סוניקציה מסוג בדיקה להכנת דגימה: מדריך מקיף
סוניקציה מסוג בדיקה היא כלי רב עוצמה לשיבוש תאים, גזירת DNA ופיזור חלקיקים בדגימות נוזליות. כמו כל הטכניקות במדעי החיים, מיקרוביולוגיה ואנליזה קלינית, סוניקציה דורשת אופטימיזציה זהירה כדי למנוע נזק לדגימה, במיוחד כאשר עובדים עם חומרים רגישים לחום. על ידי ביצוע טיפים – כגון שמירת דגימות על קרח, שליטה באמפליטודת סוניקציה, שימוש במצב פולס ומיטוב עומק הטבילה של הסונוטרודה – אתה יכול להשיג תוצאות יעילות וניתנות לשחזור. בסופו של דבר, פרוטוקול סוניקציה ממוטב היטב מבטיח את ההצלחה של יישומים במורד הזרם ושומר על שלמות הדגימות היקרות שלך.
סוניקציה – שלב הכרחי בהכנת מדגם
סוניקציה מסוג בדיקה היא טכניקה נפוצה להכנת דגימות במחקר ביולוגי, כימי וחומרים. התהליך כולל שימוש באנרגיה על-קולית כדי לפרק תאים, לגזור DNA, לפזר ננו-חלקיקים או לתמול. העברת גלי אולטרסאונד באנרגיה גבוהה דרך דגימה נוזלית באמצעות בדיקה (סונוטרודה, קרן, סונופרוב), סוניקציה מסוג בדיקה יוצרת אזורים מקומיים של לחץ גבוה, מערבולות וקוויטציה, אשר משבשת מכנית מבנים תאיים או מפזרת חלקיקים הומוגניים. עם זאת, הטכניקה דורשת אופטימיזציה זהירה כדי למנוע פגיעה בדגימה, במיוחד חומרים ביולוגיים רגישים כגון חלבונים וחומצות גרעין. מדריך זה על סוניקציה מסוג בדיקה נותן עצות מעשיות להכנת דגימה יעילה.

המעבדה האולטרסונית הומוגנייזר UP200Ht פופולרי במעבדות מחקר להכנת דגימות, ליזיס, מיצוי, פיצול DNA והמסתו.
- התאמת הגדרות משרעת
משרעת סוניקציה מתייחסת לגודל התנודות המיוצרות על ידי הגשושית. אמפליטודות גבוהות יותר מספקות אנרגיה על-קולית אינטנסיבית יותר אך מייצרות יותר חום, מה שמגדיל את הסיכון להתפרקות דגימה. לעומת זאת, אמפליטודות נמוכות יותר מספקות סוניקציה עדינה יותר, המפחיתות את הצטברות החום תוך שמירה על שלמות הדגימה.
בהתאם ליישום הספציפי שלך, שימוש באמפליטודה נמוכה יותר על פני תקופה ארוכה יותר עשוי לספק תוצאות טובות יותר מאשר החלת משרעת גבוהה מאוד עבור התפרצויות קצרות. גישה זו מפחיתה את הסיכוי להתפרקות תרמית תוך הבטחת הפרעה או ערבוב נאותים של הדגימה. - שימוש בפרוטוקולי נתונים אוטומטיים
התפריט החכם של כל הסוניקטור הדיגיטלי Hielscher תכונה הקלטת נתונים אוטומטית. ברגע שאתה מפעיל את הסוניקטור, כל הנתונים החשובים כגון קלט אנרגיה (סה"כ ונטו), משרעת, כוח, זמן – אפילו טמפרטורה ולחץ מנוטרים אם חיברת את חיישני הטמפרטורה והלחץ. כל הנתונים נכתבים עם חותמת תאריך ושעה כקובץ CSV על כרטיס SD מובנה.
