Как ултразвуковата обработка може значително да повиши ефективността на лизозима при лизис на бактериални клетки
, Kathrin Hielscher, публикувано в Новини от Hielscher
Разрушаването на бактериалните клетки е критична стъпка в биотехнологиите, фармацевтичните изследвания и производството на протеини. Един от най-често използваните инструменти за тази цел е лизозимът – ензим, който отслабва бактериалните клетъчни стени. Но макар лизозимът да е ефективен, самостоятелно той често не действа достатъчно бързо или достатъчно силно – особено при работа с плътни култури или бактерии, генетично модифицирани за свръхекспресия на протеини.
Тук се намесва ултразвуковата обработка. Изследователите все по-често разчитат на нея, за да подобрят значително клетъчния лизис с лизозим. Когато се използват заедно, лизозимът и ултразвуковата обработка образуват високоефективна система с взаимно допълващо се действие, която осигурява по-бързи, по-пълни и по-възпроизводими резултати.
Защо лизозимът самостоятелно често не е достатъчен
Лизозимът действа чрез разграждане на пептидогликана – основен структурен компонент на бактериалните клетъчни стени. Този ензимен подход е щадящ и широко използван, особено при E. coli. В реални лабораторни условия обаче обработката само с лизозим може да има ограничения.
Често срещаните затруднения включват:
- Непълно разрушаване на клетките в култури с висока плътност или с клетъчни агрегати
- Продължително време за инкубация
- Намалена ефективност при бактерии със свръхекспресия или адаптирани към стрес
- Вариации между партидите
Тези ограничения могат да повлияят отрицателно на последващите процеси като извличане на протеини, избистряне и пречистване – като в крайна сметка намалят добива и постоянството на резултатите.
Научната основа на синергията между лизозима и ултразвуковата обработка
Ултразвуковата обработка въвежда ултразвукови вълни с висок интензитет в течна проба. Тези вълни генерират микроскопични мехурчета, които бързо колабират в процес, известен като кавитация. Възникващите сили на срязване, промени в налягането и микроструи физически разрушават клетъчните структури.
Когато ултразвуковата обработка се прилага след обработката с лизозим – или едновременно с нея – двата метода взаимно усилват действието си по няколко важни начина:
- По-лесен достъп до клетъчната стена
Лизозимът отслабва бактериалната клетъчна стена, като я прави много по-уязвима към механичните сили, създавани от ултразвука. - По-бърз клетъчен лизис
Ултразвуковата енергия значително съкращава времето, необходимо за пълно разрушаване на клетките, в сравнение със самостоятелната ензимна обработка. - По-равномерна обработка
Ултразвуковата обработка подобрява смесването, като осигурява равномерно излагане на всички клетки както на лизозима, така и на механичното натоварване. - По-високи добиви на протеини
По-пълният лизис означава по-голямо освобождаване на вътреклетъчни протеини, ензими и метаболити – което подобрява общото им извличане.
Типичен работен процес за ултразвукова обработка с помощта на лизозим
В лабораториите, работещи с бактериални щамове със свръхекспресия, утвърден работен процес съчетава ензимен и ултразвуков лизис:
- Ресуспендиране на клетките
Събраните бактериални утайки се ресуспендират в подходящ буфер за лизис, съдържащ лизозим, обикновено в концентрации от 0,1–1 mg/mL. Щадящата ултразвукова обработка подпомага бързото и равномерно ресуспендиране на клетките. - Предварителна ензимна обработка
Суспензията се инкубира в продължение на 10–30 минути при контролирани температури (обикновено между 4 °C и 25 °C), което позволява на лизозима да отслаби клетъчната стена. - Ултразвуково разрушаване
Предварително обработената суспензия се подлага на ултразвукова обработка с ултразвуков процесор Hielscher при оптимизирани амплитуда, импулсен режим и охлаждане. - Избистряне
Клетъчните остатъци се отстраняват чрез центрофугиране или филтриране, като остава избистрен лизат, богат на целевите протеини.
Защо изследователите избират ултразвуковите апарати Hielscher
Ултразвуковите апарати Hielscher са особено подходящи за клетъчен лизис с помощта на лизозим благодарение на своята прецизност и гъвкавост. Основните предимства включват:
- Регулируема амплитуда и подавана енергия за възпроизводима обработка
- Работа в импулсен режим за намаляване на натрупването на топлина
- Ефективна кавитация в широк диапазон от обеми и вискозитети
- Лесно мащабиране от лабораторни проби с микролитров обем до промишлено производство
Тази комбинация превръща системите Hielscher в ценни инструменти както за изследователските лаборатории, така и за широкомащабното производство.
