Metaboloomika, mida hõlbustab suure läbilaskevõimega ultrahelitöötlus
Metaboloomika on uurimisvaldkond, mis kasutab suure läbilaskevõimega tehnikaid väikeste molekulide iseloomustamiseks ja kvantifitseerimiseks erinevates biovedelikes, nagu uriin, seerum, plasma, väljaheited ja sülg, paljastades ainulaadsed metaboolsed allkirjad. Suure läbilaskevõimega sonikaatori UIP400MTP, mis on mõeldud mitme kaevuga plaatidele, on võimas vahend rakkude lüüsimiseks nendes proovides, hõlbustades metaboliitide vabanemist järgnevaks analüüsiks. See täpne ja usaldusväärne lähenemine on oluline metaboloomika jaoks, kus täpne uuringu kavandamine, hoolikas proovi ettevalmistamine, optimeeritud platvormi seadistamine, põhjalik andmete analüüs ja sisukas bioloogiline tõlgendamine on ülimalt tähtsad. Metaboloomika kasutab nii sihipäraseid lähenemisviise, mis keskenduvad konkreetsetele molekulide klassidele, nagu süsivesikud, lipiidid ja aminohapped, kui ka mittesihipäraseid tehnikaid, mis annavad laia ülevaate proovi metaboolsetest profiilidest, paljastades metaboolse signaalimise keeruka keerukuse.
UIP400MTP on kontaktivaba, suure läbilaskevõimega sonikaator rakkude lüüsimiseks ja metaboliitide ekstraheerimiseks mitme süvendiga plaatidel
Suure läbilaskevõimega proovi ettevalmistamine 96-augulise plaadi sonikaatoriga UIP400MTP
Kontaktivaba sonikaatori UIP400MTP kasutamine koos 96-süvendiga plaatidega on tõhus meetod suure läbilaskevõimega homogeniseerimiseks ja metaboliitide ekstraheerimiseks. See seadistus väldib otsest kokkupuudet prooviga, vähendades ristsaastumise ohtu mitme proovi samaaegsel töötlemisel.
Samm-sammuline protokoll homogeniseerimiseks 96-süvendiga Sonicator UIP400MTP
- Metaboloomiliste proovide valmistamine
Proovi paigutus: Iga proov (nt väljaheited, soolekude või luminaalne sisu) jaotatakse 96-augulise plaadi või mikroplaadi eraldi aukudesse.
Lahusti: Orgaanilised lahustid, nagu metanool, etanool, atsetonitriil, kloroform ja nende (vesi)segud, on metaboliitide ekstraheerimiseks hädavajalikud, aidates kaasa rakusiseste metaboliitide vabanemisele rakumaatriksist. Süvendi kohta kasutatakse 100–300 μl lahustit, tagades piisava mahu proovi täielikuks sukeldamiseks.
Sisestandardid: Valikuliselt lisage igasse auku sisestandardid normaliseerimiseks allavoolu metaboloomilise analüüsi käigus. - Siduri keskmise seadistus
Veetase: Asetage 96welli plaat veega täidetud ultrahelitöötlusplatvormile (ühendusvahend), nagu on kirjeldatud juhendis. - UIP400MTP Parameetrite konfiguratsioon
Võimsuse seaded: Efektiivseks homogeniseerimiseks reguleerige ultraheli amplituud 50–80% -ni maksimaalsest võimsusest.
Impulsi režiim: Seadke ultrahelitöötlustsükkel vahelduvatele impulssidele (nt 30 sekundit SEES, 30 sekundit VÄLJAS), et võimaldada jahutamist ja vältida proovi ülekuumenemist.
Koguaeg: 4–10 minutit, sõltuvalt proovi keerukusest ja tugevusest.
Temperatuuri reguleerimine: Kasutage ultrahelitöötluse ajal vee hoidmiseks 4–8 ° C juures laboratoorset jahutit, et kaitsta kuumatundlikke metaboliite. - ultrahelitöötluse protsess
Alustage ultrahelitöötlustsüklite UIP400MTP.
Jälgige protsessi UIP400MTP liidese kaudu.
Kavitatsiooniefekt homogeniseerib proovid ja lüüsib rakke süvendites, vabastades rakusisesed metaboliidid lahustisse. - PostSonication
Tsentrifuugimine: Pärast ultrahelitöötlust viige plaadi sisu vajadusel kogumistorudesse. Tsentrifuugitakse 4 000–6 000 × g juures 10 minutit, et granuleerida lahustumatuid prahti ja rakulist materjali.