- אופטימיזציה של קלט אנרגיה: קבל את הכמות הנכונה של כוח אולטרסאונד
אופטימיזציה של עיבוד אולטראסוני על ידי קלט אנרגיה ספציפי (Ws/mL) מציעה גישה ניתנת לשחזור וניתנת לכימות יותר מאשר פרוטוקולים מבוססי זמן. בעוד שמשך הסוניקציה נשאר גורם, האנרגיה הכוללת המועברת ליחידת נפח היא שקובעת בסופו של דבר את היקף שיבוש הדגימה. קלט אנרגיה לא מספק עלול לגרום לליזה או פיזור לא שלמים, בעוד שקלט מוגזם עלול לגרום לפירוק מולקולרי, דנטורציה של חלבונים או התחממות יתר - במיוחד במערכות ביולוגיות או פולימריות רגישות.
הטיפ שלנו: התחל עם כניסות אנרגיה ספציפיות נמוכות - בדרך כלל בטווח של 10-50 Ws/mL, תלוי בסוג הדגימה - והגדל בהדרגה לפי הצורך. עקוב אחר התהליך על ידי הערכת שינויים פיזיים (למשל, עכירות, צמיגות, פיזור חלקיקים) וצפה באינדיקטורים של סוניקציה יתר כגון קצף מוגזם, עליית טמפרטורה או שינוי צבע דגימה. התאם את המשרעת, מחזור הדופק ומשך הזמן בהתאם כדי להגיע למינון האנרגיה היעד תוך מזעור הלחץ התרמי או המכני. - השתמש במצב פולס כדי למזער הצטברות חום
ניתן להפעיל את הסוניקטורים של Hielscher במצב דופק, וזה שימושי במיוחד עבור דגימות רגישות לטמפרטורה. מצב פולס עובר לסירוגין בין שלבי סוניקציה ומנוחה, ומאפשר לדגימה להתקרר בין פולסים. זה מונע קפיצות טמפרטורה מהירות, וממזער את הסיכון להתדרדרות הנגרמת על ידי חום. - החשיבות של בקרת טמפרטורה: שמרו על הדגימות שלכם קרירות
סוניקציה מעבירה אנרגיה קולית לתוך הנוזל, יצירת חום עקב מערבולות וחיכוך. אם לא בודקים את זה, זה יכול להוביל לטמפרטורות גבוהות, שעלולות לפגוע בדגימות ביולוגיות רגישות, כגון חלבונים, אנזימים וחומצות גרעין. כדי למתן זאת, בקרת הטמפרטורה היא קריטית במהלך סוניקציה.
אחת הדרכים הפשוטות והיעילות ביותר למנוע התחממות יתר היא לשמור את הדגימות על קרח לאורך כל תהליך הסוניקציה. זה עוזר לשמור על טמפרטורה יציבה ונמוכה ומגן על הדגימה מפני התפרקות תרמית.
כל הסוניקטורים הדיגיטליים של Hielscher כוללים ניטור טמפרטורה. חיישן טמפרטורה הניתן לחיבור מודד ברציפות את הטמפרטורה בדגימה. בהתאם למגבלת הטמפרטורה שנקבעה בתוכנית, הסוניקטור משתהה אוטומטית כאשר מגיעים לגבול הטמפרטורה העליון וממשיך לסוניק ברגע שמגיעים לגבול התחתון של דלתא הטמפרטורה שנקבעה.
בנוסף, באפשרותך:- הניחו את שפופרת הדגימה על קרח לפני תחילת תהליך הסוניקציה.
- השהה מעת לעת את הסוניקציה כדי לאפשר קירור אם יש צורך בהפעלות ממושכות.
- שמור את הדגימה על קרח לאחר סוניקציה כדי לייצב אותו עוד יותר.
זה חשוב במיוחד עבור דגימות חלבון, כמו חלבונים יכולים denature במהירות בטמפרטורות גבוהות. על ידי שמירה על הדגימות שלך קרות, אתה שומר על שלמותן התפקודית עבור יישומים במורד הזרם, כגון כתמים מערביים, בדיקות אנזימים או ספקטרומטריית מסות.