Ултразвуков апарат UIP400MTP за многогнездови плаки за подготовка на проби с висок капацитет за обработка
Ключови фактори за оптимизиране на резултатите
За да извлекат максимална полза от ултразвуковата обработка с помощта на лизозим, изследователите внимателно настройват няколко параметъра:
- Концентрация на лизозима: Използвайте най-ниската ефективна доза, за да контролирате разходите и да сведете до минимум смущенията в последващите процеси.
- Ултразвукова енергия: Прилагайте достатъчна мощност, за да осигурите пълен лизис, без да увреждате чувствителните протеини.
- Контрол на температурата: Охлаждащите системи или ледените бани помагат да се защитят термочувствителните целеви вещества.
- Настройки на импулсния режим: Ултразвуковата обработка с прекъсвания подобрява ефективността на кавитацията и стабилността на пробата.
Повишете ефективността на лизозимите с ултразвукова обработка!
Съчетаването на лизозим с ултразвуково разрушаване предлага надеждно, високопроизводително решение за лизис на бактериални клетки. Ултразвуковата обработка повишава ефективността на ензимната обработка, като осигурява по-бърза обработка, по-пълно разрушаване и по-високи добиви на вътреклетъчни продукти.
С прецизно управляеми и мащабируеми ултразвукови системи като тези на Hielscher изследователите могат да настройват фино работните си процеси, за да отговорят на изискванията на съвременните биотехнологии – независимо дали в малка лаборатория, или на промишлена производствена линия.
Лизис на бактерии с висок капацитет за обработка на проби с ултразвуковия апарат UIP400MTP за микроплаки
Литература / Източници
- Ghosh, A., Bhar, K. & Siddhanta, A. (2019): Oxygen sequestration by Leghemoglobin is positively regulated via its interaction with another late nodulin, Nlj16 of Lotus japonicus. Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology 28, 2019. 414–423.
- Hannah K. Lembke; Adeline Espinasse; Mckenna G. Hanson; Christian J. Grimme;Zhe Tan; Theresa M. Reineke; Erin E. Carlson (2023): Cationic Polymers Enable Internalization of Negatively Charged Chemical Probes into Bacteria. ACS Chem Biol . 2023 September 15; 18(9): 2063–2072.
- Müller MRA, Ehrmann MA, Vogel RF (2000): Multiplex PCR for the Detection ofLactobacillus pontis and Two Related Species in a Sourdough Fermentation. Applied Environmental Microbiology 66, 2000.
- Di Giosia, Matteo; Bomans, Paul; Bottoni, Andrea; Cantelli, Andrea; Falini, Giuseppe; Franchi, Paola; Guarracino, Giuseppe; Friedrich, Heiner; Lucarini, Marco; Paolucci, Francesco; Rapino, Stefania; Sommerdijk, Nico; Soldà, Alice; valle, Francesco ; Zerbetto, Francesco; Calvaresi, Matteo (2018): Proteins as Supramolecular Hosts for C60: A True Solution of C60 in Water. Nanoscale 10(21); 2018.
Често задавани въпроси
Какво представляват лизозимите?
Лизозимите са антимикробни ензими, които катализират хидролизата на β(1→4) гликозидните връзки в пептидогликана – основен структурен компонент на бактериалните клетъчни стени – и водят до отслабване на клетъчната стена и лизис, особено при грам-положителни бактерии и грам-отрицателни клетки с повишена пропускливост.
Какви са предимствата и ограниченията на клетъчния лизис с лизозоми?
Клетъчният лизис с лизозими предлага предимства като меки реакционни условия, запазване на функционалността на протеините и ниско механично натоварване, но е ограничен от бавна кинетика, непълен лизис в плътни или устойчиви бактериални култури, намалена ефективност срещу неповредени външни мембрани на грам-отрицателни бактерии и вариации в зависимост от клетъчната физиология и условията на растеж.
Как ултразвуковата обработка усилва действието на лизозимите?
Ултразвуковата обработка усилва активността на лизозима чрез механично разрушаване и повишаване на пропускливостта на бактериалните клетъчни стени посредством сили на срязване, породени от кавитацията. Това увеличава достъпа на ензима до пептидогликана, ускорява кинетиката на лизиса и води до по-пълно и равномерно разрушаване на клетките.