Supernatandi kollektsioon: Supernatant viiakse ettevaatlikult igast august analüüsimiseks uutesse katseklaasidesse või plaatidesse.
Kuivatamine ei ole kohustuslik: Kuivatatakse supernatandid, kasutades vaakumkontsentraatorit (nt SpeedVac), kui on vaja kontsentreerida, ning lahustatakse seejärel väikeses koguses sobivas lahustis.
Kasutage ära UIP400MTP mitme kaevuga plaadisonikaatori suure läbilaskevõimega töötlemisvõimet ja hõlbustage oma metaboloomilisi uuringuid ja analüüse!
UIP400MTP suure läbilaskevõimega sonikaator metaboloomilisteks uuringuteks mitme auguga taldrikutes, 96 auguga taldrikutes, torudes ja Petri tassides.
UIP400MTP Multiwell Plate Sonicator suure läbilaskevõimega proovide ettevalmistamiseks metaboloomilistes uuringutes.
Kontaktivaba ultrahelitöötluse põhimõte UIP400MTP
UIP400MTP rakendab ultraheli laineid 96-augulise plaadi kaevudele kaudselt ühenduskeskkonna (nt vee) kaudu. Need lained tekitavad kavitatsiooni, mis häirib rakke ja vabastab metaboliite ilma füüsilise kontaktita sonikaatori sondi ja proovi vahel.
“Kirjutan, et tänada teid fantastilise kogemuse eest, kasutades teie UIP400MTP sonikaatorit fekaalide mikrobioomi proovide ühtlaseks ja järjepidevaks bakteriaalseks lüüsiks. Lükkame ümbriku suure läbilaskevõimega lüüsitehnoloogia jaoks ja teie instrument sobib selle ülesande täitmiseks hästi. Mõned peamised esiletõstmised on järgmised:
- Lihtne kasutada – Instrumenti on lihtne kasutada ja menüüvalikute abil on kohandamine lihtne
- suur läbilaskevõime – Suurepärane plaatide käsitsemiseks, 96 prooviga korraga
- Kõigi laevade ühtlane ultrahelitöötlus – Seade suutis kõikidele kaevudele pakkuda sama palju ultrahelitöötlust, mis oli meie rakenduse jaoks ülioluline
- Hielscheri meeskonna toetus – Toetus oli suurepärane, olite alati meie jaoks koolitusel olemas, et vastata meie küsimustele ja lahendada probleeme, koos soovitustega, mis aitasid meil oma eesmärgini jõuda.
Tänan teid veel kord abi ja abi eest, kui töötasime oma protokollide optimeerimise nimel.”
Mark D. Driscoll, Ph.D. – Teadusdirektor – Intus Biosciences
Mitme auguga plaadi sonikaatori UIP400MTP hõlbustab suure läbilaskevõimega proovi ettevalmistamist, nt metaboliitide uurimisel ja analüüsimisel.
96-augulise plaadi sonikaatori UIP400MTP: Ultraheli edastav vedelik ümbritseb kõiki süvendeid ja tagab iga proovi ühtlase ultrahelitöötluse
UIP400MTP Multi-well plaadi sonikaatori põhijooned
| suure läbilaskevõimega ultrahelitöötlus | Sobib ideaalselt 96-süvenditele ja muudele mitmekihilistele plaatidele, UIP400MTP võimaldab mitme proovi samaaegset, identset ultrahelitöötlust, lühendades oluliselt proovi ettevalmistamise kestust ja suurendades suure proovide arvu testimise läbilaskevõimet. |
| Kasutage oma valitud mitmekihilist plaati | UIP400MTP on mõeldud mis tahes standardsete mitmekihiliste plaatide, PCR-plaatide või mikrotiiterplaatide sonikeerimiseks. Valite oma katseteks kõige sobivama plaadi. Kuna UIP400MTP ei vaja varalisi tarbekaupu, säästab see palju raha! |
| Kontaktivaba ultraheliuuring | Multiwell Plate Sonicator rakendab UIP400MTP intensiivset ultraheli ilma proovi midagi sisestamata. Saate sonikeerida ealed mitmekihilisi plaate, suletud anumaid ja viaale. Hielscher varustab teid kohandatud proovihoidjatega mis tahes mittestandardsete viaalide või anumate jaoks. |
| Täpsus ja kontroll | Täpne kontroll ja nutikas tarkvara võimaldavad teil seadistada ultraheli parameetrid vastavalt teie konkreetsetele töötlemisvajadustele optimaalselt. Iga katse jaoks saate maksimaalse ultrahelitöötluse efektiivsuse ja tõhususe. |