- גודל הסונוטרוד הנכון עבור המדגם שלך
בחירת גודל הסונוטרוד הנכון לסוניקציה לדוגמה במדעי החיים ובמיקרוביולוגיה חיונית להבטחת העברת אנרגיה אופטימלית ושיבוש יעיל של תאים או ביומולקולות. סונוטרודה בגודל מתאים מאפשרת קוויטציה יעילה, החיונית לפירוק דפנות תאים, תאים שוכבים והומוגניזציה של דגימות. אם הסונוטרוד גדול מדי או קטן מדי עבור נפח או סוג הדגימה, הוא עלול להוביל לסוניקציה לא אחידה, חימום מוגזם או הפרעה לא מספקת לתאים, מה שעלול לסכן את תוצאות הניסוי. לכן, בחירת גודל הסונוטרוד המתאים מסייעת לשמור על שלמות הדגימה ומבטיחה יכולת שחזור בניסויים.
- עומק בדיקה נכון: יש להימנע מהקצפה ומחשיפה אחידה
מיקום הגשושית הוא גורם קריטי אך לעתים קרובות מתעלמים ממנו בסוניקציה. עומק בדיקה נכון מבטיח העברת אנרגיה יעילה וערבוב דגימות. אם הבדיקה רדודה מדי, אתה עלול לחוות הקצפה מוגזמת, אשר יכול ללכוד בועות אוויר ולהפחית את האפקטיביות של סוניקציה. אם הגשושית עמוקה מדי, ייתכן שלא תשיג זרימת דם מספקת, מה שיוביל לסוניק לא אחיד של הדגימה.
עומק הבדיקה האידיאלי נופל בדרך כלל בין 1/4 ל -1/3 מגובה הנוזל בצינור או במיכל. התנסו בעומקים שונים כדי למצוא את המיקום האופטימלי שממקסם את העברת האנרגיה מבלי לגרום להקצפה.
מיכל דגימה גדול עשוי להפיק תועלת מהעברת הסונוטרוד באיטיות דרך הדגימה כדי להבטיח סוניקציה אחידה של הדגימה כולה.
אם אתה משתמש בדגמי הסוניקטור מרובי הדגימות CupHorn או UIP400MTP, מלא את ה- cuphorn כמתואר במדריך. - מטב את תהליך הסוניקציה: התאם אישית את הדגימה שלך
המפתח לסוניקציה מוצלחת מסוג בדיקה הוא אופטימיזציה. מכיוון שדגימות שונות, כולל תאים, רקמות וכימיקלים, מגיבות באופן שונה לאנרגיה על-קולית, חשוב להתאים את התהליך לצרכים הספציפיים שלך. גורמים שיש לקחת בחשבון במהלך האופטימיזציה כוללים:
נפח לדוגמה: נפחים גדולים יותר עשויים לדרוש זמני סוניקציה ארוכים יותר או אמפליטודות גבוהות יותר.
צמיגות הדגימה: דגימות צמיגות עשויות להזדקק לסוניקציה חזקה יותר כדי להשיג הפרעה מספקת.
התוצאה הרצויה: אם אתה שוכב רקמות קשות ייתכן שיהיה צורך במשטר סוניקציה אינטנסיבי יותר, בעוד שסוניקציה קצרה יותר עשויה להספיק לגזירת DNA.
על ידי בדיקה שיטתית ושכלול הפרמטרים – כגון, משרעת, משך ועומק בדיקה - אתה יכול למטב את תהליך הסוניקציה עבור הדגימה הייחודית שלך.
מצא את הסוניקטור המתאים למשימת הכנת הדגימה שלך
Hielscher Ultrasonics מציעה תיק ספקטרום מלא של sonicators עבור משימת הכנת הדגימה שלך. ספר לנו גורמים חשובים כגון סוג הדגימה, אמצעי האחסון והיישום הספציפי שאתה עובד עליו. צוות המומחים שלנו ישמח להתייעץ איתך ולהציע את ההומוגנייזר הקולי המתאים ביותר לניסויי המחקר שלך.
