлення (яке тепер містить відокремлені біоплівки) у новий стерильний планшет для подальшого аналізу.
(A) Планшет, що містить TSB із 2% глюкози та використовується для формування біоплівки, відновлення клітин і
визначення MIC та MBCB; (B) Кришка зі штифтами для формування стафілококових біоплівок. визначення MIC та MBCB; (B) Кришка зі штифтами для формування стафілококових біоплівок.
Клітини біоплівки, сформованої на штифтах, відокремлювали ультразвуковою обробкою (Hielscher Ultrasound Technology) протягом 5 min у 96-лункових планшетах, що містили свіже культуральне середовище для відновлення клітин.
(Зображення та дослідження: ©de Oliveira et al., 2016)
Етап 4: Оцінювання життєздатності
Висійте та культивуйте відокремлені біоплівки:
- Виконайте серійні розведення середовища для відновлення та висійте на агар для підрахунку колонієутворювальних одиниць (CFU).
Як альтернативу використовуйте колориметричний або флуоресцентний аналіз життєздатності. - Запишіть результати:
Визначте MBEC як найнижчу концентрацію антимікробного засобу, яка усунула життєздатність біоплівки, що піддається виявленню.
Проєктування, виробництво та консультування – якість, створена в Німеччині
Ультразвукові пристрої Hielscher добре відомі найвищими стандартами якості та проєктування. Надійність і простота експлуатації забезпечують безперешкодну інтеграцію наших ультразвукових пристроїв у промислові об’єкти. Ультразвукові пристрої Hielscher легко справляються із суворими умовами та вимогливими середовищами експлуатації.
Hielscher Ultrasonics є компанією, сертифікованою за ISO, і приділяє особливу увагу високопродуктивним ультразвуковим пристроям, що поєднують найсучасніші технології та зручність користування. Звісно, ультразвукові пристрої Hielscher відповідають вимогам CE та задовольняють вимоги UL, CSA і RoHs.
Спростіть підготовку зразків у 96-лункових та аналітичних планшетах за допомогою ультразвукового пристрою UIP400MTP для багатолункових планшетів
Література / Посилання
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Microplate Sonicator Validated in Peer-Reviewed Proteomics Study
Поширені запитання
Що таке аналіз MBEC?
Аналіз мінімальної концентрації ерадикації біоплівки (MBEC) – це стандартизований метод, який використовують для визначення найнижчої концентрації антимікробного засобу, необхідної для ерадикації бактерій, пов’язаних із біоплівкою. Він передбачає вирощування біоплівок на спеціалізованих поверхнях, вплив на них антимікробних засобів у різних концентраціях та оцінювання життєздатності відокремлених клітин після руйнування біоплівки, зазвичай за допомогою ультразвукової обробки, для оцінювання ефективності обробки.
Яка різниця між MBIC та MBEC?
Мінімальна концентрація інгібування біоплівки (MBIC) – це найнижча концентрація антимікробного засобу, необхідна для запобігання формуванню біоплівки, тоді як мінімальна концентрація ерадикації біоплівки (MBEC) – це найнижча концентрація, необхідна для ерадикації вже сформованої біоплівки. MBIC зосереджена на запобіганні утворенню біоплівок, тоді як MBEC оцінює ефективність обробки проти зрілих біоплівок.
Які планшети зазвичай використовують для аналізів MBEC?
Мікротитраційні планшети, які зазвичай використовують для аналізів MBEC, переважно є 96-лунковими планшетами з полістиролу або поліпропілену. Ці матеріали забезпечують придатну поверхню для формування біоплівки та є хімічно стійкими до антимікробних засобів, які випробовують під час аналізу. Полістирольним планшетам часто віддають перевагу через їхню оптичну прозорість, яка є перевагою для подальших аналізів, зокрема спектрофотометричних або флуоресцентних вимірювань. Конструкція цих планшетів передбачає знімні кришки зі штифтами, які є необхідними для аналізу, оскільки біоплівки формуються на штифтах, занурених у лунки з поживними середовищами. Стандартизовані планшети, зокрема ті, що відповідають протоколу аналізу MBEC, спеціально розроблено для забезпечення відтворюваності та сумісності з ультразвуковим пристроєм UIP400MTP або іншим обладнанням для обробки.
Що таке планшети з PEG-кришками?
Планшети з PEG-кришками – це спеціалізовані багатолункові планшетні системи, у яких кришка оснащена невеликими виступами або штифтами з поліетиленгліколю (PEG), що входять у кожну лунку. Ці штифти забезпечують поверхню для формування мікробних біоплівок у контрольованих умовах, імітуючи ріст біоплівок у реальних умовах. Конструкція дає змогу біоплівкам розвиватися на штифтах, тоді як лунки містять поживні середовища або антимікробні засоби, забезпечуючи високопродуктивне тестування чутливості біоплівок до обробок, зокрема в аналізах MBEC та MBIC.
Hielscher Ultrasonics виробляє високопродуктивні ультразвукові гомогенізатори від лабораторного до промислового масштабу.