Protokol ispitivanja minimalne inhibitorne koncentracije (MIC)
Ispitivanje minimalne inhibitorne koncentracije (MIC) na biofilmu ključna je metoda za procjenu učinkovitosti antimikrobnih sredstava protiv mikroorganizama povezanih s biofilmom, koji pokazuju povećanu otpornost zbog svojeg zaštitnog izvanstaničnog matriksa. Ključan korak u ovom ispitivanju jest odvajanje struktura biofilma kako bi se oslobodile uklopljene stanice radi točne procjene vijabilnosti. Sonikator za pločice s više jažica UIP400MTP olakšava taj postupak primjenom fokusiranog ultrazvuka za stvaranje kontrolirane kavitacije, čime učinkovito odvaja stanice biofilma i dispergira ih u jednoliku suspenziju. Ovo precizno i ponovljivo razaranje biofilma povećava pouzdanost i kapacitet obrade uzoraka pri ispitivanjima MIC-a, što UIP400MTP čini ključnim alatom za unapređenje istraživanja biofilmova.
Zašto primjenjivati sonikaciju tijekom ispitivanja MIC-a?
- Točni, ponovljivi podaci: Dobijte jednolike stanične suspenzije koje uklanjaju zaštitni učinak matriksa, osiguravajući da vaši rezultati brojanja kolonija i očitanja optičke gustoće doista odražavaju antimikrobnu učinkovitost.
- Učinkovitost uz velik kapacitet obrade uzoraka: Istodobno obradite cijelu pločicu s 96 jažica u samo 1–3 minute, zamjenjujući sporo, neujednačeno ručno struganje pojednostavljenim radnim postupkom.
- Očuvana vijabilnost stanica: Nježno odvojite uklopljene stanice bez fizičkih oštećenja uzrokovanih struganjem, održavajući veće stope preživljavanja radi pouzdanih izračuna MIC-a/MBEC-a.
- Nulti rizik od unakrsne kontaminacije: Iskoristite prednosti beskontaktne izvedbe s čašastim ultrazvučnim nastavkom koja jednoliko obrađuje sve jažice, bez dodirivanja pojedinačnih uzoraka ili jažica sondama.
- Usklađenost s normama: Uskladite svoju metodologiju s validiranim industrijskim protokolima kao što je ASTM E2799-22, čime vaši podaci dobivaju veću vjerodostojnost za regulatorne potrebe ili objavljivanje.
- Pouzdano probirno ispitivanje lijekova i terapija: Oslonite se na svoje rezultate ispitivanja osjetljivosti kako biste donosili bolje odluke o antimikrobnoj učinkovitosti, profiliranju otpornosti ili razvoju terapija.
Povećajte kapacitet svojeg laboratorija uz očuvanje vijabilnosti stanica. Navedite nam vrstu svoje mikropločice i dobijte preporuke za učinkovito odvajanje biofilma i dispergiranje stanica sonikacijom s velikim kapacitetom obrade uzoraka.
Sonikator za mikropločice UIP400MTP za odvajanje biofilma koje se može precizno kontrolirati u ispitivanjima MIC-a i MBEC-a.
Sonikacija za odvajanje biofilma
Ispitivanjem MIC-a na biofilmu obično se mjeri vijabilnost bakterija ili inhibicija rasta metodama kao što su nasađivanje na podlogu, brojanje kolonija ili mjerenje optičke gustoće. Sonikacija je ključan korak u ispitivanjima MIC-a na biofilmu pri procjeni osjetljivosti mikroorganizama povezanih s biofilmom na antimikrobna sredstva. Njezina je primarna funkcija odvajanje i dispergiranje stanica uklopljenih u matriks biofilma u jednoliku suspenziju radi točne analize.