הטבלה הבאה נותנת לך אינדיקציה לגבי יכולת העיבוד המשוערת של האולטרסאונד בגודל מעבדה שלנו:
מכשירים מומלצים | נפח אצווה | קצב זרימה |
---|---|---|
UIP400MTP סוניק צלחת 96 בארות | צלחות מרובות באר / מיקרוטיטר | נ.א. |
כוסית אולטראסונית | CupHorn עבור בקבוקונים או | נ.א. |
GDmini2 | כור מיקרו-זרימה על-קולי | נ.א. |
VialTweeter | 00.5 עד 1.5 מ"ל | נ.א. |
UP100H | 1 עד 500 מ"ל | 10 עד 200 מ"ל/דקה |
UP200Ht, UP200ST | 10 עד 1000 מ"ל | 20 עד 200 מ"ל/דקה |
UP400ST | 10 עד 2000 מ"ל | 20 עד 400 מ"ל/דקה |
שייקר מסננת אולטראסוני | נ.א. | נ.א. |
Hielscher Ultrasonics היא חברה מוסמכת ISO לשים דגש מיוחד על ultrasonicators ביצועים גבוהים שמציעות טכנולוגיה חדישה וידידותיות למשתמש. כמובן, Hielscher ultrasonicators הם תואמי CE ולעמוד בדרישות של UL, CSA ו RoHs.

Hielscher Ultrasonics מספקת סוניקטורים חזקים ללא מגע להכנת מדגם וניתוח קליני. UIP400MTP הסוניקטור של הצלחת מרובת הבארות, ה-VialTweeter, הגביע ו סוניק הזרימה GDmini2 לעבד את הדגימות מבלי לגעת בהן.
- יעילות גבוהה
- טכנולוגיה חדישה
- מהימנות & חוסן
- בקרת תהליך מתכווננת ומדויקת
- אצווה & מוטבעים
- עבור כל אמצעי אחסון
- תוכנה חכמה
- תכונות חכמות (למשל, ניתנות לתכנות, פרוטוקול נתונים, שלט רחוק)
- קל ובטוח לתפעול
- תחזוקה נמוכה
- CIP (נקי במקום)

VialTweeter sonicator עבור סוניקציה בו זמנית של 10 דגימות, למשל, לשבש תאים, לחלץ חלבונים ולגזור דנ"א
ספרות / מקורות
- Claudia Lindemann, Nataliya Lupilova, Alexandra Müller, Bettina Warscheid, Helmut E. Meyer, Katja Kuhlmann, Martin Eisenacher, Lars I. Leichert (2013): Redox Proteomics Uncovers Peroxynitrite-Sensitive Proteins that Help Escherichia coli to Overcome Nitrosative Stress. J Biol Chem. 2013 Jul 5; 288(27): 19698–19714.
- Turrini, Federica; Donno, Dario; Beccaro, Gabriele; Zunin, Paola; Pittaluga, Anna; Boggia, Raffaella (2019): Pulsed Ultrasound-Assisted Extraction as an Alternative Method to Conventional Maceration for the Extraction of the Polyphenolic Fraction of Ribes nigrum Buds: A New Category of Food Supplements Proposed by The FINNOVER Project. Foods. 8. 466; 2019
- Giricz Z., Varga Z.V., Koncsos G., Nagy C.T., Görbe A., Mentzer R.M. Jr, Gottlieb R.A., Ferdinandy P. (2017): Autophagosome formation is required for cardioprotection by chloramphenicol. Life Science Oct 2017. 11-16.
- Hemida, Yasmine (2016): Effect of Rapamycin as an Inhibitor of the mTOR Cell Cycle Entry Complex on the Selective Lysis of Human Leukemia Cells Lines in Vitro Using 20 kHz Pulsed Low-Frequency Ultrasound. Honors Capstone Projects – All. 942, 2016.