| temperatuuri reguleerimine | Määrake oma ultrahelitöötluse jaoks konkreetne temperatuur. Plaadi sonikaatori UIP400MTP saab jälgida proovi temperatuuri ja reguleerida ultrahelitöötlust vastavalt. Retsirkuleeriv jahutusvedelik jahutab plaadi iga auku temperatuuri täpseks reguleerimiseks. |
| Protokollimine ja kaugjuhtimispult | Iga ultrahelitöötluse jooksu saab juhtida arvutist. Tarkvara pole vaja installida. Saate kasutada oma standardset brauserit (nt Chrome, Firefox, Edge või Safari) mis tahes operatsioonisüsteemis (nt MacOS, Windows, Android, iOS või Linux), et UIP400MTP kaugjuhtida ja jälgida. Iga ultrahelitöötluse käik toodab üksikasjaliku ultrahelitöötluse protokolli hindamiseks ja dokumenteerimiseks. Protokollifail on patenteerimata CSV-vormingus, mille saate avada oma eelistatud programmiga, nt Microsoft Excel, Apple Number või OpenOffice Calc. |
| Tugev ja usaldusväärne | Saksamaal kõrgeimate kvaliteedistandardite kohaselt projekteeritud ja ehitatud UIP400MTP pole mitte ainult võimas, vaid ka märkimisväärselt vastupidav. Selle disain vastab tööstuslikele standarditele ja talub kergesti igapäevase kasutamise rangust nõudlikus laborikeskkonnas. Suure läbilaskevõimega operatsioonides saate UIP400MTP kasutada pidevalt 24 tundi, 7 päeva nädalas. |
- kõrge kasutegur
- Kaasaegne tehnoloogia
- Usaldusväärsuse & töökindlus
- reguleeritav, täpne protsessi juhtimine
- Intelligentne tarkvara
- nutikad funktsioonid (nt programmeeritavad, andmeprotokollid, kaugjuhtimispult)
- lihtne ja ohutu kasutada
- madal hooldus
- CIP (puhas kohapeal)
Disain, tootmine ja nõustamine – Kvaliteet Valmistatud Saksamaal
Hielscheri ultrasonikaatorid on tuntud oma kõrgeimate kvaliteedi- ja disainistandardite poolest. Vastupidavus ja lihtne kasutamine võimaldavad meie ultrasonikaatorite sujuvat integreerimist tööstusrajatistesse. Hielscheri ultrasonikaatorid saavad kergesti käsitseda karmid tingimused ja nõudlikud keskkonnad.
Hielscher Ultrasonics on ISO sertifitseeritud ettevõte ja paneb erilist rõhku suure jõudlusega ultrasonikaatoritele, millel on tipptasemel tehnoloogia ja kasutajasõbralikkus. Loomulikult on Hielscheri ultrasonikaatorid CE-nõuetele vastavad ja vastavad UL, CSA ja RoHs nõuetele.
Kontaktivaba sonikaatori UIP400MTP metaboloomilise proovi ettevalmistamiseks mikroplaatidel.
Kirjandus / Viited
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Korduma kippuvad küsimused metaboloomiliste uuringute kohta
Mis on mikrobioom?
Mikrobioom viitab mikroorganismide, sealhulgas bakterite, viiruste, seente ja arhede kollektiivsele kogukonnale, samuti nende geneetilisele materjalile, mis elavad konkreetses keskkonnas, näiteks inimkehas. See mängib peremeesorganismi tervises kriitilist rolli, mõjutades ainevahetust, immuunfunktsiooni ja kaitset patogeenide eest, samal ajal kui seda kujundavad sellised tegurid nagu toitumine, elustiil ja keskkond.
Mis on metaboloomika?
Metaboloomika on metaboliitide põhjalik uurimine, mis on väikesed molekulid, mis tekivad bioloogilise süsteemi ainevahetusprotsesside käigus. See hõlmab nende molekulide tuvastamist, kvantifitseerimist ja analüüsi, et mõista raku funktsioone, metaboolseid radu ja seda, kuidas nad reageerivad geneetilistele, keskkonna- või patoloogilistele muutustele.
Mis on metaboloom?
Metaboloom on väikeste molekulide või metaboliitide täielik kogum, mis esineb teatud ajahetkel bioloogilises süsteemis, näiteks rakus, koes või organismis. See peegeldab süsteemi biokeemilist aktiivsust ja füsioloogilist seisundit, andes ülevaate ainevahetusest ja selle vastasmõjudest keskkonnaga.
Hielscher Ultrasonics toodab suure jõudlusega ultraheli homogenisaatoreid alates Lab kuni tööstuslik suurus.