Biofilmovi su znatno otporniji na antimikrobna sredstva od planktonskih stanica, zbog čega je pravilno odvajanje ključno za točnu analizu. Tijekom ovog postupka ultrazvučni valovi stvaraju kontroliranu kavitaciju, razarajući matriks biofilma i oslobađajući uklopljene stanice u jednoliku suspenziju u mediju za oporavak. Ovaj korak omogućuje preciznu procjenu vijabilnosti stanica dispergiranih iz biofilma metodama kao što su nasađivanje na podlogu, razrjeđivanje i brojanje kolonija. Pravilno razaranje biofilma sonikacijom sprječava zaštitno djelovanje preostalih sastavnica matriksa na stanice, koje bi inače moglo dovesti do podcjenjivanja antimikrobne aktivnosti. Sonikator za pločice s više jažica UIP400MTP osobito je prikladan za ovu namjenu jer pruža precizne i ponovljive uvjete sonikacije koji osiguravaju pouzdanu pripremu pločica za ispitivanje uz velik kapacitet obrade uzoraka.
Zašto je sonikacija nužna u ispitivanjima minimalne inhibitorne koncentracije na biofilmu
Za mjerenje vijabilnosti i brojanje stanica potrebno je potpuno i pouzdano odvajanje i dispergiranje pojedinačnih stanica. UIP400MTP pospješuje jednoliko odvajanje biofilma i dispergiranje stanica bez oštećenja radi dobivanja pouzdanih rezultata ispitivanja.
- Složenost biofilma: Biofilmovi su strukturirane mikrobne zajednice unutar matrice izvanstaničnih polimernih tvari (EPS), koja štiti mikroorganizme i čini ih otpornijima na antimikrobna sredstva.
- Ujednačena disperzija: Kako bi se točno izmjerila održivost stanica ugrađenih u biofilm ili njihova osjetljivost na antimikrobe, biofilm se najprije mora odvojiti i razbiti u homogenu suspenziju.
Dok standardni MIC mjeri planktonsku otpornost, sonikacija je ključna za ispitivanja Biofilm-MIC i MBEC kako bi se osiguralo vraćanje ispravne početne količine stanica.
Protokol ispitivanja minimalne inhibitorne koncentracije na biofilmu
Ispitivanje minimalne inhibitorne koncentracije (MIC) određuje najnižu koncentraciju antimikrobnog sredstva potrebnu za sprječavanje vidljivog rasta mikroorganizama. Ovaj je protokol namijenjen mikroorganizmima povezanima s biofilmom, a za razgradnju biofilma koristi sonikator za ploče s više jažica UIP400MTP.
Korak 1: Priprema bakterijskog inokuluma
- Pripremite bakterijsku suspenziju:
Uzgojite bakterije u odgovarajućim podlogama do srednje logaritamske faze.
Razrijedite kulturu do standardizirane gustoće stanica (npr. 0,5 McFarlandov standard ili OD600 oko 0,1). - Pripremite antimikrobne otopine:
Razrijedite antimikrobno sredstvo u odgovarajućoj podlozi kako biste dobili raspon koncentracija (npr. dvostruka serijska razrjeđenja). - Raspodijelite u pločicu s 96 jažica:
Ulijte antimikrobne otopine u jažice standardne pločice s 96 jažica, s krajnjim volumenom po jažici od ~150–200 µL.
Uključite kontrole rasta (bez antimikrobnog sredstva) i kontrole sterilnosti (bez bakterijskog inokuluma).
Korak 2: Stvaranje biofilma na poklopcu s kolčićima
- Postavite poklopac s kolčićima:
Postavite posebni poklopac s kolčićima na inokulirane jažice, pazeći da kolčići budu potpuno uronjeni u bakterijsku suspenziju. - Inkubirajte pločicu:
Inkubirajte na odgovarajućoj temperaturi (npr. 37°C) tijekom određenog vremena (npr. 24 sata) u mirnim uvjetima kako bi se na kolčićima stvorio biofilm. - Isperite kolčiće:
Uklonite poklopac s kolčićima iz bakterijske suspenzije i nježno isperite u sterilnoj fiziološkoj otopini ili PBS-u kako biste uklonili labavo pričvršćene planktonske stanice. - Izložite antimikrobnom sredstvu:
Prenesite poklopac s kolčićima u novu pločicu s 96 jažica koja sadrži ranije pripremljena antimikrobna razrjeđenja.