- Fernandes, Luz; Santos, Hugo; Nunes-Miranda, J.; Lodeiro, Carlos; Capelo, Jose (2011): Ultrasonic Enhanced Applications in Proteomics Workflows: single probe versus multiprobe. Journal of Integrated OMICS 1, 2011.
- Priego-Capote, Feliciano; Castro, María (2004): Analytical uses of ultrasound – I. Sample preparation. TrAC Trends in Analytical Chemistry 23, 2004. 644-653.
- Welna, Maja; Szymczycha-Madeja, Anna; Pohl, Pawel (2011): Quality of the Trace Element Analysis: Sample Preparation Steps. In: Wide Spectra of Quality Control; InTechOpen 2011.
שאלות נפוצות
מהי מטרת הסוניקציה?
מטרת הסוניקציה היא להשתמש בגלי קול, בדרך כלל בטווח העל-קולי, כדי לעורר חלקיקים בדגימה, ולהקל על תהליכים כמו שיבוש תאים, הומוגניזציה ופירוק מבנים מולקולריים. הוא משמש בדרך כלל ביישומים ביולוגיים, כימיים ומדעי החומרים כדי לשפר ערבוב, לקדם תגובות או לשחרר תוכן תאי.
מהי טכניקת הסוניקציה?
טכניקת הסוניקציה כוללת שימוש בגלי אולטרסאונד אינטנסיביים (בדרך כלל בתדרים שבין 20 – 30 קילוהרץ) ליצירת תנודות מהירות בתווך נוזלי. תנודות אלה גורמות להיווצרות וקריסה של בועות מיקרוסקופיות, תהליך המכונה קוויטציה אקוסטית. קוויטציה זו יוצרת לחץ וטמפרטורה גבוהים מקומיים, שיכולים לשבש תאים, לפזר חלקיקים או להקל על תגובות כימיות. טכניקת הסוניקציה נמצאת בשימוש נרחב במעבדות ליישומים כגון ליזה של תאים, מיצוי, גזירת DNA, הומוגניזציה וסינתזה של ננו-חלקיקים.
איך מכינים דגימה לסוניקציה?
כדי להכין דגימה לסוניקציה, חומר הדגימה (בדרך כלל מוצקים נוזליים או מרחפים) מונח במיכל מתאים, לעתים קרובות בקבוק זכוכית, צינור פלסטיק או צלחת מרובת בארות, עם נפח מספיק כדי להכיל את התנודות העל-קוליות ולמנוע שפיכה. במידת הצורך, הדגימה מדוללת בחיץ או ממס כדי לשמור על הריכוז הרצוי ולמנוע התחממות יתר במהלך סוניקציה. עבור דגימות רגישות לחום, המיכל שקוע חלקית באמבט קרח או מעיל קירור כדי לפזר את החום שנוצר על ידי גלים קוליים. הבדיקה של הסוניקטור ממוקמת כראוי כדי להבטיח העברת אנרגיה יעילה. הפרמטרים כמו משרעת, זמן ומצב דופק נקבעים בהתבסס על הדרישות הספציפיות של הניסוי.
האם סוניקציה שוברת DNA?
כן, סוניקציה יכולה לשבור דנ"א. הגלים העל-קוליים בעלי האנרגיה הגבוהה הנוצרים במהלך סוניקציה יכולים לגזור מולקולות דנ"א על ידי יצירת אזורים מקומיים של לחץ וחום גבוהים, מה שמוביל ללחץ מכני על גדילי הדנ"א. התוצאה היא פיצול הדנ"א לחתיכות קטנות יותר. מידת שבירת הדנ"א תלויה במשך ובעוצמת הסוניקציה. בניסויים מסוימים, כגון במשקעים חיסוניים של כרומטין (ChIP) או בהכנת ספריית ריצוף מהדור הבא (NGS), סוניקציה משמשת כטכניקה אמינה לגזירה מבוקרת של דנ"א.

Hielscher Ultrasonics מייצרת הומוגנייזרים קוליים בעלי ביצועים גבוהים מ המעבדה ל גודל תעשייתי.