Inkubirajte određeno vrijeme (npr. 24 sata) u mirnim uvjetima kako bi antimikrobno sredstvo djelovalo na biofilmove.
Korak 3: Izlaganje antimikrobnom sredstvu
Sonikator za ploče s više jažica UIP400MTP za pripremu velikog broja uzoraka
Korak 4: Sonikacija sonikatorom za mikropločice UIP400MTP
Korak sonikacije ključan je za odvajanje biofilma s poklopaca s kolčićima radi procjene održivosti. Pratite ove korake za sonikator UIP400MTP:
- Pripremite postavu:
Napunite novu pločicu s 96 jažica podlogom za oporavak (npr. neutralizacijskim bujonom ili sterilnom podlogom za uzgoj) u svakoj jažici. - Prenesite poklopac s kolčićima:
Uklonite poklopac s kolčićima iz pločice s antimikrobnim tretmanom.
Isperite poklopac u sterilnoj fiziološkoj otopini ili PBS-u kako biste uklonili ostatke antimikrobnih sredstava. - Postavite pločicu u sonikator:
Pričvrstite poklopac s kolčićima na pločicu s podlogom za oporavak.
Stavite pločicu s podlogom za oporavak u sonikator UIP400MTP, pazeći da pločica stoji centrirano i stabilno, kako je opisano u priručniku. - Podesite parametre sonikacije:
Postavite parametre sonikacije na UIP400MTP (postavke se mogu prilagoditi biofilmu):
Amplituda: 70–100%.
Vrijeme sonikacije: 1–3 minute (prilagodite prema strukturi biofilma) u cikličkom načinu rada. - Sonicirajte:
Pokrenite postupak sonikacije. Ultrazvučni valovi će razgraditi matricu biofilma i otisnuti stanice u podlogu za oporavak. - Pratite postupak:
Upotrijebite priključivi senzor temperature za praćenje temperature uzoraka u jažicama. UIP400MTP se, radi hlađenja, može povezati s laboratorijskim rashladnim uređajem. - Rukovanje nakon sonikacije:
Odmah prenesite podlogu za oporavak s odvojenim biofilmom u novu sterilnu pločicu za naknadnu analizu.
(A) Ploča koja sadržava TSB s 2% glukoze, upotrijebljena za stvaranje biofilma, oporavak stanica te određivanje MIC-a i MBEC-a; (B) Poklopac s klinovima za stvaranje stafilokoknih biofilmova.
Stanice biofilma nastalog na klinovima odvojene su sonikacijom (Hielscher Ultrasound Technology) tijekom 5 min u pločama s 96 jažica koje su sadržavale svježi hranjivi medij za oporavak stanica.
(Slika i istraživanje: ©de Oliveira et al., 2016)
Korak 4: Procjena vijabilnosti
Nasijte i uzgojite odvojene biofilmove:
- Pripremite serijska razrjeđenja medija za oporavak i nasijte ih na agar radi određivanja broja jedinica koje tvore kolonije (CFU).
- Procijenite MIC:
Odredite MIC kao najnižu koncentraciju antimikrobnog sredstva koja potpuno inhibira vidljiv rast mikroorganizama u mediju za oporavak.
Prijeđite na preciznu beskontaktnu sonikaciju kako biste osigurali ujednačenu suspenziju stanica i pouzdane rezultate MIC-a!
Tko ima koristi od sonikacije tijekom testova MIC-a?
- Proizvođači medicinskih proizvoda: Za ispitivanje učinkovitosti površinskih premaza i validaciju protokola čišćenja proizvoda sklonih stvaranju biofilma.
- Klinički mikrobiolozi: Za preciznu dijagnostiku infekcija povezanih s implantatima (poput PJI-ja) izdvajanjem bakterija s medicinskih uređaja i dijelova.
- Stručnjaci za razvoj lijekova: Za procjenu učinkovitosti novih antimikrobnih sredstava protiv otpornih patogena uklopljenih u biofilm.
- Akademski istraživači: Za provedbu reproducibilnih istraživanja biologije biofilma i mehanizama antimikrobne rezistencije uz velik kapacitet obrade uzoraka.
- Timovi za kontrolu kvalitete u industriji: Za procjenu biološkog obraštanja i učinkovitosti dezinficijensa u industrijskim uvjetima (npr. primjenom normi ASTM E2799-22).
Projektiranje, proizvodnja i savjetovanje – kvaliteta proizvedena u Njemačkoj
Ultrazvučni uređaji Hielscher poznati su po najvišim standardima kvalitete i projektiranja. Robusnost i jednostavno rukovanje omogućuju nesmetanu integraciju naših ultrazvučnih uređaja u industrijska postrojenja. Sonikatori Hielscher lako se nose s teškim uvjetima i zahtjevnim okruženjima.
Hielscher Ultrasonics tvrtka je certificirana prema ISO normama koja poseban naglasak stavlja na ultrazvučne uređaje visokih performansi s najsuvremenijom tehnologijom i jednostavnim rukovanjem. Naravno, ultrazvučni uređaji Hielscher sukladni su zahtjevima za oznaku CE i ispunjavaju zahtjeve UL, CSA i RoHs.
Pojednostavnite pripremu uzoraka u pločama s 96 jažica i pločama za testiranje upotrebom sonikatora za ploče s više jažica UIP400MTP
Literatura / reference
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Često postavljana pitanja
Što je test MIC-a?
Test minimalne inhibitorne koncentracije (MIC) standardizirani je test kojim se određuje najniža koncentracija antimikrobnog sredstva potrebna za inhibiciju vidljivog rasta mikroorganizma. Obično se provodi metodama mikrodilucije u bujonu ili dilucije u agaru, pri čemu se mikroorganizmi izlažu serijskim razrjeđenjima antimikrobnog sredstva. Testovi MIC-a ključni su za procjenu antimikrobne učinkovitosti, usmjeravanje kliničkog liječenja i procjenu razina rezistencije i planktonskih mikroorganizama i mikroorganizama povezanih s biofilmom.
Koja je razlika između testa minimalne inhibitorne koncentracije na biofilmu i testa MBIC?
Test minimalne inhibitorne koncentracije (MIC) na biofilmu i test minimalne koncentracije koja inhibira stvaranje biofilma (MBIC) povezani su, ali se razlikuju po svrsi i metodologiji.
Test MIC-a na biofilmu određuje najnižu koncentraciju antimikrobnog sredstva potrebnu za inhibiciju vidljivog rasta ili vijabilnosti biofilma, usredotočujući se na stanice povezane s biofilmom umjesto na planktonske bakterije. Nasuprot tome, test MBIC-a specifično mjeri sposobnost antimikrobnog sredstva da spriječi stvaranje biofilma, umjesto da djeluje na prethodno formirane biofilmove. Iako se oba testa bave bakterijama povezanima s biofilmom, test MIC-a na biofilmu usmjeren je na liječenje, a test MBIC-a naglašava prevenciju, što ih čini komplementarnim alatima za proučavanje antimikrobne učinkovitosti protiv biofilmova.
Koji se biofilmovi upotrebljavaju u testovima MIC-a?
Mikrobni biofilmovi i planktonske stanice upotrebljavaju se u testovima minimalne inhibitorne koncentracije (MIC) za proučavanje antimikrobne učinkovitosti u različitim uvjetima.
- Planktonske stanice:
Planktonske stanice slobodno su plutajuće, pojedinačne mikrobne stanice koje služe kao standardni model za tradicionalne testove MIC-a. Uobičajeni mikroorganizmi uključuju Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus i Candida albicans. Ti testovi određuju MIC potreban za inhibiciju rasta slobodno živućih stanica i ključni su za početni probir antimikrobnih sredstava. - Stanice povezane s biofilmom:
Stanice biofilma mikroorganizmi su uklopljeni u izvanstanični matriks, koji znatno povećava njihovu otpornost na antimikrobna sredstva. Testovi MIC-a na biofilmu često uključuju:- Gram-negativne bakterije: Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa i Klebsiella pneumoniae, poznate po stvaranju biofilmova pri infekcijama i u industrijskim okruženjima.
- Gram-pozitivne bakterije: Staphylococcus aureus (uključujući MRSA), Staphylococcus epidermidis i Enterococcus faecalis, koje su često povezane s infekcijama vezanima uz medicinske proizvode.
- Gljive: Candida albicans i srodne vrste, važne kod gljivičnih infekcija povezanih s biofilmom.
- Biofilmovi mješovitih vrsta: ponekad se upotrebljavaju za oponašanje prirodnih polimikrobnih biofilmova, poput onih koji se nalaze u kroničnim ranama ili pri industrijskom biološkom obraštanju.
Usporedbom vrijednosti MIC-a za planktonske stanice i stanice povezane s biofilmom istraživači mogu procijeniti povećanu otpornost biofilmova i identificirati sredstva učinkovita protiv tih otpornijih mikrobnih zajednica.
Koja je razlika između MIC-a i MBEC-a?
Minimalna inhibitorna koncentracija (MIC) najniža je koncentracija antimikrobnog sredstva potrebna za sprječavanje stvaranja biofilma, dok je minimalna koncentracija za eradikaciju biofilma (MBEC) najniža koncentracija potrebna za eradikaciju već formiranog biofilma. MIC je usmjeren na prevenciju biofilma, dok MBEC procjenjuje učinkovitost tretmana protiv zrelih biofilmova.
Koje se pločice obično upotrebljavaju za testove MBEC-a?
Mikrotitarske pločice koje se obično upotrebljavaju za testove MBEC-a najčešće su pločice s 96 jažica izrađene od polistirena ili polipropilena. Ti materijali pružaju prikladnu površinu za stvaranje biofilma i kemijski su otporni na antimikrobna sredstva koja se ispituju tijekom testa. Polistirenske pločice često su prvi izbor zbog svoje optičke prozirnosti, koja je prednost za naknadne analize poput spektrofotometrijskih mjerenja ili mjerenja temeljenih na fluorescenciji. Konstrukcija tih pločica uključuje odvojive poklopce s klinovima, koji su ključni za test jer se biofilmovi stvaraju na klinovima uronjenima u jažice koje sadržavaju hranjive podloge. Standardizirane pločice, poput onih usklađenih s protokolom testa MBEC-a, posebno su konstruirane kako bi osigurale ponovljivost i kompatibilnost sa sonikatorom UIP400MTP ili drugom opremom za obradu.
Što su pločice s poklopcem PEG?
Pločice s PEG poklopcem specijalizirani su sustavi pločica s više jažica čiji je poklopac opremljen malim klinovima ili iglicama od polietilen-glikola (PEG) koji se protežu u svaku jažicu. Ti klinovi pružaju površinu za stvaranje mikrobnog biofilma u kontroliranim uvjetima, oponašajući rast biofilma u stvarnim uvjetima. Konstrukcija omogućuje razvoj biofilmova na klinovima dok jažice sadržavaju hranjive podloge ili antimikrobna sredstva, čime se omogućuje ispitivanje osjetljivosti biofilma na tretmane uz velik kapacitet obrade uzoraka, primjerice u testovima MBEC, MBIC i MIC.
Koja je prednost ultrazvučnog odvajanja biofilma u usporedbi sa struganjem stanica?
Ultrazvučno odvajanje biofilma pruža znatnu prednost u odnosu na struganje stanica jer omogućuje neinvazivno, ujednačeno i vrlo učinkovito uklanjanje biofilmova s površina. Za razliku od struganja, koje može biti neujednačeno i oštetiti površinu ispod biofilma ili stanice, ultrazvučni valovi prodiru u matriks biofilma i razgrađuju ga bez narušavanja cjelovitosti susjednih struktura. Ova metoda osigurava ponovljivost, smanjuje rizik od kontaminacije na najmanju moguću mjeru i osobito je učinkovita u primjenama koje zahtijevaju precizno uklanjanje biofilma, primjerice u mikrobiološkim istraživanjima ili ispitivanju medicinskih proizvoda. Pročitajte više o tome kako sonikator UIP400MTP nadmašuje struganje stanica!
Hielscher Ultrasonics proizvodi ultrazvučne homogenizatore visokih performansi, od laboratorijskih do industrijskih izvedbi.
